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Phytophthora_nicotianae_IRF27 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Phytophthora_nicotianae_Nic8vasi 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Phytophthora_nicotianae_P1334 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Phytophthora_nicotianae_P1335 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Phytophthora_nicotianae_P3549 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Phytophthora_nicotianae_P7449 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Phytophthora_nicotianae_PeperoneRC 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Phytophthora_nicotianae_Ph168 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Phytophthora_nicotianae_Ph3 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Phytophthora_nicotianae_Pomodoro 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Phytophthora_nicotianae_SCRP462 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Phytophthora_nicotianae_Serravalle1 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Phytophthora_nicotianae_Serravalle3 TTCGTCGGTGTCCTCGACGTCAAAAAGCTCGCCCACCTCACTCTCGAGTCTCGTGCGGCATACGTTTGGTCTAAAGAAGAAATCGAAAAGCACCGGCGACAGCGATTTTAACAACGAGGGAGCTACTAGCAACCAGCACACGCAGCACACGCACCATCATCACCACCGTCATCACCAATACCCGACTTCACAGGAACTGCCCGGGATCGTGCCATTCCCTGCCCAGAACAAGATGCTGGTATTGTGCGGTGATGTCTGTGCCAGCGATTCAAAATGCACGCACTGGGCCTGGAATAACTACAACGGCGGTACTTGCTGGTTCAAGACGGGCTCTCGRTCGGCCAAAACTGGCAAATGGGGCACGAACTGCGGCTACGTGGTATCTCGAAGCACCCAAGGTCAAAATCAAAACCAAGGCGAAGCACGGGGTCAGTCATCCAGCAGCGGTCTGTCTGCGTCCGAAATGGGCGAGATGCTGRGCCGGATCAACGCCTACCGCTCGCAGAATGGTCTACCTGGTCTCTCAATTGACAACCGATTGGTGAACGCTGCCGCTTTCCACTCTCAGGACCAGGCCAACAATTGCAAGATGCAGCACGCCGGCTCAAACGGCTCAAGGCTTGGTGACCGCATCAAGGCACAAGGTTACAACTTCAACATGGCTGCGGAGAACGTGGCTGCCGGTCAAAARTCTGTGGAGGAAGTCATGAATTCGTGGTGGAACTCGCCAGGCCACCGTGCCAACCTCCTCAACAAGAACGTGGAGAATGTCGGCTTCGCAAAGGATCTTGAGCCCGGTACAATGGACTCGGTCCGTGCCGGCCCCTACGGCCAGCTTTTCCGCCCGGACAACTTCGTGTTCGGACAGACGGGCGCCGGTAACAACTGGGCCAAGGGACACTACACTGAGGGTGCCGAGCTTATTGACTCGGTGCTCGACGTCGTCCGTAAGGAGGCCGAGAGCTGTGATTGCCTTCAGGGTTTCCAGATCACGCACTCGCTTGGTGGTGGTACCGGTTCCGGTATGGGTACGCTTCTTATCTCGAAGATTCGTGAGGAGTATCCCGACCGTATCATGTGCACATACTCGGTGTGCCCGTCGCCCAAGGTGTCGGACACGGTTGTGGAGCCCTACAACGCTACGCTGTCGGTGCACCAGCTTGTTGAGAACGCCGATGAGGTCATGTGTCTGGATAACGAGGCCCTGTACGACATTTGCTTCCGTACGCTGAAGCTTACCACTCCCACCTACGGTGACCTGAACCACCTCGTGTGTGCCGCCATGTCTGGTATCACCACGTGCCTGCGATTCCCCGGTCAGCTGAACTCGGACCTGCGTAAGCTGGCCGTGAACCTGATCCCGTTCCCGCGTCTYCACTTCTTTATGATTGGTTTCGCCCCGCTGACGTCGCGTGGCTCGCAGCAGTACCGTGCCCTGACGGTGCCCGAGCTGACCCAGCAGCAGTTCGACGCCAAGAACATGATGTGCGCCGCTGACCCTCGCCACGGCCGCTATTTAACTGCTGCTTGTATGTTCCGTGGACGTATGAGCACAAAGGAGGTTGATGAGCAGATGCTGAACGTGCAGAACAAGAACTCGTCGTACTTCGTCGAGTGGATCCCCAACAACATCAAGGCTAGCGTGTGTGATATC Phytophthora_nicotianae_Sta24 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Phytophthora_nicotianae_TL8VP TTCGTCGGTGTCCTCGACGTCAAAAAGCTCGCCCACCTCACTCTCGAGTCTCGTGCGGCATACGTTTGGTCTAAAGAAGAAATCGAAAAGCACCGGCGACTGCGATTTTAACAACGAGGGAGCTACTAGCAACCAGCACACGCAGCACACGCACCATCATCACCACCGTCATCACCAATACCCGACTTCACAGGAACTGCCCGGGATCGTGCCATTCCCTGCCCAGAACAAGATGCTGGTATTGTGCGGTGATGTCTGTGCCAGCGATTCAAAATGCACGCACTGGGCCTGGAATAACTACAACGGCGGTACTTGCTGGTTCAAGACGGGCTCTCGGTCGGCCAAAACTGGCAAATGGGGCACGAACTGCGGCTACGTGGTATCTCGAAGCACCCAAGGTCAAAATCAAAACCAAGGCGAAGCACGGGGTCAGTCATCCAGCAGCGGTCTGTCTGCGTCCGAAATGGGCGAGATGCTGGGCCGGATCAACGCCTACCGCTCGCAGAATGGTCTACCTGGTCTCTCAATTGACAACCGATTGGTGAACGCTGCCGCTTTCCACTCTCAGGACCAGGCCAACAATTGCAAGATGCAGCACGCCGGCTCAAACGGCTCAAGGCTTGGTGACCGCATCAAGGCACAAGGTTACAACTTCAACATGGCTGCGGAGAACGTGGCTGCCGGTCAAAAATCTGTGGAGGAAGTCATGAATTCGTGGTGGAACTCGCCAGGCCACCGTGCCAACCTCCTCAACAAGAACGTGGAGAATGTCGGCTTCGCAAAGGATCTTGAGCCCGGTACAATGGACTCGGTYCGTGCCGGCCCCTACGGCCAGCTTTTCCGCCCGGACAACTTCGTGTTCGGACAGACGGGCGCCGGTAACAACTGGGCCAAGGGACACTACACTGAGGGTGCCGAGCTTATTGACTCGGTGCTCGACGTCGTCCGTAAGGAGGCCGAGAGCTGTGATTGCCTTCAGGGTTTCCAGATCACGCACTCGCTTGGTGGTGGTACCGGTTCCGGTATGGGTACGCTTCTTATCTCGAAGATTCGTGAGGAGTATCCCGACCGTATCATGTGCACATACTCGGTGTGCCCGTCGCCCAAGGTGTCGGACACGGTTGTGGAGCCCTACAACGCTACGCTGTCGGTGCACCAGCTTGTTGAGAACGCCGATGAGGTCATGTGTCTGGATAACGAGGCCCTGTACGACATTTGCTTCCGTACGCTGAAGCTTACCACTCCCACCTACGGTGACCTGAACCACCTCGTGTGTGCCGCCATGTCTGGTATCACCACGTGCCTGCGATTCCCCGGTCAGCTGAACTCGGACCTGCGTAAGCTGGCCGTGAACCTGATCCCGTTCCCGCGTCTYCACTTCTTTATGATTGGTTTCGCCCCGCTGACGTCGCGTGGCTCGCAGCAGTACCGTGCCCTGACGGTGCCCGAGCTGACCCAGCAGCAGTTCGACGCCAAGAACATGATGTGCGCCGCTGACCCTCGCCACGGCCGCTATTTAACTGCTGCTTGTATGTTCCGTGGACGTATGAGCACAAAGGAGGTTGATGAGCAGATGCTGAACGTGCARAACAAGAACTCGTCGTACTTCGTCGAGTGGATCCCCAACAACATCAAGGCTAGCGTGTGTGATATC ; END; BEGIN TREES; Title Phytophthora_nicotianae_Nucl_NJ; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Phytophthora_nicotianae_Albicocco9, 2 Phytophthora_nicotianae_Anthurium, 3 Phytophthora_nicotianae_C301, 4 Phytophthora_nicotianae_C88, 5 Phytophthora_nicotianae_Ceanothus, 6 Phytophthora_nicotianae_Ciclamino1, 7 Phytophthora_nicotianae_Correa3, 8 Phytophthora_nicotianae_Correa5, 9 Phytophthora_nicotianae_Correa8, 10 Phytophthora_nicotianae_DodoneaCol1, 11 Phytophthora_nicotianae_DodoneaRad1, 12 Phytophthora_nicotianae_Ferrara11, 13 Phytophthora_nicotianae_Ferrara3, 14 Phytophthora_nicotianae_Ferrara8, 15 Phytophthora_nicotianae_HybiscusB, 16 Phytophthora_nicotianae_IMI207770, 17 Phytophthora_nicotianae_IMI268688, 18 Phytophthora_nicotianae_IMI379626, 19 Phytophthora_nicotianae_IRF26, 20 Phytophthora_nicotianae_IRF27, 21 Phytophthora_nicotianae_IRF3, 22 Phytophthora_nicotianae_IRF5, 23 Phytophthora_nicotianae_IRF8, 24 Phytophthora_nicotianae_KVB, 25 Phytophthora_nicotianae_Lavanda1, 26 Phytophthora_nicotianae_Lavanda4, 27 Phytophthora_nicotianae_Melanzana1, 28 Phytophthora_nicotianae_MirtoP5, 29 Phytophthora_nicotianae_Mirtus3, 30 Phytophthora_nicotianae_Nic8vasi, 31 Phytophthora_nicotianae_P0582, 32 Phytophthora_nicotianae_P0583, 33 Phytophthora_nicotianae_P0700, 34 Phytophthora_nicotianae_P10297, 35 Phytophthora_nicotianae_P10802, 36 Phytophthora_nicotianae_P1083, 37 Phytophthora_nicotianae_P1325, 38 Phytophthora_nicotianae_P1333, 39 Phytophthora_nicotianae_P1334, 40 Phytophthora_nicotianae_P1335, 41 Phytophthora_nicotianae_P1350, 42 Phytophthora_nicotianae_P1452, 43 Phytophthora_nicotianae_P1494, 44 Phytophthora_nicotianae_P1495, 45 Phytophthora_nicotianae_P1569, 46 Phytophthora_nicotianae_P1577, 47 Phytophthora_nicotianae_P16823, 48 Phytophthora_nicotianae_P16824, 49 Phytophthora_nicotianae_P16870, 50 Phytophthora_nicotianae_P16883, 51 Phytophthora_nicotianae_P1751, 52 Phytophthora_nicotianae_P1752, 53 Phytophthora_nicotianae_P1753, 54 Phytophthora_nicotianae_P1955, 55 Phytophthora_nicotianae_P3118, 56 Phytophthora_nicotianae_P3234, 57 Phytophthora_nicotianae_P3456, 58 Phytophthora_nicotianae_P3458, 59 Phytophthora_nicotianae_P3461, 60 Phytophthora_nicotianae_P3549, 61 Phytophthora_nicotianae_P3813, 62 Phytophthora_nicotianae_P3815, 63 Phytophthora_nicotianae_P6113, 64 Phytophthora_nicotianae_P6115, 65 Phytophthora_nicotianae_P6832, 66 Phytophthora_nicotianae_P6915, 67 Phytophthora_nicotianae_P7330, 68 Phytophthora_nicotianae_P7346, 69 Phytophthora_nicotianae_P7387, 70 Phytophthora_nicotianae_P7449, 71 Phytophthora_nicotianae_P7522, 72 Phytophthora_nicotianae_P7561, 73 Phytophthora_nicotianae_P7665, 74 Phytophthora_nicotianae_Pandorea2c, 75 Phytophthora_nicotianae_PeperoneGJ, 76 Phytophthora_nicotianae_PeperoneRC, 77 Phytophthora_nicotianae_Ph142, 78 Phytophthora_nicotianae_Ph168, 79 Phytophthora_nicotianae_Ph195, 80 Phytophthora_nicotianae_Ph3, 81 Phytophthora_nicotianae_Ph342, 82 Phytophthora_nicotianae_Ph440, 83 Phytophthora_nicotianae_Ph5, 84 Phytophthora_nicotianae_Ph647b, 85 Phytophthora_nicotianae_Ph653, 86 Phytophthora_nicotianae_Ph87, 87 Phytophthora_nicotianae_Ph9, 88 Phytophthora_nicotianae_Pittosporo, 89 Phytophthora_nicotianae_Pn17, 90 Phytophthora_nicotianae_Pomodoro, 91 Phytophthora_nicotianae_SCRP462, 92 Phytophthora_nicotianae_Serravalle1, 93 Phytophthora_nicotianae_Serravalle3, 94 Phytophthora_nicotianae_Sta24, 95 Phytophthora_nicotianae_TL8VP; TREE tree_1 = ((32:-1.619E-4,(47:-2.163E-4,(17:-8.7E-5,(66:-6.04E-5,(34:-1.192E-4,((41:0.0,(40:0.0,(39:0.0,(31:0.0,38:0.0):0.0):0.0):0.0):6.542E-4,(78:-4.18E-5,(65:-8.27E-5,(46:-1.633E-4,(44:-3.197E-4,(18:0.0,(91:0.0,(85:0.0,(59:0.0,(55:0.0,(3:0.0,27:0.0):0.0):0.0):0.0):0.0):0.0):3.197E-4):1.633E-4):8.27E-5):4.18E-5):6.56E-5):1.2E-4):6.04E-5):7.27E-5):2.163E-4):1.465E-4):1.42E-5,(22:-6.92E-5,(25:-3.2E-5,(26:-1.62E-5,(28:-8.3E-6,(84:-4.2E-6,((63:-2.1E-6,(76:-1.1E-6,(2:-6.0E-7,(74:-3.0E-7,(64:-2.0E-7,(5:-0.0,(15:-0.0,(19:-0.0,(24:-0.0,(82:-0.0,(43:-0.0,(52:-0.0,(53:-0.0,(67:-0.0,(73:-0.0,(9:-0.0,(8:-0.0,(7:-0.0,(60:-0.0,(48:-0.0,(51:-0.0,(33:0.0,(35:0.0,(56:0.0,(57:0.0,16:0.0):0.0):0.0):0.0):0.0):0.0):0.0):0.0):0.0):0.0):0.0):0.0):0.0):0.0):0.0):0.0):0.0):0.0):0.0):0.0):1.0E-7):2.0E-7):3.0E-7):6.0E-7):1.1E-6):7.0E-7,(21:-3.8E-6,(50:-6.9E-6,(6:-1.29E-5,(29:-2.44E-5,(45:-5.63E-5,((88:-2.2E-6,(94:-5.0E-7,(69:-9.0E-7,(61:-2.0E-7,(11:0.0,(1:0.0,10:0.0):0.0):2.0E-7):9.0E-7):5.0E-7):2.2E-6):5.71E-5,(42:-9.79E-5,(37:-2.032E-4,((62:-1.179E-4,(12:-0.0,(13:-0.0,(14:-1.0E-7,(72:-1.0E-7,(77:-3.0E-7,(79:-5.0E-7,(80:-1.0E-6,(86:-2.0E-6,(87:-4.0E-6,(93:-7.8E-6,(92:-1.54E-5,89:1.54E-5):7.8E-6):4.0E-6):2.0E-6):1.0E-6):5.0E-7):3.0E-7):1.0E-7):1.0E-7):0.0):0.0):1.182E-4):1.573E-4,((75:-6.81E-5,(49:-1.339E-4,83:1.339E-4):6.81E-5):1.007E-4,(71:-3.8E-4,(58:4.405E-4,(36:-5.5E-5,((70:-1.85E-4,81:1.85E-4):2.315E-4,(95:-6.4E-6,(30:-1.25E-5,(4:-2.47E-5,(54:-4.8E-5,(90:0.0,(68:0.0,(20:0.0,23:0.0):0.0):0.0):4.8E-5):2.47E-5):1.25E-5):6.4E-6):7.16E-5):5.5E-5):1.658E-4):7.69E-5):1.132E-4):9.63E-5):5.61E-5):9.79E-5):3.55E-5):1.0E-5):3.42E-5):1.29E-5):6.9E-6):3.8E-6):1.1E-6):1.6E-6):4.2E-6):8.3E-6):1.62E-5):3.62E-5):5.45E-5); END;