NEXUS [File created by TreeBASE: 7/26/07 21:14:09] [Matrix accession#: M2844] BEGIN TAXA; TITLE M2844; DIMENSIONS NTAX=25; TAXLABELS Pinus_strobus_22S4 Pinus_strobus_11S3 Pinus_strobus_09S1 Pinus_strobus_04S1 Pinus_strobus_03S2 Pinus_strobus_01S1 Pinus_squamata Pinus_monticola_16S1 Pinus_monticola_13S1 Pinus_monticola_07S1 Pinus_monticola_06S1 Pinus_monticola_05S1 Pinus_monticola_02S2 Pinus_monticola_01S1 Pinus_gerardiana Pinus_chiapensis_41S1 Pinus_chiapensis_39S1 Pinus_chiapensis_38S1 Pinus_chiapensis_35S1 Pinus_chiapensis_03S4 Pinus_chiapensis_02S1 Pinus_bungeana Pinus_ayacahuite_15S2 Pinus_ayacahuite_12S1 Pinus_ayacahuite_01S1 ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE M2844; DIMENSIONS NCHAR=1056; FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = - ; MATRIX Pinus_strobus_22S4 TCCAGCTGCGGCCAGACCTAAGGCGAGCCGAGGTTGCTTGCCATCACTGTGCTGTTGSTGCTGTTGTTGTCCAAAGTCCAAGAGTATCGATCCTAAGAAATCCGCTCCACAGGAAGATTTAAATGCTGCAATCTTCAATCTGCAAGAAATGCAAAGTAAGTAATGCAAAAAGTGACAGTTTGGTCTCATATTCAGTTTTGTGTCAACAGATAGTGAATGTTAATACAGCTCATAAAGTTTAAAATTATTATTTTGTCCATAATTTCACCTCGATTTTGGGGGCTCAGAAAATTTTGAAACATATTTATCTGTCTCATCCAACCCTTGAAAAGCCCCAAACCTCATTTAGGCCATTATTATTTTTTACAAAACAGATTTGTATTATACAATTTTGTGGGTGGTTTTTAGAAAATACATGAGGCATTGCAGAGTTGAGTAATCAATATTTTTT???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GCCATTAGAGAATTATAGTAG?CTCTATTTTTT?GCCATTAATCACCTATACCTTCTGTTTCTCTAATGAAATCTCTTA?GACATAGAAATATATTTTGAATAGGATATCTTCCTCAACTTTAGGAAAGAATTTCACATAACTGTCCTGTCCACTTAATGCACTTTGGCTAAAGCTAACAAAAATCTAGAGTAA?TATCATATATTGCTGCATTTTTCATATAACCCAGATCCCTTAAGGTAGTGAAAAATATTATTATTGGCACCCGGGGTTAACTTCTTAGTCATTGAGTTGATGTTAGAGGCTTTATTGCCCTCTTTTCTTAAAATTCTCTAAATTTGTATCAATCTCCATCTACATATGCCTGGGCAAGATCAAAACAGTATTTTAAAATTTAACGGTAATGATTTGCTCTTGTAACAGGTTATGATGATACC?C??????ACC?ACACC Pinus_strobus_11S3 TCCAGCTGCGgCcaGACcTAAGgCGAGCCGAGGTTGCTTGCCATCACTATGCTGTTGCTGCTGTtGTtGTCCAAAGTCCAAGAGTATCGATCCTAAGAAATCCGCTCCACAGGAAGATTTAAATGCTGCAATCTTCAATCTGCAAGAAATGCAAAGTAAGTAATGCAAAAAGTGACAGTTTGGTCTCATATTCAGTTTTGTGTCAACAGATAGTGAATGTTAATACAGCTCATAAAGTTTAAAATTATTATTTTGTCCATAATTTCACCTCGATTTTGGGGGCTCAGAAAATTTTGAAACATATTTATCTGTCTCATCCAACTCTTGAAAAGCCCCAAACCTCATTTAGGCCATTATTATTTTTTACAAAACAGATTTGTATTATACAATTTTGTGGGTGGTTTTTAGAAAATACACGAGGCATTGCAGAGTTGAGTTATCAATATCTTTTAATTGTTTATGATTTTATTGAGGAGGATATACCTGAATAACAAAAAGGAAGGGTTCTGTAGGTGAAGCTCTTACAAAATT???????????????????TTACAACACAAAATCTGATTAGGGTAGTTATTTTT???AGTAGATTTCATCAGCCATTAGAGAATTATAGTAGGCTCTATTTTTT?GCCATTAATCACCTATACCTTCTGTTTCTCTAATGAAATATCTTAAGACATAGAAATATATTTTGAATAGAATATCTTCCTCAACTTTAGGAAATAATTTCACATAACTGTCCTGTCCACTTAATGCACTTTGGCTAAAGCTAACAAAAATCTAGAGTAA?TATCATATATTGCTGCATTTTTCATATAACCCAGATCCCTTAAGGTAGTGAAAAATATTATTATTGGCACCTGGGGTTAACTTCTTAGTCATTGAGTTGATGTTAGAGGCTTTATTGCCCTCTTTTCTTAAAATTCTCTAAATTTGTATCAATCTCCATCTACATATGCCTGGGCAAGATCAAAGCAGTATTTTAAAATTTAACGGTAATGATTTGCTCTtgtaacaggtNNNNNNNNNACCCAAACCACAAC?AAACC Pinus_strobus_09S1 TCCAGCTGCGGCCAGACCTAAGGCGAGCCGAGGTTGCTTGCCATCACTATGCTGTTGSTGCTGTTGTTGTCCAAAGTCCAAGAGTATCGATCCTAAGAAATCCGCTCCACAGGAAGATTTAAATGCTGCAATCTTCAATCTGCAAGAAATGCAAAGTAAGTAATGCAAAAAGTGACAGTTTGGTCTCATATTCAGTTTTGTGTCAACAGATAGTGAATGTTAATACAGCTCATAAAGTTTAAAATTATTATTTTGTCCATAATTTCACCTCGATTTTGGGGGCTCAGAAAATTTTGAAACATATTTATCTGTCTCATCCAACTCTTGAAAAGCCCCAAACCTCATTTAGGCCATTATTATTTTTTACAAAACAGATTTGTATTATACAATTTTGTGGGTGGTTTTTAGAAAATACATGAGGCATTGCAGAGTTGAGTTATCAATATCTTTTAATTGTTTATGATTTTATTGAGGAGGATATACCTGAATAACAAAAAGGAAGGGTTCTGTAGGTGAAGCTCTTACAAAATT???????????????????TTACAACACAAAATCTGATTAGGGAAGTTATTTTT???AGTAGATTTCATCAGCCATTAGAGAATTATAGTAGGCTCTATTTTTTTGCCATTAATCACCTATACCTTCTGTTTCTCTAATGAAATCTCTTAAGACATAGAAATATATTTTGAATAGAATATCTTCCTCAACTTTCGGAAATAATTTCACATAACTGTCCTGTCCACTTAATGCACTTTGGCTAAAGCTAACAAAAATCTAGAGTAA?TATCATATATTGCTGCATTTTTCATATAACCCAGATCCCTTAAGGTAGTGAAAAATATTATTATTGACACCTGGGGTTAACTTCTTAGTCATTGAGTTGATGTTAGAGGCTTTATTGCCCTCTTTTCTTAAAATTCTCTAAATTTGTATCAATCTCCATCTACATATGCCTGGGCAAGATCAAAGCAGTATTTTAAAATTTAACGGTAATGATTTGCTCTTGTAACAGGTNNNNNNNNNACCCAAACCACAAACAAACC Pinus_strobus_04S1 TCCAGCTGCGGCCAGACCTAAGGCGAGCCGAGGTTGCTTGCCATCACTATGCTGTTGSTGCTGTTGTTGTCCAAAGTCCAAGAGTATCGATCCTAAGAAATCCGCTCCACAGGAAGATTTAAATGCTGCAATCTTCAATCTGCAAGAAATGCAAAGTAAGTAATGCAAAAAGTGACAGTTTGGTCTCATATTCAGTTTTGTGTCAACAGATAGTGAATGTTAATACAGCTCATAAAGTTTAAAATTATTATTTTGTCCATAATTTCACCTCGATTTTGGGGGCTCAGAAAATTTTGAAACATATTTATCTGTCTCATCCAACTCTTGAAAAGCCCCAAACCTCATTTAGGCCATTATTATTTTTTACAAAACAGATTTGTATTATACAATTTTGTGGGTGGTTTTTAGAAAATACACGAGGCATTGCAGAGTTGAGTTATCAATATCTTTTAATTGTTTATGATTTTATTGAGGAGGATATACCTGAATAACAAAAAGGAAGGGTTCTGTAGGTGAAGCTCTTACAAAATT???????????????????TTACAACACAAAATCTGATTAGGGTAGTTATTTTT???AGTAGATTTCATCAGCCATTAGAGAATTATAGTAGGCTCTATTTTTT?GCCATTAATCACCTATACCTTCTGTTTCTCTAATGAAATATCTTAAGACATAGAAATATATTTTGAATAGAATATCTTCCTCAACTTTAGGAAATAATTTCACATAACTGTCCTGTCCACTTAATGCACTTTGGCTAAAGCTAACAAAAATCTAGAGTAA?TATCATATATTGCTGCATTTTTCATATAACCCAGATCCCTTAAGGTAGTGAAAAATATTATTATTGGCACCTGGGGTTAACTTCTTAGTCATTGAGTTGATGTTAGAGGCTTTATTGCCCTCTTTTCTTAAAATTCTCTAAATTTGTATCAaTCTCcATCTACATATGCCTGGGCAaGATCAAAGCAGTATTTTAAAaTTTAACGGTAaTGATTTGCTCTtGTAACAGGTTACGATGATACCCAAACCACAAC?AAACC Pinus_strobus_03S2 TCCAGCTGCGGCCAGACCTAAGGCGAGCCGAGGTTGCTTGCCATCACTATGCTGTTGCTGCTGTTGTTGTCCAAAGTCCAAGAGTATCGATCCTAAGAAATCCGCTCCACAGGAAGATTTAAATGCTGCAATCTTCAATCTGCAAGAAATGCAAAGTAAGTAATGCAAAAAGTGACAGTTTGGTCTCATATTCAGTTTTGTGTCAACAGATAGTGAATGTTAATACAGCTCATAAAGTTTAAAATTATTATTTTGTCCATAATTTCACCTCGATTTTGGGGGCTCAGAAAATTTTGAAACATATTTATCTGTCTCATCCAACTCTTGAAAAGCCCCAAACCTCATTTAGGCCATTATTATTTTTTACAAAACAGATTTGTATTATACAATTTTGTGGGTGGTTTTTAGAAAATACATGAGGCATTGCAGAGTTGAGTTATCAATATCTTTTAATTGTTTATGATTTTATTGAGGAGGATATACCTGAATAACAAAAAGGAAGGGTTCTGTAGGTGAAGCTCTTACAAAATT???????????????????TTACAACACAAAATCTGATTAGGGAAGTTATTTTT???AGTAGATTTCATCAGCCATTAGAGAATTATAGTAGGCTCTATTTTTTTGCCATTAATCACCTATACCTTCTGTTTCTCTAATGAAATCTCTTAAGACATAGAAATATATTTTGAATAGAATATCTTCCTCAACTTTCGGAAATAATTTCACATAACTGTCCTGTCCACTTAATGCACTTTGGCTAAAGCTAACAAAAATCTAGAGTAA?TATCATATATTGCTGCATTTTTCATATAACCCAGATCCCTTAAGGTAGTGAAAAATATTATTATTGACACCTGGGGTTAACTTCTTAGTCATTGAGTTGATGTTAGAGGCTTTATTGCCCTCTTTTCtTAAAATTCTCTAAATTTGTATCAATCTCCATCTACATATGCCTGGGCAAGATCAAAGCAGTATTTTAAAATTTAACGGTAATGATTTGCTCTTGtaACAGGTTACGATGATACCCAAACCACAAACAAACC Pinus_strobus_01S1 TCCAGCTGCGGCCAGACCTAAGGCGAGCCGAGGTTGCTTGCCATCACTATGCTGTTGCTGCTGTTGTTGTCCAAAGTCCAAGAGTATCGATCCTAAGAAATCCGCTCCACAGGAAGATTTAAATGCTGCAATCTTCAATCTGCAAGAAATGCAAAGTAAGTAATGCAAAAAGTGACAGTTTGGTCTCATATTCAGTTTTGTGTCAACAGATAGTGAATGTTAATACAGCTCATAAAGTTTAAAATTATTATTTTGTCCATAATTTCACCTCGATTTTGGGGGCTCAGAAAATTTTGAAACATATTTATCTGTCTCATCCAACTCTTGAAAAGCCCCAAACCTCATTTAGGCCATTATTATTTTTTACAAAACAGATTTGTATTATACAATTTTGTGGGTGGTTTTTAGAAAATACATGAGGCATTGCAGAGTTGAGTTATCAATATCTTTTAATTGTTTATGATTTTATTGAGGAGGATATACCTGAATAACAAAAAGGAAGGGTTCTGTAGGTGAAGCTCTTACAAAATT???????????????????TTACAACACAAAATCTGATTAGGGAAGTTATTTTT???AGTAGATTTCATCAGCCATTAGAGAATTATAGTAGGCTCTATTTTTT?GCCATTAATCACCTATACCTTCTGTTTCTCTAATGAAATCTCTTAAGACATAGAAATATATTTTGAATAGAATATCTTCCTCAACTTTCGGAAATAATTTCACATAACTGTCCTGTCCACTTAATGCACTTTGGCTAAAGCTAACAAAAATCTAGAGTAA?TATCATATATTGCTGCATTTTTCATATAACCCAGATCCCTTAAGGTAGTGAAAAATATTATTATTGACACCTGGGGTTAACTTCTTAGTCATTGAGTTGATGTTAGAGGCTTTATTGCCCTCTTTTCTTAAAATTCTCTAAATTTGTATCAATCTCCATCTACATATGCCTGGGCAAGATCAAAGCAGTATTTtAAAAtTTAaCGGtAaTGATTTGCTCTtGTAaCAGGTtACGATGATACCCAAACCACAAC?AAACC Pinus_squamata tccagctgcggccagacctaaggcgagccgaggttgcttgccatcactgtgctgttgctgctgttgttgtccaaagtccaagagtatcGATCCTAAGAAATCcGCTCcaCAGGAAGATTTAAATGCTGCAATCTTCAATCTGCAAGAAATGCAGAGTAAGTAATGCAAAAAGTGACAGTTTGGTCTCATATTCAGTTTTGTGTCAACAGATAGTGAATGTTA?TACAGCTCATAAAGTTTAAAATTATTATTTTGTCCATAATTTCACCTGGATTTTGGGGGCTCAGAAAATTTTGAAACATATTTATCTGTCTCATCCAACCCTTGAAAAGCCCCAAACCTCATTTAGGCCATTATTATTTTTTACAAAACAGATTTGTATTATACAATTTTGTGGGTGGTTTTTAGAAAACACATGAGGCATTGCAGAGTTGAGTTATCAATAATTTTTAATTGTTTATGATTTTATTGCGGAGGATATACCTGAATAACAAAAA?GAAGGGTTCTGTAGGTGAAGCTCTTACAAAATTATTCCAACAAAACACAAATTTACAACACAAAATCTGATTAGGGAATTTTTTTTT???AGTAGATTTCATCAGCCATTAGAGAATTATAGTA?GCTCTATTTTTT?GCCATTAATCACCTATACCTTCTGTTTCTCTAATGAAATCTCTTAAGACATAGAAATATATTTTGGATAGGATATCTTCCTCAACTTTAGGAAAGAATTTCACATAACTGTCCTGTCCACTTAATGCACTTTGGCTAAAGCTAACAAAAATCTGGAGTAAATATCATATATTGCTGCATTTTTCATATAACCCAGACCCCTTAAGGTAGTGAAAAATATTGTTATTGGTGCCTGGGATTAACTTCTTAGTCATTGAGTTGATGTTAGAGGCTTTATTGCCCTCTTTTCTTAAAATTCTCTAAATTTGTATCAATCTCCATCTACATATGCCTGGGCAAGATCAAAACAGTATTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCCAACACACCAC?AAACA Pinus_monticola_16S1 TCCAGCTGCGGCCAGACCTAAGGCGAGCCGAGGTTGCTTGCCATCACTATGCTGTTGSTGCTGTTGTTGTCCAAAGTCCAAGAGTATCGATCCTAAGAAATCCGCTCCACAGGAAGATTTAAATGCTGCAATCTTCAATCTGCAAGAAATGCAAAGTAAGTAATGCAAAAAGTGACAGTTTGGTCTCATATTCAGTTTTGTGTCAACAGATAGTGAATGTTAATACAGCTCATAAAGTTTAAAATTATTATTTTGTCCATAATTTCACCTCGATTTTGGGGGCTCAGAAAATTTTGAAACATATTTATCTGTCTCATCCAACCCTTGAAAAGCCCCAAACCTCATTTAGGCCATTATTATTTTTTACAAAACAGATTTGTATTATACAATTTTGTGGGTGGTTTTTAGAAAATACATGAGGCATTGCAGAGTTGAGTTATCAATATTTTTTAATTGTTTATGATTTT??????????????????????AACAAAAA?GAAGGGTTCTGTAGGTGAAGCTCTTACAAAATT???????????????????TTACAACACAAAATTTGATTAGGGAAGTTATTTTT???AGTAGATTTCATCAGCCATTAGAGAATTATAGTAGGCTCTATTTTTTTGCCATTAATCACCTATACCTTCTGTTTCT??AATGAAATCTCTTAAGACATAGAAATATATTTTGAATAGGATATCTTCCTCAACTTTAGGAAAGAATTTCACATAACTGTCCTGTCCACTTAATGCACTTTGGCTAAAGCTAACAAAAATCTAGAGTAA?TATCATATATTGCTGCATTTTTCATATAACCCAGATCCCTTAAGGTAGTGAAAAATATTATTATTGGCACCTGGGGTTAACTTCTTAGTCATTGAGTTGATGTTAGAGGCTTTATTGCCCTCTTTTCTTAAAATTCTCTAAATTTGTATCAATCTCCATCTACATATGCCTGGGCAaGATCAAAACAGTATTTTAAAATTTAACGGTAaTGATTTGCTCTtGTAaCAGGTTACGATGATACCCACCCCACAAACCAACC Pinus_monticola_13S1 TCCAGCTGCGGCCAGACCTAAGGCGAGCCGAGGTTGCTTGCCATCACTATGCTGTTGCTGCTGTTGTTGTCCAAAGTCCAAGAGTATCGATCCTAAGAAATCCGCTCCACAGGAAGATTTAAATGCTGCAATCTTCAATCTGCAAGAAATGCAAAGTAAGTAATGCAAAAAGTGACAGTTTGGTCTCATATTCAGTTTTGTGTCAACAGATAGTGAATGTTAATACAGCTCATAAAGTTTAAAATTATTATTTTGTCCATAATTTCACCTCGATTTTGGGGGCTCAGAAAATTTTGAAACATATTTATCTGTCTCATCCAACCCTTGAAAAGCCCCAAACCTCATTTAGGCCATTATTATTTTTTACAAAACAGATTTGTATTATACAATTTTGTGGGTGGTTTTTAGAAAATACATGAGGCATTGCAGAGTTGAGTTATCGATATTTTTTAATTGTTTATGATTTT??????????????????????AACAAAAA?GAAGGGTTCTGTAGGTGAAGCTCTTACAAAATT???????????????????TTACAACACAAAATTTGATTAGGGAAGTTATTTTT???AGTAGATTTCATCAGCCATTAGAGAATTATAGTAGGCTCTATTTTTTTGCCATTAATCACCTATACCTTCTGTTTCT??AATGAAATCTCTTAAGACATAGAAATATATTTTGAATAGGATATCTTCCTCAACTTTAGGAAAGAATTTCACATAACTGTCCTGTCCACTTAATGCACTTTGGCTAAAGCTAACAAAAATCTAGAGTAA?TATCATATATTGCTGCATTTTTCATATAACCCAGATCCCTTAAGGTAGTGAAAAATATTATTATTGGCACCTGGGGTTAACTTCTTAGTCATTGAGTTGATGTTAGAGGCTTTATTGCCCTCTTTtctTAAAATTCTCTAAATTTGTATCAATCTCCATCTACATATGCCTGGGCAAGATCAAAACAGTATTTTAAAATTTAACGGTAATGATTTGCTCTTGTAACAGGTTACGATGATACCCACCCCACAAACCAACC Pinus_monticola_07S1 TCCAGCTGCGGCCAGACCTAAGGCGAGCCGAGGTTGCTTGCCATCACTGTGCTGTTGSTGCTGTTGTTGTCCAAAGTCTAAGAGTATCGATCCTAAGAAATCCGCTCCACAGGAAGATTTAAATGCTGCAATCTTCAATCTGCAAGAAATGCAAAGTAAGTAATGCAAAAAGTGACAGTTTGGTCTCATATTCAGTTTTGTGTCAACAGATAGTGAATGTTA?TACAGCTCATAAAGTTTAAAATTATTATTTTGTCCATAATTTCACCTGGATTTTGGGGGCTCAGAAAATTTTGAAACATATCTATCTGTCTCATACAACCCTTGAAAATCCCCAAACCTCATTTAGGCCATTATTATTTTTTACAAAACAGATTTGTATTATACAATTTTGTGGGTGGTTTTTAGAAAATACATGAGGCATTGCAGAGTTGAGTTATCAATATTTTTTAATTGTTTATGATTTTATTGAGGAGGATATACATGAATAACAAAAA?GAAGGGTTCTGTAGGTGAAGCTCTTACAAAATTATTCCAACAAAACACAAATTTACAACACAAAATCTGATTAGGGAATTTTTTTTTTTAAGTAGATTTTATCAGCCATTAGAGAATTATAGTAGGCTCTATTTTTT?GCCATTAATCACCTATACCTTCTGTTTCTCTAATGAAATCTCTTAAGAAATAGAAATATATTTTGAATAGGATATCTTCCTCAACTTGAGGAAAGAATTTCACATAACTGTCGTGTCCACTTAATGCACTTTGGCTAAAGCTAACAAAAATCTAGAGTAA?TATCATATATTGCTGCATTTTTCATATAACCCAGATCCCTTAAGGTAGTGAAAAaTATTATtATTGGCACcTGGGGTTAACTTCTTAGTCATtgAGTtgATGTtaGAGGCTTTatTGCCctctTTTCTtAAAatTctCTAAATTtgtatcaatctccatctacttatgcctgggcaagatcaaaacagtattttaaaatttaacggtaatgatttgctcttgtaacaggttacNNNNNNCCCCAACACAAAAC?AAACC Pinus_monticola_06S1 TCCAGCTGCGGCCAGACCTAAGGCGAGCCGAGGTTGCTTGCCATCACTGTGCTGTTGSTGCTGTTGTTGTCCAAAGTCTAAGAGTATCGATCCTAAGAAATCCGCTCCACAGGAAGATTTAAATGCTGCAATCTTCAATCTGCAAGAAATGCAAAGTAAGTAATGCAAAAAGTGACAGTTTGGTCTCATATTCAGTTTTGTGTCAACAGATAGTGAATGTTA?TACAGCTCATAAAGTTTAAAATTATTATTTTGTCCATAATTTCACCTGGATTTTGGGGGCTCAGAAAATTTTGAAACATATCTATCTGTCTCATACAACCCTTGAAAATCCCCAAACCTCATTTAGGCCATTATTATTTTTTACAAAACAGATTTGTATTATACAATTTTGTGGGTGGTTTTTAGAAAATACATGAGGCATTGCAGAGTTGAGTTATCAATATTTTTTAATTGTTTATGATTTTATTGAGGAGGATATACATGAATAACAAAAA?GAAGGGTTCTGTAGGTGAAGCTCTTACAAAATTATTCCAACAAAACACAAATTTACAACACAAAATCTGATTAGGGAATTTTTTTTTTTAAGTAGATTTTATCAGCCATTAGAGAATTATAGTAGGCTCTATTTTTT?GCCATTAATCACCTATACCTTCTGTTTCTCTAATGAAATCTCTTAAGAAATAGAAATATATTTTGAATAGGATATCTTCCTCAACTTGAGGAAAGAATTTCACATAACTGTCGTGTCCACTTAATGCACTTTGGCTAAAGCTAACAAAAATCTAGAGTAA?TATCATATATTGCTGCATTTTTCATATAACCCAGATCCCTTAAGGTAGTGAAAAATATTATTATTGGCACcTGGGGTTAACTtcttAGTCATTGAGTTGATGTTAGagGCTTTATtGCCcTCTTTTCTtAAAATTCTCTAAATTtgtatcaatctccatctacatatgcctgggcaagatcaaaacagtattttaaaatttaacNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCCAACACAAAAC?AAACC Pinus_monticola_05S1 TCCAGCTGCGGCCAGACCTAAGGCGAGCCGAGGTTGCTTGCCATCACTGTGCTGTTGSTGCTGTTGTTGTCCAAAGTCTAAGAGTATCGATCCTAAGAAATCCGCTCCACAGGAAGATTTAAATGCTGCAATCTTCAATCTGCAAGAAATGCAAAGTAAGTAATGCAAAAAGTGACAGTTTGGTCTCATATTCAGTTTTGTGTCAACAGATAGTGAATGTTA?TACAGCTCATAAAGTTTAAAATTATTATTTTGTCCATAATTTCACCTGGATTTTGGGGGCTCAGAAAATTTTGAAACATATCTATCTGTCTCATACAACCCTTGAAAATCCCCAAACCTCATTTAGGCCATTATTATTTTTTACAAAACAGATTTGTATTATACAATTTTGTGGGTGGTTTTTAGAAAATACATGAGGCATTGCAGAGTTGAGTTATCAATATTTTTTAATTGTTTATGATTTTATTGAGGAGGATATACATGAATAACAAAAA?GAAGGGTTCTGTAGGTGAAGCTCTTACAAAATTATTCCAACAAAACACAAATTTACAACACAAAATCTGATTAGGGAATTTTTTTTTTTAAGTAGATTTTATCAGCCATTAGAGAATTATAGTAGGCTCTATTTTTT?GCCATTAATCACCTATACCTTCTGTTTCTCTAATGAAATCTCTTAAGAAATAGAAATATATTTTGAATAGGATATCTTCCTCAACTTGAGGAAAGAATTTCACATAACTGTCGTGTCCACTTAATGCACTTTGGCTAAAGCTAACAAAAATCTAGAGTAA?TATCATATATTGCTGCATTTTtCATAtaACCCAGATCCCTTAagGTAGTGAAAAaTATtATtatTGgcACCTGGGgtTaaCTtCTtAGTCATtGAGTtGATGTtAgagGCTTtATtGCCCTCTTTtCTtaAAaTtctctaAAtTTGtatcaatctccatctacatatgccNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCCAACACAAAAC?AAACC Pinus_monticola_02S2 TCCAGCTGCGGCCAGACCTAAGGCGAGCCGAGGTTGCTTGCCATCACTGTGCTGTTGCTGCTGTTGTTGTCCAAAGTCTAAGAGTATCGATCCTAAGAAATCCGCTCCACAGGAAGATTTAAATGCTGCAATCTTCAATCTGCAAGAAATGCAAAGTAAGTAATGCAAAAAGTGACAGTTTGGTCTCATATTCAGTTTTGTGTCAACAGATAGTGAATGTTA?TACAGCTCATAAAGTTTAAAATTATTATTTTGTCCATAATTTCACCTGGATTTTGGGGGCTCAGAAAATTTTGAAACATATCTATCTGTCTCATACAACCCTTGAAAATCCCCAAACCTCATTTAGGCCATTATTATTTTTTACAAAACAGATTTGTATTATACAATTTTGTGGGTGGTTTTTAGAAAATACATGAGGCATTGCAGAGTTGAGTTATCAATATTTTTTAATTGTTTATGATTTTATTGAGGAGGATATACATGAATAACAAAAA?GAAGGGTTCTGTAGGTGAAGCTCTTACAAAATTATTCCAACAAAACACAAATTTACAACACAAAATCTGATTAGGGAATTTTTTTTTTTAAGTAGATTTTATCAGCCATTAGAGAATTATAGTAGGCTCTATTTTTT?GCCATTAATCACCTATACCTTCTGTTTCTCTAATGAAATCTCTTAAGAAATAGAAATATATTTTGAATAGGATATCTTCCTCAACTTGAGGAAAGAATTTCACATAACTGTCGTGTCCACTTAATGCACTTTGGCTAAAGCTAACAAAAATCTAGAGTAA?TATCATATATTGCTGCATTTTTCATATAACCCAGATCCCTTAAGGTAGTGAAAAATATTATTATTGGCACCTGGGGTTAACTTCTTAGTCATTGAGTTGATGTTAGAGGCTTTATTGCCCTCTTTTCTTAAAATTCTCTAAATTTGTATCAATCTCCATCtACATATGCCTGGGcAagatcaaaacagtattttaaaatttaacggtaatgatttgctcttgtaacaggttacgatgatCCCCAACACAAAAC?AAACC Pinus_monticola_01S1 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTTGTCCAAAGTCTAAGAGTATCGATCCTAAGAAATCCGCTCCACAGGAAGATTTAAATGCTGCAATCTTCAATCTGCAAGAAATGCAAAGTAAGTAATGCAAAAAGTGACAGTTTGGTCTCATATTCAGTTTTGTGTCAACAGATAGTGAATGTTA?TACAGCTCATAAAGTTTAAAATTATTATTTTGTCCATAATTTCACCTGGATTTTGGGGGCTCAGAAAATTTTGAAACATATCTATCTGTCTCATACAACCCTTGAAAATCCCCAAACCTCATTTAGGCCATTATTATTTTTTACAAAACAGATTTGTATTATACAATTTTGTGGGTGGTTTTTAGAAAATACATGAGGCATTGCAGAGTTGAGTTATCAATATTTTTTAATTGTTTATGATTTTATTGAGGAGGATATACATGAATAACAAAAA?GAAGGGTTCTGTAGGTGAAGCTCTTACAAAATTATTCCAACAAAACACAAATTTACAACACAAAATCTGATTAGGGAATTTTTTTTTTTAAGTAGATTTTATCAGCCATTAGAGAATTATAGTAGGCTCTATTTTTT?GCCATTAATCACCTATACCTTCTGTTTCTCTAATGAAATCTCTTAAGAAATAGAAATATATTTTGAATAGGATATCTTCCTCAACTTGAGGAAAGAATTTCACATAACTGTCGTGTCCACTTAATGCACTTTGGCTAAAGCTAACAAAAATCTAGAGTAA?TATCATATATTGCTGCATTTTTCATATAACCCAGATCCCTTAAGGTAGTGAAAAATATTATTATTGGCACCTGGGGTTAACTTCTtaGTCATTGAGTTGATGTtaGAGGCTTTAttgcCCTCTTTTCTtAAaatTctCTAAaTTtGtatcaatctccatctacatatgcctgggcaagatcaaaacagtattttaaaatttaacggtaatgatttgctcttgtaacaggttacgatgatCCCCAACACAAAAC?AAACC Pinus_gerardiana TCCAGCTGCGGCCAGACCTAAGGCGAGCCGAGGTTGCTTGCCATCACTGTGCTGTTGCTGCTGTTGTTGTCCAAAGTCCAAGAGTATCGATCCTAAGAAATCCGCTCCACAGGAAGATTTAAATGCTGCAATCTTCAATCTGCAAGAAATGCAGAGTAAGTAATGCAAAAAGTGACAGTTTGGTCTCATATTCAGTTTTGTGTGAACAGATAGTGAATGTTA?TACAGCTCATAAAGTTTAAAATTATTATTTTGTCCATAATTTCACCTGGATTTTGGGGGCTCAGAAAATTTTGAAACATATTTATCTGTCTCATCCAACCCTTGAAAAGCCCCAAACCTCATTTAGGCCATTATTATTTTTTACAAAACAGGTTTGTATTATACAATTTTGTGGGTGGTTTTTAGAAAATACATGAGGCATTGCAGAGTTGAGTTATCAATATTTTTTAATTGTTTATGATTTTATTGAGGAGGATATACCTGAATAACAAAAA?GAAGGGTTCTGTAGGTGAAGCTCTTACAAAATTATTCCAATAAAACACAAATTTACAACACAAAATCTGATCAGGGAATTTTTTTT????AGTAGATTTCATCAGCCATTAGAGAATTATAGTA?GCTCTATTTTTT?GCCATTAATCACCTATACCTTCTGTTTCTCTAACGAAATCTCTTAAGACA??GAAATATATTTTGGATAGGATATCTTCCTCAACTTTAGGAAAGAATTTCACATAACTGTCCTGTCCACTTAATGCACTTTGGCTAAAGCTAACAAAAATCTGGAGTAAATATCATATATTGCTGCATTTTTCATATAACCCAGACCCCTTAAGGTAGTGAAAAATATTGTTATTGGCGCCTGGGATTAACTTCTTAGTCATTGAGTTGATGTTAGAGGCTTTATtgCCCTCTTTTCTTAAAATTCTCTAAATTTGTATCAATCTCCATCTACATATGCCTGGGCAAGATCAAAACAGTATTTTAAAATTTAACGGTAATGATTTGCTCTTGTAACAGGTTACGATGATCCCCAACACC?CAC?AACCA Pinus_chiapensis_41S1 TCCAGCTGCGGCCAGACCTAAGGCGAGCCGAGGTTGCTTGCCATCACTATGCTGTTGSTGCTGTTGTTGTCCAAAGTCCAAGAGTATCGATCCTAAGAAATCCGCTCCACAGGAAGATTTAAATGCTGCAATCTTCAATCTGCAAGAAATGCAAAGTAAGTAATGCAAAAAGTGACAGTTTGGTCTCATATTCAGTTTTGTGTCAACAGATAGTGAATGTTAATACAGCTCATAAAGTTTAAAATTATTATTTTGTCCATAATTTCACCTCCATTTTGGGGGCTCAGAAAATTTTGAAACATATTTATCTGTCTCATCCAACCCTTGAAAAGCCCCAAACCTCATTTAGGCCATTATTATTTTTTACAAAACAGATTTGTATTATACAATTTTGTGGGTGGTTTTTAGAAAATACATGAGGCATTGCAGAGTTGAGTTATCAATATTTTTTGATGGTTTATGATTTTATTGAGGAGGATATACCTGAATAACAAAAAGGAAGGGTTCTGTAGGTGAAGCTCTTACAAAATT???????????????????TTACAACACAAAATCTGATTAGGGAAGTTATTTTT???AGTAGATTTCATCAGCCATTAGAGAATTATAGTAGGCTCTATTTTTT?GCCATTAATCACCTATACCTTCTGTTTCTCTAATGAAATCTCTTAAGACATAGAAATATATTTTGAATAGGATATCTTCCTCAACTTTAGGAAAGAATTTCACATAACTGTCGTGTCCACTTAATGCACTTTGGCTAAAGCTAACAAAAATCTAGAGTAA?TATCATATATTGCTGCATTTTTCATATAACCCAGATCCCTTAAGGTAGTGAAAAATATTATTATTGGCACCTGGGGTTAACTTCTTAGTCATTGAGTTGATGTTAGAGGCTTTATTGCCCTCTTTTCTTAAAATTCTCTAAATTTGTATCAATCTCCATCTACATATGCCTGGGCAAGATCAAAACAGTATTTTAAAaGTTAACGgtAATGATTTgCTCTtGTAACagGtTACGATGATACCCAAACCACAAC?AAACC Pinus_chiapensis_39S1 NNNNNNNNNGGCCAGACCTAAGGCGAGCCGAGGTTGCTTGCCATCACTATGCTGTTGSTGCTGTTGTTGTCCAAAGTCCAAGAGTATCGATCCTAAGAAATCCGCTCCACAGGAAGATTTAAATGCTGCAATCTTCAATCTGCAAGAAATGCAAAGTAAGTAATGCAAAAAGTGACAGTTTGGTCTCATATTCAGTTTTGTGTCAACAGATAGTGAATGTTAATACAGCTCATAAAGTTTAAAATTATTATTTTGTCCATAATTTCACCTCCATTTTGGGGGCTCAGAAAATTTTGAAACATATTTATCTGTCTCATCCAACCCTTGAAAAGCCCCAAACCTCATTTAGGCCATTATTATTTTTTACAAAACAGATTTGTATTATACAATTTTGTGGGTGGTTTTTAGAAAATACATGAGGCATTGCAGAGTTGAGTTATCAATATTTTTTGATGGTTTATGATTTTATTGAGGAGGATATACCTGAATAACAAAAAGGAAGGGTTCTGTAGGTGAAGCTCTTACAAAATT???????????????????TTACAACACAAAATCTGATTAGGGAAGTTATTTTT???AGTAGATTTCATCAGCCATTAGAGAATTATAGTAGGCTCTATTTTTT?GCCATTAATCACCTATACCTTCTGTTTCTCTAATGAAATCTCTTAAGACATAGAAATATATTTTGAATAGGATATCTTCCTCAACTTTAGGAAAGAATTTCACATAACTGTCGTGTCCACTTAATGCACTTTGGCTAAAGCTAACAAAAATCTAGAGTAA?TATCATATATTGCTGCATTTTTCATATAACCCAGATCCCTTAAGGTAGTGAAAAATATTATTATTGGCACCTGGGGTTAACTTCTTAGTCATTGAGTTGATGTTAGAGGCTTTATTGCCCTCTTTTCTTAAAaTTCTCTAAATTTGTATCAaTCTCcATCTACaTATGCcTGGgcAagATCAAAaCAGTATTTtAAAaGTtAACGgTAaTGATTTgCTCTtGTAaCaGgTtACGATGATACCCAAACCACAAC?AAACC Pinus_chiapensis_38S1 TCCAGCTGCGGCCAGACCTAAGGCGAGCCGAGGTTGCTTGCCATCACTATGCTGTTGCTGCTGTTGTTGTCCAAAGTCCAAGAGTATCGATCCTAAGAAATCCGCTCCACAGGAAGATTTAAATGCTGCAATCTTCAATCTGCAAGAAATGCAAAGTAAGTAATGCAAAAAGTGACAGTTTGGTCTCATATTCAGTTTTGTGTCAACAGATAGTGAATGTTAATACAGCTCATAAAGTTTAAAATTATTATTTTGTCCATAATTTCACCTCCATTTTGGGGGCTCAGAAAATTTTGAAACATATTTATCTGTCTCATCCAACCCTTGAAAAGCCCCAAACCTCATTTAGGCCATTATTATTTTTTACAAAACAGATTTGTATTATACAATTTTGTGGGTGGTTTTTAGAAAATACATGAGGCATTGCAGAGTTGAGTTATCAATATTTTTTGATGGTTTATGATTTTATTGAGGAGGATATACCTGAATAACAAAAAGGAAGGGTTCTGTAGGTGAAGCTCTTACAAAATT???????????????????TTACAACACAAAATCTGATTAGGGAAGTTATTTTT???AGTAGATTTCATCAGCCATTAGAGAATTATAGTAGGCTCTATTTTTT?GCCATTAATCACCTATACCTTCTGTTTCTCTAATGAAATCTCTTAAGACATAGAAATATATTTTGAATAGGATATCTTCCTCAACTTTAGGAAAGAATTTCACATAACTGTCGTGTCCACTTAATGCACTTTGGCTAAAGCTAACAAAAATCTAGAGTAA?TATCATATATTGCTGCATTTTTCATATAACCCAGATCCCTTAAGGTAGTGAAAAATATTATTATTGGCACCTGGGGTTAACTTCTTAGTCATTGAGTTGATGTTAGAGGCTTTATTGCCCTCTTTTCTTAAAATTCTCTAAATTTGTATCAATCTCCATCTACATATGCCTGGGCAaGATCAAAACAGTATTTTAAAAGTTAACGGTAATGATTTGCTCTtGTAACAGGTTACGATGATACCCAAACCACAAC?AAACC Pinus_chiapensis_35S1 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTATGCTGTTGSTGCTGTTGTTGTCCAAAGTCCAAGAGTATCGATCCTAAGAAATCCGCTCCACAGGAAGATTTAAATGCTGCAATCTTCAATCTGCAAGAAATGCAAAGTAAGTAATGCAAAAAGTGACAGTTTGGTCTCATATTCAGTTTTGTGTCAACAGATAGTGAATGTTAATACAGCTCATAAAGTTTAAAATTATTATTTTGTCCATAATTTCACCTCCATTTTGGGGGCTCAGAAAATTTTGAAACATATTTATCTGTCTCATCCAACCCTTGAAAAGCCCCAAACCTCATTTAGGCCATTATTATTTTTTACAAAACAGATTTGTATTATACAATTTTGTGGGTGGTTTTTAGAAAATACATGAGGCATTGCAGAGTTGAGTTATCAATATTTTTTGATGGTTTATGATTTTATTGAGGAGGATATACCTGAATAACAAAAAGGAAGGGTTCTGTAGGTGAAGCTCTTACAAAATT???????????????????TTACAACACAAAATCTGATTAGGGAAGTTATTTTT???AGTAGATTTCATCAGCCATTAGAGAATTATAGTAGGCTCTATTTTTT?GCCATTAATCACCTATACCTTCTGTTTCTCTAATGAAATCTCTTAAGACATAGAAATATATTTTGAATAGGATATCTTCCTCAACTTTAGGAAAGAATTTCACATAACTGTCGTGTCCACTTAATGCACTTTGGCTAAAGCTAACAAAAATCTAGAGTAA?TATCATATATTGCTGCATTTTTCATATAACCCAGATCCCTTAAGGTAGTGAAAAATATTATTATTGGCACCTGGGGTTAACTTCTTAGTCATTGAGTTGATGTTAGAGGCTTTATTGCCCTCTTTTCTTAAAaTTCTCTAAATTTGTATCAATCTCCATCTACATATGCCTGGGCAaGATCAAAACAGTATTTTAAAAGTTAACGGTAATGATTTGCTcTtgTaACAGGTTACGATGATACCCAAACCACAAC?AAACC Pinus_chiapensis_03S4 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATCCGCTCCACAGGAAGATTTAAATGCTGCaATCTTCAATCTGCAAGAAATGCAAAGTAAGTAATGCAAAAAGTGACAGTTTGGTCTCATATTCAGTTTTGTGTCaACAGATAGTGAATGTTAATACAGCTCATAAAGTTTAAAATTATTATTTTGTCCATAATTTCACCTCCATTTTGGGGGCTCAGAAAATTTTGAAACATATTTATCTGTCTCATCCAACCCTTGAAAAGCCCCAAACCTCATTTAGGCCATTATTATTTTTTACAAAACAGATTTGTATTATACAATTTTGTGGGTGGTTTTTAGAAAATACATGAGGCATTGCARAGTTGAGTTATCAATATTTTTTGATGGTTTATGATTTTATTGAGGAGGATATACCTGAATAACAAAAAGGAAGGGTTCTGTAGGTGAAGCTCTTACAAAATT???????????????????TTACAACaCAAAATCTGATTAGGGAAGTTATTTTT???AGTAGATTTCATCAGCCATTAGAGAATTATAGtAGGCTCTATTTTTT?GCCATTAATCACCTATACCTTCTGTTTCTCTAATGAAATCTCTTAAGACATAGAAATATATTTTGAATAGGATATCTTCCTCAACTTTAGGAAAGAATTTCACATAACTGTCGTGTCCACTTAATGCACTTTGGCTAAAGCTAACAAAAaTCTAGAGTAa?TATCATATATTGCTGCATTTTTCATATAACCCAGATCCCTTAAGGTAGTGaAAAATATTATTATTGGCACCTGGGGtTAACTTCTTAGTCaTTGAGTTGATGTTAGAGGCTTTATtGCCCTCtTTTCTTAAAATtCtCtaAATTTGtATCAATCTCCaTCTACAtATGCCTGGGCAAGATCAAAaCAGTaTTTTAAAAGTTAaCGGtAAtgatttgctcttgtaacaggttacgatgatACCCAAACCACAAC?AAACC Pinus_chiapensis_02S1 TCCAGCTGCGGCCAGACCTAAGGCGAGCCGAGGTTGCTTGCCATCACTATGCTGTTGSTGCTGTTGTTGTCCAAAGTCCAAGAGTATCGATCCTAAGAAATCCGCTCCACAGGAAGATTTAAATGCTGCAATCTTCAATCTGCAAGAAATGCAAAGTAAGTAATGCAAAAAGTGACAGTTTGGTCTCATATTCAGTTTTGTGTCAACAGATAGTGAATGTTAATACAGCTCATAAAGTTTAAAATTATTATTTTGTCCATAATTTCACCTCCATTTTGGGGGCTCAGAAAATTTTGAAACATATTTATCTGTCTCATCCAACCCTTGAAAAGCCCCAAACCTCATTTAGGCCATTATTATTTTTTACAAAACAGATTTGTATTATACAATTTTGTGGGTGGTTTTTAGAAAATACATGAGGCATTGCAGAGTTGAGTTATCAATATTTTTTGATGGTTTATGATTTTATTGAGGAGGATATACCTGAATAACAAAAAGGAAGGGTTCTGTAGGTGAAGCTCTTACAAAATT???????????????????TTACAACACAAAATCTGATTAGGGAAGTTATTTTT???AGTAGATTTCATCAGCCATTAGAGAATTATAGTAGGCTCTATTTTTT?GCCATTAATCACCTATACCTTCTGTTTCTCTAATGAAATCTCTTAAGACATAGAAATATATTTTGAATAGGATATCTTCCTCAACTTTAGGAAAGAATTTCACATAACTGTCGTGTCCACTTAATGCACTTTGGCTAAAGCTAACAAAAATCTAGAGTAA?TATCATATATTGCTGCATTTTTCATATAACCCAGATCCCTTAAGGTAGTGAAAAATATTATTATTGGCACCTGGGGTTAACTTCTTAGTCATTGAGTTGATGTTAGAGGCTTTATTGCCCTCTTTTCTTAAAATTCTCTAAATTTGTATCAATCTCCATCTACATATGCCTGGGCaAgATCAAAACAGTATTTTAAAaGTtaACGGTAATGATTTGCTCTtgTAACaGGTTACGATGATACCCAAACCACAAC?AAACC Pinus_bungeana tccagctgcggccagacctaaggcgagccgaggttgcttgccatcactGtGTtGTTGCtGCTGTTGTTGTCCAAAGTCCAaGAGTATCGATCCTAAGAAATCCGCTCCaCGGGAAGATTTAAATGCTGCAATCTTCAATCTGCAAGAAATGCAAAGTAAGTAATGCAAAAAGTGACAGTTTGGTCTCATATTCAGTTTTGTGTCAACAGATAGTGAATGTTA?TACAGCTCATAAAGTTTAAAATTATTATTTTGTCCATAATTTCACCTGGATTTTGGGGGCTCAGAAAATTTTGAAACATATTTATCTGTCTCATCCAACCCTTGAAAAGGCCCAAACCTCATTTAGGCCATTATTATTTTTTACCAAACAGATTTGTATTATACAATTTTGTGGGTGGTTTTTAGAAAATACATGAGGCATTGCAGAGTTGAGTTATCAATATTTTTTAATTGTTTATGATTTTATTGAGGAGGATATACCTGAAAAACAAAAA?GAAGGGTTCTGTAGGTGAAGCTCTTACAAAATTATTCCAACAAAACACAAATTTACAACACAAAATCTGATTAGGGAATTTTTTTT????AGTAGATTTCATCAGCCATTAGAGAATTATAGTA?GCTCTATTTTTTTGCCATTAATCACCTATACCTTCTGTTTCTCTAATGAAATCTCTTAAGACATAGAAATATATTTTGGATAGGATATCTTCCTCAACTTTAGGAAAGAATTTCACATAACTGTCCTGTCCATAAAATGCACTTTGGCTAAAGCTAACAAAAATCTGGAGTAAATATCATATATTGCTGCATTTTTCATATAACCCAGACCCCTTAAGGTAGTGAAAAATATTGTTATTGGCGCCTGGGATTAACTTCTTAGTCATTGAGTTGATGTTAGAGGCTTTATTGCCCTCTTTTCTTAAAATTCTCTAAATTTGTaTCAATCTCCATCTACATAtGCCtGGGCAAGATCAAAACAGTaTTCTaaaatttaaNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCCAACACC?CAACAAACA Pinus_ayacahuite_15S2 NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGCCGAGGTTGCTTGCCATCACTGTGCTGTTGCTGCTGTTGTTGTCCAAAGTCCAAGAGTATCGATCCTAAGAAATCCGCTCCACAGGAAGATTTAAATGCTGCAATCTTCAATCTGCAAGAAATGCAAAGTAAGTAATGCAAAAAGTGACAGTTTGGTCTCATATTCAGTTTTGTGTCAACAGATAGTGAATGTTAATACAGCTCATAAAGTTTAAAATTATTattttgtccataaTTTCACCTCGATTTTGGGGGCTCAGAAAATTTTGAAACATATTTATCTGTCTCATCCAACCCTTGAAAAGCCCCAAACCTCATTTAGGCCATTATTATTTTTTACAAAACAGATTTGTATTATACAATTTTGTGGGTGGTTTTTAGAAAATACATGAGGCATTGCAGAGTTGAGTAATCAATATTTTTTAATTGTTTATGATTTTATTGAGGAGGATATACCTGAATAACAAAAA?GAAGGGTTCTGTAGGTGAAGCTCTTACAAAATTATTCCAACAAAACACAAATTTACAACACAAAATCTGATCAGGGAATTTTTTTT????AGTAGATTTCATCGGCCATTAGAGAATTATAGTAGGCTCTATTTTTTTGCCATTAATCACCTATACTTTCTGTTTCTCTAACGAAATCTCTTAAGACATAGAAATATATTTTGAATAGGATATCTTCCTCAACTTTAGGAAAGAATTTCACATAACTGTCCTGTCCACTTAATGCACTTTGGCTAAAGCTAACAAAAATCTAGACTAA?TATCATATATTGCTGCATTTTTCATATAACCCAGATCCCTAAAGGTAGTGAAAAATATTATTATTGGCACCTGGGGTTAACTTCTTAGTCATTGAGTTGATGTTAGAGGCTTTATTGCCCTCTTTTCTTAAAATTCTCTAAATTTGTATCAATCTCCATCTACATATGCCTGGGCAAGATCAAAACAGTATTTTAAAATTTAACGGTAATGATTTGCTCTTGTAacNNNNNNNNNNNNNACCCAACACC?AAACAAACC Pinus_ayacahuite_12S1 TCCAGCTGCGGCCAGACCTAAGGCGAGCCGAGGTTGCTTGCCATCACTGTGCTGTTGCTGCTGTTGTTGTCCAAAGTCCAAGAGTATCGATCCTAAGAAATCCGCTCCACAGGAAGATTTAAATGCTGCAATCTTCAATCTGCAAGAAATGCAAAGTAAGTAATGCAAAAAGTGACAGTTTGGTCTCATATTCAGTTTTGTGTCAACAGATAGTGAATGTTAATACAGCTCATAAAGTTTAAAATTATTATTTTGTCCATAATTTCACCTCGATTTTGGGGGCTCAGAAAATTTTGAAACATATTTATCTGTCTCATCCAACCCTTGAAAAGCCCCAAACCTCATTTAGGCCATTATTATTTTTTACAAAACAGATTTGTATTATACAATTTTGTGGGTGGTTTTTAGAAAATACATGAGGCATTGCAGAGTTGAGTAATCAATATTTTTTAATTGTTTATGATTTTATTGAGGAGGATATACCTGAATAACAAAAA?GAAGGGTTCTGTAGGTGAAGCTCTTACAAAATTATTCCAACAAAACACAAATTTACAACACAAAATCTGATCAGGGAATTTTTTTT????AGTAGATTTCATCGGCCATTAGAGAATTATAGTAGGCTCTATTTTTTTGCCATTAATCACCTATACTTTCTGTTTCTCTAACGAAATCTCTTAAGACATAGAAATATATTTTGAATAGGATATCTTCCTCAACTTTAGGAAAGAATTTCACATAACTGTCCTGTCCACTTAATGCACTTTGGCTAAAGCTAACAAAAATCTAGACTAA?TATCATATATTGCTGCATTTTTCATATAACCCAGATCCCTAAAGGTAGTGAAAAATATTATTATTGGCACCTGGGGTTAACTTCTTAGTCATTGAGTTGATGTTAGAGGCTTTATtGCCCTCTTTTCTtAAAaTTCTCTAAATTTGTATCAatCTCcATCTACaTATGCCTGGgcaAGATCAAAACAGTATTTTAAAaTTTAacgGTAaTGATTTGCTCTTGtaACAGGTTACGATGATACCCAACACC?AAACAAACC Pinus_ayacahuite_01S1 tccagctgcggccagacctaaggcgagccgaggtTGCtTGCCATCACTGTGCTGtTGCTGCTGtTGtTGTCCAAAGTCCAAGAGTATCGATCCTAAGAAATCCGCTCcACAGGAAGATTTAAATGCTGCAATCTTCAATCTGCAAGAAATGCAAAGTAAGTAATGCAAAAAGTGACAGTTTGGTCTCATATTCAGTTTTGTGTCAACAGATAGTGAATGTTAATACAGCTCATAAAGTTTAAAATTATTATTTTGTCCATAATTTCACCTCGATTTTGGGGGCTCAGAAAATTTTGAAACATATTTATCTGTCTCATCCAACCCTTGAAAAGCCCCAAACCTCATTTAGGCCATTATTATTTTTTACAAAACAGATTTGTATTATACAATTTTGTGGGTGGTTTTTAGAAAATACATGAGGCATTGCAGAGTTGAGTAATCAATATTTTTTAATTGTTTATGATTTTATTGAGGAGGATATACCTGAATAACAAAAA?GAAGGGTTCTGTAGGTGAAGCTCTTACAAAATTATTCCAACAAAACACAAATTTACAACACAAAATCTGATCAGGGAATTTTTTTT????AGTAGATTTCATCGGCCATTAGAGAATTATAGTAGGCTCTATTTTTTTGCCATTAATCACCTATACTTTCTGTTTCTCTAACGAAATCTCTTAAGACATAGAAATATATTTTGAATAGGATATCTTCCTCAACTTTAGGAAAGAATTTCACATAACTGTCCTGTCCACTTAATGCACTTTGGCTAAAGCTAACAAAAATCTAGACTAA?TATCATATATTGCTGCATTTTTCATATAACCCAGATCCCTAAAGGTAGTGAAAAATATTATTATTGGCACCTGGGGTTAACTTCTTAGTCATTGAGTTGATGTTAGAGGCTTTATTGCCCTCTTTTCTTAAAATTCTCTAAATTTGTATCAATCTCCATCTACATATGCCTGGGCAAGATCAAAACAGTATTTTAAAATTTAacggtaatgatttgctctNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCCAACACC?AAACAAACC ; END; BEGIN CODONS; CODONPOSSET * CodonPositions = N: 1 - 1056 ; CODESET * UNTITLED = Universal: all ; END; BEGIN ASSUMPTIONS; OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; END;