#NEXUS
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	Heliconius_doris_02_1939_Pe             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	Heliconius_erato_erato_NCS2556_FG       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	Heliconius_erato_favorinus_GS012_Pe     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	Heliconius_erato_petiverana_618_P       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;



END;

BEGIN TREES;
	Title 'BEAST chronogram (Maximum Clade Credibility)';
	LINK Taxa = Taxa;
	TRANSLATE
		1 Acraea_encedon_fj55_3,
		2 Acraea_pseudegina_NW116_16,
		3 Actinote_stratonice_NW90_14,
		4 Actinote_surima_NW136_19,
		5 Agraulis_vanillae_8554_P,
		6 Cethosia_cyane_NW100_12,
		7 Cethosia_cydippe_NW137_4,
		8 Cethosia_myrina_NW106_8,
		9 Dione_glycera_PE57_Pe,
		10 Dione_juno_8727_Pe,
		11 Dione_moneta_8748b_Pe,
		12 Dryadula_phaetusa_2921_P,
		13 Dryas_iulia_8648_Pe,
		14 Eueides_aliphera_555_P,
		15 Eueides_heliconioides_8947_Pe,
		16 Eueides_isabella_780_P,
		17 Eueides_lampeto_8750_Pe,
		18 Eueides_lineata_2991_P,
		19 Eueides_lybia_02_2001_Pe,
		20 Eueides_pavana_C9_B,
		21 Eueides_procula_2933_E,
		22 Eueides_tales_09_256_Pe,
		23 Eueides_vibilia_320_FG,
		24 Heliconius_antiochus_S,
		25 Heliconius_aoede_09_347_Pe,
		26 Heliconius_astraea_MCZ116526_B,
		27 Heliconius_atthis_8162_E,
		28 Heliconius_besckei_bes110_B,
		29 Heliconius_burneyi_8560_Pe,
		30 Heliconius_charithonia_8830_P,
		31 Heliconius_clysonymus_9211_E,
		32 Heliconius_congener_9210_E,
		33 Heliconius_cydno_cordula_WOM007_C,
		34 Heliconius_demeter_8562_Pe,
		35 Heliconius_doris_02_1939_Pe,
		36 Heliconius_egeria_MJ4001_FG,
		37 Heliconius_eleuchia_842_P,
		38 Heliconius_elevatus_09_270_Pe,
		39 Heliconius_erato_erato_NCS2556_FG,
		40 Heliconius_erato_favorinus_GS012_Pe,
		41 Heliconius_erato_petiverana_618_P,
		42 Heliconius_eratosignis_09_256_Pe,
		43 Heliconius_ethilla_09_67_Pe,
		44 Heliconius_godmani_Vienna_C,
		45 Heliconius_hecale_02_1326_Pe,
		46 Heliconius_hecalesia_856_P,
		47 Heliconius_hecuba_8550_E,
		48 Heliconius_hermathena_94_15_Pe,
		49 Heliconius_heurippa_WOM001_C,
		50 Heliconius_hewitsonii_P,
		51 Heliconius_hierax_8149_E,
		52 Heliconius_himera_8076_P,
		53 Heliconius_hortense_MB9111,
		54 Heliconius_ismenius_666_P,
		55 Heliconius_leucadia_RB119,
		56 Heliconius_luciana_AN2_V,
		57 Heliconius_melpomene_melpomene_9317_FG,
		58 Heliconius_melpomene_plesseni_9156_E,
		59 Heliconius_melpomene_rosina_546_P,
		60 Heliconius_metharme_2949_E,
		61 Heliconius_nattereri_C2_B,
		62 Heliconius_numata_346_FG,
		63 Heliconius_pachinus_3035_P,
		64 Heliconius_pardalinus_09_371_Pe,
		65 Heliconius_peruvianus_EC190_E,
		66 Heliconius_ricini_1180_FG,
		67 Heliconius_sapho_260_C,
		68 Heliconius_sara_8862_P,
		69 Heliconius_telesiphe_16722_E,
		70 Heliconius_timareta_09_57_Pe,
		71 Heliconius_tristero_C15_C,
		72 Heliconius_wallacei_04_200_Pe,
		73 Heliconius_xanthocles_9106_E,
		74 Philaethria_constantinoi_MG4062_E,
		75 Philaethria_diatonica_8749a_Pe,
		76 Philaethria_dido_8700_Pe,
		77 Philaethria_neildi_AN4_V,
		78 Philaethria_ostara_MG4260_E,
		79 Philaethria_pygmalion_MCZ115413_B,
		80 Philaethria_wernickei_NW126_5_B,
		81 Podotricha_euchroia_NHM808498_C,
		82 Podotricha_telesiphe_8146_E;
	TREE BEAST_MCC = ((2:31.280740071658506,(1:17.35303022437255,(3:7.924844681640199,4:7.924844681640199):9.4281855427318):13.9277098472865):15.275273426238698,((7:5.060781143993996,(6:4.1099558402216445,8:4.109955840221641):0.9508253037723478):32.6228100747155,((((13:16.909174429285997,12:16.909174429285997):1.3464102816310017,(82:10.8775215240905,81:10.8775215240905):7.378063186826498):1.305353699020003,(80:3.9711343076128998,(79:3.1269892847711027,(74:2.8023042939464986,(76:2.266459899200701,(75:0.6297473733874028,(77:0.34220015682335614,78:0.34220015682335614):0.2875472165640467):1.636712525813298):0.5358443947457978):0.3246849908246041):0.8441450228416976):15.589804102324102):4.198913198579241,((5:11.583952253389995,(10:4.414131207482008,(9:2.7590509504341583,11:2.7590509504341583):1.6550802570478496):7.1698210459079945):10.199142123292006,(((14:7.737940875753054,(22:5.983719375503952,19:5.983719375503952):1.754221500249102):1.2646755291649505,((16:5.229109307117003,18:5.229109307117007):1.1848783816582582,(15:5.1371211481364085,(21:3.7918340525430025,(20:1.853981940263246,(17:1.4415166952792973,23:1.4415166952792973):0.41246524498404114):1.9378521122797423):1.3452870955935055):1.2768665406387534):2.5886287161428427):7.6918703990990025,((((53:2.8091434729208444,(31:2.1509084137438457,69:2.1509084137438457):0.6582350591769988):1.7089509648672525,(46:3.6198629908549513,(48:2.6485294142575064,(41:1.641930320693053,(52:1.4291825165850014,(39:1.200044854338426,40:1.200044854338426):0.2291376622465897):0.21274780410804794):1.00659909356445):0.9713335765974449):0.8982314469331527):0.5844996282961539,((65:2.507850403522191,30:2.507850403522191):1.7326861605713475,((34:1.5721632867376982,42:1.5721632867376982):2.477623397348694,(66:3.7860766416510003,((68:1.664777173668604,55:1.664777173668611):0.4457611335360383,(24:1.8395077495244863,(50:1.5914444187843415,(67:1.2343152584341013,(32:0.7054301906087801,37:0.7054301906087801):0.5288850678253141):0.35712916035024733):0.24806333074014475):0.27103055768016304):1.675538334446344):0.26371004243539886):0.1907498800071572):0.8620575019907015):5.1385755345214434,((25:4.3723470268829985,(60:3.4026834818650187,44:3.4026834818650116):0.9696635450179869):4.643429590543658,((47:4.468750953730687,(35:3.211082286139188,(51:1.7639144091331111,73:1.7639144091331111):1.4471678770059917):1.257668667591492):3.8505766982273606,((36:3.897341971050949,(26:2.2585798669232098,(29:2.0991107975424086,72:2.0991107975424086):0.1594690693808012):1.6387621041277463):3.6206875612349556,(((58:1.5662332583506604,(57:1.181471538421306,59:1.181471538421306):0.3847617199293616):0.33662740268378144,((33:0.7730570364879483,63:0.7730570364879483):0.6535098058514031,(70:1.1168216463071126,(71:0.22747313080369835,49:0.22747313080369835):0.8893485155034071):0.30974519603224593):0.47629381869509047):1.3263189077996493,((54:2.1404797993356013,62:2.1404797993356013):0.6591216256495045,(28:2.632190610542196,((61:1.910498540300452,43:1.910498540300452):0.3077057579059854,((27:1.5640294776186892,45:1.5640294776186892):0.34449444180670596,(38:1.380223753303909,(64:0.9862373985519355,56:0.9862373985519355):0.3939863547519735):0.5283001661214861):0.30968037878103516):0.41398631233576566):0.16741081444290984):0.4295781438489854):4.288849963451813):0.8012981196721434):0.6964489654688002):1.2253929831788462):6.453317203411505):5.088607572665001):1.9767572318342417):13.923739610193259):8.872422279187695);

END;


BEGIN LABELS;
	CHARGROUPLABEL 'Co I/II codon positions 1 and 2' COLOR = (RGB 1.0 0.03529412 0.41960784) ;
	CHARGROUPLABEL 'Co I/II codon position 3' COLOR = (RGB 1.0 0.03529412 0.41960784) ;
	CHARGROUPLABEL 'tRNA-Leu' COLOR = (RGB 1.0 0.03529412 0.41960784) ;
	CHARGROUPLABEL 16S;
	CHARGROUPLABEL Ef1a COLOR = (RGB 1.0 1.0 1.0) ;
	CHARGROUPLABEL Wg COLOR = (RGB 1.0 1.0 1.0) ;
	CHARGROUPLABEL Dpp COLOR = (RGB 1.0 0.03529412 0.41960784) ;
	CHARGROUPLABEL ArgK COLOR = (RGB 1.0 0.03529412 0.41960784) ;
	CHARGROUPLABEL Cad COLOR = (RGB 1.0 1.0 1.0) ;
	CHARGROUPLABEL Cmdh COLOR = (RGB 1.0 0.03529412 0.41960784) ;
	CHARGROUPLABEL Ddc COLOR = (RGB 1.0 1.0 1.0) ;
	CHARGROUPLABEL Gapdh COLOR = (RGB 1.0 0.03529412 0.41960784) ;
	CHARGROUPLABEL Idh COLOR = (RGB 1.0 0.03529412 0.41960784) ;
	CHARGROUPLABEL Rps2 COLOR = (RGB 1.0 0.03529412 0.41960784) ;
	CHARGROUPLABEL Rps5 COLOR = (RGB 1.0 0.03529412 0.41960784) ;
	CHARGROUPLABEL Aact COLOR = (RGB 1.0 1.0 1.0) ;
	CHARGROUPLABEL Cat COLOR = (RGB 1.0 1.0 1.0) ;
	CHARGROUPLABEL Gts COLOR = (RGB 1.0 1.0 1.0) ;
	CHARGROUPLABEL Hsp40 COLOR = (RGB 1.0 1.0 1.0) ;
	CHARGROUPLABEL Lam COLOR = (RGB 1.0 1.0 1.0) ;
	CHARGROUPLABEL Tada3 COLOR = (RGB 1.0 0.03529412 0.41960784) ;
	CHARGROUPLABEL Trh COLOR = (RGB 1.0 1.0 1.0) ;
	CHARGROUPLABEL Vas COLOR = (RGB 1.0 1.0 1.0) ;
	CHARGROUPLABEL Hcl COLOR = (RGB 1.0 1.0 1.0) ;
	CHARGROUPLABEL Character_Matrix;
	CHARGROUPLABEL Character_Matrix2;
	CHARGROUPLABEL Character_Matrix3;
	CHARGROUPLABEL Character_Matrix4;
	CHARGROUPLABEL Character_Matrix5;
	CHARGROUPLABEL Character_Matrix6;
	CHARGROUPLABEL Character_Matrix7;
	CHARGROUPLABEL Character_Matrix8;
	CHARGROUPLABEL Character_Matrix9;
	CHARGROUPLABEL Character_Matrix10;
	CHARGROUPLABEL Character_Matrix11;


END;

BEGIN SETS;
	CHARSET cox12   =   1 -  1489;
	CHARSET cox3   =   1490 -  2235;
	CHARSET tRNA   =   2235 -  2311;
	CHARSET 16S   =   2312 -  2845;
	CHARSET ef1a   =   2846 -  4034;
	CHARSET wg   =   4035 -  4408;
	CHARSET dpp   =   4409 -  4723;
	CHARSET argK   =   4724 -  5331;
	CHARSET cad   =   5332 -  6141;
	CHARSET cmdh   =   6142 -  6931;
	CHARSET ddc   =   6932 -  7270;
	CHARSET gapdh   =   7271 -  7992;
	CHARSET idh   =   7993 -  8670;
	CHARSET rps2   =   8671 -  9088;
	CHARSET rps5   =   9089 -  9703;
	CHARSET aact   =   9704 -  10446;
	CHARSET cat   =   10447 -  11185;
	CHARSET gts   =   11186 -  12121;
	CHARSET hsp40   =   12122 -  12660;
	CHARSET lam   =   12661 -  13540;
	CHARSET tada3   =   13541 -  14297;
	CHARSET trh   =   14298 -  14974;
	CHARSET vas   =   14975 -  15696;
	CHARSET hcl   =   15697 -  16457;

END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
	TYPESET * UNTITLED   =  unord:  1 -  16457;

END;

BEGIN CODONS;
	CODESET * UNTITLED   =  universal:  1 -  16457;


END;

BEGIN MESQUITECHARMODELS;
	ProbModelSet * UNTITLED   =  'Jukes-Cantor':  1 -  16457;
END;

Begin MESQUITE;
		MESQUITESCRIPTVERSION 2;
		TITLE AUTO;
		tell ProjectCoordinator;
		timeSaved 1395293396985;
		getEmployee #mesquite.minimal.ManageTaxa.ManageTaxa;
		tell It;
			setID 0 7791942611868540027;
		endTell;
		getEmployee #mesquite.charMatrices.ManageCharacters.ManageCharacters;
		tell It;
			setID 0 2357316345307727063;
			mqVersion 275;
			checksumv 0 3 3803189404 null  getNumChars 16457 numChars 16457 getNumTaxa 82 numTaxa 82   short true   bits 2305843009213693967   states 15   sumSquaresStatesOnly 1.9982199E7 sumSquares -1.2912720851596676E21 longCompressibleToShort false usingShortMatrix true   NumFiles 1 NumMatrices 1;
			mqVersion;
		endTell;
		getWindow;
		tell It;
			suppress;
			setResourcesState true false 327;
			setPopoutState 400;
			setExplanationSize 0;
			setAnnotationSize 0;
			setFontIncAnnot 0;
			setFontIncExp 0;
			setSize 952 498;
			setLocation 206 56;
			setFont SanSerif;
			setFontSize 10;
			getToolPalette;
			tell It;
			endTell;
			setActive;
			desuppress;
		endTell;
		endTell;
end;