#NEXUS [written Fri Feb 07 19:03:00 JST 2014 by Mesquite version 2.75 (build 564) at R-PC/133.11.3.167] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=34; TAXLABELS Chloromonas_serbinowii Chloromonas_reticulata Chloromonas_asteroidea Chloromonas_typhlos Chloromonas_radiata Gloeomonas_lateperforata Chloromonas_rubrifilum Chloromonas_augustae Chloromonas_carrizoensis Chloromonas_pseudoplatyrhyncha Chloromonas_tughillensis Chloromonas_chenangoensis Chloromonas_fukushimae Chloromonas_kasaiae 'Chloromonas sp. NIES-2379/2380' Chloromonas_tenuis Chloromonas_pichinchae Chloromonas_hohamii Chloromonas_rosae Chloromonas_nivalis_UTEX_SNO66 Chloromonas_polyptera 'Chloromonas sp. 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Chloromonas_tughillensis 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Chloromonas_kasaiae 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'Chloromonas sp. NIES-2379/2380' 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Chloromonas_tenuis 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Chloromonas_nivalis_UTEX_SNO66 AGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATAATCTGCTTTATACTGAGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTAAAGTTTATTTGATGGTACTTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCGAAAATCCCGACTTCTGGAAGGGACGTATTTATTAGATAAAAGGCCAGCCGTGCTTGCACGACTTGAGTTGAATCATGATAACTCCACGAATCGTACGGCCTTGTGCTGACGATATTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGAGGCCTACCATGGTGGTAACGGGTGACGGAGGATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAATGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACCGGGCATTTAATGTCTGGTAATTGGAATGAGTACAATCCAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCGGGTGGGTCGCACCGGTCCGGCTTCGGCTGCGTACTATTGTGGCTCACCTTTCTGCCGGAAACGGACTCTCGGGCTTCACTGTCCGGGATCCGGAGTCGGCGAGGTTACTTTGAGTAAATTTGAGTGTTCAAAGCAAGCCTACGCTCTGAATACGTTAGCATGGGATAACACGATAGGACTCTGGCCTATCTTGTTGGTCTGTAGGACCGGAGTAATGATCAAGAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTACATGGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTCATGTAAGACGAACTTCTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATTAGATACCGTCGTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACTAGGGATTGGCAGGTGTTCTTTTGATGACCCTGCCAGCACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTTACCAGGTCCAGACACGGGGAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGGTTGCCTTGTCAGGTTGATTCCGGTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAAATAGTCACCTCTGCTTTTCGCAGTTGGCCGACTTCTTAGAGGGACTATTGTCGTTTAGGCAATGGAAGTATGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGCGTTCAACGAGCCTATCCTTGGCCGAGAGGCCCGGGTAAT-CTTGGAAACCGCATCGTGATGGGGATAGATTATTGCAATTATTGGTCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAGGCGCGAGTCATCAGCTCGCGTCGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGAATGTGCTGGTGAGATTTGAGGACCGGACTAACTCGGTGGCAACACTGGATTGGTCTGGGAAACAAATCGAACCCTCCCATTTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCC Chloromonas_polyptera 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'Chloromonas sp. CCCryo 047-99' AGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATAAACTGCTTTATACTGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTATTTGATGGTACTTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCGTAAATCCCGACTTCTGGAAGGGACGTATTTATTAGATAAAAGGCCAGCCGGGCTTGCCCGACTTTAGGTGAATCATGATAACTCCACGAATCGCATGGCCTTGTGCCGGCGATGTTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGAGGCCTACCATGGTGGTAACGGGTGACGGAGGATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAATGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACCGGGCATTTTATGTCTGGTAATTGGAATGAGCACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCGGGTGGGTGGCAGTGGTCCGGTTC--GCTGTGTACTGCTGCTGCCTATCTTTCTGCCGGAAACGGGCTCTTGGGCTTTACTGTCTGGGACCCGGAGTCGGCGAGGTTTCTTTGAGTAAATTAGAGTGTTCAAAGCAAGCTTACGCTCTGAATACATTAGCATGGAATAACACGATAGGACTCTGGCCTATCTTGTTGGTCTGTAGGACTGGAGTAATGATTAAGAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACTTCTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATTAGATACCGTCGTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACTAGGGATTGGCAGGTGTTCTTTTGATGACCCTGCCAGCACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTTACCAGGTCCAGACACGGGGAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGGTTGCCTTGTCAGGTTGATTCCGGTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAAATAGTCACATCTGCCTCTCGCAGCTGGCCGACTTCTTAGAGGGACTATTGTCGTTTAGGCAATGGAAGTATGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGCGTTCAACGAGCCTATCCTTGGCCGAGAGGCC-GGGTAAT-CTTCGAAACCGCATCGTGATGGGGATAGATTATTGCAATTATTAGTCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAAGCGCGAGTCATCAGCTCGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGGGTGTGCTGGTGAAGTGTTCGGATTGGCTTCAGCTGGTGGCAACACTGGTTGGAGCTAAGAAGATCATTAAACCCTCCCACCTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCC 'Chloromonas nivalis CCCryo 005-99' AGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATAAACTGCTTTATACTGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTATTTGATGGTACTTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCGTAAATCCCGACTTCTGGAAGGGACGTATTTATTAGATAAAAGGCCAGCCGGGCTTGCCCGACTTTAGGTGAATCATGATAACTCCACGAATCGCATGGCCTTGTGCCGGCGATGTBTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGAGGCCTACCATGGTGGTAACGGGTGACGGAGGATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAATGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACCGGGCATTTTATGTCTGGTAATTGGAATGAGCACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCC-GCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCGGGTGGGTGGCAGTGGTCCGGTTC--GCTGTGTACTGCTGCTGCCTATCTTTCTGCCGGAAACGGGCTCTTGGGCTTTACTGTCTGGGACCCGGAGTCGGCGAGGTTACTTTGAGTAAATTAGAGTGTTCAAAGCAAGCTTACGCTCTGAATACATTAGCATGGAATAACACGATAGGACTCTGGCCTATCTTGTTGGTCTGTAGGACTGGAGTAATGATTAAGAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACTTCTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATTAGATACCGTCGTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACTAGGGATTGGCAGGTGTTCTTTTGATGACCCTGCCAGCACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTTACCAGGTCCAGACACGGGGAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGGTTGCCTTGTCAGGTTGATTCCGGTAACGAACGAGACCTCAACCTGCTAAATAGTCACATCTGCCTCTCGCAGCTGGCCGACTTCTTAGAGGGACTATTGTCGTTTAGGCAATGGAAGTATGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGCGTTCAACGAGCCTATCCTTGGCCGAGAGGCC-GGGAAAAACTTCGAAACCGCATCGTGATGGGGATAGATTATTGCAATTATTAGTCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAAGCGCGAGTBATCAGCTCGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGGGTGTGCTGGTGAAGTGTTCGGATTGGCTTCAGCTGGTGGCAACACTGGTTGGAGCTAAGAAGATCATTAAACCCTCCCACCTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCC 'Chloromonas cf. platystigma CCCryo 020-99' AGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATAAACTTCTTTATACTGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTAAAGTTTATTTGATGGTACTTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCGTAAATCCCGACTTCAGGAAGGGACGTATTTATTAGATAAAAGGCCAGCCGGGCTTGCCCGACTTTAGGTGAATMATGATAACTCSACGAATCGCATGGCCTTGTGCCGGCGATGTTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGAGGCCTACCATGGTGGTAACGGGTGACGGAGGATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAATGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACCGGGCATTTTATGTCTGGTAATTGGAATGAGCACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGGGAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCGGGTGGGTTGCAGCGGTCCGGTTC--GCTGTGTACTGCTGTGGCCTTCCTTTCTGCCGGAAACAGACTCTTGGGCTTCACTGTCCGGGATCTGGAGTCGGCGAGGTTACTTTGAGTAAATTAGAGTGTTCAAAGCAAGCTTACGCTCTGAATACATTAGCATGGAATAACACGATAGGACTCTGGCCTATCTTGTTGGTCTGTAGGACCGGAGTAATGATTAAGAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACTTCTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATTAGATACCGTCGTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACTAGGGATTGGCAGGTGTTCTTTTGATGACCCTGCCAGCACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTTACCAGGTCCAGACACGGGGAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGGTTGCCTTGTCAGGTTGATTCCGGTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAAATAGTCACATCTGCCTCTCGCAGCTGGCCGACTTCTTAGAGGGACTATTGTCGTTTAGGCAATGGAAGTATGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGCGTTCAACGAGCCTATCCTTGGCCGAGAGGCCCGGGTAAT-CTTAGAAACCGCATCGTGATGGGGATAGATTATTGCAATTATTAGTCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAAGCGCAAGTCATCAGCTTGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGGGTGTGCTGGTGAAGTGTCCGGATTGGGTTCAGCTGATGGCAACATCGGCTGTTTCTAAGAAGGTCATTAAACCCTCCCACCTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCC 'Chloromonas rostafinskii CCCryo 010-99' ????????GCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATAAACTGCTTTATACTGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTAAAGTTTATTTGATGGTACTTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCGTDAATCCCGACTTCTGGAAGGGACGTATTTATTAGATAAAAGGCCAGCCGGGCTTGCCCGACTTTAGGTGAATCATGATAACTCCACGAATCGCATGSCCTTGTGCCGGCGATGTTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGAGGCCTACCATGGTGGTAACGGGTGACGGAGGATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAATGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACCGGGCATTTAATGTCTGGTAATTGGAATGAGCACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCARSCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCGGGTGGGTTGCAGCGGTCCGGTTC--GCTGTGTACTGCTGCGGCCTTCCTTTCTGCCGGGGACAGACTCTTGGGCTTAACTGTCCGGGATCTGGAGTCGGCGAGGTTACTTTGAGTAAATTAGAGTGTTCAAAGCAAGCTTACGCTCTGAATACATTAGCATGGAATAACACGATAGGACTCTGGCCTATCTTGTTGGTCTGTAGGACCGGAGTAATGATTAAGAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACTTCTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATTAGATACCGTCGTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACTAGGGATTGGCAGGTGTTCTTTTGATGACCCTGCCAGCACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTTACCAGGTCCAGACACGGGGAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGGTTGCCTTGTCAGGTTGATTCCGGTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAAATAGTCACATCTGCCTCTCGCAGCTGGCCGACTTCTTAGAGGGACTATTKTYKTTTAGGCAATGGAAGTATGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGCGTTCAACGAGCCTATCCTTGGCCGAG---CGCGGGTAAT-CTTCGAAACCGCATCGTGATGGGGATAGATTATTGCAATTATTAGTCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAAGCGCGAGTCATCAGCTCGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGGGTGTGCTGGTGAAGTGTCCGGATTGGCTTCASSTGATGGCAACATCGGTTGTGGCTGAGAAGGTCATTAAACCCTCCCACCTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCC 'Chloromonas cf. nivalis cyst, sample P24/DR4' ?????TATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATAAACTGCTTTATACTGTGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTATTTGATGGTACTTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCGTAAATCCCGACTTCTGGAAGGGACGTATTTATTAGATAAAAGGCCAGCCGGGCTTGCCCGACTTGAGGTGAATCATGATAACTCCACGAATCGCACGGCCTTGTGCCGGCGATGTTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGAGGCCTACCATGGTGGTAACGGGTGACGGAGGATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAATGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACCGGGCATTTTATGTCTGGTAATTGGAATGAGCACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCGGGTGGGTTGCAACGGTCCGGTTC--GCTGTGTACTGTTGCGGCCTATCTTTCTGCCGGGGACGGGCTCTTGGGCTTCATTGTCTGGGATCCGGAGTCGGCGAGGTTACTTTGAGTAAATTAGAGTGTTCAAAGCAAGCTTACGCTCTGAATACATTAGCATGGAATAACACGATAGGACTCTGGCCTATCTTGTTGGTCTGTAGGACTGGAGTAATGATTAAGAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACTTCTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATTAGATACCGTCGTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACTAGGGATTGGCAGGTGTTCTTTTGATGACCCTGCCAGCACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTTACCAGGTCCAGACACGGGGAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGGTTGCCTTGTCAGGTTGATTCCGGTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAAATAGTCACATCTGCCTCTCGCAGCTGGCCGACTTCTTAGAGGGACTATTGTCGTTTAGGCAATGGAAGTATGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGCGTTCAACGAGCCTATCCTTGGCCGAGAGGCCCGGGTAAT-CTTCGAAACCGCATCGTGATGGGGATAGATTATTGCAATTATTAGTCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAAGCGCGAGTCATCAGCTCGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGGCCGCCTCASTGAGGACTGGGGATCGGTCTCAGCTGGTGGCAACACCGGYTGTGACCGAGAACCTGTCCAAAGTTCGTCGGCTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCC Chloromonas_rosae_var._psychrophila 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'Chloromonas sp. red flagellates, sample HW01/clone1' AGTCATATGCTGGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATAAACTGCTTTATACTGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTATTTGATGATATTTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCGCACATCCCGACTTCTGGAAGGGACGTATTTATTAGATAAAAGGCCAGCCGAGCTTGCTCGACTTGAGGTGAATCATGATAACTCCACGAATCGCATGGCCTAGTGCCGGCGATATTTCTTTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGAGGCCTACCATGGTGGTAACGGGTGACGGAGGATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAATGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCAACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACCGGGCATT-AATGTCTGGTAATTGGAATGAGCACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCGGATGGGTAGCAATGGTCCGGTTC--GCTGAGTACTCTTGCTGCCTATCTTTCTGCCGGAAATGGGATCTTAGGCTTTACTGTCTGAGACCTAGAGTCGGCGAGGTTACTTTGAGTAAATTAGAGTGTTCAAAGCAAGCTTACGCTCTGAATACATTAGCATGGAATAACACAATAGGACTTCGGCCTATCTTGTTGGTCTGTAGGACTGAAGTAATGATTAAGAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACTTCTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATTAGATACCGTCGTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACTAGGGATTGGCAGGTGTTCTTTTGATGACCCTGCCAGCACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTTACCAGGTCCAGACACGGGGAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGGTTGCCTTGTCAGGTTGATTCCGGTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAAATAGTCACATCTGCCTCTCGCAGCTGGCCGACTTCTTAGAGGGACTATTGTCGTTTAGGCAATGGAAGTATGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGCGTTCAACGAGCCTATCCTTGGCCGAGAGGCCCGGGTAAT-CTTCGAAACCGCATCGTGATGGGGATAGATTATTGCAATTATTAGTCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAAGCGCGAGTCATCAGCTCGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGAGTGTGCTGGTGAAGTGTTCGGATTGGCCTCAGTCTGTGGCAACACCGATTGGGGCTGAGAAGATC??????????????????????????????????????????????? 'Chloromonas sp. red flagellates, sample HW01/clone17' AGTCATATGCTG-TCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATAAACTGCTTTATACTGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTATTTGATGATATTTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCGCACATCCCGACTTCTGGAAGGGACGTATTTATTAGATAAAAGGCCAGCCGAGCTTGCTCGACTTGAGGTGAATCATGATAACTCCACGAATCGCATGGCCTAGTGCCGGCGATATTTCTTTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGAGGCCTACCATGGTGGTAACGGGTGACGGAGGATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAATGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCAACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACCGGGCATT-AATGTCTGGTAATTGGAATGAGCACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCGGATGGGTAGCAATGGTCCGGTTC--GCTGAGTACTCTTGCTGCCTATCTTTCTGCCGGAAATGGGATCTTAGGCTTTACTGTCTGAGACCTAGAGTCGGCGAGGTTACTTTGAGTAAATTAGAGTGTTCAAAGCAAGCTTACGCTCTGAATACATTAGCATGGAATAACACAATAGGACTTCGGCCTATCTTGTTGGTCTGTAGGACTGAAGTAATGATTAAGAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACTTCTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATTAGATACCGTCGTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACTAGGGATTGGCAGGTGTTCTTTTGATGACCCTGCCAGCACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGCGCGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTTACCAGGTCCAGACACGGGGAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGGTTGCCTTGTCAGGTTGATTCCGGTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAAATAGTCACATCTGCCTCTCGCAGCTGGCCGACTTCTTAGAGGGACTATTGTCGTTTAGGCAATGGAAGTATGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGCGTTCAACGAGCCTATCCTTGGCCGAGAGGCCCGGGTAAT-CTTCGAAACCGCATCGTGATGGGGATAGATTATTGCAATTATTAGTCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAAGCGCGAGTCATCAGCTCGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGAGTGTGCTGGTGAAGTGTTCGGATTGGCCTCAGTCTGTGGCAACACCGATTGGGGCTGAGAAGATC??????????????????????????????????????????????? 'Chloromonas reticulata CCCryo 154-01' AGTCATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATAAACTGCTTTATACTGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTATTTGATGGTACTTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCGCACATCCCGACTTCTGGAAGGGACGTATTTATTAGATAAAAGGCCAGCCGGGCTTGCCCGACTTGAGGTGAATCATGATAACTCCACGAATCGCATGGCCTTGTGCCGGCGATATTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGAGGCCTACCATGGTGGTAACGGGTGACGGAGGATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAATGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACCGGGCATTTAATGTCTGGTAATTGGAATGAGCACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCGGGGGGGTCTTAGCGGTCCGGTTC--GCTGTGTACTGCTAGGGCCCTCCTTTCTGCCGGGAACAGGCTCTTGGGCTTAACTGTCTGGGACCTGGAGTCGGCGAGGTTACTTTGAGTAAATTAGAGTGTTCAAAGCAAGCCTACGCTCTGAATACATTAGCATGGAATAACACGATAGGACTCTGGCCTATCTTGTTGGTCTGTAGGACCGGAGTAATGATTAAGAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACTTCTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATTAGATACCGTCGTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACTAGGGATTGGTAGGTGTTCTTTTGATGACCCTACCAGCACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTTACCAGGTCCAGACACGGGAAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGGTTGCCTTGTCAGGTTGATTCCGGTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAAATAGTCACATCTGCCTCTCGCAGTTGGCCGACTTCTTAGAGGGACTATTGTCGTTTAGGCAATGGAAGTATGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGCGTTCAACGAGCCTATCCTTGGCCGAGAGGCCCGGGTAAT-CTTGAAAACCGCATCGTGATGGGGATAGATTATTGCAATTATTAGTCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAAGCGCGAGTCATCAGCTCGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGGGTGTGCTGGTGAAGTGTTCGGATCGGCTTCATCTGGTGGCAACATCGGGTGTCGCTGAAAAGATCATTAAACCCTCCCACCTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCC 'Chloromonas cf. schussnigii CCCryo 082-99/Chloromonas cf. insignis CCCryo 090-99' ????????GCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATAAACTGCTTTATACTGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTATTTGATGGTACTTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCGCACATCCCGACTTCTGGAAGGGACGTATTTATTAGATAAAAGGCCAGCCGAGCTTGCTCGACTTAAGGTGAATCATGATAACTCCACGAATCGCATGGCCTTGTGCCGGCGATATTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGAGGCCTACCATGGTGGTTACGGGTGACGGAGGATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAATGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACCGGGCATTTAATGTCTGGTAATTGGAATGAGCACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCGGGGGGGTCTTAGCGGTCCGGTTC--GCTGTGTACTGCTGGGGCCCTCCTTTCTGCCGGGGACAGGCTCTTGGGCTTCATTGTCTGGGACCTGGAGTCGGCGAGGTTACTTTGAGTAAATTAGAGTGTTCAAAGCAAGCCTACGCTCTGAATACATTAGCATGGAATAACACGATAGGACTCTGGCCTATCTTGTTGGTCTGTAGGACCGGAGTAATGATTAAGAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACTTCTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATTAGATACCGTCGTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACTAGGGATTGGCAGGTGTTCTTTTGATGACCCTGCCAGCACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTTACCAGGTCCAGACACGGGAAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGGTTGCCTTGTCAGGTTGATTCCGGTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAAATAGTCACATCTGCCTCTCGCAGTTGGCCGACTTCTTAGAGGGACTATTGTCGTTTAGGCAATGGAAGTATGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGCGTTCAACGAGCCTATCCTTGGCCGAGAGGCCCGGGTAAT-CTTGGAAACCGCATCGTGATGGGGATAGATTATTGCAATTATTAGTCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAAGCGCGAGTCATCAGCTCGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGGGTGTGCTGGTGAAGTGTTCGGATTGGCTTCATCTGGGGGCAACTTCGGATGTCGCTGAAAAGATCATTAAACCCTCCCACCTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCC Chloromonas_augustae_UTEX_SNO157 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Chloromonas_rosae_UTEX_SNO38 ???????????????????????????????????????????????????????????????????????AATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTATTTGATGGTACTTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCGCACATCCCGACTTCTGGAAGGGACGTATTTATTAGATAAAAGGCCAGCCGGGCTTGCCCGACTTTAGGTGAATCATGATAACTCCACGAATCGCATGGCCTTGTGCCGGCGATATTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGAGGCCTACCATGGTGGTAACGGGTGACGGAGGATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAATGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACCGGGCATTTAATGTCTGGTAATTGGAATGAGCACAATCTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCGGGGGGGTCTTAGCGGTCCGGTTC--GCTGTGTACTGCTAGGGCCCTCCTTTCTGCCGGGGACAGGCTCTTGGGCTTCACTGTCTGGGACCTGGAGTCGGCGAGGTTACTTTGAGTAAATTAGAGTGTTCAAAGCAAGCCTACGCTCTGAATACATTAGCATGGAATAACACGATAGGACTCTGGCCTATCTTGTTGGTCTGTAGGACCGGAGTAATGATTAAGAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACTTCTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATTAGATACCGTCGTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACTAGGGATTGGCAGGTGTTCTTTTGATGACCCTGCCAGCACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTTACCAGGTCCAGACACGGGAAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGGTTGCCTTGTCAGGTTGATTCCGGTAACGAACGAGACCTCAGCCTGCTAAATAGTCACATCTGCCTCTCGCAGTTGGCCGACTTCTTAGAGGGACTATTGTCGTTTAGGCAATGGAAGTATGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGCGTTCAACGAGCCTATCCTTGGCCGAGAGGCCCGGGTAAT-CTTGGAAACCGCATCGTGATGGGGATAGATTATTGCAATTATTAGTCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAAGCGCGAGTCATCAGCTCGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACAC????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Chloromonas_augustae_SAG_13.89 ????ATATGCTTGTCTCAAAGATTAAGCCATGCATGTCTAAGTATAAACTACTTTATACTGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATAGTTTATTTGATGGTACTTACTACTCGGATAACCGTAGTAATTCTAGAGCTAATACGTGCGTAAATCCCGACTTCTGGAAGGGACGTATTTATTAGATAAAAGGCCAGCCGAGCTTGCTCGACTCTTGGCGAATCATGATAACTCCACGAATCGCATGGCCTTGCGCCGGCGATGTTTCATTCAAATTTCTGCCCTATCAACTTTCGATGGTAGGATAGAGGCCTACCATGGTGGTAACGGGTGACGGAGGATTAGGGTTCGATTCCGGAGAGGGAGCCTGAGAAATGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATAACAATACCGGGCATTTAATGTCTGGTAATTGGAATGAGCACAATTTAAATCCCTTAACGAGGATCCATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTTAAGTTGTTGCAGTTAAAAAGCTCGTAGTTGGATTTCGGGTGGGTTTCAGCGGTCCGGCTTCTGCTGTGTACTGCTGAGGCCTATCTTTCCGTCGATGACATGCTCTTGGGCTTCACTGTCTGGGACTTGGAGTCGGCGAGGTTACTGTGAGTAAATTAGAGTGTTCAAAGCAGGCCTACGCTCTGAATACGTTAGCATGGAATAACATGATAGGACTCTGGCCTATCTTGTTGGTCTGTAGGACCGGAGTAATGATTAAGAGGGACAGTCGGGGGCATTCGTATTTCATTGTCAGAGGTGAAATTCTTGGATTTATGAAAGACGAACTTCTGCGAAAGCATTTGCCAAGGATGTTTTCATTAATCAAGAACGAAAGTTGGGGGCTCGAAGACGATTAGATACCGTCGTAGTCTCAACCATAAACGATGCCGACTAGGGATTGGTAGGTGTTCTTTTGATGACCCTGCCAGCACCTTATGAGAAATCAAAGTTTTTGGGTTCCGGGGGGAGTATGGTCGCAAGGCTGAAACTTAAAGGAATTGACGGAAGGGCACCACCAGGCGTGGAGCCTGCGGCTTAATTTGACTCAACACGGGAAAACTTACCAGGTCCAGACACGGGGAGGATTGACAGATTGAGAGCTCTTTCTTGATTCTGTGGGTGGTGGTGCATGGCCGTTCTTAGTTGGTGGGTTGCCTTGTCAGGTTGATTCCGGTAACGAACGAGACCTCAGCCTACTAAATAGTCACTTCTGCCTCTCGCAGTTGGCCGACTTCTTAGAGGGACTATTGTCGTTTAGGCAATGGAAGTATGAGGCAATAACAGGTCTGTGATGCCCTTAGATGTTCTGGGCCGCACGCGCGCTACACTGATGCGTTCAACGAGCCTATCCTTGGCCGAGAGGTCCGGGTAAT-CTTGAAAACCGCATCGTGATGGGGATAGATTATTGCAATTATTAGTCTTCAACGAGGAATGCCTAGTAAGCGCGAGTCATCAGCTCGCGTTGATTACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTCCTACCGATTGGATGTGCTGGTGAGGTGTTCGGATCGGCTTCAGTCGGTGGCAACACTGTCTGATGTCGAAAAGATCATCGAACCCTCCCATCTAGAGGAAGGAGAAGTCGTAACAAGGTTTCC ; END; BEGIN MRBAYES; Lset nst = 6 rates = invgamma; Prset statefreqpr = dirichlet ( 1 , 1 , 1 , 1 ); END; BEGIN ASSUMPTIONS; TYPESET * UNTITLED = unord: 1 - 1749; END; BEGIN TREES; Title 'Trees from "18sx34.nex.con.tre"'; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE 1 Chloromonas_serbinowii, 2 Chloromonas_reticulata, 3 Chloromonas_asteroidea, 4 Chloromonas_typhlos, 5 Chloromonas_radiata, 6 Gloeomonas_lateperforata, 7 Chloromonas_rubrifilum, 8 Chloromonas_augustae, 9 Chloromonas_carrizoensis, 10 Chloromonas_pseudoplatyrhyncha, 11 Chloromonas_tughillensis, 12 Chloromonas_chenangoensis, 13 Chloromonas_fukushimae, 14 Chloromonas_kasaiae, 15 'Chloromonas sp. NIES-2379/2380', 16 Chloromonas_tenuis, 17 Chloromonas_pichinchae, 18 Chloromonas_hohamii, 19 Chloromonas_rosae, 20 Chloromonas_nivalis_UTEX_SNO66, 21 Chloromonas_polyptera, 22 'Chloromonas sp. CCCryo 047-99', 23 'Chloromonas nivalis CCCryo 005-99', 24 'Chloromonas cf. platystigma CCCryo 020-99', 25 'Chloromonas rostafinskii CCCryo 010-99', 26 'Chloromonas cf. nivalis cyst, sample P24/DR4', 27 Chloromonas_rosae_var._psychrophila, 28 'Chloromonas sp. red flagellates, sample HW01/clone1', 29 'Chloromonas sp. red flagellates, sample HW01/clone17', 30 'Chloromonas reticulata CCCryo 154-01', 31 'Chloromonas cf. schussnigii CCCryo 082-99/Chloromonas cf. insignis CCCryo 090-99', 32 Chloromonas_augustae_UTEX_SNO157, 33 Chloromonas_rosae_UTEX_SNO38, 34 Chloromonas_augustae_SAG_13.89; TREE con_50_majrule = (1:0.03731594317253078,10:0.01631449936810751,14:0.02936333105937527,(6:0.02009224089534782,7:0.02306899370102459)1.000:0.02563957139766813,(8:7.40982148251566E-4,34:0.002867375157747416)1.000:0.03861908278163585,(2:0.001176701130273853,4:0.003181566012816754,19:8.307715341518898E-4,27:8.277009001429262E-4,30:0.005531858325746313,31:0.008888726389747234,32:0.004051236057841946,33:8.682615391505228E-4)0.986:0.006201190440607655,((3:0.0247924343027008,5:0.01403219475359538)0.999:0.009076441040986025,(9:0.05528649182594483,(((((11:5.928497485173104E-4,(16:0.004893372167555087,18:5.921844233661527E-4)0.998:0.002235860714277983)0.996:0.003852668544525305,13:6.808267170373627E-4)0.979:0.008220141204575962,20:0.0873455834007306)0.721:0.005503592251937309,(((15:0.006131139195055827,24:0.01433317278017262)0.723:0.002142275117378595,25:0.002150253487141737)0.676:0.003001233169887686,17:0.007068544926946706)0.966:0.006682914761602255)0.971:0.003574177043121002,((12:0.009474517813037082,((22:0.001409916793418058,23:0.00318102022639265)0.900:0.003136163067149304,(28:6.54285618427561E-4,29:0.001451605661756684)1.000:0.03871125001837571)0.994:0.005714279947039228)0.983:0.004689785905876242,(21:0.0140511626643044,26:0.02341952032681286)1.000:0.01856947314561917)0.634:0.002592481378813684)0.995:0.006844679217384578)0.542:0.00214747982217656)0.883:0.006238251590891607); END; BEGIN CODONS; CODESET * UNTITLED = universal: 1 - 1749; END; BEGIN MESQUITECHARMODELS; ProbModelSet * UNTITLED = 'Jukes-Cantor': 1 - 1749; END; Begin MESQUITE; MESQUITESCRIPTVERSION 2; TITLE AUTO; tell ProjectCoordinator; timeSaved 1391767380159; getEmployee #mesquite.minimal.ManageTaxa.ManageTaxa; tell It; setID 0 133250830588415261; endTell; getEmployee #mesquite.charMatrices.ManageCharacters.ManageCharacters; tell It; setID 0 7611810842203868053; mqVersion 275; checksumv 0 3 1350752907 null getNumChars 1749 numChars 1749 getNumTaxa 34 numTaxa 34 short true bits 3458764513820540943 states 15 sumSquaresStatesOnly 1298323.0 sumSquares -1.6371485365417227E21 longCompressibleToShort false usingShortMatrix true NumFiles 1 NumMatrices 1; mqVersion; endTell; getWindow; tell It; suppress; setResourcesState true false 100; setPopoutState 400; setExplanationSize 0; setAnnotationSize 0; setFontIncAnnot 0; setFontIncExp 0; setSize 1920 971; setLocation -8 -8; setFont SanSerif; setFontSize 10; getToolPalette; tell It; endTell; setActive; desuppress; endTell; endTell; end;