NEXUS
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[Matrix accession#: M2635]

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	TITLE M2635;
	DIMENSIONS  NTAX=34;
	TAXLABELS
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	;
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BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M2635;
	DIMENSIONS NCHAR=828;
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	MATRIX
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		Encalypta_armata                                AAAGT---TTAGAAATAATAAAATTAGTTACTGATTGTATTGAAAAAAAA--------------------------------TATTTAGTATCAACTCGATCATTTAATTATTGAGTAACACGGTTATTTTAAATTTATTACTTCGATATAAAG----------TATAAAAGTACATACAATATAAAAAAAG------------------------------------------TTAAAAGTTGTAACAAATAAATATTTATTACTATTATT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAATGATAAATTTATTTAAATAATAAAAAAAGAAA-------TTTATTGTTTCCTTTTAT---AAAAAAAAGAAATTTTGCAACAGTTTCTTTTTTATTATTTTTTA---------ACAC--TTTAATACTAATTTTAATTAAAT---TTTATTAATTAGTTTAACATTCGAAAGATTATTAGGTCAATGCTTAAAAAAATAAAAAGAATTT-ACGAAAAAA--GAATCTGAGTTGCATCAAATGTAGAAAATAATATACAATAATATTGTTTTGTTATAGG-AAAATTATTATGTCTAAAAAAAAATAGAC-AAAATTAAATATTAAATAAGCTTTTTCTT------TTAGTCTTGTT--------AAAAATCTTATTTGTCGAGCAGACCTCATCCTTGCAAGAGTTATTAATTGAG
		Ditrichum_flexicaule                            AGAAT---TTAGAAGTAATAAAATTAGTTGCTGATTGTATTGAAAAAA----------------------------------TATTTAGTATCAACTCGATCATTTAATTATTGAGTAAAAGAATTATCTTAAACTTATATAAA--------------------TATATAAGTAAATAAAATAAAAAAAA--------------------------------------------TTAAAAGTTGTAACAAGTAAATCTTTCTTGTA------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GCATAAAATTATTA-------GTAAA-TAATAAA---------------TCT-----A-TTTAAAT-AAAAAAAAAGAAATT-------------TTTTTTTTTATTTTTTA---------ATAC--TTTTTAATTAAATTTTATT-------TTTATTAATTAGTTTAACATTTGAAAGATTATTAGGTCAATGCTTAGAAAAACAAAAACAATTT-ACTAAAAAA--TAATCTGAGTTGCATCAAATGTAAAAAATAATATACAATGATAC-GTTTTGTTATAGG-AAAATCACTTTGTCT----AAAAATAGAC-AAAATTAAATAGCAAAGAAATTTTTTTCTAAGACT--------------AAAAGAAAAAACTTCTTTGTCGAGCAGACCTCATCCTTGCAAGAATTATCAATTGAG
		Diphyscium_foliosum                             AAAAT---TTAGAAGTAATAAAATTAGTTGCTGATTGACTTGAAAAA-----------------------------------TATTTAGTATCAACTCGATCATTTAATTATTGAATAAATTTTTTATTTTGAACTTATTGCGTATATATATAGATATAATATATATCTAAGTAAATAAAAAATTTAAAAATGATAACAAATAAATATGGATTATCATAAAAAAATTAGTTTAT----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTTTCTCTTTTAGTATTTTG---------ATACTAAATTGAATTAAACTTAATT-------TTTATTAATTAGTTTAACATTCAAAAGAATCTTAGGTCAATGCTTAAAAAAACAGAAACAGATT-AATTAAAAAAATAATCTGAGTTGCATCAAATGTAAAAAATAATATACAATGATAC-GTTTTGTTATAGGAAAAATCATTTTGTCT----AGCAATAGATGAAAATTTAGTAACAAATAAGTTTCTTCTT------TTAGTTTTAT--------AGAAGATTCTATTTGTCGAGCAGACCTCATCCTTGCAAGAGTTATTAATTGAG
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	;
END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions = 
 N: 1 - 828 ; 
 CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
CHARSET messyatpB = 190 - 234 266 - 372 466 - 472 517 - 525 551 - 557 758 - 768 ; 
 CHARSET atpBrbcLspacer = 1 - 828 ; 
 OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 END;