NEXUS
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[Matrix accession#: M2789]

BEGIN TAXA;
	TITLE M2789;
	DIMENSIONS  NTAX=47;
	TAXLABELS
		Prepapilio_colorado	Doritites_bosniaskii	Thaites_ruminiana	Allancastria_deyrollei	Allancastria_caucasica	Allancastria_cretica	Allancastria_louristana	Allancastria_cerisyi	Zerynthia_polyxena	Zerynthia_rumina	Sericinus_montela	Bhutanitis_ludlowi	Bhutanitis_lidderdali	Bhutanitis_thaidiana	Bhutanitis_mansfieldi	Luehdorfia_chinensis	Luehdorfia_puziloi	Luehdorfia_taibai	Luehdorfia_japonica	Archon_bostanchii	Archon_apollinaris	Archon_apollinus	Parnassius_clodius	Parnassius_simonius	Parnassius_autocrator	Parnassius_delphius	Parnassius_tenedius	Parnassius_schultei	Parnassius_hardwickii	Parnassius_phoebus	Hypermnestra_helios	Baronia_brevicornis	Papilio_demoleus	Papilio_machaon	Papilio_thoas	Iphiclides_podalirius	Eurytides_marcellus	Graphium_agamemnon	Parides_photinus	Troides_helena	Battus_philenor	Colias_eurytheme	Pieris_napi	Coenonympha_tullia	Plebejus_acmon	Hylephila_phyleus	Pyrgus_communis
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M2789;
	DIMENSIONS NCHAR=6011;
	FORMAT SYMBOLS = " A G C T R Y M K S W H B V D N 0 1 2 3 4 5 " MISSING = ? GAP = - ;
	MATRIX
		Prepapilio_colorado           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		Doritites_bosniaskii          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		Thaites_ruminiana             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		Allancastria_deyrollei        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		Allancastria_caucasica        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		Allancastria_cretica          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		Sericinus_montela             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		Bhutanitis_mansfieldi         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		Luehdorfia_japonica           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		Archon_bostanchii             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		Parnassius_simonius           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		Parnassius_hardwickii         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		Parnassius_phoebus            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		Baronia_brevicornis           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		Eurytides_marcellus           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		Pyrgus_communis               ATTTTTAT----TGCGAAAATGACTTTATTCTACTAATCATAAAGATATTGGAACTTTATATTTTATTTTTGGAATTTGAGCAGGAATAGTAGGTACTTCTTTAAGTTTATTAATTCGAACTGAATTAGGAAATCCCGGCTCATTAATTGGAGATGATCAAATTTATAATACTATTGTTACAGCACATGCTTTCATTATAATTTTTTTTATAGTCATACCTATTATAATTGGAGGATTTGGAAATTGATTAGTACCTTTAATACTAGGAGCTCCAGATATAGCATTCCCCCGTATAAATAACATAAGATTTTGATTATTACCCCCTTCATTAACATTACTTATTTCAAGAAGTATTGTAGAAAACGGTGCAGGAACTGG-ATGAACAGTTTACCCCCCATTATCAGCTAATATTGCTCATCAAGGTTCTTCTGTTGATTTAGCTATTTTTTCATTACATTTAGCAGGAATTTCATCAATTTTAGGAGCTATTAATTTTATTACAACAATTATTAATATACGTATTAGAAATTTATCATTTGATCAAATACCTTTATTTGTTTGAGCAGTAGGTATTACAGCTTTATTATTATTATTATCATTACCTGTTTTAGCAGGAGCTATTACTATATTATTAACAGATCGAAATTTAAATACATCATTTTTTGATCCTGCTGGAGGAGGAGATCCTATTTTATATCAACATTTATTTTGATTTTTTGGACATCCAGAAGTTTATATTCTTATTTTACCAGGATTTGGAATAATTTCTCATATTATTTCTCAAGAAAGAGGAAAAAAAGAAACTTTTGGATGCTTAGGAATAATTTATGCTATAATAGCAATTGGTTTATTAGGATTTATTGTATGAGCTCATCATATATTTACTGTAGGAATAGATATTGATACTCGTGCCTATTTTACATCAGCTACTATAATTATTGCAGTTCCTACTGGAATTAAAATTTTCAGATGATTAGCAACATTACATGGAACACAAATTAATTATAGACCTTCTATATTATGAAGATTAGGATTTGTATTTTTATTTACTGTAGGAGGATTAACTGGAGTAATTTTAGCTAATTCATCTATTGATATTACATTACATGATACTTATTATGTAGTTGCACATTTTCATTATGTTTTATCTATAGGAGCTGTATTTGCTATTTTTGGAGGATTTATTCATTGATATCCTCTATTTACTGGTCTTACAATAAACCCATTTTTATTAAAAATTCAATTTATTTCCATATTTTTAGGAGTAAATTTAACCTTTTTTCCTCAACATTTCTTAGGATTAGCTGGAATACCTCGACGATATTCAGATTATCCTGATAGATATATTTCTTGAAATATTATTTCCTCATTTGGATCATATATTTCATTATTATCTATAATAATTATAATAATAATTATTTGAGAATCATTTATTAATCAACGAATTATTTTATTTCCTCTTAATATATCATCTTCTATTGAATGATTTCAAAATTTACCTCCTGCTGAACATTCTTATAATGAATTACCTATTTTAAGAAATTT---------CTAATATGGCAGA-TTATATGTAATGGATTTAAACCCCATTTATAAAGGATT-ATCCTTTTTTTAGAAA-TGGCAACATGATCTAATCTTAACTTACAAAATAGAGCCTCTCCATTAATAGAACAAATTATCTTCTTTCATGATCATACTTTAGTTATTTTAATTATAATTACTGTATTAGTTAGTTATATAATAATTTCATTATTTTTTAATAAATTTATTAATCGATTTCTTCTTGAAGAACAAATAATTGAAATAATTTGAACTATTCTTCCAGCAATTACTTTAATTTTTATTGCATTACCATCTTTACGATTATTATATTTATTAGATGAATTAAATAATCCTTTAATTACTTTAAAATCTATTGGTCATCAATGATATTGAAGTTATGAATATTCAGATTTTTCAAATGTTGAATTTGATTCTTATATAATCAATTCTAATGAATT---------AAATAATTTTCGATTATTAGATGTTGATAATCGAATTACTTTACCTATAAATAATCAAATTCGTATTCTAGTAACTGCAACTGATGTAATTCATTCATGAACAGTTCCTGCTTTAGGAGTAAAAGTAGATGCTAACCCCGGTCGACTTAATCAAACTAATTTTTTTATTAATCGTCCAGGATTATTTTTTGGACAATGTTCTGAAATTTGTGGAGCTAATCATAGTTTCATACCTATTGTAATTGAAAGTATTTCAATTAAAAATTTTATTAATTGAATTAATAATTATTCTTAACATTAGTTACCGCTGGGGTATATTTATTGATTCGATTTAATAATATATTAATTGATATAATTTTTTTAAAATTTTTATTATTATTGTCTGGTTTAACTATATTTATGGCTGGAATTTCTGCTAATTATGAATTTGATTTAAAAAAAATTATTGCTTTATCTACTTTAAGACAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTAAGTATAGGTTTATCAGATTTAGCTTTTTTTCATTTATTAACTCATGCTATATTTAAAGCTTTACTTTTTATGTGTGCTGGTGTTATTATTCATATAATAAATGATAATCAAGATATTCGTTTAATGGGTGGAATTAGATTATATATTCCTTTAACTTCTCTTTGTATAAATATTTCAAATTTAGCTTTATGTGGTATTCCTTTTTTAGCTGGATTTTATTCTAAGGATTTAATTTTAGAAATATTAGTAATAAGAAATTTAAATTTAATAGTTTTTTTTTTATTTTATATTTCTACAGGTTTAACTATATTTTATACGGTTCGTTTATTAATATATTTAATAGTAAATGATTATAATTTATTATCAGTTTATAATTTATATGATGAAGATTATATTATATTAAAAAGAATGTATATATTATTATTTATAAGATTAATTACTGGAAGAATATTAAGATGATTAATTTTTTCTTATCCTTATATAATTTATTTACCTATAAATTTAAAATTAATAGTTTTATATGTTAGTTTTTTAGGTTTAATATTAGGTTATTTAATTAGAAATATAAAAATTTATTCTGTTAATAAGTTTTTGAAAACTTATAAATTAAGATTATTAAAGGGTCCTAATAAAGTTGGTTTTATAGGGTTATTACAGCCTTTTTCTGATGCTATTAAATTATTTACTAAGGAACAAATATATTTAAATTATTCTAATTATTTAATTTATTATTTTTCTCCTATTATGAGTTTTATTTTATCTTTAATAATTTGAATATTAATTCCTTATTATTTTAATATAATTAGATTTAATTTAGGTATTTTATTTTTTTTATGTTGTACTAGATTAGGGGTTTATACTATTATAATTGCTGGTTGATCTTCTAATTCTAATTATTCTTTATTGGGGGGTTTACGAGCAGTTGCTCAAACTATTTCTTATGAAGTAAGTTTGAGATTAATTTTAATATCTTGTATTATTATAATTATAAATTTTAATTTAATAAAATTTAATATATATCAATCTATAATTTGATTAATTTTTTTAATATTACCTTTAAGATTATGTTGAATATCTTCAAGATTATGCGTCTTTTTGC--TTATAATTTAAAGTCGAATCTGCCCACTGAT--AATTTATTAAAGGGCTGCAGTATATTGACTGTACAAAGGTAGCATAATCATTAGTCTTTTAATTGAAGACTTGTATGAATGATTTGATGAAATATAAACTGTCTCTATTTTA-TAATT-AAAATTTAATTTTTTAGTAAAAAAGCTAAAATAAATAAAAAAGACGAGAAGACCCTATAGAGTTTTATAATTAATTTTATTAAAATTTTTTATAAATATTA------AAT---AAAAATATTTTTAATTATTTTATTGGGGTGATAAAAAAATTAATTAAACTTTTTTT----ATATTTAAATATTAATAAATAATAAAATGATCCATAAATTATGATTAAAAGAAAAAATTACCTTAGGGATAACAGCGTAATTTTTTTTTTTAGTTCAAATAGAAAAAAGAGTTTGCGACCTCGATGTTGGATTAAGATAAAATTTA-AATGCAGAAGTTTAAAATTTT-GATCTGTTCGATCATTAAAATCTTACA???????????????CAAGTCCACCACCACTGGACATTTGATCTACAAATGTGGTGGTATCGACAAACGTACCATTGAGAAGTTCGAGAAGGAAGCCCAGGAAATGGGCAAAGGTTCCTTCAAGTACGCCTGGGTGTTGGACAAACTGAAGGCTGAGCGTGAACGTGGTATCACAATTGATATTGCTCTGTGGAAGTTCGAAACAGCCAAATACTATGTCACTATTATCGATGCTCCTGGACACAGAGATTTCATCAAAAACATGATCACCGGTACCTCGCAGGCCGACTGCGCCGTGCTGATTGTCGCCGCCGGTACTGGTGAGTTCGAAGCCGGTATCTCTAAGAACGGCCAGACCCGCGAGCACGCCCTCCTCGCCTTCACCCTTGGTGTCAAGCAGCTGATTGTAGGTGTTAACAAAATGGACTCTACTGAGCCTCCTTACAGCGAACCCCGTTTCGAGGAAATCAAGAAGGAAGTCTCCTCCTACATCAAGAAGATCGGTTACAATCCTGCTGCTGTCGCTTTCGTACCCATTTCCGGCTGGCACGGAGACAACATGTTGGAGCCATCCACCAAAATGCCTTGGTTCAAGGGATGGAACGTTGAGCGTAAGGAAGGTAAGGCTGAAGGCAAGTGCCTCATTGAGGCCTTGGACGCCATCCTGCCCCCAGCTCGCCCCACAGACAAGGCCCTCCGTCTTCCCCTGCAGGACGTGTACAAAATTGGCGGTATTGGTACAGTGCCCGTAGGAAGAGTTGAGACTGGTATCCTCAAGCCTGGTACCATTGTTGTATTCGCCCCCGCTAACATCACCACTGAAGTAAAATCTGTGGAGATGCACCACGAAGCTCTTCAAGAGGCTGTGCCTGGAGACAATGTTGGTTTCAACGTAAAGAACGTCTCTGTCAAGGAATTGCGTCGTGGGTACGTCGCCGGTGACTCCAAGAACAACCCACCCAAGGGTGCCGCTGACTTCACTGCACAGGTCATCGTGCTCAACCACCCTG??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATCGTGCATTGTGAAGACGTGCTGGATGAGGCTGCCTAGCTTCCGCTCCGTGGGCGAYGCGTTGAAGGATCGCTTCGAYGGAGCCTCGCGRGTGATGATGCCTAACACGGACCTAGAGGCGCCCGTGCAGAGGAAYGAYGCGGCGCCACACCGGGTGCCCCGRMGAGATCGGTATCGATTCCAGCTCCGACCGYACAATCCGGAYCACAAGTCCCCGGGGTCGAAGGACCTCGTGTACCTGGAATCGTCGCCGGGTTTCTGCGAAAAGAAYCCGCGGYTCGGYATTCCCGGGACGCACGGGCGCGCCTGCAACGACACGAGCCTCAACGTCGACGGCTGCGACCTGATGTGCTGCGGTCGCGGATACCGGACTGARACCATGTTCGTGGTCGAGCGGTGTAACT0101000?00211?00100000010100000????010001011000100101100110001010100111001011101000100--011100-0111000--0000??????????????????????????????????????000????????????100010010120???0021110000001010210???????0???????0???010110000011100000??00
	;
END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
CHARSET COI = 1 - 1547 ; 
 CHARSET tRNA_Leucine = 1548 - 1626 ; 
 CHARSET COII = 1627 - 2310 ; 
 CHARSET ND5 = 2311 - 3126 ; 
 CHARSET ND1 = 3127 - 3598 ; 
 CHARSET 16S = 3599 - 4131 ; 
 CHARSET Ef1a = 4132 - 5371 ; 
 CHARSET wg = 5372 - 5775 ; 
 CHARSET morphology = 5776 - 6011 ; 
 OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 END;