NEXUS [File created by TreeBASE: 7/26/07 21:06:31] [Matrix accession#: M2053] BEGIN TAXA; TITLE M2053; DIMENSIONS NTAX=64; TAXLABELS Rana_zweifelii Rana_yavapaiensis Rana_warszewitshii Rana_virgatipes Rana_vibicaria Rana_vaillanti Rana_tlaloci Rana_temporaria Rana_taylori Rana_tarahumarae Rana_sylvatica_DMH84R43 Rana_sylvatica Rana_subaquavocalis Rana_sphenocephela_utricularia Rana_sphenocephela Rana_spectabilis Rana_sp8_KU_195346 Rana_sp7_KU_194492 Rana_sp6_LACM_146810 Rana_sp5_LACM_146764 Rana_sp4_AMNH_A_124167 Rana_sp3_KU_194559 Rana_sp2_KU_204420 Rana_sp1_QCAZ13219 Rana_sierramadrensis Rana_sevosa Rana_septentrionales Rana_pustulosa Rana_psilonota Rana_pipiens_Y10945 Rana_pipiens_JSF1119 Rana_palustris Rana_palmipes_KU204425 Rana_palmipes_AMNHA118801 Rana_onca Rana_omiltemana Rana_okaloosae Rana_neovolcanica Rana_muscosa Rana_montezumae Rana_magnaocularis Rana_maculata Rana_macroglossa_b Rana_macroglossa Rana_luteiventris_MVZ225749 Rana_luteiventris_MVZ191016 Rana_juliani Rana_heckscheri Rana_grylio Rana_forreri Rana_dunni Rana_clamitans Rana_chiricahuensis_KU_194442 Rana_chiricahuensis_KU_194419 Rana_catesbiana_X12841 Rana_catesbiana_DMH84R2 Rana_cascadae Rana_capito Rana_bwana Rana_boylii Rana_blairi Rana_berlandieri Rana_aurora Rana_areolata ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE M2053; DIMENSIONS NCHAR=2014; FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? 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Rana_taylori 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Rana_sp1_QCAZ13219 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Rana_sierramadrensis GCCATAAACAATTAATTTACACTTATCAACGCCAGGGAATTACGAGCAATGCTTAAAACCCAAAGGATTTGACGGTGTCCCACCCAACTAGAGGAGCCTGTTCTATAATCGATAATCCCCGCTATACCTCACCATTCCTCGCTT-TCAGTCTGTATACCTCCGTCGAAAGCTTACCATGTGAACGTCT-ACAGTAGGCCCAATGAT---TTACAC---ATCAACACGTCAGGTCAAGGTGCAGCTTAAGGAATAGGAAGAAATGGGCTACAATTTCTAATTTAGAACAAACGGAAGACTATGTGAAACC-TAGTCATGAAGGCGGATTTAGCAGTAAAAAGGAAATA?AGTGTTCTTTTTAATCTGGCTCTGGGACGCGTACACACCGCCCGTCACCCTCTTCAATAGTA-ACTTTATTTGTTTCTAACCT-ATTAT-TACATTTT-AGAAGAAGCAAGTCGTAACATGGTAAGTGTACTGGAAAGTGCACTTGG--TC-TATCAAAATGTACCTTAACTAAAGCCCTTTGTTTACACCGAAAACATAACTGTTAAAATCAGTTCATTTTGAGCCTAAAACCTAACCTA---------CACATACTCGCATGAAC-TCTCTTC---CATAAT---CCCTAAA-TAAAACATTTTATTATTATAGTACAGGTGATCGAAAAA-TTTCTAAGCGCTTCAGATAAAGTACCGCAAGGGAAAGATGAAATAGAATTGAAATAATCTTAAAGCCTTAAACAGTAGAGATATTCCCTCGTACCTTTTGCATCATGGTCTAGTTAGTCTATTC-AAGCAAAATGAAAATTTT-AGTTAGACACCCCGAAACTAAGGGAGCTACTTCAAAACAGCCTATT-GGGCCAACCCATCTCTGTTGCAAAAGAGTGGGAAGATTTTCAAGTAGAGGTAATAAGCCTACCGAACTTAGAGATAGCTGGTTGTTCAGGAAAAGAGTTTTAGCTCTACCTTAAGCTTCGTT-ATGATACTA-AACAAATACAAAAAGCTTAAGAGCTATTCAAATAAGGCACAGCTTATTTGAAATAGGATACAACCTATAATAATGGGT-AAGTAAAA-TTTAATAAAA-TGAAGTGGGCCTAAAAGCAGCCACCTTTTAAAAAGCGTTTAAGCTTAATTAGAATT-ATTAATAA-TTTCCACAATCTTTTCAAACCCTTTAT-TCTTACTGAACTACTTTATA-ATTTTATAAAAGCAATAATGCTAGAACTAGTAACAAGAAATTGATT-TTCTCCTAAATGTAAGCATAAACCAAAATGGACTCCCCATTGGTAATTAACGTCAATGCAAAA-TTATAACAACACAC--------TAGAAAACCTTATAACCGAT-AACGTTAACCTCACACTAGAACATTTCAGGAAAGATTAAAAGAGAAAGAAGGAACTCGGCAAAATTTAGCCTCGCCTGTTTACCAAAAACATCGCCTCTTGACAAAATATAAGAGGTCCAGCCTGCCCAGTGATATAATTCAACGGCCGCGGTACCCTAACCGTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAAATGGGGACTCGTATCAATGGCACCACGAAGGCTATACTGTCTCCTTTCTCCAATCAGTGAAACTGATCTTCCCGTGAAGAAGCGGGAATTTAAATATAAGACGAGAAGACCCCATGGAGCTTTAAACTCACTATACACCTCT-GCATCCT-TTAAATCCACCCACCCAAGAGTAT-TGTATACTAATTTTAGGCTGGGGGGGCCTCCGAATAAAATTTAACCTCCATAACAAATGGGCTAACACCCTTATCTACGAAAAACACCTCTAA?AATTATTAAAATAATGTTA-AAGACCCGATAA-TTCGATTAATGAACCAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCTACTTCGAGAGTTCCTATCGACAAGTAGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTATCCCAGTGGTGCAACCGCTACTGATG-GTTCGTTTGTTCAACG Rana_sevosa 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Rana_septentrionales GCCGTAAACAATTAATTTACACCAATAAGCGCCAGGGAATTACGAGCAATGCTTAAAACCCAAAGGATTTGACGGTGTCCCACCCCACTAGAGGAGCCTGTTCTATAATCGATGATCCCCGATACACCCGACCATTTCTCGCTTATCAGTCTGTATACCTCCGTCGAAAGCTTACCATGTGAACGCCC-GCAGTAGGCTTAATGAC--CTTACAC---GTCAGTACGTCAGGTCAAGGTGCAGCTTAAGAAATGGGAAGCAATGGGCTACAATTTCTAATTTAGAACAAACGAAAGACTGTATGAAATTACAATCATGAAGGTGGATTTAGTAGTAAAAAGAAAGTAGAGTGTTCTTTTTAACCCGGCTCTGGGACGCGTACACACCGCCCGTCACCCTCTTCGATAGTA-TCTTATCTAGTTCCTAACCT-ATTAC-TACATTTT-AGAAGAGGCAAGTCGTAACATGGTAAGTGTACTGGAAAGTGCACTTGGTTTA-T-ACAAGATGTAGCTTAATAAAAGCCTCTCGCTTACACCGAGAAAATACCCGTTTAAACCGGATCATTTTGAGCCTAAAATCTAGCCTA---------TACACACTCGCATGACCCCCCCCCCTTACCCCAG---CCTTTAA-ATAATCATTTTAATATTATAGTACAGGCGATCGAAAAA-TTTCTAAGCGCTTCAGACAAAGTACCGCAAGGGAAAGATGAAATAGAAATGAAATAATCTTAAAGCCCAAAACAGCAGAGATAATCTCTCGTACCTTTTGCATCATGGTCTAGCCAGTCTACCC-AAGCGAAATAAAACTTTT-AGTTTGCCATCCCGAAACTAAGTGAGCTACTTCAGAACAGTCCTACGGGACCAACCCATCTCTGTTGCAAAAGAGTGGGAAGATTTTTAAGTAGAGGTGATAAGCCTACCGAACTTAGAGATAGCTGGTTATTCAGGAAGAGAGTTTTAGCTCTACCTTAAGCTTTCTCTATCAAACTA-AAGAAACCC-CAAAGCTTAAGAGCTATTCAAATAAGGCACAGCTTATTTGAAATAGGAAACAACCTCCAACACTGGGT-AAATAATA-GTAATTTAAA-TAAAGTGGGCCTAAAAGCAGCCACCTTTTGAAAAGCGTTAAAGCTTAACTATAAACTACTAATAA-TGCCTTAAATATTAACTAACCCTTCAT-CCCTACTGAATCACTTTATA-TTTTTATAAAAGCTATTATGCTAGAACTAGTAACAAGAAATTGGCT-TTCTCCTAAATGTATGTATAAACCAAAATGGACCATCCACTGGTAATTAACGCAAATGCAAAATTTATAACAACACAAC-------TAGAAAACCCTATAACTACA-AACGTTAAACTTACACTAGAACATTCCAGGGAAGATTAAAAGAGAAAGAAGGAACTCGGCAAATTTTAGCCTCGCCTGTTTACCAAAAACATCGCCTCTTGATTAAACATAAGAGGTCCAGCCTGCCCAGTGACAAAGTTCAACGGCCGCGGTACCCTAACCGTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTCCTTTAAATAGGGACTTGTATCAACGGCACCACGAGGGCTATACTGTCTCCTTTCTCCAATCAGTGAAACTGATCTCCCCGTGAAGAAGCGGGGATTTTATTATAAGACGAGAAGACCCCATGGAGCTTTAAACTCATCATACATCTCT-ATGCACT-ACATCAAC-CCACAT-AAGAAATC-TGTATGCTAGTTTTAGGTTGGGGGGACCACGGAGTATAATTTAACCTCCACAACAAATGGGCTAACACCCTTATCTACGAGATACACCTCTAAGAATTACTAAACTAATGTTTAATGACCCAATAA-TTTGATCAATGAACCAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCTACTTCAAGAGCCCCTATCGACAAGTAGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTATCCTAGTGGTGCAGCCGCTACTAATG-GTTCGTTTGTTCAACG Rana_pustulosa 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Rana_psilonota ACCGTAAACAATTAATTTACACCAATCAGCGCCAGGGGATTACGAGCAATGCTTAAAACCCAAAGGATTTGACGGTGTCCCACCCAACTAGAGGAGCCTGTTCTATAATCGATGATCCCCGCTACACCCAACCATTTCTCGCTC-TCAGTCTGTATACCTCCGTCGAAAGCTTACCATGTGAACGTTT-ACAGTAGGCCCAAGGAC---TTACAC---GTCAATACGTCAGGTCAAGGTGCAGCTTAAGAAATGGGAAGCAATGGGCTACAATTTCTAATTTAGAACAAACGAAAGACTATGTGAAACCATAATC-TGAAGGTGGATTTAGCAGTAAAAAGGAAATATAGTGTTCTTTTTAACCTGGCTCTGGGACGCGTACACACCGCCCGTCACCCTCTTCGATAGTA-CTCCCATTTGTTCCTAACTT-ATTAT-TACGCCTT-AGAAGAAGCAAGTCGTAACATGGTAAGTGTACTGGAAAGTGCACTTGG--AC-TACCAAAATGTAGCTTAATTAAAGCCCCTCGCTTACACCGAAGATATGACTGTTAAAATCAGTTCATTTTGAGCCTAAAATCTAGCCCA---------CTATAT-TCATATGACTTTCTATCC---CATAGT---CTCTAAA-CAAAACATTTTATTATTCTAGTATAGGTGATCGAAAGA-TTTCTAAGCGCTTCAGATAAAGTACCGTAAGGGAAAGATGAAATAGAATTGAAATAATCTTAAAGCCCTGTATAGCAGAGACACCCCCTCGTACCTTTTGCATCATGGTCTAGTTAGTTTATTC-AAGCAAAATGAAATTTTT-AGTTAGACACCCCGAAACTAAGGGAGCTACTTCAAAACAGCCTAAT-GGGCTAACCCGTCTCTGTTGCAAAAGAGTGGGAAGATTTTTAAGTAGAGGTGAAAAGCCTATCGAACTTAGAGATAGCTGGTTGTTCAGGAAAAGAGTTTTAGCTCTACCTTAAG-TTTACATATGATATAA-AACAAACTT-TGAAGCTTAAGAGCTATTCAAATAAGGCACAGCTTATTTGAAACAGGATACAACCTATAATATTGGGT-AAGTAATA-GTAGGATAAAATTAAGTGGGCCTAAAAGCAGCCACCTTCAAAAAAGCGTTAAAGCTTACCTAAAATT-ACTGATAA-TTTGTAAAATTATTATTAACCCTTTTT-TTGTACTGAACTATTTTATA-TATTTATAAAAGCAATAATGCTAGAACTAGTAACAAGAAATTGACT-TTCTCCTAAATGTAAGCTTAAACCAAAATTGACAACCCATTGGTAATTAACGTAAATGTAAAAACTATAATAAATTAC--------TAGAAAAACTTATAATCTAA-AACGTTAACCTAACACTAGAACATTATAGGAAAGATTAAAAGAGAAAGAAGGAACTCGGCAAAATTTAACCTCGCCTGTTTACCAAAAACATCGCCTCTTGATTAAATATAAGAGGTCCAGCCTGCCCAGTGACATAGTTTAACGGCCGCGGTACCCTAACCGTGCGAAGGTAGCATAATCAATTGTTCTATAAATAGGGACTAGTATCAACGGCACTACGAAGGTTATACTGTCTCCTTTCTCCAATCAGTGAAACTGATCTCCCCGTGAAGAAGCGGGGATATAACTATAAGACGAGAAGACCCCATGGAGCTTTAAACTCATTATACACCTCT-GTGATTTTTATAACCTGTTAATCCAAAAGACC-TGTATATTAGTTTTAGGTTGGGGGGACCCCGGAGTACAACTAAACCTCCGTAACAAATGGGCTAATACCCTTATCCACGAGAAACACCTCTAAGAATTAATAAATTAATGTTTAATGATCCGATTA-CTCGATCAATGAACCAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCTATTTCCAGAGCTCCTATCGACAAGTAGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTATCCCAGTGGTGCAACCGCTACTAATGTGTTCGTTTGTTCAACG Rana_pipiens_Y10945 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Rana_pipiens_JSF1119 ACCGTAAACAATTAATTTACACCCATCAGCGCCAGGGAAATACGAGCAATGCTTAAAACCCAAAGGATTTGACGGTGTCCCACCCAGCTAGAGGAGCCTGTTCTTTAATCGATGATCCCCGCTACACCTGACCATTTCTTGCTCATCAGTCTGTATACCTCCGTCGAAAGCTTACCATGTGAACGTCT-TCAGTAGGCTCAATGATCATAATTAC---ATCAATACGTCAGGTCAAGGTGCAGCTTAAGAAATGGGAAGCAATTGGCTACCATTTCTAATATAGAACAAACGAAAGGCTATGTGAAATCATAGCAGCGAAGGTGGATTTAGTAATAAAAAAAAAATATAGTGTTCTTTTTAACCCGGCTCTGGGATGCGTACACACCGCCCGTCACCCTCTTCGATAGTA-AATAATATTGTCCCTAACCC-ATTAT-CACGTTTT-AGAAGAAGCAAGTCGAAACATGGTAAGTGTACTGGAAAGTGCACTTGGAAAA-TAACAAAATGTAGCTTAACAAAAGCCCTTCGCTTACACCGAAGAAATATCTGTTCAAATCAGATCATTTTGAGCCCAAAATCTAGCCTT----------CAAGACTCACATGAACCCCATTCCT--ACTGAC---TCCTAAA-CAAAACATTCTCCCATTATAGTACAGGTGATAGAAAAAATTCTTAAGCGCTTTAGACAAAGTACCGCAAGGGAAAGATGAAATAGAACTGAAATAACCTTAAAGCCCTAAACAGCAGAGACACCCCCTCGTACCTTTTGCATCATGGTCTAGCTAGTCTACAC-AAGCAAAATGAAACTTTT-AGTTAGTCCTCCCGAAACTAAGCGAGCTACTTCAAAACAGCCCAATGGGGCTAACCCTTCTCTGTTGCAAAAGAGTGGGAAGATTTTCAAGTAGAAGTGAAAAGCCTACCGAGCTTAGAGATAGCTGGTTATTCAGGAAAAGAGTTTTAGCTCTACCTTAAGCTTCTTT-ATGACACCT-AACAAACCC-TAAAGCTTAAGAGCTATTCAAATAAGGCACAGCTTATTTGAAACAGGATACAACCTACAATACTGGGT-AAATAATAAGTGAATAAAA-TAAAGTTGGCCTAAAAGCAGCCACCTT-AAAAAAGCGTTAAAGCTTAGTTCTACAC-ACTTACAA-TTTCTAAAATTTTGATCAACCCTTTAT-CCCTACTGAATTATTTTATA-TCCTTATAAAAGTAATAATGCTAGAACTAGTAACAAGAAACTGCCCATTCTCCTAAATGCAAGCATAAACCAGAATAGACACCCTACTGGTAATCAACGTAAATGTCACTTTTATAGTAACATAG--------TAGAAAATCCTATAATCCCCTTACGTTAACCTTACACTAGAGCATTTCAGGAAAGATTAAAAGAGAAAGAAGGAACTCGGCAAACTTCAGCCTCGCCTGTTTACCAAAAACATCGCCTCTTGAAAAAATATAAGAAGTCCAGCCTGCCCAGTGACTAAGTTTAACGGCCGCGGTACCCTAACCGTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAATTGGGGACTCGTATCAACGGCATCACGAAGGCTGCACTGTCTCCTTTCTCTAATCAGTGAAACTGATCTCCCCGTGAAGAAGCGGGGATAAAATTATAAGACGAGAAGACCCCATGGAGCTTCAAACTCATCATGCAACTCT-GTCCTCC-ATATCCCT-TAATTC-AAGAGATG-TGCATGTTAGTTTTGGGTTGGGGGGACCTCGGAGTATAACTTAACCTCCAAAACAAATGGGTTAACACCTTTATCCGCGAGAAACACCTCTAAGAATTACTAAACTAATGCTTTTTGATCCGATAA--TCGATCAATGGACCAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCTACTTCAAGAGTTCATATCGACAAGTGGGTTTACGACCTCCATGTTGGATCAGGGTATCCTGGTGGTGCAACCGCTACTAATG-GTTCGTTTGTTCAACG Rana_palustris 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Rana_okaloosae 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Rana_neovolcanica 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Rana_muscosa 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Rana_montezumae 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Rana_magnaocularis 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Rana_luteiventris_MVZ225749 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Rana_juliani 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Rana_aurora 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