NEXUS [File created by TreeBASE: 7/26/07 21:07:48] [Matrix accession#: M2212] BEGIN TAXA; TITLE M2212; DIMENSIONS NTAX=10; TAXLABELS Ilyphagus_octobranchus Therochaeta_collarifera Poeobius_meseres Pherusa_plumosa_2 Pherusa_plumosa_1 Flabelligera_affinis Diplocirrus_glaucus_2 Diplocirrus_glaucus_1 Brada_villosa Cirratulus_spectabilis ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE M2212; DIMENSIONS NCHAR=318; FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = . GAP = - ; MATRIX Ilyphagus_octobranchus CCATATATTGGAAAAATATTAGTAGAATGAGTGTGGGGGGGGTTCGCAATTGATAACGCAACGTTAAACCGATTTTTCGCCATCCATTTTCTTCTCCCTTTTGTTTTAGCTGCAATTAGCTGTCTTCATTTATTATGCCTCCACCAAACCGGCTCAAATAATCCCCTTGGTCTCAATAGGGATACCGATAAAGTGCCATTTCATTGATACTACTCCGTAAAAGATACCCTAGGATTTCTCATTATAATAGTTCTTCTTCTTATAGTTTCAATATTTTTTCCAAACCTACTTACAGATCCAGAAAACTTTCTTCCTGCT Therochaeta_collarifera CCTTACATTGGTAAATACCTAGTAGAATGAGTTTGAGGGGGATTTGCAGTTGATAACGCCACTCTAAATCGATTTTTTGTCTTCCATTTCCTGCTCCCTTTTGTCCTTATTGCTTTAAGATGTTTACACCTTCTATGCCTTCATCAAACTGGGTCTAATAACCCATTAGGGTTAAATAGAGACACTGATAAAGTCCCTTTTCATCCTTATTTTTCAACCAAAGACGTTCTAGGATTTTTAGTTATACTATTTGCTATAATATTAATTGTAATATTCTTTCCAAACCTGTTGACAGACCCAGAAAACTTTATTCCTGCA Poeobius_meseres CCTTATATTGGAAAAGATTTAGTTCAATGAATTTGAGGAGGATTCGCTGTAGATAACGCAACACTAAATCGATTTTTTGTATTCCATTTTATTTTACCATTTGTCTTAATAGCTATTAGAATACTTCATTTATTATCCCTTCACCAAACTGGGTCAAATAACCCCTTAGGATTAAATAGAGATACTGATAAAATCCCTTTCCATCCATACTTTACTACAAAAGATATATTAGGATTTTTAGTTATATTATTTTTTTTAATACTAGTAGTTATATTTTCACCTAATCTTCTAGGAGACCCAGATAATTTTATCCCAGCT Pherusa_plumosa_2 CCTTATTTTGGAAAAGCTCTAGTTGAATGAGTATGAGGAGGTTTTGCAGTAGATAATGCCACATTAAACCGATTTTATGCTTTTCATTTTGTGCTACCATTTATTTTAGCTGCAGTAAGATGTCTACATATTTTATGTCTCCATCAAACAGGATCCAATAACCCACTAGGGTTAAATAGAAATACAGATAAAATTCCATTTCATTGATTTTACTCAGTAAAAGACATACTAGGATTTATAGTTATACTATTATTATTAATAATAGTAATTATATTTTTTCCATACTTATTGTCTGAACCAGATAATTTTTTACCTGCT Pherusa_plumosa_1 CCATATATTGGAAAAGCCTTAGTAGAATGAGTTTGAGGCGGATTTGCCGTTGATAACGCGACTCTTAATCGATTTTTTGCTTTCCATTTCATTCTGCCATTCATTTTGGCAGCTGTATCATGTCTTCATTTATTATGCCTTCATCAAACAGGGTCTAACAACCCACTCGGTTTAAATAGAGATACAGATAAAGTACCTTTTCATTGGTACTATACAGTTAAAGATGTTCTAGGATTCCTTTTAATAATATTTTTACTAATAATAGTAACAATATTTTTTCCTAATCTTCTAACAGAGCCCGATAACTTTCTTCCTGCA Flabelligera_affinis CCTTATATTGGAAAAACTCTAGTAGAATGAGTTTGAGGGGGATTTGCAGTAGATAACGCTACTCTTAATCGATTTTTTGCAATTCATTTTTTATTACCCTTTATTTTAGCTGCAATTGCTTGTTTACACCTGTTATGTTTACATCAAACAGGGTCTAACAATCCTCTAGGCCTAAAAAGGGATTCTGATAAAATTCCTTTTCACTGATATTATTCTTCTAAAGATATACTGGGGATCCTTATTATAATAGCCTTATTAATAATAGTAATTATATTTTTTCCAAGCCTTCTTTCAGACCCAGAAAATTTTTTGCCTGCT Diplocirrus_glaucus_2 CCCTATATTGGTAAGACCTTAGTAGAATGAGTGTGAGGGGGATTCGCCATTGATAACGCTACCTTAAACCGATTTTTTGCAATCCATTTTCTTCTTCCATTTATTTTAGCAGCTATTAGCTGTCTCCATTTACTATGTTTACATCAAACAGGGTCAAATAACCCTCTAGGGTTAAACAGGGATTCAGATAAAATCCCATTTCACTGATATTATTCTATTAAAGATGTTTTAGGCTTCCTTTTAATAATAGTCCTCCTATTAATAGTAACGATATTCTTTCCAAACCTTCTCACGGACCCAGAAAACTTTTTGCCCGCT Diplocirrus_glaucus_1 CCCTATATTGGTAAGACCTTAGTAGAATGAGTGTGAGGGGGATTCGCCATTGATAACGCTACCTTAAACCGATTTTTTGCAATCCATTTTCTTCTTCCATTTATTTTAGCAGCTATTAGCTGTCTCCATTTACTATGTTTACATCAAACAGGGTCAAATAACCCTCTAGGGTTAAACAGGGATTCAGATAAAATCCCATTTCACTGATATTATTCTATTAAAGATGTTTTAGGCTTCCTTTTAATAATAGTCCTCCTATTAATAGTAACGATATTCTTTCCAAACCTTCTCACGGACCCAGAAAACTTTTTGCCCGCT Brada_villosa CCATATATTGGAAAAATACTAGTAGAATGGGTCTGAGGAGGGTTTGCAGTAGATAACGCAACCTTAAACCGATTTTTTGCAATTCATTTTCTTTTACCCTTTGTTCTTGCTGCATTAAGATGCCTTCATTTATTATGCCTTCATCAAACAGGATCAAATAACCCATTAGGATTAAATAGTGATACCGACAAAATCCCATTTCATTGATACTACACCTCAAAAGACGCTCTAGGGTTTATTATTATATTATTTTTATTAATAATTATTACAATATTTTACCCAAATTTATTAACAGACCCCGATAATTTTTTGCCAGCA Cirratulus_spectabilis CCTCAAGTCGGTAAGATCTTAGTAGAATGAATTTGAGGCGGTTTTGCAGTAAACAACGCAACCTTAGTCCGATTTTTTACTTTTCACTTCTTATTCCCATTTATTCTTATTTTCCTAATACTTCTCCACCTTCTATTTCTTCACCAAACCGGGTCCTCTAACCCTCTCGGAATTAATAGAGACCCTCAAAGTATCCCCTTTCACCCGTATTACACCACTAAAGACCTAGTAGGCATCCTTTTTGCCTCTGCTATCCTATCAATAATCGTATTTTTATACCCATATCTTTTCCTCGAACCAGAAAACTACATTCCTGCA ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions = N: 1 - 318 ; CODESET * UNTITLED = Universal: all ; END; BEGIN ASSUMPTIONS; OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; EXSET * UNTITLED = 3 - 318 \ 3 318 ; END;