#NEXUS [written Sat Jun 18 15:18:41 EDT 2011 by Mesquite version 2.73 (build 544) at 040-084.bio.sunysb.edu/129.49.40.84] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=76; TAXLABELS Ametrida_centurio Anoura_caudifer Anoura_geoffroyi Ardops_nichollsi Ariteus_flavescens Artibeus_cinereus Artibeus_concolor Artibeus_hirsutus Artibeus_jamaicensis Brachyphylla_cavernarum Carollia_brevicauda Carollia_perspicillata Centurio_senex Chiroderma_villosum Choeroniscus_godmani Choeronycteris_mexicana Chrotopterus_auritus Desmodus_rotundus Diaemus_youngi Diphylla_ecaudata Ectophylla_alba Enchisthenes_hartii Erophylla_sezekorni Furipterus_horrens Glossophaga_longirostris Glossophaga_soricina Glyphonycteris_daviesi Glyphonycteris_sylvestris Hylonycteris_underwoodi Lampronycteris_brachyotis Leptonycteris_yerbabuenae Lionycteris_spurrelli Lonchophylla_robusta Lonchophylla_thomasi Lonchorhina_aurita Lophostoma_brasiliense Lophostoma_silvicolum Macrophyllum_macrophyllum Macrotus_californicus Macrotus_waterhousii 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Ariteus_flavescens 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Artibeus_cinereus 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Artibeus_concolor 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Artibeus_hirsutus 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Artibeus_jamaicensis 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Brachyphylla_cavernarum 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Carollia_brevicauda 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Carollia_perspicillata 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Centurio_senex 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Chiroderma_villosum 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Choeroniscus_godmani 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Choeronycteris_mexicana 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Chrotopterus_auritus 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Desmodus_rotundus 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Diaemus_youngi 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Diphylla_ecaudata 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Ectophylla_alba 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Enchisthenes_hartii 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Erophylla_sezekorni 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Furipterus_horrens 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Glossophaga_longirostris 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Glossophaga_soricina 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Hylonycteris_underwoodi 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Lampronycteris_brachyotis 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Lonchophylla_robusta 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Lonchophylla_thomasi 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Lonchorhina_aurita 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Lophostoma_silvicolum 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Macrophyllum_macrophyllum 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Macrotus_californicus 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Macrotus_waterhousii 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Mesophylla_macconnelli 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Micronycteris_hirsuta 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Micronycteris_megalotis 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Mimon_bennettii 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Mimon_crenulatum 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Monophyllus_redmani 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Mormoops_megalophylla 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Mystacina_tuberculata 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Noctilio_leporinus 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Platyrrhinus_helleri 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Pteronotus_davyi 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Pteronotus_parnellii 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Pygoderma_bilabiatum 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Saccopteryx_bilineata 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Sturnira_lilium 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Tonatia_saurophila 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Trachops_cirrhosus 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Trinycteris_nicefori 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Uroderma_bilobatum 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Vampyressa_pusilla 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Vampyriscus_bidens 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Vampyrodes_caraccioli 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Vampyrum_spectrum 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; END; BEGIN TREES; Title 'Trees from "Molecular_80spp.nex"'; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Ametrida_centurio, 2 Anoura_caudifer, 3 Anoura_geoffroyi, 4 Ardops_nichollsi, 5 Ariteus_flavescens, 6 Artibeus_cinereus, 7 Artibeus_concolor, 8 Artibeus_hirsutus, 9 Artibeus_jamaicensis, 10 Brachyphylla_cavernarum, 11 Carollia_brevicauda, 12 Carollia_perspicillata, 13 Centurio_senex, 14 Chiroderma_villosum, 15 Choeroniscus_godmani, 16 Choeronycteris_mexicana, 17 Chrotopterus_auritus, 18 Desmodus_rotundus, 19 Diaemus_youngi, 20 Diphylla_ecaudata, 21 Ectophylla_alba, 22 Enchisthenes_hartii, 23 Erophylla_sezekorni, 24 Furipterus_horrens, 25 Glossophaga_longirostris, 26 Glossophaga_soricina, 27 Glyphonycteris_daviesi, 28 Glyphonycteris_sylvestris, 29 Hylonycteris_underwoodi, 30 Lampronycteris_brachyotis, 31 Leptonycteris_yerbabuenae, 32 Lionycteris_spurrelli, 33 Lonchophylla_robusta, 34 Lonchophylla_thomasi, 35 Lonchorhina_aurita, 36 Lophostoma_brasiliense, 37 Lophostoma_silvicolum, 38 Macrophyllum_macrophyllum, 39 Macrotus_californicus, 40 Macrotus_waterhousii, 41 Mesophylla_macconnelli, 42 Metavampyressa_nymphaea, 43 Micronycteris_hirsuta, 44 Micronycteris_megalotis, 45 Micronycteris_minuta, 46 Mimon_bennettii, 47 Mimon_crenulatum, 48 Monophyllus_redmani, 49 Mormoops_megalophylla, 50 Musonycteris_harrisoni, 51 Mystacina_tuberculata, 52 Noctilio_leporinus, 53 Phylloderma_stenops, 54 Phyllonycteris_aphylla, 55 Phyllops_falcatus, 56 Phyllostomus_discolor, 57 Phyllostomus_hastatus, 58 Platalina_genovensium, 59 Platyrrhinus_helleri, 60 Pteronotus_davyi, 61 Pteronotus_parnellii, 62 Pygoderma_bilabiatum, 63 Rhinophylla_pumilio, 64 Saccopteryx_bilineata, 65 Sphaeronycteris_toxophyllum, 66 Stenoderma_rufum, 67 Sturnira_lilium, 68 Thyroptera_tricolor, 69 Tonatia_saurophila, 70 Trachops_cirrhosus, 71 Trinycteris_nicefori, 72 Uroderma_bilobatum, 73 Vampyressa_pusilla, 74 Vampyriscus_bidens, 75 Vampyrodes_caraccioli, 76 Vampyrum_spectrum; TREE Molecular_MP_StrCon_eq_wts = ((((((((((((((((((((((((1,62),65),13),(4,5)),(55,66)),(6,(7,(8,9)))),(21,22)),((14,(41,73)),(((42,74),72),(59,75)))),67),63),((11,12),((27,28),71))),(((32,34),58),33)),(((2,3),((15,16,50),29)),((10,(23,54)),(((25,26),31),48)))),((((36,37),(47,(53,56,57))),69),(38,70))),(((17,76),((18,19),20)),(30,((43,44),45)))),35),(39,40)),49),(60,61)),(24,52)),46),51),68),64); TREE Molecular_MP_StrCon_exclude_down_saturated = ((((((((((((((((((1,62),65),13),(4,5),(55,66)),((6,7),(8,9))),(21,22)),((14,(41,73)),(((42,74),72),(59,75)))),67),(((2,3),((15,16,50),29)),10,(23,54),(((25,26),31),48)),((11,12),((27,28),71)),(((32,58),33),34),(35,(38,70)),(36,37),47,(53,57),56,63,69),(17,76)),((18,19),20)),((30,46),((43,44),45))),(39,40)),49),(60,61)),((24,52),68)),51),64); TREE Molecular_ML_BS_besttree_1_model_alldata_eq_wts = ((51:0.24664137261390515,((68:0.33724825932005587,(52:0.22336946600520666,24:0.21911355044021524)98:0.04514518040305562)64:0.017260917033147735,((49:0.1399061929759331,(60:0.08511094786769735,61:0.09787986756169727)100:0.06824574779083006)87:0.017092973061008432,((40:0.07896222833140196,39:0.10640581949804857)100:0.12363864431764642,(((((76:0.10785422685677411,17:0.1327641253380597)100:0.056029546323631774,((38:0.17908477787860982,70:0.1282183275548568)97:0.024224063038344956,(69:0.13994764343748584,((37:0.05472559661167603,36:0.07539824556338806)100:0.05343874073566846,(47:0.139853039832379,((57:0.07273888807262298,56:0.10477102204474101)70:0.01779756885475487,53:0.134154703969872)30:0.00501032100430095)92:0.025242180470821524)90:0.010785665869550699)89:0.009381408928020174)63:0.008731122549882836)79:0.011338649852862459,(35:0.15810229573831425,(((63:0.21163444454848956,(67:0.10918703734879641,((((42:0.06883927608502434,74:0.06522133043928166)78:0.016989652009442514,(14:0.06943943349868191,72:0.0895289285967182)29:0.004734882482874191)41:0.006404146442784846,((75:0.05281234509998503,59:0.05360096341967393)82:0.010906500090978112,(41:0.06287125125510526,73:0.05314737533512948)100:0.024849043817596526)50:0.003485443624159748)100:0.018374088601910296,((21:0.12654382516349727,((((13:0.031231094920915133,(65:0.026237609240700184,(1:0.02203834033112569,62:0.023026729183413006)85:0.005477390491558523)99:0.010589640629722395)99:0.009301284489215463,(4:0.019053234780243546,5:0.01869580014835567)100:0.025822161184953334)86:0.00805151673656701,(66:0.01045172637730483,55:0.016358259090106034)100:0.02470496906473934)100:0.05213248166058318,((8:0.042793629454724744,9:0.0336648257520717)98:0.013062093694394586,(6:0.04975294990982019,7:0.05256402619993011)70:0.009237246524164976)100:0.026244750436592894)84:0.007150242632359603)43:0.0058476870453817555,22:0.08986657193144125)100:0.018139188485236213)100:0.020120257273766904)100:0.024487731960002024)99:0.01668142457559354,((11:0.015161625736666346,12:0.012331065225008483)100:0.10578419339372101,(71:0.1178337847980891,(27:0.1144216361524998,28:0.09458698345911229)99:0.022804341536354408)94:0.02683829845045499)85:0.011196085638279249)90:0.013846113786959373,((((2:0.06683736400475827,3:0.0636997370519778)100:0.05584500752000701,(29:0.07547182852336108,(50:0.011707190288103058,(16:0.007849279505548786,15:0.02750153367081667)19:8.471281796608534E-4)100:0.05236523258271878)100:0.11038959844840569)95:0.015875290653079042,(((31:0.07884769714302957,(25:0.08006188946366687,26:0.06642792463396684)100:0.0410339302531776)100:0.025890745024283998,48:0.07908140756043237)100:0.018670709943842692,((54:0.06230508023044073,23:0.06361416684020696)100:0.04362301527030628,10:0.08860850378505682)85:0.01282945641915167)93:0.0070688007919548785)98:0.02306387250576162,(34:0.1090060636792,(33:0.11046581333671503,(58:0.07264134155294627,32:0.08911022498035898)46:0.02220395703037901)36:0.006026872473214603)100:0.06817708203193872)48:0.008709209483115234)60:0.0077443736353733665)73:0.008390403819246647)78:0.017429255905772646,(20:0.22572902335014097,(19:0.09596758324433655,18:0.13864103170637182)100:0.08219062626910768)100:0.04016093398000872)65:0.013582185634847912,((46:0.2102878425555848,30:0.14728941921480995)48:0.029030481792682084,(45:0.10807761646657722,(43:0.07856805698516678,44:0.05850261869419341)97:0.018527230537164863)100:0.03556535928935598)51:0.02971517462310066)71:0.009346464986657812)92:0.045172616062361254)92:0.026510239405651316)76:0.020116978017316392):0.17123432569401,64:0.17123432569401); 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