NEXUS
[File created by TreeBASE:  7/26/07  21:10:07]
[Matrix accession#: M2544]

BEGIN TAXA;
	TITLE M2544;
	DIMENSIONS  NTAX=9;
	TAXLABELS
		Gyrodactylus_arcuatus	Gyrodactylus_rarus	Gyrodactylus_cf._micropsi_1	Gyrodactylus_cf._micropsi	Gyrodactylus_micropsi	Gyrodactylus_cf._micropsi_2	Gyrodactylus_cf.longidactylus	Gyrodactylus_rugiensis	Gyrodactylus_rugiensoides
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M2544;
	DIMENSIONS NCHAR=1125;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = -  ;
	MATRIX
		Gyrodactylus_arcuatus               CCGCGCAGCCATCCAGGTTGCATGTGTATCATA-TACGTGGTGCGTAAGGATCTTGCTGGTAGTCTTCGTTCA-TGAACTGGTAATGCCCATGAACGGTT-GGTCTGACTACCGGCAAGGTGCTACGGCA-ACTTAGCACTCAC-GCGGTATTACTACCCTTTGTATAT--CCAC-TGTGGTT-CC-TCGTGTTCCACGCTCGCTGGCTGGTTCGTCCTCGGACTTACCT--TCTCAACGGTTGGCGCCCCTCG----GGGAAGTAGCCTTCGATAATTATTTACCTATCGCGCAACTTAATTCTGCGTGGATTGGGAAGTTTACCATGGCTACGCGCTTAAACTGTCC----AGTTGCGGGCATACCCAGGTTCGCCTGGGGGTG-GGTGGTGGTCTAGGGTTTCAACGAACTTTACG-----TTAACCCTA-GGCTATCCCCGCCTATGTCCAATGCT--GGGGTTCTCGGCT-----TGCCTTGAACTTACAGACC-CCCCGTTTGACTCGAACATA-ACGGTCCTA-TGGGGGTGGAGTAGCTCTAGTGGTTCTTCCTTAATAACATGAGCAGTACCGTTATGTACGTTAATGACTTGCTCTACACAGGGTGTGTGGCTTAGTGTAAACTTTGTAACGCTGTACTGATGTAGAACTAGTT-GTGCATAGCTTGTTCATTTATTCAATAGTTTGGAGCAGCCGCGGTAACTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAATTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTGGGTTCTG-GTCTGGGATACCGTGGTTTATCCAGGCAGAATCTTCCAGCTGTGTCTGTGTGGTACTTCGGTACTGCATAGATAGTGCAGTTGTCTGCGC--TTGCCTCACGGCTTGCCAGCTTCGGCACTATGCACTGTTATGCCTTTAACTGGGTGTACAGTGTGGACAGCACGTTTACTTTAAACAAATTTGAGTGCAACTGTATGTGGTGGATCACTCGGCTCACGTATCGATGAAGAGTGCAGCAAACTGTGTTAACCAATGTGAAACGCAGACTGCTTCGATCATCGGTCTCTCGAACGCAAATGGCGGCTTTGGGCTTGCCCTTAGCCACGTTTGATCGAGTGTCGGC
		Gyrodactylus_rarus                  TCTTGCCACCGTTAAGGTCGGCTGTGTATCATA--CCCTGAGACGTTGGAGTGG-ACTGATAGACTTCTATTC-TGAAATGGTAATGTCCA-GAGTAGTACGGTCTGTCTATCGGTTCGGAGCTACGGCA-GCTCGACGTTTTCAGCGACATTACTACACCTTGTATTTATCCAC-CGTGGTGACTTATGAGCTCCACACTCGATGCCTGATCGGTGCTTGCGCCTTTCT--ACGTATCGGTAGGCGCCTCTCG----AGGAAGAAGCCTGCTAT-ATTATTTACCTATCGCGAAACTTAATTATTCGCGGATTGGGAAGCTTACCATGGCTACGCGTTTAAACTGTTC----AGAAGCGGGCATACTCAGGTTCTCTTGAGGGTTTGATGAAATTCTAGTACTACA-CGAACTTTACGGTTTGCTAGGGTTTCACTTTCCAATGTCTATGCGCTGGGCTCGGGGATGCTTCGGT-----ACTCTCGGGTTTGCAGACCGCCTTATCATACACGGAT-TATACGGTTTGATGAGGTGTGTAGTAGCTCTAGTGGTTCTTCCTTAATAATATGAGCAGTACTGTTATGTACGTTAATGACTTGCTCTACACAGGGTGTGTGGCTTAGTGTATACTTTGTAACGCTGTACTGTTGTAGTTTGAGTT-GTGCATAGCATGTTCATTTATTATATAGTTTGGAGCAGCCGCGGTAACTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAATTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTGGGTTCTG-GTCTGGAACAT--CGGTTTATCTAGGCCGAATCTTCCAGCTGTGTCTATGTGGTACTTCGGTATTGCGTAGATAGTGTAGTTGTCTGCGA--TTGCTTCACAGCTTTCCAGCTTCGACTCTATGCACTGTTATGCCCTTAACCGGGTGTTCAGTGTGGACAGCACGTTTACTTTGAACAAATTTGAGTGCAACTCCATGTGGTGGATCACTCGGCTCACGTATCGATGAAGAGTGCAGCAAACTGTGTTAACCAATGTGAAACGCAGACTGCTTCGATCATCGGTCTCTCGAACGCAAATGGCGGCTTTGGGCTTGCCCTTAGCCACGTTTGATCGAGTGTCGGC
		Gyrodactylus_cf._micropsi_1         TTGCTCTCCACCGTCGTTAAGATGGTTGACCCT-CAAGT-C-CCCTTTGGCGTGGACTGGTACTCTTTCCGAGCTAAAATGGTAACGACTAGCTTTGGTATGGTCTGAGTATCGGTTGGCTACGGCCACACGCATTGCGGGTTC--CGTTGTTACCTT---TTTCATTCTACTTT-TGTGGTT-CGAATGTGAACTGCTCTCTCT-GCGCCGCCTTCTTCGGATGTATGCGGTTGTGGAGGTTGGCGCCCCGTAAAAAGGGAAGAAGCCTTCTTT-ATTATTTACCTATCGCAACGCTTAATTAGTTGCGGATTGGGAAGTATACCATGACTACGCGATTTCTTGTTGCTGAAAATTGGGACTCTGGGTATTTTCGCCTGTGG-TGGTTTACCTAGAGGAGCTTTGAACGAGGAATGTGAT---CTTTTCTTGTGATGAGCTCGCCCTGATAATTAGGCA----GGTTGTGGAGCATTTATGTTCTGCATCTAAAGACCTTTTGCTCATTCACGC-TGTTGGCGGTTTGGGTGATTGTGTTGTAGTTCTAGTGGTTCTTCCTTAATTGTATGGGTAGTGTTGTTGCATAC-TTTATGGTCTGCTCTGCACAGGGTGCGTGGCTTAGTTCG--CTTTGTAACGCTGTACTGATGTAGTTTAGATTGGTGTGTGGCATACCCTTATA----AAATATTGGAGCAGCCGCGGTAACTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAATTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTGGGTTCTGTGTTTGG-AGACTGCGGTATATCTGAACCGAATCTTCCAGCTGTGTCTGCATAGGGCTTCGGCTTTGTGTGGATAGTTTCGTTGTGTGTGAGCTTCC-TCACGGGGTTCTACCTTCGTTACTATACGCTGTAATGCCTTTAATCGGGTGTTCAGTGTGGACAGCACGTTTACTTTGAACAAATTTGAGTGCAACTCCATGTGGTGGATCACTCGGCTCACGTATCGATGAAGAGTGCAGCAAACTGTGTTAACCAATGTGAAACGCAAACTGCTCCGATCATCGGTCTCTCGAACGCAAATGGCGGCTAAGGGCTTGCTCTTAGCCACGTTCGATCGAGTGTCGGC
		Gyrodactylus_cf._micropsi           TTGCTCTCCACCGTCGTTAAGATGGTTGACCCT-CAAGT-C-CCCTTTGGCGTGGACTGGTACTCTTTCCGAGCTAAAATGGTAACGACTAGCTTTGGTATGGTCTGAGTATCGGTTGGCTACGGCCACACGCATTGCGGGTTC--CGTTGTTACCTT---TTTCATTCTACTTT-TGTGGTT-CGAAAGTGAACTGCTCTCTCT-GCGCCGCCTTCTTCGGATGTATGCGGTTGTGGAGGTTGGCGCCCCGTAAAAAGGGAAGAAGCCTTCTTT-ATTATTTACCTATCGCAACGCTTAATTAGTTGCGGATTGGGAAGTATACCATGGCTACGCGATTTCTTGTTGCTGAAAATTGGGACTCTGGGTATTTTCGCCTGTGG-TGGTTTACCTAGAGGAGCTTTGAACGAGGAATGTGAT---CTTTTCTTGTGATGAGCTCGCCCTGATAATTAGGCA----GGTTGTTGAGCATTTATGTTCTGCATCTAAAGACCTTTTGCTCATTCACGC-TGTTGGCGGTTTGGGTGATTGTGTTGTAGTTCTAGTGGTTCTTCCTTAATTGTATGGGTAGTGTTGTTGCATAC-TTTATGGTCTGCTCTGCACAGGGTGCGTGGCTTAGTTCG--CTTTGTAACGCTGTACTGATGTAGTTTTGATTTGTGTGTGGCATACCCTTATA----AAATATTGGAGCAGCCGCGGTAACTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAATTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTGGGTTCTGTGTTTGG-AGACTGCGGTATATCTGAACCGAATCTTCCAGCTGTGTCTGCATAGGGCTTCGGCTTTGTGTGGATAGTTTCGTTGTGTGTGAGCTTCC-TCACGGGGTTCTACCTTCGTTACTATACGCTGTAATGCCTTTAATCGGGTGTTCAGTGTGGACAGCACGTTTACTTTGAACAAATTTGAGTGCAACTCCATGTGGTGGATCACTCGGCTCACGTATCGATGAAGAGTGCAGCAAACTGTGTTAACCAATGTGAAACGCAAACTGCTCCGATCATCGGTCTCTCGAACGCAAATGGCGGCTAAGGGCTTGCTCTTAGCCACGTTCGATCGAGTGTCGGC
		Gyrodactylus_micropsi               TTGCTCTCCACCGTCGTTAAGATGGTTGACCCT-CGAGT-C-CCCTTTGGCGTGGACTGGTACTCTTTCCGAGCTAAAATGGTAACGACTAGCTTCGGTATGGTCTGAGTATCGGTTGGCTACGGCCACACGCATTGCGGGTTC--CGTTGTTACCTT---TTTCATTCTACTTT-TGTGGTT-CGAAAGTGAACTGCTCTCTCT-GCGCCGCCTTCTTCGGATGTATGCGGTTGTGGAGGTTGGCGCCCCGTAAAAAGGGAAGAAGCCTTCTTT-ATTATTTACCTATCGCAACGCTTAATTAGTTGCGGATTGGGAAGTATACCATGACTACGCGATTTCTTGTTGCTGAAAGTTGGGGCTCTAGGTATTTTCGCCTGTGG-TGGTTTACCTAGAGGAGCTTTGAACGAGGAATGTGAT---CTTTTCTTGTGATGAGTTTGTCCTGATAATTAGGCA----GGTTGTGGAACATTTATGTTCTGCATCTAAAGACCTTTTGCTCAAACACGC-TGTTGGCGGTTTGGGTGATAGTGTTGTAGTTCTAGTGGTTCTTCCTTAATTGTATGGGTAGTGTTGTTGCATAC-TTTATGGTCTGCTCTGCACAGGGTGCGTGGCTTAGTTCG--CTTTGTAACGCTGTACTGATGTAGTTTAGATTGGTGTGTGGCATACCCTTATA----AAATATGGGAGCAGCCGCGGTAACTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAATTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTGGGTTCTGTGTTTGG-AGACTGCGGTATATCTGAACCGAATCTTCCAGCTGTGTCTGCATAGGGCTTCGGCTTTGTGTGGATAGTTTCGTTGTGTGTGAGCTTCC-TCACGGGGTTCTACCTTCGTTACTATACGCTGTAATGCCTTTAATCGGGTGTTCAGTGTGGACAGCACGTTTACTTTGAACAAATTTGAGTGCAACTCCATGTGGTGGATCACTCGGCTCACGTATCGATGAAGAGTGCAGCAAACTGTGTTAACCAATGTGAAACGCAAACTGCTCCGATCATCGGTCTCTCGAACGCAAATGGCGGCTAAGGGCTTGCTCTTAGCCACGTTCGATCGAGTGTCGGC
		Gyrodactylus_cf._micropsi_2         TTGCTCTCCACCGTTGTTAAGATGGTTGACCCTTCAAGT-C-CCCTTTGGCGTGGACTGGTACTCTTTCCGAGCTAAAATGGTAACGACTAGCTTTGGTATGGTCTGAGTATCGGTTGGCTACGGCCACACGCATTGCGGGTTC--CGTTGTTACCTT---TTTCATTCTACTTT-TGTGGTT-CGAAAGTGAACTGCTCTCTCT-GCGCCGCCTTCTTCGGATGTATGCGGTTGTGGGGGTTGGCGCCCCGTAAAAAGGGAAGAAGCCTTCTTT-ATTATTTACCTATCGCAACGCTTAATTAGTTGCGGATTGAGAAGTATACCATGACTACGAGATTTCTTGTTGCTGAAAGTTGGGACTCTGGGTATTTTCGCCTGTGG-TGGTTTGCCTGGAGGAGCTTTGGACGAGAAATGTGAT---CTTTTCTTGTGATAAGTTCTCCCTAATTATTAGGTA----GGTTGCGGAACATTTATGTCCTGCAGCTAAAGACCTTTTACTCATACACGC-TGTTGGCGGTTTGGGTGATTGTGTTGTAGTTCTAGTGGTTCTTCCTTAATTGTATGGGTAGTGTTGTTGCATAC-TTTATGGTCTGCTCTGCACAGGGTGCGTGGCTTAGTTCG--CTTTGTAACGCTGTACTGATGTAGTTTAGATTGGTGTGTAGCATACCCTTATA----AATTCTGGGAGCAGCCGCGGTAACTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAATTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTGGGTTCTGTGTTTGG-AGACTGCGGTATATCTGAACCGAATCTTCCAGCTGTGTCTGCATAGGGCTTCGGCTTTGTGTGGATAGTTTCGTTGTGTGTGAGCTTCC-TCACGGGGTTCTACCTTCGTTACTATACGCTGTAATGCCTTTAATCGGGTGTTCAGTGTGGACAGCACGTTTACTTTGAACAAATTTGAGTGCAACTCCATGTGGTGGATCACTCGGCTCACGTATCGATGAAGAGTGCAGCAAACTGTGTTAACCAATGTGAAACGCAAACTGCTCCGATCATCGGTCTCTCGAACGCAAATGGCGGCTAAGGGCTTGCTCTTAGCCACGTTCGATCGAGTGTCGGC
		Gyrodactylus_cf.longidactylus       TTACTCTCCACTGTCATTAAGATAGTTGACCC---AATTATACCCTTTGTTGTGGACTGGTACTCTTTCCGAGCTAAAATGGTAACGACTAGCTTCGGTATGGTCTGAGTATCGGTTGGCTACGGCCACACGCATTGCGG-TAC--CGTTGTTACCAAACATTTCATTCTACTTTATGTGGTT-CGATTCTGAACTACTCTCTCT-GCGCCGCCTTCTTCGGATGTATGCGGTTGTGGGGGTTGGCGCCCCGTAAAAAGGGAAGAAGCCTTCTTG-CTTATTTACCTATCGCAACGCTTAATTAGTTGCGGATTGGGAAGTATACCATGACTACGCGATTTCTTGTTGCTGAATTTTGGGACTCTAAGTATTTTCGCCTTTGG-TGGTTTTCTTAGAGGTTCTCTGAACGAGGAATGTTAT---CTTTTCTTGTGATGAGTTCGCCCTGATTATTAGGCA----GGTTGTAAATCATTTATGTTTTACTGCTAAAGACCTTTTGCTCCTACACGC-TGTTGGCGGTTTGAGTGATTGTGATGTAGTTCTAGTGGTTCTTCCTTAATTGTATGGATAGTATTGCTGCATAC-ATTATAGTCTGCTCTGCACAGGGTGCGTGGCTTAGTTCG--CTTTGTAACGCTGTACTGTTGTAGTTTAGATTTGTGTGTAGCATATCCTTATA----AAATTTGGGAGCAGCCGCGGTAACTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAATTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTGGGTTCTGTGTTTGG-AGACTGCGGTATATCTGAGCCGAATCTTCCAGCTGTGTCTGCATAGGGCTTCGGCTTTGTGTGGATAGTGGCGTTGTGTGTGGACTTCC-TCACGGGGTTCTACCTTCGTTACTATACGCTGTAATGCCTTTAACCGGGTGTTCAGTGTGGACAGCACGTTTACTTTGAACAAATTTGAGTGCAACTCCATGTGGTGGATCACTCGGCTCACGTATCGATGAAGAGTGCAGCAAACTGTGTTAACCAATGTGAAACGCAAACTGCTCCGATCATCGGTCTCTCGAACGCAAATGGCGGCTAAGGGCTTGCTCTTAGCCACGTTCGATCGAGTGTCGGC
		Gyrodactylus_rugiensis              TTGCTCTTCACTGTCATTTAGATGGTTGACCTATTAAAA---CCCTTTGATGTGAACTGGTACTCTTTCCAAGCTAAAATTGTAACGACTAGCCTTGGTATGGTCTGTGTATCGGTTGGCTACGGCCACACTCACTGCGG-TTC--CGTTGTTACTAAAA-TTTAATTCTACTTT-TGTGGTT-CGATTGCGAACTACTCTCTCT-GCTCCGCCTTCTTCGGATGTATGCGGTTGTGGAGGTTGGCGCCCCGTAAAAAGGGAAGAAGCTTTCTTT-ATTATTTACCTATCGTAACGCTTAATTAGTTGCGGATTGGGAAGCATACCATGGCTGCGAGGTTTCTTGTTGTTGAAAGTCGGGACTTTTGGTATTTTCGCCTTTGG-TGGTTTACCTTTAGTAGCTTTGATTGAGAAATGTGAT---CTTTTCTCATGATTGGTTTTCCCTGATTATTAGGCA----GGTCATTGAGCATTTATGTTTAATGATTAAAGACCTTTCGCTCATACACGC-TGTTGGCGGTTTGAGTGTTAGTGCTGTAGCTCTAGTGGTTCTTCCTTAATTGTATGGGTAGTATTGTTGCATAC-TTAATAGTCTGCTCTGCACAGGGTGCGTGGCTTAGTTCG--CTTTGTAACGCTGTACTGCTGTAGTTTAGATTAGTATGTAGCATACCCTTATA----AAAACTGGGAGCAGCCGCGGTAACTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAATTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTGGGTTCTGTGTTTGG-GTTCTGCGGTATACCTGAGCCGAATCTTCCAGCTGTGTCTGCATAGGGTTTCGGCCTTGTGTGGATAGTTTCGTTGTGCGTGGATTTCC-TCACGGGGTTCTGCCTTCGTTACTATACGCTGTAATGCCTTTATTCGGGTGTTCAGTGTGGACAGCACGTTTACTTTGAACAAATTTGAGTGCAACTCCATGTGGTGGATCACTCGGCTCACGTATCGATGAAGAGTGCAGCAAACTGTGTTAACCAATGTGAAACGCAAACTGCTCCGATCATCGGTCTCTCGAACGCAAATGGCGGCTAAGGGCTTGCTCTTAGCCACGTTCGATCGAGTGTCGGC
		Gyrodactylus_rugiensoides           TTGCTCTCCACTGTCATTTAGATGGTTGACCTATTAAAA---CCCTTTGATGTGAACTGGTACTCTTTCCAAGCTAAAATTGTAACGACTAGCTTTGGTATGGTCTGTGTATCGGTTGGCTACGGCCACACTCACTGCGG-TTC--CGTTGTTACTAAAACTTTAATTCTACTTT-TGTGGTT-CGATTGCGAACTACTCTCTCT-GCTCCGCCTTCTTCGGATGTATGCGGTTGTGGGGGTTGGCGCCCCGTAAAAAGGGAAGAAGCTTTCTTT-ATTATTTACCTATCGTAACGCTTAATTAGTTGCGGATTGGGAAGCATACCATGGCTACGAGGTTTCTTGTTGTTGAAAGTCGGGACTTTTGGTATTTTCGCCTTTGG-TGGTTTACCTTGAGTAGCTTTGATTGAGAAATGTGAT---CTTTTCTCTTGATTGGTTTTCCCTGATTATTAGGCA----GGTCATTGAGCATTTATGTTTAATGACTAAAGACCTTTCGCTCATACACGC-TGTTGGCGGTTTGAGTGTTAGTGCTGTAGTTCTAGTGGTTCTTCCTTAATTGTATGGGTAGTATTGTTGCATAC-TTAATAGTCTGCTCTGCACAGGGTGCGTGGCTTAGTTCG--CTTTGTAACGCTGTACTGCTGTAGTTTAGATTAGTATGTAGCATACCCTTATA----AAAACTGGGAGCAGCCGCGGTAACTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAATTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTGGGTTCTGTGTTTGG-GTTCTGCGGTATATCTGAGCCGAATCTTCCAGCTGTGTCTGCATAGGGTTTCGGCCTTGTGTGGATAGTTTCGTTGTGCGTGGACTTCC-TCACGGGGTTCTGCCTCCGTTACTATACGCTGTAATGCCTTTAATCGGGTGT-CAGTGTGGACAGCACGTTTACTTTGAACAAATTTGAGTGCAACTCCATGTGGTGGATCACTCGGCTCACGTATCGATGAAGAGTGCAGCAAACTGTGTTAACCAATGTGAAACGCAAACTGCTCCGATCATCGGTCTCTCGAACGCAAATGGCGGCTAAGGGCTTGCTCTTAGCCACGTTCGATCGAGTGTCGGC
	;
END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions = 
 N: 1 - 1125 ; 
 CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 END;