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Haematoxylon_8841_2 Hoffmannseggia_glauca_12699 Jacqueshuberia_brevipes Koompassia_excelsa_1V99 Lemuropisum_edule_1033_clone_2 Medicago_sativa Medicago_truncatua Melanoxylon_brauna_10 Mezoneuron_angolensis_12XII971 Mezoneuron_kauaiensis_1602 Moldenhawera_floribunda_30 Mora_gonggrijpii_13792 Moullava_spicata Pachyelasma_tessmannii_15432 Parkia_multijuga Parkinsonia_aculeata_12704 Peltophorum_dubium_2436 Peltophorum_pterocarpum_3719 Pentaclethra_macrophylla_11496 Phaseolus_vulgaris Piptadenia_anolidurus Pisum_sativum Pomaria_jamesii Pterogyne_nitens_13XII971 Pterolobium_stellatum_17XII979 Recordoxylon_amazonicum_1683 Schizolobium_parahyba_694 Sclerolobium_sp Senna_spectabilis_74IV996 Stachyothyrsus_staudtii Stahlia_monsperma Stuhlmannia_moavi_7509 Swartzia_cardiosperma Tachigali Tetrapterocarpon_geayi_1395 Umtiza_listeriana_2602 Vicia_faba Vigna_radiata Vouacapoua_macropetala_13793 ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE Fig._2_Matrix; DIMENSIONS NCHAR=3368; FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING 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Bobgunnia_fistuloides 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Burkea_africana 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Bussea_occidentalis_19245 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Cassia_javanica 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Ceratonia_siliqua_3314 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Chidlowia_sanguinea 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Dussia_tessmannii_628 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Entada_polyphylla 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Erythrophleum_ivorense 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Peltophorum_pterocarpum_3719 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Pentaclethra_macrophylla_11496 GCACTTGAGAAGACCAAGTATCCTGATTCTGACATTTACTGGAAGAAATTCGAAGACAAATACCACTTCTCATGCCAATTTACAGCCGATCTTTTCGCAATGAACCACACTGACTTCATCATCACCAGTACCTTCCAAGAGATTGCTGGAAGGAGCAAGGATACCGTTGGACAGTATGAGAGCCACACCGCGTTCACCCTCCCCGGACTCTACAGGGTGGTTCACGGTATCGATGTGTTTGATCCCAAGTTCAACATCGTCTCCCCCGGAGCCGACATGAGCATCTACTTCCCCTACACTGAAACTAAGTCTAGGTTGACTTCCTTCCACCCCGAGATCGAAGAACTTCTTTACAGCTCCGTCGAGAATGAAGAGCACATGAGCTGTGTGTTGAAGGACCGGAACAAGCCAATCATCTTCACCATGGCTAGATTGGACCGTGTGAAGAACATTACAGGACTGGTCGAGTGGTACGGTAAGAACGCCCGCCTCCGTGACCTGGTGAACCTTGTGGTGGTTGCTGGTGACAGGAGGAAGGAGTCAAAGGACTTGGAA??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATTGTAAAACGTTTAATTACTCGAATGTATCAACAGAATCATTTGATTATTTCTGCTAATGATTCTAACAAAAATCCATTTTGGGGGTACAACAAGAATTTGTATTCTCAAATAATATCAGAGGGGCTTACCGTCAGTGTGGAAATTCCATTTTCCCTACAATT---AATCTCTTCCTTAGAGAAGGCAGAAATCATAAAATCTTATAAT---TTACGATCAATTCATTCAATATTTTCTTTTTTTGAGGAAAGATTTCCATATTTAAATTATGTGTCAGATGTACAAATACCCTACCCTATCCATCTGGAAATCTTGATTCAAAACCTTCGATATTGGGTGAAAGATGCCTCTTCTTTTCATTTATTAAGGCTCTTTCTTTATGAGTATTGTAATTGGAAT------AGTCTTATTACTCCAAAAAAAAGGATTTCCACTTTT------TCAAAAA---GTAATCCAAGATTTTTCCTGTTCCTATTTCATTTTTATGTATGTGAATACGAATCCATCTTTTTTTTTCTCCGTAACAAATCTTCTTATTTACGATTAACATCTTCTGGAGTCCTTTTTGAGCGAATCTATTTCTATGCAAAAATAGAGCATTTTGTAGAAGTCTTTGATAAGGATTTTCCGTCCACCCTATGGTTCTTCAAGGACCCTCTCATTCATTATGTTAGATATCAAGGAAAATCAATTCTGGCTTCAAAGGATACGCCCTTTTTGATGAAAAAATGGAAATACTATCTTATCCATTTATGGCAATGTCATTTTGATGTTTGGTCTCAACCAGGAAAGATCCATATAAACCAATTATCCGAGCATTCGTATTCCTTTTTGGGCTATTTTTCAAATGTGCGGCTAAATCCTTCAGTGGTACGGAGTCAAATGTTGGAAAAGTCATTTATAATGGAAAATCTTATGAAAAAGCTTGATACAATAATTCCAATTATTCCTCTAATTAGATCATTGGCTACAGCGAGA???????????????GGACATCCCATTAGTAAGCCGGTCTGGGCCGATTCATCCGATTTTGATATTATTGACCGATTTTTGCAGATATGCAGAAATCTTTCTCATTATTACAACGGATCCTCAAAAAAAAAGAGTTTGTATCGAATCAAATATATACTCCAGCTTTCTTGTATTAAAACTTTGGCTCGTAAACACAAAAGTACTGTACGCGTTTTTTTGAAAAGATTAGGTTCTGAA---TTATTGGAAGAATTC------TTTACAGAGGAAGAAGATATTTTTTCTTTGATCTTCCCAAGAGCTTCTTCTACTTTGCAGAGGTTATATAGAGGTCGGATTTGGTATTTGGATATTTTTGATTTTCATCAATGATCTGGTCAA---TCATGAGACTTAATTAGATTGAGCCTTGGTATGGAAACCTACCAAGTGATAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTTCCGAAAA---------CCAAGAAGAGTTCAGAAAGGGA-------GAATAAAAAA-----AGGATAGGTGCAGAGACTCAACGGAAGCTGTTCTAACAAATGGAGTTGACGGCATCTCTTTT----CGTTAGT------------------------?---------------------AAAG-GAATCCTTCCATCGAAACTCCAGAAAA?GAAAGGATCAAGAATGAGACATATACGTACTGAAATACTATTTC-AATTGATTAGACCAGACAGA-----CCCCAAATCCCTATTTTTT------AATAT-----------------TTATATGACAAATGAAAGATGTGAAT----------------------CGATTCCAAGTTGAAGAAAGAA----TCGAATATTCATTGATCAAATCATTCACTCCATCA------TAGTCTGGTAGA----------TCTTTTGAAGAACTGAT----------------------------TAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACAACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGA Phaseolus_vulgaris 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Piptadenia_anolidurus 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Pomaria_jamesii 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Vigna_radiata 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Vouacapoua_macropetala_13793 GCACTTGAGAAGACCAAGTATCCTGATTCTGACATTTACTGGAAGAAATTTGAAGACAAGTATCACTTCTCTTGCCAATTTACGGCCGATCTTTTCGCAATGAACCACACTGACTTCATCATCACTAGTACCTTCCAAGAGATTGCTGGAAGGAGCAAGGATACTGTTGGACAGTACGAGAGCCACACCGCTTTCACCCTCCCAGGACTCTACCGGGTTGTTCACGGCATCGATGTCTTCGATCCCAAGTTCAACATTGTCTCCCCCGGAGCCGACATGAGCATCTACTTCCCCTACACTGAAACCAAGCATAGGTTGACCTCCTTCCACCCTGAGATTGAAGAACTTCTTTACAGCTCCGTGGAGAATGAAGAGCACATGAGCTGTGTGTTGAAAGACCGGAGCAAGCCAATTATCTTCACGATGGCGAGATTGGACCGTGTGAAGAACATCACGGGACTTGTGGAGTGGTACGGGAAGAACGCTCGGCTGCGGGAGCTGGTGAACCTGGTTGTGGTGGCGGGAGACAGGAGGAAGGAGTCAAAGGACTTGGAAGCACTTGAGAAGACCAAGTATCCTGACTCTGACATTTACTGGAAAAAATTTGAAGACAAGTATCACTTCTCCTGTCAATTTACAGCTGATCTTTTTGCAATGAACCACACAGACTTCATTATCACCAGTACCTTCCAAGAGATCGCTGGAAGGAGCAAGGATACTGTGGGGCAGTATGAGAGTCACACTGCTTTCACCCTCCCTGGTCTCTACCGTGTCGTTCACGGTATTGATGTGTTTGATCCGAAGTTCAACATTGTGTCTCCTGGAGCAGATATGAGCATCTACTTCCCCTTCACAGAAACAAACCATAGGTTGACATCTTTCCACCCCGAGATTGAAGAGCTTCTCTACAGCTCAGTGGAAAATGAGGAGCACATGAGATGCGTATTGAAAGACCGAAACAAGCCAATTATCTTCACCATGGCGAGATTGGACCGCGTGAAGAACATCACGGGACTTGTGGAGTGGTACGGCAAGAACGCCCGCCTCCGCGAGCTGGTGAACCTGGTGGTTGTGGCCGGAGATAGGAGGAAGGAGTCAAAGGACTTGGAAATGGAGGAATTTAAAGTATATTTAGAACTAGATAGATCTCGCCAACATGACTTCCTATACCCACTTATTTTTCGGGAGTATATTTATGCACTTGCTTATGATCATGGTTTAAATAGCTCCATTTTG------GTGGAAAATCTAGGTTATGACAATAAATCTAGTTTACTAATTGTAAAACGTTTAATTACTCGAATGTATCAACAGAATCATTTGATTATTTCTGCTAATGATTCTAACAAAAATCCATTTTGGGGGTACAACAAGAATTTGTATTCTCAAATAATATCAGAGGGGTTTGCCGTCAGTGTGGAAATTCCATTTTCCCTACAATT---AATCTCTTCCTTAGAGGAGGCAGAAATCGTAAAATCTTATAAT---TTACGATCAATTCATTCAATATTTCCTTTTTTTGAGGAAAAATTTCCATATTTAAATTATGTGTCAGATGTACGAATACCCTACCCTATCCATCTGGAAATCTTGGTTCAAACCCTTCGATACTGGGTGAAAGATGCCTCTTCTTTTCATTTATTAAGGCTCTTTCTTTATGAGTATTGTAATTGGAAT------AGTCTTATTACTCCAAAAAAATGGATTTCTACTTTT------TCAAAAA---GTAATCCAAGATTCTTCCTGTTCCTATATAATTTTTATGTATGTGAATACGAATCTATCTTTCTTTTTCTCCGTACCAAATCTTCTTATTTACGATTAACATCTTCTGGAGTCCTTTTTGAGCGAATCTATTTCTATGCAAAAATAGAACATTTTGTAGAAGTCTTTGATAAGGATTTTCCGTCCACCCTATGGTTCTTCAAGGACCCTTTCATTCATTATGTTAGATATCAAGGAAAATCCATTCTGGCTTCAAAGAATACGCCCTTTTTGATGAATAAATGGAAATACTATCTTATCCATTTATGGCAATGTCATTTTTATGTTTGGTCTCAACCAGGAAAGATCCATATAAACCAATTATCCGAGCATTCATTTGACTTTTTGGGCTATTTTTCAAATGTGCGGCTAAATCCTTCAGTGGTACGGAGTCAAATGCTGGAAAATTCATTTCTAATTGAAAATGTTATGAAAAAGCTTGATACAATAATTCCAATTATTCCTCTAATTAGATCATTGGCTAAAGCGAAATTTTGTAATGTATTAGGGCATCCCATTAGTAAGCCGGTCTGGGCCGATTCATCCGATTTTGATATTATTGACCGATTTTTGCGGAGATGCAGAAATCTTTCTCATTATTACAATGGATCCTCAACAAAAAAGAGTTTGTATCGAATAAAATATATACTTCGGCTTTCTTGTATTAAAACTTTGGCTCGTAAACACAAAAGTACTGTACGCGTTTTTTTGAAAAGATTAGGTTCAGAA---TTATTGGAAGAATTC------TTTACAGAGGAAGAAGAGATTCTTTCTTTGATCTTCCCAAGAGCTTCTTCTACTTTGCAGAGGTTATATAGAGGTCGGATTTGGTATTTGGATATTTTTTATTTTCATCAATGATCTGGTCAA---TCAT--GACTTAATTGGATTGAGCCTTGGTATGGAAACCTACCAAGTGAGAACTTTCAAATTCAGAGAAACCCTGGAATTAACAATGGGCAATCCTGAGCCAAATCCTGTTTTCCGAAAA---------CCAAGAAGAGTTCAGAAAGGGA-------GAATAAAAAAA----AGGATAGGTGCAGAGACTCAACGGAAGCTGTTCTAACAAATGGAGTTGACGACATTTCGTTT----CGTTAGT------------------------?---------------------AAAG-GAATCCTTCCATCGAAACTCCAGAAAA?GAAAGGATCAAGGATGAAACGTATACGTACTGAAATACTATTTC-AATTGATTAGACCAGACAGA-----CCCCAAATCTCTATTTTTT------AATAT-----------------TTATATGACAAATGAAAGATGTGAAT----------------------CGATTCCAAGTTGAAGAAAGAA----TCGAATATTCATTGATCAAATCATTCACTCCATCA------TAGTCTGATAGA----------TCTTTTGAAGAACTGAT----------------------------TAATCGGACGAGAATAAAGATAGAGTCCCATTCTACATGTCAATACCGACCACAATGAAATTTATAGTAAGAGGAAAATCCGTCGA ; END; BEGIN TREES; Title Fig._2_Result; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Acrocarpus_fraxinifolius_1416, 2 Adenanthera_pavonina, 3 Arapatiella_psilophylla, 4 Arcoa_gonavensis_3522, 5 Balsamocarpon_brevifolium_1869, 6 Batesia_floribunda, 7 Bobgunnia_fistuloides, 8 Burkea_africana, 9 Bussea_occidentalis_19245, 10 Caesalpinia_cacalaco_1789, 11 Caesalpinia_crista, 12 Caesalpinia_ferrea_21, 13 Caesalpinia_gracilis_2067, 14 Caesalpinia_violacea_1763, 15 Caesalpinia_yucatanensis_1766, 16 Calpocalyx_dinklagei_15461, 17 Campsiandra_comosa_1100, 18 Cassia_javanica, 19 Cenostigma_gardnerianum_9615, 20 Ceratonia_siliqua_3314, 21 Chamaecrista_654_clone_5, 22 Chidlowia_sanguinea, 23 Colvillea_racemosa_1360, 24 Conzattia_multiflora, 25 Cordeauxia_edulis, 26 Cylicodiscus_gabunensis_14866, 27 Delonix_elata_20XII971, 28 Delonix_regia_3, 29 Dialium_1474, 30 Dimorphandra_conjugata, 31 Dinizia_excelsa, 32 Dinizia_sp, 33 Diptychandra_aurantiaca_70, 34 Dussia_tessmannii_628, 35 Entada_polyphylla, 36 Erythrophleum_ivorense, 37 Erythrophleum_suavolens_17XII973, 38 Erythrostemon_gilliesii_12701, 39 Gleditsia_caspica_7V20022, 40 Glycine_max, 41 Gymnocladus_dioica_1830, 42 Haematoxylon_8841_2, 43 Hoffmannseggia_glauca_12699, 44 Jacqueshuberia_brevipes, 45 Koompassia_excelsa_1V99, 46 Lemuropisum_edule_1033_clone_2, 47 Medicago_sativa, 48 Medicago_truncatua, 49 Melanoxylon_brauna_10, 50 Mezoneuron_angolensis_12XII971, 51 Mezoneuron_kauaiensis_1602, 52 Moldenhawera_floribunda_30, 53 Mora_gonggrijpii_13792, 54 Moullava_spicata, 55 Pachyelasma_tessmannii_15432, 56 Parkia_multijuga, 57 Parkinsonia_aculeata_12704, 58 Peltophorum_dubium_2436, 59 Peltophorum_pterocarpum_3719, 60 Pentaclethra_macrophylla_11496, 61 Phaseolus_vulgaris, 62 Piptadenia_anolidurus, 63 Pisum_sativum, 64 Pomaria_jamesii, 65 Pterogyne_nitens_13XII971, 66 Pterolobium_stellatum_17XII979, 67 Recordoxylon_amazonicum_1683, 68 Schizolobium_parahyba_694, 69 Sclerolobium_sp, 70 Senna_spectabilis_74IV996, 71 Stachyothyrsus_staudtii, 72 Stahlia_monsperma, 73 Stuhlmannia_moavi_7509, 74 Swartzia_cardiosperma, 75 Tachigali, 76 Tetrapterocarpon_geayi_1395, 77 Umtiza_listeriana_2602, 78 Vicia_faba, 79 Vigna_radiata, 80 Vouacapoua_macropetala_13793; TREE Fig._2 = ((40:0.0387811081665394,(61:0.028183623978083966,79:0.037341655549604974):0.06987643099361165):0.04358850560338534,(((47:0.0036596739590301908,48:0.009777357201671333):0.022202536169203008,(63:0.020954748431443904,78:0.036138664393921216):0.02071186773485087):0.04962811661841801,(34:0.008648720147455435,((7:0.011520049355837364,74:0.03142872101052668):0.011494383029225674,((29:0.02050498755392685,45:0.011088042599648323):0.03263551649159571,((76:0.029270930706865622,(1:0.014165380799493699,20:0.018706904390225654):4.842093659080393E-4):0.006391994165309861,(4:0.022058680386263685,((77:0.01224436794477854,(39:0.009156536056921627,41:0.012957487309917304):0.004143581506489219):0.007567554230860529,(((65:0.06294962614166458,((18:0.010928485977906716,70:0.021742687948771516):0.006446400985791939,((6:0.007724274683621218,21:0.04411528988989838):0.0022344835403269314,(80:0.004582372074875135,(49:0.02925032963820612,67:0.004150625990503476):0.003310872547476862):0.003956090160405823):0.005029671586955303):0.002347960950812633):0.0037512817471337667,((25:0.005467977954914799,73:0.009969100399440572):0.0030579298330854487,(((64:0.017147501106636903,(15:0.010805274570269002,38:0.013875612669413256):0.007061694220195175):0.004217517138461413,(12:0.011999086083623933,(43:0.025020711139135177,(5:0.015292915003504937,72:0.022263865512776954):0.002902761404378257):6.589169510558823E-4):0.002690425610386765):0.006287146692113721,((42:0.02126343481974574,(10:0.012769752750903696,(13:0.0026647620591573606,14:0.002956689545225516):0.00953701719997374):0.002729052717979269):0.001255549550562285,(54:0.013343317269696897,((11:0.0016998875814481784,66:0.005662430087045006):0.00977985369158274,(50:0.0077380307346704424,(19:0.01131563708973049,51:9.963729744044691E-7):0.009475450519595086):0.002300803144152541):0.0011555326662266996):0.007155879168367019):0.004301302208437163):0.003338312003471372):0.012951535077822013):0.003134107575810563,(((33:0.02466716227015739,52:0.03208885836297859):0.0019031295309488439,((3:0.004296429611419378,44:0.00198189396496834):9.963729744044691E-7,(69:0.0034176389454217415,75:0.0018085819777164114):0.004247506152251751):0.004170682003908077):0.0014065088640303758,((55:0.007629489177142484,((36:0.0018316122148072655,37:0.003117200827850247):0.007879512199380295,(22:0.011423126001330441,(60:0.022369568291324915,((2:0.013054963006968012,16:0.01819490390905415):0.002461160396331319,(35:0.030600915102659276,(26:0.008265719061095023,(56:0.004993904883503042,62:0.016522173440000787):0.004649328216810994):0.010610063357765015):0.0010591869776169771):6.801751341803108E-4):0.0012737449503434084):0.012663197724863906):0.001012813560671677):7.884231138439168E-4,((17:0.014038796300723383,((31:0.006988601942022915,32:0.0021885467052710217):0.008987187087683562,(30:0.009525132860410429,(8:0.010566564923874172,(53:0.012333684039005754,71:0.004182375661032162):9.963729743767136E-7):7.62080198152576E-4):0.008637609683284309):9.963729744044691E-7):5.630425675856865E-4,((9:0.011307964652488539,(58:0.00425747599106252,59:0.004714078107258379):0.010622487585501744):0.006740664283285236,(68:0.015542358002048201,(57:0.01059949770347468,(24:0.007422470012110105,(28:0.005050253566125984,(46:0.007213572713901106,(23:0.0043244800365839775,27:0.003484394644154176):3.2537986758157667E-4):3.082981454409772E-4):0.0035240104097903346):0.005277617522309097):0.0028862878151068028):0.005251693709788036):0.006676907342342969):9.364640804973567E-4):8.522819744105625E-5):0.0037600042141811008):0.011543730329245883):0.0014339099376169395):0.0010309848903728436):0.011083106645425111):0.02377617167482754):2.894621877362058E-4):0.02631369607780812):0.04358850560338534)[% ] [% ] [% setBetweenBits = selected ]; END;