#NEXUS [written Wed Nov 28 12:54:15 PST 2012 by Mesquite version 2.75 (build 566) at Simba.local/127.0.0.1] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=83; TAXLABELS Minutisphaera_fimbriatispora_A242_8C Minutisphaera_fimbriatispora_A242_7D Natipusilla_decrospora_S_AF236_A54 Natipusilla_naponensis_S_AF217_A49 Natipusilla_naponensis_S_AF217_A39 Natipusilla_limonensis_S_AF286_A239 Minutisphaera_fimbriatispora_A242_8A Alternaria_alternata_CBS_916.96 Alternaria_sp_CBS_174.51 Amniculicola_immersa_CBS_123083 Amniculicola_lignicola_CBS_123094 Amniculicola_parva_CBS_123092 Anguillospora_longissima_CS869_1D 'Aquaticheirospora lignicola RK-2006a' Ascorhombispora_aquatica Botryosphaeria_dothidea_CBS_115476 Botryosphaeria_ribis_CBS_115475 Capnodium_coffeae_CBS_147.52 Capnodium_salicinum_CBS_131.34 Cheirosporium_triseriale_HMAS_180703 Cochliobolus_heterostrophus_CBS_134.39 Cochliobolus_sativus_DAOM_216378 Dendryphiella_arenaria_CBS_181.85 Dothidea_insculpta_CBS_189.58 Dothidea_sambuci_DAOM_231303 Dothiora_cannabinae_CBS_373.71 Elsinoe_phaseoli_CBS_165.31 Elsinoe_veneta_CBS_164.29 Farlowiella_carmichaeliana_CBS_206.36 Gloniopsis_praelonga_CBS_112415 Gloniopsis_smilacis_CBS_114601 Guignardia_bidwellii_CBS_237.48 'Jahnula aquatica R68-1' 'Jahnula bipileata AF220-1' 'Jahnula sangamonensis A402-1B' Lentithecium_aquaticum_CBS_123099 Lentithecium_arundinaceum_CBS_619.89 Lindgomyces_cinctospora_R56_1 Lindgomyces_ingoldiana_ATCC200398 Lindgomyces_ingoldiana_JCM16479 Lindgomyces_rotunda_JCM_16482 Lophiostoma_arundinis_CBS_269.34 Lophiostoma_crenatum_CBS_629.86 Lophiostoma_macrostomum_JCM_13545 Lophiostoma_macrostomum_JCM_13546 Massarina_eburnea_HKUCC4054 Massarina_eburnea_CBS_473.64 'Megalohypha aqua-dulces AF005 2a' Mycosphaerella_fijiensis_OSC_100622 Mycosphaerella_graminicola_CBS_292.38 Myriangium_duriaei_CBS_260.36 Mytilinidion_andinense_CBS_123562 Mytilinidion_mytilinellum_CBS_303.34 Natipusilla_limonensis_PE3_2a Natipusilla_limonensis_PE3_2b Natipusilla_bellaspora_PE91_1a Natipusilla_bellaspora_PE91_1b Aliquandostipite_khaoyaiensis_CBS118232 Roccellographa_cretacea_Duke_191Bc Schismatomma_decolorans_DUKE0047570 Tingoldiago_graminicola_JCM_16485 Tingoldiago_graminicola_JCM_16486 Minutisphaera_japonica_JCM18561 Minutisphaera_japonica_JCM18562 Minutisphaera_japonica_JCM18560 Minutisphaera_fimbriatispora_G155 Minutisphaera_sp._G156 Asterina_phenacis_TH_589 Asterina_weinmanniae_TH_592 Asterina_zanthoxyli_TH_561 Aulographina_pinorum_CBS_174.90 Laurera_megasperma_AFTOL_2094 Micropeltis_zingiberacicola_IFRDCC_2264 Neomicrothyrium_siamense_IFRDCC_2194 Paramicrothyrium_chinensis_IFRDCC_2258 Stomiopeltis_betulae_CBS_114420 Trypethelium_nitidiusculum_AFTOL_2099 Catinella_olivacea_UAMH_10679 Patellaria_atrata_CBS_958.97 Hysteropatella_elliptica_CBS_935.97 Hysteropatella_clavispora_CBS_247.34 'Muyocopron sp. MFLU CC 10-0042' 'Muyocopron sp. MFLU CC 10-0041' ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE SSU_LSU_83_x_2257; DIMENSIONS NCHAR=2257; FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING = ?; MATRIX Minutisphaera_fimbriatispora_A242_8C -----TGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATAGTACCTTACTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAACCCCAACTTCGGAAGGGGTGTATTTATTAGATAAAAAACCAACGCCCTTCGGGGCTCCTTGGTGATTCATAATAACTAAACGAATCGCATGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTATCAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCTATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTACGGGTCTTGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGCTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGCACTGGTCCGGCCGGGCCTTTCCTTCTGGGGATCCGCATGCCCTTTACTGGGTGTGCTGGGGAACCAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTTTGCTCGAATACATTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGTGCGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGATAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAGTGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGGCGATGTTACTATTCTGACTCGCGGCACCTTACGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTGGGATTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCTGGTTCAGGGCCCGAGTTGTAATTTGGAGAGGATGCTTCGGCTGCGGCCCTGGTCTAAGTTCCTTGGGACAGGACGTCACAGAGGGTGAGAACCCCGTACGTGGCTGGCTACGCCATGTGAAGCTCCTTCAACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAACGGGAGGTAGATTTCTTCTAAAGCTAAATACCGGCGAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTTAAAAAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAACCAGACTTGGGCGTAGTTGTTTATCCGGGCTTCTGCCCGGTGCACTCTTCTGCGCCCAGGCCAGCATCAGTTGGCGGCCGGATAAAGGCCTTGGGAATGTAGCTCCCGGGGAGTGTTATAGCCCTCGGTGTAATGCGGCCTGCCCGGACTGAGGTCCGCGCTTCGCTAGGATGCTGGCGTAATGGTTGTAAGCGGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTATAACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGGAAAACCCATGCGCGTAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGGCACCATCGACCGATCCTGATGTCTTTGGATTTGAGTAAGAGCATAGCCGTTATGACCCGAAAGATGGTGAACTATTCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAAGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGTATAGGGGCGAAAGACTAATCCTAGTAGCTGGTTCCTGCCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGTAACGACAGTTTTATGAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTGGGGGTTGAAACAACCTTCACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAAGTCCTTGTTACTTAGTTGAACGTGGACATTTGAATGTACCGTTACTAGTGGGCCATTTTTAGTAA????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Botryosphaeria_dothidea_CBS_115476 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Botryosphaeria_ribis_CBS_115475 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Cochliobolus_heterostrophus_CBS_134.39 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Dendryphiella_arenaria_CBS_181.85 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Dothidea_insculpta_CBS_189.58 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Gloniopsis_smilacis_CBS_114601 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Lindgomyces_ingoldiana_ATCC200398 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Micropeltis_zingiberacicola_IFRDCC_2264 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Hysteropatella_clavispora_CBS_247.34 ----------------------------------TTATTTGATAG?ACCTTACTACATGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAACCCCGACTTCGGAAGGGGTGTATTTATTAGATAAAAAACCAATGCCCTTCGGGGCTCCTTGGTGATTCATAATAACTCAACGAATCGCATGGCCTTGCGCCGGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGTGGCCTACCATGGTATCAACGGGTAACGGGGAATTAGGGTTCTATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACGGGGCTCTTTTGGGTCTCGTAATTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGCTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGTACTGGTCCGGCCGGGCCTTTCCTTCTGGGGAATCGCATGCCCTTCACTGGGTGTGTCGGGGAACCAGGACTTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTTTGCTCGAATACATTAGCATGGAATAATAGAATAGGACGTGCGGTTCTATTTTGTTGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGATAGTCGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATTGAAGACTAACTACTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAGTGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGGCGATGTTATCATTTTGACTCGCGGCACCTTACGAGAAATCAAAGTCTTTGGGTTCTGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTGGGATTGCCTCAGTAACGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCAAATTTGAAATCTGGCTCGGGGTCCGAGTTGTAATTTGTAGAGGATGCTTCGGAGTCGGCTCCGGTCTAAGTGCCTTGGAACAGGACGTCACAGAGGGTGAGAATCCCGTACGTGGCCGGCTTCTCCATGTGAAGCTCCTTCGACGAGTCGAGTTGTTTGGGAATGCAGCTCTAAATGGGAGGTAAATTTCTTCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACTTTGGAAAGAGAGTTAAAAAGTACGTGAAATTGTTGAAAGGGAAGCGCTTGCAACCAGACTTGCCCGCGGTTGCTCAACCGGCCTTTTGGCCGGTGCACTCTTCCGCGGTCAGGCCAGCATCGGTTGGCGGTCGGATAAAGGCCTTGGGAATGTAGCACCCGGGGTGTGTTATAGCCCTCGGCGCAATGCGGCCAGCCTGGACCGAGGTCCGCGCTTCGCTAGGATGCTGGCGTAATGGTTGTAAGCGGCCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCTAACATCTATGCGAGTGTTTGGGTGTCAAACCCATGCGCGTAATGAAAGTGAACGGAGGTGGGGCACCATCGACCGATCCTGATGTCTTAGGATTTGAGTATGAGCATAGCTGTTGGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCCTGAATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATTTGGGTATAGGGGCGAAAGACTAATCCTAGTAGCTGGTTCCTGCCGAAGTTTCCCTCAGGATAGCAGTAACGTCAGTTTTATGAGGTAAAGCGAATGATTAGAGGCCTTGGGGTTGAAACAACCTTAACCTATTCTCAAACTTTAAATATGTAAGAAGCCCTTGTTACTTAGTTGAACGTGGGCACTTGAATGTAGCGTTACTAGTGGGCCATTTTTGGTAAGCAGAACTGGCGATGCGGGATGAACCGAACGCGAGGTTAAGGTGCCGGAATGCACGCTCATCAGACACCACAAAAGGTGTTAGTTCATCTGGACAGCAGGACGGTGGCCATGGAAGTCGGAAACCGCTAAGGAGTGTGTAACAACTCACCTGCCGAATGAACTAGCCCTGAAAATGGATGGCGCTCAAGCGTGCTAC 'Muyocopron sp. MFLU CC 10-0042' gaaactgcgaatggctcattaaatcagttatcgtttatttgatagtaccttactacatggatacccgtggtaattctagagctaatacatgcttaaaaccccgacttcgggaggggtgtgtttattagataaaaaaccgacgccctccggggctgcttggtgattcatgataaccaaacgaatcgcatggccttgagccggcgatggttcattcaaatttctgccctatcaactttcgatggtaggatctgggcctaccatggtatcaacgggtaacggggaattagggttcgattccggagagggagcctgagaaacggctaccacatccaaggaaggcagcaggcgcgcaaattacccaatcccgacgcggggaggtagtgacaataaatactgatacagggctctttagggtcttgtaattggaatgagtacaatttaaaccccttaacgaggaacaattggagggcaagtctggtgccagcagccgcggtaattccagctccaatagcgtatattaaagttgttgcagttaaaaagctcgtagttgaaccttgggtcaggctagccggtccgccttaccgcgtgcactggttcggccggaccctttcctctggcaaaccgcatgcccttcgctgggcgtgccggggaaccaggacttttactttgaaaaaattagagtgttcaaagcaggcctttgctcggatacattagcatggaataatggaataggacgcgtggttctattttgttggtttctagaaccgccgtaatgattaatagggacagtcgggggcatcagtattcagacgcgagaggtgaaattcttagaccgtctgaagactaactactgcgaaagcatttgccaaggatgttttcattaatcagtgaacgaaagttgggggatcgaagacgatcaccgtcgtagtctcaaccgtaaactatgccgactagggatcgggcgacgttccaatcatgactcgcggcaccttacgagaaatcaaagtct------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ 'Muyocopron sp. MFLU CC 10-0041' gaaactgcgaatggctcattaaatcagttatcgtttatttgatagtaccttactacttggatacccgtggtaattctagagctaatacatgctgaaaaccccgacttcgggaggggtgtgtttattagataaaaaaccaatgcccttcggggctgcttggtgattcatgataaccaaacgaatcgcatggccttgagccggcgatggttcattcaaatttctgccctatcaactttcgatggtaggatctgggcctaccatggtatcaacgggtaacggggaattagggttcgattccggagagggagcctgagaaacggctaccacatccaaggaaggcagcaggcgcgcaaattacccaatcccgacacggggaggtagtgacaataaatactgatacagggctctttagggtcttgtaattggaatgagtacaatttaaaccccttaacgaggaacaattggagggcaagtctggtgccagcagccgcggtaattccagctccaatagcgtatattaaagttgttgcagttaaaaagctcgtagttgaaccttgggacaggctagccggtccgccttaccgcgtgcactggtttggccggtccctttcctctggcaaaccgcatgcccttcactgggcgtgtcggggaaccaggacttttactttgaaaaaattagagtgttcaaagcaggcctttgctcggatacattagcatggaataatagaataggacgcgtggttctattttgttggtttctagaaccgccgtaatgattaatagggacagtcgggggcatcagtattcagacgcgagaggtgaaattcttagaccgtctgaagactaactactgcgaaagcatttgccaaggatgttttcattaatcagtgaacgaaagttgggggatcgaagacgatcaccgtcgtagtctcaaccgtaaactatgccgactagggatcgggcgacgttccatttatgactcgcggcaccttacgagaaatcaaagtctt--------------------------------------gggattgccttagtaacggcgagtgaagcggcaacagctcaaatttgaaatctggcttggcgtccgagttgtaatttgtagaggatgcttcggcgtaggcgccgcctaaagttccttggaacgggacgtcgtagaaggtgatagccctgtgacagggcggcgtcgccatgtgaagctccttcgacgagtcgagttgtttgggaatgcagctcaaaacgggaggtaaatttcttctaaagctaaataccggccggagaccgatagtgcacaagtagagtgatcgaaagatgaaaagcactttggaaagagagtcaaacagcgcgtgaaattgttaaaagggaagcgcttgcggtcagacttggccgccgttgctcggggagtctcgtgcctccctcgctcttcggcggctgggccagcatcggttggcggctcgataaaggccgcgggaacgtagctcccggggagtgttatagcccgcggcggaatggggcccgcctggatcgaggtctgcgcatcgctcggatgctggcgtaatggcctcaagcggcccgtcttgaaacacggaccaaggagtctaacattcgtgcgagtgttcgggtgtcaaacccgtgcgcgcaatgaaagtgaacgtaggtggggcaccatcgaccgatcctgatgtctttggatttgagtatgagcacgtatgttgggacccgaaagatggtgaactatgcgtaaacagggcgaagccagaggaaactctggtggaggctcgcagcggttctgacgtgcaaatcgatcgtcaaattcgcgcataggggcgaaagaccaatcctagtagctgggttct----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- ; END; BEGIN ASSUMPTIONS; TYPESET * UNTITLED = unord: 1 - 2257; END; BEGIN TREES; Title NJ_SSU_LSU_83; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Minutisphaera_fimbriatispora_A242_8C, 2 Minutisphaera_fimbriatispora_A242_7D, 3 Natipusilla_decrospora_S_AF236_A54, 4 Natipusilla_naponensis_S_AF217_A49, 5 Natipusilla_naponensis_S_AF217_A39, 6 Natipusilla_limonensis_S_AF286_A239, 7 Minutisphaera_fimbriatispora_A242_8A, 8 Alternaria_alternata_CBS_916.96, 9 Alternaria_sp_CBS_174.51, 10 Amniculicola_immersa_CBS_123083, 11 Amniculicola_lignicola_CBS_123094, 12 Amniculicola_parva_CBS_123092, 13 Anguillospora_longissima_CS869_1D, 14 'Aquaticheirospora lignicola RK-2006a', 15 Ascorhombispora_aquatica, 16 Botryosphaeria_dothidea_CBS_115476, 17 Botryosphaeria_ribis_CBS_115475, 18 Capnodium_coffeae_CBS_147.52, 19 Capnodium_salicinum_CBS_131.34, 20 Cheirosporium_triseriale_HMAS_180703, 21 Cochliobolus_heterostrophus_CBS_134.39, 22 Cochliobolus_sativus_DAOM_216378, 23 Dendryphiella_arenaria_CBS_181.85, 24 Dothidea_insculpta_CBS_189.58, 25 Dothidea_sambuci_DAOM_231303, 26 Dothiora_cannabinae_CBS_373.71, 27 Elsinoe_phaseoli_CBS_165.31, 28 Elsinoe_veneta_CBS_164.29, 29 Farlowiella_carmichaeliana_CBS_206.36, 30 Gloniopsis_praelonga_CBS_112415, 31 Gloniopsis_smilacis_CBS_114601, 32 Guignardia_bidwellii_CBS_237.48, 33 'Jahnula aquatica R68-1', 34 'Jahnula bipileata AF220-1', 35 'Jahnula sangamonensis A402-1B', 36 Lentithecium_aquaticum_CBS_123099, 37 Lentithecium_arundinaceum_CBS_619.89, 38 Lindgomyces_cinctospora_R56_1, 39 Lindgomyces_ingoldiana_ATCC200398, 40 Lindgomyces_ingoldiana_JCM16479, 41 Lindgomyces_rotunda_JCM_16482, 42 Lophiostoma_arundinis_CBS_269.34, 43 Lophiostoma_crenatum_CBS_629.86, 44 Lophiostoma_macrostomum_JCM_13545, 45 Lophiostoma_macrostomum_JCM_13546, 46 Massarina_eburnea_HKUCC4054, 47 Massarina_eburnea_CBS_473.64, 48 'Megalohypha aqua-dulces AF005 2a', 49 Mycosphaerella_fijiensis_OSC_100622, 50 Mycosphaerella_graminicola_CBS_292.38, 51 Myriangium_duriaei_CBS_260.36, 52 Mytilinidion_andinense_CBS_123562, 53 Mytilinidion_mytilinellum_CBS_303.34, 54 Natipusilla_limonensis_PE3_2a, 55 Natipusilla_limonensis_PE3_2b, 56 Natipusilla_bellaspora_PE91_1a, 57 Natipusilla_bellaspora_PE91_1b, 58 Aliquandostipite_khaoyaiensis_CBS118232, 59 Roccellographa_cretacea_Duke_191Bc, 60 Schismatomma_decolorans_DUKE0047570, 61 Tingoldiago_graminicola_JCM_16485, 62 Tingoldiago_graminicola_JCM_16486, 63 Minutisphaera_japonica_JCM18561, 64 Minutisphaera_japonica_JCM18562, 65 Minutisphaera_japonica_JCM18560, 66 Minutisphaera_fimbriatispora_G155, 67 Minutisphaera_sp._G156, 68 Asterina_phenacis_TH_589, 69 Asterina_weinmanniae_TH_592, 70 Asterina_zanthoxyli_TH_561, 71 Aulographina_pinorum_CBS_174.90, 72 Laurera_megasperma_AFTOL_2094, 73 Micropeltis_zingiberacicola_IFRDCC_2264, 74 Neomicrothyrium_siamense_IFRDCC_2194, 75 Paramicrothyrium_chinensis_IFRDCC_2258, 76 Stomiopeltis_betulae_CBS_114420, 77 Trypethelium_nitidiusculum_AFTOL_2099, 78 Catinella_olivacea_UAMH_10679, 79 Patellaria_atrata_CBS_958.97, 80 Hysteropatella_elliptica_CBS_935.97, 81 Hysteropatella_clavispora_CBS_247.34, 82 'Muyocopron sp. MFLU CC 10-0042', 83 'Muyocopron sp. MFLU CC 10-0041'; TREE nj = ((15:0.05436455,20:0.03726517):0.02931937,(14:-0.04213934,(36:-0.01282311,(37:-0.00654533,(61:-0.00400102,(62:-0.00211026,(((8:-3.8829E-4,9:3.8829E-4):0.00560595,(23:0.00234422,(21:-5.024E-5,22:5.024E-5):0.0012613):0.00495909):0.02280269,((43:0.00206981,(42:0.00265965,(44:0.0,45:0.0):6.2253E-4):2.263E-4):0.01741619,(((13:5.4197E-4,(10:0.00317205,(11:0.00438066,12:0.0018745):0.0020477):0.00166103):0.01645393,(41:0.00127944,(38:0.00445856,(39:0.0,40:0.0):7.5248E-4):0.00114294):0.00560465):0.00354325,((46:0.00153033,47:0.00529894):0.02587292,(((30:0.00292282,31:0.00423076):0.00488074,(52:0.01152661,53:0.0054298):0.00566974):0.01531406,(((59:0.02002089,60:0.02424387):0.02417021,((82:-0.00555617,83:0.01865487):0.04442036,(((34:0.00682993,35:0.01078921):0.01341317,(58:0.01679928,(33:0.0138602,48:0.01258205):0.00918832):0.00149047):0.02738095,((76:0.04203285,(70:0.00792922,(68:0.02209478,69:-0.00364017):0.00758202):0.05915163):0.00611564,(74:0.00934181,((56:6.0365E-4,57:8.5788E-4):0.02296716,((4:0.00133612,5:6.5201E-4):0.02055725,(3:0.00485658,(55:0.00127769,(6:7.3681E-4,54:-2.4755E-4):1.8857E-4):0.00320089):0.01354022):0.00888378):0.03960647):0.01519183):0.00310811):6.5173E-4):0.00107686):0.0019333,(((32:0.01330135,(16:0.00800653,17:0.0048548):0.00543846):0.0063713,((81:0.00280296,(79:0.06643381,80:0.05096062):0.02449822):0.00966831,(29:0.01340192,((65:0.0,(63:0.0,64:0.0):0.0):9.026E-5,((66:0.00174725,67:0.00215581):0.00160178,(2:2.5685E-4,(1:1.0844E-4,7:3.8971E-4):4.9098E-4):1.6449E-4):0.00256694):0.01107218):0.00805508):0.00119296):0.00352623,((78:0.03144751,(73:0.03811723,(72:-3.4076E-4,77:0.02456638):0.05958413):0.00730171):0.0021077,((75:0.02722349,(51:0.02454847,(27:0.00622517,28:0.00375864):0.00583636):0.01155308):0.00344363,((26:0.00215825,(24:7.5948E-4,25:0.00146503):0.00405873):0.01625411,((49:0.0130854,50:0.01004583):0.00913001,(71:-0.00721237,(18:0.01837552,19:0.01855171):0.00405718):8.2886E-4):0.00453231):0.00358757):0.0024898):9.1722E-4):6.2427E-4):0.00251882):0.00598836):0.00689245):0.0037329):0.00397953):0.01399715):0.00211026):0.0079103):0.01320889):0.02962336):0.02931937)[% ] [% ] [% setBetweenBits = selected ]; END; BEGIN CODONS; CODESET * UNTITLED = universal: 1 - 2257; END; BEGIN MESQUITECHARMODELS; ProbModelSet * UNTITLED = 'Jukes-Cantor': 1 - 2257; END; Begin MESQUITE; MESQUITESCRIPTVERSION 2; TITLE AUTO; tell ProjectCoordinator; timeSaved 1354136056320; getEmployee #mesquite.minimal.ManageTaxa.ManageTaxa; tell It; setID 0 7959026163526653079; endTell; getEmployee #mesquite.charMatrices.ManageCharacters.ManageCharacters; tell It; setID 0 5041291431164459090; mqVersion 275; checksumv 0 3 1281929825 null getNumChars 2257 numChars 2257 getNumTaxa 83 numTaxa 83 short true bits 1152921504606846991 states 15 sumSquaresStatesOnly 3349629.0 sumSquares -2.764705768047219E21 longCompressibleToShort false usingShortMatrix true NumFiles 1 NumMatrices 1; mqVersion; endTell; getWindow; tell It; suppress; setResourcesState true false 211; setPopoutState 400; setExplanationSize 0; setAnnotationSize 0; setFontIncAnnot 0; setFontIncExp 0; setSize 1208 631; setLocation 8 22; setFont SanSerif; setFontSize 10; getToolPalette; tell It; endTell; setActive; desuppress; endTell; endTell; end;