NEXUS
[File created by TreeBASE:  7/26/07  21:16:34]
[Matrix accession#: M3079]

BEGIN TAXA;
	TITLE M3079;
	DIMENSIONS  NTAX=35;
	TAXLABELS
		Amphilogia_gyrosa	Annulohypoxylon_bovei_var_microspora	Annulohypoxylon_cohaerens	Annulohypoxylon_moriforme_var_microdiscus	Annulohypoxylon_nitens	Annulohypoxylon_squamulosum	Biscogniauxia_anceps	Biscogniauxia_arima	Biscogniauxia_capnodes	Biscogniauxia_cylindrospora	Biscogniauxia_latirima	Biscogniauxia_mediterranea	Biscogniauxia_philippinensis_var_microspora	Biscogniauxia_simplicior	Cryphonectria_macrospora	Daldinia_caldariorum	Daldinia_fissa	Daldinia_loculata	Hypoxylon_rubiginosum	Hypoxylon_shearii_var_minor	Kretzschmaria_clavus	Kretzschmaria_lucidula	Kretzschmaria_megalospora	Nemania_illita	Nemania_primolutea	Rosellinia_lamprostoma	Rosellinia_necatrix	Stilbohypoxylon_elaeicola	Stilbohypoxylon_quisquiliarum_172	Stilbohypoxylon_quisquiliarum_89091608	Theissenia_cinerea	Theissenia_rogersii	Whalleya_microplaca	Xylaria_bambusicola	Xylaria_venosula
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M3079;
	DIMENSIONS NCHAR=433;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = -  ;
	MATRIX
		Amphilogia_gyrosa                                 ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGACGATGCCCCTCGGGCTGTCTTCCGTAAGT------CATCACCCCGCTTCCGACCTCC-AGC---------------------GCCGGCTTTGGAGCTATCGCCCT-GGGCGAC--CCAACAGCGCGGCACCG-CAAC----------GTTT-T------------GGG---AAAA-----CGGAT----GCTAAA-GA-TCT-----TCCACAGCTTCCATCGTCGGTCGTCCTCGCCACCATGGGTAAATGACTC-----C-----CCCA---------TTCAA-------------T-TCC--GGCGAT------CCGA------GGC---GAT----TCTAATG-GG-ATA---------TGC------AGTATCATGATCGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Annulohypoxylon_bovei_var_microspora              ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGATGACGCTCCTCGAGCTGTTTTCCGTAAGT------AA----------------CTATCTT-------------------------------CGCCCAA-CGGC---CGCCC----CCGCTTGAGCCTCGT----GG-----------C-GGCCTCA-------TTCAT----G---G-ATCCGCTT---TCTAAC--GT-----CTAAA-ACAGCGTCGATTGTCGGTCGTCCCCGTCATCATGGGTGAGT--AGCC-----AAC--TCCGACC--------CCGTA-------------TATCGTGTTCG-------CGC---------GGCAATA---TCTAACT----ATGTA-------ACC------AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Annulohypoxylon_cohaerens                         ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGATGACGCTCCCCGAGCTGTTTTCCGTAAGT------------TT-----------TGCCCTT-------------------------------GCCCAA-CGAC-----CC-----CCGCTTGAACCTCAT----GG-----------C-GGCCTCAA---CTCAACCT---CG---G-AATTATCT---TCTAAC--AT-----CTAACAACAGCGTCGATTGTCGGCCGTCCCCGTCATCATGGGTGAGT--AGTC-----GA---CCCGATC--------ATATATGT----------AATGTCGTTTG-------CGC---------AGCAATA---TCTAACC----GT-AC-------GTC------AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Annulohypoxylon_moriforme_var_microdiscus         ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGACGATGCTCCCCGAGCTGTTTTCCGTAAGT-------------T----------CTATCCT-------------------------------CGCCCAA-CAAG---CACCC----CCACCTGAGCCTCAT----GG-----------C-GGCCTC--------AACCT---CG---G-ATCCGCTT---TCTAAC--AT-----TTGG-TATAGCGTCCATTGTCGGTCGTCCCCGCCACCATGGGTGAGT--AGTT-----AA---GCCGACG--------ATATACGT----------AATA-TGCTCG-------CGC---------AGCAATA---TCTAACT----ATGT--------ACC------AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Annulohypoxylon_nitens                            ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGACGATGCTCCCCGAGCTGTTTTCCGTAAGT-------------T----------CTCCCCTT------------------------------CGCCCAA-CGGC---CGCCC----CCGCTTGAGCCTCAT----GG-----------C-GGCCTC--------AACCT---CG---G-ATCCGCTT---TCTAAC--AC-----TCGTCTATAGCGTCCATTGTCGGTCGTCCCCGTCATCATGGGTGAGT--AGTC-----GA---TCTCG---------ATAATATG-----------TATAGTGTTCG-------CGC---------AGTAGTA---TCTAACT----ATGG--------ACT------AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Annulohypoxylon_squamulosum                       ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGATGATGCTCCCCGAGCCGTTTTCCGTAAGT-------------T----------CTATCCT-------------------------------CGCCCAA-CGAC---CGCCC----CCGCTTGAGCTTCAG----GG-----------C-GGCCTC--------AACAT---CG---G-ATCGGCTT---TCTAAC--AT-----TTGAACATAGCGTCCATTGTCGGTCGTCCCCGTCATCATGGGTAAGT--AGTT-----GA---CCCTG-------CTCATATA-------------AATCGTGTTCG-------CGC---------AGCGATA---TCTAACT----ATGTA-------ACC------AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Biscogniauxia_anceps                              ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGATGATGCTCCCCGTGCTGTTTTCCGTAAGT-------ACCTCGTCCT------TCTCCCCTT------------------------------AGCTGAA-GCC----CGCC-----CCGCTTGAGCCTTATCT-CGA----------TCGGGCCAAGTA-----A--GT---GAA------CCGTTT---TCTAAC--GC-----TTGCGAACAGCGTCCATCGTCGGTCGTCCCCGCCACCATGGGTGAGT--TTG-----AGCT--CCCGATTC-------GAG-----CCTCG--AA-AAA--TGCTTG-------CGACTCTG-------GAT----TCTGACT-GG-TTGT--------GTT------AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Biscogniauxia_arima                               ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGATGATGCCCCCCGAGCTGTTTTCCGTAAGTT-------CTTCGT---------CCTCGCCCT------------------------------AGCTGAA-GCC----CGCC-----CCGCTTGAGCCTTATCT-CGA----------TTGGGCCAATT---------GT-TGGA-----CATC-T-----TCTAAC-TCC------TGCGGATAGCGTCCATTGTCGGTCGTCCCCGCCACCATGGGTGAGTACTCT-----CGTT--CCCGGATC-------GAG-----TATCG-GA--AA---TGCTTG-------CGACT--G-------GAT----TCTAAC---GA--GTC-------GTT------AGTATCATGATTGGCATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Biscogniauxia_capnodes                            ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGATGATGCTCCCCGTGCTGTTTTCCGTAAGT-------ACCTCGCCCT------CCTCTCTTT------------------------------AGCTGAG-GCC----CGCC-----CCGCTTGAGCCTTATCT-CGA----------TCGGGCTAAGTT--------GT---GAA------TCGTTT---TCTAAC--AC-----CTGCGAACAGCGTCCATCGTCGGTCGTCCCCGCCACCATGGGTGAGT--TTG-----AGCT--CCCGGAAC-------GAG-----CCTCG--AC-AA---TGTTTG-------CGATTCTG-------GAT----TCTGACT-GG-TTGT--------GCT------AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Biscogniauxia_cylindrospora                       ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGATGATGCCCCCCGAGCTGTTTTCCGTAAGT-------ACCTCGTCCT------CTTCGCTTT------------------------------AGCTGAA-GCT----CGCC-----CCGCTTGAGCCTTATCT-CGA----------TCGGGCCAATT------A--GT---GAA------TGCTCT---TCTAAC--GC-----TTGAGAACAGCGTCCATCGTCGGTCGTCCCCGTCATCATGGGTGAGT--TTG-----AATT--CCCGATCC-------GAT-----TTTCG--AG-AA---TGCTTG-------CGACTTTG-------GAT----TCTGACT-GG-TTGT--------GTT------AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Biscogniauxia_latirima                            ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGATGATGCTCCCCGTGCTGTTTTCCGTAAGT-------ACCTCGT---------TCTC-TTCTGTTCTCGTCTCCGTCCCTGTCCCTCGCCTTAGCTCGA-GCT----CGCC-----CCGCTTGAGCCTTAACT-CCA----------TCGGGCCAACTTT----A--GT---GCA------TGCTTT---TCTAAC--GC-----CTGTGTATAGCTTCTATCGTCGGTCGTCCCCGTCATCATGGGTGAGT--TTG-----AATT--CCCGAGTC-------GAC-----CTTCG--AT-AA---TGCCTC-------GGA-------TTTTGGAT----TCTGACT-GG-TTTT--------GCT------AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Biscogniauxia_mediterranea                        ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGATGATGCTCCCCGTGCTGTTTTCCGTAAGT-------ACCTCGT---------CCTCGCCTT------------------------------AGCTCGA-GCT----CGCC-----CCGCTTGAGCCTTATCT-CGA----------TCGGGCCAATTT-----A--GT---GAA------TGGGTT---TCTGAC--GC----CC-GCGGACAGCTTCTATCGTCGGTCGTCCCCGTCATCATGGGTGAGT--TTG-----CATT--CCCGGATC-------GAT-----CTTCG--AGCAA---CGTCTG-------CGATTCTG-------GAT----TCTGACT-GG-TTGT--------GCT------AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Biscogniauxia_philippinensis_var_microspora       ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGATGATGCTCCCCGTGCTGTTTTCCGTAAGT-------ACCTCGT---------TCTCGCTCTCGT-T---CT-CG-CCCCGTCCCTCGCCTTAGCTTGA-GCT----CGCC-----CCGCTTGAGCCTTATCT-CGA----------TCGGGCCAACTT-----A--GT---GCA------TGCTTT---TCTAAC--GC-----CTGCGGATAGCTTCTATCGTCGGTCGTCCCCGTCATCATGGGTGAGT--TTG-----AATT--CCCGAGTC-------GAC-----CTTCG--AC-GA---TGCCTC-------CGATTCTGCTTTCTGGAT----TCTGACT-GG-TTGT--------GCT------AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Biscogniauxia_simplicior                          ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGATGATGCCCCCCGAGCTGTTTTCCGTAAGT-------ACCTCTT---------CCTCGCCCC------------------------------AGCTGAA-GCC----CGCC-----CCGCTTGAGTCTTATCT-CGA----------TCTGGCCAATT------A--TT---GAA-------CGTTT---TCTAACCTAC-------GCGGATAGCGTCCATTGTCGGTCGTCCCCGCCACCATGGGTGAGT--TCT-----AGCT--CCCGAATC-------GAG-----CATGG--AG-AA---TACTTG-------CGACTCTG-------GAT----TCTGAC--GGATT----------GTT------AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Cryphonectria_macrospora                          ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGACGATGCTCCTCGAGCTGTCTTCCGTAAGT------CATCCTTCCCCCC---GCTTAC-CGT----------CC-AGCTCAACGCCAGCTCTGGACCAA-CGCCCTCGGGCGAC--CCAGCAGTGCGGTACGA-CAAC---------GGTTTCTTCTAGTACC---AGA---AAAA-----TGGTTT---GCTAATTAAATC-----TCATGCAGCTTCCATCGTCGGTCGTCCTCGCCACCATGGGTAAATAAATC-----CCT---CCCAAAAAC-----CCAG-------------TTTCT--GGCCCT------CCGA------GGT---GAT----TCTGACG-GC-ATG-------TTTGC------AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Daldinia_caldariorum                              ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGACGATGCTCCCCGAGCTGTTTTCCGTAAGT------------TT----------CCATCCT-------------------------------CGCCCAA-CCAT---CTCTC--CTCCGCTTCAGCCTCATCGG-GA-----------T-GAACTCA-------AATTT---GAATCA-TAT--------TCTAAC--GT-----GTCAACACAGCGTCCATCGTTGGTCGTCCCCGCCACCATGGGTAAGT--AGCT----AGCTAGCTCG-----------ATATAC--------TATATGTA-TAATCCA------CGC-----ACACGA-AACGATGTCTAACG----ATAT--------GCTTAACATAGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Daldinia_fissa                                    ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGACGATGCTCCCCGAGCTGTTTTCCGTAAGT-------------T----------CCATCCT-------------------------------CGCCCAA-CCAT---CGCCC----CCGCTTCAGCCTCATTGG-AA-----------CGGGCCTA--------AATTT---GGATTA-TTT--------TCTAAC--AT---CAATCAATATAGCGTCCATCGTTGGTCGTCCCCGCCACCATGGGTAAGT--AGCT-----AA---TCCG-----------ATATAC--------TACACGTA-TAACCTCCG----CGC-------ATGACAATA---TCTAACA----ATAAT-------GTT------AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Daldinia_loculata                                 ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGATGATGCTCCCCGAGCTGTTTTCCGTAAGT-------------T----------CCATCCT-------------------------------CGCCCAA-CCAT---CGCCC----CCGCTTCAGCCTCATCAG-AA-----------CGGGCCTA--------AATTT---GGAATC-TTT--------TCTAAC--AT-----GTTAACACAGCGTCCATCGTTGGTCGTCCCCGCCATCATGGGTAAGT--AGCT-----GA---TCCG-----------ATATAC--------TACGTGTA-CAACCTCCG----CGC-------ACGACAATA---TCTAACA----ATAT--------GCT------AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Hypoxylon_rubiginosum                             ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGATGATGCTCCCCGAGCTGTTTTCCGTAAGT-----------TTT------------CCCCT-------------------------------CGCCCAA-TCAA---CACCC----CCGCTTGAGCCTCAC----TA-----------T-GACCTCC-------ATCCT---GAAA-T-AATC-------GCTAAC--TT-----GGAATCCTAGCGTCCATTGTCGGTCGTCCCCGCCACCATGGGTGAGT--AGTT-----GT----CCGCTT--------ATCA----------AATACGC--TCGGCGTG-----CGC------AACGACAATA---TCTAACA----CGAT--------GCC------AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Hypoxylon_shearii_var_minor                       ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGACGATGCTCCCCGAGCTGTTTTCCGTAAGT------------TT---------CCCCCCCT-------------------------------CGCCCAA-TCAA---CGCCC----CCGCTTGAGCCTCAC----TA-----------C-GGCTTCC-------AACCT---GAAA-T-AATCC------ACTGAC--AT-----GGAACTTTAGCGTCCATCGTTGGTCGTCCCCGCCATCATGGGTGAGT--AGCT-----GT----CCCCT---------ATCA----------AACACCT--TGGGTTGGGTGCGCGC------AACGATAGCAA--TCTAACA----ATAT--------GCC------AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Kretzschmaria_clavus                              ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGATGATGCTCCCCGAGCTGTTTTCCGTAAGT---CCCCCCCCCC-------TTACCCAG-CCT------------------------------TGCCCAA-CGG----CGGCC----CCGCTTGTGCCTTGCCA-TGCCTTGGCAAGCTGCGGCTCGTTCT----ATCAT---CGACAG-CTTCCCT----TCTAACCTA-------TTTGCATAGCGTCGATTGTCGGTCGTCCCCGTCACCATGGGTATGT--CTGC----ACCC--TCCGT----------GTA-----GATTG--GT-CGC--GGCCTT----TG-CGA---TTTGGGG--CAT-CA-ATTAACT-GTAATT---------TTT------AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Kretzschmaria_lucidula                            ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGATGATGCTCCCCGAGCTGTTTTCCGTAAGTCCCCCCCCCCCCC--------TACCCAG-CCT------------------------------TGCCCAA-CGG----CGGCC----CCGCTTGTGCCTTGCCA-TGCCTTGGCAATCTGCGGCTGGTTCT----ATCAT---CGACAG-CTTCCCT----TCTAACCTA-------TTCGCGTAGCGTCGATTGTCGGTCGTCCCCGTCACCATGGGTACGT--CTGC----ACCC--TCCGT----------ATA-----GATTG--GT-CGC--GGTCTC----TG-CGA---TTTGAGG--CGT-CA-ATTAACT-GTAGTT---------TTT------AGTATCATGATCGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Kretzschmaria_megalospora                         ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGATGATGCTCCCCGAGCTGTTTTCCGTAAGT----C-CCCCCCT---------ACCCAG-CCT------------------------------TGCCCAA-CGG----CCGCC----CCGCTTGTGCCTTGCCA-AGA----------TGCGGCTTTCTAT---TATTAA---CGAC----TTGCCT----TCTAACCTG-------TTCGCATAGCGTCGATTGTTGGTCGTCCTCGTCACCATGGGTAAGT--CTGT----GCCC--TCCGC----------ATA-----AGTCG--GT-CGT--GGCTTTC---TG-TGG---TTTGGG---CGT-CA-ATTAACTGTACATA---------TTT------AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Nemania_illita                                    ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGATGATGCTCCTCGAGCTGTTTTCCGTAAGT----C-AACCCCT--------AACCCAG-CCT------------------------------TGCCCAA-CCG-----GGCT----CCGCTTGTACCTTGCCA-AGA----------TGCGGCTCT-CT--------AT---TATTAA--CTGCTTTCCTTCTAACCTC-------TGCGCGCAGCGTCTATTGTCGGTCGTCCCCGTCATCATGGGTAAGT--CTGC----GCCC--CCCGC----------ATA-----GATTG--GT-CGC--AAATTTT---TG-CGG--TGATGGG---CGTTC--GCTAATT----AT---------CTTC------AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Nemania_primolutea                                ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGATGATGCTCCTCGAGCTGTTTTCCGTAAGT----CT-ACTCCT---------ACCCAG-CCT------------------------------TGCCCAA-CCG----CAGCC----CCGCTTGCAACTTGCCA-AGA----------TGCGGCTCTACT--------GT---CAATAA--CTCGGTT---TCTAACCTT-------TGCCTACAGCGTCTATTGTCGGTCGTCCCCGCCATCATGGGTAAGT--TTGC----GCTC--TCTGT----------ACA-----GATTC--GT-ATC--GGCTATC-----ACGA--TGGTGGC---GGC-C--GCTAACCGT-AATT--C------CTC------AGTATCATGATTGGCATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Rosellinia_lamprostoma                            ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGACGATGCTCCCCGAGCTGTTTTCCGTAAGTTTGCCTTACCCCG---------ATCTAG-CCT------------------------------TGCCTAA-TCG----CTGCC----CCGCTCGTTCTTTGCCA-AGA----------TGCGGCTCGTTCTACC-ATCGT---CAA-----CTTAGCT---TCTAACCTT-------TACGTACAGCGTCTATTGTCGGTCGCCCCCGTCATCATGGGTAAGT-CTTGC----G-T---TCCC-----------CTA----CGTGGAGTATTCAC--CCCTT-----TG-CGA--TCATGA----CGT-AT-ATTAACG----ATG--CACCG--CAC------AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Rosellinia_necatrix                               ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGATGATGCTCCCCGAGCTGTTTTCCGTAAGT----CT-ACCCCT---------ACCTAG-CCT------------------------------CGCCCGA-CGG----CGGCC----CCGCTTGTACCTTGCCA-AGA----------TGCGGCTCGTTCTGT--ATCGT---CAA-----CTCAT-----TCTGACCTCC-------GCGCACAGCGTCGATTGTTGGTCGTCCCCGTCATCATGGGTAAGT--TTGC----GCCC--TCCC-----------ATA-----CG-CG--ATAACC-ATAATCC----TG-CGAC-TGGGGGC---TGT-TT-ATTAATTG----TG--CGTCG--CTT------AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Stilbohypoxylon_elaeicola                         ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGACGATGCTCCCCGAGCTGTTTTCCGTAAGT----CT-ATCTATCCCCCCTTCACTTAG-CCT------------------------------TGCCCAA-CTG----TGGCC----CCGCCCGTGCCTTGCCA-AGA----------TGCGGCTCGTTCT-------GT---CAACAAT--CGTTCGTCTTCTGACCTAGC-------CGCACAGCGTCGATCGTCGGTCGTCCCCGTCATCATGGGTGAGT-TATGATCT--CCC-ATCTA-----------GA------CGA----AT-CGCCATGG-------TGGCGACCCAAGGCGT---GT----GCTAATC----A-GGTCTTCGGTCTTC-----AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Stilbohypoxylon_quisquiliarum_172                 ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGATGACGCTCCCCGAGCTGTTTTCCGTAAGT----CTTATCTCCC--------ACCTAG-CCT------------------------------TGCCCAA-CAGA---CGGCC----CCGCTCGTGCCTTGCCA-AGA----------TGCGGCTCGTTCTAT----CGTTATCGAC----TTGCCT----TCTAACCTC-------TGTGCACAGCGTCCATTGTCGGTCGTCCCCGCCATCATGGGTAAGT--CTGC----GCCC-GTCGC-----------AAG-----CGTTG--AT-CGCTCTGTCTC----TG-CGGCCTAAGGAGTC-CGT-CG-GTTAACTT---ATG----TCC--CTC------AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Stilbohypoxylon_quisquiliarum_89091608            ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGATGACGCTCCCCGAGC-TTTTTCCGTAAGT----CTTATCTCCC--------ACCTAG-CCT------------------------------TGCCCAA-CAGA---CGGCC----CCGCTCGTGCCTTGCCA-AGA----------TGCGGCTCGTTCTAT----CCTCATCGAC----TTGTCT----TCTAACCTC-------TGTGCACAGCGTCCATTGTCGGTCGTCCCCGCCATCATGGGTAAGT--CTGC----GCCC-GTCAC-----------GAG-----CGTTG--AT-CGC--TGTCTC----TG-CGGCCTAAGGAGCC-CGT-CG-GTTAACTT---ATG----TCC--CTC------AGTATCATGATTGGCATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Theissenia_cinerea                                ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGACGATGCTCCTCGAGCTGTATTCCGTAAGT---------CTCAT---------CCTCG-CCC------------------------------AAC---A-GC-----CGCCCC---CCGCCTGAGCCCCATCAGCGAC----------AGCTTCAAAAAT------------ATACACC--TG-------TCTAACATGC-------GAGCGTAGCGTCCATCGTCGGTCGGCCCCGTCATCACGGGTAAGT--AACTTCTCAGACTTCTAGTAAC-------GTG-----CTTGA--AT-AC--GCAGTTG-------GGC------------GGT-A--CCTGACC----GTG-------ACATT------AGTATTATGATCGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Theissenia_rogersii                               ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGACGATGCTCCCCGAGCTGTATTCCGTGAGT---------CTCAT---------CCTCG-CCC------------------------------AAC---A-AC-----CGCCC----CCACCCGCGCTTCATCAGCGGC----------AGCTTCAAAAAC------------AAAAACC--TG-------CCTAACATGC-------GAGCATAGCGTCCATCGTTGGTCGGCCCCGTCATCACGGGTAAGT--AACCACTCGGACCTCCAGCAAC-------ATG-----CCTGGATAT-CCACGCGGTTG--------GC------------GGT---ACCTGACC----GTG-------ACGTT------AGTATCATGATCGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Whalleya_microplaca                               ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGATGATGCTCCTCGAGCTGTCTTCCGTAAGT--------TCT-GT---------CCTCAACCC------------------------------AGC---C-GC-----CGCC-----CCGCTCGCGGCCTATCT-CGG-----------CGGGCCCCAAA--------TTC--GAG-----CTATGC----TCTAAC--CT-----TTGTCTATAGCGTCCATTGTTGGTCGTCCCCGCCACCATGGGTGAGT--ATCT-----AT--CCTGGCCCCCAAATTTTGC----------GATG-AA---TGTTCG------CCGGC----------GGGT----TCTAA-T---GGCGT--------CGT------AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Xylaria_bambusicola                               ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGATGATGCTCCCCGAGCTGTTTTCCGTAAGT----C--GTCTCT---------ACCCAG-CCT------------------------------TGCCCAA-CCG----TGGCC----CCGCTCGTGCCTTGCCA-AGA----------TGCGGCTCCTTCT----GTCAT---TGATAA-CCCGCCAG----CTAACATC-------TTCATACAGCGTCGATTGTTGGTCGACCCCGTCATCATGGGTAAGT--TTAC----AACC--TCCGGCGCCATCAGGATA-----CGCTG--GT-CGT--AGCTTT----TGGCTATCTG-TGGG---CGT-C-AATTAACT--GTATA------TTTTTC------AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
		Xylaria_venosula                                  ATGTGCAAGGCCGGTTTCGCCGGTGATGATGCTCCCCGAGCTGTTTTCCGTAAGT----CTT-CCC-T---------ACCTAG-CCT------------------------------TGCCCAA-CCG----TGGCC----CCGCTTGTGCCTTGCCA-AGA----------TGCGGCTCCTTCT----ATCAT---CGACAA-CAAGCCT----GCTAACGCA-------TTTGCACAGCGTCGATTGTCGGTCGTCCCCGTCACCATGGGTAAGT--CTACG---AGCC---CCAAAGAGCTTTGCATA-----GGCTG--GT-CGC--AGCTGTCG--TG-CACT-TTTTGGG---CGT-CA-ATTAACC--GTATA-------TCTGC------AGTATCATGATTGGTATGGGCCAGAAGGACTCGTA
	;
END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions = 
 N: 1 - 433 ; 
 CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 END;