NEXUS [File created by TreeBASE: 7/26/07 21:13:26] [Matrix accession#: M2777] BEGIN TAXA; TITLE M2777; DIMENSIONS NTAX=8; TAXLABELS Dubautia_sp._Asap3B_haplotype6 Dubautia_sp._Asap3B_haplotype5 Dubautia_sp._Asap3B_haplotype4 Dubautia_sp._Asap3B_haplotype2 Dubautia_sp._Asap3B_haplotype3 Dubautia_sp._Asap3B_haplotype1 Dubautia_laxa_subsp._hirsuta_Asap3B Argyroxiphium_sandwicense_subsp._macrocephalum_Asap3B ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE M2777; DIMENSIONS NCHAR=1216; FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = - ; MATRIX Dubautia_sp._Asap3B_haplotype6 AAAGAGAAGAAATGGGATATTCAAGAAAGCTCATGAGCTCACTGTTCTCTGTGATGCCAAGGTTTCTCTTATTATGTTCTCCAACACTGGAAAATTCCATGAGTACATCAGCCCTTCCACCACGTATGCTAGCTCGCTCGCTCGTATAACATGTAATATATATGCATACACTGTCATAATCTTGATTAACTTTTGTTAATTTTACGCAGGACTAAGAAAATTTATGATATGTATCAGACTACTCTTGGGTTTGATCTGTGGAGCTCCCACTATGAGGTTAACTTCTTAGAAGGCTGTCCCTCTTTTTTTTCATATGACCTGCCGACTTTTTTCAAGTCGAAAAAGTTAGACGGTCATACAATGGTGTTGGCGGATGGTTGTTTAACTTATAGTTGACCATAGTGGTGTTGTGAGATTAGAAAAAAATGGTTAATTCGTTAATAGCAACACCGGCCTCTAGAGCCTAGCTTACCATAACAAAATTAGTTTCACGAATGTTACCATTTATGTATCAAGAACTAGAAGATCGCCTAAAA-TTGTGAGGTTTCAAATCCTTATAAGTGTAATGTTGGGTACTTTGGTGGTATTTGAAGAAAATAACTGATGTCAGAATCACATAATAATAAATACAACACTTGTATGTAGTGCTTTGAATATGATATATAACAAAGTTACATAACTTTCTTACTTTCTTTCTTCAGATACTTCAATTATATTCTATATACACTATGTATCGCTTAATTATATATGCTATTCTGGTTTTCAACATTTTATTGGTTCTAATGGACATACAACCAGCTTTAACATTTTATACATAATAAAAAGACACTTGATGATGTATATCACTTTTATGTTGATAATCTATCAATTAAGCCGGGGGCCTCTAGAACCTACGGTCTGCCGTAGGACTTTTGCTTAAGAAAATACTCATTTTTCTAGTAGCGAGTTATGTCGGTTTTAATTAACTAGAGAACATGAAGGCCGGGTTTGTCTTGATTATTGATATTTGTGTAACATGGTGGTGTCTATACAATTGGGCTTGAGTCTTGTAATGAAACTAATCTAGTATGTATACAAATGTGTAGAGGATGACAGAAACAATGAAGAAGCTTAAAGATAGCAACAACAAACTTAGAAGAGAGATCGGGTGACTCTAGTACAATAAAGATTAACGTTTTGTTGTGGGTTTAGTTAATCAATTGGTTAACTCTTAAC Dubautia_sp._Asap3B_haplotype5 AAAGAGAAGAAATGGGATATTCAAGAAAGCTCATGAGCTCACTGTTCTCTGTGATGCCAAGGTTTCTCTTATTATGTTCTCCAACACTGGAAAATTCCATGAGTACATCAGCCCTTCCACCACGTATGCTAGCTCGCTCGCTCGTATAACATGTAATATATATGCATACACTGTCATAATCTTGATTAACTTTTGTTAATTTTACGCAGGACTAAGAAAATTTATGATATGTATCAGACTACTCTTGGGTTTGATCTGTGGAGCTCCCACTATGAGGTTAACTTCTTAGAAGGCTGTCCCTCTTTTTTTTCATATGACCTGCCGACTTTTTTCAAGTCGAAAAAGTTAGACGGTCATACAATGGTGTTGGCGGATGGTTGTTTAACTTATAGTTGACCATAGTGGTGTTGTGAGATTAGAAAAAAATGGTTAATTCGTTAATAGCAACACCGGCCTCTAGAGCCTAGCTTACCATAACAAAATTAGTTTCACGAATGTTACCATTTATGTATCAAGAACTAGAAGATCGCCTAAAA-TTGTGAGGTTTCAAATCCTTATAAGTGTAATGTTGGGTACTTTGGTGGTATTTGAAGAAAATAACTGATGTCAGAATCACATAATAATAAATACAACACTTGTATGTAGTGCTTTGAATATGATATATAACAAAGTTACATAACTTTCTTACTTTCTTTCTTCAGATACTTCAATTATATTCTATATACACTATGTATCGCTTAATTATATATGCTATTCTGGTTT-CAACATTTTATTGGTTCTAATGGACATACAACCAGCTTTAACATTTTATACATAATAAAAAGACACTTGATGATGTATATCACTTTTATGTTGATAATCTATCAATTAAGCCGGGGGCCTCTAGAACCTACGGTCTGCCGTAGGACTTTTGCTTAAGAAAATACTCATTTTTCTAGTAGCGAGTTATGTCGGTTTTAATTAACTAGAGAACATGAAGGCCGGGTTTGTCTTGATTATTGATATTTGTGTAACATGGTGGTGTCTATACAATTGGGCTTGAGTCTTGTAATGAAACTAATCTAGTATGTATACAAATGTGTAGAGGATGACAGAAACAATGAAGAAGCTTAAAGATAGCAACAACAAACTTAGAAGAGAGATCGGGTGACTCTAGTACAATAAAGATTAACGTTTTGTTGTGGGTTTAGTTAATCAATTGGTTAACTCTTAAC Dubautia_sp._Asap3B_haplotype4 AAAGAGAAGAAATGGGATATTCAAGAAAGCTCATGAGCTCACTGTTCTCTGTGATGCCAAGGTTTCTCTTATTATGTTCTCCAACACTGGAAAATTCCATGAGTACATCAGCCCTTCCACCACGTATGCTAGCTCGCTCGCTCGTATAACATGTAATATATATGCATCCACTGTCATAATCTTGATTAACTTTTGTTAATTTTACGCAGGACTAAGAAAATTTATGATATGTATCAGACTACTCTTGGGTTTGATCTGTGGAGCTCCCACTATGAGGTTAACTTCTTAGAAGGCTGTCCCTCTTTTTTTTCATATGACCTGCCTACTTTTTTCAAGTCGAAAAAGTTAGACGGTCATACAATGGTGTTGGCGGATGGTTGTTTAACTTATAGTTGACCATAGTGGTGTTGTGAGATTAGAAAAAAATGGTTAATTCGTTAATAGCAACACCGGCCTCTAGAGCCTAGCTTACCATAACAAAATTAGTTTCACGAATGTTACCATTTATGTATCAAGAACTAGAAGATCGCCTAAAA-TTGTGAGGTTTCAAATCCTTATAAGTGTAATGTTGGGTACTTTGGTGGTATTTGAAGAAAATAACTGATGTCAGAATCACATAATAATAAATACAACACTTGTATGTAGTGCTTTGAATATGATATATAACAAAGTTACATAACTTTCTTACTTTCTTTCTTCAGATACTTCAATTATATTCTATATACACTATGTATCGCTTAATTATATATGCTATTCTGGTTTTCAACATTTTATTGGTTCTAATGGACATACAACCAGCTTTAACATTTTATACATAATAAAAAGACACTTGATGATGTATATCACTTTTATGTTGATAATCTATCAATTAAGCCGGGGGCCTCTAGAACCTACGGTCTGCCGTAGGACTTTTGCTTAAGAAAATACTCATTTTTCTAGTAGCGAGTTATGTCGGTTTTAATTAACTAGAGAACATGAAGGCCGGGTTTGTCTTGATTATTGATATTTGTGTAACATGGTGGTGTCTATACAATTGGGCTTGAGTCTTGTAATGAAACTAATCTAGTATGTATACAAATGTGTAGAGGATGACAGAAACAATGAAGAAGCTTAAAGATAGCAACAACAAACTTAGAAGAGAGATCAGGTGACTCTAGTACAATAAAGATTAACGTTTTGTTGTGGGTTTAGTTAATCAATTGGTTAACTCTTAAC Dubautia_sp._Asap3B_haplotype2 AAAGAGAAGAAATGGGATATTCAAGAAAGCTCATGAGCTCACTGTTCTCTGTGATGCCAAGGTTTCTCTTATTATGTTCTCCAACACTGGAAAATTCCATGAGTACATCAGCCCTTCCACCACGTATGCTAGCTCGCTCGCTCGTATAACATGTAATATATATGCATACACTGTCATAATCTTGATTAACTTTTGTTAATTTTACGCAGGACTAAGAAAATTTATGATATGTATCAGACTACTCTTGGGTTTGATCTGTGGAGCTCCCACTATGAGGTTAACTTCTTAGAAGGCTGTCCCTCTTTTTTTTCATATGACCTGCCGACTTTTTTCAAGTCGAAAAAGTTAGACGGTCATACAATGGTGTTGGCGGATGGTTGTTTAACTTATAGTTGACCATAGTGGTGTTGTGAGATTAGAAAAAAATGGTTAATTCGTTAATAGCAACACCGGCCTCTAGAGCCTAGCTTACCATAACAAAATTAGTTTCACGAATGTTACCATTTATGTATCAAGAACTAGAAGATCGCCTAAAA-TTGTGAGGTTTCAAATCCTTATAAGTGTAATGTTGGGTACTTTGGTGGTATTTGAAGAAAATAACTGATGTCAGAATCACATAATAATAAATACAACACTTGTATGTAGTGCTTTGAATATGATATATAACAAAGTTACATAACTTTCTTACTTTCTTTCTTCAGATACTTCAATTATATTCTATATACACTATGTATCGCTTAATTATATATGCTATTCTGGTTTTCAACATTTTATTGGTTCTAATGGACATACAACCAGCTTTAACATTTTATACATAATAAAAAGACACTTGATGATGTATATCACTTTTATGTTGATAATCTATCAATTAAGCCGGGGGCCTCTAGAACCTACGGTCTGCCGTAGGACTTTTGCTTAAGAAAATACTCATTTTTCTAGTAGCGAGTTATGTCGGTTTTAATTAACTAGAGAACATGAAGGCCGGGTTTGTCTTGATTATTGATATTTGTGTAACATGGTGGTGTCTATACAATTGGGCTTGAGTCTTGTAATGAAACTAATCTAGTATGTATACAAATGTGTAGAGGATGACAGAAACAATGAAGAAGCTTAAAGATAGCAACAACAAACTTAGAAGAGAGATCAGGTGACTCTAGTACAATAAAGATTAACGTTTTGTTGTGGGTTTAGTTAATCAATTGGTTAACTCTTAAC Dubautia_sp._Asap3B_haplotype3 AAAGAGAAGAAATGGGATATTCAAGAAAGCTCATGAGCTCACTGTTCTCTGTGATGCCAAGGTTTCTCTTATTATGTTCTCCAACACTGGAAAATTCCATGAGTACATCAGCCCTTCCACCACGTATGCTAGCTCGCTCGCTCGTATAACATGTAATATATATGCATCCACTGTCATAATCTTGATTAACTTTTGTTAATTTTACGCAGGACTAAGAAAATTTATGATATGTATCAGACTACTCTTGGGTTTGATCTGTGGAGCTCCCACTATGAGGTTAACTTCTTAGAAGGCTGTCCCTCTTTTTTTTCATATGACCTGCCGACTTTTTTCAAGTCGAAAAAGTTAGACGGTCATACAATGGTGTTGGCGGATGGTTGTTTAACTTATAGTTGACCATAGTGGTGTTGTGAGATTAGAAAAAAATGGTTAATTCGTTAATAGCAACACCGGCCTCTAGAGCCTAGCTTACCATAACAAAATTAGTTTCACGAATGTTACCATTTATGTATCAAGAACTAGAAGATCGCCTAAAA-TTGTGAGGTTTCAAATCCTTATAAGTGTAATGTTGGGTACTTTGGTGGTATTTGAAGAAAATAACTGATGTCAGAATCACATAATAATAAATACAACACTTGTATGTAGTGCTTTGAATATGATATATAACAAAGTTACATAACTTTCTTACTTTCTTTCTTCAGATACTTCAATTATATTCTATATACACTATGTATCGCTTAATTATATATGCTATTCTGGTTTTCAACATTTTATTGGTTCTAATGGACATACAACCAGCTTTAACATTTTATACATAATAAAAAGACACTTGATGATGTATATCACTTTTATGTTGATAATCTATCAATTAAGCCGGGGGCCTCTAGAACCTACGGTCTGCCGTAGGACTTTTGCTTAAGAAAATACTCATTTTTCTAGTAGCGAGTTATGTCGGTTTTAATTAACTAGAGAACATGAAGGCCGGGTTTGTCTTGATTATTGATATTTGTGTAACATGGTGGTGTCTATACAATTGGGCTTGAGTCTTGTAATGAAACTAATCTAGTATGTATACAAATGTGTAGAGGATGACAGAAACAATGAAGAAGCTTAAAGATAGCAACAACAAACTTAGAAGAGAGATCAGGTGACTCTAGTACAATAAAGATTAACGTTTTGTTGTGGGTTTAGTTAATCAATTGGTTAACTCTTAAC Dubautia_sp._Asap3B_haplotype1 AAAGAGAAGAAATGGGATATTCAAGAAAGCTCATGAGCTCACTGTTCTCTGTGATGCCAAGGTTTCTCTTATTATGTTCTCCAACACTGGAAAATTCCATGAGTACATCAGCCCTTCCACCACGTATGCTAGCTCGCTCGCTCGTATAACATGTAATATATATGCATACACTGTCATAATCTTGATTAACTTTTGTTAATTTTACGCAGGACTAAGAAAATTTATGATATGTATCAGACTACTCTTGGGTTTGATCTGTGGAGCTCCCACTATGAGGTTAACTTCTTAGAAGGCTGTCCCTCTTTTTTTTCATATGACCTGCCGACTTTTTTCAAGTCGAAAAAGTTAGACGGTCATACAATGGTGTTGGCGGATGGTTGTTTAACTTATAGTTGACCATAGTGGTGTTGTGAGATTAGAAAAAAATGGTTAATTCGTTAATAGCAACACCGGCCTCTAGAGCCTAGCTTACCATAACAAAATTAGTTTCACGAATGTTACCATTTATGTATCAAGAACTAGAAGATCGCCTAAAA-TTGTGAGGTTTCAAATCCTTATAAGTGTAATGTTGGGTTCTTTGGTGGTATTTGAAGAAAATAACTGATGTCAGAATCACATAATAATAAATACAACACTTGTATGTAGTGCTTTGAATATGATATATAACAAAGTTACATAACTTTCTTACTTTCTTTCTTCAGATACTTCAATTATATTCTATATACACTATGTATCGCTTAATTATATATGCTATTCTGGTTTTCAACATTTTATTGGTTCTAATGGACATACAACCAGCTTTAACATTTTATACATAATAAAAAGACACTTGATGATGTATATCACTTTTATGTTGATAATCTATCAATTAAGCCGGGGGCCTCTAGAACCTACGGTCTGCCGTAGGACTTTTGCTTAAGAAAATACTCATTTTTCTAGTAGCGAGTTATGTCGGTTTTAATTAACTAGAGAACATGAAGGCCGGGTTTGTCTTGATTATTGATATTTGTGTAACATGGTGGTGTCTATACAATTGGGCTTGAGTCTTGTAATGAAACTAATCTAGTATGTATACAAATGTGTAGAGGATGACAGAAACAATGAAGAAGCTTAAAGATAGCAACAACAAACTTAGAAGAGAGATCAGGTGACTCTAGTACAATAAAGATTAACGTTTTGTTGTGGGTTTAGTTAATCAATTGGTTAACTCTTAAC Dubautia_laxa_subsp._hirsuta_Asap3B AAAGAGAAGAAATGGGATATTCAAGAAAGCTCATGAGCTCACTGTTCTCTGTGATGCCAAGGTTTCTCTTATTATGTTCTCCAACACTGGAAAATTCCATGAGTACATCAGCCCTTCCACCACGTATGCTAGCTCGCTCGCTCGTATAACATGTAATATATATGCATACACTGTCATAATCTTGATTAACTTTTGTTAATTTTACGCAGGACTAAGAAAATTTATGATATGTATCAGACTACTCTTGGGTTTGATCTGTGGAGCTCCCACTATGAGGTTAACTTCTTAGAAGGCTGTCCCTCTTTTTTTTCATATGACCTGCCGACTTTTTTCAAGTCGAAAAAGTTAGACGGTCATACAATGATGTTGGCGGATGGTTGTTTAACTTATAGTTGACCATAGTGGTGTTGTGAGATTAGAAAAAAATGGTTAATTCGTTAATAGCAACACCGGCCTCTAGAGCCTAGCTTACCATAACAAAATTAGTTTCAAGAATGTTACCATTTATGTATCAAGAACTAGAAGATCGCCTAAAA-TTGTGAGGTTTCAAATCCTTATAAGTGTAATGTTGGGTACTTTGGTGGTATTTGAAGAAAATAATTGTTGTCAGAATCACATAATAATAAATACAACACTTGTATGTAGTGCTTTGAATATGATATATAACAAAGTTACATAACTTTCTAACTTTCTTTCTTCAGATACTTCAATTATATTCTATATACACTATGTATCACTTAATTATATATGCTATTCTGGTTTTCAACATTTTATTGGTTCTAATGGACATACAACCAGCTTTAACATTTTATACATAATAAAAAGACACTTGATGATGTATATCACTTTTATGTTGATAATCTATCAATTAAGCCGGGGGCCTCTAGAACCTACGGTCTGCCGTAGGACTTTTGCTTAAGAAAATACTCATTTTTCTAGTAGCGAGTTATGTCGGTTTTAATTAGCTAGAGAACATGAAGGCCGGGTTTGTCTTGATTATTGATATTTGTGTAACATGGTGGTGTCTATACAATTGGGCTTGAGTCTTGTAATGAAACTAATCTAGTATGTATACAAATGTGTAGAGGATGACAGAAACAATGAAGAAGCTTAAAGATAGCAACAACAAACTTAGAAGAGAGATCAGGTGACTCTAGTACAATAAAGATTAACGTTTTGTTGTGGGTTTAGTTAATCAATTGGTTAACTCTTAAC Argyroxiphium_sandwicense_subsp._macrocephalum_Asap3B AAAGAGAAGAAATGGGATATTCAAGAAAGCTCATGAGCTCACTGTTCTCTGTGATGCCAAGGTTTCTCTTATTATGTTCTCCAACACTGGAAAATTCCATGAGTACATCAGCCCTTCCACCACGTATGCTAGCTCGCTCGCTCGTATAACATGTAATATATATGCATACACTGTCATAATCTTGATTAACTTTTGTTAATTTTACGCAGGACTAAGAAAATTTATGATATGTATCAGACTACTCTTGGGTTTGATCTGTGGAGCTCCCACTATGAGGTTAACTTCTTAGAAGGCTGTCCCTCTTTTTTTTCATATGACCTGCCGACTTTTTTCAAGTCGAAAAAGTTAGACGGTCATACAATGGTGTTGGCGGATGGTTGTTTAACTTATAGTTGACCATAGTGGTGTTGTGAGATTAGAAAAAAATGGTTAATTCGTTAATAGCAACACCGGCCTCTAGAGCCTAGCTTACCATAACAAAATTAGTTTCAAGAATGTTACCATTTATGTATCAAGAACTAAAAGATCGCCTAAAAATTGTGAGGTTTCAAATCCTTATAAGTGTAATGTTGGGTACTTTGGTGGTATTTGAAGAAAATAATTGTTGTCAGAATCACATAATAATAAATACAACACTTGTATGTAGTGCTTTGAATATGATATATAACAAAGTTACATAACTTTCTTACTTTCTTTCTTCAGATACTTCAATTATATTCTATATACACTATGTATCACTTAATTATATATGCTATTCTGGTTTTCAACATTTTATTGGTTCTAATGGACATACAACCAGCTTTAACATTTTATACATAATAAAAAGACACTTGATGATGTATATCACTTTTACGTTGATAATCTATCAATTAAGCAGGGGGGCTCTAGAACCTACGGTCTGCCGTAGGACTTTTGCTTAAGAAAATACTCATTTTTCTAGTAGCGAGGTATGTCGGTTTTAATTAACTAGAGAACATGAAGGCCGGGTTTGTCTTGATTATTGATATTTGTGTAACATGGTGGTGTCTATACAATTGGGCTTGAGTCTTGTAATGAAACTAATCTAGTATGTATACAAATGTGTAGAGGATGACAGAAACAATGAAGAAGCTTAAAGATAGCAACAACAAACTTAGAAGAGAGATCAGGTGACTCTAGTACAATAAAGATTAACGTTTTGTTGTGGGTTTAGTTAATCAATTGGTTAACTCTTAAC ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions = N: 1 - 1216 ; CODESET * UNTITLED = Universal: all ; END; BEGIN ASSUMPTIONS; OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; END;