#NEXUS Begin taxa; Dimensions ntax=25; Taxlabels Herzogiella_seligeri_Denmark Isopterygiopsis_muelleriana_Scotland Plagiothecium_cavifolium_Denmark Plagiothecium_cavifolium_Germany Plagiothecium_curvifolium_Denmark Plagiothecium_curvifolium_Germany Plagiothecium_denticulatum_Denmark Plagiothecium_denticulatum_var_obtusifolium_Germany Plagiothecium_draytonii_HI_USA Plagiothecium_euryphyllum_Yunnan_China Plagiothecium_handelii_Yunnan_China Plagiothecium_laetum_Germany Plagiothecium_latebricola_Denmark Plagiothecium_neckeroideum_Yunnan_China Plagiothecium_nemorale_Germany Plagiothecium_nemorale_Iran Plagiothecium_nemorale_aquatic_Germany Plagiothecium_piliferum_WA_USA Plagiothecium_platyphyllum_Finland Plagiothecium_ruthei_Denmark Plagiothecium_succulentum_Denmark Plagiothecium_succulentum_concave_leaves_Denmark Plagiothecium_undulatum_Denmark Pseudotaxiphyllum_elegans_Germany Taxiphyllum_sp_Yunnan_China ; End; Begin paup; Set storebrlens=y; End; Begin trees; [Treefile saved Friday, January 2, 1970 4:12 AM] [! >Data file = trnG_Wynns_10_Jan_14.nex >Branch-and-bound search settings: > Optimality criterion = parsimony > Character-status summary: > Of 637 total characters: > All characters are of type 'unord' > All characters have equal weight > 543 characters are constant > 53 variable characters are parsimony-uninformative > Number of parsimony-informative characters = 41 > Gaps are treated as "missing" > Initial upper bound: unknown (compute heuristically) > Addition sequence: furthest > Initial 'MaxTrees' setting = 100 (will be auto-increased by 100) > Branches collapsed (creating polytomies) if maximum branch length is zero > 'MulTrees' option in effect > Topological constraints not enforced > Trees are unrooted > >Branch-and-bound search completed: > Score of best tree found = 129 > Number of trees retained = 12 > Time used = 0.20 sec ] Translate 1 Herzogiella_seligeri_Denmark, 2 Isopterygiopsis_muelleriana_Scotland, 3 Plagiothecium_cavifolium_Denmark, 4 Plagiothecium_cavifolium_Germany, 5 Plagiothecium_curvifolium_Denmark, 6 Plagiothecium_curvifolium_Germany, 7 Plagiothecium_denticulatum_Denmark, 8 Plagiothecium_denticulatum_var_obtusifolium_Germany, 9 Plagiothecium_draytonii_HI_USA, 10 Plagiothecium_euryphyllum_Yunnan_China, 11 Plagiothecium_handelii_Yunnan_China, 12 Plagiothecium_laetum_Germany, 13 Plagiothecium_latebricola_Denmark, 14 Plagiothecium_neckeroideum_Yunnan_China, 15 Plagiothecium_nemorale_Germany, 16 Plagiothecium_nemorale_Iran, 17 Plagiothecium_nemorale_aquatic_Germany, 18 Plagiothecium_piliferum_WA_USA, 19 Plagiothecium_platyphyllum_Finland, 20 Plagiothecium_ruthei_Denmark, 21 Plagiothecium_succulentum_Denmark, 22 Plagiothecium_succulentum_concave_leaves_Denmark, 23 Plagiothecium_undulatum_Denmark, 24 Pseudotaxiphyllum_elegans_Germany, 25 Taxiphyllum_sp_Yunnan_China ; tree PAUP_1 = [&U] (1:0,((2:12,(((((((((3:0,4:0,22:1):1,(((7:0,20:0):1,(8:0,19:1):1):5,15:0,16:0,17:0,21:0):1):1,((5:0,6:0):1,12:1):3):0,(13:6,14:4):2):3,(9:0,23:1):3):2,10:7):10,11:13):2,24:8):2,18:5):2):2,25:20):8); tree PAUP_2 = [&U] (1:0,((2:12,(((((((((3:0,4:0,22:1):1,(((7:0,20:0):1,(8:0,19:1):1):5,(15:0,16:0,17:0,21:0):0):1):1,((5:0,6:0):1,12:1):3):0,(13:6,14:4):2):3,(9:0,23:1):3):2,10:7):10,11:13):2,24:8):2,18:5):2):2,25:20):8); tree PAUP_3 = [&U] (1:0,((2:12,((((((((((3:0,4:0,22:1):1,(15:0,16:0,17:0,21:0):1):0,((7:0,20:0):1,(8:0,19:1):1):5):1,((5:0,6:0):1,12:1):3):0,(13:6,14:4):2):3,(9:0,23:1):3):2,10:7):10,11:13):2,24:8):2,18:5):2):2,25:20):8); tree PAUP_4 = [&U] (1:0,((2:12,(((((((((3:0,4:0,22:1):1,((7:0,20:0):1,(8:0,19:1):1):5,(15:0,16:0,17:0,21:0):1):1,((5:0,6:0):1,12:1):3):0,(13:6,14:4):2):3,(9:0,23:1):3):2,10:7):10,11:13):2,24:8):2,18:5):2):2,25:20):8); tree PAUP_5 = [&U] (1:0,((2:12,((((((((3:0,4:0,22:1):1,(((7:0,20:0):1,(8:0,19:1):1):5,15:0,16:0,17:0,21:0):1):1,((5:0,6:0):1,12:1):3,(13:6,14:4):2):3,(9:0,23:1):3):2,10:7):10,11:13):2,24:8):2,18:5):2):2,25:20):8); tree PAUP_6 = [&U] (1:0,((2:12,((((((((3:0,4:0,22:1):1,(((7:0,20:0):1,(8:0,19:1):1):5,(15:0,16:0,17:0,21:0):0):1):1,((5:0,6:0):1,12:1):3,(13:6,14:4):2):3,(9:0,23:1):3):2,10:7):10,11:13):2,24:8):2,18:5):2):2,25:20):8); tree PAUP_7 = [&U] (1:0,((2:12,(((((((((3:0,4:0,22:1):1,(15:0,16:0,17:0,21:0):1):0,((7:0,20:0):1,(8:0,19:1):1):5):1,((5:0,6:0):1,12:1):3,(13:6,14:4):2):3,(9:0,23:1):3):2,10:7):10,11:13):2,24:8):2,18:5):2):2,25:20):8); tree PAUP_8 = [&U] (1:0,((2:12,((((((((3:0,4:0,22:1):1,((7:0,20:0):1,(8:0,19:1):1):5,(15:0,16:0,17:0,21:0):1):1,((5:0,6:0):1,12:1):3,(13:6,14:4):2):3,(9:0,23:1):3):2,10:7):10,11:13):2,24:8):2,18:5):2):2,25:20):8); tree PAUP_9 = [&U] (1:0,((2:12,(((((((((3:0,4:0,22:1):1,(((7:0,20:0):1,(8:0,19:1):1):5,15:0,16:0,17:0,21:0):1):1,(13:6,14:4):2):0,((5:0,6:0):1,12:1):3):3,(9:0,23:1):3):2,10:7):10,11:13):2,24:8):2,18:5):2):2,25:20):8); tree PAUP_10 = [&U] (1:0,((2:12,(((((((((3:0,4:0,22:1):1,(((7:0,20:0):1,(8:0,19:1):1):5,(15:0,16:0,17:0,21:0):0):1):1,(13:6,14:4):2):0,((5:0,6:0):1,12:1):3):3,(9:0,23:1):3):2,10:7):10,11:13):2,24:8):2,18:5):2):2,25:20):8); tree PAUP_11 = [&U] (1:0,((2:12,((((((((((3:0,4:0,22:1):1,(15:0,16:0,17:0,21:0):1):0,((7:0,20:0):1,(8:0,19:1):1):5):1,(13:6,14:4):2):0,((5:0,6:0):1,12:1):3):3,(9:0,23:1):3):2,10:7):10,11:13):2,24:8):2,18:5):2):2,25:20):8); tree PAUP_12 = [&U] (1:0,((2:12,(((((((((3:0,4:0,22:1):1,((7:0,20:0):1,(8:0,19:1):1):5,(15:0,16:0,17:0,21:0):1):1,(13:6,14:4):2):0,((5:0,6:0):1,12:1):3):3,(9:0,23:1):3):2,10:7):10,11:13):2,24:8):2,18:5):2):2,25:20):8); End;