NEXUS
[File created by TreeBASE:  7/26/07  21:08:46]
[Matrix accession#: M2347]

BEGIN TAXA;
	TITLE M2347;
	DIMENSIONS  NTAX=7;
	TAXLABELS
		Leptosphaeria_maculans_brassicae	Leptosphaeria_maculans_lepidii	Leptosphaeria_biglobosa_thlaspii	Leptosphaeria_biglobosa_erysimii	Leptosphaeria_biglobosa_brassicae	Leptosphaeria_biglobosa_canadensis	Leptosphaeria_biglobosa_australensis
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M2347;
	DIMENSIONS NCHAR=2618;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = -  ;
	MATRIX
		Leptosphaeria_maculans_brassicae           CACACTTTCTACAACGAGTTGCGTGTCGCCCCCGAGGAGCACCCCGTCCTCCTCACCGAGGCTCCCATCAACCCCAAGTCCAACCGTGAGAAGATGACCCAGATCGTCTTCGAGACTTTCAACGCACCCGCCTTCTACGTCTCCATCCAGGCTGTCCTGTCCCTGTACGCCTCTGGACGTACCACCGGTATCGTGCTCGACTCCGGTGACGGTGTCACCCACGTTGTCCCCATCTACGAGGGTTTCGCGCTTCCCCACGCCATTTCCCGTGTCGACATGGCTGGTCGTGATCTGACTGATTACCTCATGAAGATCCTGGCTGAGCGTGGTTACACCTTCTCCACCACGGCCGAGCGCGAAATCGTCCGTGACATCAAAGAGAAGCTCTGCTACGTTGCGCTCGACTTTGAGCAGGAGATCCAGACTGCCAGCCAGTCTTCCAGCTTGGAGAAGTCGTACGAACTTCCCGACGGACAGGTCATCACCATTGGGAACGAGCGTTTCCGTGCTCCTGAGGCTCTTTTCCAGCCTTCTGTGCTTGGTCTTGAAAGCGGTGGTATCCACGTCACCACTTTCAACTCCATCATGAAGTGCGATGTCGATGTCAGGAAAGATCTCTACGGCAACATCGTCATGGTACGTGATTGACGCACTCACAGTCATATTCCGCACTAACAAGGACATAGTCTGGTGGTACCACCATGTACCCTGGTATCTCCGACCGCATGCAGAAGGAAATCACCGCTCTTGCACCCTCATCCATGAAGGTCAAGATCATCGCTCCTCCTGAGCGCAAGTACTCCGTCTGGATCGGTGGTTCCATTCTCGCCTCGCTCTCCACCTTCCAGCAGATGTGGATCTCCAAGCAGGAGTACGATGAGAGCGGTCCTTCCATTGTTTGGGCGAAGGGTCACTACACTGAGGGTGCCGAGCTGGTTGACCAGGTCCTCGATGTCGTCCGTCGCGAGGCTGAGGGCTGTGACTGCCTCCAGGGTTTCCAGATCACTCACTCCCTCGGTGGTGGTACCGGTGCTGGTATGGGTACCCTATTGATCTCCAAGATCCGTGAGGAGTTCCCTGACCGTATGATGGCCACCTTCTCGGTCGTGCCCTCCCCCAAGGTCTCCGACACCGTTGTCGAGCCCTACAACGCCACCCTATCCGTGCACCAGCTTGTCGAGAACTCCGACGAGACCTTCTGCATTGACAACGAGGTATGTCTTGATC-------TCCACTACT-CATACGGACGGCGCCGAACTAACTCGACCTAGGCTCTCTACGATATCTGCATGAGGACCCTCAAGCTGAACAACCCTTCATACGGTGACCTGAACCACCTCGTCTCCGCCGTCATGTCGGGTGTCACCACCTGCCTGCGTTTCCCTGGTCAGCTCAACTCCGATCTCAGGAAGTTGGCTGTCAACATGGTGCCCTTCCCCCGTCTCCACTTCTTCATGGTCGGATTCGCTCCCCTTACCAGCCGCGGTGCCCACTCCTTCCGCGCCGTCACCGTTCCCGAGCTCACCCAGCAGATGTTCGACCCCAAGAACATGATGGCTGCGTCCGACTTCCGTAACGGTCGCTACCTGACCTGCTCTGCCTACTTCCGTGGTAAGGTCTCCATGAAGGAGGTCGAGGACCAGATGCGCAACGTCCAGAACAAGAACTCATCCTACTTCGTTGAGTGGATCCCCAACAACGTCCAGACCGCTCTCTGTTCCGTGCCTCCCCGTGGCCTCAAGATGTCCTCCACCTTTGTCGGTAACTCGACCTCCATTCAGGAGCTATTCAAGCGTGTTGGTGACCAGTTCACTGCCATGTTCAGGCGCAAGGCTTTCTTGCATTGGTACACTGGTGAGGGTTGCTGGATCATCTTCAGGGATGCCATGCACAAGAAGCTCAAGTCGGAGAATCCGTCTCTCACTGTACAGCAGATATGTAAGTATTGCCTCTCTAACCTCAATTCCTCTTCATATGTCCTAACTTTTCCTAGCGACTCGTTGCTCCGAGATCTGGCACGCTTTCTCTCCCGACGAGAAGAAGGTCTGGCAGACTGCTGCCAAGAATGCGAAGGAGGAGCACTCTCGCCAGCACCCTGATTACAAGTATAGCCCTCGCAAGCCTGGTGAGAAGAAGAAGCGCCAGTCGCGCAAGGCCAAGCAATGCAAGTATGCGGCAGCTTCTACAGTCAACACCGAGTTCTTTGATGTGCAGATGACCCCAGACTCCAGTATGATGCAATCTCAGATGCCGCTGCCTGAATTGCGGCGCAACTACAGCATTCCAGCGACCACTCACCATGGCGACATGGCCCACTCTTTCGTTAATGAGACTGTTGACTTCAACGCGACTGTTGACTTCAATGGCGCTGATGACTTCAAC------------------GGCTCTGTCGACTTCAATTGCTCTGGCAACTTCAA------------------TGAGCCGGCCGAGTTCAACAGTAACATTCCTAAGGAGCCGTTCGCCATCAACGAATTCCACGATGCTGAAGCTCTTCGTCATGCCCTTCTTTCATATGAATTCGGAGGTGAAGTTGAAGCCGAAGCCGAAGCATTCCATCAGCTCGATGTCGCCGAAGAC
		Leptosphaeria_maculans_lepidii             CACACTTTCTACAACGAGTTGCGTGTCGCCCCCGAGGAGCACCCCGTCCTCCTCACCGAGGCTCCCATCAACCCCAAGTCCAACCGTGAGAAGATGACCCAGATCGTCTTCGAGACCTTCAACGCACCCGCCTTCTACGTCTCCATCCAGGCTGTCCTGTCCCTGTACGCCTCTGGACGTACCACCGGTATCGTGCTCGACTCCGGTGACGGTGTCACCCACGTTGTCCCCATCTACGAGGGTTTCGCGCTTCCCCACGCCATTTCCCGTGTCGACATGGCTGGTCGTGATCTGACTGATTACCTCATGAAGATCCTGGCTGAGCGTGGTTACACCTTCTCCACCACGGCCGAGCGCGAAATCGTTCGTGACATCAAGGAGAAGCTCTGCTACGTTGCGCTCGACTTTGAGCTGGAGATCCAGACTGCCAGCCAGTCTTCCAGCTTGGAGAAGTCGTACGAACTTCCCGATGGACAGGTCATCACCATTGGCAACGAGCGTCTCCGTGCTCCTGAGGCTCTTTTCCAGCCTTCTGTGCTTGGTCTTGAAAGCGGTGGTATCCACGTCACCACCTTCAACTCCATCATGAAGTGCGATGTCGATGTCAGGAAAGATCTCTACGGCAACATCGTCATGGTACGTGATTTACGCACTCACAGTCACATCCCGCACTAACAAGGATATAGTCTGGTGGTACCACGATGTACCCTGGCATCTCCGACCGCATGCAGAAGGAAATCACCGCTCTCGCACCCTCATCCATGAAGGTCAAGATCATCGCTCCTCCTGAGCGCAAGTACTCCGTCTGGATCGGTGGCTCCATTCTCGCCTCGCTCTCCACCTTCCAGCAGATGTGGATCTCCAAGCAGGAGTACGATGAGAGCGGTCCTTCCATTGTTTGGGCAAAGGGTCACTACACCGAGGGCGCCGAGCTGGTTGACCAGGTCCTCGATGTCGTCCGTCGCGAGGCTGAGGGCTGTGACTGCCTCCAGGGTTTCCAGATCACTCACTCCCTCGGTGGTGGTACCGGTGCTGGTATGGGTACCCTATTGATCTCCAAGATCCGTGAGGAGTTCCCCGACCGTATGATGGCCACCTTCTCGGTCGTGCCCTCCCCCAAGGTCTCCGACACCGTTGTCGAACCCTACAACGCCACCCTATCCGTGCACCAGCTTGTCGAGAACTCCGACGAGACCTTCTGCATTGACAACGAGGTATGTCTTGATC-------TACACTACT-CATACGGGCGGCGTCAAACTAACTCGACTTAGGCTCTCTACGATATCTGCATGAGGACCCTCAAGCTGAACAACCCTTCATACGGTGACCTGAACCACCTCGTCTCCGCCGTCATGTCGGGTGTCACCACCTGCCTGCGTTTCCCTGGTCAGCTCAACTCCGATCTCAGGAAGTTGGCTGTCAACATGGTGCCCTTCCCCCGTCTCCACTTCTTCATGGTCGGATTCGCTCCGCTTACCAGCCGCGGTGCCCACTCCTTCCGCGCGGTCACCGTTCCCGAGCTCACCCAGCAGATGTTCGACCCCAAGAACATGATGGCTGCGTCTGACTTCCGTAACGGTCGCTACCTGACCTGCTCTGCCTACTTCCGTGGTAAGGTCTCCATGAAGGAGGTCGAGGACCAGATGCGCAACGTCCAGAACAAGAACTCATCCTACTTCGTTGAGTGGATCCCCAACAACGTCCAGACCGCTCTCTGCTCCGTGCCTCCCCGTGGCCTCGAGATGTCCTCCACCTTTGTCGGTAACTCGACCTCCATTCAGGAGCTGTTCAAGCGTGTTGGTGACCAGTTCACTGCCATGTTCAGGCGCAAGGCTTTCTTGCATTGGTACACTGGTGAGGGTTGCTGGATCATCTTTAGGGATGCCATGCACAAGAAGCTCAAGTCGGAGGACCCGTCTCTCACTGTACAGCAGATATGTAAGTATTACTCTTGTCACCACAATTCATCTTCATGT-TCCTAACTTTTCCTAGCGACTCGTTGCTCCGAGATCTGGCACGCTTTCTCTCCCGACGAGAAGAGGGTTTGGCAAACTGCTGCCAAAAATGCGAAGGAGGAGCACTCTCGCCAGCACCCTGATTACAAGTATAGCCCTCGCAGGCCTGGTGAGAAGAAGAAGCGCCAGTCGCGCAAGGCCAAGCAACGCAAGCATGCGACAGCTTCTACAGTCGACACCGAGGTCTTCGATGTGCAGATGACCCCAGACACCAGTATGATG------CAGATGCAGCTGCCTGGATTGCAGCGCAACTACAGCATTCCAGCAACAACCCACCTTGGCGACATGGCCCACCCTTTTGTTAATGAGATTGCTGACTTCGATGGTGCTATTGACTTCAATGGTGCTGTTGACTTCAACAATGCTGGTGACTTCAACGGCTCTTTCGACTTCAATTGCTCTGGCAACTTCAATGAGGTTGGCGACTTCAACGAGCCGGTCGAGTTCACCAGTAACATTCCTAAGGAGCCGTTCGCCATTAACGAATTCCACGATGCTGAAGCTCCTCGTCATGCCCTTCTTTCAGATGAATTT------GAAGTCGAAGCCGAAGCCGAAGCATTCCCTCAGCTCGATGTGGCCGAAGAC
		Leptosphaeria_biglobosa_thlaspii           CACACTTTCTACAACGAGTTGCGTGTCGCCCCCGAAGAGCACCCCGTCCTGCTCACCGAGGCTCCCATCAACCCCAAGTCCAACCGTGAGAAGATGACGCAGATCGTCTTCGAGACCTTCAACGCACCAGCCTTCTACGTCTCCATCCAGGCCGTCCTGTCCCTGTACGCCTCTGGGCGTACCACCGGTATCGTGCTTGACTCCGGTGACGGTGTCACCCACGTTGTCCCCATCTACGAGGGTTTCGCGCTTCCCCATGCCATCTCTCGTGTCGACATGGCTGGTCGTGATCTCACTGATTACCTCATGAAGATCCTGGCTGAGCGTGGTTACACCTTCTCCACCACTGCCGAGCGCGAAATCGTTCGTGACATCAAGGAGAAGCTGTGCTACGTTGCGCTCGACTTCGAGCAGGAGATCCAGACTGCCAGCCAGTCCTCCAGCTTGGAGAAGTCCTACGAACTTCCCGATGGACAGGTCATCACCATTGGCAACGAGCGTTTCCGTGCTCCCGGGGCTCTTTTCCAGCCCTCCGTGCTCGGTCTTGAGAGCGGTGGTATCCATGTCACCACCTTCAACTCCATCATGAAGTGCGATGTCGACGTCAGGAAAGACCTCTACGGCAACATCGTCATGGTACGTCATGCACGCATTCACTGCCAAATATCTTGCTAACAATGACATAGTCTGGTGGTACCACCATGTACCCCGGTATCTCCGACCGCATGCAGAAGGAAATCACTGCTCTTGCGCCCTCATCCATGAAGGTCAAGATCATTGCCCCTCCTGAGCGCAAGTACTCCGTCTGGATCGGTGGTTCCATTCTGGCCTCCCTCTCCACCTTCCAGCAGATGTGGATCTCGAAGCAGGAGTACGACGAGAGTGGTCCTTCCATCGTCTGGGCGAAGGGTCACTACACTGAGGGTGCCGAGTTGGTCGACCAGGTCCTCGATGTCGTCCGCCGCGAGGCCGAGGGCTGCGACTGCCTCCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCCCTCGGTGGTGGTACGGGTGCCGGTATGGGCACCCTCCTGATCTCCAAGATCCGCGAGGAGTTCCCGGACCGCATGATGGCCACCTTCTCCGTTGTGCCATCCCCCAAGGTCTCCGACACCGTTGTCGAGCCATACAACGCCACCCTGTCCGTGCACCAGCTTGTCGAGAACTCTGACGAGACCTTCTGCATTGACAACGAGGTATGTCTTGATC-------TGTGCTTCT-CACCGGGACCGCGCCAAACTGACTCGACCTAGGCTCTGTACGATATCTGCATGAGGACCCTCAAGCTGAACAACCCTTCATATGGTGATCTGAACCACCTCGTCTCCGCTGTCATGTCGGGTGTCACCACCTGCCTGCGTTTCCCTGGTCAGCTCAACTCCGATCCCCGCAAGTTGGCTGTCAACATGGTGCCCTTCCCTCGTCTCCACTTCTTCATGGTTGGATTCGCTCCCCTCACCAGCCGTGGTGCCCACTCCTTCCGCGCAGTCACCGTTCCCGAGCTCACCCAGCAGATGTTCGACCCCAAGAACATGATGGCTGCCTCTGACTTCCGCAACGGTCGCTACCTGACCTGCTCCGCCTACTTCCGCGGTAAGGTCTCCATGAAGGAGGTCGAGGATCAGATGCGCAACGTTCAGAACAAGAACTCCTCGTACTTCGTTGAGTGGATCCCCAACAACGTCCAGACCGCTCTCTGCTCCGTGCCTCCCCGTGGCCTCAAGATGTCCTCCACCTTCGTCGGTAACTCAACCTCCATCCAGGAGCTGTTCAAGCGTGTCGGTGACCAGTTCACTGCCATGTTCAGGCGCAAGGCTTTCTTGCATTGGTACACTGGTGAGGGTTGCTGGATCATCTTCAGGGATGCCATGCAGAAGCGTCTCAAGTCTGAGGACCCGGAGATCAGCGTCCAGGAGATCTGTAAGTATTATCCTCTCTATCTCACTCCAGCTTCATGCATACTGACTTTGCCTAGCCACCCGTTGCTCCCAGCTTTGGCACGGTCTCTCTCCATCCGAGAAGACACCCTGGCAGGCAGCCGCCAAGAATGCGAAGGAAGAACACTCTCGTCAGCACCCTGACTACAAGTATAGTCCTCGCAAGCCGGGTGAGAAGAAGAAGCGCCAGTCTCGCAAGGCAGCCAAGCGT------GCAGCGGCTTCTGCAGTCGATTCCGAGGTCTTCACTCTGCCGATGACTCCCGACATCAGCATGATGCTGTCTCAGATGCCGCTTCCTGAGTTCCAGTTCAATTTCACCACTCCGGCGACCACGACCATCGGCGACATGGCGAACTCTTTCGTCAGTGAGGCTGCTTTCCACAAG------------------------------------------------------------------------------------------------------------GACCCAGCCGAGTTCATCGGTACCGTTCCACAGGACGAGTTGTCCATGGGCGATTTCTACGATGCGGAGACTCTTCGTCATGCCCGTCTTCGAGCTGAGTTC------GAGGCCGGA------ACCGACAAGGATCTTGATCTCGGTGTCAATGGAGAC
		Leptosphaeria_biglobosa_erysimii           CACACTTTCTACAACGAGTTGCGTGTCGCCCCCGAGGAGCACCCCGTCCTGCTCACCGAGGCTCCCATCAACCCCAAGTCCAACCGTGAGAAGATGACGCAGATTGTCTTCGAGACCTTCAACGCACCAGCCTTCTACGTCTCCATCCAGGCCGTTCTGTCCCTCTACGCCTCTGGACGTACCACCGGTATCGTGCTTGACTCCGGTGACGGTGTCACCCACGTTGTCCCCATCTACGAGGGTTTCGCGCTTCCCCATGCCATTTCACGTGTCGACATGGCTGGTCGTGATCTCACTGATTACCTCATGAAGATTCTGGCTGAGCGTGGTTACACCTTCTCCACCACTGCCGAGCGCGAAATTGTTCGTGACATCAAGGAGAAGTTGTGCTACGTTGCTCTCGACTTTGAGCAGGAGATCCAGACTGCCAGCCAGTCCTCCAGCTTGGAGAAGTCGTACGAACTTCCCGATGGACAGGTCATCACCATTGGCAACGAGCGTTTCCGTGCTCCTGAGGCTCTTTTCCAGCCTTCTGTGCTCGGTCTTGAGAGCGGTGGTATCCACGTCACCACTTTCAACTCCATCATGAAGTGCGATGTCGATGTCAGGAAAGACCTCTACGGCAACATCGTCATGGTACGTTCTGCACACTTTTACTGGCAAATATTTCGCTAACAAAAGTACAGTCTGGTGGTACCACCATGTACCCCGGTATCTCCGACCGCATGCAGAAGGAGATCACTGCTCTTGCACCCTCATCCATGAAGGTCAAGATCATTGCTCCCCCTGAGCGCAAGTACTCTGTCTGGATCGGTGGTTCCATCCTGGCCTCGCTCTCCACCTTCCAGCGGATGTGGATCTCGAAGCAGGAGTACGACGAGAGCGGTCCTTCCATCGTTTGGGCGAAGGGTCACTACACTGAGGGTGCCGAGCTCGTCGACCAGGTCCTCGATGTCGTCCGTCGCGAGGCCGAGGGCTGCGACTGCCTCCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCCCTCGGTGGTGGTACTGGTGCCGGTATGGGTACTCTCTTGATCTCCAAGATCCGTGAGGAGTTCCCAGACCGCATGATGGCCACCTTCTCCGTTGTGCCATCCCCCAAGGTCTCCGACACCGTTGTCGAGCCCTACAACGCCACCCTGTCGGTGCACCAGCTTGTCGAGAACTCCGACGAGACCTTCTGCATTGACAACGAGGTATGTTTTGATCCGCGCTTTTTTATATAACACAAGACTCGCGCCAAACTGACTCGACCTAGGCCCTGTACGATATCTGCATGAGGACCCTCAAGCTGAACAACCCTTCATACGGCGACTTGAACCACCTCGTCTCCGCCGTCATGTCGGGTGTCACCACCTGCCTGCGTTTCCCTGGTCAGCTCAACTCCGATCTCCGCAAGTTGGCTGTCAACATGGTGCCCTTCCCTCGTCTCCACTTCTTCATGGTTGGATTCGCGCCCCTCACCAGTCGTGGTGCCCACTCCTTCCGCGCCGTCACCGTTCCCGAGCTCACCCAGCAGATGTTCGACCCTAAGAACATGATGGCGGCCTCTGACTTCCGTAACGGTCGCTACCTGACCTGCTCCGCTTACTTCCGCGGAAAGGTCTCCATGAAGGAGGTCGAGGACCAGATGCGCAACGTTCAGAACAAGAACTCGTCGTACTTTGTTGAGTGGATCCCCAACAACGTCCAGACTGCTCTCTGCTCCGTGCCTCCTCGTGGCCTCAAGATGTCGTCTACCTTCGTCGGTAACTCGACCTCCATCCAGGAGCTGTTCAAGCGTGTCGGTGACCAGTTCACCGCCATGTTCAGGCGCAAGGCTTTCTTGCATTGGTACACTGGTGAGGGTTGCTGGATCATCTTCAGGGATGCCATGGCAAAGAAGCTCAAGTCTGAGGACGCCGACCTCTCCGTCCAGGAAATTTGTAAGTATCGCCCTCTTCGCCTCACTCCAGATTCATGTATGCTAACTTGACCTAGCCGGCCGCTGCTCCCAGGTCTGGCGTGGTCTCTCCGAGGCAGAGAAGAAGCCCTGGCAGACAGCCGCCGAGCATGCGAAGGAAGAACACTTTCGCCAGCACCCTGATTACAAGTACAGCCCTCGCAAGCCGGGCCAGAAGAAGAAGCGCCAGTCGCGCAAGGCCAAGCAA---------GCAGCGGCTTCTGCAGTCGGTACTGAGATCTTCGACATGCAGATGGCTCCAGAGACAAACATGATGGCGTCTCAGTTGCCGCTGCCT------CAGTTCGACTACACTATTCTGGCAACCACCACCCTCAGTGACATCACGGATTCTTTCGTCGGTGAGGCTGCTTACTTCAAC------------------------------------------------------------------------------------------------------------GACCCAGCGGAGTTTATCGGTGTCCTTCCACAGGAGGAACAGTCCACCGACGATTTTCACGATGCAGAGGCTGTTCGTCATGGCCGCCTTGAAGAGGAGTTC------GAAGCCGAGACCGAGACCGGCAATACTCTTCATCTCGACATAATCAACACA
		Leptosphaeria_biglobosa_brassicae          CACACTTTCTACAACGAGTTGCGTGTCGCCCCCGAGGAGCACCCCGTCCTGCTCACCGAGGCTCCCATCAACCCCAAGTCCAACCGTGAGAAGATGACCCAGATCGTCTTCGAGACCTTCAACGCACCAGCCTTCTACGTCTCCATCCAGGCCGTCCTGTCCCTGTACGCTTCTGGACGTACCACCGGTATCGTGCTTGACTCCGGTGACGGTGTCACCCACGTTGTCCCCATTTACGAGGGTTTCGCGCTTCCCCATGCCATCTCTCGTGTCGACATGGCTGGTCGTGATCTCACTGATTACCTCATGAAGATTCTGGCTGAGCGTGGATACACCTTCTCCACCACTGCCGAGCGCGAAATCGTTCGTGACATCAAGGAGAAACTGTGCTACGTTGCTCTCGACTTTGAGCAGGAGATCCAGACTGCCAGCCAGTCCTCCAGCTTGGAGAAGTCCTACGAACTTCCCGATGGACAGGTCATCACCATTGGCAACGAGCGTTTCCGTGCTCCTGAGGCTCTTTTCCAGCCTTCCGTGCTCGGTCTTGAGAGCGGTGGCATCCACGTCACCACCTTCAACTCCATCATGAAGTGCGATGTCGATGTCAGGAAAGACCTCTACGGCAACATCGTCATGGTACGTTCTGCACGCATTCACTGACAATTTTTTCGCTGACAAAGACACAGTCTGGTGGTACCACCATGTACCCCGGTATCTCCGACCGCATGCAGAAGGAAATCACTGCTCTTGCACCCTCATCCATGAAGGTCAAGATCATTGCTCCTCCTGAGCGCAAGTACTCTGTCTGGATCGGTGGTTCCATTCTGGCCTCGCTCTCCACCTTCCAGCAGATGTGGATCTCGAAGCAGGAGTACGACGAGAGCGGTCCCTCCATCGTCTGGGCGAAGGGTCACTACACTGAGGGTGCCGAGCTCGTCGACCAGGTCCTCGATGTCGTCCGTCGCGAGGCCGAGGGCTGCGACTGCCTCCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCCCTCGGTGGTGGTACTGGTGCTGGTATGGGTACCCTCTTGATCTCCAAGATCCGTGAGGAGTTCCCAGACCGCATGATGGCCACCTTCTCCGTTGTGCCATCGCCCAAGGTCTCCGACACGGTTGTCGAGCCCTACAACGCCACCCTGTCGGTGCACCAGCTTGTCGAGAACTCCGACGAGACCTTCTGCATTGACAACGAGGTATGTCTTGATCCTGCGCATCCTTTGTTACCCAAGAAACGCGCCAAACTGACTTGACCTAGGCCCTGTACGATATCTGCATGAGGACCCTGAAGCTGAACAACCCTTCATATGGCGATTTGAACCACCTCGTCTCCGCCGTCATGTCGGGTGTCACCACCTGCCTGCGTTTCCCTGGTCAGCTCAACTCCGATCTCCGCAAGTTGGCTGTCAACATGGTGCCCTTCCCCCGTCTCCACTTCTTCATGGTTGGATTCGCTCCCCTCACCAGCCGTGGTGCCCACTCCTTCCGCGCCGTCACCGTTCCCGAGCTCACCCAGCAGATGTTCGACCCCAAGAACATGATGGCGGCCTCTGACTTCCGTAACGGTCGCTACCTGACCTGCTCCGCTTACTTCCGCGGAAAGGTCTCCATGAAGGAGGTTGAGGACCAGATGCGCAACGTTCAGAACAAGAACTCGGCGTACTTTGTTGAGTGGATCCCCAACAACGTCCAGACTGCTCTCTGCTCCGTGCCTCCTCGTGGCCTGAAGATGTCGTCTACCTTCGTCGGTAACTCGACCTCCATCCAGGAGCTGTTCAAGCGTGTCGGTGACCAGTTCACTGCCATGTTCAGGCGCAAGGCTTTCTTGCATTGGTACACTGGTGAGGGTTGCTGGATCATCTTCAGGGATGCCATGCACAAGAAGCTCAAATCTGAGAACTCCGACCTTACCGTCCAGGACATTTGTAAGTATAGCCCTCTTCGCGTCACTCTAGCTTCATGTATGCTAACTTTGCCTAGCCAGTCGCTGCTCCCAGCTCTGGCGTAGTCTCTCCGAGTCAGAGAAGAAGCCCTGGCAGACAGCCGCTGAGAATGCGAAGGAGGAACACTCTCGCCAGCACCCCGATTACAAGTACAGCCCTCGCAAGCCGGGCCAGAAGAAGAAGCGCCAGTCACGCAAGGCCAAGCAA---------GCAGCGGCTTCTGCAGCTCGTAATGAGATGTTCAACATGCAGATGGCTCCAGAGACAAATATGATGGCGTCTCAGATGCAGCTGCCT------CAGTTTGATTACACTATTCCGGCAACCACCACCCTTGGTGACATCGCGAACTCTTTCGTCGGTGAGACTGCTTACTTCAAC------------------------------------------------------------------------------------------------------------GACCCATCGGAGTTCATCGGTGTCCTTCCACAGGAGGAGCAGTCCACGGACGCTTTTCACGATGCAGAGGCTCTTCGTCATGCCCGCCTTGAAGAGGAGTTC------GAAGCCGGAATCGACATTGGCAATACTCTTCATCTCGACGTAATCAATGGA
		Leptosphaeria_biglobosa_canadensis         CACACTTTCTACAACGAGTTGCGTGTCGCCCCCGAGGAGCACCCCGTCCTGCTCACCGAGGCTCCCATCAACCCCAAGTCCAACCGTGAGAAGATGACCCAGATCGTCTTCGAGACCTTCAACGCACCAGCCTTCTACGTCTCCATCCAGGCCGTCCTGTCCCTGTACGCCTCTGGACGTACCACCGGTATCGTGCTTGACTCCGGTGACGGTGTCACCCACGTTGTCCCCATTTACGAGGGTTTCGCGCTTCCCCATGCCATCTCTCGTGTCGACATGGCTGGTCGTGATCTCACTGATTACCTCATGAAGATCCTGGCTGAGCGTGGATACACCTTCTCCACCACTGCCGAGCGCGGAATCGTTCGTGACATCAAGGAGAAGCTGTGCTACGTTGCTCTCGACTTTGAGCAGGAGATCCAGACTGCCAGCCAGTCCTCCAGCTTGGAGAAGTCCTACGAACTTCCCGATGGACAGGTCATCACCATTGGCAACGAGCGTTTCCGTGCTCCTGAGGCTCTTTTCCAGCCTTCCGTGCTCGGTCTTGAGAGCGGTGGCATCCACGTCACCACCTTCAACTCCATCATGAAGTGCGATGTCGATGTCAGGAAAGACCTCTACGGCAACATTGTCATGGTACGTTCTGCACGCATTCACTGACAAATCTCTCGCTAACAAAGACATAGTCTGGTGGTACCACCATGTACCCCGGTATCTCCGACCGCATGCAGAAGGAAATCACTGCTCTTGCACCCTCATCCATGAAGGTCAAGATCATTGCTCCTCCTGAGCGCAAGTACTCTGTCTGGATCGGTGGTTCCATTCTGGCCTCGCTCTCCACCTTCCAGCAGATGTGGATCTCGAAGCAGGAGTACGACGAGAGCGGTCCCTCCATCGTCTGGGCGAAGGGTCACTACACTGAGGGTGCCGAGCTCGTCGACCAGGTCCTCGATGTCGTCCGTCGCGAGGCCGAGGGCTGCGACTGCCTCCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCCCTCGGTGGTGGTACTGGTGCTGGTATGGGTACCCTCTTGATCTCCAAGATCCGCGAGGAGTTCCCAGACCGCATGATGGCCACCTTCTCCGTTGTGCCATCCCCCAAGGTCTCCGACACGGTTGTCGAGCCCTACAACGCCACCCTGTCGGTGCACCAGCTTGTCGAGAACTCCGACGAGACCTTCTGCATTGACAACGAGGTATGTCTTGATC-TGCGCATCCTTTATTCCCCAAGAACCGCGCCAAACTGACTCTACCTAGGCCCTGTACGATATCTGCATGAGGACCCTCAAGCTGAACAACCCTTCATATGGCGATTTGAACCACCTCGTCTCCGCCGTCATGTCGGGTGTCACCACCTGCCTGCGTTTCCCTGGTCAGCTCAACTCCGATCTCCGCAAGTTGGCTGTCAACATGGTGCCCTTCCCCCGTCTCCACTTCTTCATGGTTGGATTCGCTCCCCTCACCAGCCGTGGTGCCCACTCCTTCCGCGCCGTCACCGTTCCCGAGCTCACCCAGCAGATGTTCGACCCCAAGAACATGATGGCGGCCTCTGACTTCCGTAACGGTCGCTACCTGACCTGCTCTGCTTACTTCCGCGGAAAGGTCTCCATGAAGGAGGTCGAGGACCAGATGCGCAACGTTCAGAACAAGAACTCGTCGTACTTTGTTGAGTGGATCCCCAACAACGTCCAGACTGCTCTCTGCTCCGTGCCTCCTCGTGGCCTCAAGATGTCGTCTACCTTCGTCGGTAACTCGACCTCCATCCAGGAGCTGTTCAAGCGTGTCGGTGACCAGTTCACTGCCATGTTCAGGCGCAAGGCTTTCTTGCATTGGTACACTGGTGAGGGCTGCTGGATCATCTTCAGGGACGCCATGCACAAGAAGCTCAAATCTGAGGACTCCGACCTCACCGTCCAGGACATTTGTAAGTATCACCCTCTTCGCCCCACTCCAGCTTCATGTATGCTAACTTTGCCTAGCCAGCCGCTGCTCCCAGCTCTGGCGTAGTCTCTCCGAGTCGGAGAAGAAGCCCTGGCAGACAGCAGCCGAGAATGCGAAGGAGGAACACTCTCGCCAGCACCCCGATTACAAGTACAGCCCTCGCAAGCCAGGCCAGAAGAAGAAGCGCCAGTCGCGCAAGGCCAAGCAA---------GCAGCGGCTTCTGCAGCCCGTACCGAGATCTTCAACATGCAGATGGCTCCAGAGACAAACATGATGGCGTCTCAGATGCAGCTGCCT------CAGTTTGATTACACTATTCCGGCAACCACCACCCTTGGTGACATCGCGGACTCTTTCGTCGGTGAGGCTGCTTTTTTCAAC------------------------------------------------------------------------------------------------------------GACCCAGCGGAGTTCATCGGTGTCCTTCCACAGGAGGAGCAGTCCATGGATGCTTTTCACGATGCAGAGGCTCTTCGTCATGCCCGCCTTGAAGAGGAGTTC------GAAGCCGGAATCGAGACCGGCAATACTCTTCATCTCGACGTAATCAATGGA
		Leptosphaeria_biglobosa_australensis       CACACTTTCTACAACGAGTTGCGTGTCGCCCCCGAGGAGCACCCCGTCCTGCTCACCGAGGCTCCCATCAACCCCAAGTCCAACCGTGAGAAGATGACCCAGATTGTCTTCGAGACCTTCAACGCACCAGCCTTCTACGTCTCCATCCAGGCCGTCCTGTCCCTCTACGCCTCTGGACGTACCACCGGTATCGTGCTTGACTCCGGTGACGGTGTCACCCACGTTGTCCCCATCTACGAGGGTTTCGCGCTTCCCCATGCCATCTCTCGTGTCGACATGGCTGGTCGTGATCTCACTGATTACCTCATGAAGATCCTGGCTGAGCGTGGTTACACCTTCTCCACCACTGCCGAGCGCGAAATCGTTCGTGACATCAAGGAGAAGCTGTGCTACGTTGCTCTCGACTTTGAGCAGGAGATCCAGACTGCCAGCCAGTCCTCCAGCTTGGAGAAGTCCTACGAACTTCCCGATGGACAGGTCATCACCATTGGCAACGAGCGTTTCCGTGCTCCTGAGGCTCTTTTCCAGCCTTCTGTGCTCGGTCTTGAGAGCGGTGGTATCCACGTCACCACTTTCAACTCCATCATGAAGTGCGATGTCGATGTCAGGAAAGACCTATACGGCAACATCGTCATGGTACGTTCTGCACGCATTCACTGGCAAATTTTTCGCTGACAAAATGACAGTCTGGTGGTACCACCATGTACCCCGGTATCTCCGACCGCATGCAGAAGGAGATCACTGCTCTTGCACCCTCATCCATGAAGGTCAAGATCATTGCTCCCCCTGAGCGCAAGTACTCTGTCTGGATCGGTGGTTCCATCTTGGCCTCGCTCTCCACCTTCCAGCAGATGTGGATCTCGAAGCAGGAGTACGACGAGAGCGGTCCTTCCATCGTTTGGGCGAAGGGTCACTACACTGAGGGTGCCGAGCTCGTCGACCAGGTCCTCGATGTCGTCCGTCGCGAGGCCGAGGGCTGCGACTGCCTCCAGGGTTTCCAGATCACCCACTCCCTCGGTGGTGGTACTGGTGCTGGTATGGGTACCCTCTTGATCTCCAAGATCCGTGAGGAGTTCCCAGACCGCATGATGGCCACCTTCTCCGTTGTGCCATCCCCCAAGGTCTCTGACACGGTTGTCGAGCCCTACAACGCCACCCTGTCGGTGCACCAGCTTGTCGAGAACTCCGACGAGACATTCTGCATTGACAACGAGGTATGTCTTGATCTGCGCCTATTTATATGACTCAAGAATCGCGCCAAACTGACTTGACCTAGGCCCTGTACGATATCTGCATGAGGACCCTCAAGCTGAACAACCCTTCATATGGCGACTTGAACCACCTCGTCTCCGCCGTCATGTCGGGTGTCACCACCTGTCTGCGTTTCCCTGGTCAGCTCAACTCCGATCTCCGCAAGTTGGCTGTCAACATGGTGCCTTTCCCTCGTCTCCACTTCTTCATGGTTGGATTCGCTCCCCTCACCAGCCGTGGTGCCCACTCCTTCCGCGCCGTCACCGTTCCCGAGCTCACCCAGCAGATGTTCGACCCCAAGAACATGATGGCGGCCTCTGACTTCCGTAACGGTCGCTACCTGACCTGCTCCGCTTACTTCCGCGGAAAGGTCTCCATGAAGGAGGTCGAGGACCAGATGCGCAACGTTCAGAACAAGAACTCGTCGTACTTCGTTGAGTGGATCCCCAACAACGTCCAGACTGCTCTCTGCTCCGTGCCTCCTCGTGGCCTCAAGATGTCGTCTACCTTCGTTGGTAACTCGACCTCCATCCAGGAGCTGTTCAAGCGTGTCGGTGACCAGTTCACTGCCATGTTCAGGCGCAAGGCTTTCTTGCATTGGTACACTGGTGAGGGTTGCTGGATCATTTTCATGGATGCCATGCACAAGAAACTCAAGTCTGAGAACCCCGACCTCACCGTCCAGGACATTTGTAAGTATCGCCCTCTTCGCCTCACTCCAGATTCATGTATGCTAACTTTGCCTAGCCAGCCGCTGCTCCCAGGTCTGGCGTAGTCTCTCCGAGTCAGAGAAGAAGCCCTGGCAGACAGCCGCGGAGAATGCGAAGGAGGAACACTCTCGCCAGCACCCCGATTACAAGTACAGCCCTCGCAAGCCGGGCCAGAAGAAGAAGCGCCAGTCGCGCAAGGCCAAGCAA---------GCAGCGGCTTCTGCAGTCGGTACTGAGATCTTCAACATGCCGATGGCTCCAGAGACAAACATGATGGCGTCTCAGTTGCCGCTGCCT------CAGTTCGACTACACTATTCCTGCAACCACCACCCTCGGTGACATCACGGACTCTTTCGTCGGTGAGGCTGCTTACTTCAAC------------------------------------------------------------------------------------------------------------GACCCAGCGGAGTTTATCGGTGTCCTTCCAGAGGAGGAACAGTCCACGGACGCTTTTCACGATGCAGAGGCTCTTCGTCATGCCCGCCTTGCAGAGGAGTTC------GAAGCTGAGACCGACACCGGCAATACTCTTCATCTCGACTTGATCAATACG
	;
END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions = 
 N: 1 - 2618 ; 
 CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
CHARSET ACT = 1 - 899 ; 
 CHARSET BTUB = 900 - 1867 ; 
 CHARSET MAT = 1868 - 2618 ; 
 CHARSET Exon_ACT = 1 - 636 687 - 899 ; 
 CHARSET Exon_BTUB = 900 - 1214 1277 - 1867 ; 
 CHARSET Exon_MAT = 1868 - 1943 1999 - 2618 ; 
 CHARSET Exon_COMBI = 1 - 636 687 - 1214 1277 - 1943 1999 - 2618 ; 
 CHARSET Intron_COMBI = 637 - 686 1215 - 1276 1944 - 1998 ; 
 CHARSET 1stpos = 1 - 634 \ 3 687 - 1212 \ 3 1277 - 1943 \ 3 2001 - 2616 \ 3 ; 
 CHARSET 2ndpos = 2 - 635 \ 3 688 - 1213 \ 3 1278 - 1941 \ 3 1999 - 2617 \ 3 ; 
 CHARSET 3rdpos = 3 - 636 \ 3 689 - 1214 \ 3 1279 - 1942 \ 3 2000 - 2618 \ 3 2618 ; 
 CHARPARTITION ACT_BTUB = ACTIN: 1 - 899 , BTUB: 900 - 1867 , Default: 1868 - 2618 ; 
 CHARPARTITION BTUB_MAT = Default: 1 - 899 , BTUB: 900 - 1867 , MAT: 1868 - 2618 ; 
 CHARPARTITION COMBINED = ACTIN: 1 - 899 , BTUB: 900 - 1867 , MAT: 1868 - 2618 ; 
 OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS GAPMODE = NEWSTATE ; 
 WTSET WEIGHTED = 3: 1 - 634 \ 3 687 - 1212 \ 3 1277 - 1943 \ 3 2001 - 2616 \ 3 , 2: 2 - 635 \ 3 688 - 1213 \ 3 1278 - 1941 \ 3 1999 - 2617 \ 3 , 1: 3 - 636 \ 3 637 - 686 689 - 1214 \ 3 1215 - 1276 1279 - 1942 \ 3 1944 - 1998 2000 - 2618 \ 3 2618 ; 
 END;