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Amasa_versicolor TGAAGGCTGAGCGTGAACGTGGTATCACCATTGACATTGCCCTGTGGAAGTTTGAAACTGCTAAGTACTATGTAACCATCATTGATGCCCCTGGACACAGAGACTTCATTAAGAACATGATTACGGGCACATCCCAGGCTGATTGTGCTGTGCTAATTGTAGCTGCTGGTACTGGTGAATTTGAAGCTGGTATCTCCAAAAATGGACAGACCCGAGAACATGCTCTTTTGGCCTTTACCCTTGGAGTGAGACAACTTATTGTCGGTGTCAACAAAATGGATTCCACTGAACCGCCCTATAGCGAGTCTCGATTTGAGGAAATTAAAAAGGAAGTCTCGTCTTATATCAAGAAAATTGGTTACAATCCAGCTGCTGTCGTTTTTGTGCCCATTTCTGGCTGGCACGGAGACAACATGTTGGAACCATCCACCAAGATGTCCTGGTTCAAGGGCTGGTCCATTGAACGCAAAGAAGGAAAGGCTGAAGGAAAGACCCTCATCGACGCTTTGGACGCTATTCTTCCGCCTAGCCGCCCAACTGACAAACCTCTTCGTCGTATGTGGGAACCTCATTAAGTATACTAATTCGAACAGAGCTAGGAACCCCGGGAAGATTAATTATAGATGATCAAATTTTTAATACTATCGTTACAGCCCACGCTTTTATCATAATTTTTTTTATAGTTATACCAATTTTAATTGGAGGATTTGGAAATTGGTTAGTTCCACTAATATTGGGAGCCCCAGATATAGCTTTTCCTCGATTAAACAACATAAGATTTTGACTTTTACCCCCTAGACTCTCTTTACTACTAATATCAAGAATTATTGATAAAGGAGCAGGAACTGGATGAACAGTTTATCCCCCATTAGCCGCTAATATTGCTCATGAAGGGGCTTCAATTGATCTAGCAATCTTTAGATTACATATATCAGGAGTTTCATCAATTTTAGGGGCCATTAATTTCATTTCAACTATTATTAATATACATCCAGTAGGAATAAAACCAGAACAACTATCCTTATTTACATGAGCAGTAAAAATTACTGCTATTCTTCTTCTTTTATCTCTTCCTGTACTAGCTGGGGGAATTACTATACTACTCACAGATCGAAACATTAACACCTCATTTTTTGATCC?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CGTGACGCCTATGACAACTGCATAACCGTCTGCAACATGGAAAACGTAGACCCCTTGGGCATTCACACTGGAGAATCAATAGTAGTCGCCCCTAGCCAGACTTTATCCAATAGAGAATACAATATGCTACGTACCACCGCCATAAAGGTCATAAGACACTTTGGAGTTGTTGGCGAGTGCAACATCCAGTATGCATTGAGCCCGTTTTCTGAAGAGTACTACATCATCGAAGTCAATGCCCGCCTGTCCAGGAGTTCGGCCCTGGCGAGCAAGGCCACAGGATATCCATTAGCTTATGTGGCTGCAAAGCTCTCCCTGGGAATATCCTTGCCAGAAATTAAGAACTCAGTCACTGGACACACCACCGCCTGCTTCGAGCCCAGCCTGGATTACTGTGTGGTGAAAATTCCGCGCTGGGACCTCCACAAGTTTTCCAGAGTGAGCACCAAGATTGGAAGCTCAATGAAAAGCGTTATGCTCCTGATGCTGAAGCCTATACAGTATTCGCTGATCTTTTCGATCCCATCATCGAAGACTATCATAAAGGGTTCGGTAGGAACGACAAGCACCCTCCTAAGAACTGGGGTGATGTCAGCGTGTTCGGGAACCTCGACCCCAACAATGAATTTGTTGTTTCTACCCGTGTGAGGTGCGGTAGATCTATGGAAGGGTACCCCTTCAACCCCTGCTTGACCGAGGAGCAGTATAAGGAAATGGAACAAAAAGTCTCCAGCACCCTATCCGGACTTGAGGGCGAGTTGAAAGGAACTTTCTATCCTTTGACTGGAATGAGTAAAGACGTTCAGCAGAAACTGATCGATGATCACTTCTTGTTCAAAGAAGGTGACAGATTCTTGCAGGCTGCCAACGCTTGCCGTTTCTGGCCCTCTGGACGTGGAATTTTCCACAACGAAAACAAAACATTCTTGGTCTGGTGCAACGAAGAAGATCATCTTCGTATTATTTCCATGCAAATGGGTGGTGATTTAGGACAAGTTTACCGTCGTCTGGTCACAGCCGTTAATGATATTGAAAAGCGTGTCCCCTTCTCTCACAACGACCGGCTTGGATTTCTTACTTTCTGCCCAACTAATTTGGGTACCACTGTCCGTGCTTCAGTGCACATTAAGGTGCCGAAGCTGGCCGCGAACAAGGCCAAACTTGAAGAGGTTGCTTCCAAGTACAAC???????????????????????TTAGGGGTAAACCTGAGAAACCCGAAAGGTCGAAGGGAGAAA-TTCATTCGCG--TTT-CGA--CGT-AGGCGTGGAATG----GGGTC-----GAGCGA--------CGG---------GA----CACG--TTCTT------C----GGA-GCGAG--------------------TTTCGCGC---------CCTCCGTTCT--TCGAACCGGCGACGAACGCGT-GCACT-TTTCTCCTGGTAGGACGTCGCGATCCGTCGGGTGTCGGTCT-ACGAC-------TTGC-GGTGGAGCCCGTCCGTCGTT------TCGT----ACGT--ACGGA-----CGGACCCGCT-CGTT--------CTGGCCGACTCGCTCGACGGTAT-ACG----TAAGGTCGGAGGCCGCTCGTT---TTTTT--------AGGAGCGTTCGACTCGTCGCAAGCGCGCCATGTGCGTCGGCACGCGGACTCAGTGCCGCGTCCGACCTCTGGTGACTGTTGGCGACGATGTTCTCGGACAGACCTCTTT------------------------------------------------------TTTT---------------------------CGAAA-------------------------------GACC-GATCGGCGACGCTATAGCTTTGGGTACTTTC-AGGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAGCATGTACGC-GAGTCATTGGGAAT---CACTAAACCTAA-AGGCGTAATGAAAGTGAAGGTCTTCCTC--GCGA-A-GACCGAGGGAAGACGGACGGTTA------CG------TCAAACCGCCCTAAAAA------GTGGGACCGTCCTGCATTCCCGGGGCGTCTCGTTCACA-TCGCGTG--AAGAGGCGCACCAAGAGCGTACACGCTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGGTCAGGACGAAGTCAG???????????????????????????????? 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'Xylosandrus sp. n. 342 SAD-2010' TGAAGGCTGAACGTGAACGTGGTATCACCATTGATATTGCCTTATGGAAATTCGAAACTGCAAAGTACTATGTAACCATCATTGATGCTCCTGGACACAGAGATTTCATCAAGAACATGATCACTGGAACATCTCAAGCTGATTGTGCTGTGCTAATTGTAGCTGCTGGTACTGGAGAATTTGAAGCTGGTATCTCGAAAAATGGACAAACCAGAGAACATGCTCTTCTCGCTTTTACCCTTGGAGTAAGGCAACTCATTGTCGGTGTCAACAAAATGGATTCCACCGAACCGCCCTACAGCGAGCCTCGTTTTGAGGAAATTAAGAAGGAAGTCTCTTCATATATCAAGAAAATTGGTTACAACCCAGCTGCAGTCGTTTTTGTGCCTATTTCTGGTTGGCATGGAGACAATATGTTGGAGCCATCTAACAAGATGCCATGGTTCAAAGGATGGTCCATTGAACGTAAAGAAGGAAAGGCTGAAGGCAAAACTCTCATTGATGCTTTGGATGCCATCCTCCCACCTAGTCGCCCAACTGACAAACCCTTCGTC?CATAGTAGGAACATCCCTAAGAGTCTTAATTCGTACAGAATTAGGAACCCCAGGAAGATTAATTATAGATGATCAAATTTTTAATACTATTGTAACAGCCCATGCATTCGTAATAATTTTCTTTATAGTTATACCTATTCTTATTGGAGGTTTTGGCAATTGACTAGTCCCTTTAATATTAGGGGCCCCAGATATAGCTTTTCCACGACTTAATAATATAAGATTTTGACTACTTCCACCAAGATTAACCCTTCTATTAATAAGAAGAATTATTGATAAAGGAGCTGGAACAGGATGAACAGTTTACCCACCACTAGCAGCAAATATTGCCCATGAAGGAGCATCCGTTGACCTAGCAATTTTTAGCTTGCATATATCAGGAGTATCTTCAATTCTTGGAGCAATCAATTTTATTTCAACAATCATTAATATACATCCAACAGGAATAAAACCTGAACAACTTTCATTATTTACATGAGCTGTAAAAATTACAGCTATCCTTCTATTACTTTCTCTACCAGTTTTGGCAGGAGGAATTACTATACTTCTTACAGATCGAAATATTAATACATCTTTTTTTGATCCAGGTTTTGCCAATACAAACGAAGAGCTGACTGTGTTAGCCACTCAAGCCTTAGCGCATTCCAGCCAACTTGTCATCGACAAATCTTTAAAAGGTTGGAAGGAAGTTGAGTACGAAGTGGTCCGTGATGCATATGATAACTGCATAACCGTGTGTAACATGGAAAACGTAGACCCCTTGGGCATTCATACTGGAGAATCAATCGTAGTCGCCCCCAGCCAGACTTTATCCAATCGAGAATACAACATGTTACGGACCACCGCCATAAAAGTTATAAGACACTTTGGAGTTGTGGGTGAATGCAACATCCAGTACGCTTTGAGCCCTTTTTCCGAAGAGTACTACATCATTGAAGTTAATGCCCGACTGTCCAGGAGTTCTGCCCTTGCAAGCAAGGCCACAGGGTATCCGCTGGCATATGTGGCTGCAAAACTGTCCTTAGGAATACCTTTGCCAGAAATTAAAAACTCCGTTACAGGAGACACCACTGCTTGCTTCGAGCCCAGTTTGGATTA?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TATGCTCCAGATGCTGAAGCCTATACAGTATTCGCTGATCTCTTCGATCCCATCATCGAAGACTACCACAAAGGGTTCAGCAAGGGCGATAAGCACCCCCCCAAGAACTGGGGTGATGTCAGCGTATTCGGCAACCTCGATCCTAACAACGAATTCGTGGTTTCTACCCGCGTGAGGTGCGGTAGGTCTCTGGAAGGATACCCTTTCAACCCCTGCTTAACCGAGGAGCAGTACAAGGAAATGGAACAGAAAGTTTCCAGTACCTTATCCGGACTTGAGGCCGAGTTGAAAGGAACTTTCTACCCATTGACTGGAATGAGCAAAGACGTTCAGCAGAAACTGATCGATGATCACTTCTTGTTCAAGGAAGGGGACAGATTCTTGCAGGCTGCCAACGCCTGCCGTTTCTGGCCCTCTGGACGTGGTATTTTCCACAACGAAAACAAAACATTCTTGGTCTGGTGTAACGAGGAAGACCATCTTCGTATCATTTCTATGCAAATGGGTGGTGACTTGGGACAAGTCTACCGTCGTCTGGTCACAGCTGTTAATGATATCGAGAAGAGAATCCCCTTCTCTCACAACGACAGGCTTGGATTCCTTACTTTTTGCCCTACTAACTTAGGTACTACTGTTCGTGCTTCAGTACACATCAAGGTACCCAAGCTGGCCGCCAATAAGGCCAAACTTGAAGAAGTGGCTGGCAAGTACAAC????????????????????????????????????????AAACCCGAAAGGTCGAAGGGAGAAA-TTCATTCGCG--TTT-CGA--CGT-AGGCGTT-GGAC---GGGGTCG---AGAGAGAGAG---CGAGATAAC-GATGGAA---CGCGTTCTTCGGAACGAG----TTTCGCGTTT------CTC----------ACCCCC-T---------ACTCGTTCT--T-CGAACCGGCGACGAACGCGT-GCACT-TTTCTCCTGGTAGGACGTCGCGATCCGTCGGGTGTCGGTCT-ACGACT-------TGC-GGTGGAGCCCGTCCGT--------CGTCCTAA---CGT-GACGGTACGGATGGACCCGCA-ACGCTC-------TGGCCGACTCGCTCGACGGTAT-AC---TAAACGGTCGGAGGCCGCTCG-------TTACAGG-------AGCGTTCGACTCGTCGCAAGCGCGCCACGTGCGTCGGCACGCGGACCTAGTGCCGCGTCCGACCTCTGGTGACTGTTGGCGACGAAGTTCTCGAACAGACCTT-------------------------------------------------------CTTTTTTTTTG---------------------GAAACAAAAAAA-----------------------ATGACC-GATCGGCGACGCTATAGCTTTGGGTACTTTC-AGGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAGCATGTACGC-GAGTCATTGGGAA--T-CACTAAACCTAA-AGGCGTAATGAAAGTGAAGGTCTTCCTC--GCGA-A-GACCGAGGGAAGACGGACGGTTAA--------TTTTTATAAACCACCCTCAAAAA-----GTGGGACCGTCCTGCATTCCCGGGGCGTCTCGTTCACAT---TGCGTGAAGAGGCGCACCAAGAGCGTACACGCTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGGTCAGGACGAAGTCAGGGGAAACCCTGATGGAGGTCCGTA???????? Xylosandrus_ursa ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????AACCCCCATTGATGCT?CCGGACACAGAGATTTCATCAAGAACATGATCACTGGAACGTCCCAGGCTGATTGTGCTGTGCTAATCGTAGCTGCTGGTACTGGTGAATTTGAAGCCGGTATCTCGAAAAATGGACAGACCAGAGAACATGCTCTTCTTGCCTTCACCCTTGGAGTGCGACAACTTATTGTCGGTGTCAACAAAATGGATTCTACAGAACCCCCTTACAGCGAGTCTCGATTTGAAGAAATTAAGAAGGAAGTCTCTTCTTACATCAAGAAAATTGGTTACAATCCAGCTGCTGTCGTTTTCGTGCCTATTTCTGGTTGGCACGGGGACAACATGTTGGAACCCTCCACCAAGATGCCATGGTTCAAAGGATGGTCCATTGAACGC????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CATAGTAGGGACCTCCCTGAGAATACTAATTCGTACAGAACTAGGAACCCCAGGAAGGCTAATCAGAGATGATCAAATCTTCAATACTATTGTAACCGCTCATGCCTTCATTATAATTTTCTTTATAGTAATGCCAATCCTAATTGGTGGATTTGGAAACTGGTTAGTACCATTAATGCTTGGAGCCCCCGATATAGCCTTCCCACGACTTAACAATATAAGATTCTGACTTCTCCCTCCCAGACTATCTCTCCTTCTTATAAGAAGAATTATTGACAAAGGAGCAGGAACAGGATGAACAGTATACCCCCCGCTAGCCTCCAACATTGCCCATGAAGGGGCATCTGTTGACCTAGCAATCTTCAGCCTTCACATGTCAGGGGTATCCTCAATCCTAGGAGCAATTAATTTCATCTCCACAATTATTAATATACACCCTGCAGGGATAAAGCCAGAACAGCTATCCTTATTCACCTGAGCAGTAAAAATTACTGCTATCCTATTATTATTGTCCCTTCCTGTGCTAGCAGGAGGTATCACAATACTCCTTACAGACCGTAATATCAATACATCTTTTTTTGACCC?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CGTGATGCGTATGATAACTGCATAACCGTCTGCAATATGGAGAACGTGGACCCCTTAGGCATTCATACTGGAGAATCAATCGTAGTCGCCCCCAGCCAGACTTTATCCAATCGCGAGTACAACATGTTGCGAACCACCGCCATAAAAGTTATAAGACACTTCGGAGTTGTCGGTGAATGCAACATCCAGTATGCTTTGAGTCCCTTTTCCGAGGAGTACTACATCATTGAGGTGAATGCTCGACTGTCGAGGAGTTCTGCCCTTGCAAGCAAGGCCACAGGGTATCCGTTGGCATATGTGGCTGCAAAACTTTCTTTGGGAATATCTTTGCCAGAAATTAAAAATTCCGTTACTGGAAACACCACCGCCTGTTTCGAGCCCAGTTTAGATTACTGCGTAGTGAAAATTCCACGCTGGGATCTCCACAAATTTTCCAGAGTGAGCACCAAGATTGGTAGTTCAATGAAAAGCGTTATGCTCCTGATGCTGAAGCCTACACAGTATTCGCCGATCTCTTCGATCCCATTATCGAAGACTATCACAAAGGGTTCACCAAGGGCGACAAGCATCCCCCCAAGAACTGGGGTGATGTCAGCGTGTTCGGCAACCTCGACCCCAACAACGAATTCGTGGTTTCCACCCGTGTGAGGTGCGGCAGGTCGCTGGAAGGATATCCTTTCAACCCCTGCTTAACCGAAGAGCAGTATAAGGAAATGGAACAGAAAGTCTCCAGTACTTTATCCGGCCTTGAGAGCGAGTTGAAGGGAACTTTCTACCCTTTAACTGGCATGAGCAAAGACGTTCAGCAGAAATTGATCGACGATCATTTCTTGTTCAAGGAGGGTGACAGGTTCTTGCAGGCTGCCAACGCCTGTCGTTTCTGGCCGTCTGGACGTGGCATTTTCCACAACGAAAACAAAACATTCTTGGTCTGGTGTAATGAGGAAGATCATCTTCGTATCATTTCCATGCAAATGGGTGGTGACTTGGGGCAAGTCTACCGCCGTCTGGTCACAGCTGTCAATGATATCGAGAAGCGTATTCCCTTCTCTCACAACGACAGGCTTGGATTCCTCACTTTCTGCCCAACCAACTTAGGTACCACTGTCCGTGCTTCAGTACACATCAAGGTACCCAAGCTGGCCGCTAACAAGGCCAAACTTGAAGAAGTTGCTGCCAAGTACAAC??????????????????????????????????????????????????????????????????????TTCGCG--TTT-CGA--CGC-AGGCGTG-GGAC---GGAG-TT---TGTGC--------GACGGAACT-CGCGCGC---CGCGCGTTCTTC-GGAAC----CGCGAGCGTG------TC------CGTAGTTTTGCGC---------CCTTCGTTC--TTCGAACCGGCGACGAACGCGT-GCACT-TTTCTTCTGGTAGGACGTCGCGATCCGTCGGGCGTCGGTCT-ACGACT-------TGC-GG?GGAGCCCGTCCGT--------CGTCGTCTT-TCGT--ACGATGCGGACGGACCCGTT-CGTTTT------CCGACCGACTCGCTCGACGGTAT-GCT--TATAAGGTCGGAGGCCGCTCGATATTTTTTCAAGG-------AGCGTTCGACTCGTCGCAAGCGCGCCACGTGCGTCGGCACGCGGACCCAGTGCCGCGTCCGACCTCTGGTGACTGTTGGCGACGATGTTCTCGGACAGACCTCTTCACATCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTCTTTCCTCTCTTCTCATTTTAACC-----GGTGGGAGGAGGGTGTGCGGCGAGGGGATTGTGGGGGGAGTCGGTGAGAG--GAGACC-GATCGGCGACGCTATAGCTTTGGGTACTTTC-AGGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAGCATGTACGC-GAGTCATTGGGAAT---TACTAAACCTAA-AGGCGTAATGAAAGTGAAGGTCTTCCT--CGCGA-A-GACCGAGGGAAGACGGACGGTCTGC-----------------GCCCTCAAAAGTG-----TTGGGACCGTCCTGCATTCCCGGGGCGTCTCGTTCACAT---TGCGTGAAGAGGCGCACCAAGAGCGTACACGCTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGGTCAGGA-???????????????????????????????????????? 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; END; BEGIN SETS; CHARSET ef1a = 1 - 555; CHARSET coi = 556 - 1140; CHARSET argk = 1141 - 1734; CHARSET cad = 1735 - 2448; CHARSET 28s = 2449 - 3496; END; BEGIN paup; charset ef1a = 1 - 555; charset coi = 556 -1140; charset argk = 1141 -1734; charset cad = 1735 - 2448; charset 28s = 2449 - 3496; END; BEGIN TREES; Title Xylosandrus_result; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1t Amasa_bicostatus, 1 Amasa_resectus, 2 Amasa_schlichi, 3 Amasa_sp._301, 4 Amasa_sp._349, 5 'Amasa sp. n. 1 SAD-2010', 6 Amasa_striatotruncatus, 7 Amasa_versicolor, 8 Anisandrus_dispar, 9 Anisandrus_hirtus, 10 Anisandrus_obesus, 11 Anisandrus_sayi, 12 Cnestus_bimaculatus, 13 Cnestus_pseudosuturalis, 14 Coccotrypes_dactyliperda, 15 Coccotrypes_longior, 16 Euwallacea_russulus, 17 Xyleborus_affinis, 18 Xyleborus_californicus, 19 Xyleborus_impexus, 21t Xyleborus_pelliculosus, 20 Xyleborus_rotundicollis, 21 Xylosandrus_ater, 22 Xylosandrus_cf._zimmermanni, 25t Xylosandrus_compactus_02, 23 Xylosandrus_compactus_04, 24 Xylosandrus_crassiusculus_01, 25 Xylosandrus_crassiusculus_02, 26 Xylosandrus_crassiusculus_07, 27 Xylosandrus_crassiusculus_08, 28 Xylosandrus_discolor_02, 29 Xylosandrus_germanus_01, 30 Xylosandrus_germanus_02, 31 Xylosandrus_improcerus, 32 Xylosandrus_mancus_02, 33 Xylosandrus_monteithi_A17, 34 Xylosandrus_morigerus, 38t Xylosandrus_morigerus_01, 35 Xylosandrus_morigerus_02, 36 Xylosandrus_morigerus_03, 37 Xylosandrus_mutilatus, 38 Xylosandrus_queenslandi, 39 Xylosandrus_sp._2, 44 Xylosandrus_sp._Borneo_466, 40 'Xylosandrus sp. n. 342 SAD-2010', 41 Xylosandrus_ursa, 42 Xylosandrus_ursinus; TREE Fig._1 = (14:0.034585,(15:0.060384,17:0.090152):0.043432,(((18:0.040036,21t:0.028739):0.044518,(5:0.066021,(4:0.054952,((1t:0.029344,2:0.01949):0.014867,(3:0.030582,(1:0.024738,(6:0.026581,7:0.017318):0.006599):0.019507):0.011951):0.033391):0.026613):0.0):0.026008,((38:0.055887,((25t:0.015096,23:0.013483):0.025773,((44:0.037942,(29:0.0,30:8.51E-4):0.031735):0.009482,(38t:0.018195,(35:0.007415,36:0.004655):0.007892):0.027748):0.00689):0.023106):0.003912,((16:0.032638,20:0.034045):0.066272,((33:0.061068,40:0.082431):0.036363,((9:0.044888,((41:0.048543,42:0.035496):0.033598,(8:0.029612,(10:0.042996,11:0.023595):0.009611):0.014631):0.003452):0.061164,((28:0.046288,32:0.082398):0.013165,(((24:0.006397,25:0.007311):0.007757,(26:0.0,27:0.0):0.02043):0.064055,((12:0.070681,13:0.059065):0.046711,(31:0.067955,(21:0.052162,37:0.033543):0.043573):0.009177):0.093057):0.015287):0.005306):0.009606):0.006073):0.0):0.008538):0.046917)[% ] [% ] [% setBetweenBits = selected ]; END;