#NEXUS [written Thu Nov 07 12:55:14 GMT 2013 by Mesquite version 2.75 (build 564) at MacBook-Pro-de-Sarah.local/192.168.1.5] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=37; TAXLABELS Fungus_sp._F4886____ Robillarda_sessilis_CY187 Fungus_sp._RFLP29 Robillarda_sessilis_BCC13393 Discostroma_tricellulare_FG11 Amphisphaeriaceae_sp._9BS21 Discosia_sp._SW_2w_D02 Discosia_sp._KL_2w_H09 Discosia_sp._SW_2w_A10 Discosia_sp._KL_2w_G06 Discosia_sp._KL_2w_B11 Discosia_sp._AC_2w_E12 Discosia_sp._AC_2w_A05 Discosia_sp._AC_2w_G10 Discosia_sp._AC_2w_F09 Discosia_sp._KL_2w_A03 Discosia_sp._AC_2w_E02 Discosia_sp._OS_2w_F08 Discostroma_tricellulare_JZ171 Discostroma_tricellulare__ Amphisphaeria_sp._Kobayashi Amphisphaeria_sp._MAFF235878_ Discosia_sp._HKUCC_6626 Discostroma_fuscellum__ Seiridium_banksiae_CBS Discosia_sp._2_KT_2010 Discosia_sp._2_KT_2010_AB5947881 Discosia_sp._3_KT_2010 Discosia_sp._1_KT_2010 Discosia_sp._4_KT_2010 Discosia_sp._R158_ Discostroma_sp._E000535628 Discosia_sp._1_KT2010 Discosia_sp._KT2188_genes Adisciso_yakushimense Discosia_sp._6KT2010 Seimatosporium_azaleae ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE Character_Matrix; DIMENSIONS NCHAR=547; FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING = ?; MATRIX Fungus_sp._F4886____ GATCATTATAGAGTTTTCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATT-GTTGCCTCGGCAGAACCTACCCGGTACCTACCCTGGAACAGCTACCCTGTAGCTACCCAGGAACGGGCTACCCTGTAACGTCCTGCCGGTGGACTTCTAAACTCTTGTTATTT-ATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTGCTGTATGGCAGTTCCTCAAATACAACGGCGGATCTGTAACATCCTCTGAGCGTAGTAAATTTTTATCTCGCTTCTGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTTGTGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Robillarda_sessilis_CY187 GATCATTATAGAGTTTTCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATT-GTTGCCTCGGCAGAACCTACCCGGTACCTACCCTGGAACAGCTACCCTGTAGCTACCCAGGAACGGACTACCCTGTAACGTCCTGCCGGTGGACTTCTAAACTCTTGTTATTT-ATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTGCTGTAAAGCAGTTCCTCAAATACAACGGCGGATCTGTAACATCCTCTGAGCGTAGTAAATTTTTATCTCGCTTTTGTCAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTTGTGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Fungus_sp._RFLP29 GATCATTATAGAGTTTTCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATT-GTTGCCTCGGCAGAGCCTACCCGGTACCTACCCTGGAACAGCTACCCTGTAGCTACCCAGGAACGGGCTACCCTGTAACGTCCTGCCGGTGGACTTCTAAACTCTTGTTATTT-ATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTGCTGTATTGCAGTTCCTCAAATACAACGGCGGATCTGTAACATCCTCTGAGCGTAGTAAATTTTTATCTCGCTTTTGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTTGTGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Robillarda_sessilis_BCC13393 GATCATTATAGAGTTTTCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATT-GTTGCCTCGGCAGAGCCTACCCGGTACCTACCCTGGAACAGCTACCCTGTAGCTACCCAGGAACGGGCTACCCTGTAACGTCCTGCCGGTGGACTTCTAAACTCTTGTTATTTGATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTGCTGTATTGCAGTTCCTCAAATACAACGGCGGATCTGTAACATCCTCTGAGCGTAGTAAATTCTTATCTCGCTTTTGTCAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAA-CCCCCAATTTTTGTGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Discostroma_tricellulare_FG11 GATCATTATAGAGTTTTCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATT-GTTGCCTCGGCAGAGCCTACCCGGTACCTACCCTGGAACAGCTACCCTGTAGCTACCCAGGAACGGGCTACCCTGTAACGTCCTGCCGGTGGACTTCTAAACTCTTGTTATTT-ATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTGCTGTATTGCAGTTCCTCAAATACAACGGCGGATCTGTAACATCCTCTGAGCGTAGTAAATTTTTATCTCGCTTTTGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTTGTGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Amphisphaeriaceae_sp._9BS21 GATCATTATAGAGTTTTCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATT-GTTGCCTCGGCAGAGCCTACCCGGTACCTACCCTGGAACAGCTACCCTGTAGCTACCCAGGAACGGGCTACCCTGTAACGTCCTGCCGGTGGACTTCTAAACTCTTGTTATTTGATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCTTAGCTTAGTGTTGGGAATCTGCTGTATTGCAGTTCCTCAAATACAACGGCGGATCTGTAACATCCTCTGAGCGTAGTAAATTCTTATCTCGCTTTTGTCAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAA-CCCCCAATTTTTGTGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Discosia_sp._SW_2w_D02 GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAACCTACCCGGTACCTACCCTGGAGCGGCTACCCTGTAGCTACCCTGGAGCGGGCTACCCTGTAACGTCCTGCCGGTGGACCTTTAAACTCTTGTTATTTTATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGTAATATCCTCTGAGCGTAGTAATTTTTTT-CTCGCTTTGGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Discosia_sp._KL_2w_H09 GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAACCTACCCGGTACCTACCCTGGAGCGGCTACCCTGTAGCTACCCTGGAGCGGGCTACCCTGTAACGTCCTGCCGGTGGACCTTTAAACTCTTGTTATTTTATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGTAATATCCTCTGAGCGTAGTAATTTTTTT-CTCGCTTTGGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Discosia_sp._SW_2w_A10 GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAACCTACCCGGTACCTACCCTGGAGCGGCTACCCTGTAGCTACCCTGGAGCGGGCTACCCTGTAACGTACTGCCGGTGGACCTTTAAACTCTTGTTATTTTATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGTAATATCCTCTGAGCGTAGTAATTTTTTT-CTCGCTTTGGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Discosia_sp._KL_2w_G06 GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAACCTACCCGGTACCTACCCTGGAGCGGCTACCCTGTAGCTACCCTGGAGCGGGCTACCCTGTAACGTACTGCCGGTGGACCTTTAAACTCTTGTTATTTTATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGTAATATCCTCTGAGCGTAGTAATTTTTTT-CTCGCTTTGGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Discosia_sp._KL_2w_B11 GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAACCTACCCGGTACCTACCCTGGAGCGGCTACCCTGTAGCTACCCTGGAGCGGGCTACCCTGTAACGTCCTGCCGGTGGACCTTTAAACTCTTGTTATTTTATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGGATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGTAATATCCTCTGAGCGTAGTAATTTTTTT-CTCGCTTTGGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Discosia_sp._AC_2w_E12 GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAACCTACCCGGTACCTACCCTGGAGCGGCTACCCTGTAGCTACCCTGGAGCGGGCTACCCTGTAACGTACTGCCGGTGGACCTTTAAACTCTTGTTATTTTATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGTAATATCCTCTGAGCGTAGTAATTTTTTT-CTCGCTTTGGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Discosia_sp._AC_2w_A05 GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAACCTACCCGGTACCTACCCTGGAGCGGCTACCCTGTAGCTACCCTGGAGCGGGCTACCCTGTAACGTACTGCCGGTGGACCTTTAAACTCTTGTTATTTTATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGTAATATCCTCTGAGCGTAGTAATTTTTTT-CTCGCTTTGGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Discosia_sp._AC_2w_G10 GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAACCTACCTGGTACCTACCCTGGAGCGGCTACCCTGTAGCTACCCTGGAGCGGGCTACCCTGTAACGTACTGCCGGTGGACCTTTAAACTCTTGTTATTTTATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGTAATATCCTCTGAGCGTAGTAATTTTTTT-CTCGCTTTGGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Discosia_sp._AC_2w_F09 GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAACCTACCTGGTACCTACCCTGGAGCGGCTACCCTGTAGCTACCCTGGAGCGGGCTACCCTGTAACGTACTGCCGGTGGACCTTTAAACTCTTGTTATTTTATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGTAATATCCTCTGAGCGTAGTAATTTTTTT-CTCGCTTTGGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Discosia_sp._KL_2w_A03 GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAACCTACCCGGTACCTACCCTGGAGCGGCTACCCTGTAGCTACCCTGGAGCGGGCTACCATGTAACGTACTGCCGGTGGACCTTTAAACTCTTGTTATTTTATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAGATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGTAATATCCTCTGAGCGTAGTAATTTTTTT-CTCGCTTTGGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Discosia_sp._AC_2w_E02 GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAACCTACCCGGTACCTACCCTGGAGCGGCTACCCTGTAGCTACCCTGGAGCGGGCTACCCTGTAACGTACTGCCGGTGGACCTTTAAACTCTTGTTATTTTATAGTAATCTGAGTGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCCGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGTAATATCCTCTGAGCGTAGTAATTTTTTT-CTCGCTTTGGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Discosia_sp._OS_2w_F08 GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAACCTACCTGGTACCTACCCTGGAGCGGCTACCCTGTAGCTACCCTGGAGCGGGCTACCCTGTAACGTACTGCCGGTGGACCTTTAAACTCTTGTTATTTTATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGTAATATCCTCTGAGCGTAGTAATTTTTTT-CTCGCTTTGGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Discostroma_tricellulare_JZ171 --TTGGACTTGAG-TTTCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATT-GTTGCCTCGGCAGAGCCTACCCGGTACCTACCCTGGAACAGCTACCCTGTAGCTACCCAGGGATGGGCTACCTTGTAACGTCCTGCCGGTGGACTTCTAAACTCTTGTTATTT-ATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTGCTGTATTGCAGTTCCTCAAATACAACGGCGGATCTGTAACATCCTCTGAGCGTAGTAAATTTTTATCTCGCTTTTGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTTTTGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Discostroma_tricellulare__ GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAGGCTACCCGGTACCTACCCTGGAGCAGCTACCCTGTAGCTACCCTGGAACGGCCTACCCTGTAGCGTCCTGCCGGTGGACCTTTAAACTCTTGTTATTTTAAAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATATAACGGCGGATCTGTAATGTCCTCTGAGCGTAGTAATTTTTTTCCTCGCTTTGGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Amphisphaeria_sp._Kobayashi GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAGCCTACCTGGTATCTACTCTGGAGCGGCTACCCTGTAGCTACCCTGGAGCGGGTTACCCTGTAACGTCCTGCCGGTGGACCTTTAAACTCTTGTTATTATATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATATAACGGCGGATCTGCAATATCCTCTGAGCGTAGTAATTTTTTT-CTCGCTTTGGTTAGGTGTTGTAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Amphisphaeria_sp._MAFF235878_ GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAGCCTACCTGGTATCTACTCTGGAGCGGCTACCCTGTAGCTACCCTGGAGCGGGTTACCCTGTAACGTCCTGCCGGTGGACCTTTAAACTCTTGTTATTATATAGTAATCTGAGCCTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATATAACGGCGGATCTGCAATATCCTCTGAGCGTAGTAATTTTTTT-CTCGCTTTGGTTAGGTGTTGTAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Discosia_sp._HKUCC_6626 GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAACCTACCCGGTACCTACCCTGGAGCGGCTACCCTGTAGCTACCCTGGAGCGGGCTACCCTGTAACGTCCTGCCGGTGGACTTCTAAACTCTTGTTATTTTATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGTTAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATATAACGGCGGATCTGTAATATCCTCTGAGCGTAGTAATTTTTTT-CTCGCTTTGGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGT?????????????????? Discostroma_fuscellum__ GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATT-GTTGCCTCGGCAGAACCTACCCGGTACCTACCCTGTAACACCTACCCTGTAGCTACCTGGGAACGGCTTACCCTGTAGTGCGCTGCCGGCGGACCTCTTAACTCTTGTTATTTTATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAGCCTACTGTATTGTAGCTCCCCAAATCCAACGGCGGATCTGTGGTATCCTCTGAGCGTAGTAATTTTTAT-CTCGCTTTTGTTAGGTGCCGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Seiridium_banksiae_CBS GATCATTACAGAGTTAAACAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCTTCTGTTGCCTCGGCAGGACCTACCCGGTACCTACCCTGTAGCAGCTACCCTGTAGCTACCCGGGAACGGCCTACCCTGTAACGCCCTGCCGGTGGACCATCAAACTCTTGTTATTT-TTAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTATTGGGAGTCTGCTGTATTGCAGTTCCTCAAATCCAACGGCGGATCTGTGGTGTCCTCTGAGCGTAGTAAATCTTTATCTCGCTTTTGTCAGGTGCCGCAGCTCCCAGCCGCTAAACCCCCTATTTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Discosia_sp._2_KT_2010 GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAGCCTACCTGGTACCTACCCTGGAGCAGCTACCCTGTAGCTACCCTGGAGCGGGCTACCCTGTAACGTCCTGCCGGTGGACCTTTAAACTCTTGTTATTTTATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGTAATATCCTCTGAGCGTAGTAATTTTTTT-CTCGCTTTTGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Discosia_sp._2_KT_2010_AB5947881 GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAGCCTACCTGGTACCTACCCTGGAGCAGCTACCCTGTAGCTACCCTGGAGCGGGCTACCCTGTAACGTCCTGCCGGTGGACCTTTAAACTCTTGTTATTTTATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGTAATATCCTCTGAGCGTAGTAATTTTTTT-CTCGCTTTTGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Discosia_sp._3_KT_2010 GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAACCTACCCGGTACCTACCCTGGAGCGGCTACCCTGTAGCTACCCTGGAGCGGGCTACCCTGTAACGTCCTGCCGGTGGACCTTTAAACTCTTGTTATTTTATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATATAACGGCGGATCTGTAATATCCTCTGAGCGTAGTAAATTTTTT-CTCGCTTTGGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Discosia_sp._1_KT_2010 GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAACCTACCCGGTACCTACCCTGGAGCGGCTACCCTGTAGCTACCCTGGAGCGGGCTACCCTGTAACGTCCTGCCGGTGGCCCTTTAAACTCTTGTTATTTTATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGTAATATCCTCTGAGCGTAGTAAATTTTTT-CTCGCTTTGGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Discosia_sp._4_KT_2010 GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAACCTACCCGGTACCTACCCTGGAGCGGCTACCCTGTAGCTACCCTGGAGCGGGCTACCCTGTAACGTACTGCCGGTGGACCTTTAAACTCTTGTTATTTTATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGTAATATCCTCTGAGCGTAGTAATTTTTTT-CTCGCTTTGGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Discosia_sp._R158_ GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAACCTACCCGGTACCTACCCTGGAGCGGCTACCCTGTAGCTACCCTGGAGCGGGCTACCCTGTAACGTCCTGCCGGTGGACCTTTAAACTCTTGTTATTTTATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATATAACGGCGGATCTGTAATATCCTCTGAGCGTAGTAAATTTTTT-CTCGCTTTGGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAG??????????????????????? Discostroma_sp._E000535628 GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATT-GTTGCCTCGGCAGAACCTACCCGGTACCTACCCTGTAACACCTACCCTGTAGCTACCCGGGAACGGCCTACCCTGTAGCGCGCTGCCGGTGGACTTCTAAACTCTTGTTATTT-ATTGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAGTCTACTGTATTGTAGCTCCCCAAATCCAACGGCGGATCTGTGGTATCCTCTGAGCGTAGTAATTTTTTT-CTCGCTTTGGCTAGGTGCTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Discosia_sp._1_KT2010 GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAGCCTACCCGGTACCTACCCTGGAGCAGCTACCCTGTAGCTACCCTGGAGCGGGTTACCCTGTAGCGTCCTGCCGGTGGACCTTTAAACTCTTGTTATTTTATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATATAACGGCGGATCTGTAATATCCTCTGAGCGTAGTAATTTTTTT-CTCGCTTTGGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Discosia_sp._KT2188_genes GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAGCCTACCCGGTACCTACCCTGGAGCAGCTACCCTGTAGCTACCCTGGAGCGGGTTACCCTGTAGCGTCCTGCCGGTGGACCTTTAAACTCTTGTTATTTTATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATATAACGGCGGATCTGTAATATCCTCTGAGCGTAGTAATTTTTTT-CTCGCTTTGGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Adisciso_yakushimense GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAGCCTACCCGGTACCTACCCTGGAGCAGCTACCCTGTAGCTACCCTGGAGCGGCCTACCCTGTAGCGTCCTGCCGGTGGACCTTTAAACTCTTGTTATTTTATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATATAACGGCGGATCTGTAATATCCTCTGAGCGTAGTAATTTTTTT-CTCGCTTTGGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Discosia_sp._6KT2010 GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAGCCTACCTGGTACCTATTTCGGAGCAGCTACCCTGTAGCTACCCTGTAACGGGCTACCCTGTAACGTCCTGCCGGTGGACCTTTAAACTCTTGTTATTTTATAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATACAACGGCGGATCTGTAATATCCTCTGAGCGTAGTAATTTTTTT-CTCGCTTTGGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA Seimatosporium_azaleae GATCATTACAGAGTTATCTAACTCCCAAACCCATGTGAACTTACCATTTGTTGCCTCGGCAGAGGCTACCCGGTACCTACCCTGGAGCAGCTACCCTGTAGCTACCCTGGAACGGCCTACCCTGTAGCGTCCTGCCGGTGGACCTTTAAACTCTTGTTATTTTAAAGTAATCTGAGCGTCTTATTTTAATAAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCATTAGTATTCTAGTGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTTCAACCCTTAAGCCTAGCTTAGTGTTGGGAATCTACTGTATTGTAGTTCCTGAAATATAACGGCGGATCTGTAATGTCCTCTGAGCGTAGTAATTTTTTTCCTCGCTTTGGTTAGGTGTTGCAGCTCTCAGCCGCTAAACCCCCCAATTTTAATGGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAA ; END; BEGIN TREES; Title 'Group8_ML'; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Fungus_sp._F4886____, 2 Robillarda_sessilis_CY187, 3 Fungus_sp._RFLP29, 4 Robillarda_sessilis_BCC13393, 5 Discostroma_tricellulare_FG11, 6 Amphisphaeriaceae_sp._9BS21, 7 Discosia_sp._SW_2w_D02, 8 Discosia_sp._KL_2w_H09, 9 Discosia_sp._SW_2w_A10, 10 Discosia_sp._KL_2w_G06, 11 Discosia_sp._KL_2w_B11, 12 Discosia_sp._AC_2w_E12, 13 Discosia_sp._AC_2w_A05, 14 Discosia_sp._AC_2w_G10, 15 Discosia_sp._AC_2w_F09, 16 Discosia_sp._KL_2w_A03, 17 Discosia_sp._AC_2w_E02, 18 Discosia_sp._OS_2w_F08, 19 Discostroma_tricellulare_JZ171, 20 Discostroma_tricellulare__, 21 Amphisphaeria_sp._Kobayashi, 22 Amphisphaeria_sp._MAFF235878_, 23 Discosia_sp._HKUCC_6626, 24 Discostroma_fuscellum__, 25 Seiridium_banksiae_CBS, 26 Discosia_sp._2_KT_2010, 27 Discosia_sp._2_KT_2010_AB5947881, 28 Discosia_sp._3_KT_2010, 29 Discosia_sp._1_KT_2010, 30 Discosia_sp._4_KT_2010, 31 Discosia_sp._R158_, 32 Discostroma_sp._E000535628, 33 Discosia_sp._1_KT2010, 34 Discosia_sp._KT2188_genes, 35 Adisciso_yakushimense, 36 Discosia_sp._6KT2010, 37 Seimatosporium_azaleae; TREE bestREP1 = (23:0.00766261,(11:0.00185142,((8:1.0E-8,7:1.0E-8):1.0E-8,(((30:1.0E-8,13:1.0E-8):1.0E-8,(12:1.0E-8,(((((18:1.0E-8,15:1.0E-8):1.0E-8,14:1.0E-8):0.00185442,16:0.00376409):1.0E-8,9:1.0E-8):1.0E-8,10:1.0E-8):1.0E-8):1.0E-8):1.0E-8,17:0.00372157):0.00187216):1.0E-8):0.00184889,((((36:0.01142631,(((19:0.01957651,((((2:0.0069002,1:0.00288367):0.00339467,(4:1.0E-8,6:0.00184715):0.00399341):1.0E-8,3:1.0E-8):1.0E-8,5:1.0E-8):1.0E-8):0.02306769,(25:0.04571847,(24:0.01515519,32:0.0079231):0.0121189):0.02390945):0.01137222,(27:1.0E-8,26:1.0E-8):1.0E-8):0.00203342):0.00375489,((34:1.0E-8,33:1.0E-8):0.00184315,(35:1.0E-8,(37:1.0E-8,20:1.0E-8):0.00791738):0.00197745):0.00209575):0.00188578,(21:1.0E-8,22:0.00185723):0.01319692):0.00196977,(29:0.00374905,(28:1.0E-8,31:1.0E-8):1.0E-8):0.00185849):1.0E-8); END; BEGIN MESQUITECHARMODELS; ProbModelSet * UNTITLED = 'Jukes-Cantor': 1 - 547; END; BEGIN CODONS; CODESET * UNTITLED = universal: 1 - 547; END; BEGIN ASSUMPTIONS; TYPESET * UNTITLED = unord: 1 - 547; END; Begin MESQUITE; MESQUITESCRIPTVERSION 2; TITLE AUTO; tell ProjectCoordinator; timeSaved 1383828914633; getEmployee #mesquite.minimal.ManageTaxa.ManageTaxa; tell It; setID 0 5350676178700849380; endTell; getEmployee #mesquite.charMatrices.ManageCharacters.ManageCharacters; tell It; setID 0 7455828663872285451; mqVersion 275; checksumv 0 3 1408472675 null getNumChars 547 numChars 547 getNumTaxa 37 numTaxa 37 short true bits 15 states 15 sumSquaresStatesOnly 478928.0 sumSquares 478928.0 longCompressibleToShort false usingShortMatrix true NumFiles 1 NumMatrices 1; mqVersion; endTell; getWindow; tell It; suppress; setResourcesState false false 244; setPopoutState 400; setExplanationSize 0; setAnnotationSize 0; setFontIncAnnot 0; setFontIncExp 0; setSize 1026 720; setLocation 8 22; setFont SanSerif; setFontSize 10; getToolPalette; tell It; endTell; desuppress; endTell; getEmployee #mesquite.minimal.ManageTaxa.ManageTaxa; tell It; showTaxa #5350676178700849380 #mesquite.lists.TaxonList.TaxonList; tell It; setTaxa #5350676178700849380; getWindow; tell It; newAssistant #mesquite.lists.DefaultTaxaOrder.DefaultTaxaOrder; newAssistant #mesquite.lists.TaxonListCurrPartition.TaxonListCurrPartition; setExplanationSize 30; setAnnotationSize 20; setFontIncAnnot 0; setFontIncExp 0; setSize 782 653; setLocation 8 22; setFont SanSerif; setFontSize 10; getToolPalette; tell It; setTool mesquite.lists.TaxonList.TaxonListWindow.ibeam; endTell; endTell; showWindow; getEmployee #mesquite.lists.ColorTaxon.ColorTaxon; tell It; setColor Red; removeColor off; endTell; getEmployee #mesquite.lists.TaxonListAnnotPanel.TaxonListAnnotPanel; tell It; togglePanel off; endTell; endTell; endTell; getEmployee #mesquite.trees.BasicTreeWindowCoord.BasicTreeWindowCoord; tell It; makeTreeWindow #5350676178700849380 #mesquite.trees.BasicTreeWindowMaker.BasicTreeWindowMaker; tell It; suppressEPCResponse; setTreeSource #mesquite.trees.StoredTrees.StoredTrees; tell It; setTreeBlock 1; toggleUseWeights off; endTell; setAssignedID 12087.1383827100206.3174710469100874736; getTreeWindow; tell It; setExplanationSize 30; setAnnotationSize 20; setFontIncAnnot 0; setFontIncExp 0; setSize 782 653; setLocation 8 22; setFont SanSerif; setFontSize 10; getToolPalette; tell It; endTell; setActive; getTreeDrawCoordinator #mesquite.trees.BasicTreeDrawCoordinator.BasicTreeDrawCoordinator; tell It; suppress; setTreeDrawer #mesquite.trees.SquareTree.SquareTree; tell It; setNodeLocs #mesquite.trees.NodeLocsStandard.NodeLocsStandard; tell It; branchLengthsToggle off; toggleScale on; toggleBroadScale off; toggleCenter on; toggleEven on; endTell; setEdgeWidth 6; orientUp; setCornerMode Right_Angle 50; endTell; setBackground White; setBranchColor Black; showNodeNumbers off; showBranchColors on; labelBranchLengths off; centerBrLenLabels on; showBrLensUnspecified on; showBrLenLabelsOnTerminals on; setBrLenLabelColor 0 0 255; setNumBrLenDecimals 6; desuppress; getEmployee #mesquite.trees.BasicDrawTaxonNames.BasicDrawTaxonNames; tell It; setColor Black; toggleColorPartition on; toggleShadePartition off; toggleShowFootnotes on; toggleNodeLabels on; toggleCenterNodeNames off; toggleShowNames on; namesAngle ?; endTell; endTell; setTreeNumber 1; setTree '(((24:0.01515519,32:0.0079231):0.0121189,((19:0.01957651,((((2:0.0069002,1:0.00288367):0.00339467,(4:1.0E-8,6:0.00184715):0.00399341):1.0E-8,3:1.0E-8):1.0E-8,5:1.0E-8):1.0E-8):0.02306769,((27:1.0E-8,26:1.0E-8):1.0E-8,(36:0.01142631,(((34:1.0E-8,33:1.0E-8):0.00184315,(35:1.0E-8,(37:1.0E-8,20:1.0E-8):0.00791738):0.00197745):0.00209575,((21:1.0E-8,22:0.00185723):0.01319692,((29:0.00374905,(28:1.0E-8,31:1.0E-8):1.0E-8):0.00185849,(23:0.00766261,(11:0.00185142,((8:1.0E-8,7:1.0E-8):1.0E-8,(((30:1.0E-8,13:1.0E-8):1.0E-8,(12:1.0E-8,(((((18:1.0E-8,15:1.0E-8):1.0E-8,14:1.0E-8):0.00185442,16:0.00376409):1.0E-8,9:1.0E-8):1.0E-8,10:1.0E-8):1.0E-8):1.0E-8):1.0E-8,17:0.00372157):0.00187216):1.0E-8):0.00184889):1.0E-8):0.00196977):0.00188578):0.00375489):0.00203342):0.01137222):0.02390945):0.022859235,25:0.022859235);'; setDrawingSizeMode 0; toggleLegendFloat on; scale 0; toggleTextOnTree off; showWindow; endTell; desuppressEPCResponse; getEmployee #mesquite.trees.ColorBranches.ColorBranches; tell It; setColor Red; removeColor off; endTell; getEmployee #mesquite.ornamental.BranchNotes.BranchNotes; tell It; setAlwaysOn off; endTell; getEmployee #mesquite.ornamental.ColorTreeByPartition.ColorTreeByPartition; tell It; colorByPartition off; endTell; getEmployee #mesquite.ornamental.DrawTreeAssocDoubles.DrawTreeAssocDoubles; tell It; setOn on; setDigits 4; writeAsPercentage off; toggleCentred on; toggleHorizontal on; toggleWhiteEdges on; setFontSize 10; setOffset 0 0; endTell; getEmployee #mesquite.ornamental.DrawTreeAssocStrings.DrawTreeAssocStrings; tell It; setOn on; toggleCentred on; toggleHorizontal on; setFontSize 10; setOffset 0 0; endTell; getEmployee #mesquite.trees.TreeInfoValues.TreeInfoValues; tell It; panelOpen false; endTell; endTell; endTell; getEmployee #mesquite.charMatrices.BasicDataWindowCoord.BasicDataWindowCoord; tell It; showDataWindow #7455828663872285451 #mesquite.charMatrices.BasicDataWindowMaker.BasicDataWindowMaker; tell It; getWindow; tell It; getTable; tell It; rowNamesWidth 234; endTell; setExplanationSize 30; setAnnotationSize 20; setFontIncAnnot 0; setFontIncExp 0; setSize 782 653; setLocation 8 22; setFont SanSerif; setFontSize 10; getToolPalette; tell It; endTell; setTool mesquite.charMatrices.BasicDataWindowMaker.BasicDataWindow.arrow; colorCells #mesquite.charMatrices.ColorByState.ColorByState; tell It; setStateLimit 9; toggleUniformMaximum on; endTell; colorRowNames #mesquite.charMatrices.TaxonGroupColor.TaxonGroupColor; colorColumnNames #mesquite.charMatrices.CharGroupColor.CharGroupColor; colorText #mesquite.charMatrices.NoColor.NoColor; setBackground White; toggleShowNames on; toggleShowTaxonNames on; toggleTight off; toggleThinRows off; toggleShowChanges off; toggleSeparateLines off; toggleShowStates on; toggleAutoWCharNames off; toggleAutoTaxonNames off; toggleShowDefaultCharNames off; toggleConstrainCW on; toggleBirdsEye off; toggleShowPaleGrid off; toggleShowPaleCellColors off; togglePaleInapplicable on; toggleShowBoldCellText off; toggleAllowAutosize off; toggleColorsPanel off; toggleLinkedScrolling on; toggleScrollLinkedTables off; endTell; showWindow; getWindow; tell It; forceAutosize; endTell; getEmployee #mesquite.charMatrices.ColorCells.ColorCells; tell It; setColor Red; removeColor off; endTell; getEmployee #mesquite.categ.StateNamesStrip.StateNamesStrip; tell It; showStrip off; endTell; getEmployee #mesquite.charMatrices.AnnotPanel.AnnotPanel; tell It; togglePanel off; endTell; getEmployee #mesquite.charMatrices.CharReferenceStrip.CharReferenceStrip; tell It; showStrip off; endTell; getEmployee #mesquite.charMatrices.QuickKeySelector.QuickKeySelector; tell It; autotabOff; endTell; getEmployee #mesquite.charMatrices.SelSummaryStrip.SelSummaryStrip; tell It; showStrip off; endTell; getEmployee #mesquite.align.AlignToDropped.AlignToDropped; tell It; gapCosts 8 3 2 2; subCosts 10 5 10 10 10 5 5 10 10 10 5 10; endTell; getEmployee #mesquite.molec.ColorByAA.ColorByAA; tell It; emphasizeDegeneracy off; endTell; getEmployee #mesquite.molec.SequenceInfoEditor.SequenceInfoEditor; tell It; panelOpen false; endTell; endTell; endTell; endTell; end;