#NEXUS
[written Wed Jan 18 11:12:14 EST 2012 by Mesquite  version 2.75 (build 566) at ComPhy.local/10.0.1.4]

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	TITLE  Lepidostroma_LSU;
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	MATRIX
	Tylospora_asterophora_AF325323_18996435         ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AATAAGCGGAGGAAAAGAAAC-TAACAAGGATTCCCCTAGTAACTGCGAGTGAAGCGGGAAAAGCTCAAATTTAAAATCTGGCG-GTCTC--CGG-CCGTCCGAGTTGTAATCTGGAGAAGCGTTT-TCCGCGTCGGA-CCGTGTACAAGTCTTCTGGA-ACGGAG-CGTCGTAGAGGGTGAGAATCCCGTCTCTGACACGGACTG-CCGATGCTTTTGTGATACGCTCTCGAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAACGTTTGAAGTCAGTCGCGTCGGCCGAGA-CTCAACCTTGCGA-------TCTCGCTTGGTGTACTTCT-CGG-TC-GACGGGTCAGCATCAATTTCGA-CCGTCGGATAAAGGCCG-AG-GGAATGTGGCAT-CCTTCGGG--GT-GTGT-TATA--GCCTT--TGGTTCGGATACGGCGATTGGGATTGAGGAACTCAGCACG-------------CCTTTATTGG-----TCGGGGCTTCGG---------CCCACGTT----------A---ACGTGCT---TAGGATGCT----GGCATAAT-----GGC----TTTAAGCGACCCGTCTT--GAAA-----CAC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
	Acantholichen_pannarioides_EU825953_194354456   GGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTAACGAACTCTCGAAGGACGCAGTTGCTGCTGGACTTCTCAGAAGTCAACGTGCACACAGTATCTTTCTTCTCGTTCGATCATCTACCCCTATCTGTGCACCCCTCGTAGGCTGACATCTCTCGGCCTATGCTCTTTCCACAAAGCATCCTTAATATATCAGTGAA?GCGCAGTCGTTCGAGCCTCGTCTCAACGCA?CGTTTAT?T?T?ACTTTCAACAACGGACT?TTGGCTCTCGCATCGATAAAGAACGCAGCGAAGTGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCT?GCGCCCCTTGGTACTCCGAGGGGCATGCCTGTTTGAGTGTCATCAGACCATCAACCCGAAAGGCTTTCGAGCTCATCGGTGTTTGGAGCTTGCGGCGTGCGGGGATCGCTCTCGCGAGCGCTCCGCTCCTCGCGGAATACATCAGCGGATGTCCACTTGCGGTCCAGCCA-----------------TGG?GTGATAACTGTCTACGCTCTGGCATGGGTCGCGTGCCCTTGGCTCTGCTTCAAACGGTTGCCATTCACCCGACGGGGGGGGGGGGGGGAAAACCCGCTGAACTTAAGCATATCAATAAGCGGA-GAAAAGAAAC-TAACAAGGATTCCCCTAGTAACTGCGAGTGAAGCGGGAAAAGCTCAAATTTAGAATCTGGCG-GTCCCCGCGG-TCGTCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGCGTCA-TCCGCGCCAGC-CCGCGTACAAGTCTCTTGGA-ATAGAG-CGTCGCAGAGGGTGAGAATCCCGTCTCTGACGCGGACTG-CTGGCGCGT-TGCGATGCGCTCTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCGTACGCTGGGA-ATCAACCTTCTC---------TCGAGTCGGCGCACTTCC-CAG-CG-AACGGGTCGGCATCAATTTCAT-CTGCCGGAGAAAGG-CGAGG-GGAATGTGGCA--TCTTC-AG--AT-GTGT-TATA--GCCTC--CCG-TCATATGCGGCAGATGGGATTGAGGATCTCAGCACG-------------CCGCAA--GG-----CCGGGGC----TCG-------CCCACG------------T---ACGTGCT---TAGGATGCC----GGCATAAT-----GGC----TTTAATCGACCCGTCTT--GAAA-----CACGGACCAAGGAGTCTAACATGCTCGCGAGTGTTTGGGTG--T-C-AAACCCGAGCGCGCAACGAAAGTG-AAA-GTTGAG-AT-CTCTGTCATGGAGAGCATCGACGCCCAGACCAGA-CCTTCTG-CGACGGATCTGCGGTCAAGCGCGTATGTTGGGA-CCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGCGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGTAGCGATTCTGACGTGCAAATCGATCGTCGAATTTGGGTATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACCAT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTAGTAGCTGGTTCCTGCCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGAAACTCGT--ATCAGATTTATGTGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTTGGGGTTGAAACAACCTTAACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAACGGGGGGTCTCTTGATTGGACCTCCCGGCGATTGAGAGTTTCTAGTGGGCCATTTTTGGTAAGCAGAACTGGCGATGCGGGATGAACCGAACGCGAGGTTAAGGTGCCGGAATTCAC-GCTCATCAGACACCACAAAAGGTGTTAGTTCATCTAGACAGCAGGACGGTGGCCAT-GGAAGTCGGAATCCGCTAAGGAGTGTGTAACAACTCACCTGCCGAATGAACTAGCCCT-GAAAATGGATGGCGCTTAAGCGTGATACCCATACCTCGCCGTCGGCGTTCAAG-TGACGCGCCGACGAGTAGGCAGGCGTGGAGGTC-CGTGAAGAAGCCTCGGGCAGCAATGCTGGGGT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
	Athelia_pyriformis_EU118605_157057257           CAAACAGA-----------------------------------------------------CCAAAGGTAGGCGGTCGTCGCTGGTCTCCCTCACAGGAGACATCGTGCGCGCCCCTATCTTCTCTTTCATTCATCTACCCCTATCTGTGCACCCTATGTGGGCCGACATAGTTCGGTTCACGCTTTCAATACA------CCCTTCTTAAACATTCAATGAACGAATTCATTCGAGCTCAGTCTCGATATAATCTAATACAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCCCCTTGGTATTCCGAGGGGCATGCCTGTTTGAGTGTCATTAAATTATCAACGCCGAAGCGCTTTACCGCGCCTTCGGTGCTTGGACTTTGGAGTCGTGCAGGTCCCCTTTCGGATCTGCTCCTCTTGAAATGCATTAGCAGAGCGCAGACCTGCCCTGGCGTGATAATTATCTACGTCGCGGCCGCGAAGCTCACCTTCTGCTCACAACCGTCGCCGTCAAGGTGACTATATGCGGTGTATACGCAATGACAATTTTGACCTCAGATCAGGTAGGATTACCCGCTGAACTTAAGCATATCAATAAGCGGAGGAAAAGAAAC-TAACAAGGATTCCCCTAGTAACTGCGAGTGAAGCGGGAAAAGCTCAAATTTAAAATCTGGCG-GCCCTCGCGG-TCGTCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGTGACA-TCCGTGC?GG?-CCG?GTACAAGTCTCTTGGA-ATAGAG-CGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTCTGCCGCGGACTA-CCGGTGCAT-TGTGATGCGCTCTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCGTCGGTTGGGG-ATCAGCCTTCTC---------TCGAGTTGGCGTACTTCC-CAG-TC-CACGGGTCAGCATCGATTTCGT-CCGTCGGAAAAAGG-TGGGA-GGAATGTGGCA--TCTCC-GG--AT-GTGT-TATA--GCCTC--TCG-CTGTATGCGTCGGTCGGGATCGAGGTTCGCAGCGCG-------------CCGCAA--GG-----CCGGGGT----TCG-------CCCACG------------T---CCGCGCT---TAGGATGCT----GGCATAAT-----GGC----TTTAATCGACCCGTCTT--GAAA-----CACGGACCAAGGAGTCTAACATGCTCGCGAGTGTTTGGGTG--T-C-AAACCCGAGCGCGCAACGAAAGTG-AAA-GTTGAG-AT-CTCTGTCATGGAGAGCATCGACGCCCAGACCAGA-CCTTTTG-TGACGGATCTGCGGTCGAGCGCGTATGTTGGGA-CCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGCGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGTAGCGATTCTGACGTGCAAATCGATCGTCGAATTTGGGTATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACCAT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTAGTAGCTGGTTCCTGCCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGAAACTCAT--ATCAGATTTATGTGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTTGGGGTTGAAACAACCTTAACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAACGGGGGGTCTCTTGATTGGACCTTCCGGCGATTGAGAGTTTCTAGTGGGCCATTTTTGGTAAGCAGAACTGGCGATGCGGGATGAACCGAACGCGAGGTTAAGGTGCCGGAATTCAC-GCTCATCAGACACCACAAAAGGTGTTAGTTCATCTAGACAGCAGGACGGTGGCCAT-GGAAGTCGGAATCCGCTAAGGAGTGTGTAACAACTCACCTGCCGAATGAACTAGCCCT-GAAAATGGATGGCGCTTAAGCGTGATACCCATACCTCGCCGTCAGCGTTCAAG-TGACGCGCTGACGAGTAGGCAGGCGTGGAGGTC-AGTGAGGAAGCC-T-GGCAGCGATGCTGGTGAAA????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
	Galerina_marginata_DQ457669_92090890            ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGAACTTAAGCATATCAATAAGCGGAGGAAAAGAAAC-TAACAAGGATTCCCCTAGTAACTGCGAGTGAAGCGGGAAAAGCTCAAATTTAAAATCTGGTG-GTCTTT--GG-CCATCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGTGTTA-TCCGCGCTGGA-CCGTGTACAAGTCTCCTGGA-ATGGAG-CGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTTTGACACGGACTG-CCAGGGCTT-TGTGATGCGCTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGCTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCGTTGGCCGGGA-ATCAACCTTGCT---------TTTGCTGGGCGTACTTTC-CGG-TT-GACGGGTCAGCATCAATTTTGA-CCGTTGGATAAAGT-TCAAG-GGAATGTGGCA--TCTTC-GG--AT-GTGT-TATA--GCCTT--TGT-TCGCATACAACGGTTGGGATTGAGGAACTCAGCACG-------------CCGCAA--GG-----CCGGGTATTTAT---------ACTACG------------T---TCGTGCT---TAGGATGCT----GGCATAAT-----GGC----TTTAATCGACCCGTCTT--GAAA-----CACGGACCAAGGAGTCTAACATGCCTGCGAGTGTTTGGGTG--G-A-AAACCCGAGCGCGTAATGAAAGTG-AAA-GTTGAG-AT-CCCTGTCGTGGGGAGCATCGACGCCCGGACCAGA-CCTTTTG-TGACGGATCCGCGGTAGAGCATGTATGTTGGGA-CCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGTAGCGATTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGTATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACCAT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTAGTAGCTGGTTCCTGCCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGAAACTCAT--TTCAGATTTATGTGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTTGGGGTTGAAACAACCTTAACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAACGAGCCGTCTCTTGATTGGACCGCTCGGCGATTGAGAGTTTCTAGTGGGCCATTTTTGGTAAGCAGAACTGGCGATGCGGGATGAACCGAACGCGAGGTTAAGGTGCCGGAATTCAC-GCTCATCAGACACCACAAAAGGTGTTAGTTCATCTAGACAGCAGGACGGTGGCCAT-GGAAGTCGGAATCCGCTAAGGAATGTGTAACAACTCACCTGCCGAATGAACTAGCCCT-GAAAATGGATGGCGCTTAAGCGTGATACCCATACCTCGCCGTCAGCGTTGAAG-TGACGCGCTGACGAGTAGGCAGGCGTGGAGGTC-AGTGAAGAAGCCTT-GGCAGTGATGCTGGGTGAAACGGCCTCTAGTGCAGATCTTG??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
	Kuehneromyces_rostratus_DQ457684_92090905       ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GCTGAACTTAAGCATATCAATAAGCGGAGGAAAAGAAAC-TAACAAGGATTCCCCTAGTAACTGCGAGTGAAGCGGGAAAAGCTCAAATTTAAAATCTGGCG-GTCTCT--GG-CCGTCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGTGTTA-TCCGTGCTGGA-CCGTGTACAAGTCTCCTGGA-ATGGAG-CGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTTTGACACGGACTG-CCAGTGCTT-TGTGATGCGCTCTCAAAGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCGTTAGTTGGGG-ATCAACCTTGCT---------TTTGCTGGGTGTACTTTC-CAA-TT-GACGGGTCAGCATCAATTTTGA-CCGTTGGATAAAGT-CTAGG-GGAATGTGGCA--TCTTC-GG--AT-GTGT-TATA--GCCCT--TGG-TCGCATACAACGATTGGGATTGAGGAACTCAGCACG-------------CCGCAA--GG-----CCGAGAATTTAT---------TCTACG------------T---TCGTGCT---TAGGATGCT----GGCATAAT-----GGC----TTTAATCGACCCGTCTT--GAAA-----CACGGACCAAGGAGTCTAACATGCCTGCGAGTGTTTGGGTG--G-A-AAACCCGAGCGCGTAATGAAAGTG-AAA-GTTGAG-AT-CCCTGTCGCGGGGAGCATCGACGCCCGGACCAGA-CCTTTTG-TGACGGCTCCGCGGTAGAGCATGTATGTTGGGA-CCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGTAGCGATTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGTATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACCAT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTAGTAGCTGGTTCCTGCCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGAAACTCAT--TTCAGATTTATGTGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTTGGGGTTGAAACAACCTTAACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAACGAGCCGTCTCTTGATTGGACCGCTCGGCGATTGAGAGTTTCTAGTGGGCCATTTTTGGTAAGCAGAACTGGCGATGCGGGATGAACCGAACGCGAGGTTAAGGTGCCGGAATTCAC-GCTCATCAGACACCACAAAAGGTGTTAGTTCATCTAGACAGCAGGACGGTGGCCAT-GGAAGTCGGAATCCGCTAAGGAGTGTGTAACAACTCACCTGCCGAATGAACTAGCCCT-GAAAATGGATGGCGCTTAAGCGTGATACCCATACCTCGCCGTCAGCGTTGAAG-TGACGCGCTGACGAGTAGGCAGGCGTGGAGGTC-AGTGAAGAAGCCTT-GGCAGTGATGCTGGGTGAAACGGCCTCTAGTGCAGATCTTGGT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????
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	Serpula_himantioides_AJ440943_117585062         ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GCATATCAATAAGCGGAGGAAAAGAAAC-TAACAAGGATTCCCCTAGTAACTGCGAGTGAAGCGGGAAGAGCTCAAATTTTGAATCTGGCG-GTCCTCGTGG-TCGTCCGAGTTGTAATCTAGAGAAGCGTTT-TCCGCGCTGGA-CCGTGTACAAGTCTCCTGGA-ACGGAG-CGTCATAGAGGGTGAGAATCCCGTCTCTGACACGGACTA-CCAGGGCTTTTGTGATGCGCTCTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCAAATTGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATACAGGCGAGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGCTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCGCGTTGGCCGGGG-ATCAGCCTTGCAA-------TCTTGTTGGGTGCATTTCC-TGG-TT-GACGGGTCAGCATCGATTTTGA-CCGTCGGAGAAGGG-TCGAG-GGAATGTGGCAT-CCTTCGGG--GG-GTGT-TATA--GCCTT--TGA-TCGTATGCGACGGTTGGGATCGAGGAACTCAGCATGA--------CC--CCTCGTGGGT-----TTGGGGCTTCGG---------CTCACA------------T---CCATGCT---TAGGATGCT----GGCATAAT-----GGC----TTTAAGCGACCCGTCTT--GAAA-----CACGGACCAAGGAGTCTAACATGCCCGCGAGTGTTTGGGTG--TTTAAAACCCGAGCGCGTAATGAAAGTG-AAA-GTTGAG-AC-CTCTGTCGTGGAGGGCATCGACGCCCGGACCAGA-ACTTTTG-TGACGGCCCTGCGGTAGAGCGCGTATGTTGGGA-CCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGTAGCGATTCTGACGTGCAAATCGATCGTCGAATTTGGGTATAGGGGCGAAAGACTAATCGAACCAT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTAGTAGCTGGTTCCTGCCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGAAACTCACTGATCAGATTTATGTGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTTGGGGTTGAAACAACCTTAACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAACGAGCCGTCTCTTGATTGGACCGCTCGGCGATTGAGAGTTTCTAGTGGGCCATTTTTGGTAAGCAGAACTGGCGATGCGGGATGAACCGAACGCGAGGTTAAGGTGCCGGAATGCAC-ACTCATCAGACACCACAAAAGGTGTTAGTTCATCTAGACAGCAGGACGGTGGCCAT-GGAAGTCGGAATCCGCTAAGGAGTGTGTAACAACTCACCTGCCGAATGAACTAGCCCT-GAAAATGGATGGCGCTCAAGTGTGTTACCCATACCTCGCCGTCGGCGTTGAAG-TGACGCGCCGACGAGTAGGCAGGCGTGGAGGTC---GTGAAGAAGCCTTGGCAGTGATGCTGGGTGGAACCGCCTCTAGTGCAGATCTTGGTGGTAGTAGCAAATATTCAAGTGAGATCCTTGAAGACTGAAGTGGAGAAAGGTTCCGTGGTAACAGCAGTTGGACACGGGTCAGTCGATCCTAAGAGATAGGGAAACTCCGTTTAAAAGTGCATGATTCTTCATGCCGCCTATCGAAAGGGAATCCGGTTAATATTCCGGAACCAGAATGTGGAATTTTGAACGGCAACGTAAATGAACTTGGAGACGTTGGCAAGGGCCCCGGGAAGAGTTATCTTTTCTCCTTAACAGCCTGAAACCCTGAAATCGGTTTGTCCGGAGCTAGGGTTTAATGGTTGGTAGAGCTCGGCAATTCTGTCGGGTCCGGTGCGTTCTTGACAGCCCTTGAAATCCAAGGGAATTATTAATTCTCACGTCTGGTCGTACTCATAACCGCAGCAGGTCTCCAAGGTGAACAGCCTCTAGTTGATAGAACAATGTAGATAAGGGAAGTCGGCAAAATAGATCCGTAACTTCGGGAAAAGGATTGGCTCTAAGGGTTGGGTGCGTCGGGCCTTGTGCAGGAAGCTTTCGGGCGATCCAGTTGGGGATTGTTTTACGACGATTTCTGGCCAGAGAGCCTGTCGGTGGGTGGCCTTGGCTTGTCCTTCGGGGCAGTTCCGGCGCACGCTTAACAACCAACTTAGAACTGGTACGGACAAGGGGAATCTGACTGTCTAATTAAAACATAGCATTGCGATGGCCAGAAAGTGGTGTTGACGCAATGTGATTTCTGCCCAGTGCTCTGAATGTCAAAGTGAAGAAATTCAACCAAGCGCGGGTAAACGGCGGGAGTAACTATGACTCTCTTAAGGTAGCCAAATGCCTCGTCATCTAATTAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCCACTGTCCCTATCTACTATCTAGCGAAACCACAGCCAAGGGAACGGGCTTGGCAGAATCAGCGGGGAAAGAAGACCCTGTTGAGCTTGACTCTAGTTTGACATTGTGAAAAGACATAGAGGGTGTAGCATAAGTGGGAGCTTCGGCGCCGTTGAAATACCACTACCTTTATCGTCTTTTTACTTATTCGATGATGCGGAGCTGGGATTAACAGTCCCACCTTTTGGCGTTAAGGTCCTTCGCGGGCCGATGCCGGGTTGAAGACATTG??AGGTGGGGAGTTTGGCTGGGGCGGCACATCTGTTAAAAGATAACGCAGGTGTCCTAAGGGGGACTCATCGAGAACAGAAATCTCGAGTGGAACAAAAGGGTAAAAGTCCCCTTGATTTTGATTTTCAGTGTGAATACAAACCATGAAAGTGTGGCCTATCGATCCTTTAGTCCCTCGGAATTTGAGGCTAGAGGTGCCAGAAAAGTTACCACAGGGATAACTGGCTTGTGGCAGCCAAGCGTTCATAGCGACGTTGCTTTTTGATCCTTCGATGTCGGCTCTTCCTATCATACCGAAGCAGAATTCGGTAAGCGTTGGATTGTTCACCCACTAATAGGGAACGTGAGCTGGGTTTAGACCGTCGTGAGACAGGTTAGTTTTACCCTACTGATGGAGCGTCGTCGCAACAGTAATTGAACTTAGTACGAGAGGAACCGTTCATTCAGATATTTGGTATTTGCGCCTGTCCGATCGGGCAATGGCGCGAAGCTATCATCTGCTGGATTATGGCTGAACGCCTCTAAGCCAGAATCCGTGCTAGAAACGACGATATTTGGTCCCGCACATGTCAATTGAGTTGAGATAGAGCTTTGCTCGTGAACCAAATCAGGTGGGCTAGGCTCGTCGGGCGGAAATGCCTGGCGGGTTCGTCTACGAATTGCAATCATCATATGCGCGGGGGTGAATCCTTTGCAGACGACTTGAATGGGAACGGGGTACTGTAAGCGGTAGAGTAGCCTTGTTGCTACGATCCGCTGAGGTTAAGCCCTTGTTCTATAGATTTGTT
	Stephanospora_caroticolor_AF518652_22652964     ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TAACAAGGATTCCCCTAGTAACTGCGAGTGAAGAGGGAAAAGCTCAAATTTGAAATCTGGCG-GTCTTTATAG-CCGTCCGAGTTGTAATTTAGAGAAGTATTA-CCCGCGCTGGA-CCGTGTACAAGTCTCCTCGA-ACGGAG-CATCATAGAGGGTGAGAATCCCGTATATGACATGGACTA-CCAGGGCTTTTGTGGTGTGCTCTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATAGGCGAGAGACCGATAGTGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGGAAAGAGAGTTAAACAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAACGCTTGAAGTCAGTCATGTCT-CTCAGAGATCAACCTGGCCT-------TTTTGCTTGGTGCACTCTC-T-G-TGGGATGGGTCAGCATCAATTTTGA-CCGGGGGAAAAAG--TCTGTGGGGATGTGGCACCCTC----GT-GGTGTGT-TATAACCTGCT--TG---CATATACCTCGGTTGGGATTGAGGAACTCAGCACGCCGCAAGGCCGGACTT--------------------------------------------TTTAGTCACGTACGTGCT---TAGGATGCT----GGCATAAT-----GGC----TTCAATCGACCCGTCTT--GAAA-----CACGGACCAAGGAGTCTAACATGCCCGCGAGTGTTTGGGTG--A-A-AAACCCAAGCGCATAATGAAAGTG-AAA-GTTGAG-ACCTCTGTCGTG-GAGGGCATCGACGCCCGGATCAGA-TCTTTTG-GGACGATTCCGAGGTAGAGCGTGCACGTTGGGA-CCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGTAGCGATTCTGACGTGCAAATCGATCGTCGAATTTGGGTATAGGGGCGAAAGACTAATCGAGGCAT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????

;



END;

BEGIN TREES;
	Title Results;
	LINK Taxa = Taxa;
	TRANSLATE
		1 Tylospora_asterophora_AF325323_18996435,
		2 Acantholichen_pannarioides_EU825953_194354456,
		3 Athelia_pyriformis_EU118605_157057257,
		4 Galerina_marginata_DQ457669_92090890,
		5 Kuehneromyces_rostratus_DQ457684_92090905,
		6 Hygrophorus_flavodiscus_AY635769_49188468,
		7 Hygrophorus_pudorinus_DQ457678_92090899,
		8 Pterula_echo_AY629315_48773771,
		9 Hygrophoropsis_aurantiaca_AY684156_51449879,
		10 Paxillus_vernalis_AY645059_49481811,
		11 Exidia_uvapsassa_AY645056_49481808,
		12 Fomitiporia_mediterranea_AY684157_51449880,
		13 Athelia_decipiens_AY586632_46402555,
		14 Piloderma_olivaceum_DQ469289_93138955,
		15 Tylospora_asterophora_AY463480_46402658,
		16 Byssocorticium_pulchrum_AY586639_46402562,
		17 Fibulorhizoctonia_sp_AY635779_49188478,
		18 Albatrellus_skamanius_AF393044_15127916,
		19 Polyporoletus_sublividus_AF393066_15127938,
		20 Athelia_arachnoidea_AF518601_22652913,
		21 Athelopsis_subinconspicua_AY586634_46402557,
		22 Piloderma_byssinum_AY586699_46402622,
		23 Leptosporomyces_galzinii_EU118642_157057294,
		24 Piloderma_lanatum_AY586700_46402623,
		25 Dendrocorticium_roseocarneum_AF393053_15127925,
		26 Junghuhnia_subundata_AF518625_22652937,
		27 Laetisaria_fuciformis_AY293192_32187430,
		28 Gloeophyllum_sepiarium_AF393059_15127931,
		29 Polyporus_squamosus_AF393069_15127941,
		30 Echinodontium_tinctorium_AF393056_15127928,
		31 Thelephora_sp_AF287890_10717095,
		32 Lepidostroma_akagerae_FJ171733_217324115,
		33 Lepidostroma_akagerae_FJ171734_217324116,
		34 Lepidostroma_calocerum_FJ171737_217324119,
		35 Lepidostroma_calocerum_FJ171738_217324120,
		36 Lepidostroma_sp_nov_RV_MX16_LSU,
		37 Lepidostroma_rugaramae_FJ171735_217324117,
		38 Lepidostroma_rugaramae_FJ171736_217324118,
		39 Sarcodon_imbricatus_AF518646_22652958,
		40 Plicaturopsis_crispa_AY293203_32187441,
		41 Xerocomus_chrysenteron_AF071537_3243252,
		42 Bondarcevomyces_taxi_DQ534672_108744800,
		43 Exidiopsis_calcea_AY293180_32187418,
		44 Gautieria_otthii_AF336249_18461728,
		45 Dictyonema_glabratum_DQ917660_115361525,
		46 Lachnella_villosa_DQ097347_73672576,
		47 Hydnum_albidum_AY293186_32187424,
		48 Hydnum_rufescens_AY293187_32187425,
		49 Multiclavula_corynoides_U66440_2289047,
		50 Multiclavula_mucida_AF287875_10717080,
		51 Sistotrema_eximum_AF393076_15127948,
		52 Calocera_cornea_AY293170_32187408,
		53 Dacrymyces_sp_AY691892_51557893,
		54 Serpula_himantioides_AJ440943_117585062,
		55 Stephanospora_caroticolor_AF518652_22652964;
	TREE RAxML_best_tree = (((11:0.02305648725981128,43:2.33420284619903E-6):0.07381304875221291,(52:0.048239256580266655,53:0.09975384434196354):0.15195149731326607):0.014339013034178538,((31:0.04040536757530848,39:0.014860578269135198):0.001830315955353732,((26:0.02157622709188302,29:0.037734921427113356):2.33420284619903E-6,((28:0.03558694132584659,(44:0.08719119387970202,(51:0.057528238205961556,((47:0.02843471329043347,48:0.04843720991832466):0.06393524962237629,(49:2.33420284619903E-6,50:2.33420284619903E-6):0.02942675126866782):0.04464089423887222):0.10149114515330765):0.013980289719654279):0.02038172765700335,((25:0.02796112968133294,27:0.0592427113339656):0.02724705125698149,(12:0.09969207841815486,(((40:0.07991555190956828,((42:0.0427807869144375,54:0.03825309602819853):0.011558728489395197,(9:0.004954451076418154,(10:0.03560659665737353,41:0.028921597841254296):0.055193068454596726):0.01763296445659227):0.03542600232377291):0.010555041658550151,(((4:0.012944952498216327,5:0.006419396805719694):2.33420284619903E-6,(6:0.05325926706962305,7:0.021550240050589795):0.04862218949866421):0.02182524337758969,((3:0.03240810240255446,(2:0.007647709132045809,45:0.021191237512975657):0.07189337129578925):0.07116846869034067,(46:0.11999233746526634,(8:0.04732968765151991,55:0.10761245384374366):0.0016399490109351624):0.013673062136515446):0.005430947013094428):2.33420284619903E-6):0.016767073765695403,((30:0.05518418416690328,(18:0.009509725084437613,19:0.0027923476641254857):0.028733969507287113):0.038563814352574236,(((32:2.33420284619903E-6,33:2.33420284619903E-6):0.040677285981091604,(36:0.017486452029951714,((34:0.009199209441191665,35:0.012400946540131998):2.33420284619903E-6,(37:2.33420284619903E-6,38:2.33420284619903E-6):0.003064310483990765):0.004793775225745792):0.038310635968045764):0.028718499073306085,((17:0.006010440407086424,(13:0.002999976020890816,20:2.33420284619903E-6):0.009569967566407071):0.01494353396985315,((21:0.01966519299466297,(16:0.027098098393398277,23:0.006082368771985981):0.021614241562440257):0.019266985520264956,((1:2.33420284619903E-6,15:2.33420284619903E-6):0.007987691270604877,(24:0.016495333053762794,(14:0.0026445113005484325,22:0.019734970809455257):0.006446319562295984):0.011610796255039219):0.0072912100618638155):0.007793217276231849):0.014026520578755215):2.33420284619903E-6):0.012511484744320744):0.00801735046155463):0.018386650775817567):0.00614058751424755):0.009313181669087773):0.022778348679663336):0.014339013034178538)[% ] [% ] [%  setBetweenBits = selected ];
	TREE Lepidostroma_bkbn = (((11,43),(52,53)),(12,28,40,44,(25,27),(26,29),(31,39),(30,(18,19)),(9,42,54,(10,41)),(51,((47,48),(49,50))),(46,(4,5),(6,7),(8,55),(3,(2,45))),(((32,33),((34,35),(37,38))),((1,15),(17,(13,20)),(24,(14,22)),(21,(16,23))))))[% ] [% ] [%  setBetweenBits = selected ];

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BEGIN SETS;
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END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
	TYPESET * UNTITLED   =  unord:  1 -  4548;

	EXSET * UNTITLED  =  1 -  706 760 -  776 815 -  818 880 -  883 890 -  893 1088 -  1098 1106 -  1122 1135 -  1145 1167 1180 -  1188 1196 -  1214 1222 -  1238 1268 -  4548;

END;

BEGIN CODONS;
	CODESET * UNTITLED   =  universal:  1 -  4548;


END;

BEGIN MESQUITECHARMODELS;
	ProbModelSet * UNTITLED   =  'Jukes-Cantor':  1 -  4548;
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Begin MESQUITE;
		MESQUITESCRIPTVERSION 2;
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