NEXUS
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[Matrix accession#: M2461]

BEGIN TAXA;
	TITLE M2461;
	DIMENSIONS  NTAX=7;
	TAXLABELS
		Bunodera_sacculata	Bunodera_mediovitellata	Bunodera_luciopercae	Bunodera_inconstans	Bunodera_eucaliae	Crepidostomum_cooperi	Allocreadium_lobatum
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M2461;
	DIMENSIONS NCHAR=836;
	FORMAT SYMBOLS = " A C G T 4 5 6 7 8 9 B D E F H J K L M N P Q R 0 1 2 " MISSING = ? GAP = -  ;
	MATRIX
		Bunodera_sacculata            TT????ATTAGGCAATGTGGTGTTTAGGTCGTTCCGCAGAGACACTGCTCCACTCTAAGTCCATTAATGAGTACGGTTGTACTGACATGGCCCATGGAGGGTGAAAGGCCCGTGAGAGTGGAGTCTTGGCATGACAGTGTCTCTCTGGATTGACCTTGGAGTCGGGTTGTTTGGGAATGCAGCCCTAAGCGGTTGGTAAACTCCATCCAAGGCTAAATACAAGCACGAGTTCTATAGCGAACAAGTTCCGCTAGGGAAAGTTGAAAAGTACCTTTGAAGAGAGAGTAAGCAGTGCGTGAAACCGCTTAGAGGTAAACGGGTGGAGTTGAACTGCAATCTCTGAGAATTCAGCTGGGGAATTTTGCTTGAGCTTGGTCAA-TTGGGCAGGGCCTCGGGGTATGCTTATCTGCATGTTCTGATCTTCGGGTCGGAATGCGCGTTGCTCTTATCAAGGGCTGTGCGCCCCGGGTGTCCGGCTGGCTCATTCGCCAGTGCACTTTCTTGGAGTGATCACCACGACCGGCGCTGCTGCTGGGCTGTTATTGTTAAACCGGGTATTCATCGTCCTTGTGGCGTTGGGTGCACGACACGGCAGGTAACTGGGTT-CTTGCTTCGGCTTGTTT-CTTGGTGTATGTCGGCTTTAACGGTTCTATGCGGTGTGTCGGAGACGGCGGCTTGTGGTGTGTGCATGCGTGTCTATCTGT-TGGTGCATTCTGGTTTGGTAGCTGTGTGGTTGTTC-GACAGGCCCAGTTATGGTTGGAGTGTATCAGTGGGTGGTTGCGTGTGTGGCACTTTTCAGGGCCAATAGTCTG1111111000100000011
		Bunodera_mediovitellata       TTGGTTATTAGGCAATGTGGTGTTTAGGTTGTTCCGCAGAGACACTGCTCCTCTCTAAGTCCATCAATGAGTACGGTTGTACTGACATGGCCCAAGGAGGGTGAAAGGCCCGTAAGAGTGGAGTTGTGGCATGACAGTGTCTCTCTGGATCGACCTTGGAGTCGGGTTGTTTGGGAATGCAGCCCAAAGCGGGTGGTAAACTCCATCCAAGGCTAAATACAAGCACGAGTCCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGTAC-TTTGAAGAGAGAGTAAACAGTGCGTGAAACCGCTTAGAGGTAAACGGGTGGAGTTGAACTGCAATCTCTGAGAATTCAGCTGGGGAATTTTGCTTGAGCTTGGTCAA-TTGGGCAGGGCCTCGAGGTATGCTTATCTGCATGTTCTGATCTTCGGGTCGGGATGCGCGTTGCTCTTATCAAGGGCTGTGCGCCTCGGGTGTCATGCTGGCTCATTCGCCAGTGCACTTTCTTGGAGTGATCATCACGACCGGCGCTGCTGCTGGGCTGTTATAGTTAAACCGGGCATTCTTCGTCCTTGTGGCGTTGGGTGTACGACACGGCAGGTAACTGGGAT-CTTGCTTCGGCTTGTTT-CTTGGTGTATGTCGGCTTTAATGGTTCTATGCGGTGTGTCGGAGACGGCGGCTTGTGGTGTGTGCATGCGTGTCTATCTGT-TGGCGCATTCTAGTTTGGTAGCTGTGTGCTTGTTCAAGCAGGCCCAGTTATGGCTGGAGTGTGTCAGTGGGTGGTTGCGTGTGTGACACTTTTCAGGGCCAATAGTCTG1110110000000011011
		Bunodera_luciopercae          TTGATTATAAGGCAATGTGGTGTTTAGGTCGTTCCGTAGAGACACTGCTCCTCTCTAAGTCCATCAATGAGTACGGTTGTACTGACATGGCCCATGGAGGGTGAAAGGCCCGTAAGAGTGGAGTTTTGATATGACAGTGTCTCTCTGGATTGACCTTGGAGTCGGGTTGTTTGGGAATGCAGCCCAAAGCGGGTGGTAAACTCCATCCAAGGCTAAATACAAGCACGAGTCCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGTAC-TTTGAAGAGAGAGTAAACAGTGCGTGAAACCGCTTAGAGGTAAACGGGTGGAGTTGAACTGGAATCTCTGAGAATTCAGCTGGGGAATTTTGCTTGAGCTTGGTCAA-TTGGGCAGGGCCTCGAGGTATGCTTATCTGCATGTTCTGATCTTCGGATCGGGATGCGCGTTGCTCTTATCAAGGGCTGTGCGCCTTGGGTGTCCGGCTGGCTCATTCGCCAGTGCACTTTCTTGGAGTGATCACCACGACCGGCGCTGCTGCTGGGCTGTTATAGTTAAACCGGGCATTCTTCGTCCTTGTGGCGTTGGGTGTTCGACACGGCAGGTAACTGGGTT-CTTGCTTCGGCTTGTTT-CTTGGTGTATGCTGGCTTTAACGGTTCCATGTGGTGTGTCGGAGACGGCGGCTTGTGGTGTGTGCATGCGTGTCTATCTGT-TGGGGCATTCTAGTTTGGTAGCTGTGTGCTTGTTCAAGCAGGCCCAGTTATGGCTGGAGTGTGTCAGTGGGTGGTTGCGTGTGTGACACTTTTCAGGGCCAATAGTCTG1110011000000000011
		Bunodera_inconstans           TTGGTTATTAGGCAATGTGGTGTTTAGGTTGTACCGCAGAGACACTGCTCCTCTCTAAGTCCATCAATGAGTACGGTTGTACTGACATGGCCCATGGAGGGTGAAAGGCCCGTAAGGGAGGAGTTGTGGCATGACAGTGTCTCTCTGGAATGACCTTGGAGTCGGGTTGTTTGGGAATGCAGCCCAAAGCGGGTGGTAAACTCCATCCAAGGCTAAATACAAGCACGAGTCCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGTAC-TTTGAAGAGAGAGTAAACAGTGCGTGAAACCGCTTAGAGGTAAACGGGTGGAGTTGAACTGCAATCTCTGAGAATTCAGCTGGGGAATTTTGCTTGAGCTTGGTCAA-TTGGGCAGGGCCTCGAGGTATGCTTAACTGCATGTTCTGATCTTCGGGTCGGGATGCGCGTTGTTCTTATCAAGGACTGCGCGCCTTGGG-GTCATGCTGGCTCATTCGCCAGTGCACTTTCTTGGAGTGATCACCACGACCGGCGCTGCTGCTGGGCTGTTATAGTTAAACCGGGCATTCTTCGTCCTTGTGGCGTTGGGTGTACGACACGGCAGGTAACTGGGAT-CTTGCTTCGGCTTGTTGTCCTGGTGTATGCTGGCTTTAATGGTTCTATGCGGTGTGTCGGAGACGGCGGCTTGTGGTGTGTGCATGCGTGTCTATCTGT-TGGCGCATTCTGGTTTGGTGGCTGTGTGCTTGTTCAAGCAGGCCCAGTTATGGCCGGAGTGTGTCAGTGGGTGGTTGCGTGTGTGGCACTTTTCAGCGCCAATAGTCAG0011110000000000110
		Bunodera_eucaliae             TTGGTTATTAGGCAATGTGGTGTTTAGGTTGTACCGCAGAGACACTGCTCCTCTCTAAGTCCATCAATGAGTACGGTTGTACTGACATGGCCCATGGAGGGTGAAAGGCCCGTAAGAGTGGAGTTGTGGCATGACAGTGTCTCTCTGGAACGACCTTGGAGTCGGGTTGTTTGGGAATGCAGCCCAAAGCGGGTGGTAAACTCCATCCAAGGCTAAATACAAGCACGAGTCCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGTAC-TTTGAAGACAGAGTAAACAGTGCGTGAAACCGCTTACAGGTAAACGGGTGGAGTTGAACTGCAATCTCTGA-AATTCATCTGGGGAATTTTGCTTGAGCTTGTTCAA-TTGGGCAGGGCTC???????????????????????????????????????????????????ATTTATCAAGGATTGTGCGCCTTGGCGGTCTAGCTGGCTCATTCGCCAGTGCACTTTCTTGGAGTGATCACCACGACCGGCGCTGCTGCTGGGCTGTTATAGTTAAACCGGGCATTCTTCGTCCTCGTGGCGTTGGGTGTACGACACGGCAGGTAACTGGGATACTTGCTTCGGCTTGTTTTCTTGGTGTATGCTGGCTTTAACGGTTCTATGCGGTGTGTCGGAGACGGCGGCTTGTGGTGTGTGCATGCGTGTCTATCTGT-TGGCGCATTCTGGTTTGGTGGCTGTGTGCTTGTTCAAGCAGGCCCAGTTATGGCCGGAGTGTGTCAGTGGGTGGATGCGTGTGTGACATTTTTCAGGGCCAATAGTCTG1111110000000000115
		Crepidostomum_cooperi         TTGGTTACTAGGCAATGTGGTGTTTAGGTCGTTCCGCAGAGACACTGCTCCTCTCTAAGTCCATCAATGAGTACGGTTGTACTGACATGGCCCATGGAGGGTGAAAGGCCCGTAAGAGAGGAGTTTTGGTATGACAGTGTCTCTCTGGATTGACCTTGGAGTCGGGTTGTTTGGGAATGCAGCCCTAAGCGGGTGGTAAACTCCATCCAAGGCTAAATACAAGCACGAGTCCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGTAC-TTTGAAGAGAGAGTAAACAGTGCGTGAAACCGCTTAGAGGTAAACGGGTGGAGTTGAACTGCAATCTCTGAGAATTCAGCTGGGGAATTTTGCTTGAGCTTGGTCAAATTGGGCAGGGCCTCGGGGTATGCTCATGTGCATGTTCTGACCTTCGGGTCGGGATGCGCGTTGCTCTTATCAAGGGCTGCGCGCCCCGGGTGTCCGGCTGGCTCTGTCGCCAGTGCACTTTCTCGGAGTGATCACCACGACCGGCGCTGCTGCTTGGCTGTTTTTGTCAAACCGAACGTTCATCGTCCTTGTGGCGTTGGGTGGTCGGCACGGCAGGTAACTGGGGG-CTTGCTTCGGCTTGCTG-CTCGGTGTATGTCGGCTTTAACGGTTCTATGCGGTGTGTCGGAGACGGCGGCTAGTAGTGTGTGCGTGCGTATCTATCTGT-TGGCATATTCTGGTTTGGTGACTGTGTGCTTGTTCAAGCAGGCCCAGTTATGGCCGGGGTGTGTTAGTGGGTGGTTGCGTGTGTGGCACTTTTCAGGGCCAACAGTCTG1110000101001110112
		Allocreadium_lobatum          TTGGCCATTAGGCAATGTGGTGTTTAGGTCGTTCCGCAGAGACACTGCTCCTCTCTAAGTCCATCAATGAGTACGGTTGTACTAACATGGCCCAAGGAGGGTGAAAGGCCCGTAAGAGTGGAGTTCTGGTACGACAGTGTCTCTCTGGATTGACCTTGGAGTCGGGTTGTTTGGGAATGCAGCCCAAAGCGGGTGGTAAACTCCATCCAAGGCTAAATACTAGCACGAGTCCGATAGCGAACAAGTACCGTGAGGGAAAGTTGAAAAGTAC-TTTGAAGAGAGAGTAAACAGTGCGTGAAACCGCTTAGAGGTAAACGGGTGGAGTTGAACTGTAATCTTTGAGAATTCAGCTGGTGAATTT-GCTTGAGCTTGGTCAAAATGAGCAGGGCTCCGAGGTATGCTTACTTGCATGTCCTGGTCTTCGGATTGGGATGCGCGTTGCTCTTATCAAGGGTTGCGCGCCTCGGGTGTCCAGCTGGCTCTGTCGCCAGTGCACTTTCTCAGAGTGATCACCACGACCGGCGCTGCTGCTTTTCTGTTATAGTTAAATCGGTCATTCATCGTCCTTGTGGCGTTGGGTGGTCGACACGGCAGGTAACTGGGGG-CATTCTTCGGTTTGTTG-CCCGGTGTATGCTGGCTTTAACGGTCCTATGCAGTGTGTCGGAGACGGCGGCTTGTGGTGTGTGCGTGCGTGCCTATCTGT-TGGCATATTCTGGTTTGGTGGCTGTGTGCTTGTTCAAGCAGGCCTAGTTATAGCCGGAGTGTGTCAGTGGGTGGTTGCGTGTGTGACACTGTTCAGGGCCAATAGTCTG0000000000000000000
	;
END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
CHARSET MORFOLOGICOS = 818 - 836 ; 
 CHARSET DNA = 1 - 817 ; 
 CHARPARTITION MYPARTITIONS = DNA: 1 - 817 , MORFOLOGICOS: 818 - 836 ; 
 OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 TYPESET * stored_1 = unord: 1 - 836 ; 
 EXSET * stored_1 = ; 
 END;