#NEXUS [written Mon Dec 10 16:22:09 JST 2012 by Mesquite version 2.75 (build 566) at KAGEYAMA-SHARE/133.66.202.145] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=116; TAXLABELS Phytophthora_drechsleri_CH96HE1 Phytophthora_drechsleri_CH96HE2 Phytophthora_citricola_CH97TUL2 Phytophthora_megasperma_CH95PHG7 Phytophthora_megasperma_CH04PHR12 Phytophthora_megasperma_NBRC32176 Phytophthora_megasperma_GF543 Phytophthora_megasperma_Pm_1 Phytophthora_megasperma_CH00MKR1 Phytophthora_megasperma_CH00MKR2 Phytophthora_megasperma_CH94PHR1 Phytophthora_megasperma_CH95PHG8 Phytophthora_megasperma_CH95PHR16 Phytophthora_megasperma_CH95PHR17 Phytophthora_megasperma_CH97PHR1 Phytophthora_megasperma_NBRC31624 Phytophthora_megasperma_P_B Phytophthora_megasperma_GF649 Phytophthora_megasperma_CH02PHR1 Phytophthora_megasperma_CH04PHR11 Phytophthora_megasperma_CH95PHR10 Phytophthora_megasperma_P_A Phytophthora_megasperma_GF433 Phytophthora_sp_APC001 Phytophthora_sp_GF468 Phytophthora_sp_GF534 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Phytophthora_bisheria 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Phytophthora_capsici 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Phytophthora_cinnamomi 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Phytophthora_cryptogea 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Phytophthora_drechsleri 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Phytophthora_erythroseptica 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Phytophthora_europaea 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Phytophthora_fragariae 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Phytophthora_fallax 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Phytophthora_foliorum 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Phytophthora_glovera 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Phytophthora_heveae 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Phytophthora_hedraiandra 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Phytophthora_humicola 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Phytophthora_hibernalis 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Phytophthora_idaei 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Phytophthora_ilicis 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Phytophthora_infestans 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Phytophthora_inflata 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Phytophthora_insolita 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Phytophthora_ipomoeae 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Phytophthora_inundata 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Phytophthora_kernoviae 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Phytophthora_macrochlamydospora 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Phytophthora_meadii 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Phytophthora_medicaginis 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Phytophthora_megakarya 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Phytophthora_megasperma 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Phytophthora_melonis 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Phytophthora_mirabilis 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Phytophthora_multivesiculata 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Phytophthora_nemorosa 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Phytophthora_nicotianae 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Phytophthora_niederhauserii 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Phytophthora_palmivora 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Phytophthora_pistaciae 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Phytophthora_porri 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Phytophthora_primulae 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Phytophthora_pseudosyringae 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Phytophthora_pseudotsugae 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Phytophthora_quininea 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Phytophthora_ramorum 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Phytophthora_rubi 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Phytophthora_sansomeana 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Phytophthora_sinensis 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Phytophthora_tentaculata 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Phytophthora_vignae 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Phytophthora_sp_kelmania 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Halophytophthora_vesicula TAGTAACGGCGAGTGAAGCGGGATGAGCTCAAGCTTAAAATCTCCGTGCACGTTGTGCGCGGCGAATTGTAGTCTATAGATGCGTGATCAGCGCGGGCGCTCGGGGTAAGTTCCTTGGAAGAGGACAGCATGGAGGGTGATACTCCCGTTTGTACCTGAGTGTTTTGCGCGTACGGTCCGTGTTCTTTGAGTCGCGTTGTTTGGGAATGCAGCGCAAAGTAGGTGGTAAATTCCATCTAAAGCTAAATATTGGTGCGAGACCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGATGAAAAGAACTTTGAAAAGAGAGTTAAAGAGTACCTGAAACTGCTGAAAGGGAACCGAATCGTTTCCAGTGTCTATAATCTGCGGCATATTTCATGTGCGAGTGCGTGCGTTTCGGCTTTGTGGCAGTGGTTTTTGTCTGCGCGTTGCTGTTTGTGCGTGTGGTTGCGCGTGCCCTGTGCTGTGGTGGGACGTCAAGGTGAGTTCGAATGCTGCGGGAAATGGCCGTCGGGGAGGTAGGTCTTAAGCTTGCTTTTGGCTATTATATCTCGGCGGTTGAGTCGTCGCGGTTGGGACTGAGGTGCCTACAACGTGCTTTTGAGCGCGTGCGTGTCTCTGTGCTTGCGTTGTGCGGATAGCTTGCTATGCGCGTGGCGTTGCGTGCGGATGGATATGCGCTGCTGCTTGTTGCCGTTCACACAAATTCCACGTGACCGTGGGGGCTCGTCGCGATGGTTGTAGGCGTTGCCTGGCGCGTGTTTTGAACCAGACTGAGATACTGTGGGGACGAAAGTCTCTGCTTTGACTAGATAGCAACTTTCAGCAGTGGATGTCTAGGCTCGCACATCGATGAAGGACGCTGCGAACTGCGATACGTAATGCGAATTGCAGGATTCAGTGAGTCATCGAAATTTTGAACGCATATTGCACTTCCGGGTTATGCCTGGGAGTATGTCTGTATCAGTGTCCGTAAAGCACTGTTGCCTCTCTTCCTTCCGTGTAGTCGGTGGCGGGGACGGCAGACGTGAAGCGTCTTGCCAGTTTTCGGCAAGTCCTTTGAAAACTGTGTTCTCTCTGTTTGGAAACTGAATGGCGTTGTGGTGCGTGCGTGGCGGCCTGCTGGCGAGTGTTCGCGAGGGCGTGGAGAGGTTGATTCGCGGTATGTTAGGTTTCGGCCGGACAGGCTTATCGGGGGCGTTCTCTGTTCTTGCGGATCGTTGGCGGCGTGTGGTTGTGGCTTTGGCGTTTGAATTAGTGTGCGGAGCTGCGTTGTGCGGTCGAAGGGTGAGTGATTTGGGAATGTGCTTGCGCAAATCATAAAGATATTGGTACTTTATATTTAATTTTTAGTGCATTTGCTGGTATGGTTGGTACAACTTTATCTGTTTTAATTAGAATGGAATTAGCACAACCAGGTAATCAAATTTTTATGGGAAATCATCAATTATATAATGTAATTGTAACTGCACATGCTTTTGTTATGGTATTCTTTTTAGTAATGCCAGCATTAATTGGTGGTTTTGGTAATTGGTTTGTTCCTTTAATGATTGGTGCTCCTGATATGGCTTTTCCTCGTATGAATAATATTAGTTTTTGGTTATTACCTCCTTCTTTATTATTATTAGTTTCATCAGCTCTTGTAGAATCTGGTGCTGGTACAGGTTGGACTGTTTATCCACCTTTATCTAGTGTACAAGCTCACTCAGGACCTTCAGTAGATTTAGCAATTTTTAGTTTACATTTATCAGGTATTTCATCATTATTAGGTGCAATTAATTTTATTTCAACTATTTATAATATGAGAGCGCCTGGTTTAAGTTTTCATAGATTACCTTTATTTGTTTGGTCTATATTAATTACAGCTTTTCTTTTATTATTAACTTTACCTGTATTAGCTGGAGCATTAACTATGCTTTTAACTGATAGAAATTTAAATACTTCATTTTATGATCCATCAGGAGGAGGTGATCCAGTATTATATCAA ; END; BEGIN TREES; Title MP_Result; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Phytophthora_drechsleri_CH96HE1, 2 Phytophthora_drechsleri_CH96HE2, 3 Phytophthora_citricola_CH97TUL2, 4 Phytophthora_megasperma_CH95PHG7, 5 Phytophthora_megasperma_CH04PHR12, 6 Phytophthora_megasperma_NBRC32176, 7 Phytophthora_megasperma_GF543, 8 Phytophthora_megasperma_Pm_1, 9 Phytophthora_megasperma_CH00MKR1, 10 Phytophthora_megasperma_CH00MKR2, 11 Phytophthora_megasperma_CH94PHR1, 12 Phytophthora_megasperma_CH95PHG8, 13 Phytophthora_megasperma_CH95PHR16, 14 Phytophthora_megasperma_CH95PHR17, 15 Phytophthora_megasperma_CH97PHR1, 16 Phytophthora_megasperma_NBRC31624, 17 Phytophthora_megasperma_P_B, 18 Phytophthora_megasperma_GF649, 19 Phytophthora_megasperma_CH02PHR1, 20 Phytophthora_megasperma_CH04PHR11, 21 Phytophthora_megasperma_CH95PHR10, 22 Phytophthora_megasperma_P_A, 23 Phytophthora_megasperma_GF433, 24 Phytophthora_sp_APC001, 25 Phytophthora_sp_GF468, 26 Phytophthora_sp_GF534, 27 Phytophthora_sp_MAFF235784, 28 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