#NEXUS BEGIN DATA; DIMENSIONS NTAX=58 NCHAR=718; FORMAT DATATYPE=DNA MISSING=X GAP=-; MATRIX Sphaerophorus_globosus AAGATCGACTCAGTTGAATAAAATTCTGAGTAGAATTATGATTATGACATTGTCTACTCACATGTCTTGACTAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATCTTTAATTGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGCAAATCAAGCCTTTT--GGGACTAGTTTGCTAGAGTTTCTTGTGAGGGGGCATTAATGTACTAACGGTGTAGAGATAAAATGTTGTGATACCTCTTTTCT-------------GGCACTGGTATAGGCGAAAGCATCCCCTTATGTGTAAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTTGTGTCGCGAATAGGATTAGATACCCTAGTAGTCAAAGGAGAAAATTATGAATGTCATAGATTAGA--------TTTAGTCTAT-----------AAATGAAAGTGTAAGCATTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGGAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAATCCGCAAAAAACCTTACCATAACTTGAATATTTA--------------------CAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGTGAGACTTTGGTTAGTTCCATTAAATTAACGTAAGCCCTTACTTTATTTTTAAATAAAGTTGTTCCCCACTAGATTGGATAA-GATAACAGGGATCAAGAC Ramalina_farinacea 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AATATCGACTCAGTCGAATAAAATTCTGGGTATAATTATGATAATGACATTGTTTACCCATGTGTCTTGGCTAAATTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATCTTTAATAGGTTTAAAGGGTACCCAGACGGTAAATCGAGCCCTAC--GGGACTAATTTGCTAGAGTTACTTACGCGGGGGTTATAAAGTACTAATGGTGTAGAGATAAAATTTTGTAATACCATTCTTCT-------------GGCACTGGTAAAGGCGAAAGCATCCCCTAATGTGATAACTGACGTTGAAGGACGAAGGCTTTGGATAGCAAATAGGATTAGATACCCTAGTAGTCTAAGCAGAGAATTATGAGTGTCATAAATTAGA--------TTTATTTTAT-----------AAATGAAAGTGTAAGCACTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGGAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAATCCGCAAAAAACCTTACCACAGCTTGAATGTTTA--------------------CAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGTGAGACTTTGGTTAGATCCATTAAATTAACGCAAACCCTTACTTTATTTTTGAATAAAGTCGTTCCCCACTATATTGGATAT-GATAACAGGGACTAAGAC Biatora_pallens 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AATATCGACTATGTTGAATAAAATTCTGGGTAGTATTATGATAATGACATTGTTTACCCATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATCTTTAATAGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTAAATCAAGCCCTAT--GGGACTAATTTACTAGAGTTACTTACAAGGAGGTTATAAAGTACTAATGGTGTAGAGATGAAATTTTGTAATACCATTTCTCT-------------GGCACTGATAAAGGCGAAAGCATCCTCTTATGTGATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTTGGGTCGCGAATAGGATTAGATACCCTAGTAGTCAAAGCAGACAATGATGAGTGTCATAGATTAGG--------TTTATTCTAT-----------AAATGAAAGTGTAAGCACTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGGAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAATCCGCAAAACACCTTACCACAACTTGAATATGAA--------------------CAAGCGTTGCACGGCTGTCTACAGTTAATGTCGTGAGACTTTGGTTAGATCCATTAAATTAACGCAAGCCCCTACTTTATTTTTAAATAAAGTCGTTCCCCACTATATTGGATAT-GATAACAGGGACTAAGAC Lecania_gerlachei AATATCGACTACGTCGAATAAAATTCTGGGTAGAATTTTGATAATGACATTGTTTACCCATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATCTTTAATAGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTAAATCGAGCCAGAT--GGGACTAATTTACTAGAGTTACTTACAAGGAGGCTATAAAGTACTAATGGTGTAGAGATGAAATTTTGTGATACCATTTTCCT-------------GGCACTGGTAAAGGCGAAAGCATCCTCTTATGTGATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTTGGATCGCGAATAGGATTAGATACCCTAGTAGTCAAAGCAGAAAATGATGAGTGTCATAGATTAGA--------TTTATTCTAT-----------AAATGAAAGTGTAAGCACTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGGAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAATCCGCAAAACACCTTACCACAACTTGAATAATAA--------------------CAAGCGTTGCACGGTTGTCTACAGTTAATGTCGTGAGACTTTGGTTAGATCCATTAAATTAACGCAAGCCCTTACTTTATTTACTGATAAAGTTGTTCCCCACTATATTGGATAT-GATAACAGGGACTAAGAC Lecania_belgica AATATCAACTACGTTGAATAAAATTCTGGGTAAAATTATGATGATGACATTGTTTACCCATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATCTTTAATAGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTAAACCAAGCTCTAC--AGGACTAGTTTACTAGAGTTACTTACAAGGAGGCTATAAAGTACTAATGGTGTAGAGATGAAATTTTGTGATACCATTTCTCT-------------GGCACTGATAAAGGCGAAAGCATCCTCTTATGTGATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTTGGATCGCGAATAGGATTAGATACCCTAGTAGTCAAAGCAGAAAATGATGAGTGTCATAGATTAGA--------TTTATTCTAT-----------AAATGAAAGTGTAAGCACTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGGAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAATCCGCAAAACACCTTACCACAACTTGAATATGGA--------------------CAAGCGTTGCACGGCTGTCTACAGTTAATGTCGTGAGACTTTGGTTAGATCCATTAAATTAACGCAAGCCCTTACTTTATTTTCAAATAGAGTCGTTCCCCGCTAGATTGGATAT-GATAACAGGGACTAAGAC Lecania_sambucina AATATCAACTACGTTGAATAAAGTTCTGGGTAAAATTATGATGATGACATTGTTTATCCATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATCTTTAATAGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTAAACCAAGCCCTAT--GGGACTAGTTTACTAGAGTTACTTACAAGGAGGCTATAAAGTACTAATGGTGTAGAGATGAAATTTTGTGATACCATTTCTCT-------------GGCACTGATAAAGGCGAAAGCATCCTCTTATGTGATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTTGGGTCGCGAATAGGATTAGATACCCTAGTAGTCAAAGCAGAAAATGATGAGTGTCATAGATTAGA--------TTTATTCTAT-----------AAATGAAAGTGTAAGCACTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGGAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAATCCGCAAAACACCTTACCACAACTTGAATATGGA--------------------CAAGCGTTGCACGGCTGTCTACAGTTAATGTCGTGAGACTTTGGTTAGATCCATTAAATTAACGCAAGCCCTTACTTTATTTTTAAATAGAGTCGTTCCCCGCTATATTGGATAT-GATAACAGGGACTAAGAC Lecidea_sphaerella AATATCGACTATGTTGAATAAAATTCTGGGTAGAATTATGATAATGACATTATTTACCCATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATCTTTAATAGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTAAATAAAGCCCTAC--GGAACTAATTTACTAGAGTTACTTACAAGGGGGCTATAAAGTACTAATGGTGTAGAGATGAAATTTTGTAATACCATTTTCCT-------------GGCACTGATAAAGGCGAAAGCATCCTCTTATGTGATAACTGACGTTGAGGGACGAAGGCTTTGGATCGCGAATAGGATTAGATACCCTAGTAGTCAAAGCAGACAATCATGAGTGTCATAGATTAGA--------TTTCTTCTAT-----------AAATGAAAGTGTAAGCACTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGGAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAATCCGCAAAACACCTTACCACAACTTGAATAGTAA--------------------CAAGCGTTGCACGGCTGTCTACAGTTAATGTCGTGAGACTTTGGTTAGATCCATTAAATTAACGCAAGCCCTTACTTTATTTTAATATAAAGTTGTTCCCCACTATATTGGATAT-GATAACAGGGACCAAGAC Mycobilimbia_pilularis AATATCGACTATGTTGAATAAAATTCTGGGTATATTTATGATAATGACATTTTTTGCCCATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATCTTTAATAGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTAAATAAAGCCCTAC--GGAACTAATTTACTAGAGTTACTTACAAGGAGGCTATAAAGTACTAATGGTGTAGAGATGAAATTTTGTAATACCATTTTCTT-------------GGCACTGATAAAGGCGAAAGCATCCTCTTATGTGATAACTAACGTTGAGGGACGAAGGCTTTGGATCGCGAATAGGATTAGATACCCTAGTAGTCAAAGCAGACAATGATGAGTGTCATAGATTAGA--------TTTATTCTAT-----------AAATGAAAGTGTAAGCACTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGGAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATGATCCGCAAAACACCTTACCACAACTTGAATAAAAA--------------------CAAGCGTTGCACGGCTGTCTACAGTTAATGTCGTGAGACTTTGGTTAGATCCATTAAATTAACGCAAGCCCTTACTTTATTTCCAAATAAAGTAGTTCCCCACTATA-TGGATAT-GATAACA----------- Lecania_glauca AATATCGACTCTGTCGAATAAAGTTTTGGGTAAATTTATGATAATGACATTGTTTACCTAGATGTCTTGACCAAATTATGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACATAGAAGACAAGTGTTATTCATCTTTAGTAGGTTTAAAGGGTACCTAGACAGTAAATCAAGCCCCAC--GGTACTAATTTTCTAGAGTTACTTACAAGGGGGCTCTTAAGTACTAATGGTGTAGAGATAAAATTTTGTGATACCAATTTTAT-------------GGCACTGGTAAAGGCGAAAGCATCCCCTTATGTGATAACTGACGTTGAAGGACGAAGGCTTTGAGTCGCGAATAGGATTAGATACCCTAGTAGTCTAAGCAGAGAATTATGAGTGTCATAGATTAGA--------TTTATTCTAT-----------AAATGAAAGTGTAAGCACTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGGAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAATCCGCAAAACACCTTACCACAATTTGAATAAAGA--------------------CAAGCGTTGCACGGCTGTCTACAGTTAATGTCGTGAGACTTTGGTTAGATCCATTAAATTAACGCAAGCCCTTACTTTATTTTTAAATAAAGTTGTTCCCCACTATATCGGATAT-GATAACAGGGACT----- Biatora_vernalis AAAATCGACTCAGTCGAATAAAATTCTGGGTATAATTATGATGATGACATTATTTACCCATGTGTCTTGACCAAATTACGTGCCAGCAGTCGCGGTAATACGTAGAAGACTAGTGTTATTCATCTTTAATAGGTTTAAAGGGTACCTAGACGGTAAATCAAGCCCTAT--GGGACTAATTTGCTAGAGTTACTTTCGCGGGGGTTTTAAAGTACTAATGGTGTAGAGATAAAATTTTGTAATACCATTTTTCT-------------GGCACTGGTAAAGGCGAAAGCATCCCCTTATGTGATAACTGACGTTGAAGGACGAAGGCTTTGGGTCGCGAATAGGATTAGATACCCTAGTAGTCGAAGCAGAAAATGATGAGTGTCATAGATTAGA--------TTTATTCTAT-----------AAATGAAAGTGTAAGCACTCCACCTCAAGAGTAATTTGGCAACATTGGAACTGAAATCATTAGACCGTTTCTGAAACCAGTAGTGAAGTATGTTGTTTAATTTGATAACCCGCAAAAAACCTTACCACAACTTGAATATTTA--------------------CAAGCGTTGCACGGCTGTCTTCAGTTAATGTCGTGAGACTTTGGTTAGATCCATTAAATTAACGCAAGCCCTTACTTTATTTTTAAATAAAGTCGTTCCCCACTATATTGGATAT-GATAACAGGGACTAAGAC ; END; BEGIN ASSUMPTIONS; OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS; TYPESET * UNTITLED = unord: 1 - 718; EXSET * UNTITLED = 169-170 254- 266 394-401 412-422 565-584 700; END; Begin trees; Translate 1 Sphaerophorus_globosus, 2 Ramalina_farinacea, 3 Lecania_baeomma, 4 Lecania_aipospila, 5 Lecania_cyrtella, 6 Lecania_cyrtellina, 7 Lecania_atrynoides, 8 Lecania_hutchinsiae, 9 Lecania_rabenhorstii, 10 Lecania_erysibe, 11 Lecania_inundata, 12 Lecania_naegelii, 13 Lecania_nylanderiana, 14 Lecania_furfuracea, 15 Lecania_turicensis, 16 Crocynia_pyxinoides, 17 Lecania_chlorotiza, 18 Lecania_falcata_1, 19 Lecania_falcata_2, 20 Toninia_sedifolia_1, 21 Toninia_sedifolia_2, 22 Toninia_cinereovirens, 23 Bacidina_phacodes, 24 Scutula_miliaris, 25 Scutula_krempelhuberi, 26 Bacidia_sulphurella, 27 Bacidina_arnoldiana, 28 Bacidina_egenula_1, 29 Bacidina_egenula_2, 30 Bacidina_chloroticula_1, 31 Bacidina_neosquamulosa_1, 32 Bacidina_neosquamulosa_2, 33 Bacidia_sipmanii, 34 Bacidia_rosella, 35 Bacidia_rubella_1, 36 Bacidia_rubella_2, 37 Bacidia_arceutina, 38 Bacidia_schweinitzii, 39 Bilimbia_lobulata, 40 Bilimbia_microcarpa, 41 Bilimbia_sabuletorum, 42 Catillaria_scotinodes, 43 Cliostomum_tenerum, 44 Biatora_meiocarpa, 45 Mycobilimbia_tetramera, 46 Lecania_brialmontii, 47 Biatora_veteranorum, 48 Biatora_ligni_mollis, 49 Biatora_pallens, 50 Lecania_dubitans, 51 Lecania_fuscella, 52 Lecania_gerlachei, 53 Lecania_belgica, 54 Lecania_sambucina, 55 Lecidea_sphaerella, 56 Mycobilimbia_pilularis, 57 Lecania_glauca, 58 Biatora_vernalis ; tree mtssu = [&U] (1:0,((2:100,3:100):76.048,(4:100,((5:100,8:100,(10:100,53:100):92.383):64.501,50:100,54:100):98.683,6:100,((7:100,15:100):96.524,11:100):76.458,9:100,(12:100,14:100,43:100):99.676,13:100,((39:100,40:100):53.727,41:100):85.83,42:100,45:100,(46:100,52:100):100,51:100,(55:100,56:100):60.175):60.532,16:100,44:100,(47:100,48:100):85.891,49:100,57:100,58:100):78.383,(((((17:100,18:100):100,22:100,23:100,((24:100,25:100):100,(26:100,27:100,((28:100,29:100):100,(31:100,32:100):100):53.254,30:100):100):50.389):73.022,(20:100,21:100):100):61.84,19:100):96.098,(((33:100,37:100):100,(34:100,(35:100,36:100):90.422):53.353):98.617,38:100):100):98.8); End;