NEXUS
[File created by TreeBASE:  7/26/07  21:08:25]
[Matrix accession#: M2311]

BEGIN TAXA;
	TITLE M2311;
	DIMENSIONS  NTAX=14;
	TAXLABELS
		Crocidura_canariensis	Crocidura_leucodon_H13	Crocidura_russula_H8	Crocidura_russula_H7	Crocidura_russula_H6	Crocidura_russula_H1	Crocidura_russula_H4	Crocidura_russula_H5	Crocidura_russula_H3	Crocidura_russula_H2	Crocidura_russula_H10	Crocidura_russula_H9	Crocidura_russula_H12	Crocidura_russula_H11
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M2311;
	DIMENSIONS NCHAR=832;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = -  ;
	MATRIX
		Crocidura_canariensis        ATCAAACATGGATTAAAATTTTAAAACTTGGGTGATTTTGATGGGGAAATGGGAAAATGTCCCTTCAATATATTGGAGGCATTCAGGTTTTTAAAAACTAGATATATATTCATCAATTGTAGAGTACATGCTTTCTATGTTTGAGGTCCTGAATTATATCCCTGGCATCCCCTATAAAAGAAGTGATCTTGTCAGCATAAAGTAGGTATAATATGTCTAGAGAACTACAGTACAAGTTCTTCAGTTCATCTGACATTCCA------------------A-TTTGCATACAAGCTTTTTGCAGAGTTTTGTAGTTGACAACAATTGGAATTTTTAAATAAAGCAGAAATTTTGATAATGAAGCTTTATTTTTCATAATTTCCCTCCATTTTCTAAATTGATACAGCTTCAGCGGCTAGTTGATAGTTACATATTTATTGACTTTTTTTTTTTAACTGTAGAGGGTAAGGTGGTCATGCTGAGCAAAGTGTCCAGAGCAGATTCTCT-------GAGATTGGTAACGATTAATAGCAAATAACCTAACTTAAGAGTATCTACCTTCAAATGTTCAAATGACACACT--AAATATTTGAAGAAACTCAAACAGAACTTGATTTGTGATCACTCACGCTCCTTTCTTTCTCTTTCTTAGCAATAATTATTGGCCCTGATGGACATCCCTTGACTGTCTATCCTTGTATGATATGTGGGAAAAAGTTTAAGTCGAGAAGTTTTCTGAAGAGACACATGAAAAATCTTTTCCCCCTGCATCT--TTCGAAGTCAGTACCCGTCTCCTGCGTAACATTACGGCGACAACCGTCGGGGAA
		Crocidura_leucodon_H13       ATCAAACATAGATTAAAATTTTAAAACTTGGGTGATTTTGATGGGGAAATGGGAAAAGGTCCCTTCAATATATTGGAGGTATTAAGGTTTTTACAAACTAGATATATATTCATCAATTGTAGAGTACATGCTTTCTATGTTTGAGGTCCTGAGTTATATCCCTGGCATCACCTATAAAAGAAGTGATCTTGTCAGCATAAAGCAGGTATAATATGTCTAGAGAACTACAGTACAAGTTCTTCAGTTCATCTGACATTCCACCCTTACTCTTGTATGCCAATTTGCATACAAGCTTTTCACAGAGTTTTGTAGTTGACAACAATAGGAATTTTTAAATAAAGCAGAAATTTTGATAATGAAGCTTTATTTTTCATAATTTCCCTCCATTTTCTAAATTGATACAGCTTCAGCGGCTAGTTGATAGTTACATATTTATTGACTTTTTTTTTTTAACTGGAGAGGGAAAGGTGGTCATGCTGAACAAAGTGTCCAGGGCAAATTCTCTTTATGATGAGATTGGTAACAATTAATAGCAAATAACCTAACTTAAGAGTATCTACCTTCAAATGTTCAAATGATACACT--AAATTTTTGAAGAAACTCAAACAGAACTT-------GATCACTCATGCTCCTTTCTTTCTCTTTCTTAGCAATAATTATTGGCCCTGATGGACATCCCTTGACTGTCTATCCTTGTATGATCTGTGGGAAAAAGTTTAAGTCGAGAGGGAACCTGAAGAGACACATGAAAAACCAT---CCTGAACACCTTGTTAAGAAGAAGTACCGTTGTACTGACTGGGATTACACTACCAACAAGAAGCTAA
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		Crocidura_russula_H7         ATCAAACATGGATTAAAATTTTAAAACTTGGGTGATTTTGATGGGGAAATGGGAAAAAGTCCCTTCAATATATTGGAGGCATTAAGGTTTTTAAAAACTAAATACATATTCATCAATTGTAGAGTACATGCTTTCTATGTTTGAGGTCCCGAGTTATATCCCTTGCATCACCTATAAAAGAAGTGATCTTGTCAGCATAAAACAAGTAGAATATGTCTAAAGAACTACAGTACAAGTTCTTCAGTTCATCTGACATTCCAGCCTTACTCTTGTATGCCAATTTGCATACAAGCTTTTCGCAG--TTTTGTAGTTGACAACAATTGGAATTTTTAAATAAAGCAGAAATTTTGATAATGAAGCTTTATTTTTCATGATTTCCTTCCATCTTCTAAATTGATACAGCTTCAGCGGCTAGTTGATATTTATATATTTATTGACTTTTTTTTTTTAACTGTAGAGGGTAAGGTGGTCATGCTGAACAAAGTGTCCAGGGCAGATTCTCTTTATGATGAGATTGGTAACGATTAATAGCAAATAACCTAACTTAAGAGTATCTACCTTCAAATGTTCAAATGACAAACTCTAAATTTTTGAAGAAACTCAAACAGAACTTGATTT--GATCACTCATGCTCCTTTCATTCTCTTTCTTAGCAATAATTATTGGCCCTGATGGACATCCCTTGACTGTCTATCCTTGTATGATCTGTGGGAAAAAGTTTAAGTCGAGAGGTTTTCTGAAGAGACACATGAAAAACCAT---CCTGAACACCTTGTTAAGAAGAAGTACCGTTGTACTGACTGGGATTACACTACCAACAAGAAGCTAA
		Crocidura_russula_H6         ATCAAACATGGATTAAAATTTTAAAACTTGGGTGATTTTGATGGGGAAATGGGAAAAAGTCCCTTCAATATATTGGAGGCATTAAGGTTTTTAAAAACTAAATACATATTCATCAATTGTAGAGTACATGCTTTCTATGTTTGAGGTCCCGAGTTATATCCCTTGCATCACCTATAAAAGAAGTGATCTTGTCAGCATAAAACAAGTAGAATATGTCTAAAGAACTACAGTACAAGTTCTTCAGTTCATCTGACATTCCAGCCTTACTCTTGTATGCCAATTTGCATACAAGCTTTTCGCAG--TTTTGTAGTTGACAACAATTGGAATTTTTAAATAAAGCAGAAATTTTGATAATGAAGCTTTATTTTTCATGATTTCCTTCCATCTTCTAAATTGATACAGCTTCAGCGGCTAGTTGATATTTATATATTTATTGACTTTTTTTTTTTAACTGTAGAGGGTAAGGTGGTCATGCTGAGCAAAGTGTCCAGGGCAGATTCTCTTTATGATGAGATTGGTAACGATTAATAGCAAATAACCTAACTTAAGAGTATCTACCTTCAAATGTTCAAATGACAAACTCTAAATCCTTGCAGAAACTCAAACAGAACTTGATTT--GATCACTCATGCTCCTTTCATTCTCTTTCTTAGCAATAATTATTGGCCCTGATGGACATCCCTTGACTGTCTATCCTTGTATGATCTGTGGGAAAAAGTTTAAGTCGAGAGGTTTTCTGAAGAGACACATGAAAAACCAT---CCTGAACACCTTGTTAAGAAGAAGTACCGTTGTACTGACTGGGATTACACTACCAACAAGAAGCTAA
		Crocidura_russula_H1         ATCAAACATGGATTAAAATTTTAAAACTTGGGTGATTTTGATGGGGAAATGGGAAAAAGTCCCTTCAATATATTGGAGGCATTAAGGTTTTTAAAAACTAAATACATATTCATCAATTGTAGAGTACATGCTTTCTATGTTTGAGGTCCCGAGTTATATCCCTTGCATCACCTATAAAAGAAGTGATCTTGTCAGCATAAAACAAGTAGAATATGTCTAAAGAACTACAGTACAAGTTCTTCAGTTCATCTGACATTCCAGCCTTACTCTTGTATGCCAATTTGCATACAAGCTTTTCGCAG--TTTTGTAGTTGACAACAATTGGAATTTTTAAATAAAGCAGAAATTTTGATAATGAAGCTTTATTTTTCATGATTTCCTTCCATCTTCTAAATTGATACAGCTTCAGCGGCTAGTTGATATTTATATATTTATTGACTTTTTTTTTTTAACTGTAGAGGGTAAGGTGGTCATGCTGAGCAAAGTGTCCAGGGCAGATTCTCTTTATGATGAGATTGGTAACGATTAATAGCAAATAACCTAACTTAAGAGTATCTACCTTCAAATGTTCAAATGACAAACTCTAAATTTTTGAAGAAACTCAAACAGAACTTGATTT--GATCACTCATGCTCCTTTCATTCTCTTTCTTAGCAATAATTATTGGCCCTGATGGACATCCCTTGACTGTCTATCCTTGTATGATCTGTGGGAAAAAGTTTAAGTCGAGAGGTTTTCTGAAGAGACACATGAAAAACCAT---CCTGAACACCTTGTTAAGAAGAAGTACCGTTGTACTGACTGGGATTACACTACCAACAAGAAGCTAA
		Crocidura_russula_H4         ATCAAACATGGATTAAAATTTTAAAACTTGGGTGATTTTGATGGGGAAATGGGAAAAAGTCCCTTCAATATATTGGAGGCATTAAGGTTTTTAAAAACTAAATACATATTCATCAATTGTAGAGTACATGCTTTCTATGTTTGAGGTCCCGAGTTATATCCCTTGCATCACCTATAAAAGAAGTGATCTTGTCAGCATAAAACAAGTAGAATATGTCTAAAGAACTACAGTACAAGTTCTTCAGTTCATCTGACATTCCAGCCTTACTCTTGTATGCCAATTTGCATACAAGCTTTTCGCAG--TTTTGTAGTTGACAACAATTGGAATTTTTAAATAAAGCCGAAATTTTGATAATGAAGCTTTATTTTTCATGATTTCCTTCCATCTTCTAAATTGATACAGCTTCAGCGGCTAGTTGATATTTATATATTTATTGACTTTTTTTTTTTAACTGTAGAGGGTAAGGTGGTCATGCTGAGCAAAGTGTCCAGGGCAGATTCTCTTTATGATGAGATTGGTAACGATTAATAGCAAATAACCTAACTTAAGAGTATCTACCTTCAAATGTTCAAATGACAAACTCTAAATTTTTGAAGAAACTCAAACAGAACTTGATTT--GATCACTCATGCTCCTTTCATTCTCTTTCTTAGCAATAATTATTGGCCCTGATGGACATCCCTTGACTGTCTATCCTTGTATGATCTGTGGGAAAAAGTTTAAGTCGAGAGGTTTTCTGAAGAGACACATGAAAAACCAT---CCTGAACACCTTGTTAAGAAGAAGTACCGTTGTACTGACTGGGATTACACTACCAACAAGAAGCTAA
		Crocidura_russula_H5         ATCAAACATGGATTAAAATTTTAAAACTTGGGTGATTTTGATGGGGAAATGGGAAAAAGTCCCTTCAATATATTGGAGGCATTAAGGTTTTTAAAAACTAAATACATATTCATCAATTGTAGAGTACATGCTTTCTATGTTTGAGGTCCCGAGTTATATCCCTTGCATCACCTATAAAAGAAGTGATCTTGTCAGCATAAAACAAGTAGAATATGTCTAAAGAACTACAGTACAAGTTCTTCAGTTCATCTGACATTCCAGCCTTACTCTTGTATGCCAATTTGCATACAAGCTTTTCGCAG--TTTTGTAGTTGACAACAATTGGAATTTTTAAATAAAGCAGAAATTTTGATAATGAAGCTTTATTTTTCATGATTTCCTTCCATCTTCTAAATTGATACAGCTTCAGCGGCTAGTTGATATTTATATATTTAAGGACTTTTTTTTTTTAACTGTAGAGGGTAAGGTGGTCATGCTGAGCAAAGTGTCCAGGGCAGATTCTCTTTATGATGAGATTGGTAACGATTAATAGCAAATAACCTAACTTAAGAGTATCTACCTTCAAATGTTCAAATGACAAACTCTAAATTTTTGAAGAAACTCAAACAGAACTTGATTT--GATCACTCATGCTCCTTTCATTCTCTTTCTTAGCAATAATTATTGGCCCTGATGGACATCCCTTGACTGTCTATCCTTGTATGATCTGTGGGAAAAAGTTTAAGTCGAGAGGTTTTCTGAAGAGACACATGAAAAACCAT---CCTGAACACCTTGTTAAGAAGAAGTACCGTTGTACTGACTGGGATTACACTACCAACAAGAAGCTAA
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	;
END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions = 
 N: 1 - 832 ; 
 CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 
 exclude gapped ; 
 END;