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Pannaria_multifida_R961 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Parmeliella_brisbanensis_T1 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Xanthopsoroma_soccatum_GB 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; END; BEGIN TREES; Title 'Best MLT, concatenated dataset (mycobiont)'; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Degelia_durietzii_GB, 2 Degelia_plumbea_GB, 3 Erioderma_verruculosum_GB, 4 Fuscoderma_applanatum_GB, 5 Fuscopannaria_ahlneri_GB, 6 Fuscopannaria_confusa_GB, 7 Fuscopannaria_ignobilis_GB, 8 Fuscopannaria_leucosticta_GB, 9 Fuscopannaria_leucosticta_R1123, 10 Fuscopannaria_mediterranea_GB, 11 Fuscopannaria_praetermissa_GB, 12 Fuscopannaria_praetermissa_R1060, 13 Fuscopannaria_sampaiana_GB, 14 Joergensenia_cephalodina_GB, 15 Kroswia_crystallifera_M788, 16 Kroswia_crystallifera_R1055, 17 Kroswia_crystallifera_R1679, 18 Leciophysma_furfurascens_GB, 19 Leptogidium_contortum_GB, 20 Leptogidium_dendriscum_GB, 21 Leptogium_lichenoides_GB, 22 Pannaria_athroophylla_GB, 23 Pannaria_calophylla_GB, 24 Pannaria_conoplea_GB, 25 Pannaria_implexum_GB, 26 Pannaria_lurida_M786, 27 Pannaria_lurida_R1012, 28 Pannaria_lurida_R1033, 29 Pannaria_lurida_R1125, 30 Pannaria_microphyllizans_GB, 31 Pannaria_multifida_R942, 32 Pannaria_multifida_R960, 33 Pannaria_multifida_R961, 34 Pannaria_pallida_GB, 35 Pannaria_rubiginella_GB, 36 Pannaria_rubiginosa_GB, 37 Pannaria_rubiginosa_R1008, 38 Pannaria_rubiginosa_R1011_a, 39 Pannaria_rubiginosa_R1126, 40 Pannaria_sp._R969, 41 Pannaria_sp._T4, 42 Pannaria_sphinctrina_GB, 43 Pannaria_tavaresii_GB, 44 Parmeliella_appalachensis_GB, 45 Parmeliella_borbonica_R1122, 46 Parmeliella_brisbanensis_R1019, 47 Parmeliella_brisbanensis_R1247, 48 Parmeliella_brisbanensis_T1, 49 Parmeliella_brisbanensis_T3, 50 Parmeliella_brisbanensis_T7, 51 Parmeliella_mariana_R974, 52 Parmeliella_miradorensis_GB, 53 Parmeliella_parvula_GB, 54 Parmeliella_polyphyllina_R1021, 55 Parmeliella_polyphyllina_R1058, 56 Parmeliella_polyphyllina_R1120, 57 Parmeliella_sp._T2, 58 Parmeliella_sp._T6_a, 59 Parmeliella_stylophora_R979, 60 Parmeliella_triptophylla_GB, 61 Parmeliella_triptophylloides_R965, 62 Peltigera_aphthosa_GB, 63 Physma_byrsaeum_GB, 64 Physma_byrsaeum_R1121, 65 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((50:2.28563205293396E-6,46:5.4438550737421E-4):2.28563205293396E-6,((47:5.400639879830221E-4,49:2.28563205293396E-6):2.28563205293396E-6,(((59:0.012575315552113399,((82:0.013342194334397026,(81:0.00705165812007705,((((3:0.07960516893956616,((20:0.0638497312660966,19:0.04776944386786145):0.02498247209543555,(1:0.030288844737253504,14:0.08712046418104813):0.009941059016768259):0.013641706325992892):0.010705279788374374,(2:0.061478599394634015,((60:0.006977770610713566,52:0.00617159275526586):0.024646176010927598,((61:0.008301916784254742,44:0.013051911134793195):0.009159593767370397,(55:0.004535169497270455,(56:0.0012694858501774882,54:2.28563205293396E-6):0.008549396212150274):0.006381594932321472):0.025083945387202208):0.01965627443495211):0.00952210074949431):0.03723279233321702,((21:0.11993711783584636,70:0.08277858858658549):0.023947710763943992,(62:0.16840145316201577,(79:0.03749505511885042,(80:0.018352801441022325,78:0.00957825022945247):0.039556519241182954):0.05305827474871223):0.039660343060731656):0.018173210618585046):0.04360272602369812,(((4:0.041467013321482615,((73:0.004570633953549086,72:0.009755174046401882):0.01269474811878486,74:0.02945611310838393):0.007225959989995404):0.011148455244530947,((75:0.08451964184057686,(77:0.0130187561961062,76:0.02618976183153167):0.029073938832972563):0.015299334460058057,(((22:0.01857366703283784,(34:0.012639485789194237,(23:0.008902396116577449,(42:2.28563205293396E-6,30:2.28563205293396E-6):0.008809153869010366):0.009188880463231304):6.975734871803008E-4):0.0025128078451974283,((41:0.008335636578534526,(((28:0.0038563419489214723,(33:4.062231592335206E-4,(31:4.091614079249227E-4,32:2.28563205293396E-6):2.28563205293396E-6):0.002795279911362023):0.0028841194655138225,(26:0.005869395910852831,29:0.00168526364617654):0.002342352642065677):0.0024426017959663024,27:0.008445351143335058):0.0045851364293238404):0.02172439530284336,(((36:0.0025725515728191434,24:2.28563205293396E-6):0.00189072731152194,(38:0.006150980288704348,(37:0.005189594696261809,39:0.005982396314038901):4.177919618039666E-4):0.0012509686026963747):0.003897892483454815,(35:2.28563205293396E-6,43:0.0021761381911196425):0.014020730560817185):0.007722578800112673):0.001044968856282356):0.011274538568137324,25:0.02011941148126904):0.02224471973893125):0.00365013557083493):0.004576034649838487,((18:0.02095000392417015,((71:0.03805222878221196,((10:0.006553810572267821,7:0.005113298811783221):0.013960278751038136,((12:0.0024266627387973774,(6:0.004341783244157282,11:0.0011688419329824377):2.61488759341581E-6):0.00224609999409969,(5:0.004838933345892492,((15:0.0038126904377920774,(8:0.004047258872904283,9:0.003026052411558262):0.0012559367588484357):0.0017895785889274663,(16:2.28563205293396E-6,17:4.4986434313843435E-4):0.0035070473611404814):5.161558062357325E-4):0.002828738870771999):0.010374313315332766):0.01811429688211093):0.00216198735425178,53:0.029771868722334206):0.003032178446147938):0.0038248425335646007,13:0.06354160123801847):0.01729703241158213):0.012156564872398789):0.006787896896896122):0.0040368798700176674):0.07998366996542008,((((66:6.44938773175614E-4,65:2.28563205293396E-6):0.030487374415683652,(69:0.009900245616656653,68:0.00377558725358863):0.006844264240022936):0.007093611423714447,(45:0.05528966817351026,(67:2.28563205293396E-6,(64:0.027399041739777377,63:0.01646361767303372):0.013030340131855072):0.009869569035994443):0.004086496891241442):0.005112408708737776,40:0.019415035657767837):0.001657898710109287):0.007581045271306235):0.02110778971889075,51:0.014997681584487069):0.005650304194754701,(57:2.28563205293396E-6,58:2.28563205293396E-6):0.006638860484412296):0.00950131807435176):2.28563205293396E-6,48:2.28563205293396E-6); END; BEGIN TREES; Title 'Consensus bayesian result, concatenated dataset (mycobiont)'; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Degelia_durietzii_GB, 2 Degelia_plumbea_GB, 3 Erioderma_verruculosum_GB, 4 Fuscoderma_applanatum_GB, 5 Fuscopannaria_ahlneri_GB, 6 Fuscopannaria_confusa_GB, 7 Fuscopannaria_ignobilis_GB, 8 Fuscopannaria_leucosticta_GB, 9 Fuscopannaria_leucosticta_R1123, 10 Fuscopannaria_mediterranea_GB, 11 Fuscopannaria_praetermissa_GB, 12 Fuscopannaria_praetermissa_R1060, 13 Fuscopannaria_sampaiana_GB, 14 Joergensenia_cephalodina_GB, 15 Kroswia_crystallifera_M788, 16 Kroswia_crystallifera_R1055, 17 Kroswia_crystallifera_R1679, 18 Leciophysma_furfurascens_GB, 19 Leptogidium_contortum_GB, 20 Leptogidium_dendriscum_GB, 21 Leptogium_lichenoides_GB, 22 Pannaria_athroophylla_GB, 23 Pannaria_calophylla_GB, 24 Pannaria_conoplea_GB, 25 Pannaria_implexum_GB, 26 Pannaria_lurida_M786, 27 Pannaria_lurida_R1012, 28 Pannaria_lurida_R1033, 29 Pannaria_lurida_R1125, 30 Pannaria_microphyllizans_GB, 31 Pannaria_multifida_R942, 32 Pannaria_multifida_R960, 33 Pannaria_multifida_R961, 34 Pannaria_pallida_GB, 35 Pannaria_rubiginella_GB, 36 Pannaria_rubiginosa_GB, 37 Pannaria_rubiginosa_R1008, 38 Pannaria_rubiginosa_R1011_a, 39 Pannaria_rubiginosa_R1126, 40 Pannaria_sp._R969, 41 Pannaria_sp._T4, 42 Pannaria_sphinctrina_GB, 43 Pannaria_tavaresii_GB, 44 Parmeliella_appalachensis_GB, 45 Parmeliella_borbonica_R1122, 46 Parmeliella_brisbanensis_R1019, 47 Parmeliella_brisbanensis_R1247, 48 Parmeliella_brisbanensis_T1, 49 Parmeliella_brisbanensis_T3, 50 Parmeliella_brisbanensis_T7, 51 Parmeliella_mariana_R974, 52 Parmeliella_miradorensis_GB, 53 Parmeliella_parvula_GB, 54 Parmeliella_polyphyllina_R1021, 55 Parmeliella_polyphyllina_R1058, 56 Parmeliella_polyphyllina_R1120, 57 Parmeliella_sp._T2, 58 Parmeliella_sp._T6_a, 59 Parmeliella_stylophora_R979, 60 Parmeliella_triptophylla_GB, 61 Parmeliella_triptophylloides_R965, 62 Peltigera_aphthosa_GB, 63 Physma_byrsaeum_GB, 64 Physma_byrsaeum_R1121, 65 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((((((((((48:0.0,49:0.0,50:0.0,46:1.0,47:1.0):16.0,(57:0.0,58:0.0):12.0):13.0,51:20.0):31.0,59:16.0):11.0,((((69:13.0,68:6.0):23.0,(66:1.0,65:0.0):42.0):15.0,(((64:47.0,63:30.0):17.0,67:0.0):17.0,45:21.0):17.0):14.0,40:28.0):14.0):58.0,(81:5.0,82:2.0):19.0):58.0,(((((41:17.0,(((26:14.0,29:4.0):5.0,((31:1.0,32:0.0,33:1.0):7.0,28:9.0):7.0):7.0,27:18.0):12.0):45.0,((((37:11.0,39:15.0):1.0,38:13.0):4.0,24:1.0,36:8.0):10.0,(35:0.0,43:1.0):20.0):24.0,22:8.0,(23:4.0,(30:0.0,42:0.0):4.0):13.0,34:11.0):8.0,25:8.0):60.0,((77:4.0,76:6.0):29.0,75:45.0):77.0,(4:53.0,((72:6.0,73:5.0):12.0,74:22.0):36.0):34.0):32.0,((((((15:8.0,(16:0.0,17:1.0):11.0,(9:4.0,8:8.0):6.0,5:10.0,6:2.0):8.0,(12:4.0,11:2.0):5.0):25.0,(7:3.0,10:6.0):34.0):35.0,71:58.0,53:15.0):17.0,18:28.0):4.0,13:20.0):39.0):43.0):71.0,(((((61:12.0,44:20.0):13.0,((54:0.0,56:3.0):19.0,55:11.0):15.0):49.0,(52:7.0,60:12.0):43.0):46.0,2:76.0):38.0,((1:8.0,14:23.0):42.0,(3:10.0,19:12.0,20:27.0):65.0):51.0):62.0):47.0,(21:144.0,70:97.0):48.0):21.0,(62:167.0,((78:19.0,80:24.0):52.0,79:35.0):85.0):84.0); END;