NEXUS
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[Matrix accession#: M40c11x5x95c20c28c52]

BEGIN TAXA;
	TITLE M40c11x5x95c20c28c52;
	DIMENSIONS  NTAX=28;
	TAXLABELS
		Allophyllum_giliodes	Bonplandia_geminiflora	Cantua_buxifolia	Cantua_cuzcoensis	Cobaea_scandens	Collomia_rawsoniana	Eriastrum_wilcoxii	Gilia_achilleifolia	Gilia_capitata	Gilia_diegensis	Gilia_leptantha	Hordeum	Ipomopsis_aggregata	Lactuca_sativa	Leptodacylon_pungens	Linanthus_grandiflorus	Loeseliastrum_matthewsii	Madia_bolanderi	Navarretia_divaricata	Nicotiana_tabacum	Oryza	Phlox_diffusa	Phlox_gracilis	Pisum	Polemonium_occidentale	Sinapsis	Solanum_tuberosum	Acanthogilla_gloriosa
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M40c11x5x95c20c28c52;
	DIMENSIONS NCHAR=270;
	FORMAT  MISSING=? GAP=- SYMBOLS= " A T C G 0 1";
	MATRIX
		Allophyllum_giliodes           TTAGGGTCCGTTTATCCAGACCGTTACAGGTCACAGGGCCTTCTATAAGCCCTCCCACTCTGACCTGGCAAGTTGTAAGTAGGGAGCTGTTAGCGGTCCATCCTGAGTCCGGTGTCGGATCACGTTAATAGGCTGCGTCCTCACGTATATCCTTCAGCAAGGCGATTCAGAGGTACACCTGTGTAACTACCGCGATTCCGAAACTTGTCCCAAAGGTTTGCGCCGGGG---CAAAGACATATT?TTTGTTGTCGATAATGACGATCGGG1
		Bonplandia_geminiflora         TTAGGATCCTTTTATCCGGACCGTTACAGGTCACAGGGCCTCCTCTCAGCTCTCCCACTCTGGCCTCGCAAGCTGCAAGTAGGTAGCTATTGGCGATCCAGAGTAATTCAGTCGTCGGAAGACGTTAATGAGCTGCGTTCTTACTTATATCCCTCACGAAGGTGATTCAGGGGTACACATGTGTAATTACTGAGATTCGGAGACTTGTCCCAAAAGTTTCCGCCGGGGTTAAAAAGGTATATTGTTTGTTATCTATTACAATGATCGGG0
		Cantua_buxifolia               TTAGGGCCCTTTTATCCGGACCGTTACAGGTCACAGGGCCATCTCTCAGCCCTCTCACTCTGGCCCCGCAAGCTGCAAGGAGGTAGCTATTGGCGATCCATAGTAATTCCGGCGTCGTAAGACGTTAATGAGCTGTGTTCTCACGTATATCCCTCAGCACGGTGATTCCGGGATACACATGTGTAATTACTGAGATTTGGAGACTTATCCCAAAAATTTCCGCCGGGGTTAAAAA?ACATATTGTTTTTTATCTATCATAACGATCGGG0
		Cantua_cuzcoensis              TTAGGGCCCTTTTATCCGGACCGTTACAGGTCACAGGGCCATCTCTCAGCCCTCTCACTCTGGCCCCGCAAGCTGCAAGGAGGTAGCTATTGGCGATCCATAGTAATTCCGGCGTCGTAAGACGTTAATGAGCTGTGTTCTCACGTATATCCCTCAGCACGGTGATTCCGGGATACACATGTGTAATTACTGAGATTTGGAGACTTATCCCAAAAATTTCCGCCGGGGTTAAAAAGACATATTGAATTTTATCTATCATAACGATCGGG0
		Cobaea_scandens                TTAGGGTCCTTTTATCCGGACCGTTACAGGTCACAGGGCCTCCTCTAAGCCCTCCCACTCTGGCCCCGCAAGCTGCAAGTAGGTAGCTATTGGCGATCCATGTTAATTCCGGCGTCGGAAGACCTTAACGAGCTGCGTTCTCATGTATATCCCTCAGCAAGGTGATTCAGGGGTACACCTGTGTAATTACTAAGATTCCGAGACTTGTCTCAAAAGTTTCCGTCGGGGTTAAAAAGGCATATTGTTTGTTGTTTATCATAACGATCGGG0
		Collomia_rawsoniana            ???????????TTATCCCTACCGTTACAGGTCACAGGGCCTTCTATAAGCCCTCCCACTCTGACCCGGCAAGCTGTAAAGAGGGAGTTGTTAAAAGTCCATCCTGAGTCCGGCGACGGCAGACGTTAACGAGCTGTGTCCTCACGTATATCATTCACGAAGGCGATTCAGAGGTACACCTGTGTAACTACCGCGATTCTGAAACTTGTCTCAAAGGTTTCCGCCGGGG---CAAAGGCATATTGTTTGTTATCGATCATGATGATCGGG1
		Eriastrum_wilcoxii             TTAGGGTCCTTTTATCTAAAACGTTACGGGTCACAGGACCTCCTCTAAGCCCTCCCACTCTGACCCCGCAAGCTGTAAGTAGGTACCTATTGGCGGTCCATAGTAATTACGGCGTCGGAAGACGTTAATAAGCTGCGTCCGTACGTATATCCCTCGGCAAGATGATTCAGATATACACATATGTAATTACTGAGGTTCAGAGACTTGTCCAAAAAGTTTACGCGGGGGCCAAAAAGGCATATTGTTTGTTATCTATCATGATGATCGGG0
		Gilia_achilleifolia            ????????????T?TCCAGACCGTTACAGGTCACAGGGCCTCCTCTAAGCCCTCCCACTCTGACCCGACAAGCTGTAAGTAGGTAGCTGCTGGTGGTCCATAGTTATTCCGGCGTCGGAAGACGTTAGTAGGCTGCATCCTCACGTATATCCTTCGGCAAGGCGATTCAGAGGTACACCTGTGTAACTACCGCGATTCCGAGACTTGTCCCAAGGGTTTCCCCTGGTT---CAAAGGCATATTGTTTGTTATTTATCATGACGATCGGG1
		Gilia_capitata                 ????????????TATCCAGACCGTTACAGGTCACAGGGCCTCATCTAAGCCCTCCCACTCTGACCTGGCAAGTTGTAAGTAGGTAGCTGCTGGTGGTCCATAGTTATTCCGGCGTCGGATGACGTTAATAGGCTGCATCCTCACGTATAT?CTTCGGC??GGCGATTCAGAGGTACACCTGTGTAACTACCGCGATTCCGAGACTTGTCCCAAGGGTTTCCCCTGGTT---CAAAGGCATATTGTTTGTTATTTATCATGACGATCGGG1
		Gilia_diegensis                ????????????TATCCAGACCGTTACAGGTCACAGGGCCTCCTCTAAGCCCTCCCACTCTCACCCGACAAGCTGTAAGTAGGTAGCTGCTGGCGGTCCATGGTTATTCCGGCGTCGGAAGACGTTAATAGGCTTCATCCTCACGTATATCCTTCGGCAAGGCGATTCAGAGGTACACCTGTGTAACTGTCGCGATTCCGAGACTTGTCCCAAGGGTTTCCCCCGGTT---CAAAGGCATATTGTTTGTTATTTATCATGACGATCGGG1
		Gilia_leptantha                TTAGGATCCGTATATCCAGACCGTTACAGGTCACAGGGCCTCCTCTAAGCCCTCCCACTCTGACCCGACAAGCTGTAAGTAGGTAGCTGCTGGCGGTCCATAGTTATTCCGGCGTCGGATGACGTTAACAGGCTGCATCCTCACGTATATCCTTCGGCAAGGCGATTCAGAGGTACACATGTGTAACTATCGCGATTCCGAGACTTGTCCCAAGGGTTTCCCCCGGTT---CAAGGCATTATTGTTTGTTATTTATCATGACGATCGGG1
		Hordeum                        ACAGCTTTTTAGTGCCCACACCATCTTTTGACGCGGGACCTCCGACTCTGCTTCTAGACCTACATCCTTGTTAGACGGTCAGATCCGAATGAACGATCCATAGCCGCTCCCGCATAGTCAACTGGCGGTACATTAGGTAGGTATGTGGGTCTCTTACTGACGTGCACCAGAGTTACATACGAAACATTGTTGTAATTCGGAAGATTGTGCCCAAAACAAC--------CTTTCTTTCAGTGGACCCATGGTATGGTATTGGTTTATTCG0
		Ipomopsis_aggregata            ????????????TATCCAGACCGTTACAGGTCACAGGGCCTCCTCTAAGCCCTCTTACTTTGACCCCGCAAGCTGTAAGTAGGTAGCTATAGGCGGTCCATAGTAATTCTGGCGTCGGAAGACGTTAATAAGCTGCGTCCGCGCGTATATCCCTCGGCAAGGTGATTCAGAGATACACATGTGTAATTATTGAGATTCGGAAACTTGTCCCAAAA-----CGCGGGGGCTAAAAAGGCATATTGTTTGTTGTCTATCATGATGATCGGA0
		Lactuca_sativa                 TCAGGGTTCTTTTATCTGCACACTTACCGGTCACAGGGTTTCCTCTCATCCCTTCCGTTCGGGCGCCTCAATCCGCAAGCTGA?AGCTATTGGTGAGCTATTGTAATGCTGGAGGTTTAAAAA???????????????????????????????????????????????AGTTGCATACTTGTAATTCCTGAAACTCGGAAAATCGCCTCAAGGGTTTCTCCGAAGGTACAGAAGGCGGATTGTTTGTTATGTATCATGATGGCCCGG0
		Leptodacylon_pungens           TTAGGGTCCTTTTATCCCGACCGTTACAGGTCACAGGGCCTCCTCTAAGCCCTCCCACTCTGACCCGGCAAGCTGTAAGTAGGTAGAGATTGGCGGTCCATAGTAA?TCCGGCGTCGGAAGACGTTAAAAAGCTG?GTCCTCACGTATATCCCTCGGCAAGGTAATTCAGAGGTACACCTGCGTAATTACTGTGATTCGGAGACTTGTCCAAAAAGTTTCCGCCGGGGCCAAAAAGGCATATTGTTTGTTATCTATCATGACGATCGGG0
		Linanthus_grandiflorus         TTAGGGTCCTTTTATCTAGACGCGTACAGGTCACAGGGCCTTATCTAAGCCCTACTACTCTGACCCGGCAAGCTGTAAGTAGGTAGATATTGGTGGTCCATAGTAATTCCGCCGTCGGAAGACCTTAAAAAGCTGCGTCCTCACGTATATACCTCGGCAAGGTAATTCAGAGGTACACCTG?GTAATTATTGTGATTCGGAGACTTGTCCAAAAAGTTTACGCCGGGATCAAAAAGGCATATTGTTTGTTACCTATCATGACGATCGGG0
		Loeseliastrum_matthewsii       ????????????TATCCAGACCGTTACAGGTCACAGGACCTCCTCTAAGCCCTCTCAATCTGACCCCGCAAGCTGTAAG?AGGTACCTATAGG????CCATAGTAATTACGGCGTCGGAAAACGTTAATAAGCTGCGTCCTAACGTATATCCCTCGGCAAGATGAGTCAGATATACACATGTGTAATTACTGAGATTCCGAGACTAGTCCCAAAAGGTTACGCGGGGGCCAAAAAGGCATATTGTTTGTTATCTATCATGATGATCGGG0
		Madia_bolanderi                TTAGGGTTCTTTTATCTGCACACTTACCGGTCACAGGGTTTCCTCTCATCCCTTCTGTTCGGGCGCCTCAATCCGCAAACCGATAGCTATTTGTGATGTATTGTAATGCCGGAGTTTGAAAAA???????????????????????????????????????????????AGTTGCATATTTGTAATTCTTGAGGCTCAGAAAATCGCCTCAAGAGTTTCTCCGAAGGTCCAGAAGGCGGATTGTTTGTTGTGTATCACGATGGCCCTG0
		Navarretia_divaricata          TTAGGGTCCGTTTATCCATACCGTTACAGGTCACAGGGCCTTCTATAAGCCCTCCCACTCTGACCCGGCAAGCTGTGAATAGGGAGTGGTTAACAGTCCATCCTGAGTCCGGCGTCGAAAGACGTTAATAGGCTGCGTCCTTACGTATATCATTCAGCAAGGCGATTCAGAGGTACACCTGTGTAACTACCGCGATTCCGAAACTTGTCCAAAAGGTTTCCGCCGGGG???CAAAGGCATATTGTTTGTTTCTCAATATTTACAATGGG1
		Nicotiana_tabacum              TCAGGGTTCTTTTTTCCGCATCGCTCTCGCTTCAAGGGCCTCCTCTCATCCCGTCAGCTCTGGCTCCTCAATCTGTAATCCAATAGCAATTGGCGATCCCTTGTAATTCTGGAAGTGAACACCGTTAGCAGGTTTCGTACTCATGGGTGCCTTTCACTCACATGATTCAGAGTGACACATTCATAATCGCTGAGACACGTCGAACTGCCCCACGAGCTTCGTTGGGGAGAAAGAAGTCGGATTGTTTGTTTTGTATCATGACGGCGTCG0
		Oryza                          ACAGATCTCTAGTGTCCGCCGCATCCTTTGACACGCAGCCTCCGACTCTGCTTCTCGGCTTACATTCTTGTTAGACGGTCAGATCCAAATGAACGATCCAAAGCTGCTCCCGTAGAGCCAACTGGCGGTAAATTACGTGGGTGTGTGGGTCTCCTACTAACGTGCACCAGAGTTACATACGAGACGTTGTTGTAATTCGGAAGATTGTGCCCAAAACAAC--------TCTTCTTTCCGTGGACCCATGGTATGGATTTCTCTATCGCG0
		Phlox_diffusa                  ????????????TATCTAGACGCTTACAGGTCACAGGGCCTCCTCCAAGCCCTCCCACTCTGACCCGGCAAGCTGTAAAAAGGTAGATATTGGCGGTCCATAGTAATTCCGCCGTCGGAAGACTCTAAAAAGCTGCGTCCTCACGTATATCCCTTGGCAAGGTAATTCAGAGGTAACACTGCGTAATTACTGTGATTCGGAGACTTGTCCAAAAAGTTTCCGCCGGGGTCAAAAAGGCATATTGTTTGTTACCTATCATGACGATCGGG0
		Phlox_gracilis                 ????????CTTTTATCTAGACGCTTA?AGGTCACAGGGCCACCTCCAAGCCCTCCCACTCTGACCCCGCAAGCTGTAAATAGGTAGATATTGGCGGTCCATAGTAATTCCACCGTCGGAAGACTCTAAAAGGCTGCGTCCTCACGTATATCCCTTGGCAAGGTAATTCAGAGGTAACACTGTGTAATTACTGTGATTCGGAGACTTGTCCAAAAAGTTTACGCCGGGGTCAAAAAGGCATATTGTTTGTTACTTATCATGACGATCGGG0
		Pisum                          TCGATGCCTTTTCACTTACCACGTTATGTGTCACAAGGCATCCTCACATCATTTGTACTTTGGCTCGTCAGTCGGCGAACCGAATGTTATCAAGGATTAATAGTAATTCCAACGGTGGAAAATGTTAGCGGGTCGCGCCTTTATTGGAGCCCTTTACCAAGGTGATTTAAGGTTACACATTCGTAATCATTAAGACTCAGAGAAATGTTTCAAGAGATTCCTCAGAGGTAAAGAAATCGTATTGTTTGTTCTTCAGTACGACGGTCGGG0
		Polemonium_occidentale         TTAGGGTCCTTTTATCTAGACCGTTACAGGTCACAGGGCCTCCTCTAAGCCCTCCCACTCTGACCCCGCAAGCTGTAAGTAGGTAGCTATTGGCGGTCCATAGTAAGTCCGGCGTCGGAAGACGTTAATAAGCTGCGTCCTCATGTATATCCCTCGGCAAGGTGATTCAGAGGTACACCTGTGTAATTACTGAGATTCAGAGACTTGTCCCAAAAGTTTCCGCCGGGGCCAAAAAGGCCTATTGTTTGTTATCTATCATGACGATCGGG0
		Sinapsis                       ACGATGCCCTTTCATTTGTAACGTTCCGAGTTATGCAGTATTCTTAGATATTTTACGTTTTGGCTTCTTAGTCTGCAATCAGATAGTTAGCAACGATGCAACATAACTTATGGGGTGTAAAATGTTAGCAGACCAGGCACTCATTGGTGCACTCCACTAAAGTGATTTAAGGTTACACATTCGTAGTTGCTGAAACTCGGGGCACTATCCCAAGAAGTGACCAAAAGATAACGAGTGCGGGTTGTTTGTTCTATCTTATGATGGTCCGA0
		Solanum_tuberosum              TCAGGGTTCTTTTTTCCGCATCGCTCTAGCTTCAAGGGCCTCCTCCCATCCCGTCAGCTCTGGCTCATCAATCTGTAATCCAATACCAATTGGCGAGCCCTTGTAATTCTGGAAGTGACCACCGTTAGCAAGTTTCGTACTCATGGGTGCCTTTCACTCACATGATTCAGAGTGACACATTAATAATCGCTGAGACACGTCGAACTGCCCCACGAGCTTCGTTGGGGAGAAAGAAGTCGGATTGTTTGTTTTGTATCATGACGGCGTCG0
		Acanthogilla_gloriosa          TTAGGGTCCTTTTATTCGGACCGTTACAGGTCACAGGGCCTCCTCTCAGCCCTCCCACTCTGGCCCCGCAAGCTGCAAGTAGGTAGCTATTGGCGGTCCATAGTAATTCCGGCGTCGGAAGACGTTAATGAGCTGCGTCCTCACGTATATCCCTCAGCAAGGTGATTCAGGGGTACACATGTGTACTTACTGAGATTCGGAGACTTGTCCCAAAAGTTTCCGCCGGGGTCAAAAAGGCATATTGTTTGTTATCTATCATGACGATCGGG0
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END;