NEXUS
[File created by TreeBASE:  7/26/07  21:10:08]
[Matrix accession#: M2552]

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		Halimeda_lacunalis                                    AAGAATATGATAACAGGAGCAGCGCAAATGGATGGTGCTATTTTAGTAGTCTCTGGTGCTGATGGGCCAATGCCCCAAACAAAAGAACATATATTATTAGCTCAACAGGTTGGTGTGCCCGCTATTGTTGTTTTTTTAAATAAAATTGATCAGGTCGATGATCAAGACTTACTTGAACTTGTTGAACTTGAAATTCGAGAAACTTTAGATCGATATGATTTCCCTGGAGATGAGATCCCAATTATTAGTGGTTCAGCATTAGCAGCAGTGGAAGCATTAACTACAAATCCGATGATTCAAAGAGGTGAAAATGATTGGGTTGATAAGATTTACAAATTAATGGATATCATAGATGATGAAATACCTCTGCCACCTCGAAATACAGAGAAGGATTTTTTGATGGCTATTGAAAATGTTGTTTCTATTACAGGTCGGGGAACAGTTGCTACAGGTCGAGTTGAAAGAGGTCAAATAAAAGTAGGTCAAACTGTTGAAATTGTAGGCCTTAAAGAAACAAAAGCAACAACTGTTATTGGACTTGAAATGTTTCAGAAAACACTAGAAGAGAGTGTTGCTGGTGATAATGTTGGTGTTTTATTACGTGGTGTTCAGAAAAATGAAATTGAACGGGGTATGGTGTTAGCAAAACCTGGTTCTATTAAACCTCATACTCGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGKTTATCTTTAAAAAGTTTTGATGGTTGGGGTAATTACAATTTTGGTCTTGACGAACAACTCATGTTTCCAGAAATTCATTACGATCAAATACAACAGATTCGTGGAATGGATATTACAATTGTAACAACTGCTCAAACCGATCAAGAAGGATTAGCTTTATTACAAGAGTTTGGTATGCCTTTTTATGAA---------TGAATGAAT------GAT---TCTCTCTCTGATCTTTTTACACGTATCCGAAATGCACAT---------TTAGTAAGT---CATAATACGGTTCGAGTTCCGTTGACATCTATAAATAGGAGTGTTTTGGAAATTTTAGTACGTCATGGTTTTATTCAAAATTTTGAT---CAA---------ATTCAGAAT---------CGACAGTTTTTAGTTACGTTCAAATCCAAACAAACTCTCCCTTCCTTTGAGTTACAACGCCTCAGTCGACCAGGCTGTCGACTCTATGTTTCGGCACAAAACATTCCTCAAATTCGTGGACAATTGGGTATTATCTTTTTATCTACGTCTAAAGGAATTCTTAGCGATCGTGAAGCTCGCTATTTTAAACTTGGAGGGGAAATTCTTGGATATATTTCATAAATG---------------AAAAAACAA---------------------------CCAAAGGGTGTCCAACTCCCGGGTGTAGTATACCAATGTTTATCAAATGGTATGTTTGGTGAGTTTGCACCTACACGTTATTTTCGAGGTCATAAAAACACTGATAAA------AAATTCAAACGTAAAAAAAGT------CGT---------------TAA------ATGGGACAAAAAGTACATCCGTTAGGGTTTCGATTAGGTATCACACAACCTCATTTATCACAATGGTATGCTTCTAAAACAAATTATTCAAAATATGTATTGGAAGATAATTTTATAAGAACAATATTGTCAGAAAAATATAAAAGAGCAAAATTTGTAAAAATTCAAATTTCTCGTAAAATAGAAGATCACCTCGAAATAGTGATCCACGCTCAAAAACCTGATATTTTGATTGGAAAAAAAATTGACAGTCGA---------GAATCTTTAAAAATTTTTCAGAAACAAATTAAGAAATTCATTTTTCAATATCGGGGAATTGAATGGAATTCTAAACTCAAAGTTATATTATATATATTTCGATGTAAAACTAGTGCATCTTCT---ATTGCTGATTTTATTGTAGAACATTTGGAAAAACGCGTTCCATATAAAGTCGTATTTGTTTTATTAAAAAAACATTTACAAAGACAAAAACATTCAGCT------------------------------TTAGGAATGAAAATTCTCATTTCTGGC
		Halimeda_macrophysa                                   AAAAACATGATTACTGGAGCAGCTCAAATGGATGGAGCAATTTTAGTGGTTTCTGGTGCTGATGGACCAATGCCTCAAACAAAAGAACATATATTATTAGCTCAGCAAGTTGGTGTGCCAGCTATAGTTGTTTTTCTTAATAAAATTGATCAGGTTAATGATCGAGAGTTATTAGAACTTGTGGAACTTGAAATTCGGGACACTTTAGACCGATATGATTTTCCAGGGGATGAGATTCCAGTAATTAGTGGTTCAGCCTTAGCAGCAGTGGAAGCATTAACGACAAATCCAATGATTCAAAGAGGTGAAAATAAATGGGTTGATAACATTTATGAATTAATGGATATGATTGATGATGAAATACCTCTGCCACCTCGAAATACAGAGAAAGATTTTTTGATGGCAATTGAAAATGTTGTTTCGATAACAGGTCGGGGAACAGTTGCTACAGGCCGAGTTGAAAGAGGTCAAATAAAAGTAGGACAAACTGTTGAAATTGTAGGCCTGAAAGAAACAAAAGAAACAACTGTTATTGGACTTGAAATGTTTCAAAAAACATTAGAAGAAAGTGTTGCTGGTGATAATGTTGGTGTTTTATTGCGTGGTATTCAAAAACATCAAATTGAACGTGGTATGGTTTTGGCAAAACCAGGTTCAATTACACCTCATACTCGTTTTAAAGCTCAGGTCTATATTTTAAAAAAAGATGAAGGTGGACGTCATACTTCTTTTGTTGCAGGTTATAGACCACAATTTTATGTTCGAACTACAGATGTTACTGGTAAAATTGATTCTTTTCAAGGAGATGATGATAGTGTAATTCGTATGGTAATGCCAGGGGATCGAGTAAAAATTGTTGGTTTATCTTTACAAAGTTTTGATGGCAAGGGAAATTACAATTTTGGTCTTGATGAACAACTCATGTTTCCAGAAATTCATTATGATCAAATACAACAAATCCGCGGAATGGATATTACAATTGTAACAACTGCTCAAACGGATCAAGAAGGATTAACTTTATTACAACAATTTGGTATGCCTTTTTATGAATTT---ATTTGAATGAATTTATTTGATGATTCTCTCTCTGATCTTTTTACACGCATTCGAAATGCACAT---------TTAGTAGGT---CATATGACAGTTCGAGTTCCTTTTTCTTTTACTAATAAAAGTATTTTAGATATTTTAGTACGTCATGGTTTTATTCTCAATTTTGAT---CAA---------ATTCAAAAT---------CAACAGTTTTTAGTTACGTTTAAATCCAAATCTGTTATTCGA------GAATTACAACGACTCAGTCGACCAGGCTGTCGACTTTATGTTTCAGCACAGAACATTCCTCAAATTCGTGGACAATTGGGAATTCTATTTTTATCTACATCCAAAGGAATTCTTAGCGATCGTGAAGCTCGATATTTGAAGCTTGGAGGAGAAATTCTCGGATATATTTCATAGATGACTTCMCAAAAAAAAAAAAAACATGTCAAA------------------CATGCCAAAGGTGTACAACTACCCGGGATCGTTTTTCAATGTTTATCCAATGGTATGTTTGGTGAGTTTGCACCTACACGTTCTTTTCGGGGTCATAAAAACACTGATAAA------AAATTCAAACGT---------------CGT---------------TAA------ATGGGACAAAAAGTACATCCTTTGGGGTTTCGATTAGGTATTACACAACCTCATTTATCACAATGGTATGCTTCCAAAAAATACTATTCTAAATATGTCTTGGAAGATAATTTTATAAGAACTCTATTGTCAGAAAAGTATAATAGAGCACGATTTGAAAAAATACACATTTCTCGTAAAATAGAAGATCATATTGAAATAGTGATCTATGCTCAAAAACCTGATCTTCTGATTGGCAAAAAAGGT------------------GAAAATTTAGAAATTTTTCAAAAACAAATTAAAAAATCTATTTTTCAATATCGAGAAATTGAATGGAACTCAAACCTTAAAGTTATATTATATATATTTCGGTGTAAAACTAGTGCATCATCTGCTATTGCTGATTTTATTGTTGAACATCTGGAAAAACGTATTCCATATAAAGTTGTTTTTACTTTATTAAAAAAACATTTAAAAAGAAAAAAACAATCAACT------------------------------TTAGGTATGAAAATTAAAATTTCTGGC
		Halimeda_magnidisca                                   NNNNNNNNNNNNNNTGGAGCGGCTCAAATGGACGGAGCAATTTTAGTAGTTTCTGGTGCTGATGGACCAATGCCTCAAACAAAAGAACATATATTATTAGCCCAACAAGTGGGTGTGCCTGCTATAGTAGTTTTTCTGAATAAAATAGATCAAGTTGATGATAAAGAATTATTAGAACTTGTGGAGCTTGAAATCCGAGAAAATTTAGATAAATATGATTTTCCAGGAGATGAGATTTCAATAATAAGTGGTTCAGCATTAGCTGCAGTGGAAGCGTTAACAACAAATCCAATGATTCAAAGAGGTGAAAATGAATGGGTTGATAATATCTATAAATTAATGGATATTATTGATGATGAGATACCTTTGCCGCCTAGAAATACAGAGAAGGACTTTTTGATGGCAATTGAAAATGTTGTTTCGATTACAGGTCGTGGAACAGTTGCTACAGGTCGAGTTGAAAGAGGTCAAATAAAAGTAGGTCAAACTGTTGAAATTGTAGGTTTGAAAGAGACAAAAGAAACAACTGTTATTGGACTTGAAATGTTTCAAAAAACNTTAGAAGAAAGTGTTGCTGGTGATAATGTTGGTGTTTTATTGCGTGGTATTCAAAAAAATGAAATTGAACGTGGTATGGTTTTAGCAAAACCAGGTTCGATTACACCTCATACTCGTTTTAAAGCTCAAGTTTATATTTTAAAAAAAGATGAAGGTGGGCGACATACTTCTTTTGTTGCAGGTTATAGACCNCAATTTTATGTTCGAACAACAGATGTGACTGGTAAAATTGATTCTTTTCAAGGTGATGATGATAGTATGATTCGTATGGTAATGCCAGGAGATCGAGTAAAAATTGTGGGTTTATCTTTACAAAGTTTTGATGGTCGGGGAAATTACAATTTTGGTCTTGATGAACAACTCATGTTTCCAGAAATTCATTATGACCAAATACAACAAATCCGTGGAATGGATATTACAATTGTAACAACTGCTCAAACGGATCAAGAAGGATTAGCTTTATTACAAAAATTTGGTATGCCTTTTTATGAA---------TGAATGAAT------GAT---TCTCTCTCTGATCTTTTTACACGTATCCGAAACGCACAT---------TTAGTAGGT---CATCTGACAGTTCCAGTTCCTTTATCCTCTACTAATAAAAGCATTTTGGACATTTTAGTACGTCANGGTTTTATTCAACATTTTGAC---CAA---------ATTCAAAAT---------CGCCAGTTTTTAGTTACCCTAAAATCAAAATCTGTTATTCGA------GAATTACAACGACTCAGTCGACCAGGCTGCCGACTTTATGTTTCTGCACAAAACATTCCTCAAATTCGTGGACAATTGGGAATTCTCTTTTTATCCACGTCCAAAGGGATTCTAAGCGATCGTGAAGCTCGATTTTTGAAGCTTGGAGGTGAAATTCTCGGATATATTTCATAAATTTCTTCACAA------AAAAAACAA------------------------TATCCAAAAGGTGTACAATTGCCTGGGGTCGTTTACCAATGTTTATCAAATGGTATGTTTGGTGAGTTTGCACCTACACGTTATTTTCGAGGTCATAAAAACACTGATAAA------AAATTTAAACGT---------------CGT---------------TAA------ATGGGACAAAAAGTACATCCCTTGGGATTTCGATTAGGTATTACACAACCTCATTTATCACATTGGTATGCTTCCAAAAAATATTATTCAAAATATGTCTTGGAAGACCATTTTGTAAGAACTCTATTGTCAGAAAAATATAATAGAGCACGATTTGAGAAAATTCAAATTTCTCGTAAAATCGAAGATCATCTTGAAATAGTGATCTATGCTCAAAAACCTGATATTCTGATTGGTAAAAAAGGT------------------GAAAATTTAGAAATTTTTCAAAAACAAATTAAAACATTTATTTTTCAATATCGACAAATTGAATGGAACTCAAAATTGAAAGTTATATTATATATATTTCAGTGTAAAATGAGTGCGTCATCTGCTATTGCTGATTTTATTGTTGAACATCTGGAAAAACGAATTCCATATAAAGTTGTTTTTACTTTATTAAAAAAACATTTAAAAAGACAAAAACAATCAACT------------------------------TTAGGAATGAAAATTCAAATTTCTGGC
		Halimeda_taenicola                                    NNNNNCATGATCACTGGAGCGGCTCAAATGGATGGGGCAATTCTAGTAGTTTCTGGTGCTGATGGGCCAATGCCTCAAACAAAAGAACATATATTATTAGCCCAACAAGTAGGTGTGCCAGCTATAGTTGTTTTCTTGAATAAAATTGATCAGGTTGATGATCAAGATTTATTAGAACTTGTGGAACTTGAAATTCGAGAAACTTTAGACCGCTATGATTTTCCAGGAGATGAGATTCCAATAATTAGTGGTTCAGCATTAGCAGCAGTGGAAGCATTAACAACAAATCCAATGATTCAAAGAGGTGAAAATGAATGGGTTGATAACATCTATAAATTAATGGATATTATTGATGATGAAATACCTCTGCCACCTCGAAATACAGAAAAAGATTTTTTAATGGCAATTGAAAATGTTGTTTCAATAACAGGTCGAGGAACAGTTGCTACAGGCCGAGTTGAAAGAGGTCAAATAAAAGTAGGACAAACTGTTGAAATTGTAGGCCTTAAAGAAACAAAAGAAACAACTGTAATTGGACTTGAAATGTTTCAAAAAACATTAGAAGAAAGTGTTGCTGGTGATAATGTTGGTGTTTTATTACGTGGTATTCAAAAAAATCAAATTGAACGTGGTATGGTTTTGGCAAAACCAGGTTCTATTACACCTCATACTCGTTTTAAAGCTCAAGTCTATATTTTAAAAAAAGATGAAGGTGGACGTCATACTTCTTTTGTTGCAGGTTATAGACCACAATTTTATGTTCGAACAACAGATGTTACTGGTAAAATTGATTCTTTTCAAGGAGATGACGATAGTGTGATTCGTATGGTAATGCCAGGAGATCGAGTAAAAATTNNNGGTTTATCTTTACAAAGTTTTGATGGCAGGGGAAATTACAATTTTGGTCTTGATGAACAACTTATGTTTCCAGAAATTCAGTATGATCAAATACAACAAATTCGTGGAATGGATATTACAATTGTAACAACTGCTCAAACGGATCAAGAAGGACTAGCTTTATTACAAGAATTTGGTATGCCTTTTTATGAA---------TGAATGAAT------GATGATTCTCTCTCTGATCTTTTTACACGTATTCGCAATGCACAT---------TTAGTAGGT---CATCTGACAGTTTTAGTTCCTTTGTCCTCTACTAATAAAAGCATTTTAGAGATTTTAGTACGTCATGGTTTTATTCAAAATTTTGAC------CCA------ATTCAAAAT---------CAACAGTTTTTAGTTACCTTCAAACCAAAATCTGTTATTCGA------GAATTACAACGACTCAGTCGACCAGGCTGCCGACTTTATGTATCAGCACAAAACATTCCTCAAATTCGTGGACAATTGGGAATTCTTTTTTTATCTACGTCCAAAGGAATTCTTAGCGATCGTGAAGCTCGATATTTGAAGCTTGGAGGTGAAATTCTCGGATATATTTCATAGATTCCTTCAAAATCAAAAAAAAAACAA------------------------CATGTGAAAGGTGTACAACTGCCGGGGGTCGTTTATCAATGTTTATCAAATGCTATGTTTGGTGAGTTTGCACCTACACGTTATTTTCGAGGTCATAAAAACACTGATAAA------AAATTCAAACGT---------------CGT---------------TAA------ATGGGACAAAAAGTACATCCCTTGGGATTTCGATTAGGTATTACACAACCTCATTTATCACAATGGTACGCTTCCAAAAAATATTATTCAAAATATGTCTTGGAAGATTATTTTGTAAGAACTCTATTGTTAGAAAAATATAATAGAGCAGGATTTGAAAAAATTCACATTTCTCGTAAAATAGAAGATCATCTTGAAATAGTAGTTCATGCTCAAAAACCTGATATTTTGATTGGAAAAAAAGGT------------------GAAAATTTAGAAATTTTTCAAAAACAAATTAAAACATTTATTTTTCAATATCGACAAATTGAATGGAACTCAAAACTTAAAGTTATATTATATATATTTCGGTGTAAAACTAGTGCATCATCTGCTATTGCTGATTTTATTGTTGAACATCTGGAAAAACGAATTCCATATAAAGTTGTTTTTACTTTATTAAAAAAACATTTAAAAAGAAAAAAACAATCAACT------------------------------TTAGGAATGAAAATTCAAATTTCTGGC
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BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
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