#NEXUS [written Tue Jun 07 01:23:52 EDT 2011 by Mesquite version 2.73 (build 544) at ComPhy.local/10.0.1.7] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=237; TAXLABELS Abietinella_abietina_AY907953 Acrocladium_auriculatum_AY306854 Acroporium_pungens_AY908207 Actinothuidium_hookeri_AY908335 Aerobryidium_aureonitens_AY306857 Aerobryum_speciosum_AY306861 Aerolindigia_capillacea_AY908303 Alsia_californica_AY908258 Amblystegium_serpens_AY908237 Andoa_berthelotiana_AY908179 Anomodon_viticulosus_AY908201 Aptychella_proligera_AY908228 Aptychopsis_pyrrophylla_AY908212 Baldwiniella_kealeensis_AY908590 Barbellopsis_trichophora_AY908288 Benitotania_elimbata_AY449661 Bissetia_lingulata_AY908352 Boulaya_mitteni_AY908338 Brachelyma_subulatum_AF306998 Braithwaitea_sulcata_AY524469 Brotherella_recurvans_AY908227 Bryoandersonia_illecebra_AY908317 Bryocrumia_andersonii_AY908196 Bryonorrisia_acutifolia_AY908553 Bryostreimannia_turgida_AY908556 Callicladium_haldanianum_AY908561 Calliergon_cordifolium_AF469844 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GTGTAAGAATAATACGTCGTTTAGGAACTTTACCAGGACTAACTAATAAAACACCCCAGTTAAAATCTAGTTCTATCAACCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAGTATCGCATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGAATAACAGAACGACAATTACTTAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGCAAAAGGATCCACAGGTGAAGTTTTATTACAATTACTCGAAATGCGTTTAGATAATGTTATTTTTCGGTTAGGTATGGCTCCTACGATTCCTGGAGCAAGACAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATGATTCTATAGTAGATATACCAAGTTATCGGTGTAAACCTCAGGATTTTATTACTATAAAAAATCAACGAAAATCTGAGACTATAATTAATAAAAATATAGAGTTTTATCAAAAATCTAAAATACCAAATCATTTAACTTATAGTTTTTTAGAAAAAAAAGGATTAGTTAATCAAATATTAGATCGTGAATCGATTGATTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGC--------------------TTAACTAAA---AATTAATAG-TATTTT ; END; BEGIN TREES; Title TS1_rps4; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Abietinella_abietina_AY907953, 2 Acrocladium_auriculatum_AY306854, 3 Acroporium_pungens_AY908207, 4 Actinothuidium_hookeri_AY908335, 5 Aerobryidium_aureonitens_AY306857, 6 Aerobryum_speciosum_AY306861, 7 Aerolindigia_capillacea_AY908303, 8 Alsia_californica_AY908258, 9 Amblystegium_serpens_AY908237, 10 Andoa_berthelotiana_AY908179, 11 Anomodon_viticulosus_AY908201, 12 Aptychella_proligera_AY908228, 13 Aptychopsis_pyrrophylla_AY908212, 14 Baldwiniella_kealeensis_AY908590, 15 Barbellopsis_trichophora_AY908288, 16 Benitotania_elimbata_AY449661, 17 Bissetia_lingulata_AY908352, 18 Boulaya_mitteni_AY908338, 19 Brachelyma_subulatum_AF306998, 20 Braithwaitea_sulcata_AY524469, 21 Brotherella_recurvans_AY908227, 22 Bryoandersonia_illecebra_AY908317, 23 Bryocrumia_andersonii_AY908196, 24 Bryonorrisia_acutifolia_AY908553, 25 Bryostreimannia_turgida_AY908556, 26 Callicladium_haldanianum_AY908561, 27 Calliergon_cordifolium_AF469844, 28 Calliergonella_cuspidata_AY908183, 29 Calyptothecium_praelongum_AY908594, 30 Camptochaete_arbuscula_AY306934, 31 Campyliadelphus_stellatus_AY908248, 32 Campylophyllum_halleri_AY908252, 33 Caribaeohypnum_polypterum_AY908347, 34 Catagoniopsis_berteroana_AY908200, 35 Catagonium_nitens_AF307003, 36 Chaetomitriopsis_glaucocarpa_AY908603, 37 Chaetomitrium_borneense_AY306880, 38 Chionostomum_rostratum_AY908210, 39 Cirriphyllum_cirrosum_AY908310, 40 Claopodium_whippleanum_AY908294, 41 Clastobryophilum_bogoricum_AY908208, 42 Clastobryopsis_planula_AY908229, 43 Clastobryum_tenuirameum_AY908230, 44 Colobodontium_vulpinum_AY908215, 45 Conardia_compacta_AY908568, 46 Cratoneuron_filicinum_AY908250, 47 Cratoneuropsis_relaxa_AY908244, 48 Crosbya_straminea_AY306887, 49 Cryptoleptodon_longisetus_AY908260, 50 Cryptopapillaria_penicillata_AY908292, 51 Ctenidium_molluscum_AY907954, 52 Curvicladium_kurzii_AY908266, 53 Cyathophorum_bulbosum_AY306889, 54 Cyptodon_muelleri_AY908586, 55 Cyptodontopsis_obtusifolia_AY908588, 56 'Cyrto-hypnum schistocalyx AY908336', 57 Dendroalsia_abietina_AY908185, 58 Dendrocryphaea_cuspidata_AY908587, 59 Dendropogonella_rufescens_AY908562, 60 Dichelyma_falcatum_AY908318, 61 Dimerodontium_balansae_AY907952, 62 Dimorphocladon_borneense_AY306898, 63 Dixonia_thamnioides_AY907956, 64 Dolichomitra_cymbifolia_AY908344, 65 Dolichomitriopsis_diversiformis_AY908329, 66 Donnellia_commutata_AY908211, 67 Dozya_japonica_AY908262, 68 Ectropothecium_leptochaeton_AY908558, 69 Elmeriobryum_philippinense_AY908323, 70 Eriodon_conostomus_AY908239, 71 Erythrodontium_longisetum_AY908256, 72 Eulacophyllum_cultelliforme_AY908197, 73 Eurhynchiella_acanthophylla_AY908299, 74 Eurohypnum_leptothallum_AY908203, 75 Fabronia_pusilla_AY908199, 76 Fauriella_tenuis_AY908233, 77 Foreauella_orthothecia_AY908560, 78 Forsstroemia_trichomitria_AM990365, 79 Garovaglia_elegans_AY306915, 80 Gradsteinia_andicola_AY908246, 81 Habrodon_perpusillus_AY908293, 82 Hamatocaulis_vernicosus_AY908251, 83 Handeliobryum_sikkimense_AY908267, 84 Haplohymenium_triste_AY908202, 85 Helodium_blandowii_AY908339, 86 Henicodium_geniculatum_AY908563, 87 Herpetineuron_toccoae_AY908566, 88 Heterophyllium_affine_AY908577, 89 Himantocladium_cyclophyllum_AY908268, 90 Homalia_trichomanoides_AY908276, 91 Homaliodendron_flabellatum_AY908271, 92 Hookeria_acutifolia_AY306929, 93 Horikawaea_redfearnii_AY908600, 94 Horridohypnum_mexicanum_AY908349, 95 Hydropogon_fontinaloides_AY908216, 96 Hygrohypnum_smithii_AY908620, 97 Hylocomiastrum_pyrenaicum_AY908181, 98 Hylocomiopsis_cylindracarpa_AY908342, 99 Hylocomium_splendens_AY908280, 100 Hymenodon_pilifer_AY908176, 101 Hypnobartlettia_fontana_AY908245, 102 Hypnum_cupressiforme_DQ467883, 103 Ischyrodon_lepturus_AY908591, 104 Isocladiella_surcularis_AY908204, 105 Isodrepanium_lentulum_AY907964, 106 Isothecium_myosuroides_AY306933, 107 Jaegerina_scariosa_AY908601, 108 Juratzkaeella_sinensis_AY908198, 109 Lembophyllum_divulsum_AY306936, 110 Leptodictyum_riparium_AY907967, 111 'Leptopterigynandrum austro-alpinum AY908190', 112 Lepyrodontopsis_trichophylla_AY907965, 113 Lescuraea_radicosa_AY908326, 114 Leskeadelphus_bolivianus_AY907948, 115 Leskeella_nervosa_AY908325, 116 Leucodon_sciuroides_AY908186, 117 Leucomium_strumosum_AY306943, 118 Levierella_fabroniacea_AY907961, 119 Limbella_tricosta_AY908572, 120 Lindbergia_brachyptera_AY907949, 121 Lindigia_aciculata_AY908304, 122 Loeskeobryum_brevirostre_AY908278, 123 Macrothamnium_macrocarpum_AY908182, 124 Mahua_enervis_AY908319, 125 Mesochaete_undulata_AY631154, 126 Mesonodon_flavescens_AY908255, 127 Metaneckera_menziesii_AY908264, 128 Meteoridium_remotifolium_AY306949, 129 Meteoriella_soluta_AY306950, 130 Meteorium_illecebrum_AY908187, 131 Mittenothamnium_reptans_AY908346, 132 Muellerobryum_whiteleggei_AY908602, 133 Myurium_hochstetteri_AY908180, 134 Myuroclada_maximowiczii_AY908309, 135 Neckera_pennata_AY908265, 136 Neodicladiella_pendula_AY908284, 137 Neodolichomitra_yunnanensis_AY908297, 138 Neolindbergia_cladomnioides_AY908194, 139 Noguchiodendron_sphaerocarpum_AY907958, 140 Oedicladium_doii_AY908592, 141 Okamuraea_hakoniensis_AY908311, 142 Orthorrhynchium_elegans_AY908612, 143 Orthostichella_pentasticha_AY907962, 144 Orthostichidium_involutifolium_AY908195, 145 Orthostichopsis_tetragona_AY908192, 146 Orthotheciella_varia_AY908238, 147 Orthothecium_chryseum_AY907966, 148 Oxyrrhynchium_rugosipes_AY908315, 149 Palamocladium_leskeoides_AY908296, 150 Palisadula_chrysophylla_AY908593, 151 Papillidiopsis_complanata_AY908220, 152 Paranapiacabaea_paulista_AY908218, 153 Penzigiella_cordata_AY306972, 154 Phyllodon_truncatulus_AY908604, 155 Phyllogonium_fulgens_AY908193, 156 Pilotrichopsis_dentata_AY908599, 157 Pinnatella_piniformis_AY907963, 158 Pireella_angustifolia_AY908565, 159 Plagiothecium_cavifolium_AY908321, 160 Platygyriella_aurea_AY908575, 161 Platyhypnidium_riparioides_AY908298, 162 Platylomella_lescurii_AY908337, 163 Pleuroziopsis_ruthenica_AY908571, 164 Pleurozium_schreberi_AY908281, 165 Porothamnium_arbusculans_AY908277, 166 Porotrichodendron_nitidum_AY908273, 167 Porotrichopsis_flacca_AY908275, 168 Porotrichum_longirostre_AY908274, 169 Potamium_lonchophyllum_AY908221, 170 Pseudocalliergon_angustifolium_AY908242, 171 Pseudocryphaea_domingensis_AY908188, 172 Pseudoleskea_andina_AY908257, 173 Pseudoleskeella_tectorum_AY907950, 174 Pseudoleskeopsis_imbricata_AY908582, 175 Pseudotaxiphyllum_elegans_AY908578, 176 Pseudotrachypus_martinicensis_AY306982, 177 Pseudotrismegistia_perundulata_AY908618, 178 Pterigynandrum_filiforme_AY908189, 179 Pterobryella_praenitens_AF307002, 180 Pterobryopsis_stolonacea_AY908595, 181 Pterogonidium_pulchellum_AY908232, 182 Pterogoniopsis_cylindrica_AY908213, 183 Pterogonium_gracile_AY907970, 184 Ptychodium_plicatum_AY908327, 185 Puiggariopsis_aurifolia_AY908348, 186 Pulchrinodus_inflatus_AY907975, 187 Pylaisia_polyantha_AY907960, 188 Racopilum_cuspidigerum_AY524477, 189 Radulina_borbonica_AY908223, 190 Rauiella_lagoensis_AY908340, 191 Regmatodon_declinatus_AY908191, 192 Renauldia_mexicana_AY908333, 193 Rhacopilopsis_trinitensis_AY908225, 194 Rhaphidostichum_schwaneckeanum_AY908222, 195 Rhizogonium_pennatum_AY631170, 196 Rhynchostegium_serrulatum_AY908301, 197 Rhytidiadelphus_triquetrus_AY908279, 198 Rhytidium_rugosum_AY907951, 199 Rigodiadelphus_robustus_AY908569, 200 Rigodium_toxarion_AY908331, 201 Rozea_pterogonioides_AY907957, 202 Rutenbergia_madagassa_AY908605, 203 Sauloma_tenella_AY306987, 204 Schimperobryum_splendidissimum_AY306988, 205 Schofieldiella_micans_isolate_AY908235, 206 Schroeterella_zygodonta_AY908209, 207 Schwetschkea_grateloupii_AY908305, 208 Scleropodium_obtusifolium_AY306989, 209 Scorpidium_scorpioides_AY908584, 210 Sematophyllum_demissum_AY908214, 211 Sphaerotheciella_sphaerocarpa_AY908589, 212 Spiridentopsis_longissima_AY908564, 213 Steerecleus_serrulatus_AY908302, 214 Stenocarpidiopsis_salicicola_AY908307, 215 Stereophyllum_radiculosum_DQ467885, 216 Struckia_argentata_AY908320, 217 Symphyodon_imbricatifolius_AY306999, 218 Symphysodontella_cylindracea_AY908597, 219 Taiwanobryum_speciosum_AY908272, 220 Taxiphyllopsis_iwatsukii_AY908351, 221 Thamniopsis_incurva_AY449668, 222 Thuidiopsis_furfurosa_AY908341, 223 Toloxis_imponderosa_AY908289, 224 Tomentypnum_falcifolium_AY908567, 225 Trachybryum_megaptilum_AY908312, 226 Trachyloma_planifolium_AY631172, 227 Trachyphyllum_gastrodes_AY908236, 228 Trachypodopsis_serrulata_AY307008, 229 Trachypus_bicolor_AY908290, 230 Tripterocladium_leucocladulum_AY908334, 231 Vesicularia_vesicularis_AY908559, 232 Vittia_pachyloma_AY908240, 233 Warburgiella_leucocytus_AY908219, 234 Warnstorfia_exannulata_AY907968, 235 Weymouthia_mollis_AY307013, 236 Wijkia_extenuata_AY908205, 237 Yunnanobryon_sp.; TREE TS1_rps4_MP = (((((22,44,206,227,(43,12),(182,77)),(89,194,((236,105),(178,(((195,(170,152)),(190,42)),(233,((153,(96,45)),211,207,183,67,39,13,3))))))),(82,(61,19),((196,((187,(126,101)),(189,(180,21)))),(54,((143,80),(204,((118,221,(205,93)),(49,16))))))),((40,(135,(225,20))),(197,162),(209,97),(122,7),214,208,150,149,142,138,129,74,23,6),(112,(((168,(169,167)),166),((219,92),(90,84),140,91,53))),((237,192),((121,(78,(231,69))),199,174,115,62)),(47,(32,((171,81),232,147,102,71,48,9))),((139,133),(157,((108,94),(145,(218,181,30))))),((235,110),(193,107),230,201,66,31),(((215,109,73),35),(104,76),14),(165,(((79,68),50),(136,128,8))),(56,59,212,(173,55)),((151,141),((234,111),28)),(228,177,137,15,5),(155,(63,(38,37))),((226,203,172),36),(198,(130,123)),(119,(127,72)),((216,125),70),(224,(220,64)),(175,(222,57)),(229,131,51),(184,160),(213,146),(158,144),(113,106),(217,24),(134,10),223,210,202,200,188,185,179,176,164,163,161,159,156,154,148,124,120,117,116,114,103,100,99,98,88,87,86,85,83,75,65,60,58,52,46,41,33,29,27,26,25,18,17,11,4,2,1:2.0,191:2.0),132,95,34):0.5,186:0.5); 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