#NEXUS [written Thu Oct 17 22:12:34 SGT 2013 by Mesquite version 2.75 (build 566) at Simba.local/192.168.1.6] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=86; TAXLABELS Abortiporus_biennis Antrodia_serialis Antrodiella_semisupina Bjerkandera_adusta Ceriporia_reticulata Ceriporiopsis_subvermispora Cerrena_unicolor Climacocystis_borealis Climacodon_septentrionalis Coriolopsis_cf_byrsina Coriolopsis_cf_caperata Coriolopsis_trogii Daedalea_quercina Datronia_mollis Datronia_scutellata Dentocorticium_sulphurellum Dichomitus_squalens Donkioporia_expansa Earliella_scabrosa Fomitopsis_pinicola Ganoderma_sp Ganoderma_tsugae Gloeoporus_taxicola Grifola_frondosa Grifola_sordulenta Heterobasidion_annosum Hydnopolyporus_fimbriatus Hypochnicium_lyndoniae Hypochnicium_subrigescens Irpex_lacteus Ischnoderma_benzoinum Laetiporus_cincinnatus Laetiporus_conifericola Laetiporus_gilbertsonii Laetiporus_huroniensis Lopharia_cinerascens Mycoacia_fuscoatra Nigroporus_vinosus Oligoporus_rennyi Pachykytospora_tuberculosa Parmastomyces_mollisimus Perenniporia_medullapanis Perenniporiella_chaquenia Perenniporiella_micropora Perenniporiella_neofulva Perenniporiella_pendula Perenniporiella_tepeitensis Phaeolus_schweinitzii Phanerochaete_chrysosporium Phlebia_brevispora Phlebia_firma Phlebia_radiata Phlebia_tremellosa Phlebia_unica Physisporinus_sanguinolentus Piptoporus_betulinus Podoscypha_venustula Polyporus_squamosus Postia_placenta Skeletocutis_nivea Sparassis_crispa Spongipellis_pachyodon Steccherinum_ochraceum Stereum_hirsutum Trametes_aff_maxima Trametes_betulina Trametes_cinnabarina Trametes_conchifer Trametes_cubensis Trametes_ectypa Trametes_elegans Trametes_gibbosa Trametes_hirsuta Trametes_maxima Trametes_membranacea Trametes_ochracea Trametes_pavonia Trametes_polyzona Trametes_pubescens Trametes_sanguinea Trametes_suaveolens Trametes_versicolor Trametes_villosa Trametopsis_cervina Wolfiporia_cocos Xanthoporus_syringae ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE tef1; DIMENSIONS NCHAR=1327; FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING = ?; MATRIX Abortiporus_biennis ?????????GATTCCGGCAAGTCYACAACTACTGGACATTTGATCTACAAGTGCGGTGGTATCGATAAGCGTACCATCGAGAAGTTCGAAAAAGAAGCTGCTGAGCTCGGCAAGGGTTCATTCAAGTATGGTGAGCAGCTTGGGTGCTCGATAAGCTCAAAGCTGAGCGTGAACGTGGTATCACCATCGATATCGCTCTCTGGAAGTTCGAGACCCCCAAATTCATGGTCACTGTAAGTAGGTCATCGATGCCCCCGGTCACCGTGATTTCATCAAGAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGATTGTGCTATCCTCATCATCGCCGCTGGTACTGGTGAGTTCGAGGCTGGTATTTCCAAAGAYGGTCAGACTCGCGAGCACGCTCTCCTCGCCTTCACCCTCGGTGTCAGGCAACTCATCGTCGCCATCAACAAGATGGATACCACCAAGGTACATACTTTGTTTAGTGGTCCGAGGATCGTTTCAACGAAATTGTCAAGGAAACCTCCACCTTCATCAAGAAGGTCGGTTACAACCCCAAGGCTGTCGCCTTCGTCCCCATCTCC???GGATGGCACGGTGACAACATGTTGGAGGAGTCTACCAA????????????CATGCCCTGGTACAAGGGCTGGACCAAGGAGACCAAGGCTGGTGTTGTCAAGGGTAAGACCCTCCTTGACGCCATCGACGCCATTGAGCCCCCCGTTCGTCCCTCCGACAAGCCTCTCCGTCTTCCTCTCCAGGATGTCTACAAAATTGGTGGTATTGGCACAGTGCCCGTCGGTCGTGTTGAGACCGGTATCATCAAGGCCGGCATGGTCGTCACCTTCGCTCCTACCAACGTGACCACTGAAGTCAAGTCCGTCGAAATGCACCACGAGCAGCTCGAGCAGGGTGTTCCCGGTGACAACGTCGGTTTCAACGTCAAGTGAGTTTAGGAACGTTTCCGTCAAGGATATCCGTCGTGGTAACGTCGCTTCTGACTCCAAAAACGACCCCGCCAAGGAGGCCGCATCCTTCAACGCTCAGGTCATCATCCTTAACCACCCTGGTCAAATCGGTGCTGGTTACGCTCCCGTTTTGGATTGCCACACTGCCCACATTGCTTGCAAGTTCGCTGAGCTCATCGAGAAGATCGATCGTCGAACTGGAAAATCTATTGAGGCTAGCCCCAAGTTCGTCAAGTCTGGTGATGCCTGCATTGCCAAGCTTGTCCCCAGCAAGCCTATGTGTGTTGAGTCCTACAACGAGTACCCTCCTCTCGGTCGTTTCGCCGTCCGTGACATGAGGCAAACCGTCGCCGTCGGGTGT--- Antrodia_serialis GGTCACGTCGATTCCGGCAAGTCGACCACCACTGGTCACTTGATCTACAAGTGCGGTGGTATCGACAAGCGTACCATCGAGAAATTCGAGAAGGAGGCCGCCGAGTTGGGCAAGGGTTCCTTCAAGTATGGTAAGCAGCCTGGGTGCTTGACAAGCTCAAGGCCGAGCGTGAGCGTGGTATCACGATCGATATTGCGCTCTGGAAGTTCGAGACGCCGAAGTTCATGGTCACCGTGAGTAGGTCATCGATGCCCCCGGTCACCGTGACTTCATCAAGAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCCGACTGTGCTATCCTCATCATTGCTGCCGGTACTGGTGAGTTCGAGGCCGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGCGAGCACGCTCTCCTTGCCTTCACGCTCGGTGTGAGGCAGCTCATCGTTGCCATCAACAAGATGGACACTACCAAGGTGCGCTTATATCATAGTGGAGCGAGGACCGCTTC---GAAATCGTCAAGGAGACGTCCACCTTCATCAAGAAGGTCGGCTACAACCCGAAGGCAGTTGCCTTCCTGCCTATCTCT???GGCTGGCACGGCGACAACATGTTGGAAGAGTCCGCTAAGTACGTATCGAGCACGCT????????????????????????????????????----????????-------------GATGCTATTGACGCCATTGAGCCCCCSGTCCGTCCG---GACAAGCCCCTCCGTCTGCCCCTCCAGGATGT?TACAAGATTGG?GGTATCGGTACGGTGCCCGTCGGTCGTGTCGAGACTGGTATCATCAAGGCYGGCATGGTCGTCACCTTCGCGCCCTCGAACGTGACCACGGAAGTGAAGTCGGTCGAGATGCACCACGAGCAGCTCGAGCAGGGTTCTCCCGGTGACAACGTTGGCTTCAACGTCAAGTACGTCGAGGAACGTCTCGGTCAAGGATATCCGTCGTGGCAACGTCGCGTCTGACTCCAAGAACGACCCGGCGAAGGAGGCTGCTTCCTTCACTGCTCAGGTCATCATCCTCAACCACCCTGGTCAGATCGGTGCTGGCTACGCACCCGTTCTTGATTGCCACACCGCCCAC---GCCTGCAAATTCGCCGAGCTCATCGAGAAGATCGACCGACGGACGGGTAAGTCGCTCGAGGCGGCCCCCAAGTTCGTCAAGTCGGGTGATGCCTGCATTGCCAAGCTTGTGCCGAGCAAGCCGATGTGTGTCGAGTCCTACAACGAGTACCCTCCTCTCGGTCGTTTCGCTGTTCGTGACATGAGACAAAC??????????????????? 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Irpex_lacteus GGTCACGTCGATTCCGGCAAGTCCACCACCACTGGTCACTTGATCTACAAGTGCGGTGGTATCGATAAGCGTACCATCGAGAAGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGCTCGGCAAGGGTTCCTTCAAGTATGGTGAGTAGCTTGGGTGCTCGACAAGCTGAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGATATCGCTCTCTGGAAGTTCGAGACCCCCAAGTACAACGTTACTGTAAGTAGGTCATTGACGCTCCCGGACATCGTGACTTCATCAAGAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCTGACTGTGCCATCCTCATCATCGCCGGTGGTACCGGTGAGTTCGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACTCGCGAGCACGCTCTCCTTGCCTTCACCCTCGGTGTCAGGCAGCTCATCGTCGCCGTCAACAAGATGGACACCAC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GGCTGGCACGGTGACAACATGTTGGAGGCCTCCACCAAGTGAGTATATAGCATGCCATGGTACAAGGGCTGGACCAAGGAGACCAAGGCTGGTGTCGTCAAGGGTGTCACTCTCCTCGACGCCATCGATGCCATCGAGCCCCCYGTTCGTCCCTCAGACAAGCCCCTCCGTCTCCCCCTCCAGGATGTCTACAAGATCGGTGGTATTGGCACGGTGCCCGTCGGTCGTGTYGAGACYGGTGTCATCAAGGCCGGCATGGTCGTCACCTTCGCTCCYACTGGTGTCACCACTGAAGTCAAGTCCGTCGAGATGCACCACGAGCAGCTCGAGGCTGGTCTCCCCGGTGACAACGTCGGCTTCAACGTCAA??????????GAACGTCTCCGTCAAGGATATCCGTCGTGGCAACGTCGCCTCCGACTCCAAGAACGACCCCGCCAAGGAGGCYGCTTCCTTCAACGCTCAGGTCATCGTCCTCAACCACCCTGGTCAGATCGGTGCCGGCTACGCCCCCGTTCTCGAT---CACACTGCCCACATTGCTTGCAAGTTCGCTGAGCTCCTCGAGAAGATCGATCGCCGAACTGGTAAGTCGATCGAGGCCAACCCCAAGTTCGTCAAGTCYGGCGACGCCGTCATCGTCAAGCTCGTCCCCAGCAAGCCCATGTGTGTTGAGTCCTACACTGAGTACCCTCCTCTCGGTCGTTTCGCCGTYCGTGACATG---???????????????????????? Ischnoderma_benzoinum GGTCACGTCGACTCCGGCAAGTCCACCACCACTGGACATCTTATCTACAAGTGCGGTGGTATCGATAAGCGTACCATCGAGAAGTTCGAGAAGGAAGCTGCTGAACTCGGCAAGGGTTCCTTCAAATATGGTGTGTAGCTTGGGTGCTCGACAAGCTGAAAGCCGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATTGATATCGCTCTCTGGAAATTCGAGACCCCCCGTTACATGATCACCGTATGCAGGTCATTGATGCTCCCGGTCACCGTGATTTCATCAAGAACATGATCACTGGTACTTCGCAGGCTGACTGTGCCATTCTCATCATCGCCGGTGGTACTGGTGAGTTCGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACTCGCGAGCATGCTCTCCTTGCGTTCACTCTCGGTGTCAGGCAGCTCATTGTTGCCGTCAACAAGATGGACACCACTAAGGTTAGTTTATATCCCAGTGGAGTGAGGACCGTTTCAACGAAATTGTTAAGGAGACGTCCACCTTCATCAAGAAGGTCGGTTACAACCCGAAGACCGTTGCTTTCGTCCCCATCTCT???GGCTGGCACGGTGACAACATGATCGAGGAGTCCGCCAAGTCAGTTTGCAGCATGCCATGGTACAAGGGCTGGACCAAGGAGACCAAGGCTGGTGTTACCAAGGGCAAGACTCTGCTTGAGGCTATCGACGCTATT---CCCCCAGTTCGTCCC---GACAAGCCCCTCCGTCTTCCTCTC---GATGTCTACAAAATTGGTGGTATTGGCACGGTGCCCGTCGGCCGTGTTGAGACTGGTGTTATCAAGGCCGGCATGATCGTTAACTTCGCCCCCTCAAACGTCACCACTGAAGTCAAGTCCGTCGAGATGCATCACGAGCAGCTCGTTGAGGGTCTCCCCGGTGACAACGTTGGTTTCAACGTCAAGTATGTTTAGGAACGTGTCCGTCAAGGATATTCGTCGTGGTAACGTCGCCTCTGACTCTAAGAATGACCCCGCGAAGGAGGCTGCGTCCTTCATCGCCCAGGTCATTATTCTTAACCACCCTGGTCAGATTGGTGCCGGTTACGCGCCGGTGCTCGATTGCCACACCGCCCACATTGCCTGCAAGTTCGCCGAGCTCATCGAGAAGGTCGATCGCCGAACAGGCAAGTCCATTGAGGCAGCCCCCAAGTTCGTC---????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Laetiporus_cincinnatus ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????-AAGAACATGATCACCGGTACCTCGCAGGCTGACTGCGCTATTCTAATCATTGCCGCTGGTACTGGTGAGTTCGAGGCCGGTATTTCCAAGGACGGCCAGACTCGCGAGCACGCTCTGCTTGCCTTCACCCTTGGTGTCAGGCAGCTCATCGTTGCCATCAACAAGATGGACACTACCAAAGTTTGTACTCTTCAGAGTGGAGCGAGGACCGTTTCAACGAAATCGTCAAGGAGACGTCTACCTTCATCAAGAAGGTGGGCTACAACCCGAAGGCGGTACCGTTCGTCCCCATCTCC???GGCTGGCACGGTGACAACATGTTGGAGGAGTCCCCCAAGTATGTATCCAGCATGCCATGGTACAAGGGTTGGACCAAGGAGACCAAGGCTGGTGTCGTCAAGGGAAAGACCCTCCTCGATGCCATTGACGCCATCGAGCCACCCGTTCGTCCTTCCGACAAGCCTCTCCGTCTTCCCCTCCAGGATGTCTACAAGATCGGTGGT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Laetiporus_conifericola ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????-AAGAACATGATCACCGGTACCTCGCAAGCTGACTGCGCTATCCTTATCATTGCCGCTGGTACTGGTGAGTTCGAGGCCGGTATTTCCAAGGACGGCCAGACTCGCGAGCACGCTCTACTTGCCTTCACCCTTGGTGTCAGGCAGCTCATCGTTGCCATCAACAAGATGGACACTACCAAAGTTCGTACTCTTCAAAGTGGAGCGAGGACCGTTTCAACGAAATCGTCAAGGAGACGTCTACCTTCATCAAGAAGGTGGGCTACAACCCGAAGGCGGTACCGTTCGTCCCCATCTCC???GGCTGGCACGGTGACAACATGTTGGAGGAGTCCCCCAAGTATGTATACAGCATGCCATGGTACAAGGGTTGGACCAAGGAGACCAAGGCTGGTGTCGTCAAGGGAAAGACCCTCCTCGATGCCATTGACGCCATCGAGCCACCCGCTCGTCCTTCCGACAAGCCTCTCCGTCTCCCCCTCCAGGATGTCTACAAGATCGGTGGT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Laetiporus_gilbertsonii ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????-AAGAACATGATCACCGGTACCTCGCAGGCTGACTGCGCTATTCTTATCATTGCCGCTGGCACTGGTGAGTTCGAGGCCGGTATTTCCAAGGACGGCCAGACTCGCGAGCACGCTCTGCTTGCCTTCACCCTTGGTGTCAGGCAGCTCATCGTTGCCATCAACAAGATGGACACTACCAAAGTTCGTACTCTTCAAAGTGGAGCGAGGACCGTTACAACGAAATCGTCAAGGAGACGTCTACCTTCATCAAGAAAGTGGGCTACAACCCGAAGGCGGTACCGTTCGTCCCTATCTCG???GGCTGGCACGGTGACAACATGTTGGAGGAATCTCCCAAGTATGTATACAGCATGCCATGGTACAAGGGTTGGACCAAGGAGACCAAGGCTGGTGTCATCAAGGGAAAGACCCTCCTCGATGCCATTGATGCCATCGAGCCACCCGTTCGTCCTTCAGACAAGCCTCTCCGTCTCCCCCTCCAGGATGTCTACAAGATCGGTGGT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Laetiporus_huroniensis ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????-AAGAACATGATCACCGGTACCTCGCAGGCTGACTGCGCTATCCTTATCATTGCCGCTGGTACTGGTGAGTTCGAGGCCGGTATTTCCAAGGACGGCCAGACTCGCGAGCACGCTCTACTTGCCTTCACCCTTGGTGTCAGGCAGCTCATCGTTGCCATCAACAAGATGGACACTACCAAAGTTTGTACTCTTCAAAGTGGAGCGAGGACCGTTTCAACGAAATCGTCAAGGAGACGTCTACCTTCATCAAGAAGGTGGGCTACAACCCGAAGGCGGTACCGTTCGTCCCCATCTCC???GGCTGGCACGGTGACAACATGTTGGAGGAGTCCCCCAAGTACGTATACAGCATGCCATGGTACAAGGGTTGGACCAAGGAGACCAAGGCTGGTGTCGTCAAGGGAAAGACCCTCCTCGATGCCATTGACGCCATCGAGCCACCCGCTCGTCCTTCCGACAAGCCTCTCCGTCTCCCCCTCCAGGATGTCTACAAGATCGGTGGT?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Pachykytospora_tuberculosa GGYCACGTCGATTCCGGCAAGTCCACCACCACCGGACATCTGATTTACAAGTGCGGTGGTATCGACAAGCGTACCATCGAGAAGTTCGAAAAGGAGGCTGCTGAGCTCGGCAAGGGCTCGTTCAAGTATGGTGAGTAGCCTGGGTGCTCGACAAGCTCAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACGATCGATATCGCCTTGTGGAAGTTCGAGACCCCCCGGTACATGATTACCGTAAGTAGGTCATTGACGCCCCAGGCCACCGTGACTTCATCAAGAACATGATCACTGGTACCTCGCAAGCCGACTGCGCCATTCTCATCATTGCCGGTGGTACCGGTGAGTTCGAGGCTGGTATTTCCAAGGACGGCCAGACTCGCGAGCACGCTCTCCTCGCCTTCACCCTCGGTGTTAGGCAACTCATCGTCGCCGTCAACAAGATGGACACTACGAAGGTTCGTTATCACTTCAGTGGTCCGAGGACCGTTTCAACGAAATCATCAAGGAGACGTCCACTTTCATCAAGAAGGTCGGCTACAACCCCAAGTCGGTCGCGTTCGTCCCTATTTCT???GGCTGGCACGGTGACAACATGTTGGAGGAGTCCGGCAAGTGAGTATATAGCATGCCTTGGTACAAGGGCTGGACCAGGGAGACCAAGGCGGGTCCCGTCAAGGGCAAGACCCTTCTCGACGCCATCGACGCCATTGAGCCTCCTGTCCGTCCCTCCGACAAGCCTCTCCGTCTCCCCCTCCAGGATGTCTACAAGATCGGTGGTATCGGCACGGTGCCGGTCGGCCGTGTCGAGACTGGTGTCATCAAGTCTGGCATGGTCGTTACTTTCGCGCCCTCGAACGTCACCACTGAGGTGAAATCCGTCGAGATGCACCACGAGCAACTTGTCGAGGGTCTTCCTGGTGACAACGTTGGTTTCAACGTGAAGTAYGTGCAGGAACGTATCGGTCAAGGATATTCGCCGTGGTAACGTCGCTTCCGACTCCAAGAACGACCCCGCCAAGGAGGCGGCATCGTTCAACGCTCAGGTCATCGTCCTCAACCACCCCGGTAATATCTTAGCCGGTTACACGCCCGTGATGGATTGCCATACCGCGCACATTGCTTGCAAGTTCGCCGAGCTCATCGAGAAGATCGACCGCCGGTCGGGCAAGTCGATCGAGGCGTCTCCCAAGTCCGTCAAGTCTGGCGATGCCTGCATTGCCAAGCTTGTGCCCAGCAAGCCGATGTGCGTGGAGTCCTACAACGAGTACCCGCCTCTTGGTCGTTTCGCCGTTCGTGACATGAGGCAAACYGTYGCCGTCGGGTGT--- Parmastomyces_mollisimus GGTCACGTCGATTCCGGCAAGTCCACCACCACTGGACATCTGATCTACAAGTGCGGTGGTATCGATAAGCGTACTATCGAGAAGTTCGAGAAGGAAGCYGCTGAACTCGGCAAGGGTTCCTTCAAGTACGGTGGGTAGCATGGGTGCTCGACAAGCTCAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACGATCGATATCGCCCTCTGGAAGTTCGAGACCCCTAAATACATGGTTACGGTGCGTAGGTCATTGACGCTCCCGGACACCGTGACTTCATCAAGAACATGATTACTGGTACCTCCCAGGCTGACTGTGCTATTCTCATTATTGCCGGDGGTACTGGTGAATTCGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGCCAGACTCGCGAGCACGCTCTCCTTGCGTTCACCCTTGGTGTCAGGCAATTGATTGTTGCCGTCAACAAGATGGACACTACCAAGGTGAGTTGGGAGCATAGTGGAGCGAGGACCGTTTCAACGAAATTGTTAAGGAGACGTCCACCTTC---AAGAAGGTCGGTTACAACCCCAAGGCCGTCGCTTTTCGTCCCCCATCTCAAGGCTGGCACGGTGACAACATGTTGGAGGAGTCCCCC?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Trametes_versicolor GGTCACGTCGATTCCGGCAAGTCGACCACCACCGGTCACTTGATCTACAAGTGCGGTGGCATCGACAAGCGTACCATCGAGAAGTTCGAAAAGGAGGCTGCTGAGCTCGGCAAGGGCTCGTTTAAGTATGGTGAGTAGCCTGGGTGCTCGACAAGCTGAAAGCCGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATCGACATCGCCCTCTGGAAGTTCGAGACCCCCAAGTACATGGTCACTGTAAGTAGGTCATCGACGCCCCCGGTCACCGTGACTTCATCAAGAACATGATCACCGGTACCTCGCAGGCTGACTGCGCTATTCTCATCATCGCCGCTGGTACCGGTGAGTTCGAGGCTGGTATCTCCAAGGATGGCCAGACCCGCGAGCACGCTCTCCTTGCCTTCACCCTCGGTGTCAGGCAGCTCATCGTCGCCGTCAACAAGATGGACACCACGAAGGTTCGTTATCGCGCGAGTGGTCCGAGGACCGTTTCAACGAGATCATCAAGGAGACGTCGACCTTCATCAAGAAGGTTGGCTACAACCCGAAGGCGGTCGCGTTCGTCCCCATCTCC???GGATGGCACGGCGACAACATGCTGGAGGAGTCTGCCAAGTGCGTATATAGCATGCCCTGGTACAAGGGCTGGACCAAGGAGACCAAGGCCGGTGTTGTCAAGGGCAAGACGCTCCTCGACGCCATCGACGCCATCGAGCCCCCCGTCCGTCCCTCCGACAAGCCCCTCCGTCTCCCCCTCCAGGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGCACGGTGCCCGTCGGTCGTGTCGAGACTGGTGTCATCAAGGCCGGCATGGTCGTCACCTTCGCGCCCTCGAACGTGACCACTGAAGTCAAGTCCGTCGAGATGCACCACGAGCAGCTCGAGTCCGGCAACCCCGGTGACAACGTCGGCTTCAACGTCAAGTACGTCGAGGAACGTGTCCGTCAAGGATATCCGCCGTGGCAACGTCGCTTCCGACTCCAAGAACGACCCCGCCAAGGAGGCCGCGTCCTTCAACGCCCAGGTCATCATCCTCAACCACCCTGGTCAGATCGGTGCCGGCTACGCTCCCGTCCTCGATTGCCACACCGCCCACATTGCCTGCAAGTTCGCTGAGCTCATCGAGAAGATCGACCGTCGTACCGGCAAGTCGATCGAGGCTGCGCCCAAGTTCGTCAAGTCTGGTGATGCCTGCATTGCCAAGCTTGTGCCCAGCAAGCCCATGTGCGTGGAGTCGTACAACGAGTACCCCCCTCTCGGTCGTTTCGCCGTCCGTGACATGCGGCAGACGGTTGCCGTCGGCATCATC Trametes_villosa ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATCAAGAACATGATCACCGGTACCTCGCAGGCTGACTGCGCTATCCTCATCATCGCCGGTGGTACCGGTGAGTTCGAGGCTGGTATCTCCAAGGACGGCCAGACCCGCGAGCACGCCCTCCTTGCCTTCACCCTCGGTGTCAGGCAGCTCATTGTCGCCGTCAACAAGATGGACACCACCAAGGTTTGTCTGATGGCGAGTGGTCCGAGGACCGCTTCAACGAAATCGTCAAGGAGACGTCCACCTTCATCAAGAAGGTCGGCTACAACCCCAAGGCGGTTGCGTTCGTCCCCATCTCC???GGCTGGCACGGCGACAACATGTTGGAGGAGTCCACCAAGTGCGTATATAGCATGCCGTGGTACAAGGGCTGGACCAAGGAGACCAAGGCTGGTGTCGTCAAGGGCAAGACCCTCCTCGATGCCATCGACGCGATCGAGCCCCCCGTCCGTCCCTCCGACAAGCCCCTCCGTCTCCCCCTCCAGGATGTCTACAAGATTGGCGGTATTGGCACGGTGCCCGTCGGCCGTGTCGAGACTGGTATCATCAAGGCCGGCATGGTCGTTACGTTCGCGCCCACGAACGTGACCACTGAGGTCAAGTCCGTCGAGATGCACCACGAGCAGCTCGAGCAGGGTGTCCCCGGTGACAACGTCGGCTTCAACGTCAAGTATGTCCAGGAACGTGTCCGTCAAGGATATCCGCCGTGGCAACGTCGCCTCCGACTCGAAGAACGACCCCGCCAAGGAGGCCGCGTCGTTCAACGCGCAGGTCATCATCCTCAACCACCCCGGTCAGATCGGTGCTGGCTACGCCCCCGTCCTCGATTGCCACACCGCCCACATTGCTTGCAAGTTCGCCGAGCTCATCGAGAAGATCGACCGCCGTACCGGCAAGTCGATCGAGGCGGCCCCCAAGTTCGTCAAGTCTGGTGATGCGTGCATTGCCAAGCTTGTCCCCAGCAAGCCCATGTGCGTGGAGTCCTACAAC?????????????????????????????????????????????????????????????????? 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Wolfiporia_cocos GGCCACGTCGATTCCGGCAAGTCGACCACCACCGGTCACTTGATCTACAAGTGCGGTGGTATCGACAAGCGTACCATCGAGAAGTTCGAGAAGGAGGCTGCTGAGCTCGGCAAGGGTTCGTTCAAGTATGGTCAGTAGCCTGGGTGCTCGACAAGCTCAAGGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATCGATATCGCCCTCTGGAAGTTCGAGACCCCCAAGTTCATGGTCACCGTATGTAGGTCATTGACGCCCCTGGTCACCGTGACTTCATCAAGAACATGATCACTGGTACCTCCCAGGCCGATTGCGCTATCCTCATCATTGCCGCCGGCACTGGTGAGTTCGAGGCCGGTATCTCCAAGGACGGTCAGACTCGCGAGCACGCTCTCCTTGCGTTCACCCTCGGTGTCAGGCAGCTCATCGTCGCCATCAACAAGATGGACACCACCAAGGTAAGCAGCATATTCAGTGGAGCGAGGACCGTTTCAACGAAATCGTTAAGGAGACGTCCACCTTCATCAAGAAGGTTGGTTACAACCCCAAGGCAGTCGCGTTCGTTCCCATCTCC???GGCTGGCACGGCGACAACATGTTGGAGGAGTCCGTCAAGTGAGTGTCTAGCATGACGTGGTACAAGGGTTGGACCAAGGAGACCAAGGCGGGTGTTGTCAAGGGCAAGACGCTCCTCGACGCCATCGACGCCATCGAGCCCCCCGTCCGTCCCTCCGACAAGCCTCTCCGTCTCCCTCTCCAGGATGTCTACAAGATCGGTGGTATCGGTACGGTGCCCGTCGGTCGTGTTGAGACTGGTGTCATCAAGGCTGGTATGGTCGTCACCTTCGCACCTTCGAACGTGACCACCGAAGTCAAGTCCGTCGAGATGCACCACGAGCAGCTCGAGCAAGGTGTCCCTGGTGACAACGTCGGCTTTAACGTCAAGTAAGCCAAGGAACGTGTCGGTCAAGGATATCCGCCGTGGTAACGTTGCGTCCGACTCGAAGAACGACCCCGCCAAGGAGGCCGCCTCCTTCACCGCTCAGGTCATCATCCTCAACCACCCTGGTCAGATTGGTGCCGGCTACGCGCCCGTCCTTGACTGCCACACCGCCCACATTGCCTGCAAGTTCGCTGAGCTCATCGAGAAGATCGACCGTCGTACGGGTAAGTCGCTCGAGGCGAGCCCCAAGTTCGTCAAGTCCGGCGACGCTTGCATTGCCAAGCTCGTGCCCAGCAAGCCCATGTGCGTTGAGTCTTACAACGAGTACCCACCTCTCGGTCGTTTCGCCGTCCGTGACATGCGGCAGACCGTCGCTGTCGGTATCATC Xanthoporus_syringae ??????---GATTCCGGCAAGTCAACAACTACTGGACACTTGATCTACAAGTGCGGTGGTATCGATAAGCGTACCATCGAGAAGTTCGAGAAGGAAGCCGCTGAACTCGGCAAGGGTTCCTTCAAATATGGTGAGCAGCCTGGGTGCTCGACAAGCTCAAAGCTGAGCGTGAGCGTGGTATCACCATCGATATCGCCCTATGGAAGTTCGAGACTCCCAAATTCATGGTTACCGTAAGTAGGTCATCGATGCTCCTGGACATCGTGATTTCATCAAGAACATGATTACTGGTACCTCTCAGGCAGATTGCGCCATCCTTGTCATCGCTGCTGGAACTGGTGAATTCGAAGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAGACCCGTGAACACGCTCTCCTCGCTTTCACCCTCGGTGTCAGGCAGCTGATCGTCGCCATCAACAAGATGGACACAACGAAGGTTCGTTTACTTCAGAGTGGAGTGAGGACCGTTTCAATGAAATTGTTAAGGAAACTTCCAACTTCATTAAGAAGGTCGGTTACAACCCTAAGGCTGTTGCTTTCGTCCCTATCTCT???GGCTGGCACGGTGACAACATGTTGGAGGATTCCGTCAAGTGAGTATATAGCATGACATGGTTCAAGGGCTGGACCAAGGAGACTAAGGCCGGTGTTGTCAAGGGCAAGACCCTCCTCGACGCCATTGACGCTATTGAGCCACCAGTCCGTCCCTCCGACAAGCCTCTTCGACTTCCTCTCCAAGATGTCTACAAAATTGGTGGTATCGGCACGGTGCCCGTCGGCCGTGTTGAGACTGGTATCATCAAGGCTGGCATGGTCGTCACTTTCGCTCCCACGAACGTGACCACTGAAGTCAAGTCCGTCGAAATGCATCATGAGCAGCTCGAGCAGGGTAACCCAGGTGACAATGTCGGTTTCAACGTCAAGTATGTCGAGGAACGTTTCCGTTAAGGACATTCGTCGTGGTAACGTTGCTTCTGACTCCAAGAACGACCCTGCCAAGGAGGCCGCTTCCTTCACTGCCCAGGTCATCATCCTCAACCACCCCGGTCAGATTGGTGCCGGTTACGCTCCCGTCCTCGATTGTCACACCGCCCACATTGCTTGCAAGTTCCAAGAACTTGTTGAGAAGATTGATCGCCGTACCGGCAAGTCCATCGAGGCGAGCCCCAAGTTCGTCAAGTCCGGTGATGCTTGCATCGCTGTTCTCGTTCCCAGCAAGCCCATGTGTGTTGAGGAGTACAACCAGTACGCTCCCCTCGG????????????????????????????????????????????????? ; END; BEGIN TREES; Title tef1; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Abortiporus_biennis, 2 Antrodia_serialis, 3 Antrodiella_semisupina, 4 Bjerkandera_adusta, 5 Ceriporia_reticulata, 6 Ceriporiopsis_subvermispora, 7 Cerrena_unicolor, 8 Climacocystis_borealis, 9 Climacodon_septentrionalis, 10 Coriolopsis_cf_byrsina, 11 Coriolopsis_cf_caperata, 12 Coriolopsis_trogii, 13 Daedalea_quercina, 14 Datronia_mollis, 15 Datronia_scutellata, 16 Dentocorticium_sulphurellum, 17 Dichomitus_squalens, 18 Donkioporia_expansa, 19 Earliella_scabrosa, 20 Fomitopsis_pinicola, 21 Ganoderma_sp, 22 Ganoderma_tsugae, 23 Gloeoporus_taxicola, 24 Grifola_frondosa, 25 Grifola_sordulenta, 26 Heterobasidion_annosum, 27 Hydnopolyporus_fimbriatus, 28 Hypochnicium_lyndoniae, 29 Hypochnicium_subrigescens, 30 Irpex_lacteus, 31 Ischnoderma_benzoinum, 32 Laetiporus_cincinnatus, 33 Laetiporus_conifericola, 34 Laetiporus_gilbertsonii, 35 Laetiporus_huroniensis, 36 Lopharia_cinerascens, 37 Mycoacia_fuscoatra, 38 Nigroporus_vinosus, 39 Oligoporus_rennyi, 40 Pachykytospora_tuberculosa, 41 Parmastomyces_mollisimus, 42 Perenniporia_medullapanis, 43 Perenniporiella_chaquenia, 44 Perenniporiella_micropora, 45 Perenniporiella_neofulva, 46 Perenniporiella_pendula, 47 Perenniporiella_tepeitensis, 48 Phaeolus_schweinitzii, 49 Phanerochaete_chrysosporium, 50 Phlebia_brevispora, 51 Phlebia_firma, 52 Phlebia_radiata, 53 Phlebia_tremellosa, 54 Phlebia_unica, 55 Physisporinus_sanguinolentus, 56 Piptoporus_betulinus, 57 Podoscypha_venustula, 58 Polyporus_squamosus, 59 Postia_placenta, 60 Skeletocutis_nivea, 61 Sparassis_crispa, 62 Spongipellis_pachyodon, 63 Steccherinum_ochraceum, 64 Stereum_hirsutum, 65 Trametes_aff_maxima, 66 Trametes_betulina, 67 Trametes_cinnabarina, 68 Trametes_conchifer, 69 Trametes_cubensis, 70 Trametes_ectypa, 71 Trametes_elegans, 72 Trametes_gibbosa, 73 Trametes_hirsuta, 74 Trametes_maxima, 75 Trametes_membranacea, 76 Trametes_ochracea, 77 Trametes_pavonia, 78 Trametes_polyzona, 79 Trametes_pubescens, 80 Trametes_sanguinea, 81 Trametes_suaveolens, 82 Trametes_versicolor, 83 Trametes_villosa, 84 Trametopsis_cervina, 85 Wolfiporia_cocos, 86 Xanthoporus_syringae; TREE tef1_tree = ((4:0.061797233692638905,((((60:0.17850281701641169,((49:0.04443139368186286,(54:0.07081730693901717,51:0.11589578575010073)82:0.02399895446242143)93:0.028120730540997927,((9:0.09178353633171876,50:0.07743341055526488)61:0.014931593055607767,(37:0.07431297222565143,(53:0.05932561761713866,52:0.05800829030047762)85:0.02431684545369626)64:0.018797523245260527)77:0.01788575723839653)69:0.00860798002986034)21:0.005565627908313695,(5:0.09523618210234845,23:0.06364280506526815)87:0.020249623383064446)16:0.013995986761469152,(84:0.07370489829334559,(27:0.08561174316942614,30:0.009350237616021726)100:0.0529725154419213)24:0.002582190345848564)4:0.01198456458047404,((((24:0.09101425492528113,25:0.10008728373317624)42:0.019884192652732367,(((48:0.12634326398803086,(61:0.16309264943395238,(41:0.09653396157959582,39:0.22461100708018034)20:0.018752604654882397)8:0.007440875977022868)12:0.015599945872390693,31:0.14311372033050204)13:0.009535782161083629,(36:0.10586433391531525,16:0.10827889955914097)39:0.021539381928374447)2:0.007940415978532483)14:0.014502688305834288,(((55:0.14911925112019203,8:0.05792410940969753)17:0.02086498758095455,(((57:0.04374257274210995,1:0.04771784646051108)56:0.01465096727631666,(28:0.09486263989397196,29:0.07762562218055177)35:0.03655127729663458)4:0.00965045910438433,7:0.10993109476939453)8:0.00769528890784946)60:0.012923943909487782,(62:0.11204655557235652,(3:0.07476229214804109,(63:0.04617199567262103,(86:0.12175471943254905,38:0.05089910696530682)59:0.020055746689389628)37:0.006836864783006424)99:0.03603701748911217)52:0.017044954054329913)39:0.01604546400473719)4:0.01118605462988876,(((((((43:0.007152361360787703,47:0.006036377296325146)100:0.015709166742782693,(46:0.02526782792405054,44:0.03438688743344101)77:0.0111309478100155)100:0.04067956045898012,((42:0.08193118085037467,17:0.03325353428095929)68:0.018282688095116812,(((12:0.0782521799470893,40:0.13365371799377979)16:0.004501583661032168,11:0.05050469533924743)17:0.013446841832183178,(10:0.18255269641819874,(21:0.05448673812062088,22:0.0553834253348769)61:0.008525020893042237)28:0.004365668387078427)10:0.00529453440874503)7:0.0045742589801394075)8:0.008861602979866632,(45:0.06896327955724196,18:0.10374375473262079)13:0.005129157720078508)11:0.019408399484457987,((15:0.09489328761598052,(14:0.10473325345810548,58:0.17683819013306268)90:0.04704295403445707)100:0.10462734431914145,19:0.02954753796429559)94:0.04936274908681475)14:0.00440078269057258,(6:0.08913384653758818,((69:0.045898303498316605,(67:0.06629569967840676,80:0.013354520159756224)90:0.013976098187550438)25:0.0026147185882395827,(75:0.048727990169382195,(78:0.03267617813632623,((77:0.06881593603170878,((66:0.08414186485679584,(68:0.0324720949156987,(((76:0.016811764909359338,(82:0.008157686728160831,70:0.011254435547764856)78:0.003752605829556789)71:0.004013662193543688,79:0.011190750676409284)34:0.00332862523317686,81:0.050060011659468606)39:0.004453981860021063)92:0.01463914620251627)57:0.013585270826514843,(83:0.02954172081556027,73:0.02233569636624957)54:0.008161771558430004)16:0.003272773467428188)17:0.011957399648769225,((71:0.07930091391515641,72:0.08282837455444683)37:0.014036167943948881,(74:0.043493702026047104,65:0.04088814366756514)95:0.020877591665518634)23:0.012910569098496012)18:0.008501303205841047)7:0.009788798430029845)2:0.004979500632932806)18:0.010721508396418148)15:0.00471649917863287)44:0.01793862398592815,(85:0.0822472746109748,(((33:0.004503715023580004,35:0.0025425574252368917)84:0.006159801399561554,(32:0.010465915020093178,34:0.027886894973523015)62:4.975194521132566E-4)100:0.09885487620511006,(((56:0.05717506935642173,20:0.07780895834615455)75:0.017377758804918705,(2:0.09159432229582062,13:0.07240207864014417)26:0.009585465105282862)80:0.036490973744206234,59:0.11506970945094652)49:0.003093335573857754)28:0.010519217976512512)33:0.01683244778190177)25:0.015868283424226963)2:0.004452613982888337)19:0.013128552543544688)84:0.45,(64:0.04839542205872025,26:0.2580835241471735)84:0.45); 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