NEXUS [File created by TreeBASE: 7/26/07 21:10:45] [Matrix accession#: M2591] BEGIN TAXA; TITLE M2591; DIMENSIONS NTAX=47; TAXLABELS Ascidia_ahodori Ascidia_ceratodes Boltenia_villosa Botrylloides_violaceus Botryllus_planus Branchiostoma_floridae Chelyosoma_siboja Ciona_intestinalis Ciona_savignyi Cnemidocarpa_finmarkiensis Corella_inflata Dendrodoa_grossularia Doliolum_nationalis Feylinia_grandisquamis Galeocerdo_cuvier Halocynthia_igaboja Halocynthia_roretzi Herdmania_curvata Homo_sapiens Megalodicopia_hians Metandrocarpa_taylori Molgula_arenata Molgula_bleizi Molgula_citrina Molgula_complanata Molgula_manhattensis Molgula_occulta Molgula_oculata Molgula_pacifica Molgula_provisionalis Molgula_pugetiensis Molgula_retortiformis Oikopleura_dioica Pelonaia_corrugata Perophora_sagamiensis Petromyzon_marinus Phallusia_mammilata Polycarpa_papillata Polycarpa_pomaria Pyrosoma_atlanticum Pyura_haustor Ranodon_sibiricus Styela_gibbsii Styela_montereyensis Styela_plicata Symplegma_viride 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Cnemidocarpa_finmarkiensis 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Corella_inflata 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Dendrodoa_grossularia 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Doliolum_nationalis 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Feylinia_grandisquamis 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Galeocerdo_cuvier 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Halocynthia_igaboja 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Halocynthia_roretzi --------------------TAGTGATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCAGGTCTAAGTACGAGTTGTC--GTAAAGCGAAACTGCGAACGGCTCATTAAATCAGTCTTGGTTTATTTGGTCTTGTG---TTGCAA-GTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCGT--AA-GCGCCGACTC--CGGG----AGG----CGTGCTTTTATCA-GATCAAAA-CCGACCGGGCTC----------------GCCCGAGACGT-TTGATGACTCTGGATAACCA----CGCGGATCGTATGGTCTCTGTACCGACGACGAATCATTCAAGTGTCTGCCC-TATCAACTTTCGAAGGTAGCTTACGTGCCTACC----TTTGTGATAA--CGGGTGAC-GGAGAATCAGGGTTTGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATC-CAAGGAAGGCAGCAGGCGGGCAAATTACCCATTCCCGACACGGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACAGGACTCTAA-CGAGTCCCTGTAATTGGAATGAGTACATTCTAAACCCTTTAACGAGTATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAACAGTGTATGCTAAAGTTGTTGCGGTTGAAAAGCTCGTAGTTGGATCTTGG-GTGGGTGCAGCCGGTCCGTCGCAAGGCGTG-CACTGGCTGCGCTCGCCTCGC--CTT-CGGTTCTCCGTCGGTGCTCTTGACTGAGTGTCGG--CGGTGGCCGATAAGTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCTGC-T--CGCCTGAATAGTGTTGCATGGAATAATGGAATAGGACCTCGGTTCTATTTT-GTTGGTTTTCGGAG-CGCGAGGTAATGATTAAGAGGGACAGACGGGGGCGTCCGTACTCTGCCGTTAGAGGTGAAATTCTTGGATCGGCGGAAGACGAACTACTGCGAAAGCATTCGCCAAGAATGTTTTCTTTAATCAAGAGCGAAAGTCAGAGGTTCGAAGACGA-TCAGATACCGTCCTAGTTCTGACTATAAACGATGCCAACTAGCGATCGGGAGG--CGTTACCATGACGACCTTCCCGGCAGCTTCCGGGAAACCAAAGTCTTTCGGTTCCGGGGGAAGTATGGTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCCGGCCCGGACACAGGTAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGACTCTGGCTTGCTAAATAGTTACGCGACCTTCT--CGGTCGGCGTCT---AACTTCTTAGAGGGACTAGTGGCGCTTAGCCACACGAGATTGAGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCGGG-CCGCACGCGCGCTACACTGAATGGATCAGCGAGTGA----ATGCCCTAGGCCGAAAGGTCCGGGTAACCCGTTGAACCCCATTCGTGATTGGGATAGGG-ACTTGCAATTGTTTCCCTTGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCAAGTCATCAACTTGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGTTTAGTGAGATCCTTGGATTGGCCCCTT-CGCGGTCGGC---AACGGCCGCGGCGGCGAGCC-GAGAAGACGATC-AAACTTGATC--ATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACA------------------------------------ Herdmania_curvata 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Homo_sapiens 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Megalodicopia_hians 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Metandrocarpa_taylori 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Molgula_arenata 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Molgula_bleizi 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Molgula_citrina 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Molgula_complanata 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Molgula_manhattensis 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Molgula_occulta 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Perophora_sagamiensis 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Petromyzon_marinus 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Phallusia_mammilata 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Polycarpa_papillata 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Polycarpa_pomaria 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Pyura_haustor 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Ranodon_sibiricus 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Styela_gibbsii 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Styela_montereyensis 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Styela_plicata NATCTGGTTGATCCTGCCAGTAGTGATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCAGGTGCAAGTACGAGTTGTC--GTAAAGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTCTTGGTTTATTTGGTCTCGAA---AGCTAA-GTGGATAACTGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCATT-AA-GCGCCGACTT--CGGG----AGG----CGCGCTTTTATCA-GATCAAAA-CCGACCGGGTTC----------------GCCCGTGACGT-TTGATGACTCTGGATAACCA----CGCGGATCGTACGGTCTCTGCACCGACGACGTATCATTCAAGTGTCTGCCC-TATCAACTGTCGAAGGTACGCTACTTGCCTACC----TTTGTGATAA--CGGGTAAC-GGGGAATCAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATC-CAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCATTCCCGACACGGGGAGGTAGTGACGAAAAATAACAATACAGGACTCTAA-CGAGGCCCTGTAATTGGAATGAGTACATCCTAAAACTCTTAACGAGTATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAACAGTGTATGCTAAAGTTGTTGCGGTTGAAAAGCTCGTAGTTGGATTTTGG-GCGAGCGCAGCCGGTCCGTCGCAGGGCGTGTTACTGGTTGCGTTCGCCTCAC--CTT-CGGTTCTCCGTCGGTGCTCTTGACTGAGTGTCGG--CGGTGGCCGATAAGTTTACTTTGAAAAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCTGC-T--CGCCTGCATAGTGTTGCATGGAATAATGGAATAGGACCTCGGTTCTATTTT-GTTGGTTTTCGGAG-CACGAGGTAATGATTAAGAGGGACAGACGGGGGCGTCCGTACTCTGCCGTTAGAGGTGAAATTCTTGGATCGGCGGAAGACGAACTACTGCGAAAGCATTCGCCAAGAATGTTTTCTTTAATCAAGAGCGAAAGTCAGAGGTTCGAAGACGA-TCAGATACCGTCCTAGTTCTGACTATAAACGATGCCAACTAGCGATCGGGAGG--CGTTACCATGACGACCTTTCCGGCAGCTTCCGGGAAACCAAAGTCTTTGGGTTCCGGGGGAAGTATGGTTGCAAAGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGAGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGGAAACTCACCCGGCCCGGACACAGGTAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGAGCGATTTGTCTGGTTAATTCCGATAACGAACGAGACTCTGGCATGCTAAATAGTTACGCGACCTTCT--CGGTCGGCGTCT---AACTTCTTAGAGGGACTAGTGGCGTTTAGCCACACGAGATTGAGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTCCGGGGCCGCACGCGCGCTACACTGAGTGAAGCAGCGAGTGT----CTAACCTAGGCCGAAAGGTCCGGGTAACCCGTTGAACCTCATTCGTGATTGGGATAGGG-ACTTGCAATTGTTTCCCTTGAACGAGGAATTCCCAGTAAGCGCAAGTCATCAACTTGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGTTTAGTGAGATCCTTGGATCGGCCCCGT-CGCTGCCGGC---AACGGC-GCGTCGGCGTGTC-GAGAAGACGATC-AAACTTGATC--ATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGT---------------------------------------- Symplegma_viride 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Thalia_democratica 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