NEXUS [File created by TreeBASE: 7/26/07 21:12:46] [Matrix accession#: M2718] BEGIN TAXA; TITLE M2718; DIMENSIONS NTAX=96; TAXLABELS Taricha_rivularis Taricha_granulosa_MVZ173374 Taricha_granulosa_ED Salamandrina_terdigitata Salamandra_semenovi Salamandra_salamandra Salamandra_lanzai Salamandra_infraimmaculata Salamandra_corsica Salamandra_atra_aurorae Salamandra_atra_atra Salamandra_algira Pleurodeles_waltl_Spain_MVZ186112 Pleurodeles_waltl_Morocco_MVZ162384 Pleurodeles_poireti Phaegnathus_hubrichti Paramesotriton_sp_TP28303 Paramesotriton_sp_ROM35433 Paramesotriton_sp_FMNH259125 Paramesotriton_laoensis Paramesotriton_hongkongensis_NT_TP24836 Paramesotriton_hongkongensis_LI_TP24846 Paramesotriton_hongkongensis_HI_TP24839 Paramesotriton_guanxiensis Paramesotriton_fuzhongensis Paramesotriton_deloustsali Paramesotriton_chinensis_TP25035 Paramesotriton_chinensis_TP24995 Paramesotriton_caudopunctatus Pachytriton_labiatus Pachytriton_brevipes_MVZ2311167 Pachytriton_brevipes_DW75 Notophthalmus_viridescens Tylototriton_wenxianensis Tylototriton_verrucosus Tylototriton_taliangensis Tylototriton_sp_ROM35330 Tylototriton_shanjing Tylototriton_kweichowensis Tylototriton_hainanensis Tylototriton_asperrimus Triturus_vulgaris_vulgaris Triturus_vulgaris_lantzi_RM7631 Triturus_vulgaris_lantzi_DWW1117 Triturus_vittatus_ophriticus_MVZ219525 Triturus_vittatus_ophriticus_DWW1101 Triturus_pygmaeus Triturus_montandoni_TP26567 Triturus_montandoni_DWW1158 Triturus_marmoratus_MVZ191887 Triturus_marmoratus_DWW334 Triturus_karelini_Georgia Triturus_karelini_Azerbaijan Triturus_dobrogicus_macrosomus Triturus_dobrogicus_dobrogicus Triturus_cristatus Triturus_carnifex_macedonicus Triturus_carnifex_carnifex Triturus_boscai Triturus_alpestris_cyreni Triturus_alpestris_alpestris Taricha_torosa_MVZ230652 Taricha_torosa_MVZ230468 Notophthalmus_perstriatus Notophthalmus_meridionalis Neurergus_strauchii_strauchii Neurergus_strauchii_barani Neurergus_microspilotus Neurergus_kaiseri Neurergus_crocatus Necturus_alabamensis Mertensiella_caucasica Lyciasalamandra_luschani Lyciasalamandra_helverseni Lyciasalamandra_flavimembris Lyciasalamandra_finikensis Lyciasalamandra_fazilae Lyciasalamandra_billae Lyciasalamandra_basoglui Lyciasalamandra_atifi Lyciasalamandra_antalyana Eurycea_wilderae Euproctus_platycephalus Euproctus_montanus Echinotriton_chinhaiensis Echinotriton_andersoni Dicamptodon_tenebrosus Cynops_pyrrhogaster Cynops_orphicus_Zhejiang_TP26273 Cynops_orientalis_TP25011 Cynops_orientalis_Fujian_JF259 Cynops_ensicauda Cynops_cyanuras Chioglossa_lusitanica Calotriton_asper Ambystoma_tigrinum ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE M2718; DIMENSIONS NCHAR=2765; FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? 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Salamandra_lanzai 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Paramesotriton_guanxiensis 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Paramesotriton_fuzhongensis 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Triturus_dobrogicus_macrosomus 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Triturus_dobrogicus_dobrogicus GTTAAGATGGCAGAGCCTGGTAATTGCAAAAGGTCTAAGCCCTTTC-TACCAGAGGTTCAACTCCTCTTCTTAACTATGTACCTTCTCCCT---ATAGTCTTAAACCCGTTACTGTACATCGTACCAATCCTGTTAGCCGTAGCATTCCTAACCCTTGTTGAACGAAAAGTACTAGGGTATATACAACTACGAAAAGGCCCCAATGTTGTTGGCCCAGTAGGCCTTCTTCAACCAATTGCAGACGGATTAAAGCTATTTATTAAAGAACCAGTTCGACCGTCAACAGCATCACAAACTCTATTTCTTATTATACCCACAATGGCATTAACCCTAGCACTTATAATCTGACTCCCTCTGCCTATGCCATTTATATTATCAAACTTGAACCTTGGGGTCCTTTTTCTACTAGCTCTATCAAGCTTGGCCGTATATTCAATTTTAGGCTCAGGCTGATCCTCAAACTCAAAATATGCCTTAATTGGAGCACTTCGAGCAGTAGCACAAACTATCTCGTATGAGGTCACCCTAGGCCTTATTCTATTATGCCTTATTCTAATAACGGGGGGCTTTATACTAACGGCCTTTAATACTACACAAGAAGCAGCTGGTTTTATTATCCCGGCATGACCAATAGCAATAATATGGTTTATTTCTACTCTGGCAGAAACAAATCGAGCCCCATTTGACCTCACAGAGGGAGAATCCGAACTTGTATCAGGGTTTAACGTAGAATATGCGGGAGGCCCCTTTGCCTTATTTTTCTTAGCAGAATATTCTAATATTTTACTAATAAACACCCTGTCGGCCATCCTATTCCTAGGCCCAACGGTAAACCACCTTCAGCCAGAAATCTTGACAGTTAACCTTATAATTAAGGCATCAGCACTTTCAGTTGTATTTTTATGAGTACGAGCATCTTACCCGCGATTCCGATATGACCAGCTCATACACCTAATTTGAAAAAACTTTTTGCCATTTACGCTTGCAATAACACTATTACATATTTCCCTTCCAATTATGATAACGAGCATTCCACCTTTATCTTA-------GGACATGTGCCCGAAAG-ATAGGAGTTACTTTGATAGAGTAACCCATAGAGGTTCAAACCCTCTCATCTCCTGC---------TAAAAAA-TAGGACTCGAACCTACCCCTAGGAGATCAAAACCCCTTGTGCATCCACTACACCACTTTTTA------AGTAAAATAAGCTAAA--TAAGCTTTCGGGCCCATACCCCAAATATGTTGGTGAAAACCCTTCTTTTACTAATGAGCCCCTATGCACTATCGATATTAATATCAAGCCTAGCTATAGGAACGATTATTACACTGTCTAGCTCCCACTGGTTCTTGGCTTGAATGGGGCTAGAAATTAATACACTGGCCATTATCCCACTTATGACTAAAATACATCACCCACGAGCCACAGAATCTGCAACAAAATACTTCCTAACACAAGCCACAGCTTCTGCTTTACTTCTATTCTCTGCCACTATAAACGCATGGATAACAGGAGAATGAACTATTATAAACATAAATAGTTATACCCCTACAACAATCTTAACAATTGCCCTAGCAATTAAATTAGGAATTGCCCCATTTCACCTCTGATTACCAGACGTCCTACAAGGGCTCGACATGATAACATGCCTAATCCTCTCAACATGACAAAAACTTGCCCCAATAGCCCTATTAATTTTAACAAGCCACCAACTAAATACCACCTTATTAACCCTAATGGCCCTCGCATCCGCAATCATCGGGGGATGAGGGGCCCTAAATCAAACTCAAATACGGAAAATTATAGCATACTCGTCTATCGCACACCTTGGCTGGATAACACTGGTTATCTCATTTGCCCCTAACCTGGCACTGTTGAATTTAATAATTTACCTTATAATAACCTCATCTATATTTATAATACTAATAGCCCTAAACGCCACAAATATAAATAAACTATCAGTTTCCTGACTAAAAACACCAACACTAGCAGCCTCAATAATAGCCGGCCTCCTCTCCCTCGGAGGCCTCCCCCCTCTCTCAGGGTTTCTACCAAAGTGGCTAATCCTACAAGAAATAACTAAGCATCACCTAGGGGCCCTCTCTGCCGTAATAGCCTTATCGGCCCTACTTAGTCTTTTTTTTTACCTCCGACTCTCGTATATAATCTCAATAACCTCCCCACCCAACATCTCAAACGCTAACTTGGCCTGGCGAAAGAAAAATAACATATCGCTTATTAACCCAATCTTGATTGTGTTATCCTCTATACTAATGCCAATCACACCCATACTGCTA---ATAAGAAACCAAAGACTTAGGATAACA-AGACCAAAGGCCTTCAAAGCCTTCAGCAGAAGTTAAAATCTTCTAGTCTTTGA--------TAAGACCTGCAGGACTCTACCCCACATCTTCTGAATGCAACCCAGACACTTTAATTAAGCTAAAAC?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Triturus_cristatus 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Triturus_carnifex_macedonicus GTTAAGATGGCAGAGCCCGGTAATTGCAAAAGGTCTAAGCCCTTTC-TACCAGAGGTTCAACTCCTCTTCTTAACTATGTACCTTCTTTCT---ATAGTCTTAAACCCATTACTATATATCGTACCAGTCCTGCTAGCCGTAGCATTCCTAACCCTTGTTGAACGAAAAGTCCTAGGGTATATACAACTACGAAAGGGCCCCAATGTTGTTGGCCCAGTAGGCCTTCTTCAACCAATTGCAGACGGTTTAAAACTATTTATTAAAGAACCAGTTCGACCGTCAACAGCATCACAAACTCTATTTCTTGTTATACCCACAATGGCACTAACCCTGGCACTTATAATCTGACTCCCTCTGCCCATACCATTTATACTGTCAAATTTGAACCTTGGGGTCCTTTTTCTACTAGCTCTATCAAGCCTGGCCGTATACTCAATTTTAGGCTCAGGCTGATCCTCAAACTCAAAATACGCCCTAATTGGGGCACTTCGAGCAGTAGCACAGACTATCTCGTATGAGGTTACCTAGGGGCTTATTCTATTATGCCTTATTTTAATAACGGGGGGCTTCATACTAACGGCCTTTAATACTACACAAGAGGCAATCTGGTTTATTATTCCAGCATGACCCATAGCAATAATATGGTTTATTTCTACTCTGGCAGAGACAAATCGAGCCCCATTTGACCTCACAGAAGGAGAGTCCGAACTTGTATCCGGATTTAACGTAGAATATGCGGGAGGCCCGTTTGCCTTATTTTTCTTAGCAGAATATTCTAATATTTTACTAATAAACACCCTGTCAACCATCCTATTTTTAGGACCAACAGTAAACCACCTTCAACCAGAAATCTTGACAGTTAATCTTATAATTAAGGCATCAGCACTTTCAGTTGTATTTCTATGAGTACGAGCATCCTACCCACGATTCCGATATGACCAGCTAATACACCTAATTTGAAAAAACTTTTTGCCATTCACGCTTGCAATAACACTATTACACATTTCCCTTCCTATTATGATAACGAGTATTCCACCTTTATCCTA-------GGACATGTGCCCGAAAG-ATAGGAGTTACTTTGATAGAGTGACCAATAGAGGTTCAAACCCTCTCATCTCCTAC---------TAAAAAA-TAGGACTCGAACCTACCCCTAGGAGATCAAAACCCCTTGTGCTCCCACTACACCA?????????????????????????????-??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Triturus_carnifex_carnifex 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Triturus_boscai 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Triturus_alpestris_cyreni 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Triturus_alpestris_alpestris 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Notophthalmus_perstriatus 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Notophthalmus_meridionalis 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Neurergus_strauchii_strauchii 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Neurergus_strauchii_barani 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Neurergus_microspilotus 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Neurergus_kaiseri 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Neurergus_crocatus 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Necturus_alabamensis 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Mertensiella_caucasica 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Lyciasalamandra_luschani 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Lyciasalamandra_helverseni 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Lyciasalamandra_flavimembris 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Lyciasalamandra_finikensis 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Lyciasalamandra_fazilae 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Lyciasalamandra_billae 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Lyciasalamandra_basoglui 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Lyciasalamandra_antalyana 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Eurycea_wilderae 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Echinotriton_chinhaiensis 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Cynops_pyrrhogaster 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Cynops_cyanuras 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Calotriton_asper 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Ambystoma_tigrinum 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