#NEXUS
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	Calotriton_arnoldi            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	Lissotriton_boscai            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	Alytes_muletensis             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	Mertensiella_caucasica        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	Bufo_siculus                  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	Rana_cerigensis               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	Hydromantes_sarrabusensis     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	Rana_esculenta                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	Bufo_variabilis               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	Bufo_balearicus               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	Pelobates_syriacus            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	Rana_holtzi                   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	Hyla_intermedia               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	Rana_perezi                   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	Lyciasalamandra_fazilae       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	Pelodytes_ibericus            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	Lyciasalamandra_helverseni    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	Lyciasalamandra_luschani      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	Pleurodeles_waltl             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	Hydromantes_flavus            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	Hyla_savignyi                 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	Salamandra_corsica            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	'Pelobates cultripes	'        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	Triturus_marmoratus           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	Lyciasalamandra_antalyana     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	Chioglossa_lusitanica         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	Bufo_viridis                  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	Rana_graeca                   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	Ommatotriton_ophryticus       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	Alytes_obstetricans           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	Lissotriton_helveticus        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	Triturus_italicus             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	Lyciasalamandra_flavimembris  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	Pelodytes_punctatus           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	Salamandra_infraimmaculata    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	Bombina_pachypus              -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CGCCCGGGAACTACGAGCCCAGCTTAAAACCC-AAAGGACT-TGGCGGTGCCCC--ACCC-ACCTAGAGGAGCCTGTTCTATAATCGATAACCCCCGCTTAACCTCACCACTTCTTGCCACCGCCTATATACCACCGTCGTCAGCCCACCCCTGAGGG-CAGTAGGCACAATGATCATCAAAACGTCAGGTCAAGGTGTAGCATATGAAGTGGGAAGAAATGGGCTACATTCTCTA-ACCTAG-AGCA-CACGAAAAATCTATGAAA--AGAAGGAGGATTTAGTAGTAAAAAGAAACAATAGTGTTCTTTTTAAGCTG--GCCCTGGGGCGCGCACACACCGCCCGTCACCCTCTTCAAAAGAAGAGGTAAGTCGTAACATGGTAAGTATACCGGAAGGTGTGCTTGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CGTAATCACTTGTCTTTTAAATAAAGACTAGTATGAATGGCATCACGAGAGTTCAACTGTCTCCCGCACCCAATCAGTGAAACTGATCTCCCCGTGCA?AAGCGGGG-ATAAAACCATAAGACGAGAAGACCCCATGGAGCTTTAAAC-TAAAGGCACTA?CCCCTAATTAA--CCCCTTAGGGTAAAACATT--TTAACCGGCTAA-AGTGACCTGTCGTTCTCGG?TG??GCGACCACGGAGAAAAACAAA?CCTCCGAGATGAAAGGGACAA--CCCTTAGCCAAGACCAACAATTCTAAGCAATAGAACGTCTAAC--ACACTGATCCAA--TCAGATTGATCAACGAACCAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCTATTTTCAGAGTTCATATCGACAAAT-AGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGCCTCCTAGCGGTG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTATTTAGTATTTGGTGCCTGGGCTGGTATGGTGGGAACTGCCCTCAGCTTGTTAATTCGAGCAGAGCTAAGCCAGCCCGGAACCTTACTTGGGGATGACCAGATCTATAATGTAATCGTCACTGCCCACGCTTTTGTAATAATCTTCTTCATAGTTATGCCTATTATGATTGGGGGATTTGGCAACTGACTGGTTCCCCTGATAATTGGGGCCCCCGACATGGCCTTCCCCCGAATAAATAATATAAGCTTTTGACTTCTCCCCCCCTCATTTCTCCTGCTCTTAGCATCCTCAGGCGTAGAGGCAGGGGCCGGGACCGGTTGAACTGTTTACCCGCCCCTAGCGGGGAACCTGGCCCATGCAGGAGCATCAGTAGACCTGACTATTTTTTCTTTACATCTTGCAGGAGTATCCTCAATTCTAGGCGCCATCAACTTTATTACAACAACAATTAACATGAAGCCCCCGGCGATATCACAGTATCAAACACCCCTGTTTGTTTGATCTGTGCTAATCACAGCCATCCTTCTACTTCTCTCTCTCCCTGTTCTTGCTGCAGGAATTACTATGCTCCTCACAGACCGTAATTTAAACACAACCTTTTTTGACCCTGCTGGGGGAGGTGATCCTGTGCTATACCAGCACCTATTCTGATTTTTCGGTCATCCAGAGGTATATATTCTTATCTTGCCAGGGTTTGGTATAATTTCGCACATTGTCACGTACTACTCAAAAAAGAACCATTTGGCTACATGGGCATAGTCTGAGCCATGATGTCTATCGGCCTGCTGGGCTTTATTGTTTGAGCCCATCACATATTCACAGACCTAAATGTAGACACTCGGGCCTACTTTACCTCGGCAACAATAATTATTGCAATTCCTACAGGAGTAAAAGTATTTAGCTGGCTAGCTACAATACACGGAGGATCAAATGAGACGCAGCCATACTATGGGCCCTGGGCTTCATCTTCTTATTTACAGTAGGGGGCCTGACCGGCATTGTTCTGGCTAACTCTTCCCTGGACATTGTTCTCCACGACACATACTACGTC-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????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	Bufo_verrucosissimus          -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GCCCAGCCGTAAACTTCGCCAGGGAACTACGAGCCAAGCTTAAAACCC-AAAGGACT-TGACGGTACCCCACATCC-CCCTAGAGGAGCCTGTCCTATAATCGATAATCCACGTTTAACCTCACCATTTTTAGTTACAGCCTGTATACCTCCGTCGTCAGCTTACCACTGAGCGTTAGTGAGCTTAATGTTCACCAACACGTCAGGTCAAGGTGCAGCAAATGAAGTGGAAAGAGATGGGCTACACTTTCTA-TTTTAG-AAGA-AACGAAAAACTTATGAAA--AGAAGGCGGATTTAGCAGTAAAAAGGAATCAGCACGTCCATTTTAACCCG--GCACTGGGGTGTGTACACACCGCCCGTCACCCTCTTCAACAGAAGAGGCAAGTCGTAACATGGTAAGTATACCGGAAGGTGTGCTTGGGCTAAAAACCTAGCCCAACAAACATGAATTTTACTTAATTAACTAAACCCC-CTTAACAAACCATTT--TAACATTCTAGTAAAGGAGATTGAAAAACTATTTGGAGCTATAAAAACAGTACCGCAAGGGAACGGTGAAATATTATGAAAA-----ACTTCAAGCAGCAAAAAGTAAAGATTACCTCTTGTACCTTTCGCATCATGGTTTAACTAGTCTAA-CCAAGCAAAACGT-TTTAAGTTTGACTTCCCGAAA-CTAAGTGAGCTACTTCAGGGCAGCT---AGAAGAGCAAACCCGTCTCTGTAGCAAAAGAGTGGGACGACCCTCA-AGTAGTGGTGACAGACCTAACGAACTTAGTGATAGCTGGTTGCTCAAGAAACGGATTTAAGTCCAACCTGAAAGTTT-TATAACCTAAGTTCATCAAAACAATCACCTAACTTTCAGCGTAATTCAAATAAGGTACAGCCTATTTGAAACAGGATACAACCTAGCCTAATGGATAAGATCAGCCTAAC-------ATACAATCAAGTGGGCCTAAAAGCAGCCACCTTTAA-TACA-GCGTCAAAGCTAAATTGT-AACCGAGCCCAATTACTTAACCCATATCTTAATCCCCTGCTAATACTGAGTAATTCTATAATA--TTATAGAAATTTTTATGTTAA-AACTAGTAACAAGAGATTCTTCTCTTAAATGTACATATAAATCAGAAAA-GACAAGCTACTGATACTTAACACCTCTGAGCATAAAGTAGTAACTAACCAAGAAAACTCTACTTTTACTGGTGTTAATCTAACACAAGAACATTCTAA-GAAAGATTAAAAGAAAAAGAAGGAACTCGGCAAACA--TTAACCTCGCCTGTTTACCAAAAACATCGCCTCTTG-------AATTTATATAAGAGGTCCAGCCTGCCCAGTGAC---CC--TGTTCAACGGCCGCGGTATCCTAACCGTGCGAAGGTAGCGTAATCACTTGTTCTCTAAATGCGGACTAGTATGAATGGCATCACGAAGGTTATACTGTCTCCTTTTTCTAATCAGTGAAACTAATCTCCCCGTGAAGAAGCGGGG-ATAATACTATAAGACGAGAAGACCCTATGGAGCTTTAAACAGTACAGCATCTGCCCCATAACACTAAAATTTCTGAATTAAAAAC--TTCATTGGACAG-TATGACTGCGAGTTTTTGGTTGGGGTGACCACGGAGCACAATACAACCTCCATGCTGAAAGAAA---ATTTCTAAGCCAAGGTCTACAAACCTAAGCATCAACATATTGACA-TCCATTGACCCAA--TACACTTGAACAACGAACCAAGTTACCCTAGGGATAACAGCGCAATCCACTTCAAAAGCTCCTATCGACAAGT-GGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTCTCCCAGTGGTGCAGCCGCTACTAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAA-AACCCTACGTGATCTGAGTTCAGACCGGAGCAAT-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCAGGTCAGTTTCTATC--TATATCTGAG-----------------------------------------------------------------------------------------------CTTCTTCCAGTACGAAAGGACCGAAGAAACGTGGCCCATGTCTAC-ACAAGCCG---CCGCTACAAAATTATGAAGCAAACTTAATAGTATCATAGCCTATAAATTTTCTCTAGA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CATCCACCTCGTCCCAAACACTCTTCCTTCTACCAATAATAGCGCTTTCTTTAGCAATAATTATCTGAACACCTATTCCAATACCCATCTCACTCTCTGACATAAACCTAGGAGTCATGTTTCTACTAGCCCTCTCAAGCCTCACTGTTTACTCCATTCTAGGTTCAGGTTGGGCCTCAAATTCCAAATACGCCCTAATTGGGGCCTTACGAGCAGTAGCGCAAACAATCTCATACGAGGTTACTCTGGCCCTTATTCTCCTGTGCACCATCCTTCTATCAGGGAACTTCTCCCTAACTTTAACATTACCCAGGAGCTATGACTAATTATTCCTGACCCTTGGCCATAATATGGTACATCTCAACCTTGGCAGAAACAAACCGAGCCCCATTTGATTTGACTGAAGGGGAATCTGAGTTAGTGTCAGGGTTTAATGTAGAATATGCAGGGGGGCCCTTTGCCCTATTTTTTCTCGCTGAATACGCTAACATTCTTAT-AATGAACACAATTTCTGCGGTAATTTTCCTCGGATCTCTCCACTACCTTATGTTTAAATCAGCCGCCCTCTCGATAATTTTTCTTTGAGTGCGAGCCTCCTACCCCCGATTTCGGTATGACCAGTTAATGCACTTAGTCTGAAAAAATTTCCTTCCCCTCACCCTTGCCCTAACAATCTACGTCTCATTCCCAATTTCGCTACCCCACCCATTTATTAACCCGTATGCCCTTTCAATAATTGTTTCAAGCCTCGCCCTAGGTACCATTTTAACGCTATCAAGTTATCATTGAATTTTGGCCTGAATTGGCCTTGAAATTAACACACTAGCAATTATTCCCCTAATGACAAAAACCCCTCACCCCCGGGCCATTGAAGCCGCAACAAAATATTTTCTAACGCAGGCCGCGGCTTCTGCCCTTATTTTATTTTCCAGCATCCTCAACGCATTCACCGTCGGGGGGTGAGCCATCAATACCCCCAACCTCCCAGCCACTCTTTTATCCATTGCCCTCGCAATAAAACTTGGAATCGCCCCATTTCACTTCTGACTCCCCGAGGTTCTCCAAGGGTCGACACTCCAAACAGGTCTTATCCTTTCCACATGACAAAAATTAGCCCCCATAGCACTTCTCATCCAACTCTCTCAATCAGTAAACCTCACCCTTATGCT------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GTTAACGTAGCAAAATCTGGTATTGCAAAAGACCTAAGCCCTTTCTATAGAAGTTCAAATCTTCTCGTTAACTCGTAATGTAGCTTAACAAAGCATCTCGCTTACACCGAGAAAATGCCCGTGAAAACCGAGCCATTCCGA

;



END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
	TYPESET * UNTITLED   =  unord:  1 -  10109;

END;

BEGIN TREES;
	Title Imported_trees;
	LINK Taxa = Taxa;
	TRANSLATE
		1 Bombina_bombina,
		2 Triturus_carnifex,
		3 Salamandrina_perspicillata,
		4 Calotriton_arnoldi,
		5 Lissotriton_boscai,
		6 Alytes_muletensis,
		7 Mertensiella_caucasica,
		8 'Hydromantes supramontis	',
		9 Euproctus_platycephalus,
		10 Hydromantes_genei,
		11 Discoglossus_pictus,
		12 Pelobates_fuscus,
		13 Rana_cretensis,
		14 Discoglossus_sardus,
		15 Bufo_siculus,
		16 Rana_cerigensis,
		17 Discoglossus_jeanneae,
		18 Rana_pyrenaica,
		19 Hydromantes_sarrabusensis,
		20 Rana_esculenta,
		21 Bufo_variabilis,
		22 Rana_shqiperica,
		23 Rana_kurtmuelleri,
		24 Bufo_balearicus,
		25 Pelobates_syriacus,
		26 Rana_holtzi,
		27 Hyla_intermedia,
		28 Rana_bedriagae,
		29 Rana_perezi,
		30 Triturus_pygmaeus,
		31 Rana_lessonae,
		32 Triturus_vittatus,
		33 Lyciasalamandra_atifi,
		34 Bufo_boulengeri,
		35 Salamandrina_terdigitata,
		36 Triturus_dobrogicus,
		37 Bufo_bufo,
		38 Rana_macrocnemis,
		39 Hyla_sarda,
		40 Lyciasalamandra_fazilae,
		41 Pelodytes_ibericus,
		42 Rana_ridibundus,
		43 Hyla_meridionalis,
		44 Lyciasalamandra_helverseni,
		45 Lyciasalamandra_luschani,
		46 Pleurodeles_waltl,
		47 Rana_iberica,
		48 Triturus_karelinii,
		49 Rana_caralitana,
		50 Alytes_dickhilleni,
		51 Mus_musculus,
		52 Rana_arvalis,
		53 Euproctus_montanus,
		54 Hydromantes_italicus,
		55 Rana_tavasensis,
		56 Rana_latastei,
		57 Hydromantes_flavus,
		58 Hyla_savignyi,
		59 Salamandra_corsica,
		60 Triturus_vulgaris,
		61 'Pelobates cultripes	',
		62 Triturus_marmoratus,
		63 Salamandra_salamandra,
		64 Bombina_variegata,
		65 Triturus_montandoni,
		66 Xenopeltis_unicolor,
		67 Neurergus_strauchii,
		68 Rana_temporaria,
		69 Neurergus_crocatus,
		70 Calotriton_asper,
		71 Salamandra_atra,
		72 Alytes_cisternasii,
		73 Triturus_cristatus,
		74 Hydromantes_imperialis,
		75 Lyciasalamandra_antalyana,
		76 Salamandrella_keyserlingii,
		77 Rana_italica,
		78 Hydromantes_strinatii,
		79 Pelodytes_caucasicus,
		80 Chioglossa_lusitanica,
		81 Bufo_viridis,
		82 Rana_graeca,
		83 Discoglossus_galganoi,
		84 Epidalea_calamita,
		85 Hydromantes_ambrosii,
		86 Gallus_gallus,
		87 Ommatotriton_ophryticus,
		88 Lyciasalamandra_billae,
		89 Rana_dalmatina,
		90 Salamandra_lanzai,
		91 Discoglossus_montalentii,
		92 Proteus_anguinus,
		93 Hyla_arborea,
		94 Triturus_macedonicus,
		95 Rana_bergeri,
		96 Triturus_alpestris,
		97 Alytes_obstetricans,
		98 Lissotriton_helveticus,
		99 Triturus_italicus,
		100 Lyciasalamandra_flavimembris,
		101 Pelodytes_punctatus,
		102 Rana_epeirotica,
		103 Salamandra_infraimmaculata,
		104 Bombina_pachypus,
		105 Bufo_verrucosissimus;
	TREE Best_ML_Amphibian_tree = (((76:0.3789902876081128,(((3:5.82905288382746E-6,35:0.0023733125798056525):0.30205310411733965,((46:0.22165537007210168,((96:0.2516481934524825,((5:0.1521492812015774,((99:0.08868367550330696,(65:0.019350835076463513,60:0.026235207739211813):0.09034053743162385):0.03210879620559189,98:0.16515801299568783):0.019169440742145962):0.0690212503164204,((((30:0.0223764193808734,62:0.025791967746299656):0.0658849483649558,(94:0.03167202794129775,((2:0.01605442516199611,48:0.02791385149221446):0.01930658330154563,(73:0.04144342332378593,36:0.036535721658672804):0.0069998574056885365):0.0071579747504221):0.07022985680682618):0.06810056398662023,(70:0.0197781695082743,4:0.030133869388341162):0.1057975343496032):0.02060270601552938,((87:0.048169802548297384,32:0.05994714893267099):0.10910726681669324,(69:0.061533014328475966,67:0.06822624457997833):0.09278485636450605):0.02332027251749481):0.032539046800041146):0.007816545582072416):0.02715076297002269,(53:0.09248811717508819,9:0.07466487767229418):0.09431419572479674):0.05587290716551686):0.03700719165920179,((((103:0.005171484988452926,63:0.005253339801763193):0.041698508669604874,((59:0.03882450959238283,71:0.03689978780902439):0.012718325732350332,90:0.03874815120768961):0.01654864980319309):0.05154637139687854,(33:0.05476022643172348,(45:0.04836870861617077,((88:0.04875365980944829,(40:0.061992588797642224,(75:0.06022875924599137,44:0.05413459923353101):0.00538268999757194):0.0037570654902705594):0.006554913768412197,100:0.05611202221626175):0.002632985144131061):0.006527467734452792):0.08027365638801233):0.09205748040777638,(7:0.21772852150684233,80:0.21533474106759679):0.05087457469797984):0.05460554721453626):0.03600885566600161):0.16246761310910426,(92:0.6042192985940262,((78:0.01933249161855941,(54:0.0186821994399452,85:0.02058547392443031):0.02554149535543363):0.0484517118514153,(10:0.0984316958541093,((74:0.05002622358190898,19:0.04552798475024773):0.00986231853152523,(57:0.047849335552226764,8:0.05319446355737133):0.00986626653885781):0.050523558217610946):0.0036554930971202863):0.5029857479398353):0.05339814712587394):0.026290803803261986):0.2364210327601933,(((((97:0.04649142143832493,(50:0.04293842097053099,6:0.029762672870334978):0.01930510852078249):0.08956834905098186,72:0.14725338493214418):0.25584139580584414,((83:0.03923573070976651,17:0.0422293008616696):0.04296714307165283,((11:0.06254879093929179,14:0.046412935363501516):0.008463686272660023,91:0.16677128598225588):0.03999586287092569):0.2695961198425602):0.08632734112234447,(1:0.06683206840253997,(104:0.04304741269444682,64:0.032975188601880145):0.047002355990196566):0.321390853497587):0.09210643484514801,(((79:0.14344367325000149,(41:0.0207135153770625,101:0.0321793254069621):0.10303783282666526):0.2366203486200686,(61:0.05419626315398294,(25:0.062186714130297374,12:0.05784867584844222):0.02727183353802249):0.32636465244312496):0.20275908353718064,(((43:0.10043966868323242,(58:0.11052615769129977,(39:0.10420863572844792,(27:0.08605850632229763,93:0.07985354558317523):0.013638839165152341):0.019551216012349344):0.044267581505269805):0.19613744959205812,((84:0.11309640832191434,(37:0.02109143223551795,105:0.024331864041486437):0.14234716348916682):0.020034965742852066,((21:0.02224987613740103,(24:0.03214828493941943,81:0.017894589567106357):0.010737810314673073):0.023451952714114117,(15:0.03500415418197174,34:0.019593507840794267):0.02600771520633768):0.05633708505138951):0.22648006106961102):0.19622848781520602,((89:0.05312477654101051,((82:0.04396239914558301,56:0.07064873593347826):0.009352131945668708,(((26:0.004936870476814315,38:0.006362680132584837):0.027596841539047175,55:0.03984456420850136):0.045286885414894326,(((52:0.07490329823563205,68:0.04612472212914187):0.01290159821301172,18:0.034257551054795436):0.011784391750713451,(47:0.0558688413334788,77:0.06505778295670812):0.006921008679106498):0.027137542760659203):0.01522754595977554):0.015229915558112218):0.18103513874908456,(29:0.11592503010324808,(((95:0.022211865012961875,(20:0.003594411964375479,31:0.004447025330741561):0.02087901077925609):0.02067073788501312,22:0.03747097699915822):0.06684238197475403,((13:0.06520831435704366,(((49:0.008223325375080501,16:0.006466658112042695):0.012380998920711662,28:0.01921432181022292):0.014365897379187859,(23:0.037050020275409205,42:0.01933033223651477):0.006596139136150362):0.01600946777805813):0.008375539862108343,102:0.08835603171457711):0.022090203789493973):0.038466466005688316):0.06430024631371792):0.4102409007344644):0.20324732390407002):0.060451424705977044):0.2169637807322296):0.07641425936537401,(51:0.9406517056884878,(86:0.7788002741996435,66:1.578669201120138):0.16575599679625036):0.07641425936537401);

END;


BEGIN CODONS;
	CODESET * UNTITLED   =  universal:  1 -  10109;


END;

BEGIN MESQUITECHARMODELS;
	ProbModelSet * UNTITLED   =  'Jukes-Cantor':  1 -  10109;
END;

Begin MESQUITE;
		MESQUITESCRIPTVERSION 2;
		TITLE AUTO;
		tell ProjectCoordinator;
		timeSaved 1352473292656;
		getEmployee #mesquite.minimal.ManageTaxa.ManageTaxa;
		tell It;
			setID 0 244232623260893894;
		endTell;
		getEmployee #mesquite.charMatrices.ManageCharacters.ManageCharacters;
		tell It;
			setID 0 7756994812703374235;
			mqVersion 275;
			checksumv 0 3 4022952498 null  getNumChars 10109 numChars 10109 getNumTaxa 105 numTaxa 105   short true   bits 2305843009213693967   states 15   sumSquaresStatesOnly 1.0102493E7 sumSquares -1.8446744073709522E20 longCompressibleToShort false usingShortMatrix true   NumFiles 1 NumMatrices 1;
			mqVersion;
		endTell;
		getWindow;
		tell It;
			suppress;
			setResourcesState false false 100;
			setPopoutState 400;
			setExplanationSize 0;
			setAnnotationSize 0;
			setFontIncAnnot 0;
			setFontIncExp 0;
			setSize 984 1001;
			setLocation 8 22;
			setFont SanSerif;
			setFontSize 10;
			getToolPalette;
			tell It;
			endTell;
			desuppress;
		endTell;
		getEmployee  #mesquite.minimal.ManageTaxa.ManageTaxa;
		tell It;
			showTaxa #244232623260893894 #mesquite.lists.TaxonList.TaxonList;
			tell It;
				setTaxa #244232623260893894;
				getWindow;
				tell It;
					newAssistant  #mesquite.lists.DefaultTaxaOrder.DefaultTaxaOrder;
					newAssistant  #mesquite.lists.TaxonListCurrPartition.TaxonListCurrPartition;
					getTable;
					tell It;
						rowNamesWidth 130;
					endTell;
					setExplanationSize 30;
					setAnnotationSize 20;
					setFontIncAnnot 0;
					setFontIncExp 0;
					setSize 884 934;
					setLocation 8 22;
					setFont SanSerif;
					setFontSize 10;
					getToolPalette;
					tell It;
						setTool mesquite.lists.TaxonList.TaxonListWindow.ibeam;
					endTell;
					setActive;
				endTell;
				showWindow;
				getEmployee #mesquite.lists.ColorTaxon.ColorTaxon;
				tell It;
					setColor Red;
					removeColor off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.lists.TaxonListAnnotPanel.TaxonListAnnotPanel;
				tell It;
					togglePanel off;
				endTell;
			endTell;
		endTell;
		getEmployee  #mesquite.trees.BasicTreeWindowCoord.BasicTreeWindowCoord;
		tell It;
			makeTreeWindow #244232623260893894  #mesquite.trees.BasicTreeWindowMaker.BasicTreeWindowMaker;
			tell It;
				suppressEPCResponse;
				setTreeSource  #mesquite.trees.StoredTrees.StoredTrees;
				tell It;
					setTreeBlock 1;
					toggleUseWeights off;
				endTell;
				setAssignedID 1066.1352471596997.853205372070594040;
				getTreeWindow;
				tell It;
					setExplanationSize 30;
					setAnnotationSize 20;
					setFontIncAnnot 0;
					setFontIncExp 0;
					setSize 884 934;
					setLocation 8 22;
					setFont SanSerif;
					setFontSize 10;
					getToolPalette;
					tell It;
					endTell;
					getTreeDrawCoordinator #mesquite.trees.BasicTreeDrawCoordinator.BasicTreeDrawCoordinator;
				tell It;
					suppress;
					setTreeDrawer  #mesquite.trees.SquareTree.SquareTree;
					tell It;
						setNodeLocs #mesquite.trees.NodeLocsStandard.NodeLocsStandard;
						tell It;
							branchLengthsToggle off;
							toggleScale on;
							toggleBroadScale off;
							toggleCenter on;
							toggleEven on;
						endTell;
						setEdgeWidth 6;
						orientUp;
						setCornerMode Right_Angle  50;
					endTell;
					setBackground White;
					setBranchColor Black;
					showNodeNumbers off;
					showBranchColors on;
					labelBranchLengths off;
					centerBrLenLabels on;
					showBrLensUnspecified on;
					showBrLenLabelsOnTerminals on;
					setBrLenLabelColor 0 0 255;
					setNumBrLenDecimals 6;
					desuppress;
					getEmployee #mesquite.trees.BasicDrawTaxonNames.BasicDrawTaxonNames;
					tell It;
						setColor Black;
						toggleColorPartition on;
						toggleShadePartition off;
						toggleShowFootnotes on;
						toggleNodeLabels on;
						toggleCenterNodeNames off;
						toggleShowNames on;
						namesAngle ?;
					endTell;
				endTell;
					setTreeNumber 1;
					setDrawingSizeMode 0;
					toggleLegendFloat on;
					scale 0;
					toggleTextOnTree off;
					showWindow;
				endTell;
				desuppressEPCResponse;
				getEmployee #mesquite.trees.ColorBranches.ColorBranches;
				tell It;
					setColor Red;
					removeColor off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.ornamental.BranchNotes.BranchNotes;
				tell It;
					setAlwaysOn off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.ornamental.ColorTreeByPartition.ColorTreeByPartition;
				tell It;
					colorByPartition off;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.ornamental.DrawTreeAssocDoubles.DrawTreeAssocDoubles;
				tell It;
					setOn on;
					setDigits 4;
					writeAsPercentage off;
					toggleCentred on;
					toggleHorizontal on;
					toggleWhiteEdges on;
					setFontSize 10;
					setOffset 0  0;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.ornamental.DrawTreeAssocStrings.DrawTreeAssocStrings;
				tell It;
					setOn on;
					toggleCentred on;
					toggleHorizontal on;
					setFontSize 10;
					setOffset 0  0;
				endTell;
				getEmployee #mesquite.trees.TreeInfoValues.TreeInfoValues;
				tell It;
					panelOpen false;
				endTell;
			endTell;
		endTell;
		endTell;
end;