NEXUS
[File created by TreeBASE:  7/26/07  21:10:07]
[Matrix accession#: M2545]

BEGIN TAXA;
	TITLE M2545;
	DIMENSIONS  NTAX=14;
	TAXLABELS
		Gyrodactylus_arcuatoides	Gyrodactylus_arcuatus	Gyrodactylus_branchialis	Gyrodactylus_branchicus	Gyrodactylus_cf._longidactylus	Gyrodactylus_cf._micropsi_1	Gyrodactylus_cf._micropsi_2	Gyrodactylus_flavescensis	Gyrodactylus_gondae	Gyrodactylus_micropsi	Gyrodactylus_ostendicus	Gyrodactylus_rugiensis	Gyrodactylus_rugiensoides	Gyrodactylus_sp.
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M2545;
	DIMENSIONS NCHAR=678;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = -  ;
	MATRIX
		Gyrodactylus_arcuatoides             AGCAGCCGCGGTAACTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAATTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTGGGTTCTG-GCCTGGGATAT-CGTGGATTTATTCAGGCCGAATCTTCCAGCTGTGTCTGTGTGGTACCTCGGTACTACATAGATAGTGTCGTCGTCTGCGA--TTGCCTCACGGCTAGCCTCGACATTATGCACTGCTATGCCTTTAACTGGGTGTACAGTGTGGACAGCACGTTTACTTTGAACAAATTTGAGTGCTCAAAGCAGGCCTTCAACTGTATGTGGTGGATCACTCGGCTCACGTATCGATGAAGAGTGCAGCAAACTGTGTTAACCAATGTGAAACGCAGACTGCTTCGATCATCGGTCTCTCGAACGCAAATGGCGGCTTTGGGCTTGCCCTTAGCCACGTTTGATCGAGTGTCGGCCTTTTACCTATCGCAAAACTTAATTATTTGCGGATTGGGAAGCATACCATGGCTACGCGCTTAAACTGTCCCTTACAGACCCCCA-ACTCGTTTACGGTGCAATGGGG-GTGT-AGTAGCTCTAGTGGTTCTTCCTTAATAACATGAGCAGTACCGTTATGTACGTTAATGCTCTACACAGGGTGTGTGGCTTAGTACTTTGTAACGCTGTACTGATGTTG-TTTGCATAACTTGTTC
		Gyrodactylus_arcuatus                AGCAGCCGCGGTAACTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAATTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTGGGTTCTG-GTCTGGGATAC-CGTGGGTTTATCCAGGCCGAATCTTCCAGCTGTGTCTGTGTGGTACTTCGGTACTGCATAGATAGTGCAGTTGTCTGCGC--TTGCCTCACGGCTAGCTTCGGCACTATGCACTGTTATGCCTTTAACTGGGTGTACAGTGTGGACAGCACGTTTACTTTGAACAAATTTGAGTGCTCAAAGCAGGCCTTCAACTGTATGTGGTGGATCACTCGGCTCACGTATCGATGAAGAGTGCAGCAAACTGTGTTAACCAATGTGAAACGCAGACTGCTTCGATCATCGGTCTCTCGAACGCAAATGGCGGCTTTGGGCTTGCCCTTAGCCACGTTTGATCGAGTGTCGGCCTTTTACCTATCGCGCAACTTAATTCTGCGTGGATTGGGAAGTTTACCATGGCTACGCGCTTAAACTGTCCCTTACAGACCCCCG-ACTCGTA-ACGGTCCTATGGGG-GTGG-AGTAGCTCTAGTGGTTCTTCCTTAATAACATGAGCAGTACCGTTATGTACGTTAATGCTCTACACAGGGTGTGTGGCTTAGTACTTTGTAACGCTGTACTGATGTAG-TTTGCATAGCTTGTTC
		Gyrodactylus_branchialis             AGCAGCCGCGGTAACTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAATTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTGGGTTCTG-GCCTGGGATAT-CGTGGATTTATTCAGGCCGAATCTTCCAGCTGTGTCTGTGTGGTGCCTCGGTACTACATAGATAGTGTCGTCGTCTGCGA--TAGCCTCACGGCTAGCCTCGACACTATGCACTGCTATGCCTTTAACTGGGTGTACAGTGTGGACAGCACGTTTACTTTGAACAAATTTGAGTGCTCAAAGCAGGCCTTCAACTGTATGTGGTGGATCACTCGGCTCACGTATCGATGAAGAGTGCAGCAAACTGTGTTAACCAATGTGAAACGCAGACTGCTTCGATCATCGGTCTCTCGAACGCAAATGGCGGCTTTGGGCTTGCCCTTAGCCACGTTTGATCGAGTGTCGGCCTTTTACCTATCGCAAAACTTAATTATTTGCGGATTGGGAAGCATACCATGGCTACGCGCTTAAACTGTCCCTTACAGACCCCCA-ACTCGTTTACGGTGCAATGGGG-GTGT-AGTAGCTCTAGTGGTTCTTCCTTAATAACATGAGCAGTACCGTTATGTACGTTAATGCTCTACACAGGGTGTGTGGCTTAGTACTTTGTAACGCTGTACTGATGTTG-TTTGCATAGCTTGTTC
		Gyrodactylus_branchicus              AGCAGCCGCGGTAACTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAATTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTGGGTTCTG-GTCTGGAACAT-CTCGGGTTTATCTAGGCCGAATCTTCCAGCTGTGTCTATGTGGTACTTCGGTATTGCGTAGATAGTGTAGTTGTCTGCGA--TTGCTTCACAGCTAGCTTCGACTCTATGCACTGTTATGCCCTTAACCGGGTGTTCAGTGTGGACAGCACGTTTACTTTGAACAAATTTGAGTGCTCAAAGCAGGCCTTCAACTCCATGTGGTGGATCACTCGGCTCACGTATCGATGAAGAGTGCAGCAAACTGTGTTAACCAATGTGAAACGCAGACTGCTTCGATCATCGGTCTCTCGAACGCAAATGGCGGCTTTGGGCTTGCCCTTAGCCACGTTTGATCGAGTGTCGGCCTTTTACCTATCGCGAAACTTAATTATTCGCGGATTGGGAAGCTTACCATGACTACGCGTTTAAACTGTTCTTTGCAGACCACCATACACGTATACGGTTTGATGAGGTGTGT-AGTAGCTCTAGTGGTTCTTCCTTAATAATATGAGCAGTACTGTTATGTACGTTAATGCTCTACACAGGGTGTGTGGCTTAGTACTTTGTAACGCTGTACTGTTGTAG-TTTGCATAGCATGTTC
		Gyrodactylus_cf._longidactylus       AGCAGCCGCGGTAACTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAATTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTGGGTTCTGTGTTTGGAGACTGCTTGGGTATATCTGAGCCGAATCTTCCAGCTGTGTCTGCATAGGGCTTCGGCTTTGTGTGGATAGTGGCGTTGTGTGTGGACTTCC-TCACGGGGACCTTCGTTACTATACGCTGTAATGCCTTTAACCGGGTGTTCAGTGTGGACAGCACGTTTACTTTGAACAAATTTGAGTGCTCAAAGCAGGCCTTCAACTCCATGTGGTGGATCACTCGGCTCACGTATCGATGAAGAGTGCAGCAAACTGTGTTAACCAATGTGAAACGCAAACTGCTCCGATCATCGGTCTCTCGAACGCAAATGGCGGCTAAGGGCTTGCTCTTAGCCACGTTCGATCGAGTGTCGGCCTTTTACCTATCGCAACGCTTAATTAGTTGCGGATTGGGAAGTATACCATGACTACGCGATTT-CTTGTTGGCTAAAGACCTTTCTACACGTTGGCGGTTTGAGTGATTGTGCATGTAGTTCTAGTGGTTCTTCCTTAATTGTATGGATAGTATTGCTGCATAC-ATTATGCTCTGCACAGGGTGCGTGGCTTAGT-CTTTGTAACGCTGTACTGTTGTAGATTTGTGTAGCATATCC
		Gyrodactylus_cf._micropsi_1          AGCAGCCGCGGTAACTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAATTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTGGGTTCTGTGTTTGGAGACTGCTTGGGTATATCTGAACCGAATCTTCCAGCTGTGTCTGCATAGGGCTTCGGCTTTGTGTGGATAGTTTCGTTGTGTGTGAGCTTCC-TCACGGGGACCTTCGTTACTATACGCTGTAATGCCTTTAATCGGGTGTTCAGTGTGGACAGCACGTTTACTTTGAACAAATTTGAGTGCTCAAAGCAGGCCTTCAACTCCATGTGGTGGATCACTCGGCTCACGTATCGATGAAGAGTGCAGCAAACTGTGTTAACCAATGTGAAACGCAAACTGCTCCGATCATCGGTCTCTCGAACGCAAATGGCGGCTAAGGGCTTGCTCTTAGCCACGTTCGATCGAGTGTCGGCCTTTTACCTATCGCAACGCTTAATTAGTTGCGGATTGGGAAGTATACCATGACTACGCGATTT-CTTGTTGTCTAAAGACCTTTATTCACGTTGGCGGTTTGGGTGATTGTGT-TGTAGTTCTAGTGGTTCTTCCTTAATTGTATGGGTAGTGTTGTTGCATAC-TTTATGCTCTGCACAGGGTGCGTGGCTTAGT-CTTTGTAACGCTGTACTGATGTAGATTTGTGTGGCATACCC
		Gyrodactylus_cf._micropsi_2          AGCAGCCGCGGTAACTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAATTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTGGGTTCTGTGTTTGGAGACTGCTTGGGTATATCTGAACCGAATCTTCCAGCTGTGTCTGCATAGGGCTTCGGCTTTGTGTGGATAGTTTCGTTGTGTGTGAGCTTCC-TCACGGGGACCTTCGTTACTATACGCTGTAATGCCTTTAATCGGGTGTTCAGTGTGGACAGCACGTTTACTTTGAACAAATTTGAGTGCTCAAAGCAGGCCTTCAACTCCATGTGGTGGATCACTCGGCTCACGTATCGATGAAGAGTGCAGCAAACTGTGTTAACCAATGTGAAACGCAAACTGCTCCGATCATCGGTCTCTCGAACGCAAATGGCGGCTAAGGGCTTGCTCTTAGCCACGTTCGATCGAGTGTCGGCCTTTTACCTATCGCAACGCTTAATTAGTTGCGGATTGAGAAGTATACCATGACTACGAGATTT-CTTGTTGCCTAAAGACCTTTATACACGTTGGCGGTTTGGGTGATTGTCT-TGTAGTTCTAGTGGTTCTTCCTTAATTGTATGGGTAGTGTTGTTGCATAC-TTTCTGCTCTGCACAGGGTGCGTGGCTTAGT-CTTTGTAACGCTGTACTGATGTAGTTTTGTGTAGCATACCC
		Gyrodactylus_flavescensis            AGCAGCCGCGGTAACTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAATTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTGGGTTCTG-GCCTGGGATAT-CGTGGATTTATTCAGGCCGAATCTTCCAGCTGTGTCTGTGTGGTACCTCGGTACTACATAGATAATGTCGTCGTCTGCGA--TTGCCTCACGGCTAGCCTCGACATTATGCACTGCTATGCCTTTAACTGGGTGTACAGTGTGGACAGCACGTTTACTTTGAACAAATTTGAGTGCTCAAAGCAGGCCTTCAACTGTATGTGGTGGATCACTCGGCTCACGTATCGATGAAGAGTGCAGCAAACTGTGTTAACCAATGTGAAACGCAGACTGCTTCGATCATCGGTCTCTCGAACGCAAATGGCGGCTTTGGGCTTGCCCTTAGCCACGTTTGATCGAGTGTCGGCCTTTTACCTATCGCAAAACTTAATTATTTGCGGATTGGGAAGCATACCATGGCTACGCGCTTAAACTGTCCCTTACAGACCCCCA-ACTCGTTTACGGTGCGATGGGG-GTGT-AGTAGCTCTAGTGGTTCTTCCTTAATAACATGAGCAGTACCGTTATGTACGTTAATGCTCTACACAGGGTGTGTGGCTTAGTACTTTGTAACGCTGTACTGATGTGG-TTTGCATAGCTTGTTC
		Gyrodactylus_gondae                  AGCAGCCGCGGTAACTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAATTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTGGGTTCTG-GCCTGGGATAT-CGTGGATTTATTCAGGCCGAATCTTCCAGCTGTGTCTGTGTGGTACCTCGGTACTACATAGATAATGTCGTCGTCTGCGA--TTGCCTCACGGCTAGCCTCGACATTATGCACTGCTATGCCTTTAACTGGGTGTACAGTGTGGACAGCACGTTTACTTTGAACAAATTTGAGTGCTCAAAGCAGGCCTTCAACTGTATGTGGTGGATCACTCGGCTCACGTATCGATGAAGAGTGCAGCAAACTGTGTTAACCAATGTGAAACGCAGACTGCTTCGATCATCGGTCTCTCGAACGCAAATTGCGGCTTTGGGCTTGCCCTTAGCCACGTTTGATCGAGTGTCGGCCTTTTACCTATCGCAAAACTTAATTATTTGCGGATTGGGAAGCATACCATGGCTACGCGCTTAAACTGTCCCTTACAGACCCCCA-ACTCGTTTACGGTGCAATGGGG-GTGT-AGTAGCTCTAGTGGTTCTTCCTTAATAACATGAGCAGTACCGTTATGTACGTTAATGCTCTACACAGGGTGTGTGGCTTAGTACTTTGTAACGCTGTACTGATGTAG-TTTGCATAGCTTGTTC
		Gyrodactylus_micropsi                AGCAGCCGCGGTAACTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAATTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTGGGTTCTGTGTTTGGAGACTGCTTGGGTATATCTGAACCGAATCTTCCAGCTGTGTCTGCATAGGGCTTCGGCTTTGTGTGGATAGTTTCGTTGTGTGTGAGCTTCC-TCACGGGGACCTTCGTTACTATACGCTGTAATGCCTTTAATCGGGTGTTCAGTGTGGACAGCACGTTTACTTTGAACAAATTTGAGTGCTCAAAGCAGGCCTTCAACTCCATGTGGTGGATCACTCGGCTCACGTATCGATGAAGAGTGCAGCAAACTGTGTTAACCAATGTGAAACGCAAACTGCTCCGATCATCGGTCTCTCGAACGCAAATGGCGGCTAAGGGCTTGCTCTTAGCCACGTTCGATCGAGTGTCGGCCTTTTACCTATCGCAACGCTTAATTAGTTGCGGATTGGGAAGTATACCATGACTACGCGATTT-CTTGTTGTCTAAAGACCTTTAAACACGTTGGCGGTTTGGGTGATAGTGT-TGTAGTTCTAGTGGTTCTTCCTTAATTGTATGGGTAGTGTTGTTGCATAC-TTTATGCTCTGCACAGGGTGCGTGGCTTAGT-CTTTGTAACGCTGTACTGATGTAGATTTGTGTGGCATACCC
		Gyrodactylus_ostendicus              AGCAGCCGCGGTAACTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAATTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTGGGTTCAG-GCCTGGGATAT-CGTGGATTTATCCAGGCCGAATCTTCCAGCTGTGTCTGTGTGGTACTTCGGTACTACATAGATAATATCGTCGTCTGCGA--TTGCCTCACGGCTAGCCTCGATATTATGCACTGTTATGCCTTTAACTGGGTGTACAGTGTGGACAGCACGTTTACTTTGAACAAATTTGAGTGCTCAAAGCAGGCCTTCAACTGTATGTGGTGGATCACTCGGCTCACGTATCGATGAAGAGTGCAGCAAACTGTGTTAACCAATGTGAAACGCAGACTGCTTCGATCATCGGTCTCTCGAACGCAAATGGCGGCTTTGGGCTTGCCCTTAGCCACGTTTGATCGAGTGTCGGCCTTTTACCTATCGCAAAACTTAATTATTTGCGGATTGGGAAGCATACCATGGCTACGCGCTTAAACTGTCCCTTACAGACCCCCA-ACTCGTTTACGGTGCAATGGGG-GTGT-AGTAGCTCTAGTGGTTCTTCCTTAATAACATGAGCAGTACCGTTATGTACGTTAATGCTCTACACAGGGTGTGTGGCTTAGTACTTTGTAACGCTGTACTGATGTGG-TTTGCATAGCATGTTC
		Gyrodactylus_rugiensis               AGCAGCCGCGGTAACTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAATTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTGGGTTCTGTGTTTGGGTTCTGCTTGGGTATACCTGAGCCGAATCTTCCAGCTGTGTCTGCATAGGGTTTCGGCCTTGTGTGGATAGTTTCGTTGTGCGTGGATTTCC-TCACGGGGGCCTTCGTTACTATACGCTGTAATGCCTTTATTCGGGTGTTCAGTGTGGACAGCACGTTTACTTTGAACAAATTTGAGTGCTCAAAGCAGGCCTTCAACTCCATGTGGTGGATCACTCGGCTCACGTATCGATGAAGAGTGCAGCAAACTGTGTTAACCAATGTGAAACGCAAACTGCTCCGATCATCGGTCTCTCGAACGCAAATGGCGGCTAAGGGCTTGCTCTTAGCCACGTTCGATCGAGTGTCGGCCTTTTACCTATCGTAACGCTTAATTAGTTGCGGATTGGGAAGCATACCATGGCTGCGAGGTTT-CTTGTTGATTAAAGACCTTTATACACGTTGGCGGTTTGAGTGTTAGTGC-TGTAGCTCTAGTGGTTCTTCCTTAATTGTATGGGTAGTATTGTTGCATAC-TTAATGCTCTGCACAGGGTGCGTGGCTTAGT-CTTTGTAACGCTGTACTGCTGTAGATTTATGTAGCATACCC
		Gyrodactylus_rugiensoides            AGCAGCCGCGGTAACTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAATTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTGGGTTCTGTGTTTGGGTTCTGCTTGGGTATATCTGAGCCGAATCTTCCAGCTGTGTCTGCATAGGGTTTCGGCCTTGTGTGGATAGTTTCGTTGTGCGTGGACTTCC-TCACGGGGGCCTCCGTTACTATACGCTGTAATGCCTTTAATCGGGTGT-CAGTGTGGACAGCACGTTTACTTTGAACAAATTTGAGTGCTCAAAGCAGGCCTTCAACTCCATGTGGTGGATCACTCGGCTCACGTATCGATGAAGAGTGCAGCAAACTGTGTTAACCAATGTGAAACGCAAACTGCTCCGATCATCGGTCTCTCGAACGCAAATGGCGGCTAAGGGCTTGCTCTTAGCCACGTTCGATCGAGTGTCGGCCTTTTACCTATCGTAACGCTTAATTAGTTGCGGATTGGGAAGCATACCATGGCTACGAGGTTT-CTTGTTGACTAAAGACCTTTATACACGTTGGCGGTTTGAGTGTTAGTGC-TGTAGTTCTAGTGGTTCTTCCTTAATTGTATGGGTAGTATTGTTGCATAC-TTAATGCTCTGCACAGGGTGCGTGGCTTAGT-CTTTGTAACGCTGTACTGCTGTAGATTTATGTAGCATACCC
		Gyrodactylus_sp.                     AGCAGCCGCGGTAACTCCAGCTCCAATAGCATATATTAAAATTGCTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATCTGGGTTCTG-GCCTGGGATAT-CGTGGATTTATTCAGGCCGAATCTTCCAGCTGTGTCTGTGTGGTACCTCGGTACTACATAGATAGTGTCGTCGTCTGCGA--TTGCCTCACGGCTAGCCTCGACATTATGCACTGCTATGCCTTTAACTGGGTGTACAGTGTGGACAGCACGTTTACTTTGAACAAATTTGAGTGCTCAAAGCAGGCCTTCAACTGTATGTGGTGGATCACTCGGCTCACGTATCGATGAAGAGTGCAGCAAACTGTGTTAACCAATGTGAAACGCAGACTGCTTCGATCATCGGTCTCTCGAACGCAAATGGCGGCTTTGGGCTTGCCCTTAGCCACGTTTGATCGAGTGTCGGCCTTTTACCTATCGCAAAACTTAATTATTTGCGGATTGGGAAGCATACCATGGCTACGCGCTTAAACTGTCCCTTACAGACCCCCA-ACTCGTTTACGGTGCAATGGGG-GTGT-AGTAGCTCTACTGGTTCTTCCTTAATAACATGAGCAGTACCGTTATGTACGTTAATGCTCTACACAGGGTGTGTGGCTTAGTACTTTGTAACGCTGTACTGATGTAG-TTTGCATAGCTTGTTC
	;
END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions = 
 N: 1 - 678 ; 
 CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 END;