NEXUS
[File created by TreeBASE:  7/26/07  21:11:48]
[Matrix accession#: M2640]

BEGIN TAXA;
	TITLE M2640;
	DIMENSIONS  NTAX=18;
	TAXLABELS
		Trichonympha_agilis	Pseudotrichonympha_grassii_06B88	Holomastigotoides_mirabile_02A21	Spirotrichonympha_leidyi_13A66	Devescovina_sp._D75	Devescovina_sp._D77	Stephanonympha_sp._St01	Stephanonympha_sp._St03	Stephanonympha_sp._St08	Trichomitus_batrachorum_1	Trichomitus_batrachorum_2	Hypotrichomonas_acosta	Monocercomonas_sp.	Tritrichomonas_foetus_1	Tritrichomonas_foetus_2	Tetratrichomonas_gallinarum	Trichomonas_vaginalis_1	Trichomonas_vaginalis_2
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M2640;
	DIMENSIONS NCHAR=243;
	FORMAT datatype = protein gap = - ;
	MATRIX
		Trichonympha_agilis                    GRLVFRAFLYPEQVVAIHDLPITNHLLKYDSAHGGVFCSGWVQNEKVPSLPWDLVDFVLESTGYKASGVDGYDGHIAGAKKVVLSVPASDAIQCTLVCGVNEDLPVISNASCTTNCLGPVAKINFISGFMTTVHSYTNDQKVADMHDLRRARAAANIIPTSTGAAKALPIVVLCLDGALRVPTITGSLVDSVNVVTQVNALKAASPLKGILYTDEIVSTDIISSILDSLTKVINGGTLVKVLS
		Pseudotrichonympha_grassii_06B88       GRLVFRARLYPEKVVAIHDLPITNHLLKYDSAHGEIFVGGWVQNEKVPALPWELVDFVLESTGFKKDGVDGYDGHIAGAKKVILSVPASDDIQCTLVCGVNEDLPIISNASCTTNCLGPVAKINFINGFMTTVHSYTNDQKVADMHDLRRARAAANIIPTSTGAAIALPIVVLSLDGALRVPTITGSLVDTVNVVTDVNAVEAASALKGILYVDPIVSTDIISSVFDSLTKVINGGSLVKVLS
		Holomastigotoides_mirabile_02A21       GRLVFRARLYPEQIVAIHDLDITNHLLKYDSAHGEIFVGGWVKNGRIPWLPWELVDVVLESTGYKKDGVDGYDGHIAGARKVVLSVPAGDEIECTLVLGVNEDLPTISNASCTTNCLAPVTKIHWVNGFMTTVHAYTNDQQVADAHDLRRARAAGNIIPTSTGAAKALPIVVLSLDGSIRVPVITGSLVDSFNVPTEVNALKEASPLKGILYVDPIVSSDIISSIVDSETKVIHGGAIVKVLS
		Spirotrichonympha_leidyi_13A66         GRLVFRARLYPEQVVAIHDLAIVNHLLKYDSAHGEIFVGGWVENGRIPKLKWEKVDVVLESTGYKKDGVDGYDGHIAGAKKVVLSVPAGDEIECTLVLGVNEDVPTISNASCTTNCLAPITKINWITGFMTTVHAYTNDQQVADAHDMRRARAAANIIPTSTGAAKALPIVVLSLDGSIRVPVITGSLVDSFNVPTEINALKAATPLKGILYTDAIVSSDIISSIVDSETKVINGSALVKVLS
		Devescovina_sp._D75                    GRLVFRARLYPEQVVAIHDLEITNHLLKFDTAHKEIFVGGWVKNGRLPSLPWDLVDIVLESTGFKHNGVDGYDGHIAGAKRVVLSVPSADEIECTLVLGVNEDLPTISNASCTTNCLAPVVKLNFVNGFMTTVHSYTNDQVVSDMHDLRRARAAGNIIPTSTGAAIALPRVVLSLDGSLRVPTLTGSLVDTLNLVTEVNALIAATELKGILFSDPLVSSDIVSSIVDGSTKVITAGSLVKVLS
		Devescovina_sp._D77                    GRLVFRARLYPEQVIAIHDLDITNHLLKFDTAHNEIFVGGWVKNGRLPSLPWELIDVVLESTGFKHNGVDGYDGHIAGAKRVVLSVPSADEIECTLVLGVNEDLPTISNASCTTNCLAPVVKLNFVNGFMTTVHSYTNDQVVSDMHDLRRARAAGNIIPTSTGAAIALPKVVLCLDGSLRV?TLTGSLVDTLNLVTEVNALTDAAELKGVLFSDPLVSSDIVSSIVDGSTKVITAGSLVKVLS
		Stephanonympha_sp._St01                GRLVFRARLYPEQVVAIHDLDLTNHLLKFDTAHKEIFIGGWVKSGRLPSLPWELVDVVLESTGFRKDGVDGYDGHISGAKKVVLSVPSADEIECTLVLGVNEDLPTISNASCTTNCLAPLVKLNFVNGFMTTTHSYTNDQVVSDMHDLRRARAAANIIPTSTGAAIALPRVVLSLDGSLRVPTLTGSLVDSLNLVTEVNALIAATELQGILFSDPLVSSDIVSSIVDGSTKVITLGSLVKVLS
		Stephanonympha_sp._St03                GRLVFRARLYPEQVVAIHDLDLTNHLLKFDTAHKEIFIGGWVKSGRLPSLPWDLVDVVLESTGFKKDGVDGYDGHISGAKKVVLSVPSADEIECTLVLGVNEDLPTISNASCTTNCLAPLVKLNFVNGFMTTTHSYTNDQVVSDMHDLRRARAAANIIPTSTGAAIALPRVVLSLDGSLRVPTLAGSLVDSLNLVTEVNALIAATELQGILFSDPLVSSDIVSSIVDGSTKVITLGSLVKVLS
		Stephanonympha_sp._St08                GRLVFRARLYPEQVVAIHDLDLTNHLLKFDTAHKEIFIGGWVKSGRLPSLPWELVDVVLESTGFRKDGVDGYDGHISGAKKVVLSVPSADEIECTLVLGVNEDLPTISNASCTTNCLAPLVKLNFVNGFMTTTHSYTNDQVVSDMHDLRRARAAANIIPTSTGAAIALPRVVLSLDGSLRVPTLTGSLVDSLNLVTEVNALIAATELQGILFSDPLVSSDIVSSIVDGSTKVITLGSLVKVLS
		Trichomitus_batrachorum_1              GRLAFRARRYAEQIVAIHDIDITNHLLKYDSAHGEIFVGGWVKSGRTPSLPWEMIDIVLESTGFRKDGVDGYDGHIAGAKKVLLSVPSLDEIDGVIVVGVSNDLKMISAASCTTNCLAPIVKLMFVCGFLTTVHAFTNDQIVADKHDLRRARSAGNMIPTSTRAKFVLPKVILSMDGSIRVPIITGSLVETAVVCTEVNALRAATPLVGILYTDPIVSTDIRSSIIDSSTKAIIGGTLVKVLS
		Trichomitus_batrachorum_2              GRLVFRARRYADQVVAIHDLDLTNHLLKYDSAHGDLFVGGWVKSGRIPSLPWELVDVVLESTGFRKDGVDGYDGHLAGAKKVVLSVPSADEIECTLVLGVNEDLKTISNASCTTNCLAPVAKLMFINGFMTTVHSYTNDQVVADVHDLRRARSAANMIPTSTGAAIALPKVVLSMDGSIRVPTVTGSIVDTVNVCTEVNALKAATPLVGIMYTDPIVSTDIISSIVDSCTKVINGGSLVKVLS
		Hypotrichomonas_acosta                 GRLVFRARLYPEQVVAVHDLNVVNHLLKYDTAHGEIFVGGWINSGSDPSLPWELVDVVLESTGFRK-GDEGYYGHIAGAKKVILSAPADDDIESTLVLGVNSDLPTISNASCTTNALGPVAQIMFINGFMTTVHAYTNDQVVHDVHDPRRARSACNIVPTSTGIAKALPKVVLSFNGSFRVPVVTGSLIDTVLVCTEVNALKTATPLKGIMYSEPLVSSDIISCVVDGSTQVMT-GSLIKILA
		Monocercomonas_sp.                     GRLVFRARLYPEQIVAIHDLDITNHLLKYDTAHREIFVGGWVKCGRLPSLPWELVDVVLESTGFRHDGVDGYDGHISGAKRVVLSVPSADEIECTLVLGVNEDFAVVSNASCTTNCLAPVTKINFVNGFMTTVHSYTNDQVVSDMHDLRRARAAANIIPTSTGAAIALPRVVLSMDGSLRVPTITGSLVDTFNVVTEVNALKAACALKGIMFTDPIVSSDIISSIVDGSTMVLNGGSLVKVLS
		Tritrichomonas_foetus_1                GRLVFRARLYPEQVVAIHDLDITNHLLNYDSAHREVFVGGWVKNGRLPSLPWELVDVVLESTGFRHD-VDGYDGHIAGAKKVVLSVPSADEIECTLVLGVNEDLPTISNASCTTNCLAPVVKINFVNGFMTTVHSYTNDQVVSDMHDLRRARAAANIIPTTTGAAIALPRVVLSMDGSLRVPTITGSLVDTVNTVTQVNALKAAAALKGILYTDPIVSSDIISSIVDGSTMVLNGGSLVKVLS
		Tritrichomonas_foetus_2                GRLVFRARLYPEQIVAVHDLDITNHLLNYDSAHQELFVGGWVKNGRLPSLPWELVDVVLESTGFRHDGVDGYDGHLAGAKKVVLSVPSADEIECTLVLGVNEDLPTISNASCTTNCLAPVIKLNFINGYMTTVHAYTNDQVVSDMHDLRRARAAANIIPTSTGAAIALTRVVLCMDGALRVPAITGSLVDTVNTVTQVNALKAASALRGILYTEPIVSSDIISSIVDSSTMVLNGGSLVKVLS
		Tetratrichomonas_gallinarum            GRLVFRARLYPDQVVAIHDLDLTNYLLRYDSAHREILIGGWVKSGRLPSLPWEMIDVVLESTGFRKDGVDGYDGHIAGAKKVVLSVPSADEIECTLVLGVNEDLPTISNASCTTNCLGPVAKLNFISGFMTTVHSYTNDQVVADMHDLRRARAAGNIIPTSTGAAIALPKVCLSLDGALRVPTITGSLVDTVNVCTEVNALKKATSLKGIMYVDPIVSTDIISSIVDSSTKVLNGGTLVKVLS
		Trichomonas_vaginalis_1                GRLVFRARLYPDQVVAIHDLDITNYLLKYDTAHREVFVGGWVKSGRLPSLPWELIDVVLESTGFRKEGIDGYDGHLSGAKKVVLSVPSADEIECTLVLGVNEDLPTISNASCTTNCLGPVAKLNFINGFMTTVHSYTNDQVVADMHDLRRARAAGNIIPTSTGAAIALPKVCLSLDGALRVPTITGSLVDTVNVVTEVNALKKATSLKGIMYVDPIVSSDIISSIVDASTKVLNGGTLVKVLS
		Trichomonas_vaginalis_2                GRLVFRARLYPDQVVAIHDLDITNYLLKYDTAHREVFVGGWVKSGRLPSLPWELIDVVLESTGFRKDGVDGYDGHISGAKKVVLSVPSADEIECTLVLGVNEDLPTISNASCTTNCLGPVAKLNFINGFMTTVHSYTNDQVVADMHDLRRARAAGNIIPTSTGAAIALPKVCLSLDGALRVPTITGSLVDTVNVVTEVNALKKATSLKGIMYVDPIVSSDIISSIVDASTKVLNGGTLVKVLS
	;
END;