#NEXUS

BEGIN TAXA;
	TITLE Taxa;
	DIMENSIONS NTAX=13;
	TAXLABELS
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	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE  'Gamma-Glutamyl Transpeptidase';
	DIMENSIONS  NCHAR=1299;
	FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING = ?;
	MATRIX
	Helicobacter_bilis           GTAGCAGTTGGCTATGCTTTAGCGGTAGTCCATCCTGCTGCCGGAAACATCGGTGGTGGTGGCTTTGCTGTCATTCACCTTGCAAATGGTGAGAATATTACACTTGATTTTAGAGAAAAAGCCCCGTTAAAAGCCACAAGAGATATGTATTTGGATAATAAGGGCAATGTGATTCCAAATGCTTCAACACTTGGATATTTAGCTGCGGGAGTGCCCGGCACTGTTAAAGGTATGAGTGCTATGCTTGATAAATATGGCACAAAGCCGCTTGGCGAACTCATGCAACCTGCTATCGATTTAGCTGAAAATGGCTTTGTGATTACTGATAGACAGGCTGAAACCATGCTTGAAGTAAAAGATGATTTAGCTAAATTTGCAAGCACGAGAAAATACTTTTTAAAGGATGGCTCACTTTATCAAGGTGGGGATACACTCGTGCAAAAAGATTTGGCAAAGACCTTGAGACTTATACAAAAAGAGGGTGAGAGTGCGTTTTATCAAGGGAAAATTGCAGAATTGATCGTTGCTGATATGCAAAATAATGGTATAATCTCTAAAGAAGATTTAGCACAATATAATGTGGTATGGCGAAAGCCAGTAACAGGCACATATAGAGGCTATGAGATTATCTCCATGTCTCCACCAAGTAGCGGCGGGACACATATCATTCAGATTCTAAACACAATGGAAAATGCAGATATAGCTAGTCTAGGTTTTGGCTCATCAAAGTCTATTGCCTTAATGACTGAAGCAATGCGTCAAGCCTATGCTGATAGATCGGTATTTATGGCAGATCCAGATTTTTTCAGTGTGCCAACTGATAAATTATTAGCAAAAGAGTATGCAAAAAAAATCTACACAAATATAAAGGGCAAGGCAGTCCCTAGTAAAAATATTAAGCCCGGACTTGGTGTTATAAAAGAGGGTAATCACACTACACATTATTCAGTAGCAGATAAATGGGGCAATGCTGTAAGCGTAACCTATACTATTAATGCAAGTTATGGTGCGATAGCAGCGGTTGAAGGGGCTGGATTTATACTTAATAATGAAATGGATGACTTTTCTATTAAACCCGGTGTAGCCAATCTTTATGGCTTAGTAGGCGGTGAAGCAAATGCGATTGTCCCAAGGAAAAGACCGCTAAGTTCAATGAGTCCTACAATCATTCTAAAAGATGGTAAGCTATTTATGGTAGTGGGCAGTCCGGGTGGTGCAAGGATTATTACCACTGTGTTGCAAGTGATTTCTAATGTGATTGATCATAAAATGGATATAGCAAAAGCGGTAGAATCACCA
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	Helicobacter_pylori          GTAGCGATAGGTTTTGCTCTTGCGGTTGTCCATCCGGCAGCAGGCAATATTGGTGGAGGCGGTTTTGCGGTTATCCATTTGGCTAATGGTGAAAATGTTGCGTTAGATTTTAGAGAAAAAGCCCCCTTAAAAGCCACTAAAAACATGTTTTTAGACAAGCAAGGCAATGTAGTCCCTAAACTCAGCGAAGATGGCTATTTGGCGGCCGGGGTTCCTGGAACGGTGGCAGGCATGGAAGCGATGCTGAAAAAATACGGCACTAAAAAACTATCGCAACTCATTGATCCTGCCATTAAATTGGCTGAAAATGGTTATGCGATTTCACAAAGACAAGCAGAAACCCTAAAGGAAGCAAGGGAGCGGTTTTTAAAATACAGTTCTAGCAAAAAGTATTTTTTTAAAGGCCATCTTGATTATCAAGAAGGGGATTTGTTTGTCCAAAAAGATTTAGCCAAGACTTTGAATCAAATCAAAACGCTAGGCGCTAAAGGCTTTTATCAAGGGCAAGTCGCTGAGCTTATTGAGAAAGACATGAAAAAAAATGGGATTATCACTAAAGAAGATTTAGCCAGTTACAATGTGAAATGGCGCAAACCCGTGGTAGGGAGTTATCGTGGGTATAAGATCATTTCTATGTCGCCGCCAAGTTCGGGAGGCACGCATTTGATCCAGATTTTAAATGTCATGGAAAATGCGGATTTAAGCGCCCTTGGGTATGGGGCTTCTAAGAATATCCATATCGCTGCCGAAGCGATGCGTCAGGCTTATGCGGATAGATCGGTTTATATGGGAGACGCTGATTTTGTTTCGGTGCCGGTGGATAAATTGATTAATAAAGCGTATGCCAAAAAGATTTTTGACACTATCCCAGATACGGTTACGCCAAGCTCTCAAATCAAACCAGGAATGGGGCAGTTGCATGAGGGGAGCAATACCACGCATTATTCTGTAGCGGACAGGTGGGGGAATGCAGTCAGCGTTACTTACACCATTAACGCTTCTTATGGAAGCGCTGCCAGTATTGATGGGGCAGGATTTTTATTGAACAATGAAATGGATGATTTTTCCATCAAGCCAGGGAATCCCAATCTCTATGGTTTAGTAGGGGGCGATGCGAATGCGATTGAAGCCAATAAGCGCCCTTTAAGCTCCATGTCGCCTACGATTGTGTTGAAAAACAATAAGGTTTTTTTGGTGGTGGGAAGCCCTGGAGGGTCTAGGATTATCACTACGGTGCTGCAAGTGATTTCTAATGTCATTGATTATAATATGAATATTTCTGAAGCGGTTTCAGCCCCA
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	Campylobacter_jejuni_81176   ATAGCAGTAGGTTATGCTTTGGCTGTAGTGCATCCTGCAGCAGGAAACATAGGTGGTGGTGGCTTTGCAGTCATTCATCTAGCCAATGGAGAAAATACCACGCTTGATTTTAGAGAAATGGCACCTTTAAAAGCAAGCAGAGATATGTATCTTGATAGCAAAGGAGAAATTATAAAAGATGCTTCAACTATAGGTTATCTAGCTGCTGGAGTACCAGGAACGGTTAAAGGTATGAGTGCTATGCTTGATCGCTACGGCACTATGAAACTAAAAGACTTGATGGCTCCTGCTATAAAACTAGCTGAAAAAGGTTATCTCATCAATGATAGACAAGAACAAACCATGCTAGAAGCTAAAGATATGTTTAAAGAATTTCCTAGTTCAAGCAAATATTTCCTTAAAGATGGTAGCACTTATAAAAGCGGGGATTTATTTGTCCAAAAAGATCTAGCAAAAACTTTAAAACTTATCGCAAAGGAAGGTCCTGATGCTTTTTATAAGGGAAAAATCGCTGATTTAATAGCAGCGGATATGGCTAAAAACGGCATTATCACTAAAGAAGATCTAGCACAATACCAAGCTATTTGGAGAAAACCTGTAGAAGGCACTTATAGGGGTTATGATATCATTTCCATGTCGCCACCTAGCAGTGGGGGTGCTCATATCATCGAAATTTTAAATATCATGGAAAATGCCAATATAGAAAATTTAGGCTTTGCAAGCTCTAAAACTTTACACATAATGGCTGAAGCTATGCGTCAAGCTTATGCGGATAGATCAGAATACATGGGCGATCCTGATTTTGTAAAAATCCCACTTGATAAACTTACAAGCAAAGAATACGCTAAAGAAATTTATGCAAAAATTAAAGATAAGGCTTTACCAAGCTCAAAAGTAAAACCTGGTTTAGGACAAATTCACGAAGGACATAATACCACTCATTATTCTGTACTAGATAGCAAAGGCAATGCTGTAAGCATTACCTATACGATCAATGCGAGTTATGGTTCAGGTGCTACGGTTGAAGGGGCAGGGTTTTTACTCAATGATGAAATGGATGATTTTTCAATCAAACCAGGCGTGCCAAATTTATACGGACTTGTAGGCGGAGAAGCTAATGCTATAGAACCTAAAAAAAGACCTTTAAGCTCTATGAGTCCAACTATCATACTAAAAGATGGAAAAGTATTTATGGTAGTAGGTAGTCCAGGTGGTTCTAGGATCATCACGACAGTTTTACAAGTGATTTCAAATGTGATCGATCATAAAATGGATATATCAACAGCGGTAGAATCTCCA
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	Campylobacter_coli_Clade_2   gtagctgtaggctacgctttagccgtggtacatcctgcagcaggaaacataggcggtgggggctttgcggttattcatctagcaaatggagaaaatgttacattagactttagggaaatggcacctttaaaagcaagcaaagatatgtatcttgatgacaaaggggaagttgtccaagatgcttcaactataggctatttagccgccggagtaccaggaacagtcaaaggtatgagtgctatgcttgatcgctatggcactatgaaattaaaagacttgatggctcctgctatagaactagctgaaaaaggctatcttatcaacaatagacaagaacaaaccttgctagaagccaaagatatgtttaaaaaatttcctagctcaagtaaatatttccttaaagatggtagtacttataaaagtggggagttgtttatccaaaaagatctagcaaagactttaaaactcatcgccaaagaaggccctgatgctttttataaagggaaaattgcagatctaatagcaaatgatatggctaaaaatggtatcatcaccaaagaagatctagcacaataccaagtcatttggagaaaacccgtaaaaggtacttatagaggctatgatattatttctatgtcgccacctagtagcgggggtactcatatcattcaaattttaaacatcatggaaaatgctaatatagaaaatttaggttttgcaagctctaaaactttacacataatggctgaagctatgcgtcaagcttatgcagatagatcagaatacatgggtgatcctgattttgtaaaaattccacttgataaactcacaagtaaagaatacgctaaagaaatctatgcaaaaattaaagataaagccttaccaagctcaaaagttaaaccgggtttaggacaaattcatgaaggatataataccactcattattctgtgctagatggcaagggtaatgcagtaagcattacttatacaattaatgcaagctatggctcaggtgctgctatcgatggagcaggatttttgctcaacaatgaaatggatgatttttcaatcaaaccaggagttccaaacctatatggacttgtaggcggggaggctaacgctatagaacctaaaaaaagacctttaagctctatgagtccgactatcatacttaaagatggaaaagtatttatggtggtgggtagcccaggcggctctagaatcatcacaacagttttgcaagtgatttcaaatgtaatcgatcataaaatggatatatcaacagcggtagaatctcca
	Helicobacter_bizzozeronii    GTGGCAATTGGCTATGCCCTAGCGGTGGTGCATCCAGCCGCAGGCAATATTGgCGGGGGGGGCTTTGCGGTGATTCATTTGGCTAATGGGGATAATCTCACCCTTGATTTTAGGGAGAAAGCCCCcTTAAGAGCCACCAAAAACATGTATTTGGATCGCGATGGCAAAGTGATCCCTAATTTGAGCACCGATGGCTACTTGGCTGCTGGGGTTCCGGGCACCGTGGCGGGTTTGAGTGAAATGTTAGACAAATACGGGACTAAAAAATTAGCCACCTTGATCCAGCCTGCTATTGATTTGGCTGAAAAAGGTTTTAAACTCAGTGCTAGACAAGGGGAAACCATGCTAGCTGCCAAGGAGCGTTTTGCCAAATATGCCAGTAGCCGCAAGTATTTTTTGAAAGGCATGGTGTCTTATCGGGAGGGGGATTTATTTGTGCAAAGCGATTTAGCCAAGACTCTCACCCTCATTAAAGAGCAAGGTCCTAGTGCTTTTTACAAGGGCAAAATCGCCGAATTGATCGCAGAGGATATGCGCCGCAATGGGATCATCACTAAGGAGGATTTAGCACAATATAATGTCGTGTGGCGCAAACCCGTTGTGGGCACTTATCGGGGCTATAAGATCGTTTCTATGGGTCCGCCTAGCTCAGGAGGCACGCACATCATTGAGATTTTAAACACAATGGAGAATGCCGACATTGGCAGCTTAGGCTTTGGCTCTAGCCAAACCATGCACATCATGGCAGAGGCGATGCGCCAAGCCTATGCCGATCGCTCCCTTTACATGGGCGATCCCGATTTTATCACCATCCCGGTTGAAAAACTCACCAGCAAACCTTATGCTAAAAAGGTCTATGAAAATATCCCCAACTTAGCCACTGATAGCACCAAGATCAACCCCGGGTTAGGGCAATTACATGAGGGCAAAAACACCACGCATTATTCTGTTGCGGACAAATGGGGGAATGCGGTGAGTATTACCTACACGATCAACGCTTCTTATGGGAGTGCTGCTGCCATTGAGGGGGCGGGCTTTTTACTTAATAACGAAATGGATGATTTTTCAATCAAGGCAGGTTCGCCCAATATATACGGGCTTGTGGGGGGCGATGCTAATTCCATTGAGCCCAAAAAACGCCCCTTAAGCTCCATGTCGCCAACCATTGTGCTTAAAAACAACAAGGTTTTCATGGTCGTGGGCAGTCCGGGTGGGGCGCGCATCATCACCACGGTTTTACAAGTGATCAGCAATGTAATCGATCATGGCATGAACATCGCAGAAGCCATCACCGCCCCG
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;



END;

BEGIN TREES;
	Title 'Gamma-Glutamyl Transpeptidase GGTfna2';
	LINK Taxa = Taxa;
	TRANSLATE
		1 Helicobacter_bilis,
		2 Escherichia_coli,
		3 Heliocobacter_acynonichis,
		4 Helicobacter_pylori,
		5 Campylobacter_jejuni_doylei,
		6 Campylobacter_jejuni_81176,
		7 Campylobacter_jejuni_260.94,
		8 Campylobacter_coli_76339,
		9 Campylobacter_coli_Clade_2,
		10 Helicobacter_bizzozeronii,
		11 Helicobacter_felis,
		12 Helicobacter_trogontum,
		13 Helicobacter_canis;
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