#NEXUS [written Sun Feb 19 23:59:55 CET 2012 by Mesquite version 2.01 (build j28) at Carmelo-TOSH/192.168.1.132] BEGIN TAXA; TITLE ITS2_Q_INSI_1; DIMENSIONS NTAX=32; TAXLABELS Carabus_abbreviatus_BABA44 Carabus_abbreviatus_TENE15007 Carabus_famini_MORR54807 Carabus_famini_EURY1625 Carabus_dufourii_ZUHE111 Carabus_macrocephalus_FORO157 Carabus_lusitanicus_VESC5 Carabus_riffensis_KETA569 Leistus_spinibarbis_CMOJ3909 Carabus_melancholicus_ROBU37 Carabus_melancholicus_EALM42207 Carabus_melancholicus_TIDI39104 Carabus_coriaceus_TURQ91306 Carabus_violaceus_POPO83000 Carabus_monilis_SAOU1538 Carabus_nemoralis_RONC1549 Carabus_auronitens_ROMA93906 Carabus_rutilans_SENY1548 Carabus_rugosus_KSAR65807 Carabus_rugosus_SMAR43907 Carabus_morbillosus_TUNA1622 Carabus_morbillosus_TUNC1624 Carabus_morbillosus_MAZA5908 Carabus_morbillosus_TUNB1623 Carabus_cancellatus_ROMA94106 Carabus_cancellatus_TACHcc816 Carabus_clatratus_TURQ51901 Carabus_irregularis_ROMA94006 Ceroglossus_chilensis_CHIL1GA Calosoma_auropunctatum_TURQ52001 Calosoma_sycophanta_CALO25405 Cychrus_semigranosus_CYCH1003 ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE ITS2_Q_INSI_1; DIMENSIONS NCHAR=1264; FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING = ?; MATRIX Carabus_abbreviatus_BABA44 CCC-------AT-GATTTGAACGCACA-TTGCGGT-CGCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGATCG--TCC-----------------------------------------------------GTT-----------GT--T-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------T----GGC-------------GACG---ACGAC----------------------------GATCT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTATCG-----GGGAACCAGTGGTGTT--TTGTTACT-GG-CAA-------C-----------------------TTG-------T-TG-TCGTGT----GCAATTCACG---------------T-TACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCACTGTTCACA-CACT--AAACCGAATA-ACTGTTT-T------GCA--GTTTATTCACACA---------GTACAC-ATTTA-----TA------TATCT-C--------GTAT-T--GCG-GTC-------------TCCCGTA--TGCA--ACATGTA-T--TTATATGTTT--TGT--------GTGT-CAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---GACGTGTCCA-TGAGT--AC-CA---TG--AT-G--A-ATG--------TGGTGT---------AC--A------CAAA------C-----TCT-------TT-----------GCA-----GAG-------TTTA-T---CACATTTTGTTT-G------TT--------ACCCG-CG---G------TCGTCCGTAGATACTTGGCTTG--------GAGACA---TA---CA---GTTTTCGAACGC---------------GTATAT--A-TTATAT--GCA-----------------TGCATACAC----TT--TA---TGG-GCTG-TA-ACGCTTTACG------TTTGT---AGA--TGT----TGTGCAACT-AG------------------------------------------AA---TAGAATCACTCT Carabus_abbreviatus_TENE15007 CCG-------AT-GATTCGAACGCACA-TTGCGGTCCGCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGATCG--TCC-----------------------------------------------------GTT-----------GT--T-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------T----GGC-------------GACG---ACGAC----------------------------GATCT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTATCG-----GGGAACCAGTGGTGTT--TTGTTACT-GG-CAA-------C-----------------------TTG-------T-TG-TCGTGT----GCAATTCACG---------------T-TACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCACTGTTCACA-CACT--AAACCGAATA-ACTGTTT-T------GCA--GTTTATTCACACA---------GTACAC-ATTTA-----TA------TATCT-C--------GTAT-T--GCG-GTC-------------TCCCGTA--TGCA--ACATGTA-T--TTATATGTTT--TGT--------GTGT-CAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---GACGTGTCCA-TGAGT--AC-CA---TG--AT-G--A-ATG--------TGGTGT---------AC--A------CAAA------C-----TCT-------TT-----------GCA-----GAG-------TTTA-T---CACATTTTGTTT-G------TT--------ACCCG-CG---G------TCGTCCGTAGATACTTGGCTTG--------GAGACA---TA---CA---GTTTTCGAACGC---------------GTATAT--A-TTATAT--GCA-----------------TGCATACAC----TT--TA---TGG-GCTG-TA-ACGCTTTACG------TTTGT---AGA--TGT----TGTGCAACT-AG------------------------------------------AA---TAGAATGACTCT Carabus_famini_MORR54807 CCG-------AT-GATTCGAACGCACA-TTGCGGTCCGCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGATCG--TCC-----------------------------------------------------GTT-----------GT--T-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------T-----------------------------GAC----------------------------GATCT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTATCG-----GGGAACCAGTGGTGTT--TTGTTACT-GG-CAA-------C-----------------------GTG-------T-TG-TCGTGT----GCAATTCACG---------------T-TACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCACTGTTCACA-CACT--AAACCGAATG-ACTGTTT-T------GCA--GTTTATTCACACA---------GTGCAC-ATTTA-----TA------TA--T-C--------GTAT-T--GCG-GTC-------------TCCCGTA--TGCA--TCATGTA-T--TTATATGTTT--TGT--------GTGT-TAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---GACGTGTCCATTGAGT--AT-CA---TG--AT-A--A-ATG--------TGGTGT---------AC--A------AAAA------C-----TCT-------TT-----------GCA-----GAG-------TTTA-T---CACATTTTGTTT-G------TT--------ACCCG-CG---G------TCGTCCGTAGATACTTGGCTTA--------GCGACA---TA---CA---GTTTTTGAACGC---------------GATTAT--AATTATAT--GCA-----------------TGCATACAC----TT--TA---TGG-GCTG-TA-ACGCTTTATG------TTTGT---AAA--TGT----TGTGCGACT-AG------------------------------------------AA---TAGAATCACTCT Carabus_famini_EURY1625 CCT-------AT-GATTCGA--CGCCA-TTGCGGTCCGCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGATCG--TCC-----------------------------------------------------GTT-----------GT--T-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------T-----------------------------GAC----------------------------GATCT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTATCG-----GGGAACCAGTGGTGTT--TTGTTACT-GG-CAA-------C-----------------------GTG-------T-TG-TCGTGT----GCAATTCACG---------------T-TACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCACTGTTCACA-CACA--AAACCGAATG-ACTGTTT-T------GCA--GTTTATTCACACA---------GTGCAC-ATTTA-----TA------TA--T-C--------GTAT-T--GCG-GTC-------------TCCCGTA--TGCA--TCATGTA-T--TTATATGTTT--TGT--------GTGT-TAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---GACGTGTCCATTGAGT--AT-CA---TG--AT-A--A-ATG--------TGGTGT---------AC--A------AAAA------C-----TCT-------TT-----------GCA-----GAG------TTTTA-T---CACATTTTGTTT-G------TT--------ACCCG-CG---G------TCGTCCGTAGATACTTGGCTTA--------GCGACA---TA---CA---GTTTTCGAACGC---------------GAATAT--A-TTATATT-GCA-----------------TGCATACAC----TT--TA---TGG-GCTG-TA-ACGCTTTACG------TTTGT---AGA--TGT----TGTGCGACT-AA------------------------------------------GAA-TTAGATGGACTCT Carabus_dufourii_ZUHE111 CCG-------AT-GATTCGA---CGCC-TTGCGGTCCGCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGGTCG--TTC----------------------------GTTTA--------------------GTT-----------GT--T-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTGAGGAC-------------AACG---ACGAC----------------------------GATCT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTTTCG-----GGGAACCAGTGGTGTT--TTGTTACT-GG-CAA-------CTTGATGAT-----------GTGATGG-------T-TG-TCGTGT----GCACTACACG---------------T-TACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCACTGTTCACA-CACT--CAACCGAATA-ATACTGT-TTG---CACA--GTTTATTCACACA---------GTACAC-ATTTA-----TA------T-TAT-C--------GTAT-T--GCG-GTC-------------TCCCGTA--TGCA--AC-TATA-T--TTATATGTTT--TGT--------GTGT-TAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---GACGTGTCTA-TGAGT--ACACA---TG--AT-G--A-ATG--------T-GTGT---------GC--A------CAAA------C-----TCT-------TTT--------ACAAA-----GAG-------TTTA-T---CACATTCTGTTT-G------TT--------GCCCA-CG---C------TCGTCCGTAGATACTTGGCTTA--------GAGACA---TA---CAATTGTTTTCGAACGC---------------ATATAT--A-TTATAC--GCT-----------------TGCATACAC----TCAATA---TGG-GCTG-TA-ACGCTTTACG------TATGT---AGA--TGT---TTGTGCGACT-AG------------------------------------------AA--TAGATATCACTCG Carabus_macrocephalus_FORO157 ?????????????????????????????????????GCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGGTCG--TTT----------------------------A------------------------GTT-----------GT--T--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGAGGAC-------------AACG---ACGAC----------------------------GATCT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTTTCG-----GGGAACCAGTGGTGTT--TTGTTACT-GG-CAA-------CT------------------GTGATGG-------T-TG-TCGTGT----GCACTACACG---------------T-TACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCACTGTTCACA-CACT--CAACCGAATA-ATACTGT-TTG---CACA--GTTTATTCACACA---------GTACAC-ATTTA-----TA------T-TAT-C--------GTAT-T--GCG-GTC-------------TCCCGTA--TGCA--AC-TATA-T--TTATATGTTT--TGT--------GTGT-TAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---GACGTGTCTA-TGAGT--ACACA---TG--AT-G--A-ATG--------T-GTGT---------GC--A------CAAA------C-----TCT-------TTT--------ACAAA-----GAG-------TTTA-T---CACATTCTGTTT-G------TT--------GCCCA-CG---C------TCGTCCGTAGATACTTGGCTTA--------GAGACA---TA---CAATTGTTTTCGAACGC---------------ATATAT--A-TTATAC--GCT-----------------TGCATACAC----TC--TA---TGG-GCTG-TA-ACGCTTTACG------TATGT---AGA--TGT----TGTGCGACT-AA------------------------------------------GA??????????????? Carabus_lusitanicus_VESC5 CCT-------AT-GATTTGA---CGCA-TTGCGGTCCGCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGGTCG--TTT----------------------------A------------------------GTT-----------GT--T-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTGAGGAC-------------AACG---ACGAC----------------------------GATCT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTTTCG-----GGGAACCAGTGGTGTT--TTGTTACT-GG-CAA-------CT------------------GTGATGG-------T-TG-TCGTGT----GCACTACACG---------------T-TACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCACTGTTCACA-CACT--CAACCGAATA-ATACTGT-TTG---CACA--GTTTATTCACACA---------GTACAC-ATTTA-----TA------T-TAT-C--------GTAT-T--GCG-GTC-------------TCCCGTA--TGCA--AC-TATA-T--TTATATGTTT--TGT--------GTGT-TAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---GACGTGTCTA-TGAGT--ACACA---TG--AT-G--A-ATG--------T-GTGT---------GC--A------CAAA------C-----TCT-------TTT--------ACAAA-----GAG-------TTTA-T---CACATTCTGTTT-G------TT--------GCCCA-CG---C------TCGTCCGTAGATACTTGGCTTA--------GAGACA---TA---CAATTGTTTTCGAACGC---------------ATATAT--A-TTATAC--GCT-----------------TGCGTACAC----TC--TA---TGG-GCTG-TA-ACGCTTTACG------TATGT---AGA--TGT----TGTGCGACT-AG------------------------------------------AA--TAGATATGGCTCG Carabus_riffensis_KETA569 CCG-------AG-GATTCGA---CGCC-CTGCGGTCCGCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGGTCG--TTT----------------------------T------------------------GTT-----------GT--T-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGGC-------------GACG---ACGAC----------------------------GATCT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTTTCG-----GGGAACCAGTGGTGTT--TTGTTACT-GG-CAA-------CTG---------------------TTG-------T-TG-TCGTGT----GCACTGCACG---------------T-TACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCACTGTTCACA-CACC--ATACCGAATA-ACACTGT-TTG---CACA--GTTTATTCACACA---------GTACAC-ATTTA-----TA------TATAT-C--------GTAT-T--GCG-GTC-------------TCCCGTA--TGCA--AC-TATA-T--TTATATGTTT--TGT--------GTGT-TAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---GACGTGTCAA-TGAGT--AC-CA---TG--AT-G--A-ATG--------T-GTGT---------GT--A------CAAA------C-----TCT-------TTT--------A--CA-----GAG-------TTTA-T---CACATTCTGTTT-G------TT--------GCCCA-CA---C------TCGTCCGTAGATACTTGGCTTA--------GAGACA---TG---CA---GTTTTCGAACGC---------------ATATAT--A-TTATAC--GTG-----------------TGCATACAC----TA--TA---TGG-GCTG-TA-ACGCTTTACG------TTTGT---AGA--TGT----TGTGCGACT-AA------------------------------------------GAA-TTAGATGGACTCA Leistus_spinibarbis_CMOJ3909 CCG-------AT-GATTTGA---CGAA-TTGCGGTCCTCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGGTCTTTTGCGTATGCATTAGATGTCAGGCGAATGATGGGTACCCGGCGTTGGG---------GTT-----ACACGGCAAGCATCAACTTTGTCTCGCACT------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTATTGAG-------------CTTG-ATAACGT----------------------------GAGCTAAAGACTTGTTCGTTTGATATACCAA-ACCTGACCCGGTTCCTTAAATGGGAGGCAAGGGCGAT--TGTGGAGT-AT-ATAC------ATGTCAACTACGGGCGTGCTTATATATGTCGATTC-AG-TCGTCTCGAACCTAACCGGTAGCATATATGTGTTATTAACACTCGTGTGGCTTGTACCC----GTACACTGTTGA---CTCTT-ATTACGCATA-ATCGTGTTATGTTTTACA---TTGGCTCTCTCG---------TACTATGATATACTTTATATACG--TG--TTT--------GTAT-TCAGTGTGGCCATAATGGCCTCATACCGTA--TACG--GC-ACTT-T--ATATACCATA--CGTTATATCGAATGG-AGATATGTGAATGTTAAAACTGTCATTCTGTGTGTTA--GTAGC--A--GAGTATACAAT-C--G-GTC--------TGGACGTGTCCCAGTGTTTC------TATG------T-----GCT-------------------TACA-----GCA-------TGTACGATTCCCGTGGTCGTT-CAAACAAAG--------ACCGGGCGTCACCAC---TCGTATTT-GTTGCTAATACAA--------TATACAGTTTGTCAGATCAGTTCTAGAATACTTCAAACGGAGACTCGTATAT-----CATGGTTGTATCGTAATGTTACACATCTGTTGACATGTTACCACTATACTGGTGCTTGCACATAAGTTATA-TCTAAGCGAG---AGA-TTGT----CGCGTAAAC-AGCCCAAATAACACAGATTCTAGTTTTAAAAAACAACTTATAACGAGATCAATACAAGTCT Carabus_melancholicus_ROBU37 CCG-------AT-GATTCGA---CGCC-TTGCGGTCCGCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGGTCG-----------------------------------------------------------TT-----------GTCGA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTA--------T---------GTCG---ACATC----------------------------GATCT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTATCG-----GGGAACCAGTGGTGTT--TTGTTACT-GG-CAA-------C-----------------------GTG-------T-TG-TCGTGT----GCAATTCACA---------------T-TACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCACTGTTCACA-CACTT-AAATCGAATA-A--CTGT-TTG---CACA--GTTTATTCACACA---------GTACAC-ATTTA-----TA------TA--T-C--------GTAT-T--GCG-GTC-------------TCCCGTA--TGCA--AC-TATA-T--A-ATATGTTT--TGT--------GTGT-TAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---AATGTGTTTA-TGTGT--AC-CA---TG--AT-A--G-GTG--------TTGTGT---------TG-TA------CAAA------C-----TCT-------TT-----------GCA-----GTTTT----GTTCGCT---CGCACTTTGTTT-G------CT--------ACCAA-AA---C------TCGTTCGTAGATACTTGGCTTA--------GAGACA---TA---CA---GTTT----ACAA---------------ACGTAT-TAAATATAT--GTA-----------------TGCATACAC----T---TA---TGG-GCTG-TA-ACGCTTTATG------T-TGT---AGA--TGT----TGTGCAACT-AA------------------------------------------GAA-TTAGATTCACTCT Carabus_melancholicus_EALM42207 CCG-------AT-GATTTGA---CGCCATTGCGGTCCGCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGGTCG-----------------------------------------------------------TT-----------GTCGA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTA--------T---------GTCG---ACATC----------------------------GATCT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTATCG-----GGGAACCAGTGGTGTT--TTGTTACT-GG-CAA-------C-----------------------GTG-------T-TG-TCGTGT----GCAATTCACA---------------T-TACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCACTGTTCACA-CACTT-AAATCGAATA-A--CTGT-TTG---CACA--GTTTATTCACACA---------GTACAC-ATTTA-----TA------TA--T-C--------GTAT-T--GCG-GTC-------------TCCCGTA--TGCA--AC-TATA-T--A-ATATGTTT--TGT--------GTGT-TAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---AATGTGTTTA-TGTGT--AC-CA---TG--AT-A--G-GTG--------TTGTGT---------TG-TA------CAAA------C-----TCT-------TT-----------GCA-----GTTTT----GTTCGCT---CACACTTTGTTT-G------CT--------ACCAA-AA---C------TCGTTCGTAGATACTTGGCTTA--------GAGACA---TA---CA---GTTT----ACAA---------------ACGTAT-TAAATATAT--GAA-----------------TGCATACAC----TT--TA---TGG-GCTG-TA-ACGCTTTATG------T-TGT---AGA--TGT----TGTGCAACT-AG------------------------------------------AA---TAGATTCACTCT Carabus_melancholicus_TIDI39104 CCG-------AT-TATTCGA---CGCC-TTGCGGTCCGCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGGTCG-----------------------------------------------------------TT-----------ATCGA-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTA--------T---------GTCG---ACATC----------------------------GATCT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTATCG-----GGGAACCAGTGGTGTT--TTGTTACT-GG-CAA-------C-----------------------GTG-------T-TG-TCGTGT----GCAATTCACA---------------T-TACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCACTGTTCACA-CACTA-AAATCGAATA-A--CTGT-TTG---CACA--GTTTATTCACACA---------GTACAC-ATTTA-----TA------TA--T-C--------GTAT-T--GCG-GTC-------------TCCCGTA--TGCA--AC-TATA-T--A-ATATGTTTTGTGT--------GTGT-TAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---AATGTGTTTA-TGTGT--AC-CA---TG--AT-A--A-GTG--------TTGTGT---------TG-TA------CAAA------C-----TCT-------TT-----------GCA-----GTTTT----GTTCGCT---CACACTTTGTTT-G------CT--------ACCAA-AA---C------TCGTTCGTAGATACTTGGCTTA--------GAGACA---TA---CA---GTTT----ACAA---------------ACGTATATAAATATAT--GTA-----------------TGCATACAC----TT--TA---TGG-GCTG-TA-ACGCTTTATG------T-TGT---AGA--TGT----TGTGCAACT-AA------------------------------------------GAA-TTAGATGGACTCG Carabus_coriaceus_TURQ91306 CCA-------AAGAATTCGA--CCACA-TTGCGGTCCGCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGGTCG--TCG-------------------------TTTGTCGTTTGACGATGACACATAAGACGTT-----------CTAGGTGGTTATCGGGAATGTACAAAAAGTATTTTATTCTGACATTAAACACACATTCACAACATGCATAACGATTCCAATGCGTGTGGAGTGCATTGTCTGGGTTTATGTGTTGTCATTATTTCCTACCAAGTAGTACCATTTTACGGTCCCCTGGAACGTTGTCGTCTGACGAT-------------GACA-TATCGAC----------------------------GATCT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTATCG-----GGGAACCAGTGGTGTT--TTGTTACT-GG-CAAC-----TA-ACTTGAT-----------TGTTTGT-------T-TG-TCGTGT----GCAATTCACA---------------TATACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCACTGTTCACA-CACT--AAACCGAATA-ACACTGT-TTG---CACAGAGTTTATTCACACA---------GTGCAC-ATTTA-----TG------TA--T-C--------GTAT-T--GCG-GTC-------------TCCCGTA--TGCT--AT-ACTA-T--ATTTATGTTT--TGT--------GTGT-TAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---GACGTGTCCA-TGAGT--AT-CA---TG--AT-A--G-TTG--------TGGTGT---------T---A------CAAA------C-----TCT-------ATT--------G--CA-----GAG-------TTTA-T---CACATCTTGTTT-G------TT--------ACCCG-CG---G------TCGTCCGTAGATACTTGGCTTA--------GAGACA---TA---CA---GTTT----ACAA---------------GCATAT--A-TTATAC--GTA-----------------TACATACAC----TATATA---AGG-GCTG-TA-ACGTTTTACG------TTTAT---GAA--TGT----TGTACGACT-AG------------------------------------------AA--TTAGATGGACTCT Carabus_violaceus_POPO83000 CCTCCTATGAATGGATTCGA---CGCC-CTGCGGTCCGCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGGTCG--TCG-----------------------------------------------------TTT-----------GTCGT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTGACGAT-------------GACA-TCTCGAC----------------------------GATCT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTATCG-----GGGAACCAGTGGTGTT--TTGTTACT-GG-CAAA-----AGTGCTACTT-----------CGCGTAG-------T-TG-TCGTGT----GCAATTCACA---------------TACACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCACTGTTCACA-CACC--ATACCGAATA-ACACTGTTTT----CACA--GTTTATTCACACA---------GTGCAC-ATTTA-----TG------TA--T-C--------GTATTT--GCG-GTC-------------TCCCGTA--TGCT--AT-ACTA-T--ATTTATGTTT--TGT--------GTGT-TAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---GACGTGTCCA-TGAGT--AT-CA---TG--AT-A--G-ATG--------TTGATG---------TTACA------CAAA------C-----TCT-------ATT--------G--CA-----GAG-------TTTA-T---CACATTTTGTTT-G------TT--------ACCCA-CG---G------TCGTCCGTAGATACTTGGCTTA--------AGGGCA---TA---CA---GTTT----ACAA---------------ACATAT--A-TTATAC--GTA-----------------TACATACAC----TTTATA---TGG-GCTG-TT-ATCGCTTTTA------TGTGT---GAA--TG-----TGTACGACT-AG------------------------------------------AA--TTAGATGAGCTCT Carabus_monilis_SAOU1538 CCT-------ATGCATTCGAACGCACA-CTGCGGTCCGCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGGTCG-TTCG-------------------------TTTT------------------------GTT-----------GTCGT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTGACGAT-------------GACA-TCTCGAC----------------------------GATCT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTATCG-----GGGAACCAGTGGTGTT--TTGTTACT-GG-CATA-----TCTACTACTC--------------GTAG-------TTTG-TCGTGT----GCAATTCACA---------------TACACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCACTGTTCACA-CACC--ATACCGAATA-ACACTGTTTCA---CACA--GTTTATTCACACA---------GTGCAC-ATTTA-----TG------TA--T-C--------GTATTT--GCG-GTC-------------TCCCGTA--TGCT--AT-ACTA-T--ATTTATGTTT--TGT--------GTGT-TAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---GACGTGTCCA-TGAGT--AT-CA---TG--AT-A--G-ATG--------TTGATG---------TTACA------CAAA------C-----TCT-------ATT--------G--CA-----GAG-------TTTA-T---CACATTTTGTTT-G------TT--------ACCCA-CG---G------TCGTCCGTAGATACTTGGCTTA--------AGGGCA---TA---CA---GTTT----ACAA---------------ACATAT--A-CTATAC--GTA-----------------TGCGTACAC----TATATA---TGG-GCTG-TT-ATCGCTTTAC------GTTGT---GAA--TGT----TGTACGACT-AG------------------------------------------AA---TTGATGCACTAA Carabus_nemoralis_RONC1549 ACG-------ACGATCTCGA--CCACA-TTGCGGTCCGCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGGTCG--TCC-----------------------------------------------------GTT-----------GT--T-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGAC-------------GACA---ACGGC----------------------------GATCT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTATCG-----GGGAACCAGTGGTGTT--TTGTTACT-GG-CAA-------C-----------------------TTG-------T-TG-TCGTGT----GCAATTCACG---------------T-TACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCACTGTTCACACCACT--ATACCGAATA-TAACTGT-TTG---CGCG--GTTTATTCACACA---------GTGCACAATTTA-----TG------TA--T-C--------GTAT-T--GCG-GTC-------------TCCTGTA--TGCT--AT-ACAAGT--AATTATGTTT--TGT--------GTGT-TAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---GGTGAATCAA-CGTGT--AT-CA---TG--AT-G--G-ATG--------TGGTGT---------TAAAAACCCGTCACA------C-----ACA-------CAC--------TGTGT-----GTGTGCAGTGTTTA-T---CATATCTTGTTT-G------CT--------ACCGG-TA---T------TCATTCGTAGATACTTGGCTTA--------GAGACA---TA---CA---GTTA----ATGA---------------ACATAT--G-ATACGC--GTA-----------------TGCATACGT----TATACA---TGG-GCTGTTA-TCGCTTTATG------CCAGT---AAA-TTGT----TGTGCGACA-TT------------------------------------------AA--TACGATGCACGCG Carabus_auronitens_ROMA93906 CCG-------ATCGATTCGAACGCACA-TTGCGGTCCGCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGGTCG--TCT-------------------------TGCT------------------------GTT-----------GTCGT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTAACGACACAC---------AACA---ACGAC----------------------------GATCT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTATCG-----GGGAACCAGTGGTGTT--TTGTTACT-GG-CAAC-----AC-----------------------ACG-------T-TG-TCGTGT----GCAATTCACG---------------T-TACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCACTGTTCACA-CACT--AAACCGAATA-ACACTGTATTG---CACA--GTTTATTCACACA---------GTGCAC-ATTTA-----CG------TA--T-C--------GTAT-T--GCGGGAC-------------TCTCGTA--TGCC--AT-ACTG-T--ATTTATGTTT--TGT--------GTGT-TAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---GACGTGTCCA-TGAGT--AT-CA---TG--AT-A--A-ATG--------TGACGG---------TT--G------CAAG------C-----TCT-------TT---------G--CA-----GAGTA----TTGTAGT---CACTTTTTGTTT-G------TT--------ACCCG-CG---G------ACGTCCGTAGATACTTGGCTTA--------GAGACA---TA---CA---GTTT----ACGA---------------ACATTA--A--TATT---GTG-----------------CGCATACAC------TATA---TGG-GCTG-TA-ACGCTTTATG------TGTGT---AAA--TGT----TGTACGACT-AA------------------------------------------GAATTTAGATTGGCTCT Carabus_rutilans_SENY1548 CCG-------AAGGATTCGA---CGCC-TCGCGGTCCGCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGGTCG--TCT-------------------------TGTT------------------------GTT-----------GTCGT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTAACGACACAC---------ACCA---ACGAT----------------------------GATCT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTATCG-----GGGAACCAGTGGTGTT--TTGTTACT-GA-CAAC-----AC-----------------------ACG-------T-TG-TCGTGT----GCAATTCACG---------------T-TACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCACTGTTCACA-CACT--AAACCGAATA-ACACTGTATTG---CACA--GTTTATTCACACA---------GTGCAC-ATTTA-----CG------TA--T-C--------GTAT-T--GCGGGAC-------------TCTCGTA--TGCC--AT-ACCG-T--GTTTATGTTT--TGT--------GTGT-TAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---GACGTGTCCA-TGAGT--AT-CA---TG--AT-A--A-ATG--------TGATGG---------TT--G------CAAG------C-----TCT-------TT---------G--CA-----GAGTA----TTGTAGT---CACATTTTGTTT-G------TT--------ACCCG-CG---G------ACGTCCGTAGATACTTGGCTTA--------GAGACA---TA---CA---GTTT----ACGA---------------ACATTA--A--TATG---GTG-----------------CGCATACAC----T-TATA---TGG-GCTG-TA-ACGTTTTACG------TGTGT---AAA--TGT----TGTACGACT-AG------------------------------------------AA--TTAGATGCACTCT Carabus_rugosus_KSAR65807 CCG-------AG-GATTCGA---CGCC-TTGCGGTCCGCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGGTCG--TCT----------------------------T------------------------GTT-----------GTCGT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTAACGAT---T---------AACA---ACGAC----------------------------GATCT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTATCG-----GGGAACCAGTGGTGTC--TTGTTACT-GG-CAA-------C-----------------------TTG-------T-TG-TCGTGT----GCAATTCACG---------------T-TACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCTCTGTTCACA-CACTTATAACCGAATA-ACACTGTTTTG---CACA--GTTTATTCACACA---------GTGCAC-ATTTA-----TG------TA--T-C--------GTAT-C--GCGGGAC-------------TCCCGTA--TGCT--AT-ACTA-T--ATTTATGTTT--TGT--------GTGT-TAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---GACGTGACCAATGAGT--AA-CA---TA--AT-A--A-ATG--------TGATGG---------TT--G------CAAG------C-----TCT------------------GTATA-----GAGTA----TTGTA-T---CACGTTTTG-TT-G------TT--------TCCAG-CG---G------TCGTCCGTAGATACTTGGCTTA--------GAGACA---TA---CA---GCTT----ACGA---------------ACATAT--A-TTATAC--GTA-----------------TGCATACAC----TATATA---TGG-GCTG-TA-ACGCTTTATG------TGTGT---AGA--TGT----TGTACGACT-AG------------------------------------------AA---TAGATTGACTCT Carabus_rugosus_SMAR43907 CCG-------AT-GATTCGAACGCACA-TTGCGGTCCGCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGGTCG--TCT----------------------------T------------------------GTT-----------CTCGT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTAACGAT---T---------AACA---ACGAC----------------------------GATCT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTATCG-----GGGAACCAGTGGTGTC--TTGTTACT-GG-CAA-------C-----------------------TTG-------T-TG-TCGTGT----GCAATTCACG---------------T-TACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCACTGTTCACA-CACTTATAACCGAATA-ACACTGT-TTG---CACA--GTTTATTCACACA---------GTGCAC-ATTTA-----TG------TA--T-C--------GTAT-C--GCGGGAC-------------TCCCGTA--TGCT--AT-ACTA-T--ATTTATGTTT--TGT--------GTGT-TAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---GACGTGACCAATGTGT--AA-CA---TA--AT-A--A-ATG--------TGATGG---------TT--G------CAAG------C-----TCG------------------GTATT-----GAGTA----TTGTA-T---CACGTTTTG-TT-G------TT--------TCCAG-CG---G------TCGTCCGTAGATACTTGGCTTA--------GAGACA---TA---CA---GCTT----ACGA---------------ACATAT--A-TTATACGTGCA-----------------TGCATACAC----TATATA---TGG-GCTG-TA-ACGCTTTATG------TGTGT---AGA--TGT----TGTACGACT-AA------------------------------------------GAA-TTAGATGGACTCT Carabus_morbillosus_TUNA1622 CCT-------AT-GAATTTGACGCACA-TTGCGGTCCGCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGGTTG--TCT----------------------------T------------------------GTT-----------GTCGT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTAACGAC---T---------AACA---ACGAT----------------------------GATCT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTATCG-----GGGAACCAGTGGTGTC--TTGTTACT-GG-CAA-------C-----------------------TTG-------T-TG-TCGTGT----GCAATTCACG---------------T-TACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCACTGTTCACA-CACT--ATACCGAATA-ACACTGT-TTG---CACA--GTTTATTCACACA---------GTGCAC-ATTTA-----TG------TA--T-C--------GTAT-C--GCGGGAC-------------TCCCGTA--TGCT--AT-ACTA-T--ATTTATGTTT--TGT--------GTGT-TAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---GACGTGACCA-AGAGT--TT-CA---TA--AT-A--A-ATG--------TGATGG---------TT--G------CAAG------C-----TCT-------TT---------GTCTA-----GAGTA----TTGTA-T---CACATTTTG-TT-G------TT--------GCCCA-CG---G------TCGTCCGTAGATACTTGGCTTA--------GAGACA---TA---CA---GCTT----ATGA---------------ACATAT--A-TTATAC--GTA-----------------TGCATACAC----TATATA---TGG-GCTG-TA-ACGCTTTATG------TGTGT---AGA--TGT----TGTGCGACTAAG------------------------------------------AA---TTGATTGACTCT Carabus_morbillosus_TUNC1624 CCA-------AA-GGATTCGACG--CC-ATGCGGTCCGCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGGTTG--TCT----------------------------T------------------------GTT-----------GTCGT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTAACGAC---T---------AACA---ACGAT----------------------------GATCT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTATCG-----GGGAACCAGTGGTGTC--TTGTTACT-GG-CAA-------C-----------------------TTG-------T-TG-TCGTGT----GCAATTCACG---------------T-TACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCACTGTTCACA-CACT--ATACCGAATA-ACACTGT-TTG---CACA--GTTTATTCACACA---------GTGCAC-ATTTA-----TG------TA--T-C--------GTAT-C--GCGGGAC-------------TCCCGTA--TGCT--AT-ACTA-T--ATTTATGTTT--TGT--------GTGT-TAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---GACGTGACCA-AGAGT--TT-CA---TA--AT-A--A-ATG--------TGATGG---------TT--G------CAAG------C-----TCT-------TT---------GTCTA-----GAGTA----TTGTA-T---CACATTTTG-TT-G------TT--------GCCCA-CG---G------TCGTCCGTAGATACTTGGCTTA--------GAGACA---TA---CA---GCTT----ATGA---------------ACATAT--A-TTATAC--GTA-----------------TGCATACAC----TATATA---TGG-GCTG-TA-ACGCTTTATG------TGTGT---AGA--TGT----TGTGCGACT-AA------------------------------------------GAATTTAGATTGACTCA Carabus_morbillosus_MAZA5908 CCG-------AT-GATTTGA-CGC-CA-TTGCGGTCCGCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGGTTG--TCT----------------------------T------------------------GTT-----------GTCGT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTAACGAC---T---------AACA---ACGAT----------------------------GATCC-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTATCG-----GGGAACCAGTGGTGTC--TTGTTACT-GG-CAA-------C-----------------------TTG-------T-TG-TCGTGT----GCAATTCACG---------------T-TACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCACTGTTCACA-CACT--ATACCGAATA-ACACTGT-TTG---CACA--GTTTATTCACACA---------GTGCAC-ATTTA-----TG------TA--T-C--------GTAT-C--GCGGGAC-------------TCCCGTA--TGCT--AT-ACTA-T--ATTTATGTTT--TGT--------GTGT-TAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---GACGTGACCA-AGAGT--TT-CA---TA--AT-A--A-ATG--------TGATGG---------TT--G------CAAG------C-----TCT-------TT---------GTCTA-----GAGTA----TTGTA-T---CACATTTTG-TT-G------TT--------GCCCA-CG---G------TCGTCCGTAGATACTTGGCTTA--------GAGACA---TA---CA---GCTT----ATGA---------------ACATAT--A-TTATAC--GTA-----------------TGCATACAC----TATATA---TGG-GCTG-TA-ACGCTTTATG------TGTGT---AGA--TGT----TGTGCGACT-AG------------------------------------------AA---TAGATTCACTCT Carabus_morbillosus_TUNB1623 CCG-------AT-GATTCGAACGCACA-TTGCGGTCCGCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGGTTG--TCT----------------------------T------------------------GTT-----------GTCGT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTAACGAC---T---------AACA---ACGAT----------------------------GATCT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTATCG-----GGGAACCAGTGGTGTC--TTGTTACT-GG-CAA-------C-----------------------TTG-------T-TG-TCGTGT----GCAATTCACG---------------T-TACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCACTGTTCACA-CACT--ATACCGAATA-ACACTGT-TTG---CACA--GTTTATTCACACA---------GTGCAC-ATTTA-----TG------TA--T-C--------GTAT-C--GCGGGAC-------------TCCCGTA--TGCT--AT-ACTA-T--ATTTATGTTT--TGT--------GTGT-TAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---GACGTGACCA-AGAGT--TT-CA---TA--AT-A--A-ATG--------TGATGG---------TT--G------CAAG------C-----TCT-------TT---------GTCTA-----GAGTA----TTGTA-T---CACATTTTG-TT-G------TT--------GCCCA-CG---G------TCGTCCGTAGATACTTGGCTTA--------GAGACA---TA---CA---GCTT----ATGA---------------ACATAT--A-TTATAC--GTA-----------------TGCATACAC----TATATA---TGG-GCTG-TA-ACGCTTTATG------TGTGT---AGA--TGT----TGTGCGACT-AG------------------------------------------AA---TAGATTGACTCA Carabus_cancellatus_ROMA94106 CCG-------AT-GATTCGA--CGCCA-TTGCGGTCCGCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGATCG--TCA------------------------------------------------------TC-----------GTCGT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTGACGGC-------------GACG---TTGATAT--------------------------GATCT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTTTCG-----GGGAACCAGTGGTGTT--TTGTTACT-GG-CAAA-----CAAGCAACGAACGTTCGTTCGTTCGTTG-------T-TG-TCGTGT----GCAATTCACA---------------TTAACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCACTGTTCACA-CACAA-ATACCGAATA-ACACTGTACTA---CACA--GTTTATTCACAAA---------GTGCAC-ATTTA-----TA------TG--T-C--------GTAT-T--GCG-GTC-------------TCCCGTA--TGCA-----ACTA-T--ATTTATGTTTTCTGT--------GTGTTTAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---GACGTGTCAC-TGAGT--ACACA---TG--AT-A--A-ATG--------TTGTAT---------GCCTG------TGTA------GAGAAAGCT-----CATTA--------GCAGTCGTAACTATC----ACACATA---CACATTTTGTTT-G------TT--------ACCCA-CG---A------TCGTTCGTAGATACTTGGCTTATTGCGAAAGACACA---CA---GA---GTTT----ATAA---------------ACATAC--A-ATGTACTGCAT-----------------TGCATACAC-----CTATA---TGG-GCTG-TA-ACGCTTTACGTAT---TATAT---ATATTTGT----TGTACGCCT-AG------------------------------------------AA---TAGATTCACTCT Carabus_cancellatus_TACHcc816 CCG-------AT-GATTCGAACGCACA-TTGCGGTCCGCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGATCG--TCA------------------------------------------------------TC-----------GTCGT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTGACGGC-------------GACG---TTGATAT--------------------------GATCT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTTTCG-----GGGAACCAGTGGTGTT--TTGTTACT-GG-CAAA-----CAAGCAACGAACGTTCGTTCGTTCGTTG-------T-TG-TCGTGT----GCAATTCACA---------------TTAACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCACTGTTCACA-CACAA-ATACCGAATA-ACACTGTACTA---CACA--GTTTATTCACAAA---------GTGCAC-ATTTA-----TA------TG--T-C--------GTAT-T--GCG-GTC-------------TCCCGTA--TGCA-----ACTA-T--ATTTATGTTTTCTGT--------GTGTTTAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---GACGTGTCAC-TGAGT--ACACA---TG--AT-A--A-ATG--------TTGTAT---------GCCTG------TGTA------GAGAAAGCT-----CATTA--------GCAGTCGTAACTATC----ACACATA---CACATTTTGTTT-G------TT--------ACCCA-CG---A------TCGTTCGTAGATACTTGGCTTATTGCGAAAGACACA---CA---GA---GTTT----ATAA---------------ACATAC--A-ATGTACTGCAT-----------------TGCATACAC-----CTATA---TGG-GCTG-TA-ACGCTTTACGTAT---TATAT---ATATTTGT----TGTACGCCT-AG------------------------------------------AA---TAGATGCACTCT Carabus_clatratus_TURQ51901 CCG-------AT-GATTCGAACGCACA-TTGCGGTCCGCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGTCTGAGGGTCGTGCTATCTTACCAGACTGCCGGTCG--TTG-----------------------------------------------------ATG----------TCTCTC-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TCACCGA--------------GAGT---GTCAC----------------------------GATGT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTTTCG-----GGGAACCAGTGGTGTT--TTGTTACTCGG-CAACGCATACAATAATTTACTTCACTGTAGTTATTGG-------T-TG-TCGTGT----GCAATTCACA---------------T-TACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATTACTGTTCACACCACT--ATACCGAATA-ACTTTGC-------------TGTTATTCACACA---------GTACAC-ATTTA-----TGTATATATA--T-C--------GTAT-T--GCG-GTC-------------TCCCGTA--TACG--TT-ACTC-T--GTATGTTCTT-GTGT--------GTGT-CAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---GACGTGTTTA-TGTGTATAT-CA---TG--AT-A--A-ATG--------CTGATA---------TTAAC------AACA------C-----TCA-------GTG--------C--GA-----GTG-------TTGA-T---CACATTTTGTTTGG------TT--------ACCTA-TG---C------TCGTCCGTAGATACTTGGCTTG--------GCGACA---TATTACA---GTTA----AGGA---------------ACGTAC----TTAGTG--ATA-----------------CGTATACAC----TT--TA---TGG-GCTG-TA-ACGCTTTATG------GTGGTCATAGA--TGT----TGTGCGACT-AA------------------------------------------GTA-TATAGTTCACTCA Carabus_irregularis_ROMA94006 ACG-------AT-GATTTGA-CGCACA-TTGCGGTCC-CGGATACTGTTCCTGGACC-CGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGGTCG--TCA-----------------------------------------------------CTT----------ACAGCT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTGT-------------CGGA---GTGAC----------------------------GATCT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTATCG-----GGGAACCAGTGGTGTT--TTGTTACT-GG-CGCG-----TCGACTCTAAACTCTAGAGGTTTGGTCG-------CGTG-TTGTGT----GCAATTCACA---------------T-TACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCACTGTTCACA-CACTA-TAAACGAATA-ACTGTTT---G---CGC---TTTTATTCACACT---------GTACAC-ATTCT-----TA------TA--T-C--------GTAT-T--GCG-GTC-------------TCCCGTATATGCA--ATATACA-T--ATGTTTCTGT--GTG--------GTGT-TAATAGGTGCG-----GAGTTGTCG---GACGTGTCCA-TGAGT--TT-CAATATG--ATAA--A-ATG--------GTATAG-------------A------CACACACACAC-----ACTCT-----TTG--------CAGTGAGACTGTG-------TCTA-TCAACATTTTGATTTT-G------TT--------ACCCGTCGGGGG------TCGTCCGTAGATACTTGGCCTA--------GAGACA---CAT--CC-----------ACAG---------------AGTCA-------AAAC--GTA-----------------TGCATACACAATTGTCATA---TGG-GCTG-TATGCGCTTTACATCAATGATACCAAAGGA--TT-----AGTACGAAC-AA------------------------------------------GCATATGGACTCATCGC Ceroglossus_chilensis_CHIL1GA CCG-------AT-GATTCGAACGCACA-TTGCGGTCCTCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGGTCG--TGA--------------------------CACATTTTCACTCCTA-----------GTC----------TTTCATTTT----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTGAAGATGAAGATGATGATTATGT-ATGTTAT----------------------------GATCA-----------------------CGG-CGACGATGGGGAAGCG-----GGAAACCAGTGGTGTGTCTGTTTGCGTAC-CGAG-----ACGGTTA-----------CCATATCGAA-------T-CGTTCGTGG----GC-ATTCACA------------CAATTAACAC------TGCTCGTTCTC-TTAAATCACTGTT-ACACCTGGA-ATAACGTGTTCACACAATTAT----------TGTAAAACACACAAAATACATATTGCGG-----------TC------TC--C-C--------GCGC-T--GCA-----------------------------------ATTT----ATATATGTTT--TGT--------GTCA----TAAGTGCG-----GAGTTGTCG---GACTTGTCCA-AGAGT--TT-CG---TGAAAA-C--ATACTATATCAAAGAATAC-------------A------CATA------G-----TGGATAAATAAATCAAATGAATTTTTTGGTACTA------CTATG-T---TGTGTTTGGTTT-G------TTGTTCTGATACATCGAG---G------AAGTCCGTAGATACTTGGCTTG--------TCGACA-----------------------------------------CATAT------AGAC--TAA-----------------TAATTGCTC------------TTAG----------CGTGT----------TTGGC---AGA--CC-----CGCAACACA-TA------------------------------------------ATA-GCAGATTCACTC? Calosoma_auropunctatum_TURQ52001 CCA-------ATGATTTCGAACGCACA-CAGCGGTCTTCGGATAGTGTTCCTGGGCCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGGTCG--TCT-----------------------------------------------------TAT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTAAGAC----------------------------GATGT-----------------------CGG-CGACGAT-GGGTCTCG-----GGGAACCAGTGGTGTT--TTGTTACT-CGTCTAT----TTCTATATGTT----TTATACATATAGTA-------T-AT-TCGTGT----GCAATTCACA---------------T-TACAC------TGCCCGTCTCC-TTAAATCACTGTTCACA-CACT--ATACCGAATA-ACTTTGC-------------TGTTATTC--ACA---------TTACAC-GTTTA-----TA------TA--TGG--------GTAT-T--GCG-GTC-------------TCCCGCA--TGCATAATATATA-C--ATATGTGTGA--T-T--------GTGTTAAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---GACGTGTCCA-TGAGT--AT-CA---TG--ATAACTATATA--------TTGTAT-------------A------TATA------T-----ATG----------------------------------------------------TTTGTTT-G------TT--------ACCCGTTG---G------TCGTTCGTAGATACTTGGCTTA--------TACACA------------------------------------------ATATTAA---ACAC--GTA-----------------TATATGCAT------GGCT---CGG-GCTG-TA-ACGCTTTACCATACCAAACAT---ATA--TATCCTGTGTTAAACT-AT------------------------------------------AT--AATGATATCGCTA Calosoma_sycophanta_CALO25405 ??G----------CATTCGA-CGC-CA-TTGCGGTCCTCGGATACTGTTCCTGGACCACGCCTGGCTGAGGGTCGTGCTATATTACCAGACTGCCGGTCG--TCT-----------------------------------------------------TTC----------ACTAATA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TATATTAC-------------TAGTCGTGAGAC----------------------------GATCT-----------------------CGG-CGATGAT-GGGTCTCG-----GGGAACCAGTGGTGAT--TTGTTACT-GT-CTAT-----TCTATATTTT--------ACATATAGTT-------T-AT-TCGTGT----GCAATTCACA---------------T-TACAC------TGCCCGTTTCC-TTAAATCACTGTTCACA-CACTT-ATACCGAATA-ACTTTGC-------------TGTTATTC--ACA---------TTACAC-GTTTA-----TA------TA--T-C--------GTAT-T--GCG-GTC-------------TCCCGCA--TGCA--AT---------ATATATGTGT--T-T--------GTGTTAAATAAGTGCG-----GAGTTGTCG---GACGTGTCCA-TGAGT--AT-CA---TG--AT-A--A-CTA--------TATTA---------------------CATA-----------------------------------------------------TATATA---TATAGTTTGTTT-G------TT--------ACCCG-CG---G------TCGTCCGTAGATACTTGGCTTA--------TACACA------------------------------------------ATAT--A---CCAC--ATA-----------------TGCATGCAT----TT--AA---AGG-GCTG-TA-ACGCTTTAC-------TTTGT---ATA-TTGG----------------------------------------------------------AA--ATATATAGAATGC Cychrus_semigranosus_CYCH1003 CCT-------AT-GATTTGA-CGCACA-TTGCGGTCCTCGGATACTGTTCCTGGACCACACCTGGCTGAGGGTCGTGCTAACTTACCAGACTGCCGGTCG--TCC-------------------------TCTTAA----------------------GTACATATAGATCCATTGT----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTGCATGCGATGCGCACTCAATCGGTGTTATTGCTTAAGAGAATTGCGATGTTGGCGA---TTGATGAGAGTGTCGGAATTCGGTGTACACACAGTAGT-----------------------CTGTTTAGTACAGATACACG-----GACAACCAGACACA-----CACCACT----CTAT-----------------------TAATTTACGA-------G-TGTGTGTGT----GTAGTCCGTG-----------------TGGACAACTATTCAGCGTGTGTATGAAATCG--GTCCGT--CTCTTTA-----AATA---TTTGGTTAA---CACA-----TAT----ACT---------GTATAC-ATATAACAAATC------TG--G-CTATTAATCGGTA-C--ACA--TA-------------TACCAAA--TTAT--TTTGCGT-TTGTCGCATGTGACCTGT--------ACGA--AATA-----------GTGTTTTCGTTTGTTTTGTTGT-ACAGT--AA-CT----------GTTA-TTG--------TCAGAC---------GTGTC------CAAG------A-----GAGAACCA-----------------------CTC-------TAGG-T---CGTCTTATACAA-T------CC--------AGCTA------CAATAAAATGTACAT-----CAAGATTGA----------AACA---CA-------------------------------------CTAT---GTTACTC--GTA-----------------CGCTAGAAACGGGTTACTGGTTCGG-T-------ACGCTTAATG------AGTGT---GTA-ATG-----CGGTGG----------------------------------------------------AAGGATATTGTAT ; END; BEGIN ASSUMPTIONS; TYPESET * UNTITLED = unord: 1 - 1264; END; BEGIN CODONS; CODESET * UNTITLED = universal: 1 - 1264; END; BEGIN MESQUITECHARMODELS; ProbModelSet * UNTITLED = 'Jukes-Cantor': 1 - 1264; END; BEGIN TREES; Title 'Trees from "ITS2_Q_INSI_1_ULN_cons.(time).con"'; LINK Taxa = Untitled_Taxa_Block; TRANSLATE 1 Carabus_abbreviatus_BABA44, 2 Carabus_abbreviatus_TENE15007, 3 Carabus_famini_MORR54807, 4 Carabus_famini_EURY1625, 5 Carabus_dufourii_ZUHE111, 6 Carabus_macrocephalus_FORO157, 7 Carabus_lusitanicus_VESC5, 8 Carabus_riffensis_KETA569, 9 Leistus_spinibarbis_CMOJ3909, 10 Carabus_melancholicus_ROBU37, 11 Carabus_melancholicus_EALM42207, 12 Carabus_melancholicus_TIDI39104, 13 Carabus_coriaceus_TURQ91306, 14 Carabus_violaceus_POPO83000, 15 Carabus_monilis_SAOU1538, 16 Carabus_nemoralis_RONC1549, 17 Carabus_auronitens_ROMA93906, 18 Carabus_rutilans_SENY1548, 19 Carabus_rugosus_KSAR65807, 20 Carabus_rugosus_SMAR43907, 21 Carabus_morbillosus_TUNA1622, 22 Carabus_morbillosus_TUNC1624, 23 Carabus_morbillosus_MAZA5908, 24 Carabus_morbillosus_TUNB1623, 25 Carabus_cancellatus_ROMA94106, 26 Carabus_cancellatus_TACHcc816, 27 Carabus_clatratus_TURQ51901, 28 Carabus_irregularis_ROMA94006, 29 Ceroglossus_chilensis_CHIL1GA, 30 Calosoma_auropunctatum_TURQ52001, 31 Calosoma_sycophanta_CALO25405, 32 Cychrus_semigranosus_CYCH1003; TREE ITS2_Q_INSI_1_ULN = (((((((1:1.225158221596649,2:1.225158221596649):8.047852227013665,(3:3.705432351107504,4:3.705432351107504):5.56757809750281):6.810413860024635,((5:2.751316058654396,(6:1.183302113471509,7:1.183302113471516):1.5680139451828943):7.780195537581459,8:10.531511596235827):5.551912712399094):1.920516774828652,9:18.003941083463396):4.215282877893301,((10:1.3621047593721975,11:1.362104759372194):1.9879772110015548,12:3.350081970373745):18.869141990982953):5.049989857378051,((((13:10.496678632413602,(14:3.8231607384919997,15:3.8231607384919997):6.673517893921602):4.404002796668898,16:14.900681429082194):3.600427838252905,((17:4.49439905617751,18:4.49439905617751):6.9340812470468975,((19:3.105896464569291,20:3.105896464569291):4.283888808861162,(((21:1.2603774589185939,22:1.2603774589185939):1.1767308975795032,23:2.437108356498097):0.9949545191958045,24:3.432062875693809):3.957722397736644):4.0386950297939475):7.072628964111004):3.0781621631146443,(25:0.9798917487004957,26:0.9798917487004957):20.599379681749348):5.689942388284905):13.07256095697764,((27:21.7388313328264,28:21.738831332826393):3.247775815714199,((29:19.440320836979303,(30:9.271676356352593,31:9.271676356352593):10.168644480627002):5.490585599203502,32:24.930906436182763):0.055700712358000004):15.355167627171689); END; Begin MESQUITE; MESQUITESCRIPTVERSION 2; TITLE AUTO; tell ProjectCoordinator; getEmployee #mesquite.minimal.ManageTaxa.ManageTaxa; tell It; setID 0 8391860748564359547; tell It; setDefaultOrder 0 22 11 6 31 7 30 8 3 13 5 23 29 12 18 17 14 19 9 20 24 26 10 25 16 21 27 15 2 28 1 4; attachments ; endTell; endTell; getEmployee #mesquite.charMatrices.ManageCharacters.ManageCharacters; tell It; setID 0 5912855729503785099; checksum 0 1807099508 null; endTell; getEmployee #mesquite.charMatrices.BasicDataWindowCoord.BasicDataWindowCoord; tell It; showDataWindow #5912855729503785099 #mesquite.charMatrices.BasicDataWindowMaker.BasicDataWindowMaker; tell It; getWindow; tell It; setExplanationSize 30; setAnnotationSize 20; setFontIncAnnot 0; setFontIncExp 0; setSize 700 500; setLocation 8 8; setFont SanSerif; setFontSize 10; getToolPalette; tell It; endTell; setActive; setTool mesquite.charMatrices.BasicDataWindowMaker.BasicDataWindow.arrow; colorCells #mesquite.charMatrices.ColorByState.ColorByState; setBackground White; toggleShowNames on; toggleShowTaxonNames on; toggleTight off; toggleShowChanges off; toggleSeparateLines off; toggleShowStates on; toggleAutoWCharNames off; toggleShowDefaultCharNames off; toggleConstrainCW on; toggleBirdsEye off; toggleColorsPanel off; birdsEyeWidth 2; toggleLinkedScrolling on; toggleScrollLinkedTables off; endTell; showWindow; getWindow; tell It; forceAutosize; endTell; getEmployee #mesquite.categ.StateNamesStrip.StateNamesStrip; tell It; showStrip off; endTell; getEmployee #mesquite.charMatrices.AnnotPanel.AnnotPanel; tell It; togglePanel off; endTell; getEmployee #mesquite.charMatrices.CharReferenceStrip.CharReferenceStrip; tell It; showStrip off; endTell; getEmployee #mesquite.charMatrices.ColorCells.ColorCells; tell It; setColor Red; removeColor off; endTell; getEmployee #mesquite.charMatrices.QuickKeySelector.QuickKeySelector; tell It; autotabOff; endTell; getEmployee #mesquite.align.AlignToDropped.AlignToDropped; tell It; gapCosts 8 3 2 2; subCosts 10 5 10 10 10 5 5 10 10 10 5 10; endTell; endTell; endTell; endTell; end;