#NEXUS BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=57; TAXLABELS Bromus_arvensis Bromus_sterilis Agropyron_cristatum Amblyopyrum_muticum Australopyrum_pectinatum Australopyrum_retrofractum Australopyrum_velutinum Aegilops_comosa_H6673 Triticum_monococcum Dasypyrum_villosum Eremopyrum_distans Eremopyrum_triticeum Festucopsis_serpentinii Henrardia_persica Heteranthelium_piliferum Hordeum_brachyantherum Hordeum_erectifolium Hordeum_marinum Hordeum_murinum Hordeum_vulgare Lophopyrum_elongatum Aegilops_tauschii Peridictyon_sanctum Crithopsis_delileana Psathyrostachys_fragilis_ssp._fragilis Psathyrostachys_fragilis_ssp._villosus Psathyrostachys_stoloniformis Secale_strictum Pseudoroegneria_spicata Aegilops_speltoides_H4523 Taeniatherum_caput_medusae Thinopyrum_bessarabicum Aegilops_bicornis Aegilops_searsii_H6605 Aegilops_comosa_H6606 Aegilops_umbellulata Triticum_urartu_6664 Triticum_urartu_H665 Aegilops_uniaristata Aegilops_caudata Aegilops_longissima Aegilops_sharonensis Aegilops_searsii_H6683 Aegilops_speltoides_H6797 Triticum_turgidum_ssp._durum_H6838B Triticum_turgidum_ssp._turgidum_B Triticum_turgidum_ssp._dicoccoides_H6840B Triticum_turgidum_ssp._dicoccoides_H6841B Triticum_turgidum_ssp._durum_H6842B Triticum_turgidum_ssp._durum_H6838A Triticum_turgidum_ssp._turgidum_A Triticum_turgidum_ssp._dicoccoides_H6840A Triticum_turgidum_ssp._dicoccoides_H6841A Triticum_turgidum_ssp._durum_H6842A Triticum_aestivum_B Triticum_aestivum_A Triticum_aestivum_D ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE Triticum_and_Aegilops; DIMENSIONS NCHAR=3190; FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING = ?; MATRIX Bromus_arvensis GACAACGTATGGCTCCTTTTATATCTCTCTT--AATCCATTTAGGGAAGAATAGATCAATATCTTTGTTTAATTCGTGATCTTTCT-TTTTAGATCATATACGCTCGCGCATACACCTATGAGCACCAGTACAACTTGCTCCTGGGCCTTGCTGCCAAGATGGCTGAAGAGCCTTTCAGGCTTCTGGTACGCATGAACTT-GCTGCCAAGTA------AATTTACATGTTGATAGATCTAAACTGTGCTCATGTGATCTCTTGTTTAAATTGGAAATGATAGATTGTGGACTCTGTGATTGCGCTATTCCGTGTTGATTTCAGTGGTAGGGGTGAACTTGCAGAGCGTCAGGTATTCTGTTGGAACTAGCTAACTACGT-------AAAAAATACAAGCAACTCATGAAGTAG-CTAA--CT-------------------------------ATGTGCTCTGGAACTGCAGCAAAAACTGGCACAAATGCTGTCCCGCCTTACCAAGATTGCTGAGGAGTTCAATGTTGCAGTGTACATCACCAACCAAGGTGTGCTTT-GCAATCTTAAGTTCTGTCCTTGTTCAAGTGATTGCTTTAAGTGGATGCCAATGCTGTTCTTAAGGTCTGTTCCAAGAA---------TAAATTCGTGGGCCTTGAATCAT--AAGTTCTGT----CCTTGTTACAGTGATTGCGGATCCAGGTGGTGGTATGTTCATAACTGACCCCAAAAAGCCGGCGGGAGGCCATGTGCTGGCGCATGCAGCCACCATCCGGTTGATGCTGAGGAAAGGCAAAGGCGAGCAGCGTGTCTGCAAGATCTTTGATGCCCCTAACCTTCCCGAGGGAGAAGCTATATCCTCTT-GCTCTATA------------------------------------------------------------------------------------------CTTGTTTACTGCTT-GT--GCTATTCATTGCTTTAATATTTT--GGTTGTT--AAACTCTTGATAAAATT----------------------------------------GGACCTGCACTGCAAAGTTTAT-ATTTAATTC-TA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTTGCTAACCTCCTT-----------CACATAGCACAAATTAGCAATGATTAGAT--GT-CGACAAGTTGTTTCCCTTGACCACCAACACGGGGGGCCTTCCGTGAAGGATTGAGGAAAGCTGGTCCACGACTCCTGGAACCTATAATGAAGGTCGAAGTGATTACCCCTGAGGAGCATTTGGGTGATGTTATTGGTGATTTGAACTCTAGAAGAGGACAAGTTAACAGCTTCGGAGATAAGCCAGGTGGACTGAAGGTATTAAGCAGCAC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TA--CATTTTATTCTCGTAGTTATTTC-TCCAATTTGGCTTC-TAGTTTAGCATGATGTGCTGTCTCAAATGTATATCGAGAATAT-AACTTTCCATTGCCTTTTAATTGCAGGTGGTTGACGCTTTCGTGCCACTTGCSGAGATGTTCCAGTATGTCAGCACTCTGAGGGGAATGTCCAAGGGGCGTGCGTCGTACACGATGCAGCTTGCCAAGTTCGACGTTGTCCCACAGCATATCCAGAACCAGCTCTCCGCGGCAAAAACAGAGGAAGCTGCTGCTTAACTTTTCGGTTTT-CGTAGATA-TACACATGTGACGATGGCAGAGCAGGTGAATA--GGAGGACATCAAGGTGTATGTAGCTTTGTAGTGTCGAACCCAGCGGGTGTTATTATTCGCGATTGTTTTTTGGACCTGATAAT????????????????????????????????????????ATATATTTACTTACATTTGATGGGTATTTGCGTGTTCATTTTCAAAATTACAGCAGCACTAAAAAGAGTTCTTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAAGGATACCCAAAGGAGTTAATAGGGCTTTCGTTTTATCAACAAGGAAGAGTGGAGTTTCTTTTTTTTCACAAAATATACCCAAAATTCAAGGTAATACAAGAAATAGGATAGGATCCTTTACTACGTCTTTTGGGGCTAAAAACACTTTTGCCTATCCGCATGAAACGGGAAATACTATGTTATTTCCTCTTCTTATATTACTGCTTTTCACTTTGTTCATTGGATTCATAGGAATCTCTTTTGATAATGGAGGAATGGATAATGGAATAGCAGAATTAACCATATTATCAAAGTGGTTAACTCCCTCAATAAATTTTACCCAGGAAAATTCTAATTCTTTTATAAATTCATATGAATTTATTACTAATGCAATTTCTTCTGTAAGTCTAGCTATCCTTGGTTTATTCATAGCGTATATCTTCTATGGATCCGCTTATTCTTTTTTTCAGAATTTGGATTTAATTAACTCTTTTTCCAAAGGAAATCCTAAAAAAAAAATTTTTGATCAAGTAAAAAAAAATATATACAGTTGGTCATATAATCGTGGTTATATAGATATTTTCTATACTAGGGTCTTTACCCTCGGCATAAGAGGGTTAACCGAACTAACGGAGTTTTTCGATAAGGGTGTTATTGATGGAATTACCAATGGAGTGGGTCTTGCTAGTTTTTGT??? 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Australopyrum_velutinum 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Triticum_monococcum 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Dasypyrum_villosum 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Hordeum_marinum GACAATGTATGGCTCCTTTTACATCTCTTCT--AACCCATTTAAGGAAGAATGGATCAAGATCTTTGTTTAATTCGTGATCTTTCTGTTTTAGATCATATACGCTCGCGCATACACCTATGAGCACCAGTACAACTTACTCCTGGGCCTTGCTGCCAAGATGGCTGAAGAGCCTTTCAGGCTTCTGGTACGCATGACTTT-GCTGCCATGTA------AATTTACAAGTTGATAGATCTCAACTGTGCTCATGTGATCT-TTCTTTGACTTGGAAATGATAGATCGTGGATTCTGTGATTGCGCTATTCCGTGTTGATTTCAGTGGTAGGGGTGAACTTGCAGAGCGTCAGGTATTCTACTATAACTAGCTAACTATG---------AAAAAATCAAGCAACTCATGATGTAGTCGAATGC---TT-GCATTTTATACACTTGCTTT-AAGTGATGTGATCTGGAACTGCAGCAAAAACTGGCACAAATGCTGTCCCGCCTTAC???????GC?GAGGAGTTCAATGTTGCAGTGTACATCACCAACCAAGGTGTGCTTTTC-AATCT-AA------TCC--------------------------------------------TGTCTGTTCCAAGAAAGAGCTCCTTATATTCGTGGGTCTCAAATCAT--AAGTTCTGT----TCTCGTTCCAGTGATTGCGGACCCAGGTGGTGGTATGTTCATAACTGACCCCAAAAAGCCGGCGGGAGGCCACGTGCTGGCACATGCAGCCACCATCCGGTTGATGCTGAGGAAAGGCAAAGGCGAGCAGCGTGTCTGCAAGATCTTTGACGCCCCTAACCTTCCTGAGGGAGAAGCTATATCCTTTT-GCTCTATA------------------------------------------------------------------------------------------CTTGTTTACTGCTT-GT--GCTATTCATTGCTTTAAATTTTTT-GGTTGTT----ACTCTT-ATAAAATT-------------------------------ATTCTGCTCAGATTTGCACAGCAAAGTTTATGATTTAGTTC-TA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTTGCTAAAATCCATGACTGAAGCTCCACGTAGCACAAA-TAGCAATGATCAGATTTGT-CGAGAAATTGTTTCCCTTGACCACCAACACGGGGGGCCTTCCGTGAAGGATTGAGGAAAGCTGGCCCACGACTCCTGGAACCTATAATGAGGGTTGAAGTGATTACCCCTGAGGAGCATCTGGGTGATGTTATTGGTGACTTGAACTCTAGAAGAGGACAAGTTAACAGCTTCGGAGATAAGCCAGGTGGACTTAAGGTATTAAGCAGTACATTCTCTCCCTTTATGGCCTTCTTCTACTA-CTAATACTA------------------------TAA-CAACATGAGTAAAATCGG-------ACAAATTGCAGCATGATTATGCATTTTT----ACTTGACCTCGCAGATATACTACTTTTTAAGTCTAGT-GCACCAAATCTTCCTGCTCCACTT---AACATCCAT-GTCAACT-----CTAGCCGGGCATCTAACATTCAATAACCCTTTTATTCTTTTTCTTTTTCG--GTCAAGCGATAGCCATTTCATTCTCGGAGTTATTTC-TCCAATTAGACTTG-TAGTTTGCCAGGATCTGCTGTCTGAAATGTATCTGGAGAATTT-AACTT-GCTTTGCTGTT-GACTGCAGGTGGTTGATGCTTTTGTGCCGCTGGCCGAGATGTTCCAGTATGTCAGCAGTCTGAGGGGAATGTCCAAGGGTCGCGCGTCATACACGATGCAGCTTGCCAAGTTCGACGTTGTTCCACAGCATATCCAGAACCAGCTTTCTGCGGCAAAACAAGAGGAAGCTGCTGCTTAAATCTTCGGTATT-CGTAGATAATATATAT--GAGGACCGCAGAGCAGGTGAGTATAGG---ACATCAAGGTGTATGTAGCTTTGTAGTGTCGAACCCAGTGGGTGATATTATTTGCCATTGTTTTT-GGACCTGATAATGTCCATAATTTTGAAAGCTGGTATAATTTCATAATGACCTATATATTTACTTACATTTGGTGGGTATTTGCGTGTTCATTTTCAAAATTACAGTAGCACTAAAGAGAGTTCCTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAAGGATACCCAAAGGAGTGAATAGGGATTCCGTTTTATCAACAACGAAGAGTAGAGTTTCTTTTTTTTCACAAAATATACCCAAAATTCAAGGTAATACAAGAAATAGGATAGGATCCTTTACTACGTCTTTTGGGGCTAAAAACACTTTTGCCTATCCGCATGAAACGGGAAATACTATGTTATTTCCTCTTCTTATATTACTACTTTTCACTTTGTTCATTGGATTCATAGGAATCTCTTTTGATAATGGAGGAATGGATAATGGAATAGCAGAGTTAACCATATTATCAAAGTGGTTAACTCCCTCAATAAGCTTTACCCAGGAAAGTTCTAATTCTTTTGTAAATTCATATGAATTTATTACTAATGCAATTTCTTCTGTAAGTCTAGCTATCTTTGGTTTATTCATAGCATATATCTTCTATGGATCTGCTTATTCTTTTTTTCAGAATTTGGATTTAATAAACTCTTTTTACAAAAGAAATCCTAAAAAAGAATTTTTAGATCAAGTAAAAAAAAATATATACAGTTGGTCATATAATCGTGGTTATATAGATATTTTCTATACTAGGGTCTTTACCCTCGGTATAAGAGGGTTAACCGAACTAACGGAGTTTTTTGATAAGGGTGTTATTGATGGAATTACCAATGGAGTGGGTCTTGCTAGTTTTTGTA?? 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Lophopyrum_elongatum 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Aegilops_tauschii 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Peridictyon_sanctum 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Crithopsis_delileana 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Psathyrostachys_fragilis_ssp._fragilis 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Psathyrostachys_fragilis_ssp._villosus 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Secale_strictum GACAATGTATGGCTCCTTTTACATCTCTCTT--AACCCATTTAAGGAACAATAGATCCAGGTCTTTCTTTAATTCGTGATCTTTCTGTTTTAGATCATATACGCTCGGGCATACACCTATGAACACCAGTACAACTTACTCCTGGGCCTTGCTGCCAAGATGGCTGAAGAGCCTTTCAGGCTTCTGGTACGCATGACTTT-GCTGCCATGTT------AATTTAGAAGTTGATAGATCTCAAATGTGCTCATGTGATCT-TTGTTTGACTTGGAAATGATAGATCGTAGATTCTGTGATTGCGCTGTTCCGTGTTGATTTCAGTGGTAGGGGTGAACTTGCAGAGCGTCAGGTATTCTACTGTAACTAGCTAACTATGTG------GAAAAAGTCAAGCAACTCATGATGTAGTCGAATGC---TTTGCATTTTATGCACTTGCTTT-AAGTGATGTGCTCTGGAACTGCAGCAAAAACTAGCACAAATGCTGTCCCGCCTTAC??????????????????????????????GTACATCACCAACCAAGGTGTGCTTT-CCTATCT-AA------TCC--------------------------------------------TGTCTGTTCCAAGAAAGAGCTCCTTGTATTCGTGGATCTCAAATCATATAAGTTGTGT----CCTTGTTCCAGTGATTGCGGACCCAGGTGGTGGCATGTTCATCACTGACCCCAAAAAGCCGGCGGGAGGCCATGTGCTGGCGCATGCAGCCACCATCCGGTTGATGCTGAGGAAAGGCAAAGGCGAGCAGCGTGTCTGCAAGATCTTTGACGCCCCTAACCTTCCCGAGGGAGAAGCTATATCCTTTT-GCTCTATA------------------------------------------------------------------------------------------CTTGTTTACTGCTT-GT--GCTATTCGTTGCTTTAATTTGTTT-GGTTGTT--AAACTCTTGATAAAATTTATGTGCAAAATAAAAACTCTTGATAAAATTGTTTTGCTCAGAGTTGCACAGCAAAGTTTATGATTTAATTC-TA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTTGCTAACCTCCATGACTGAAGCTTCACGTAGTGCAAATTAGCAATGATCAGAT--GT-CGAGAAATTGTTTCCCTTGACAACCAACACG???GGCCTTCCGCGAAGGATTGAGGAAAGCTGGCCCACGACTCCTGGAGCCTATAATGAGGGTTGAAGTGATTACCCCTGAGGAGCATTTGGGTGATGTTATTGGTGATTTGAACTCTAGAAGAGGACAAGTTAACAGCTTCGGTGATAAGCCAGGTGGACTGAAGGTATTAAGCAATACATTTTCTCCATTTACGGCCTTCTACTGCTA-CTAATACTA---------CTTTGACTAACACTATAA-CAACATGAGTAAA-----------------TTGGAGTATGATTATGCATTTTTTT--ATTTGACCTCTCAAA--TACTAATTTG-AAGTCTACTTTTACCAAATCTTCMTGCTGCACTTCTTAACATACATTGTCAGCT-----ATAGCCGAGCATCTAACATTCAATAACCCTTTTATTCTTATTCTTTTTTG--GTCGAGAGATAGCCATTTTATTCTCAGAGTTATTTC-TCCAATTAGACTTG-TAGTTTGCCAGGATCTGCTGTCTGAAATATTTCTCGAGAATTG-AACTT-GCTTTGCTGTTTGACTGCAGGTGGTTGATGCTTTCGTGCCGCTGGCCGAGATGTTCCAGTATGTCAGCACTCTGAGGGGAATGTCCAAGGGGCGCGCGTCGTACACAATGCAGCTTGCGAAGTTCGACGTTGTCCCACAGCATATCCAGAACCAGCTATCTGCGGCAAAA---GAGGAAGCTGCTGCTTAAATCTTCAGTATT-CGTAGATAA-ATATAT--GAGGACGGCAGAGCAGGTGAGTATAGG---ACATCAAGGTGTATGTAGCTTTGTAGTGTCGAACCCAGTGGGTGATATTATTTGCCATTGTTTTT-GGACCTGATAATGTCCATAATTTTGCAAGCTGTTATAATTTCATAA??????ATATATTTACTTACATTTGATGGGTATTTGCGTGTTCATTTTCAAAATTACAGTAGCACTAAAGAGAGTTCCTTGTATTCAATATCCTTATGGGGAAAAAGGATACCCAAAGGAGTGAATAGGGATTTCGTTTTATCAACAACGAAGAGTGGAGTTTCTTTTTTTTCACAAAATATACCAAAAATTCAAGGTAATACAAGAAATAGGATAGGATCCTTTACTACGTCTTTTGGGGCTAAAAACACTTTTGCCTATCCGCATGAAACGGGAAATACTATGTTATTTCCTCTTCTTATATTACTACTTTTCACTTTGTTCATTGGATTCATAGGAATCTCTTTTGATAATGGAGGAATTGGTAATGGAATAGCAGAGTTAACCATATTATCAAAGTGGTTAACTCCCTCAATAAACTTTACCCAGGAAAGTTCTAATTCTTTTGTAAATTCATATGAATTTATTACTAATGCAATTTCTTCTGTAAGTCTAGCTATCTTTGGTTTATTCATAGCATATATCTTCTATGGATCTGCTTATTCTTTTTTTCAGAATTTGGATTTAATAAACTCTTTTTACAAAGGAAATCCTAAAAAAGAATTTTTAGATCAAATAAAAAAAAATATATACAGTTGGTCATATAATCGTGGTTATATAGATATTTTCTATACTAGGGTCTTTACCCTCGGTATAAGAGGGTTAACCGAACTAACGGAGTTTTTTGATAAGGGTGTTATTGATGGAATTACCAATGGAGTGGGTCTTGCTAGTTTTTGTA?? 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Aegilops_sharonensis 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Triticum_turgidum_ssp._turgidum_B 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Triticum_turgidum_ssp._dicoccoides_H6840B 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Triticum_aestivum_B 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Triticum_aestivum_A GACAATGTATGGCTCCTTTTACATCTCTCTT--AACCCATTTAAGGAAGAATAGATCAAGATCTTTGTTTAATTCGTGATCTTTCTGTTTTAGATCATATACGCTCGCGCATACACCTATGAGCACCAGTACAACTTACTCCTGGGCCTTGCTGCCAAGATGGCCGAAGAGCCTTTCAGGCTTCTGGTACGCATGACTTT-GCTGACATGTACTATCAAACTTACAAGTTGATAGATCTCAACTGTGCTCATGTGATCT-TTGTTTGGCTTGGAAATGATAGATCGTGGATTCTGTGATTGCGCTATTCCGTGTTGATTTCAGTGGTAGGGGTGAACTTGCAGAGCGTCAGGTATTCTACTGTAACTAGCTAACTATGTG-------AAAAAATCAAGCAACTCATGATGTAGTCGAATGC---TT-GCATTTTATACACTTGCTCT-AAGTGATGTGCTCTGGAACTGCAGCAAAAACTGGCACAAATGCTGTCCCGCCTTACAAAGATTGCTGAGGAGTTCAATGTTGCAGTGTACATCACCAACCAAGGTGTGCTTT-CCAATCT--A------TCC--------------------------------------------TGTCTGTTCCAAGAAAGAGCTCCTTATATTCGTGGATCTCAAATCATATAAGTTCTTT----CCTTGTTCCAGTGATTGCGGACCCAGGTGGTGGTATGTTCATCACTGACCCCAAAAAGCCGGCAGGAGGCCACGTGCTGGCGCATGCAGCCACCATCCGGTTGATGCTGAGGAAAAGCAAAGGCGAGCAGCGTGTCTGCAAGATCTTTGACGCCCCTAACCTTCCCGAGGGAGAAGCTATATCCTTTT-GCT---TA-CTA--------------------------------------------------------------------------------------CTTGTTTACTGCTT-GT--GCTATTCATTGCTTTAATTTGTTT-GGTTGCT--GAACTCTTGATAGGATT-------------------------------GTTTTGCTCAGACTTGCACAGC----TTTATGATTTAGTTCTTA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTTGTTAACCTCCTTTGCTGAAGCTTCACGTAGCACAAATTAGCAATGATCAGAT--GT-CGAGAAATTGTTTCCCTTGACCACCAACACGGGGTGCCTTCCGTGAAGGATTGAGGAAAGCTGGCCCACGACTCCTGGAACCTATAATGAGGGTTGAAGTGATTACCCCTGAGGAGCATTTGGGTGATGTTATTGGTGACTTGAACTCTAGAAGAGGACAAGTTAACAGCTTCGGAGATAAGCCAGGTGGACTTAAGGTATTAAGCAGTAC------TCC-TTTATGGCCTTCTATTACTA-CTAATACTA---------CCTTGACTAACACTATAA-TAACATGAGTAAAATTGA-------ACAAATTGCAGTATGATTATGCATT-AT----ATTTGACCTATCTGATGTACTAATTCT-GAGTCTAGT-GCACCAAATCTTCCTGCTGCACTT---AACATCCATTGTCAGCT-----ATAGCCGAGCATCTAACATTCAATAACCCTTT-ATTCTTTTTCTTTTTTG--GTCGAGAGATAGCCATTTTATTCTCGGAGTTATTTC-TCCAATTAGACTTG-TAGTTTGCCAGGATCTGCTGTCTGAAATATTTCTGCAGAATTG-AACTT-GCTTTGCTGTT-GACTGCAGGTGGTTGATGCTTTCGTGCCGCTGGCCGAGATGTTCCAGTATGTCAGCACTCTGAGGGGAATGTCCAAGGGGCGCGCGTCATACACAATGCAGCTTGCCAAGTTCGACGTTGTCCCACAGCATATCCAGAACCAGCTTTCTGCGGCAAAA---GAGGAAGCTGCTGCTTAAATCTTCAGTATT-CGTAGATAATATATAT--GAGGACGGCAGAGCAGGTGAGTATAGG---ACATCAAGGTGTATGTAGCTTTGTAGTGTCGAACCCAGCGGGTGATATTATTTGCCATTGTTTTT-GGACCTGATAATGTCCATAATTTTGCAAGCTGTTATAATTTCATAATGACCT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Triticum_aestivum_D GACAATGTATGGGTCCTTTTACATCTCTCTTATAACCCATTTAAGGAAGAATAGATCGAGATCTTTGTTTAATTTGTGATCTTTCTGTTTTAGATCATATATGCTCGTGCCTACACCTATGAGCACCAGTACAACTTACTCCTGGGCCTTGCTGCCAAGATGGCTGAAGAGCCTTTCAGGCTTCTGGTACGCATGACTTT-GCTGCCATGTA------AATTTACAAGTTGATAGATCTCAACTGTGCTCATGTGTTCT-TTGTTTGACTTGGAAATGATAGATCGTGGATTCTGTGATTGCGCTGTTCCGTGTTGATTTCAGTGGTAGGGGTGAACTTGCAGAGCGTCAGGTATTCTACTGTAACTAGCTAACTACATG-------AAAAAATCAAGCAACTCATGAAGTAGTCGAATGCTGCTT-GCATTTTATACACTTGCTTT-AAGTGATGTGCTCTGGAACTGCAGCAAAAGCTGGCACAAATGCTGTCCCGCCTTACAAAGATTGCTGAGGAGTTCAATGTTGCAGTGTACATCACCAACCAAGGTGTGCTTT-CCAATCT--A------TCC--------------------------------------------TGTCTGTTCCAAGAAAGAGCTCCTTATATTCGTGGATCTCAAATCATATAAGTTCTTT----CCTTGTTCCAGTGATTGCGGACCCAGGTGGTGGTATGTTCATCACTGACCCCAAAAAGCCGGCGGGAGGCCACGTGCTGGCGCATGCAGCCACCATCCGGTTGATGCTGAGGAAAGGCAAAGGCGAGCAGCGTGTCTGCAAGATCTTTGACGCCCCTAACCTTCCCGAGGGAGAAGCTATATCCTTTT-GCTCTATA-CTA--------------------------------------------------------------------------------------CTTGTTTACTGCTT-GTGCGCTATTCATTGCTTTAATTTGTTT-GGTTGTT--GAACTCTTGATAGGATT-------------------------------GTTTTGCTCAGACTTGCACAGCAAAGTTTATGATTTAGTTC-TA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTTGTTAACCTCCTTTACTGAAGCTTCACGTAGCACAAATTAGCGACGATCAGAT--GT-CGAGAAATTGTTTCCCTTGACCACCAACACGGGGGGCCTTCCGTGAAGGATTGAGGAAAGCTGGCCCACGACTCCTGGAACCTATAATGAGGGTTGAAGTGATTACCCCTGAGGAGCATTTGGGTGATGTTATTGGTGACTTGAACTCTAGAAGAGGACAAGTTAACAGCTTCGGAGATAAGCCAGGTGGACTTAAGGTAGTAAGCAGTAC------TCC-TTTATGACCTTCTATTACTA-CTAATACTA---------CCTTGACCAACACTATAA-CAACATGAGTAAAATTGA-------ACAAATTGCAGTATGATTATGCATTTAT----ATTTGATCTATCTAATGTACTAATTTT-GAGTCTAGT-GCACCAAATCTTCCTGCCGCACTT---AACATCCATTGTCAGCT-----ATAGCCGAGCATCTA-CATTCCATAACCCTTTTATTCTTTTTCTTTTTTG--GTCGAGAGATAGCCATTTTATTCTCGGAGTTATTTC-TCCAATTAGACTTG-TAGTTTGCCAGGATCTGCTGTCTGAAATATTTCTCGAGAATTG-AACTT-GCTTTGCTGTT-GACCGCAGGTGGTTGATGCTTTCGTGCCGCTGGCCGAGATGTTCCAGTATGTCAGCACTCTGAGGGGAATGTCCAAGGGGCGCGCGTCGTACACAATGCAGCTTGCCAAGTTTGACGTTGTCCCACAGCATATCCAGAACCAGCTTTCTGCGGCAAAA---GAGGAAGCTGCTGCTTAAATCTTCAGTATT-CGTAGATAATATATAT--GAGGACGGCAGAGCAGGTGAGTATAGG---ACATCAAGGTGTATGTAGCTTTGTAGTGTCGAACCCAGTGGGTGATATTATTTGCCATTGTTTTT-GGACCTGATAATGTCCATAATTTTGCAAGCTGTTATAATTTCATAATGACCT????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? ; END; BEGIN SETS; CHARSET DMC1 = 1 - 1497; CHARSET EFG = 1498 - 2413; CHARSET ndhF = 2414 - 3190; CHARSET MITEstowaway1 = 886 - 973; CHARSET MITEstowaway2 = 1119 - 1406; END; BEGIN TREES; Title Triticum_and_Aegilops; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Bromus_arvensis, 2 Bromus_sterilis, 3 Agropyron_cristatum, 4 Amblyopyrum_muticum, 5 Australopyrum_pectinatum, 6 Australopyrum_retrofractum, 7 Australopyrum_velutinum, 8 Aegilops_comosa_H6673, 9 Triticum_monococcum, 10 Dasypyrum_villosum, 11 Eremopyrum_distans, 12 Eremopyrum_triticeum, 13 Festucopsis_serpentinii, 14 Henrardia_persica, 15 Heteranthelium_piliferum, 16 Hordeum_brachyantherum, 17 Hordeum_erectifolium, 18 Hordeum_marinum, 19 Hordeum_murinum, 20 Hordeum_vulgare, 21 Lophopyrum_elongatum, 22 Aegilops_tauschii, 23 Peridictyon_sanctum, 24 Crithopsis_delileana, 25 Psathyrostachys_fragilis_ssp._fragilis, 26 Psathyrostachys_fragilis_ssp._villosus, 27 Psathyrostachys_stoloniformis, 28 Secale_strictum, 29 Pseudoroegneria_spicata, 30 Aegilops_speltoides_H4523, 31 Taeniatherum_caput_medusae, 32 Thinopyrum_bessarabicum, 33 Aegilops_bicornis, 34 Aegilops_searsii_H6605, 35 Aegilops_comosa_H6606, 36 Aegilops_umbellulata, 37 Triticum_urartu_6664, 38 Triticum_urartu_H665, 39 Aegilops_uniaristata, 40 Aegilops_caudata, 41 Aegilops_longissima, 42 Aegilops_sharonensis, 43 Aegilops_searsii_H6683, 44 Aegilops_speltoides_H6797, 45 Triticum_turgidum_ssp._durum_H6838B, 46 Triticum_turgidum_ssp._turgidum_B, 47 Triticum_turgidum_ssp._dicoccoides_H6840B, 48 Triticum_turgidum_ssp._dicoccoides_H6841B, 49 Triticum_turgidum_ssp._durum_H6842B, 50 Triticum_turgidum_ssp._durum_H6838A, 51 Triticum_turgidum_ssp._turgidum_A, 52 Triticum_turgidum_ssp._dicoccoides_H6840A, 53 Triticum_turgidum_ssp._dicoccoides_H6841A, 54 Triticum_turgidum_ssp._durum_H6842A, 55 Triticum_aestivum_B, 56 Triticum_aestivum_A, 57 Triticum_aestivum_D; TREE StrictConsensus = ((1:0.01808113,2:0.0172572):0.029573745,((14:0.02233223,29:0.01341375):0.00327716,((30:0.00173032,44:7.4531E-4):0.00263795,(47:5.497E-4,(48:1.0E-8,(55:1.0E-8,(45:1.0E-8,46:1.0E-8,49:1.0E-8):5.3083E-4):0.00212617):5.2093E-4):0.00509136):0.01816089,((13:0.01141595,23:0.01253834):0.00368368,(28:0.02606687,(((27:0.00860759,(25:0.00382794,26:0.00470386):0.0079342):0.00781386,((12:0.00886397,(3:0.00582786,11:0.00996764):0.0020102):0.01366199,((19:0.02657467,20:0.0242781):0.0038981,(18:0.01212801,(16:0.00472783,17:0.00459252):0.0038018):0.00860301):0.00689478):9.4339E-4):0.00212188,((10:0.01972782,15:0.02600638):0.00402326,(31:0.01308499,(7:0.00248116,(5:0.00247793,6:4.9156E-4):0.00616246):0.00906134):0.00822956,((32:0.01323178,(4:0.01407222,9:0.01050039,((37:1.0E-8,38:1.0E-8):0.00109714,(50:6.1723E-4,51:0.00123565,52:1.0E-8,53:6.1668E-4,54:1.0E-8,56:6.1768E-4):6.0861E-4):0.00710186):0.00118219):0.00180709,(21:0.01468591,(24:0.01070425,((36:0.00660007,40:0.00421855):7.3736E-4,((39:0.00260995,(8:5.2305E-4,35:1.0E-8):0.00366539):0.00217135,((22:1.0E-8,57:0.00124309):0.00587746,((34:1.0E-8,43:1.0E-8):0.0048531,(33:5.226E-4,(41:0.00102458,42:9.1185E-4):0.00216624):7.0853E-4):0.00999198):0.0051525):0.00433551):0.00698203):0.0018124):0.009768):0.0213635):0.00224733):0.00471718):0.00604363):0.00706859):0.029573745); END;