NEXUS
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[Matrix accession#: M2592]

BEGIN TAXA;
	TITLE M2592;
	DIMENSIONS  NTAX=19;
	TAXLABELS
		Symplegma_viride	Styela_plicata	Styela_montereyensis	Styela_gibbsii	Pyura_haustor	Polycarpa_pomaria	Polycarpa_papillata	Metandrocarpa_taylori	Halocynthia_roretzi	Halocynthia_igaboja	Doliolum_nationalis	Dendrodoa_grossularia	Cnemidocarpa_finmarkiensis	Ciona_savignyi	Ciona_intestinalis	Botryllus_schlosseri	Botryllus_planus	Botrylloides_violaceus	Boltenia_villosa
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M2592;
	DIMENSIONS NCHAR=451;
	FORMAT MISSING = N GAP = - DATATYPE = DNA ;
	MATRIX
		Symplegma_viride                 --TTTTTTTTTGTTTGGGGG---GAAATGAGGTTTTGAAGGGCGACCGTAATTACCAATTTTTTAAGTGTTATCCCCGGGTATAGAAGAGATATTGTTAATTGAATTTGAAGAAGGTATTCTGTGAGAGGGCCAACCCTTACTCGGTTTTATACTTTTCACTTTCTTTTTCCATTTGTTATTGTTGTTTTAAGTTTATTACATTTAATTTTTCTCCATCGAACAGGAAGCTCTAACCCTATTCAAATATCTTCAGTTTCCTTGAAAATAAATTTTTGGCCCTATAGCAGGGTGAAAGATCTTTTAAGATTTTTTATAGTTTTCTTATTTTTTTTCTGTGTAGTGTTTTTCTATCCTACTGTGTTTATGGATCCTGAGAATTTTATAAAGGCTAACCCTATGGTGACTCCGGTACACATTAAGCTT--------------------------
		Styela_plicata                   -GTTTTTTTTTGTTTGGGGG---CAAATGAGGTTTTGGGGGGCTACAGTCATCACTAATTTTTTAAGTGTTATTCCCTTTTATAGGAATGAAATTGTTACCTGGATTTGGGGGAGATTTTCCGTGGGTGGCCCAACCCTTAGTCGTTTCTATACTTTTCATTTTGTTGTTCCATTTCTTATTATTGTGTTTTCTTTGGTACATCTTTTGTTTTTACATCGTATAGGTAGTTCTAACCCTCTACAATTGAGTTCTAATTCTATAAAGATTAATTTTTGGCCTTATAGTGGAATTAAGGATTTAGTTTGGTTTTTGTTTATTTTTACCTTGTTTTTTTGTATTGTGTTTTTTTTTCCTCAGGTGTTGTGATTCCCACGAATATTATATTCAGGCTTGTCCAATAGTACTCATATCATATTTGCCCG---------------------------
		Styela_montereyensis             GTTTTTTTTTTGTTTGAGGGCACCATCAGTGGTTTTGAAGGGCAACAGTTATTACTAATTTTTTAAGTGTAATTCCCATTTATTGAGTTGAAATTGTATATTGAATTTGAAGAAGATTTTCGGTAGGTGCTCCAACTTTAAGTCGATTTTATACTTTCCATTTTATTTTACCTTTTATTATTATTGTTTTTTCAATTATTCATTTATTATTTTTACATCGAAAAGGAAGCAGTTATCCTTTATTATTAAATTCTTATAATTTATTTTTGGCCTTTTTGTGGTATTTAGGATTTTGTGATCTCTTGATTTTTTTTTATATTTTCATTTTTTTTTCTTATTGTATTTTTTTATCCTTATATTTTTTGTGATCCCCGCGAAAATTACATTCAAGCTTATCCAATTGTACTCATATCATATTAGCCCG---------------------------
		Styela_gibbsii                   -GTTTTTTTTTGTTTGAGGGCATCATCAATGGTTTTGAAGGGCTACAGTTATTGCTAATTTTTTAAGTGTTATTCCCATTTATAGGATTGAAATTGTATACTGAATTTGAAGGTGATTTTCCGTAGGTGCTCCAACTATAAGTCGATTCTATACTTTCCATTTTATTTTTCCTTTTATTATTATTGTCTTTTCAATTATTACTTTATTGTTTTTACATCGTATAGGAAGTAGTAATCCTCTATTATTAAATTCTAATAATTTATTTTTGGCCTTTTTGTGGTATTTAGGATTTTGCGATCTTTTGATTTTTTTTTATATTTACATTGTTTTTTCTTATTGTATTTTTTTATCCTTATGTTTTTTGTGATCCCCGCGAAAATTATATTCAAGCTTATCCAATAGTACTCATATCATATTAGCCCG---------------------------
		Pyura_haustor                    ----GTTTTTT---TGAGGG---CAAAGAGGTTTTGAAGAGTCT---GTGATCCCAAATTTATTAAATCCTATCCCTTTTATTGGAGGTGATACTGTTAATTGGGCTTGGAGGGGCTTTTTTGTTGGAGGGGCAACTTTAACCCGATTTTATACTTTTCATTTCCTTTTCCCATTTATTTTAGTGGTTCTTTCTATACTTCACTTAGTTTTTTTACATGAGGGTAGAAGTAGCAACCCACTAAAAAGAACTAACAATAGTTTTAAGGTGTGGTTTTGACCTTATAATGGAGTTAAAGACATATTCAGATTATTGTTTATTTTAATTAGATTGGTCTTTGTTGTTTTTTTTTTTCCTAACTTGTTAACAGATCCAGAAAACTATATGTCAGAGAATCCATCGTACTCCTACCCTCCCTTAAACCCGTT------------------------
		Polycarpa_pomaria                GTTTTTTTTTT---TGGGGG---CAAATGAGGTTTTGAAGAGCAACTGTGATTAGTAATTTTTTAAGTGTAATCCCTGTTTATGGTGTAGATATTGTGATATGGGTATGGAGAGGTTTTTCTGTTGGAAGACCTACTTTAACTCGTTTTTATACTTTTCATTTTTTGTTTCCGTTCTTAATTATTGTTTTTAGTTTGTTGCATTTGGTTTTTTTGCATCGTAAAAGGAGTAGAAATCCTTTAAAGTTAAGTTCATCCACCTTAAAAATATATTTTTGGCCTTATAGTAGAGTAAAGGATTTATTAGGTTTTTTTATGGTTTTTGGTCTCTTTTTTATTAGAGTACTTTTATTACCTGTTTATTTAAGGGATCCAGAAAATTATATAATAGCTAATCCTTTGGTACACCAATTCATTTTTAACCTGTT------------------------
		Polycarpa_papillata              -TTTTTTTTTT---TGGGGG---CAAATGAGGTTTTGAGGGGCTACTGTTATTACAAATTTTTTGAGTGTTATTCCTTATTACGGAAGAGATATTGTAAATTGAATTTGAGGGGGGTTTTCTGTGGGTTCTCCTACTTTAACTCGGTTCTATACTTTTCATTTTTTGTTTCCTTTTTTGATTATCGTTTTTAGTTTAGTTCATTTGGTTTTTTTACATCGAACTGGGAGTTCTAATCCTCTTAAGTTAAGTTCTAGTTCTTTGAAAATAAGTTTTTGGCCGTATAGCGGGGTAAAAGATATGTTAAGGTTTTTGTTGGTGTTTTTGCTTTTTTTTTTTGTGGTTTTGTTTTTACCGACTGTTTTTGGTGACCCAGAAAATTTTATAAAGGCTAATCCCATGGTGACTCCCGTACACATTAAGGTCTGTGG---------------------
		Metandrocarpa_taylori            -TTTTTTTTTT---TGGGGG---CAAATGAGGTTTTGAAGGCCAACCGTTATTACCAATTTTTTAAGTTTTATCCCCGGGTATAGAAGAGATATTGTTAATTGAATTTGAAGAAGGTATTCTGTTAGAGGTCCAACCCTTACTCGGTTTTATACTTTTCACTTTCTTTTCCCATTCGTTATTGTAGTTTTAAGTTTATTACATTTAATTTTCCTCCATCGAACAGGAAGCTCTAATCCTATTCAAGTTTCTTCAGTTTCCTTAAAAAAAAATTTTTGGCCCTACAGCAGGGTGAAAGATGTTTTAAGATATTTTGTAGTTTTCTTATTTTTTTTCTGTGTAGCGTTTTTCTATCCTACTGTGTTTATGGATCCTGAGAATTTTATAAAGAGTAACCCTATGGTCACTCCGGTACACATAGTGGTT--------------------------
		Halocynthia_roretzi              -ATTTTTTTTT---TGGGGC---CAAATGAGGTTTTGGCGTGGTACCGTAATTACTAATATGTTGAGTGCGGTTCCATACTATGGTGGTGACATTGTAATGTGAGTTTGAGGTGGTTTCTCTGTGGGGGCTCCAACTTTAACTCGATTTTACACGTTTCATTTTGTATTACCATTTGTTTTAGTGTTTTTATCTTTGATTCATTTATTTTTTTTGCATGAGGCAGGAAGTAGTAAACCCCTGAAAGTTAATTCAACTAGGTTTAAAATTAGTTTTTGACCTTATTTTAGGATTAAGGACGTGGTTGGGTTTTATAGTAGTTTTTTTTATTTTCTTTGGGTTTTTGTTGGGTTCTTAGATAGTTTAGGTGATCCTGAAAATTATATCGAGGCATTATCCTCTGAGGTGACCACTTCTGCT--------------------------------
		Halocynthia_igaboja              --TTTTTTTTT---TGGGGG---CAAATGAGGTTTTGGGGTGCTACCGTAATTACTAATATGTTGAGTGCGGTTCCATACTATGGTGGTGACATTGTAATGTGGGTTTGAGGTGGTTTCTCTGTGGGGGCTCCAACTTTAACTCGATTTTACACGTTTCATTTTGTATTACCATTTGTTTTAGTGTTTTTATCTTTGATTCATTTATTTTTTTTGCATGAGGCAGGAAGTAGTAACCCACTGAAAGTTAATTCAACAAGGTTTAAAATTAGTTTTTGACCTTATTTTAGGATTAAGGACGTGTTGGGTTTTATAGTAGTTTTTTTTATTTTAGTGATTTTTGTTGGGTTTTTACCAGATAGTTTAGGTGATCCTGAGAATTATATTGAGGCATTATCCTCTGAGGTGACTACCAGTGCATACTGACCGT----------------------
		Doliolum_nationalis              -CGTACTCCCC---TGAGGT---CAAATAAGCTATTGGGCAGCCACTGTAATCACTAACCTACTAAGTGTCGTTCCT---TATAGACCTGCCTTCGTTGAATGAGTGTGAAGAGGGTTCTCTGTAAACAACCCTACTCTAATACGGTTTTATACTCTACACTTCCTTTTCCCTTTTGTTCTAGCTTTCTTGTCTCTTCTTCATCTAGTGTTTATTCATGATTTCACTTCTAGGCACCCACTAAGGAGGTTCAGC---GCCAAGAAGATCGACTTTTGGCCTTATTTTAGGGTGAAGGATATCTTTAGGTTTATGTTTATACTCCTAGCTCTCCTATTCCTAGTATTTTTCTTTCCGCAGATTATAAGAGACGTGGAGAACTATAAGGAGGCTAACCCTCTGGTAACCCCTGCTCACATTAAACCTGAATGGTACTTTTT------------
		Dendrodoa_grossularia            --TTTTTTTTT---TGGGGG---CAAATGAGGTTTTGAGGTGCTACTGTTATTACAAATTTTTTGAGTGTTATTCCTTTTTATGGTAATGATATTGTGATATGAATTTGAAGAGGTTTTTCTGTTAGAAGACCAACTCTTACTCGTTTTTACACTTTTCATTTTTTATTTCCGTTCTTAATTATTGTTTTTAGTCTTTTGCATTTAGTTTTTTTACATCGTGGGGGTAGTTCAAACCCCTTAAAGCTTACATCAAATATATCTAAAATGTACTTTTGACCATACAGCAGGATCAAAGATTTATTTGGTTTTTTTATAGTATTTAGGTTATATTTCCTTATTGTTTTATATTTGCCTAATTATTTTAGAGATCCTGAAAATTTTATAAAAGCTAATCCTATGGTACACCAGTACATATTAAAGCCTGT------------------------
		Cnemidocarpa_finmarkiensis       -TTTTTTTTTT---TGGGGG---CAAATGAGGTTTTGAAGGGCAACTGTGATTACAAATTTTTTAAGTGTTATCCCTGGGTATGGAAGAGATATTGTTAGTTGAATTTGAAGAGGTTTTTCTGTTGGAGGGCCAACTCTAACTCGTTTTTACACTTTTCATTTTTTGTTTCCGTTTGTAATTATTGTTTTTAGTTTTTTTCATTTAGTTTTTATTCATCGAAAAAGAAGCTCTAATCCTTTAAAATTTTCTTCAGTTACCTTAAAAATAAATTTTTGGCCTTATAGTAGAGTAAAAGATTTATTGAGATTTTTTTTAATTTTTTTATTTTTTTTCTGTATAGTGTTTTTCTTTCCTACTGTGTTTATGGATGCTGAAAACTTTATAAAAGCTAATCCTATAGTAACTCCTGTACATTTAGTGGTC--------------------------
		Ciona_savignyi                   -TGTTTTACCG---TGAGGT---CAGATAAGTTTTTGAAGAGCTACTGTAATTACAAATTTAATTACAGCTGTTCCTGTGTATAGGGAGGCTATTGTTAAATGATTATGGGGTGGATTCTCTGTTGAAAATCCTACTTTAAATCGATTTTATACTTTTCATTTTCTATTCCCATTTGTTATTGTTGCTTTATCAGTAGTACATTTATTTTTTATTCATATATTAGGTTCAAGCACTCCCTTAAGAACGTTTAGTAATACAATGAAATTGGATTTTTGACCTTACTATGGAGTAAAAGACATTTTTAGATTTAGTATCATTATTAGTAGTTTTATAATATTAGTAGGATTTTCTCCTGATTTATTTAGAGATCCTGAAAATTTTAAGAAAGCAAATTCTATGGTGACGCCGGTTCATATTAAACCAGAGTGATATTT---------------
		Ciona_intestinalis               -TGTTTTACCT---TGAAGA---CAAATAAGTTTTTGGAGAGCTACGGTTATTACTAATTTTGTAACTGCTATTCCAGTTTGAAGAGAACCTATTGTAAATTGATTATGAAGAGGATTTTCTGTAGATAACCCCACATTAAATCGATTCTATACATTTCATTTTTTATTCCCTTTTCTTATTATTGCCCTTTCAGTAGTTCATTTATTTTTTATTCATCAAACGAGATCTAGTAATCCTTTAAGAAATTTTAGTGATAATTTAAAACTAGATTTTTGACCTTATTATAGAGTAAAAGATATTTTAAGGATATTTTTAGCTCTTTTTTTTTTTTTGTTACTAGTAAGATTTTCACCTGATTTGTTTAGAGATGCAGAAAATTTTTTAAAAGCTAACTCCATAGTAACTCCAGTACATATTAAACCTGAGTGATAT-----------------
		Botryllus_schlosseri             --TTTTTTTTTGTTTGGGGG---GAAATGAGGTTTTGAAGGGCGACCGTAATTACCAATTTTTTAAGTGTTATCCCCGGGTATAGAAGAGATATTGTTAATTGAATTTGAAGAAGGTATTCTGTGAGAGGGCCAACCCTTACTCGGTTTTACACTTTTCACTTTCTTTTTCCATTTGTTATTGTAGTTTTAAGTTTATTACATTTAATTTTTCTCCATCGAACAGGAAGCTCTAACCCTATTCAAGTTTCTTCAGTTTCCTTGAAAATACATTTTTGGCCCTATAGCAGGGTGAAAGATGTTTTAAGATTTTTTGTAGTTTTCTTATTTTTTTTCTGTGTAGTGTTTTTCTATCCTACTGTGTTTATGGATCCTGAGAATTTTATAAAGGCTAACCCTATGGTAACTCCGGTACACATTAAGCTA--------------------------
		Botryllus_planus                 --TTTTTTTTTGTTTGGGGG---GAAATGAGGTTTTGAAGGGCGACCGTAATTACCAATTTTTTAAGTGTTATCCCCGGGTATAGAAGAGATATTGTTAATTGAATTTGAAGAAGGTATTCTGTGAGAGGGCCAACCCTTACTCGGTTTTACACTTTTCACTTTCTTTTTCCATTTGTGATTGTAGTTTTAAGTTTATTACATTTAATTTTTCTCCATCGAACAGGAAGCTCTAACCCTATTCAAGTTTCTTCAGTTTCCTTGAAAATACATTTTTGGCCCTATAGCAGGGTGAAAGATGTTTTAAGATTTTTTGTAGTTTTCTTATTTTTTTTCTGTGTAGTGTTTTTCTATCCTACTGTGTTTATGGATCCTGAGAATTTTATAAAGGCTAACCCTATGGTAACTCCGGTACACATTAAGC----------------------------
		Botrylloides_violaceus           --TTTTTTTTTGTTTGGGGG---GAAATGAGGTTTTGAAGGGCGACCGTAATTACCAATTTTTTAAGTGTTAACCCCGTGTATAGAACAGATATTGTTAATTGAATTTGAAGAAGGTATTCTGTGAGAGGGCCAACCCTTACTCGGTTATACACTTTTCACTATCTTTTTCCATTTGTTGTTGTAGTTTTAAGTTTATTACATTTAATTTTTCTCCATCGAACAGGAAGCTCTAACCCTATTCAAGTTTCATCAGTTTCCTTGACAATACATTTTTGGCACTATAGCAGGGTGAGAGATGTTCTAAGATACTTTGTAGTTTTCTTGTTTTTTTTCTGTGTAGCGTTTTTCTATCCTACTGTGTTTATGGATCCTGAGAATTTTATAAAGGCTAACCCTATGGTCACTCCGGTACACATTAAGCTA--------------------------
		Boltenia_villosa                 ----GTTTTTT---TGGGGG---CAAAGAGGTTTTGAAGAGTCT---GTGATCCCAAATTTATTAAGTGCTATCCCTTTTATTGGAGGTGATATTGTTTATTGGGTTTGGAGGGGCTTTTTTGTTGGAGGGGCAACTTTAACCCGATTTTATACTTTTCATTTTCTTTTCCCATTTATTTTAGTGGTTCTTTCTATACTTCATTTAGTTTTTTTACATGAGGGTAGAAGTAGCAATCCGTTAAAAAGAACTAATAATAGTTTTAAGGTTTGGTTTTGACCTTATAATGGAGTTAAAGATATATTTAGATTATTGTTTATTTTAATTAGGTTGGTCTTTGTTGTTTTTTTTTTCCCTAACTTGTTAACAGATCCAGAAAATTATATGTCAGCGAATCCATCGTACTCCTACCCACCCTTAAACCCGTT------------------------
	;
END;