#NEXUS [written Mon Aug 19 10:14:34 CST 2013 by Mesquite version 2.75 (build 564) at yunxia-PC/210.29.141.243] BEGIN TAXA; TITLE AQP3; DIMENSIONS NTAX=29; TAXLABELS Bos_taurus Callithrix_jacchus Canis_familiaris Cavia_porcellus Dasypus_novemcinctus Dipodomys_ordii Equus_caballus Erinaceus_europaeus Gorilla_gorilla Macaca_mulatta Microcebus_murinus Monodelphis_domestica Mus_musculus Myotis_lucifugus Ornithorhynchus_anatinus Oryctolagus_cuniculus Pan_troglodytes Procavia_capensis Pteropus_vampyrus Rattus_norvegicus Sus_scrofa Tupaia_belangeri Tursiops_truncatus Sousa_chinensis Mesoplodon_densirostris Balaenoptera_acutorostrata Kogia_simus Lipotes_vexillifer Neophocaena_phocaenoides ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE 'Matrix in file "AQP3.nexus"'; DIMENSIONS NCHAR=768; FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING = ?; MATRIX Bos_taurus 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Dasypus_novemcinctus, 6 Dipodomys_ordii, 7 Equus_caballus, 8 Erinaceus_europaeus, 9 Gorilla_gorilla, 10 Macaca_mulatta, 11 Microcebus_murinus, 12 Monodelphis_domestica, 13 Mus_musculus, 14 Myotis_lucifugus, 15 Ornithorhynchus_anatinus, 16 Oryctolagus_cuniculus, 17 Pan_troglodytes, 18 Procavia_capensis, 19 Pteropus_vampyrus, 20 Rattus_norvegicus, 21 Sus_scrofa, 22 Tupaia_belangeri, 23 Tursiops_truncatus, 24 Sousa_chinensis, 25 Mesoplodon_densirostris, 26 Balaenoptera_acutorostrata, 27 Kogia_simus, 28 Lipotes_vexillifer, 29 Neophocaena_phocaenoides; TREE AQP3_tree = (12,15,((8,((3,(7,(21,(1,(26,(27,(25,(28,(29,(23,24)))))))))),(14,19))),((22,(11,(2,(10,(9,17))))),(16,(4,(6,(13,20)))))),(5,18))[% ] [%unrooted = on ]; END; BEGIN CODONS; CODESET * UNTITLED = universal: 1 - 768; END; BEGIN MESQUITECHARMODELS; ProbModelSet * UNTITLED = 'Jukes-Cantor': 1 - 768; END; Begin MESQUITE; MESQUITESCRIPTVERSION 2; TITLE AUTO; tell ProjectCoordinator; timeSaved 1376878474520; getEmployee 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