#NEXUS [written Fri Dec 20 16:48:05 NZDT 2013 by Mesquite version 2.75 (build 564) at YuIto-PC/10.32.22.25] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=26; TAXLABELS Triglochin_striata Potamogeton_maackianus Syringodium_isoetifolium Ruppia_tuberosa_B1 Ruppia_tuberosa_B2 Ruppia_tuberosa_A1 Ruppia_tuberosa_A2 Ruppia_megacarpa Ruppia_maritima_B Ruppia_polycarpa_B Ruppia_maritima_F2 Ruppia_maritima_F1 Ruppia_polycarpa_A Ruppia_maritima_E1 Ruppia_maritima_E2 Ruppia_maritima_A Ruppia_maritima_B. Ruppia_maritima_B... Ruppia_maritima_G2 Ruppia_maritima_G1 Ruppia_maritima_B.. Ruppia_maritima_J2 Ruppia_cirrhosa_B1 Ruppia_cirrhosa_B2 Ruppia_maritima_K1 Ruppia_maritima_K2 ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE Character_Matrix; DIMENSIONS NCHAR=1039; FORMAT DATATYPE = DNA INTERLEAVE GAP = - MISSING = -; MATRIX Triglochin_striata CGTCTGCAGGCGTTGCCTGGTGGGGATATTAAGTTGCTTTGTGACACAGTAGTGGAGCACGTTAGGGGGCTGACTGGGTATGATAGAGTGATGGTGTATAAGTTCCATGAGGACGAGCACGGTGAGGTTGTTGCAGAGAGAAAACGGGACGATTTGGAACCATATCTTGGGCTTCATTATCCGGCCACCGATATACCGCAGGCATCGAGATTCTTGTTTAAGCAGAACAGAGTTAGGATGATAGCTGACTGTCGTGCAACTCATGTACGAGTTATTCAGGATGAAAACTTGATGCAGCCACTTTGCCTTGTAGGGTCCACATTACGAGCTCCTCATGGTTGCCACGCACAATACATGGCCAACATGGGATCCATCGCATCACTCGTTATGGCTGTTATTATCAATGGGGGTGAAGAGGAGAGTACAAGGAGCTCA-TGAAGTTGTGGGGTCTAGTTGTTTGTCACCATACTTCTCCAAGGTGCATCCCGTTTCCATTACGCTACGCTTGTGAATTTCTCATGCAAGCTTTTGGTCTTCAGCTGAACATGGAGCTCCAATTAGCTTTACAGTTATCTGAAAAGCGCATCTTGAGGACACAGACGCTTTTGTGGGATATGCTCCTTCGAGATTCACCCACCGGTATTGTCACTCAGAGCCCTAGTATAATGGATCTTGTTAGGTGTGATGGTGCAGCACTTTATTACCAAGGTAAGTATTGGCCGCTAGGCGTGACTCCATCAGAGTCACAAATTAAAGACTTGGTTGAATGGTTATTGGCAAGCCATGGCGACTCAACTGGATTGAGCACGGATAGTTTGGGAGATGCTGGATATCCTGGTGCAGCCTCACTTGGTGATGCAGTTTGTGGTATGGCTGTGGCATACATTACCCCTAGGGACTTCTTGTTCTGGTTTAGGTCACATACAGCTAAAGAAATCAAATGGGGGGGAGCGAAGCATCATCCAGAAGACAAGGATGATGGGCAAAGGATGCACCCTCGGACATCTTTTAATGCTTTTCTAGAAGTAGTGAAGAGAA Potamogeton_maackianus AGGTTGCAGGCGCTGCCTGGTGGGGATATCAATCTTTTATGTGACACAGTTGTGGACCATGTTAGGGAACTCACAGGATATCACAGGGTCATGGTCTACAAGTTCCATGAGGATGAACATGGCGAGGTTGTTGCAGAGAGTAAAAGGGACGACTTAGAACCATATATGGGTCTTCACTACCCTGCCACAGATATACCCCAAGCCTCAAGATTCTTGTTCAAACAAAATAGAGTTAGGATGATAGCAGATTGTCGTGCAACCCCTGTTCGAGTCATACAAGATGAGAATCTGATGCAACCACTTTGCCTTGTGGGTTCCACTCTACGAGCTCCCCATGGTTGCCATGCACAGTATATGGCCAACATGGGATCAATTGCATCTCTTGCCATGGCTGTAATTATCAATGGAGGTGAAGAAGAGGGTACGAAGAACTCGATGAAGTTATGGGGTCTCGTTGTTTGTCACCACACTTCTCCGAGGTTCATACCCTTCCCATTGCGGTATGCATGCGAGTTCCTTATGCAGGCTTTTGGCCTTCAGTTGAATATGGAACTCCAGTTGGCCTCCCAAATGTCTGAGAAGCATATCTTGAGAACCCAGACCCTTTTGTGCGATATGATCCTTCGAGATTCACCTACTGGAATTGTCACACAAAGCCCTAGCATAATGGATCTTGTGAAGTGTGACGGCGCAGCGCTTTATTACCATGGAAAGTATTGGCCACTAGGTGTAACTCCTTCAGAATCACAAATTAAGGATATCGTGGAATGGCTGTTGGCAACCCACGGAGACTCCACAGGCCTGAGCACAGATAGTTTGGCTGATGCCGGATACCCTAGTGCTGCATCACTTGGTGATGCTGTTTGTGGTATGGCTGTGGCTTACATCACATCAAGAGATTTCTTGTTTTGGTTTAGATCCCACACAGCTAAAGAGGTTAAGTGGGGTGGTGCAAAACATCACCCTGAAGACAAGGATGATGGGCAGCGGATGCATCCTCGGACATCTTTTAATGCTTTCCTCGAAGTAGTGAAAAGTG Syringodium_isoetifolium CGGCTGCAAGCTCTACCTGGTGGAGACATCAAGCTTCTCTGTGACACGGTTGTGAACCACGTCAGGGAGCTCACGGGCTACGACAGGGTCATGGTCTACAGGTTCCATGAGGATGAGCATGGGGAGGTTGTCGCAGAGAGCAAAAGGGGCGACTTGGAGCCGTATATAGGACTCCATTATCCTGCCACCGACATACCTCAGGCCGCAAGGTTCTTGTTTAAACAGAACAGAGTTAGGATGATAGCTGATTGCCGGGCAACGCCCGTCCGAATGGTACAAGATGAGAATCTAATGCAGCCCCTCTGCCTTGTTGGATCCACTTTGCGAGCTCCACATGGTTGCCATGCACAATACATGGCCAACATGGGCTCAATTGCTTCGCTTGTTATGGCTGTAATCATTAATGGAGGTGAAGAGGAGAGCTCCAGGAAATCCATGAAGCTATGGGGCCTAGTTGTCTGTCATCACACTTCCCCTAGATGCATTCCATTTCCACTGCGATATGCCTGCGAGTTCCTCATGCAGGCCTTTGGGCTTCAGCTAAATATGGAACTTCATTTGGCATCTCAGCTGTCCGAGAAGCACATCTTGCGGACTCAGACACTTTTGTGTGACATGCTTCTTCGTGATTCTCCCACTGGAATTGTCACACAGAGTCCTAGCATAATGGATCTTGTTAAGTGTGATGGGGCTGCGCTCTATTACCAGGGTAGTTATTGGCCACTTGGTGTTACTCCTTCTGAGGCAGAGATTAAGGATATTATTGGGTGGCTGTTGGAAAGTCATGGAGACTCCACAGGCTTGAGCACAGACAGTTTGGCTGATGCTGGCTATCCAGGAATTGCTTCCTTTGGTGATGCAGTTTGTGGTATTGCGGTGGCCTACATCGCCCCAGGGGACTTCTTGTTTTGGTTCAGATCACATACAGAAAAAGAGATAAAATGGGGTGGTGCAAAGCACCATCCTGAAGACAAGGATGATGGGCAGCGTATGCACCCACGCACATCTTTCAATGCCTTCCTGGAAGTAGTGAAAAGTA Ruppia_tuberosa_B1 CGCTTGCAGGCTTTGCCTGGGGGAGATATTAAGTTTCTGTGTGATACTGTTGTGGATCATGTTAGGGAGCTGACTGGGTATGATAGGGTTATGGTTTATAAGTTTCATGAGGATGAGCATGGGGAGGTGCTTGCTGAGAGTAAGAGGAGTGACTTGGAACCGTATATTGGGCTCCATTATCCTGCGACGGATATTCCCCAGGCGTCGAGGTTCTTGTTTAAGCAGAATAGAGTTAGGATGATTGCTGATTGTCGTGCGACTCCGGTTAGTATGATACAAGATGAGAATTTGATGCAGCCGCTTTGCCTTGTTGGATCGACGCTACGAGCACCTCATGGGTGCCACGCGCAGTACATGGCGAACATGGGGTCGATTGCTTCGCTTGTTATGGCTGTTATTATTAATGGGGGTGAGGAGGATGGGACAAGGAACTCTATGAAGCTTTGGGGGCTTGTTGTTTGCCACCATACTTCTCCGAGATGCATTCCGTTTCCGTTGCGCTATGCTTGTGAGTTTCTTATGCAGGCTTTGGGTCTTCAGCTTAATATGGAGGTTCAGTTGGCTGCCCAGATGTCTGAGAAGCACATATTGAGAACTCAGACGCTTCTGTGTGATATGCTTCTTAGAGATTCTCCTACTGGGATTGTTACACAGAGTCCTAGTATAATGGACCTTGTGAAGTGTGATGGTGCTGCGCTCTATTATCATGGTAAGTATTGGCCACTCGGTGTTGCCCCTTCTGAGGAGAAGATTAAGGATATCATTGGCTGGTTGTTGACAAGTCATGGAGACTCCACGGGGTTGAGCACAGACAGCTTGGCGGATGCTAGCTACCCTGGTGCTGCTTCCCTTGGGGATGCAGTTTGTGGCATGGCAGTGGCGTATATCACCTCGAGAGATTTTTTGTTTTGGTTTAGATCACATACTGCAAAAGAGGTAAAGTGGGGTGGTGCTAAACATCATCCTGAAGACAAGGACGACGGACAGCGTATGCATCCCCGCACATCTTTTAACGCCTTCCTGGAAGTTGTGAAAAGTA Ruppia_tuberosa_B2 CGCTTGCAGGCTTTGCCTGGGGGAGATATTAAGTTTCTGTGTGATACTGTTGTGGATCATGTTAGGGAGCTGACTGGGTATGATAGGGTTATGGTTTATAAGTTTCATGAGGATGAGCATGGGGAGGTGCCTGCTGAGAGTAAGAGGAGTGACTTGGAACCGTATATTGGGCTCCATTATCCTGCGACGGATATTCCCCAGGCGTCGAGGTTCTTGTTTAAGCAGAATAGAGTTAGGATGCTTGCTGATTGTCGTGCGACTCCGGTTAGTATGATACAAGATGAGAATTTGATGCAGCCGCTTTGCCTTGTTGGATCGACGCTACGAGCACCTCATGGGTGCCACGCGCAGTACATGGCGAACATGGGGTCGATTGCTTCGCTTGTTATGGCTGTTATTATTAATGGGGGTGAGGAGGATGGGACAAGGAACTCTATGAAGCTTTGGGGGCTTGTTGTTTGCCACCATACTTCTCCGAGATGCATTCCGTTTCCGTTGCGCTATGCTTGTGAGTTTCTTATGCAGGCTTTGGGTCTTCAGCTTAATATGGAGGTTCAGTTGGCTGCCCAGATGTCTGAGAAGCACATATTGAGAACTCAGACGCTTCTGTGTGATATGCTTCTTAGAGATTCTCCTACTGGGATTGTTACACAGAGTCCTAGTATAATGGACCTTGTGAAGTGTGATGGTGCTGCGCTCTGTTATCATGGTAAGTATTGGCCACTCGGTGTTGCCCCTTCTGAGGAGAAGATTAAGGATATCATTGGCTGGTTGTTGACAAGTCACGGAGACTCCACGGGGTTGAGCACAGACAGCTTGGCGGATGCTAGCTACCCTGGTGCTGCTTCCCTTGGGGATGCAGTTTGTGGCATGGCAGTGGCGTATATCACCTCGAGAGATTTTTTGTTTTGGTTTAGATCACATACTGCAAAAGAGATAAAGTGGGGTGGTGCTAAACATCATCCTGAAGACAAGGACGACGGACAGCGTATGCATCCCCGCACATCTTTTAACGCCTTCCTGGAAGTTGTGAAAAGTA Ruppia_tuberosa_A1 CGGTTGCAGGCTCTGCCTGGGGGAGATATTAAGTTCCTGTGTGATACTGTTGTGGATCATGTTAGGGAGCTTACTGGTTATGATAGAGTTATGGTTTATAAGTTTCATGAGGATGAGCATGGGGAGGTGCTTGCTGAGAGTAAGAGGAGTGATTTGGAGCCGTATATTGGGCTCCATTATCCTGCGACGGATATTCCCCAGGCGTCGAGGTTCTTGTTTAAGCAGAATAGAGTTAGGATGATCGCTGATTGTCGTGCGACTCCGGTTAGTATGATACAGGATGAGAATCTTATGCAGCCTCTTTGCCTTGTCGGATCGACGCTACGAGCGCCTCATGGTTGTCATGCGCAGTACATGGCTAACATGGGGTCGATTGCTTCGCTTGTTATGGCTGTTATCATTAATGGGGGTGAGGAGGATGGGACTAGGAACTCTATGAAGCTTTGGGGGCTTGTTGTTTGCCACCATACTTCTCCGAGATGCATTCCGTTTCCGTTGCGCTATGCTTGTGAGTTTCTTATGCAGGCTTTGGGTCTTCAGCTTAATATGGAAGTTCAGTTGGCTGCCCAGATGTCTGAGAAGCACATATTGAGAACTCAGACGCTTCTGTGTGATATGCTTCTTCGGGATTCTCCTACTGGGATTGTTACACAGAGTCCTAGTATAATGGACCTTGTAAAGTGTGATGGTGCGGGGCTCTGTTACCATGGGAAGTATTGGCCACTCGGTGTTGCCCCTTCTGAGGAGAAGATTAAGGATATTATTGGGTGGTTGTTGACGAGTCATGGAGACTCCACGGGGTTGAGCACAGACAGTTTGGCGGATGCTAGCTACCCTGGTGCTGCTTCCCTTGGGGATGCAGTTTGTGGCATGGCAGTGGCGTATATCACCACGAGAGATTTTTTGTTTTGGTTTAGATCCCATACTGCAAAAGAGATAAAGTGGGGTGGTGCTAAACATCATCCTGAAGACAAGGACGACGGACAGCGTATGCATCCCCGCACATCTTTTAACGCCTTCCTGGAAGTTGTGAAAAGTA Ruppia_tuberosa_A2 CGGTTGCAGGCTCTGCCTGGGGGAGATATTAAGTTTCTGTGTGATACTGTTGTGGATCATGTTAGGGAGCTCACTGGGTATGATAGAGTTATGGTGTATAAGTTTCATGAGGATGAGCATGGGGAGGTGCTTGCTGAGAGTAAGAGGAGTGATTTGGAGCCGTATATTGGGCTCCATTATCCTGCGACGGATATTCCCCAGGCGTCGAGGTTCTTGTTCAAGCAGAATAGAGTTAGGATGATTGCTGATTGTCGTGCGACTCCGGTTAGTATGATACAGGATGAGAATTTGATGCAGCCGCTTTGCCTTGTCGGATCGACGCTGCGAGCACCTCATGGTTGTCATGCGCAGTACATGGCGAACATGGGGTCGATTGCTTCGCTTGTTATGGCTGTTATTATTAATGGGGGTGAGGAGGATGGGTCAAGGAACTCTATGAAGCTGTGGGGGCTTGTTGTTTGCCACCATACTTCTCCGAGATGCATTCCGTTCCCATTGCGCTATGCTTGTGAGTTTCTTATGCAGGCTTTGGGTCTTCAGCTTAATATGGAGGTTCAGTTGGCTGCCCAGATGTCTGAGAAGCACATATTGAGAACTCAGACGCTTCTGTGTGATATGCTTCTTAGGGATTCTCCTACTGGGATTGTTACACAGAGTCCTAGTATAATGGATCTTGTGAAGTGTGATGGTGCGGCGCTCTATTACCATGGTAAGTATTGGCCACTTGGGGTTGCCCCTTCTGAGGAGAAGATTAAGGATATTATTGGCTGGTTGTTGACGAGTCATGGAGACTCCACGGGGTTGAGCACAGACAGTTTGGCGGATGCTAGCTACCCTGGTGCTGCTTCCCTTGGGGATGCAGTTTGTGGCATGGCAGTGGCGTATATCACCTCGAGAGATTTTTTGTTTTGGTTTAGATCCCATACTGCAAAAGAGGTAAAGTGGGGTGGTGCTAAACATCATCCTGAAGACAAGGACGACGGACAGCGTATGCATCCCCGCGCATCTTTTAACGCCTTCCTGGAAGTTGTGAAAAGTA Ruppia_megacarpa CGGTTACAGGCTTTGCCAGGTGGAGATATTAAGTTTCTGTGTGACACAGTTGTGGACCATGTTAGGGAACTCACTGGATATGATAGGGTTATGGTCTACAAGTTCCATGAGGATGAGCATGGGGAAGTTCTTGCTGAGAGTAAAAGAAGTGACTTGGAACCGTATATAGGTCTCCATTACCCTGCCACAGACATACCCCAAGCCTCAAGGTTCTTATTTAAACAGAACAGAGTTAGGATGATAGCTGATTGTCGTGCAACTCCTGTTAGCATGATACAAGATGAGAACCTGATGCAGCCACTTTGCCTTGTAGGATCCACACTACGAGCTCCTCATGGCTGCCATGCACAATACATGGCTAACATGGGGTCAGTTGCTTCTCTTGTTATGGCTGTTATCATTAATGGGGGAGAAGAAGACGGCACAAGGAACTCTATGAAGCTATGGGGCCTTGTTGTTTGCCACCATACTTCTCCCAGATGCATTCCATTTCCATTGCGCTATGCCTGTGAGTTCCTCATGCAGGCTCTAGGCCTTCAGCTTAATATGGAAGTTCAGTTGGCTGCCCAGATGTCTGAAAAACACATATTAAGAACTCAAACCCTTTTATGTGATATGCTTCTTCGTGATTCTCCTACTGGAATTGTTACACAAAGTCCGAGTATAATGGACCTTGTGAAGTGTGATGGCGCGGCACTCTATTACCATGGTAAGTATTGGCCACTCGGTGTTGCCCCTTCTGAGGAAAAAATTAAAGATATCATTGGCTGGTTATTGGCAAGTCATGGAGACTCCACGGGCTTGAGCACAGATAGTTTGGCGGATGCTAGCTACCCAGGTGCCGCTTCCCTTGGGGATGCAGTTTGTGGCATGGCAGTGGCATATATCACCTCAAGAGATTTTTTGTTTTGGTTTAGATCCCATACTGCAAAAGAAATAAAGTGGGGTGGTGCTAAACATCATCCTGAAGACAAAGACGATGGACAGCGTATGCATCCCCGCACATCTTTTAATGCCTTCCTGGAAGTTGTGAAAAGTA Ruppia_maritima_B CGTTTACAGGCTTTGCCGGGTGGGGATATTAAGTTCCTGTGTGACACGGTTGTTGACCATGTTAGGGAGCTCACTGGATATGACAGGGTTATGGTGTATAAATTCCATGAGGATGAGCATGGGGAAGTTCTCGCCGAGAGTAAAAGAAGTGACTTGGAACCCTATATAGGTCTCCATTACCCTGCCACAGACATACCCCAAGCCTCAAGGTTCTTGTTTAAACAGAACAGAGTTAGGATGATAGCTGACTGTCGTGCAACTCCAGTTAGCATGATACAAGATGAGAACCTGATGCAGCCGCTTTGCCTTGTAGGATCCACACTACGAGCTCCTCATGGCTGCCATGCACAATACATGGCTAACATGGGCTCAATTGCTTCTCTTGTCATGGCTGTTATCATCAATGGGGGTGAAGAAGACGGCACAAGGAACTCTATGAAGCTATGGGGCCTTGTTGTTTGCCACCATACTTCTCCCAGATGCATTCCATTTCCATTGCGCTATGCCTGTGAGTTCCTCATGCAGGCCCTAGGCCTTCAGCTTAATATGGAAGTTCAGTTGGCTGCCCAGATGTCTGAAAAGCACATATTGAGAACTCAAACCCTTCTATGTGATATGCTTCTTAGGGATTCTCCTACTGGAATTGTTACACAAAGTCCTAGTATAATGGACCTTGTGAAGTGTGATGGCGCGGCACTCTATTACCATGGTAAGTATTGGCCACTCGGTGTTGCCCCCTCCGAGGAAAAGATTAAAGATATTATCGGCTGGTTATTGGCAACTCATGGAGACTCCACAGGCTTGAGCACAGACAGTTTGGCGGATGCTAGCTACCCAGCTGCCGCTTCCCTTGGGGATGCAGTTTGTGGCATGGCAGTGGCATATATCACCTCAAGAGATTTTTTGTTTTGGTTTAGATCCCACACTGCAAAAGAAATAAAGTGGGGTGGTGCTAAACATCATCCTGAAGACAAGGATGATGGACAGCGTATGCATCCACGCACGTCTTTTAATGCCTTCCTGGAAGTTGTGAAGAGTA Ruppia_polycarpa_B CGTTTACAGGCTTTGCCGGGTGGGGATATTAAGTTTCTGTGTGACACGGTTGTTGACCATGTTAGGGAGCTCACTGGATATGACAGGGTTATGGTGTATAAATTCCATGAGGATGAGCATGGGGAAGTTCTCGCCGAGAGTAAAAGAGGTGACTTGGAACCCTATATAGGTCTCCATTACCCTGCCACAGACATACCCCAAGCCTCAAGGTTCTTGTTTAAACAGAACAGAGTTAGGATGATAGCTGACTGTCGTGCAACTCCTGTTAGCATGATACAAGATGAGAACCTGATGCAGCCGCTTTGCCTTGTAGGATCCACACTACGAGCTCCTCATGGCTGCCATGCGCAATACATGGCTAACATGGGCTCAATTGCTTCTCTTGTCATGGCTGTTATCATCAATGGGGGTGAAGAAGACGGCACAAGGAACTCTATGAAGCTATGGGGCCTTGTTGTTTGCCACCATACTTCTCCCAGATGCATTCCATTTCCATTGCGCTATGCCTGTGAGTTCCTCATGCAGGCTCTAGGCCTTCAGCTTAATATGGAAGTTCAGTTGGCTGCCCAGATGTCTGAAAAGCACATATTGAGAACTCAAACCCTTCTATGTGATATGCTTCTTAGGGATTCTCCTACTGGAATTGTTACACAAAGTCCTAGTATAATGGACCTTGTGAAGTGTGATGGTGCGGCACTCTATTACCATGGTAAGTATTGGCCACTCGGTGTTGCCCCCTCCGAGGAAAAGATTAAAGATATTATCGGCTGGTTATTGGCAACTCATGGAGACTCCACAGGCTTGAGCACAGACAGTTTGGCGGATGCTAGCTACCCAGCTGCCGCTTCCCTTGGGGATGCAGTTTGTGGCATGGCAGTGGCATATATCACCTCAAGAGATTTTTTGTTTTGGTTTAGATCCCACACTGCAAAAGAAATAAAGTGGGGTGGTGCTAAACATCATCCTGAAGACAAGGATGATGGACAGCGTATGCATCCCCGCACATCTTTTAATGCCTTCCTGGAAGTTGTGAAGAGTA Ruppia_maritima_F2 CGTTTACAGGCTTTGCCGGGTGGGGATATTAAGTTTCTGTGTGACACGGTTGTTGACCATGTTAGGGAGCTCACTGGATATGACAGGGTTATGGTGTACAAGTTCCATGAGGATGAGCATGGGGAAGTTCTCGCCGAGAGTAAAAGAAGCGACTTGGAACCTTATATAGGTCTTCACTACCCTGCCACAGATATACCCCGAGCCTCAAGGTTCTTGTTTAAACAGAACAGAGTTAGAATGATAGCTGACTGTCGTGCAACGCCTGTTAGCATGATACAAGATGAGAACCTGATGCAGCCGCTTTGCCTTGTAGGATCCACACTACGAGCTCCTCATGGATGCCATGCGCAATACATGGCTAACATGGGCTCAGTTGCTTCTCTTGTCATGGCTGCTATCATCAATGGGGGCGAAGAAGACGGCACAAGGAACTCTATGAAGCTATGGGGCCTTGTTGTTTGCCACCATACTTCTCCCAGATGCATTCCATTTCCATTGCGCTATGCCTGTGAGTTCCTCATGCAGGCTCTAGGCCTTCAGCTTAATATGGAAGTTCAGTTGGCTGCCCAGATGTCTGAAAAGCACATATTAAGAACTCAAACCCTTCTATGTGATATGCTTCTTCGGGATTCTCCTACTGGAATTGTTACACAAAATCCTAGTATAATGGACCTTGTGAAGTGTGATGGTGCAGCGCTCTATTACCATGGTAAGTATTGGCCACTCGGTGTTGCCCCTTCCGAGGAAAAGATTAAAGATATTATTGGCTGGTTATTGGCAAGTCATGGAGACTCCACGGGCTTGAGCACGGACAGTTTGGCGGATGCTAGCTACCCGGCTGCCGCTTCACTTGGGGATGCAGTTTGTGGCATGGCAGTGGCATATATCACCTCAAGAGATTTTTTGTTTTGGTTTAGATCCCATACTGCAAAAGAAATAAAGTGGGGTGGTGCTAAACATCATCCGGAAGACAAGGACGATGGACAGCGTATGCATCCCCGCACATCGTTTAATGCCTTCCTGGAAGTTGTGAAGAGTA Ruppia_maritima_F1 CGTTTACAGGCTTTGCCGGGTGGGGATATTAAGTTTCTGTGTGACACGGTTGTTGACCATGTTAGGGAGCTCACTGGATATGATAGGGTTATGGTGTATAAATTCCATGAGGATGAGCATGGGGAAGTTCTCGCCGAGAGTAAAAGAAGTGACTTGGAACCCTATATAGGTCTCCATTACCCTGCCACAGACATACCCCAAGCCTCAAGGTTCTTGTTTAAACAGAACAGAGTTAGGATGATAGCTGACTGTCGTGCAACTGCAGTTAGCATGATACAAGATGAGAACCTGATGCAGCCGCTTTGCCTTGTAGGATCCACACTACGAGCTCCTCATGGCTGCCATGCACAATACATGGCTAACATGGGCTCAATTGCTTCTCTTGTCATGGCTGTTATCATCAATGGGGGTGAAGAAGACGGCACAAGGAACTCTATGAAGCTATGGGGCCTTGTTGTTTGCCACCATACTTCTCCCAGATGCATTCCATTTCCATTGCGCTATGCCTGTGAGTTCCTCATGCAGGCCCTAGGCCTTCAGCTTAATATGGAAGTTCAGTTGGCTGCCCAGATGTCTGAAAAGCACATATTGAGAACTCAAACCCTTCTATGTGATATGCTTCTTAGGGATTCTCCTACTGGAATTGTTACACAAAGTCCTAGTATAATGGACCTTGTGAAGTGTGATGGTGCGGCACTCTATTACCATGGTAAGTATTGGCCACTCGGTGTTGCCCCCTCCGAGGAAAAGATTAAAGATATTATCGGCTGGTTATTGGCAACTCATGGAGACTCCACAGGCTTGAGCACAGACAGTTTGGCGGATGCTAGCTACCCAGCTGCCGCTTCCCTTGGGGATGCAGTTTGTGGCATGGCAGTGGCATATATCACCTCAAGAGATTTTTTGTTTTGGTTTAGATCCCACACTGCAAAAGAAATAAAGTGGGGTGGTGCTAAACATCATCCTGAAGACAAGGATGATGGACAGCGTATGCATCCCCGCACATCTTTTAATGCCTTCCTGGAAGTTGTGAAGAGTA Ruppia_polycarpa_A CGTTTACAGGCTTTGCCGGGTGGGGATATTAAGTTTCTGTGTGACACTGTTGTTGACCATGTTAGGGAGCTCACTGGGTATGACAGGGTTATGGTGTACAAGTTCCATGAGGATGAGCATGGGGAAGTTCTTGCTGAGAGTAAAAGAAGTGACTTGGAACCTTACATAGGTCTCCATTACCCTGCCACAGACATACCCCAAGCCTCAAGGTTCTTGTTTAAACAGAACAGAGTTAGGATGATAGCTGACTGTCGTGCAACTCCTGTTAGCATGATACAAGATGAGAACCTGATGCAGCCACTTTGCCTTGTAGGATCCACACTACGTGCTCCTCATGGCTGCCATGCACAATACATGGCTAACATGGGCTCAGTTGCTTCTCTTGTCATGGCTGTTATCATTAATGGGGGTGAAGAAGATGGCACACGGAACTCTATGAAGCTATGGGGCCTTGTTGTTTGCCACCATACTTCTCCCAGATGCATTCCATTTCCATTGCGCTATGCCTGTGAGTTCCTAATGCAGGCTCTAGGCCTCCAGCTTAATATGGAAGTTCAGTTGGCTGCCCAGATGTCTGAAAAGCACATATTGAGAACTCAAACCCTTCTATGTGATATGCTTCTTAGGGATTCTCCTACTGGAATTGTTACACAAAGTCCTAGTATAATGGACCTTGTGAAGTGTGATGGCGCGGCGCTCTATTACCATGGTAAGTATTGGCCACTCGGTGTTGCCCCGTCTGAGGAAAAGATTAAAGATATTATTGGCTGGTTATTGGCAAGTCATGGAGACTCCACAGGCTTGAGCACAGACAGTTTGGCGGATGCTAGCTACCCAGCTGCCGCTTCCCTTGGGGATGCAGTTTGTGGCATGGCAGTGGCATATATCACCTCAAGAGATTTTTTGTTTTGGTTTAGATCCCATACTGCAAAAGAAATAAAGTGGGGTGGAGCTAAACATCACCCGGAAGACAAGGACGATGGACAGCGTATGCATCCCCGCACATCTTTTAACGCCTTCCTGGAAGTTGTGAAAAGTA Ruppia_maritima_E1 CGTTTACAGGCTTTGCCGGGTGGGGATATTAAGTTTCTGTGTGACACGGTTGTTGACCATGTTAGGGAGCTCACTGGATATGATAGGGTTATGGTGTATAAATTCCATGAGGATGAGCATGGGGAAGTTCTCGCCGAGAGTAAAAGAAGTGACTTGGAACCCTATATAGGTCTCCATTACCCTGCCACGGACATACCCCAAGCCTCAAGGTTCTTGTTTAAACAGAACAGAGTTAGGATGATAGCTGACTGTCGTGCAACTCCAGTTAGCATGATACAAGATGAGAACCTGATGCAGCCGCTTTGCCTTGTAGGATCCACACTACGAGCTCCTCATGGCTGCCATGCACAATACATGGCTAACATGGGCTCAATTGCTTCTCTTGTCATGGCTGTTATCATCAATGGGGGTGAAGAAGACGGCACAAGGAACTCTATGAAGCTATGGGGCCTTGTTGTTTGCCACCATACTTCTCCCAGATGCATTCCATTTCCATTGCGCTATGCCTGTGAGTTCCTCATGCAGGCCCTAGGCCTTCAGCTTAATATGGAAGTTCAGTTGGCTGCCCAGATGTCTGAAAAGCACATATTGAGAACTCAAACCCTTCTATGTGATATGCTTCTTAGGGATTCTCCTACTGGAATTGTTACACAAAGTCCTAGTATAATGGACCTTGTGAAGTGTGATGGTGCGGCACTCTATTACCATGGTAAGTATTGGCCACTCGGTGTTGCCCCCTCCGAGGAAAAGATTAAAGATATTATCGGCTGGTTATTGGCAACTCATGGAGACTCCACAGGCTTGAGCACAGACAGTTTGGCGGATGCTAGCTACCCAGCTGCCGCTTCCCTTGGGGATGCAGTTTGTGGCATGGCAGTGGCATATATCACCTCAAGAGATTTTTTGTTTTGGTTTAGATCCCACACTGCAAAAGAAATAAAGTGGGGTGGTGCTAAACATCATCCTGAAGACAAGGATGATGGACAGCGTATGCATCCCCGCACATCTTTTAATGCCTTCCTGGAAGTTGTGAAGAGTA Ruppia_maritima_E2 CGTTTACAGGCTTTGCCGGGTGGGGATATTAAGTTTCTGTGTGACACGGTTGTTGACCATGTTAGGGAGCTCACTGGATATGACAGGGTTATGGTGTACAAGTTCCATGAGGATGAGCATGGGGAAGTTCTCGCCGAGAGTAAAAGAAGCGACTTGGAACCTTATATAGGTCTTCACTACCCTGCCACAGATATACCCCAAGCCTCAAGGTTCTTGTTTAAACAGAACAGAGTTAGAATGATAGCTGACTGTCATGCAACGCCTGTTAGCATGATACAAGATGAGAACCTGATGCAGCCGCTTTGCCTTGTAGGATCCACACTACGAGCTCCTCATGGATGCCATGCGCAATACATGGCTAACATGGGTTCAGTTGCTTCTCTTGTCATGGCTGTTATCATCAATAGGGGCGAAGAAGACGGCACAAGGAACTCTATGAAGCTATGGGGCCTTGTTGTTTGCCACCATACTTCTCCCAGATGCATTCCATTTCCATTGCGATATGCCTGTGAGTTCCTCATGCAGGCTCTAGGCCTTCAGCTTAATATGGAAGTTCAGTTGGCTGCCCAGATGTCTGAAAAGCACATATTAAGAACTCAAACCCTTCTATGTGATATGCTTCTTCGGGATTCTCCTACTGGAATTGTTACACAAAGTCCTAGTATAATGGACCTTGTGAAGTGTGATGGTGCAGCGCTCTATTACCATGGTAAGTATTGGCCACTCGGTGTTGCCCCTTCCGAGGAAAAGATTAAAGATATTATTGGCTGGTTATTGGCAAGTCATGGAGACTCCACGGGCTTGAGCACGGACAGTTTGGCGGATGCTAGCTACCCGGCTGCCGCTTCACTTGGGGATGCAGTTTGTGGCATGGCAGTGGCATATATCACCTCAAGAGATTTTTTGTTTTGGTTTAGATCCCATACTGCAAAAGAAATAAAGTGGGGTGGTGCTAAACATCATCCGGAAGACAAGGACGATGGACAGCGTATGCATCCCCGCACATCGTTTAATGCCTTCCTGGAAGTTGTGAAGAGTA Ruppia_maritima_A CGTTTACAGGCTTTGCCGGGTGGGGATATTAAGTTTCTGTGTGACACGGTTGTTGACCATGTTAGGGAGCTCACTGGATATGACAGGGTTATGGTGTACAAATTCCACGAGGATGAGCATGGGGAAGTTCTCGCCGAGAGTAAAAGAGGTGACTTGGAACCCTATTTAGGTCTCCATTACCCTGCCACAGACATACCCCAAGCCTCAAGGTTCTTGTTTAAACAGAACAGAGTTAGGATGATAGCTGACTGTCGTGCAACTCCTGTTAGCATGATACAAGATGAGAACCTGATGCAGCCGCTTTGCCTTGTAGGATCCACATTACGAGCTCCTCATGGCTGCCATGCGCAATACATGGCTAACATGGGCTCAATTGCTTCTCTTGTCATGGCTGTTATCATCAATGGGGGTGAAGAAGACGGCACAAGGAACTCTATGAAGCTATGGGGCCTTGTTGTTTGCCACCATACTTCTCCCAGATGCATTCCATATCCATTGCGCTATGCCTGTGAGTTCCTCATGCAGGCTCTAGGCCTTCAGCTAAATATGGAAGTTCAGTTGGCTGCCCAGATGTCTGAAAAGCACATATTGAGAACTCAAACCCTTCTATGTGATATGCTTCTTAGGGATTCTCCTACTGGAATTGTTACACAAAGTCCTAGTATAATGGACCTTGTGAAGTGTGATGGTGCGGCACTCTATTACCATGGTAAGTATTGGCCACTCGGTGTTGCCCCCTCCGAGGAAAAGATTAAAGATATTATCGGCTGGTTATTGGCAACTCATGGAGACTCCACAGGCTTGAGCACAGACAGTTTGGCGGATGCTAGCTACCCAGCTGCCGCTTCCCTTGGGGATGCAGTTTGTGGCATGGCAGTGGCATATATCACCTCGAGAGATTTTTTGTTTTGGTTTAGATCCCACACTGCAAAAGAAATAAAGTGGGGTGGTGCTAAACATCATCCTGAAGACAAGGATGATGGACAGCGTATGCATCCCCGCACATCTTTTAATGCCTTCCTGGAAGTTGTGAAGAGTA Ruppia_maritima_B. CGTTTACAGGCTTTGCCGGGTGGGGATATTAAGTTCCTGTGTGACACGGTTGTTGACCATGTTAGGGAGCTCACTGGATATGACAGGGTTATGGTGTATAAATTCCATGAGGATGAGCATGGGGAAGTTCTCGCCGAGAGTAAAAGAAGTGACTTGGAACCCTATATAGGTCTCCATTACCCTGCCACAGACATACCCCAAGCCTCAAGGTTCTTGTTTAAACAGAACAGAGTTAGGATGATAGCTGACTGTCGTGCAACTCCAGTTAGCATGATACAAGATGAGAACCTGATGCAGCCGCTTTGCCTTGTAGGATCCACACTACGAGCTCCTCATGGCTGCCATGCACAATACATGGCTAACATGGGCTCAATTGCTTCTCTTGTCATGGCTGTTATCATCAATGGGGGTGAAGAAGACGGCACAAGGAACTCTATGAAGCTATGGGGCCTTGTTGTTTGCCACCATACTTCTCCCAGATGCATTCCATTTCCATTGCGCTATGCCTGTGAGTTCCTCATGCAGGCCCTAGGCCTTCAGCTTAATATGGAAGTTCAGTTGGCTGCCCAGATGTCTGAAAAGCACATATTGAGAACTCAAACCCTTCTATGTGATATGCTTCTTAGGGATTCTCCTACTGGAATTGTTACACAAAGTCCTAGTATAATGGACCTTGTGAAGTGTGATGGCGCGGCACTCTATTACCATGGTAAGTATTGGCCACTCGGTGTTGCCCCCTCCGAGGAAAAGATTAAAGATATTATCGGCTGGTTATTGGCAACTCATGGAGACTCCACAGGCTTGAGCACAGACAGTTTGGCGGATGCTAGCTACCCAGCTGCCGCTTCCCTTGGGGATGCAGTTTGTGGCATGGCAGTGGCATATATCACCTCAAGAGATTTTTTGTTTTGGTTTAGATCCCACACTGCAAAAGAAATAAAGTGGGGTGGTGCTAAACATCATCCTGAAGACAAGGATGATGGACAGCGTATGCATCCCCGCACGTCTTTTAATGCCTTCCTGGAAGTTGTGAAGAGTA Ruppia_maritima_B... CGTTTACAGGCTTTGCCGGGTGGGGATATTAAGTTTCTGTGTGACACGGTTGTTGACCATGTTAGGGAGCTCACTGGATATGATAGGGTTATGGTGTATAAATTCCATGAGGATGAGCATGGGGAAGTTCTCTCCGAGAGTAAAAGAAGTGACTTGGAACCCTATATAGGTCTCCATTACCCTGCCACGGACATACCCCAAGCCTCAAGGTTCTTGTTTAAACAGAACAGAGTTAGGATGATAGCTGACTGTCGTGCAACTCCAGTTAGCATGATACAAGATGAGAACCTGATGCAGCCGCTTTGCCTTGTAGGATCCACACTACGAGCTCCTCATGGCTGCCATGCACAATACATGGCTAACATGGGCTCAATTGCTTCTCTTGTCATGGCTGTTATCATCAATGGGGGTGAAGAAGACGGCACAAGGAACTCTATGAAGCTATGGGGCCTTGTTGTTTGCCACCATACTTCTCCCAGATGCATTCCATTTCCATTGCGCTATGCCTGTGAGTTCCTCATGCAGGCCCTAGGCCTTCAGCTTAATATGGAAGTTCAGTTGGCTGCCCAGATGTCTGAAAAGCACATATTGAGAACTCAAACCCTTCTATGTGATATGCTTCTTAGGGATTCTCCTACTGGAATTGTTACACAAAGTCCTAGTATAATGGACCTTGTGAAGTGTGATGGTGCGGCACTCTATTACCATGGTAAGTATTGGCCACTCGGTGTTGCCCCCTCCGAGGAAAAGATTAAAGATATTATCGGCTGGTTATTGGCAACTCATGGAGACTCCACAGGCTTGAGCACAGACAGTTTGGCGGATGCTAGCTACCCAGCTGCCGCTTCCCTTGGGGATGCAGTTTGTGGCATGGCAGTGGCATATATCACCTCAAGAGATTTTTTGTTTTGGTTTAGATCCCACACTGCAAAAGAAATAAAGTGGGGTGGTGCTAAACATCATCCTGAAGACAAGGATGATGGACAGCGTATGCATCCCCGCACATCTTTTAATGCCTTCCTGGAAGTTGTGAAGAGTA Ruppia_maritima_G2 CGTTTACAGGCTTTGCCGGGTGGGGATATTAAGTTTTTGTGTGACACGGTTGTTGACCATGTTAGGGAGCTCACTGGATATGACAGGGTTATGGTGTATAAGTTCCATGAGGATGAGCATGGGGAAGTTCTGGCCGAGAGTAAAAGAAATGACTTGGAACCTTATATAGGTCTCCATTACCCTGCCACAGACATACCCCAAGCCTCAAGGTTCTTGTTTAAACAGAACAGAGTTAGGATGATAGCTGACTGCCATGCAACTCCTGTTAGCATGATACAAGATGAGAACCTGATGCAGCCGCTTTGCCTTGTAGGATCCACACTAAGAGCTCCTCATGGCTGCCATGCGCAATACATGGCTAACATGGGCTCAGTTGCTTCTCTTGTCATGGCTGTTATCATCAATGGGGGCGAAGAAGACGGCACAAGGAACTCTATGAAGCTATGGGGCCTTGTTGTTTGCCACCATACTTCTCCCAGATGCATTCCATTTCCACTGCGCTATGCCTGTGAGTTCCTCATGCAGGCTTTAGGCCTTCAGCTTAATATGGAAGTTCAGTTGGCTGCCCAGATGTCCGAAAAGCACATATTAAGAACTCAAACCCTTCTATGTGATATGCTTCTTCGGGATTCTCCTATTGGAATTGTTACACAAAGTCCTAGTATAATGGACCTTGTGAAGTGTGATGGCGCGGCACTCTATTACCATGGTAAGTATTGGCCGCTCGGTGTTGCCCCGTCTGAGGAAAAGATTAAAGATATTATTGGCTGGTTATTGGCAAGTCATGGAGACTCCACGGGCTTGAGCACGGACAGTTTGGCGGATGCTAACTACCCAGCTGCCGCTTCCCTTGGGGATGCAGTTTGTGGCATGGCTGTGGCATATATCACCTCAAGAGATTTTTTGTTTTGGTTTAGATCCCATACTGCAAAAGAAATCAAGTGGGGTGGTGCTAAACATCATCCGGAAGACAAGGACGATGGACAGCGTATGCATCCCCGCACATCTTTTAATGCCTTCCTAGAAGTTGTGAAGAGTA Ruppia_maritima_G1 CGTTTACAGGCTTTGCCGGGTGGGGATATTAAGTTTCTGTGTGACACGGTTGTTGACCATGTTAGGGAGCTCACTGGATATGACAGGGTTATGGTGTATAAATTCCATGAGGATGAGCATGGGGAAGTTCTCGCCGAGAGTAAAAGAGGTGACTTGGAACCCTATATAGGTCTCCATTACCCTGCCACAGACATACCCCAAGCCTCAAGGTTCTTGTTTAAACAGAACAGAGTTAGGATGATAGCTGACTGTCGTGCAACTCCTGTTAGCATGATACAAGATGAGAACCTGATGCAGCCGCTTTGCCTTGTAGGATCCACACTACGAGCTCCTCATGGCTGCCATGCGCAATACATGGCTAACATGGGCTCAATTGCTTCTCTTGTCATGGCTGTTATCATCAATGGGGGTGAAGAAGACGGCACAAGGAACTTTATGAAGCTATGGGGCCTTGTTGTTTGCCACCATACTTCTCCCAGATGCATTCCATTTCCACTGCGCTATGCCTGTGAGTTCTTCATGCAGGCTCTAGGCCTTCAGCTTAATATGGAAGTTCAGTTGGCTGCCCAGATGTCTGAAAAGCACATATTGAGAACTCAAACCCTTCTATGTGATATGCTTCTTAGGGATTCTCCTACTGGAATTGTTACACAAAGTCCTAGTATAATGGACCTTGTGAAGTGTGATGGTGCGGCACTCTATTACCATGGTAAGTATTGGCCACTCGGTGTTGCCCCCTCCGAGGAAAAGATTAAAGATATTATCGGCTGGTTATTGTTAACTCATGGAGACTCCACAGGCTTGAGCACAGACAGTTTGGCGGATGCTAGCTACCCAGCTGCCTCTTCCCTTGGGGATGCAGTTTGTGGCATGGCAGTGGCATATATCACCTCAAGAGATTTTTTGTTTTGGTTTAGATCCCACACTGCAAAAGAAATAAAGTGGGGTGGTGCTAAACATCATCCTGAAGACAAGGATGATGGACAGCGTATGCATCCCCGCACATCTTTTAATGCCTTCCTGGAAGTTGTGAAGAGTA Ruppia_maritima_B.. CGTTTACAGGCTTTGCCGGGTGGGGATATTAAGTTTCTGTGTGACACGGTTGTTGACCATGTTAGGGAGCTCACTGGATATGACAGGGTTATGGTGTATAAATTCCATGAGGATGAGCATGGGGAAGTTCTCGCCGAGAGTAAAAGAAGTGACTTGGAACCCTATATAGGTCTCCATTACCCTGCCACAGACATACCCCAAGCCTCAAGGTTCTTGTTTAAACAGAACAGAGTTAGGATGATAGCTGACTGTCGTGCAACTCCAGTTAGCATGATACAAGATGAGAACCTGATGCAGCCGCTTTGCCTTGTAGGATCCACACTACGAGCTCCTCATGGCTGCCATGCACAATACATGGCTAACATGGGCTCAATTGCTTCTCTTGTCATGGCTGTTATCATCAATGGGGGTGAAGAAGACGGCACAAGGAACTCTATGAAGCTATGGGGCCTTGTTGTTTGCCACCATACTTCTCCCAGATGCATTCCATTTCCATTGCGCTATGCCTGTGAGTTCCTCATGCAGGCCCTAGGCCTTCAGCTTAATATGGAAGTTCAGTTGGCTGCCCAGATGTCTGAAAAGCACATATTGAGAACTCAAACCCTTCTATGTGATATGCTTCTTAGGGATTCTCCTACTGGAATTGTTACACAAAGTCCTAGTATAATGGACCTTGTGAAGTGTGATGGCGCGGCACTCTATTACCATGGTAAGTATTGGCCACTCGGTGTTGCCCCCTCCGAGGAAAAGATTAAAGATATTATCGGCTGGTTATTGGCAACTCATGGAGACTCCACAGGCTTGAGCACAGACAGTTTGGCGGATGCTAGCTACCCAGCTGCCGCTTCCCTTGGGGATGCAGTTTGTGGCATGGCAGTGGCATATATCACCTCAAGAGATTTTTTGTTTTGGTTTAGATCCCACACTGCAAAAGAAATAAAGTGGGGTGGTGCTAAACATCATCCTGAAGACAAGGATGATGGACAGCGTATGCATCCCCGCACGTCTTTTAATGCCTTCCTGGAAGTTGTGAAGAGTA Ruppia_maritima_J2 CGTTTACAGGCTTTGCCGGGTGGGGATATTAAGTTTCTGTGTGACACGGTTGTTGACCATGTTAGGGAGCTCACTGGATATGACAGGGTTATGGTGTACAAGTTCCATGAGGATGAGCATGGGGAAGTTCTCGCCGAGAGTAAAAGAAGCGACTTGGAACCTTATATAGGTCTTCACTACCCTGCCACAGATATACCCCAAGCCTCAAGGTTCTTGTTTAAACAGAACAGAGTTAGAATGATAGCTGACTGTCATGCAACGCCTGTTAGCATGATACAAGATGAGAACCTGATGCAGCCGCTTTGCCTTGTAGGATCCACACTACGAGCTCCTCATGGATGCCATGCGCAATACATGGCTAACATGGGTTCAGTTGCTTCTCTTGTCATGGCTGTTATCATCAATAGGGGCGAAGAAGACGGCACAAGGAACTCTATGAAGCTATGGGGCCTTGTTGTTTGCCACCATACTTCTCCCAGATGCATTCCATTTCCATTGCGATATGCCTGTGAGTTCCTCATGCAGGCTCTAGGCCTTCAGCTTAATATGGAAGTTCAGTTGGCTGCCCAGATGTCTGAAAAGCACATATTAAGAACTCAAACCCTTCTATGTGATATGCTTCTTCGGGATTCTCCTACTGGAATTGTTACACAAAGTCCTAGTATAATGGACCTTGTGAAGTGTGATGGTGCAGCGCTCTATTACCATGGTAAGTATTGGCCACTCGGTGTTGCCCCTTCCGAGGAAAAGATTAAAGATATTATTGGCTGGTTATTGGCAAGTCATGGAGACTCCACGGGCTTGAGCACGGACAGTTTGGCGGATGCTAGCTACCCGGCTGCCGCTTCACTTGGGGATGCAGTTTGTGGCATGGCAGTGGCATATATCACCTCAAGAGATTTTTTGTTTTGGTTTAGATCCCATACTGCAAAAGAAATAAAGTGGGGTGGTGCTAAACATCATCCGGAACACAAGGACGATGGACAGCGTATGCATCCCCGCACATCGTTTAATGCCTTCCTGGAAGTTGTGAAGAGTA Ruppia_cirrhosa_B1 CGTTTACAGGCTTTGCCGGGTGGGGATATTAAGTTTCTGTGTGACACGGTTGTTGACCATGTTAGGGAGCTCACTGGATATGACAGGGTTATGGTGTACAAGTTCCATGAGGATGAGCATGGGGAAGTTCTCGCCGAGAGTAAAAGAAGCGACTTGGAACCTTATATAGGTCTTCACTACCCTGCCACAGATATACCCCAAGCCTCAAGGTTCTTGTTTAAACAGAACAGAGTTAGAATGATAGCTGACTGTCGTGCAACGCCTGTTAGCATGATACAAGATGAGAACCTGATGCAGCCGCTTTGCCTTGTAGGATCCACACTACGAGCTCCTCATGGATGCCATGCGCAATACATGGCTAACATGGGCTCAGTTGCTTCTCTTGTCATGGCTGTTATCATCAATGGGGGCGAAGAAGACGGCACAAGGAACTCTATGAAGCTATGGGGCCTTGTTGTTTGCCACCATACTTCTCCCAGATGCATTCCATTTCCATTGCGCTATGCCTGTGAGTTCCTCATGCAGGCTCTAGGCCTTCAGCTTAATATGGAAGTTCAGTTGGCTGCCCAGATGTCTGAAAAGCACATATTAAGAACTCAAACCCTTCTATGTGATATGCTTCTTCGGGATTCTCCTACTGGAATTGTTACACAAAGTCCTAGTATAATGGACCTTGTGAAGTGTGATGGTGCAGCGCTCTATTACCATGGTAAGTATTGGCCACTCGGTGTTGCCCCTTCCGAGGAAAAGATTAAAGATATTATTGGCTGGTTATTGGCAAGTCATGGAGACTCCACGGGCTTGAGCACGGACAGTTTGGCGGATGCTAGCTACCCGGCTGCCGCTTCACTTGGGGATGCAGTTTGTGGCATGGCAGTGGCATATATCACCTCAAGAGATTTTTTGTTTTGGTTTAGATCCCATACTGCAAAAGAAATAAAGTGGGGTGGTGCTAAACATCATCCGGAAGACAAGGACGATGGACAGCGTATGCATCCCCGCACATCGTTTAATGCCTTCCTGGAAGTTGTGAAGAGTA Ruppia_cirrhosa_B2 CGTTTACAGGCTTTGCCGGGTGGGGATATTAAGTTTCTGTGTGACACGGTTGTTGACCATGTTAGGGAGCTCACTGGATATGACAGGGTTATGGTGTACAAGTTCCATGAGGATGAGCATGGGGAAGTTCTCGCCGAGAGTAAAAGAAGCGACTTGGAACCTTATATAGGTCTTCACTACCCTGCCACAGATATACCCCAAGCCTCAAGGTTCTTGTTTAAACAGAACAGAGTTAGAATGATAGCTGACTGTCGTGCAACGCCTGTTAGCATGATACAAGATGAGAACCTGATGCAGCCGCTTTGCCTTGTAGGATCCACACTACGAGCTCCTCATGGATGCCATGCGCAATACATGGCTAACATGGGCTCAGTTGCTTCTCTTGTCATGGCTGTTATCATCAATGGGGGCGAAGAAGACGGCACAAGGAACTCTATGAAGCTATGGGGCCTTGTTGTTTGCCACCATACTTCTCCCAGATGCATTCCATTTCCATTGCGCTATGCCTGTGAGTTCCTCATGCAGGCTCTAGGCCTTCAGCTTAATATGGAAGTTCAGTTGGCTGCCCAGATGTCTGAAAAGCACATATTAAGAACTCAAACCCTTCTATGTGATATGCTTCTTCGGGATTCTCCTACTGGAATTGTTACACAAAGTCCTAGTATAATGGACCTTGTGAAGTGTGATGGTGCAGCGCTCTATTACCATGGTAAGTATTGGCCACTCGGTGTTGCCCCTTCCGAGGAAAAGATTAAAGATATTATTGGCTGGTTATTGGCAAGTCATGGAGACTCCACGGGCTTGAGCACGGACAGTTTGGCGGATGCTAGCTACCCGGCTGCCGCTTCACTTGGGGATGCAGTTTGTGGCATGGCAGTGGCATATATCACCTCAAGAGATTTTTTGTTTTGGTTTAGATCCCATACTGCAAAAGAAATAAAGTGGGGTGGTGCTAAACATCATCCAGAAGACAAGGACGATGGACAGCGTATGCATCCCCGCACATCGTTTAATGCCTTCCTGGAAGTTGTGAAGAGTA Ruppia_maritima_K1 CGTTTACAGGCTTTGCCGGGTGGGGATATTAAGTTTCTGTGTGACACGGTTGTTGACCATGTTAGGGAGCTCACTGGATATGACAGGGTTATGGTGTATAAATTCCATGAGGATGAGCATGGGGAAGTTCTCGCCGAGAGTAAAAGAAGTGACTTGGAACCCTATATAGGTCTCCATTACCCTGCCACAGACATACCCCAAGCCTCAAGGTTCTTGTTTAAACAGAACAGAGTTAGGATGATAGCTGACTGTCGTGCAACTGCAGTTAGCATGATACAAGATGAGAACCTGATGCAGCCGCTTTGCCTTGTAGGATCCACACTACGAGCTCCTCATGGCTGCCATGCACAATACATGGCTAACATGGGCTCAATTGCTTCTCTTGTCATGGCTGTTATCATCAATGGGGGTGAAGAAGACGGCACAAGGAACTCTATGAAGCTATGGGGCCTTGTTGTTTGCCACCATACTTCTCCCAGATGCATTCCATTTCCATTGCGCTATGCCTGTGAGTTCCTCATGCAGGCCCTAGGCCTTCAGCTTAATATGGAAGTTCAGTTGGCTGCCCAGATGTCTGAAAAGCACATATTGAGAACTCAAACCCTTCTATGTGATATGCTTCTTAGGGATTCTCCTACTGGAATTGTTACACAAAGTCCTAGTATAATGGACCTTGTGAAGTGTGATGGTGCGGCACTCTATTACCATGGTAAGTATTGGCCACTCGGTGTTGCCCCCTCCGAGGAAAAGATTAAAGATATTATCGGCTGGTTATTGGCAACTCATGGAGACTCCACAGGCTTGAGCACAGACAGTTTGGCGGATGCTAGCTACCCAGCTGCCGCTTCCCTTGGGGATGCAGTTTGTGGCATGGCAGTGGCATATATCACCTCAAGAGATTTTTTGTTTTGGTTTAGATCCCACACTGCAAAAGAAATAAAGTGGGGTGGTGCTAAACATCATCCTGAAGACAAGGATGATGGACAGCGTATGCATCCCCGCACATCTTTTAATGCCTTCCTGGAAGTTGTGAAGAGTA Ruppia_maritima_K2 CGTTTACAGGCTTTGCCGGGTGGGGATATTAAGTTTCTGTGTGACACGGTTGTTGACCATGTTAGGGAGCTCACTGGATATGACAGGGTTATGGTGTACAAGTTCCATGAGGATGAGCATGGGGAAGTTCTCGCCGAGAGTAAAAGAAGCGACTTGGAACCTTATATAGGTCTTCACTACCCTGCCACAGATATACCCCAAGCCTCAAGGTTCTTGTTTAAACAGAACAGAGTTAGAATGATAGCTGACTGTCGTGCAACGCCTGTTAGCATGATACAAGATGAGAACCTGATGCAGCCGCTTTGCCTTGTAGGATCCACACTACGAGCTCCTCATGGATGCCATGCGCAATACATGGCTAACATGGGCTCAGTTGCTTCTCTTGTCATGGCTGTTATCATCAATGGGGGCGAAGAAGACGGCACAAGGAACTCTATGAAGCTATGGGGCCTTGTTGTTTGCCACCATACTTCTCCCAGATGCATTCCATTTCCATTGCGCTATGCCTGTGAGTTCCTCATGCAGGCTCTAGGCCTTCAGCTTAATATGGAAGTTCAGTTGGCTGCCCAGATGTCTGAAAAGCACATATTAAGAACTCAAACCCTTCTATGTGATATGCTTCTTCGGGATTCTCCTACTGGAATTGTTACACAAAGTCCTAGTATAATGGACCTTGTGAAGTGTGATGGTGCAGCGCTCTATTACCATGGTAAGTATTGGCCACTCGGTGTTGCCCCTTCCGAGGAAAAGATTAAAGATATTATTGGCTGGTTATTGGCAAGTCATGGAGACTCCACGGGCTTGAGCACGGACAGTTTGGCGGATGCTAGCTACCCGGCTGCCGCTTCACTTGGGGATGCAGTTTGTGGCATGGCAGTGGCATATATCACCTCAAGAGATTTCTTGTTTTGGTTTAGATCCCATACTGCAAAAGAAATAAAGTGGGGTGGTGCTAAACATCATCCGGAAGACAAGGACGATGGACAGCGTATGCATCCCCGCACATCGTTTAATGCCTTCCTGGAAGTTGTGAAGAGTA ; END; begin paup; set autoclose = yes warnreset = no increase = auto; set criterion = parsimony; hsearch; pset opt = acctran; roottrees outroot = monophyl; describetrees 1 / plot = phylogram brlens = yes; savetrees file = Ruppia_phyB..tre brlens = yes; contree all / strict = yes tcompress = yes treefile = RphyBcontree.tre; bootstrap nrep = 1000 treefile = RphyBbs.tre; END; BEGIN ASSUMPTIONS; TYPESET * UNTITLED = unord: 1 - 1039; END; BEGIN TREES; Title 'Trees from "Ruppia_phyB..tre"'; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Triglochin_striata, 2 Potamogeton_maackianus, 3 Syringodium_isoetifolium, 4 Ruppia_tuberosa_B1, 5 Ruppia_tuberosa_B2, 6 Ruppia_tuberosa_A1, 7 Ruppia_tuberosa_A2, 8 Ruppia_megacarpa, 9 Ruppia_maritima_B, 10 Ruppia_polycarpa_B, 11 Ruppia_maritima_F2, 12 Ruppia_maritima_F1, 13 Ruppia_polycarpa_A, 14 Ruppia_maritima_E1, 15 Ruppia_maritima_E2, 16 Ruppia_maritima_A, 17 Ruppia_maritima_B., 18 Ruppia_maritima_B..., 19 Ruppia_maritima_G2, 20 Ruppia_maritima_G1, 21 Ruppia_maritima_B.., 22 Ruppia_maritima_J2, 23 Ruppia_cirrhosa_B1, 24 Ruppia_cirrhosa_B2, 25 Ruppia_maritima_K1, 26 Ruppia_maritima_K2; TREE PAUP_1 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,(((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,((12:0.0,(14:0.0,18:1.0):2.0):1.0,25:0.0):1.0):4.0,10:0.0,20:6.0):1.0,16:6.0):10.0,((11:3.0,(15:0.0,22:1.0):4.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):13.0,19:18.0):5.0):9.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_2 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,((((((9:1.0,17:0.0)61:1.0,21:0.0)80:2.0,((12:0.0,(14:0.0,18:1.0)73:2.0):1.0,25:0.0):1.0)82:3.0,((10:0.0,20:6.0):0.0,16:7.0)54:1.0)100:9.0,((11:3.0,(15:0.0,22:1.0)97:4.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0)100:14.0,19:17.0)67:5.0)85:10.0,13:11.0)94:14.0)100:24.0)100:51.0)99:56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_3 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,(((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,(12:1.0,(14:0.0,18:1.0):1.0):1.0,25:1.0):4.0,10:0.0,20:6.0):1.0,16:6.0):10.0,((11:3.0,(15:0.0,22:1.0):4.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):13.0,19:18.0):5.0):9.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_4 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,(((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,(12:1.0,(14:0.0,18:1.0):1.0):1.0,25:1.0):4.0,(10:0.0,20:6.0):0.0):1.0,16:6.0):10.0,((11:3.0,(15:0.0,22:1.0):4.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):13.0,19:18.0):5.0):9.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_5 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,(12:1.0,(14:0.0,18:1.0):1.0):1.0,25:1.0):3.0,((10:0.0,20:6.0):0.0,16:7.0):1.0):9.0,((11:3.0,(15:0.0,22:1.0):4.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):14.0,19:17.0):5.0):10.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_6 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,(((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,((12:0.0,(14:0.0,18:1.0):2.0):1.0,25:0.0):1.0):4.0,(10:0.0,20:6.0):0.0):1.0,16:6.0):10.0,((11:3.0,(15:0.0,22:1.0):4.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):13.0,19:18.0):5.0):9.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_7 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,((12:0.0,(14:0.0,18:1.0):2.0):1.0,25:0.0):1.0):3.0,(10:0.0,16:7.0,20:6.0):1.0):9.0,((11:3.0,(15:0.0,22:1.0):4.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):14.0,19:17.0):5.0):10.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_8 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,(((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,(12:1.0,25:0.0):1.0,(14:0.0,18:1.0):2.0):4.0,10:0.0,20:6.0):1.0,16:6.0):10.0,((11:3.0,(15:0.0,22:1.0):4.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):13.0,19:18.0):5.0):9.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_9 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,(((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,((12:0.0,25:1.0):1.0,(14:0.0,18:1.0):1.0):1.0):4.0,10:0.0,20:6.0):1.0,16:6.0):10.0,((11:3.0,(15:0.0,22:1.0):4.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):13.0,19:18.0):5.0):9.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_10 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,(((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,((12:0.0,(14:0.0,18:1.0):2.0):1.0,25:0.0):1.0):4.0,10:0.0,20:6.0):1.0,16:6.0):10.0,((11:3.0,(15:0.0,22:1.0):4.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):13.0,19:18.0):5.0):9.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_11 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,(((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,((12:0.0,(14:0.0,18:1.0):2.0):1.0,25:0.0):1.0):4.0,10:0.0,20:6.0):1.0,16:6.0):10.0,(((11:3.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):1.0,(15:0.0,22:1.0):3.0):13.0,19:17.0):6.0):9.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_12 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,((12:0.0,(14:0.0,18:1.0):2.0):1.0,25:0.0):1.0):3.0,((10:0.0,20:6.0):0.0,16:7.0):1.0):9.0,(((11:3.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):1.0,(15:0.0,22:1.0):3.0):14.0,19:16.0):6.0):10.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_13 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,(((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,(12:1.0,(14:0.0,18:1.0):1.0):1.0,25:1.0):4.0,(10:0.0,20:6.0):0.0):1.0,16:6.0):10.0,(((11:3.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):1.0,(15:0.0,22:1.0):3.0):13.0,19:17.0):6.0):9.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_14 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,(((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,(12:1.0,(14:0.0,18:1.0):1.0):1.0,25:1.0):4.0,10:0.0,20:6.0):1.0,16:6.0):10.0,(((11:3.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):1.0,(15:0.0,22:1.0):3.0):13.0,19:17.0):6.0):9.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_15 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,(((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,((12:0.0,(14:0.0,18:1.0):2.0):1.0,25:0.0):1.0):4.0,(10:0.0,20:6.0):0.0):1.0,16:6.0):10.0,(((11:3.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):1.0,(15:0.0,22:1.0):3.0):13.0,19:17.0):6.0):9.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_16 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,(12:1.0,(14:0.0,18:1.0):1.0):1.0,25:1.0):3.0,((10:0.0,20:6.0):0.0,16:7.0):1.0):9.0,(((11:3.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):1.0,(15:0.0,22:1.0):3.0):14.0,19:16.0):6.0):10.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_17 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,((12:0.0,(14:0.0,18:1.0):2.0):1.0,25:0.0):1.0):3.0,(10:0.0,16:7.0,20:6.0):1.0):9.0,(((11:3.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):1.0,(15:0.0,22:1.0):3.0):14.0,19:16.0):6.0):10.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_18 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,(12:1.0,25:0.0):1.0,(14:0.0,18:1.0):2.0):3.0,((10:0.0,20:6.0):0.0,16:7.0):1.0):9.0,(((11:3.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):1.0,(15:0.0,22:1.0):3.0):14.0,19:16.0):6.0):10.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_19 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,((12:0.0,25:1.0):1.0,(14:0.0,18:1.0):1.0):1.0):3.0,((10:0.0,20:6.0):0.0,16:7.0):1.0):9.0,(((11:3.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):1.0,(15:0.0,22:1.0):3.0):14.0,19:16.0):6.0):10.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_20 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,(12:1.0,(14:0.0,18:1.0):1.0):1.0,25:1.0):3.0,(10:0.0,16:7.0,20:6.0):1.0):9.0,((11:3.0,(15:0.0,22:1.0):4.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):14.0,19:17.0):5.0):10.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_21 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,(((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,(12:1.0,25:0.0):1.0,(14:0.0,18:1.0):2.0):4.0,(10:0.0,20:6.0):0.0):1.0,16:6.0):10.0,((11:3.0,(15:0.0,22:1.0):4.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):13.0,19:18.0):5.0):9.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_22 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,(((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,((12:0.0,25:1.0):1.0,(14:0.0,18:1.0):1.0):1.0):4.0,(10:0.0,20:6.0):0.0):1.0,16:6.0):10.0,((11:3.0,(15:0.0,22:1.0):4.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):13.0,19:18.0):5.0):9.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_23 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,(12:1.0,25:0.0):1.0,(14:0.0,18:1.0):2.0):3.0,((10:0.0,20:6.0):0.0,16:7.0):1.0):9.0,((11:3.0,(15:0.0,22:1.0):4.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):14.0,19:17.0):5.0):10.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_24 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,((12:0.0,25:1.0):1.0,(14:0.0,18:1.0):1.0):1.0):3.0,((10:0.0,20:6.0):0.0,16:7.0):1.0):9.0,((11:3.0,(15:0.0,22:1.0):4.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):14.0,19:17.0):5.0):10.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_25 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,(12:1.0,25:0.0):1.0,(14:0.0,18:1.0):2.0):3.0,(10:0.0,16:7.0,20:6.0):1.0):9.0,((11:3.0,(15:0.0,22:1.0):4.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):14.0,19:17.0):5.0):10.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_26 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,((12:0.0,25:1.0):1.0,(14:0.0,18:1.0):1.0):1.0):3.0,(10:0.0,16:7.0,20:6.0):1.0):9.0,((11:3.0,(15:0.0,22:1.0):4.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):14.0,19:17.0):5.0):10.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_27 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,(((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,(12:1.0,25:0.0):1.0,(14:0.0,18:1.0):2.0):4.0,(10:0.0,20:6.0):0.0):1.0,16:6.0):10.0,(((11:3.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):1.0,(15:0.0,22:1.0):3.0):13.0,19:17.0):6.0):9.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_28 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,(((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,((12:0.0,25:1.0):1.0,(14:0.0,18:1.0):1.0):1.0):4.0,10:0.0,20:6.0):1.0,16:6.0):10.0,(((11:3.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):1.0,(15:0.0,22:1.0):3.0):13.0,19:17.0):6.0):9.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_29 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,(((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,(12:1.0,25:0.0):1.0,(14:0.0,18:1.0):2.0):4.0,10:0.0,20:6.0):1.0,16:6.0):10.0,(((11:3.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):1.0,(15:0.0,22:1.0):3.0):13.0,19:17.0):6.0):9.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_30 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,(((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,((12:0.0,25:1.0):1.0,(14:0.0,18:1.0):1.0):1.0):4.0,(10:0.0,20:6.0):0.0):1.0,16:6.0):10.0,(((11:3.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):1.0,(15:0.0,22:1.0):3.0):13.0,19:17.0):6.0):9.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_31 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,(12:1.0,(14:0.0,18:1.0):1.0):1.0,25:1.0):3.0,(10:0.0,16:7.0,20:6.0):1.0):9.0,(((11:3.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):1.0,(15:0.0,22:1.0):3.0):14.0,19:16.0):6.0):10.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_32 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,(12:1.0,25:0.0):1.0,(14:0.0,18:1.0):2.0):3.0,(10:0.0,16:7.0,20:6.0):1.0):9.0,(((11:3.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):1.0,(15:0.0,22:1.0):3.0):14.0,19:16.0):6.0):10.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; TREE PAUP_33 = (1:73.0,(2:58.0,(3:84.0,(((4:1.0,5:4.0):10.0,(6:19.0,7:12.0):8.0):56.0,(8:14.0,((((((9:1.0,17:0.0):1.0,21:0.0):2.0,((12:0.0,25:1.0):1.0,(14:0.0,18:1.0):1.0):1.0):3.0,(10:0.0,16:7.0,20:6.0):1.0):9.0,(((11:3.0,23:0.0,24:1.0,26:1.0):1.0,(15:0.0,22:1.0):3.0):14.0,19:16.0):6.0):10.0,13:11.0):14.0):24.0):51.0):56.0):63.0):0.0; END; BEGIN CODONS; CODESET * UNTITLED = universal: 1 - 1039; END; BEGIN MESQUITECHARMODELS; ProbModelSet * UNTITLED = 'Jukes-Cantor': 1 - 1039; END; Begin MESQUITE; MESQUITESCRIPTVERSION 2; TITLE AUTO; tell ProjectCoordinator; timeSaved 1387511285289; getEmployee #mesquite.minimal.ManageTaxa.ManageTaxa; tell It; setID 0 5658679234620887803; endTell; getEmployee #mesquite.charMatrices.ManageCharacters.ManageCharacters; tell It; setID 0 1216769035836305807; mqVersion 275; checksumv 0 3 2985356268 null getNumChars 1039 numChars 1039 getNumTaxa 26 numTaxa 26 short true bits 15 states 15 sumSquaresStatesOnly 627622.0 sumSquares 627622.0 longCompressibleToShort false usingShortMatrix true NumFiles 1 NumMatrices 1; mqVersion; endTell; getWindow; tell It; suppress; setResourcesState false false 167; setPopoutState 400; setExplanationSize 0; setAnnotationSize 0; setFontIncAnnot 0; setFontIncExp 0; setSize 700 464; setLocation 8 8; setFont SanSerif; setFontSize 10; getToolPalette; tell It; endTell; desuppress; endTell; getEmployee #mesquite.trees.BasicTreeWindowCoord.BasicTreeWindowCoord; tell It; makeTreeWindow #5658679234620887803 #mesquite.trees.BasicTreeWindowMaker.BasicTreeWindowMaker; tell It; suppressEPCResponse; setTreeSource #mesquite.trees.StoredTrees.StoredTrees; tell It; setTreeBlock 1; toggleUseWeights off; endTell; setAssignedID 832.1387511270703.5864695537044266058; getTreeWindow; tell It; setExplanationSize 30; setAnnotationSize 20; setFontIncAnnot 0; setFontIncExp 0; setSize 533 397; setLocation 8 8; setFont SanSerif; setFontSize 10; getToolPalette; tell It; endTell; setActive; getTreeDrawCoordinator #mesquite.trees.BasicTreeDrawCoordinator.BasicTreeDrawCoordinator; tell It; suppress; setTreeDrawer #mesquite.trees.SquareTree.SquareTree; tell It; setNodeLocs #mesquite.trees.NodeLocsStandard.NodeLocsStandard; tell It; branchLengthsToggle off; toggleScale on; toggleBroadScale off; toggleCenter on; toggleEven on; endTell; setEdgeWidth 6; orientUp; setCornerMode Right_Angle 50; endTell; setBackground White; setBranchColor Black; showNodeNumbers off; showBranchColors on; labelBranchLengths off; centerBrLenLabels on; showBrLensUnspecified on; showBrLenLabelsOnTerminals on; setBrLenLabelColor 0 0 255; setNumBrLenDecimals 6; desuppress; getEmployee #mesquite.trees.BasicDrawTaxonNames.BasicDrawTaxonNames; tell It; setColor Black; toggleColorPartition on; toggleShadePartition off; toggleShowFootnotes on; toggleNodeLabels on; toggleCenterNodeNames off; toggleShowNames on; namesAngle ?; endTell; endTell; setTreeNumber 2; setDrawingSizeMode 0; toggleLegendFloat on; scale 0; toggleTextOnTree off; showWindow; endTell; desuppressEPCResponse; getEmployee #mesquite.trees.ColorBranches.ColorBranches; tell It; setColor Red; removeColor off; endTell; getEmployee #mesquite.ornamental.BranchNotes.BranchNotes; tell It; setAlwaysOn off; endTell; getEmployee #mesquite.ornamental.ColorTreeByPartition.ColorTreeByPartition; tell It; colorByPartition off; endTell; getEmployee #mesquite.ornamental.DrawTreeAssocDoubles.DrawTreeAssocDoubles; tell It; setOn on; setDigits 4; writeAsPercentage off; toggleCentred on; toggleHorizontal on; toggleWhiteEdges on; setFontSize 10; setOffset 0 0; endTell; getEmployee #mesquite.ornamental.DrawTreeAssocStrings.DrawTreeAssocStrings; tell It; setOn on; toggleCentred on; toggleHorizontal on; setFontSize 10; setOffset 0 0; endTell; getEmployee #mesquite.trees.TreeInfoValues.TreeInfoValues; tell It; panelOpen false; endTell; endTell; endTell; endTell; end;