NEXUS
[File created by TreeBASE:  7/26/07  21:08:13]
[Matrix accession#: M2278]

BEGIN TAXA;
	TITLE M2278;
	DIMENSIONS  NTAX=21;
	TAXLABELS
		Syrrhopodon_trachyphyllus	Syrrhopodon_revolutus	Syrrhopodon_involutus_Samoa_406	Syrrhopodon_involutus_Fiji_993	Syrrhopodon_involutus_Fiji_987	Syrrhopodon_involutus_Fiji_417	Syrrhopodon_involutus_Niue_1018	Syrrhopodon_involutus_Sulawesi_1014	Syrrhopodon_involutus_Sulawesi_1015	Syrrhopodon_involutus_PNG_936	Syrrhopodon_involutus_PNG_1017	Syrrhopodon_involutus_Madagascar_941	Syrrhopodon_involutus_Australia_972	Syrrhopodon_involutus_Madagascar_973	Syrrhopodon_involutus_Seychelles_976	Syrrhopodon_involutus_Borneo_815	Syrrhopodon_involutus_Malaysia_346	Syrrhopodon_involutus_Marquesas_917	Syrrhopodon_involutus_Tahiti_813	Syrrhopodon_involutus_Moorea_458	Syrrhopodon_involutus_Raiatea_457
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M2278;
	DIMENSIONS NCHAR=702;
	FORMAT SYMBOLS = " A C G T 0 1 2 3 4 5 " MISSING = ? GAP = -  ;
	MATRIX
		Syrrhopodon_trachyphyllus                  ?????????ATCGAGGACCTCGTGTAAAAATAATACGTCGTTTAGGAACTTTATCAGGACTAACTAATAAAACA---CCCCAGTTAAAATCTAGTTCTATTAATCAATCAACATCTAGTAAAAAAATTTCTCAATATCGTATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGGTTAACCGAACGACAGTTATTAAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGTAAAAGGATCGACTGGACAAGTTTTATTACAATTACTAGAAATGCGTTTAGATAATATTATTTTTCGATTAGGTCTAGCTCCTACAATTCCTGGAGCAAGGCAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATAATCGTATAGTAAATATCCCAAGTTATCAGTGTAAACCTCAAGACTTTATTACTATAAAAGATCAACAAAAATATCAAACAATGATTATTAAAAATACAAGTTTTTTTTCAAAACATAAAACACCAAATCATTTAATATTTAATTCTGTAGAAAAAAAAGGATTTGTTAATCAGATCTTAGATCACGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATACTATTCTCGTCAGGCTTAATGAACAGATAATAATAA?????????????????????????????????????????????????????????20020000000000?10
		Syrrhopodon_revolutus                      ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????211011011000111??
		Syrrhopodon_involutus_Samoa_406            ?????????????AGGACCTCGTGTAAAAATAATACGCCGTTTAGGAACTTTATCAGGACTAACTAATAAAATA---CCCCAGTTAAAATCTAGTTCCATTAATCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAATATCGTATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGGTTAACAGAACGACAGCTATTAAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGTAAAAGGATCGACTGGGCAAGTTTTATTACAATTACTAGAAATGCGTTTAGATAATATTATTTTTCGATTAGGTCTAGCTCCTACAATTCCTGGAGCAAGGCAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATAATCATATGGTAAATATCCCAAGTTATCAGTGTAAACCTCAAGATTTTATTACTATAAAAGATCAACAAAAATACCAAACAATGATTATTAAAAATACAAATTTTTTTTCAAAACATAAAACACCAAATCATTTAACATTTAATTCTGTAGAAAAAAAAGGATTTGTTAATCAGATATTAGATCAAGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAGGCTTAATAAATACATAATAATAATTTA?TATATATATATATAATTATATTATTTTTGAAATAAGGAAAGAGAGGGATTCG21120101001011110
		Syrrhopodon_involutus_Fiji_993             ?????????????????????????????????????????????????????????GACTCACTAATAAAATA---CCCCAGTTAAAATATAGTTCCATTACTCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAATATCGTATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGGTTAACAGAACGACAGCTATTAAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGTAAAAGGATCGACTGGGCAAGTTTTATTACAATTATTAGAAATGCGTTTAGATAATATTATTTTTCGATTAGGTCTAGCTCCTACAATTCCTGGAGCAAGGCAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATAATCATATGGTAAATATCCCAAGTTATCAGTGTAAACCTCAAGATTTTATTACTATAAAAGATCAACAAAAATACCAAACAATGATTGTTAAAAATACAAATTTTTTTTCAAAACAGAAAACACCAAATCATTTAATATTTAATTCTGTAGAAAAAAAAGGATTTGTTAATCAGATATTAGATCAAGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAGGCTTAATAAATACATAATAATAATTTAGTATATATATATATAATTATATTATTTTTGAAATAAGGAAAGAGAGGGATTCG01011100200100011
		Syrrhopodon_involutus_Fiji_987             ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????---CCCCAGTTAAAATATAGTTCCATTACTCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAATATCGTATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGGTTAACAGAACGACAGCTATTAAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGTAAAAGGATCGACTGGGCAAGTTTTATTACAATTATTAGAAATGCGTTTAGATAATATTATTTTTCGATTAGGTCTAGCTCCTACAATTCCTGGAGCAAGGCAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATAATCATATGGTAAATATCCCAAGTTATCAGTGTAAACCTCAAGATTTTATTACTATAAAAGATCAACAAAAATACCAAACAATGATTGTTAAAAATACAAATTTTTTTTCAAAACAGAAAACACCAAATCATTTAATATTTAATTCTGTAGAAAAAAAAGGATTTGTTAATCAGATATTAGATCAAGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAGGCTTAATAAATACATAATAATAATTTAGTATATATATATATAATTATATTATTTTTGAAATAAGGAAAGAGAGGGATTCG01011100200100011
		Syrrhopodon_involutus_Fiji_417             ???????????????????????GTAAAAATAATACGCCGTTTAGGAACTTTATCAGGACTAACTAATAAAATA---CCCCAGTTAAAATATAGTTCCATTACTCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAATATCGTATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGGTTAACAGAACGACAGCTATTAAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGTAAAAGGATCGACTGGGCAAGTTTTATTACAATTATTAGAAATGCGTTTAGATAATATTATTTTTCGATTAGGTCTAGCTCCTACAATTCCTGGAGCAAGGCAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATAATCATATGGTAAATATCCCAAGTTATCAGTGTAAACCTCAAGATTTTATTACTATAAAAGATCAACAAAAATACCAAACAATGATTGTTAAAAATACAAATTTTTTTTCAAAACAGAAAACACCAAATCATTTAATATTTAATTCTGTAGAAAAAAAAGGATTTGTTAATCAGATATTAGATCAAGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAGGCTTAATAAATACATAATAATAATTTAGTATATATATATATAATTATATTATTTTTGAAATAAGGAAAGAGAGGGATTC?01011100200100011
		Syrrhopodon_involutus_Niue_1018            ?????????????????????????????????????????????????????????????????AATAAAATA---CCCCAGTTAAAATATAGTTCCATTACTCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAATATCGTATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGGTTAACAGAACGACAGCTATTAAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGTAAAAGGATCGACTGGGCAAGTTTTATTACAATTATTAGAAATGCGTTTAGATAATATTATTTTTCGATTAGGTCTAGCTCCTACAATTCCTGGAGCAAGGCAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATAATCATATGGTAAATATCCCAAGTTATCAGTGTAAACCTCAAGATTTTATTACTATAAAAGATCAACAAAAATACCAAACAATGATTGTTAAAAATACAAATTTTTTTTCAAAACAGAAAACACCAAATCATTTAATATTTAATTCTGTAGAAAAAAAAGGATTTGTTAATCAGATATTAGATCAAGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAGGCTTAATAAATACATAATAATAATTTAGTATATATATATATA??????????????????????????????????????0101110020010001?
		Syrrhopodon_involutus_Sulawesi_1014        ?????????????????????????????????????????????????????????????????????AAATA---CCCCAGTTAAAATATAGTTCCATTACTCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAATATCGTATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGGTTAACAGAACGACAGCTATTAAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGTAAAAGGATCGACTGGGCAAGTTTTATTACAATTATTAGAAATGCGTTTAGATAATATTATTTTTCGATTAGGTCTAGCTCCTACAATTCCTGGAGCAAGACAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATAATCATATGGTAAATATCCCAAGTTATCAGTGTAAACCTCAAGATTTTATTACTATAAAAGATCAACAAAAATACCAAACAATGATTGTTAAAAATACAAATTTTTTTTCAAAACAGAAAACACCAAATCATTTAATATTTAATTCTGTAGAAAAAAAAGGATTTGTTAATCAGATATTAGATCAAGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAGGCTTAATAAATACATAATAATAATTTAGTATATATATATAT???????????????????????????????????????1110110020010101?
		Syrrhopodon_involutus_Sulawesi_1015        ????????????????????????????????????????????????????????????????????????TA---CCCCAGTTAAAATATAGTTCCATTACTCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAATATCGTATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGGTTAACAGAACGACAGCTATTAAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGTAAAAGGATCGACTGGGCAAGTTTTATTACAATTATTAGAAATGCGTTTAGATAATATTATTTTTCGATTAGGTCTAGCTCCTACAATTCCTGGAGCAAGACAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATAATCATATGGTAAATATCCCAAGTTATCAGTGTAAACCTCAAGATTTTATTACTATAAAAGATCAACAAAAATACCAAACAATGATTGTTAAAAATACAAATTTTTTTTCAAAACAGAAAACACCAAATCATTTAATATTTAATTCTGTAGAAAAAAAAGGATTTGTTAATCAGATATTAGATCAAGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAGGCTTAATAAATACATAATAATA??????????????????????????????????????????????????????????11101100200101011
		Syrrhopodon_involutus_PNG_936              ??????????????????????????????????????????????????????????ACTAACTAATAAAATA---CCCCAGTTAAAATATAGTTCCATTACTCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAATATCGTATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGGTTAACAGAACGACAGCTATTAAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGTAAAAGGATCGACTGGGCAAGTTTTATTACAATTATTAGAAATGCGTTTAGATAATATTATTTTTCGATTAGGTCTAGCTCCTACAATTCCTGGAGCAAGACAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATAATCATATGGTAAATATCCCAAGTTATCAGTGTAAACCTCAAGATTTTATTACTATAAAAGATCAACAAAAATACCAAACAATGATTGTTAAAAATACAAATTTTTTTTCAAAACAGAAAACACCAAATCATTTAATATTTAATTCTGTAGAAAAAAAAGGATTTGTTAATCAGATATTAGATCAAGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAGGCTTAATAAATACATAATAATAATTTAGTATATATATATATAATTATATTATTTTTGAAATAAGAA??????????????11101100200101011
		Syrrhopodon_involutus_PNG_1017             ????????????????????????????????????????????????????????????????????????TA---CCCCAGTTAAAATCTAGTTCCATTAATCAATCAACATCTAATAAGAAAATTTCTCAATATCGTATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGGTTAACAGAACGACAGTTATTAAATTATGTACGTATTGCTAGAAACGTAAAAGGATCGACTGGCCAAATTTTATTACAATTACTAGAAATGCGTTTAGATAATATTATTTTTCGGTTAGGTCTAGCTCCTACAATTCCTGGAGCAAGGCAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATAATCATATGGTAAATATCCCAAGTTATCAGTGTAAACCTCAAGATTTTATTACTATAAAAGATCAAAAAAAATACCAAACAATGATTGTTAAAAATACAAATTTTTTTTCAAAACATAAAACACCAAATCATTTAATATTTAATTCTGTAGAAAAAAAAGGATTTGTTAATCAGATATTAGATCAAGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGCTTAATAAATACATAATAATAATTTAGTATATATATATATAATTATAT???????????????????????????????01020110110101100
		Syrrhopodon_involutus_Madagascar_941       ????????????GAGGACCTCGTGTAAAAATAATACGCCGTTTAGGAACTTTATCAGGACTAACTAATAAAATA---CCCCAGTTAAAATCTAGTTCCATTAATCAATCAACATCTAATAAGAAAATTTCTCAATATCGTATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGGTTAACAGAACGACAGTTATTAAATTATGTACGTATTGCTAGAAACGTAAAAGGATCGACTGGCCAAATTTTATTACAATTACTAGAAATGCGTTTAGATAATATTATTTTTCGGTTAGGTCTAGCTCCTACAATTCCTGGAGCAAGGCAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATAATCATATGGTAAATATCCCAAGTTATCAGTGTAAACCTCAAGATTTTATTACTATAAAAGATCAAAAAAAATACCAAACAATGATTGTTAAAAATACAAATTTTTTTTCAAAACATAAAACACCAAATCATTTAATATTTAATTCTGTAGAAAAAAAAGGATTTGTTAATCAGATATTAGATCAAGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGCTTAATAAATACATAATAATAATTTAGTATATATATATATAATTATATA??????????????????????????????01020110110101100
		Syrrhopodon_involutus_Australia_972        ?????????????????????????????????????????????GAACTTTATCAGGACTAACTAATAAAATA---CCCCAGTTAAAATCTAGTTCCATTAATCAATCAACATCTAATAAGAAAATTTCTCAATATCGTATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGGTTAACAGAACGACAGTTATTAAATTATGTACGTATTGCTAGAAACGTAAAAGGATCGACTGGCCAAATTTTATTACAATTACTAGAAATGCGTTTAGATAATATTATTTTTCGGTTAGGTCTAGCTCCTACAATTCCTGGAGCAAGGCAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATAATCATATGGTAAATATCCCAAGTTATCAGTGTAAACCTCAAGATTTTATTACTATAAAAGATCAAAAAAAATACCAAACAATGATTGTTAAAAATACAAATTTTTTTTCAAAACATAAAACACCAAATCATTTAATATTTAATTCTGTAGAAAAAAAAGGATTTGTTAATCAGATATTAGATCAAGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGCTTAATAAATACATAATAATAATTTAGTATATATATATATAATTATATATTTTTTGAAATAAG????????????????01020110110101100
		Syrrhopodon_involutus_Madagascar_973       ????????????????????????????????ATACGCCGTTTAGGAACTTTATCAGGACTAACTAATAAAATA---CCCCAGTTAAAATCTAGTTCCATTAATCAATCAACATCTAATAAGAAAATTTCTCAATATCGTATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGGTTAACAGAACGACAGTTATTAAATTATGTACGTATTGCTAGAAACGTAAAAGGATCGACTGGCCAAATTTTATTACAATTACTAGAAATGCGTTTAGATAATATTATTTTTCGGTTAGGTCTAGCTCCTACAATTCCTGGAGCAAGGCAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATAATCATATGGTAAATATCCCAAGTTATCAGTGTAAACCTCAAGATTTTATTACTATAAAAGATCAAAAAAAATACCAAACAATGATTGTTAAAAATACAAATTTTTTTTCAAAACATAAAACACCAAATCATTTAATATTTAATTCTGTAGAAAAAAAAGGATTTGTTAATCAGATATTAGATCAAGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGCTTAATAAATACATAATAATAATTTAGTATATATATATATAATTATA????????????????????????????????01020110110101100
		Syrrhopodon_involutus_Seychelles_976       ???????????????????????????????????????????????????????????CTAACTAATAAAATA---CCCCAGTTAAAATCTAGTTCCATTAATCAATCAACATCTAATAAGAAAATTTCTCAATATCGTATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGGTTAACAGAACGACAGTTATTAAATTATGTACGTATTGCTAGAAACGTAAAAGGATCGACTGGCCAAATTTTATTACAATTACTAGAAATGCGTTTAGATAATATTATTTTTCGGTTAGGTCTAGCTCCTACAATTCCTGGAGCAAGGCAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATAATCATATGGTAAATATCCCAAGTTATCAGTGTAAACCTCAAGATTTTATTACTATAAAAGATCAAAAAAAATACCAAACAATGATTGTTAAAAATACAAATTTTTTTTCAAAACATAAAACACCAAATCATTTAATATTTAATTCTGTAGAAAAAAAAGGATTTGTTAATCAGATATTAGATCAAGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGCTTAATAAATACATAATAATAATTTAGTATATATATATA????????????????????????????????????????01020110110101100
		Syrrhopodon_involutus_Borneo_815           ???????????????????????????????????????????AGGAACTTTATCAGGACTAACTAATAAAATA---CCCCAGTTAAAATCTAGTTCCATTAATCAATCAACATCTAATAAGAAAATTTCTCAATATCGTATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGGTTAACAGAACGACAGTTATTAAATTATGTACGTATTGCTAGAAACGTAAAAGGATCGACTGGCCAAATTTTATTACAATTACTAGAAATGCGTTTAGATAATATTATTTTTCGGTTAGGTCTAGCTCCTACAATTCCTGGAGCAAGGCAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATAATCATATGGTAAATATCCCAAGTTATCAGTGTAAACCTCAAGATTTTATTACTATAAAAGATCAAAAAAAATACCAAACAATGATTGTTAAAAATACAAATTTTTTTTCAAAACATAAAACACCAAATCATTTAATATTTAATTCTGTAGAAAAAAAAGGATTTGTTAATCAGATATTAGATCAAGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGCTTAATAAATACATAATAATAATTTAGTATATATATATATAATTATATATTTTTTG???????????????????????01020110110101100
		Syrrhopodon_involutus_Malaysia_346         ???????????????????????GTAAAAATAATACGCCGTTTAGGAACTTTATCAGGACTAACTAATAAAATA---CCCCAGTTAAAATCTAGTTCCATTAATCAATCAACATCTAATAAGAAAATTTCTCAATATCGTATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGGTTAACAGAACGACAGTTATTAAATTATGTACGTATTGCTAGAAACGTAAAAGGATCGACTGGCCAAATTTTATTACAATTACTAGAAATGCGTTTAGATAATATTATTTTTCGGTTAGGTCTAGCTCCTACAATTCCTGGAGCAAGGCAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATAATCATATGGTAAATATCCCAAGTTATCAGTGTAAACCTCAAGATTTTATTACTATAAAAGATCAAAAAAAATACCAAACAATGATTGTTAAAAATACAAATTTTTTTTCAAAACATAAAACACCAAATCATTTAATATTTAATTCTGTAGAAAAAAAAGGATTTGTTAATCAGATATTAGATCAAGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAAGCTTAATAAATACATAATAATAATTTAGTATATATATATATAATTATATATTTTTTGAAATAAGGAAAGAGAG???????01020110110101100
		Syrrhopodon_involutus_Marquesas_917        ??????????????????????TGTAAAAATAATACGCCGTTTAGGAACTTTATCAGGACTAACTAATAAAATA---CCCCAGTTAAAATATAGTTCCATTACTCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAATATCGTATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGGTTAACAGAACGACAGCTATTAAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGTAAAAGGATCGACTGGGCAAGTTTTATTACAATTATTAGAAATGCGTTTAGATAATATTATTTTTCGATTAGGTCTAGCTCCTACAATTCCTGGAGCAAGGCAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATAATCATATGGTAAATATCCCAAGTTATCAGTGTAAACCTCAAGATTTTATTAATATAAAAGATCAACAAAAATACCAAACAATGATTGTTAAAAATACAAATTTTTTTTCAAAACAGAAAACACCAAATCATTTAATATTTAATTCTGTAGAAAAAAAAGGATTTGTTAATCAGATATTAGATCAAGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAGGCTTAATAAATACATAATAATAATTTAGTATATATATATATAATTATATTATTTTTGAAATAAG????????????????01011100200100011
		Syrrhopodon_involutus_Tahiti_813           ?????????????????????GTGTAAAAATAATACGCCGTTTAGGAACTTTATCAGGACTAACTAATAAAATA---CCCCAGTTAAAATATAGTTCCATTACTCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAATATCGTATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGGTTAACAGAACGACAGCTATTAAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGTAAAAGGATCGACTGGGCAAGTTTTATTACAATTATTAGAAATGCGTTTAGATAATATTATTTTTCGATTAGGTCTAGCTCCTACAATTCCTGGAGCAAGGCAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATAATCATATGGTAAATATCCCAAGTTATCAGTGTAAACCTCAAGATTTTATTAATATAAAAGATCAACAAAAATACCAAACAATGATTGTTAAAAATACAAATTTTTTTTCAAAACAGAAAACACCAAATCATTTAATATTTAATTCTGTAGAAAAAAAAGGATTTGTTAATCAGATATTAGATCAAGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAGGCTTAATAAATACATAATAATAATTT??TATATATATATATAATTATATTATTTTTGAAATAAGGAAAGAGAGGGATTC?01011100200100011
		Syrrhopodon_involutus_Moorea_458           ????CCGTTATCGAGGACCTCGTGTAAAAATAATACGCCGTTTAGGAACTTTATCAGGACTAACTAATAAAATA---CCCCAGTTAAAATATAGTTCCATTACTCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAATATCGTATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGGTTAACAGAACGACAGCTATTAAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGTAAAAGGATCGACTGGGCAAGTTTTATTACAATTATTAGAAATGCGTTTAGATAATATTATTTTTCGATTAGGTCTAGCTCCTACAATTCCTGGAGCAAGGCAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATAATCATATGGTAAATATCCCAAGTTATCAGTGTAAACCTCAAGATTTTATTAATATAAAAGATCAACAAAAATACCAAACAATGATTGTTAAAAATACAAATTTTTTTTCAAAACAGAAAACACCAAATCATTTAATATTTAATTCTGTAGAAAAAAAAGGATTTGTTAATCAGATATTAGATCAAGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAGGCTTAATAAATACATAATAATAATTTAGTATATATATATATAATTATATTATTTTTGAAATAAGGAAAGAGAGGGATTCG01011100200100011
		Syrrhopodon_involutus_Raiatea_457          CCCCCCGTTATCGAGGACCTCGTGTAAAAATAATACGCCGTTTAGGAACTTTATCAGGACTAACTAATAAAATA---CCCCAGTTAAAATATAGTTCCATTACTCAATCAACATCTAATAAAAAAATTTCTCAATATCGTATTCGTTTAGAAGAAAAACAAAAATTACGTTTTCATTATGGGTTAACAGAACGACAGCTATTAAATTATGTACGTATTGCTAGAAAAGTAAAAGGATCGACTGGGCAAGTTTTATTACAATTATTAGAAATGCGTTTAGATAATATTATTTTTCGATTAGGTCTAGCTCCTACAATTCCTGGAGCAAGGCAATTAGTAAATCATAGACATATTTTAGTTAATAATCATATGGTAAATATCCCAAGTTATCAGTGTAAACCTCAAGATTTTATTAATATAAAAGATCAACAAAAATACCAAACAATGATTGTTAAAAATACAAATTTTTTTTCAAAACAGAAAACACCAAATCATTTAATATTTAATTCTGTAGAAAAAAAAGGATTTGTTAATCAGATATTAGATCAAGAATCAATTGGTTTAAAAATAAATGAATTATTAGTTGTAGAATATTATTCTCGTCAGGCTTAATAAATACATAATAATAATTTAGTATATATATATATAATTATATTATTTTTGAAATAAGGAAAGAGAGGGATTCG01011100200100011
	;
END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
CHARSET primer = 1 - 77 ; 
 CHARSET rps4 = 78 - 685 ; 
 CHARSET spacer = 621 - 685 ; 
 CHARSET morph = 686 - 700 ; 
 CHARSET indels = 701 - 702 ; 
 TAXSET analysisgroup = 1 - 19 21 ; 
 TAXSET outgroup = 21 ; 
 OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 END;