NEXUS
[File created by TreeBASE:  7/26/07  21:16:38]
[Matrix accession#: M3092]

BEGIN TAXA;
	TITLE M3092;
	DIMENSIONS  NTAX=31;
	TAXLABELS
		Blumeria_graminis_ex_Diarrhena_MUMH92	Blumeria_graminis_ex_Hordeum_MUMH147	Blumeria_graminis_ex_Secale_MUMH839	Blumeria_graminis_ex_Dactylis_MUMH815	Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH839	Blumeria_graminis_ex_Lolium_MUMH903	Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1619	Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1620	Blumeria_graminis_ex_Avena_MUMH1700	Blumeria_graminis_ex_Dactylis_MUMH1703	Blumeria_graminis_ex_Hordeum_MUMH1704	Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1705	Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1706	Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1707	Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1708	Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1709	Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1711	Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1712	Blumeria_graminis_ex_Triticum_MUMH1713	Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1718	Blumeria_graminis_ex_Hordeum_MUMH1719	Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH1720	Blumeria_graminis_ex_Elymus_MUMH1721	Blumeria_graminis_ex_Hordeum_MUMH1722	Blumeria_graminis_ex_Avena_MUMH1724	Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH2192	Blumeria_graminis_ex_Lolium_MUMH2288	Blumeria_graminis_ex_Secale_MUMH2289	Blumeria_graminis_ex_Agropyron_MUMH2335	Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH3273	Blumeria_graminis_ex_Hordeum_X51326
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M3092;
	DIMENSIONS NCHAR=379;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = -  ;
	MATRIX
		Blumeria_graminis_ex_Diarrhena_MUMH92         AGTTT-CCTCAGAGAGTGAGATATCCACTTCCACCAAACAATTTTAATGACTCCATTAGCTACAATGGTACATCAGATTTACAACTCGAAAGGATGAACGTATACTTTAATGAAGTCCGTTTAAGCTCTCAATAGAGATGTTATCGCTAATCTTCTCAAGGCTTCTGGTAACAAGTATGTTCCTCGTGCTGTTCTTGTCGATTTAGAGCCAGGTACCATGGATGCTGTACGAGCTGGTCCTTTTGGCCAGCTATTCAGACCAGACAATTTTGTTTTTGGACAATCTGGAGCAGGAAACAATTGGGCAAAAGGTCACTACACTGAAGGCGCGGAGCTTGTCGACCAAGTACTAGATGTGGTACGAAGAGAAGCAGAGGGC
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		Blumeria_graminis_ex_Dactylis_MUMH815         AGTTT-CCTGGGAAAATGAGGTGACTTCCGT---CAAACAATCATAATGACTCCACTAGCTACAATGGTACATCAGATTTACAACTCGAGAGGATGAACGTATACTTCAATGAGGTCCGTTTAAGCTCTCAAAAGAGATGTTATCGCTAACTCTCTTAAGGCTTCTGGTAACAAGTATGTTCCTCGTGCTGTTCTTGTCGATTTAGAGCCAGGTACCATGGATGCTGTACGAGCTGGTCCCTTTGGCCAGCTATTCAGACCAGACAACTTTGTTTTTGGGCAATCCGGAGCAGGAAACAACTGGGCAAAAGGTCACTACACTGAAGGCGCGGAGCTTGTCGACCAAGTACTAGATGTGGTGCGAAGAGAAGCAGAGGGT
		Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH839              AGTTTTCATCGGAGAACACGGTACCCGCTTCAGCCTATCATTCGTAATGACTCAAATAGCTACAATGGTACATCAGATTTGCAACTCGAACGGATGAACGTCTACTTTAACGAGGTCGAGTCAAGCACCCGAGGAAGACCTTATCGCTAATATTCTCAAGGCTTCTGGCAACAAATATGTTCCTCGTGCAGTTCTTGTCGATTTAGAGCCAGGAACCATGGATGCAGTGCGAGCCGGTCCTTTTGGTCAGCTATTCAGACCAGATAACTTTGTTTTCGGACAATCTGGAGCAGGAAACAATTGGGCAAAAGGTCACTACACCGAAGGCGCGGAGCTTGTCGACCAAGTACTAGACGTGGTACGAAGAGAAGCGGAAGGC
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		Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1619             AGTTTTCATCGGAGAACACGGTACCCGCTTCAGCCTATCATTCGTAATGACTCAAATAGCTACAATGGTACATCAGATTTGCAACTCGAACGGATGAACGTCTACTTTAACGAGGTCGAGTCAAGCACCCGAGGAAGACCTTATCGCTAATATTCTCAAGGCTTCTGGCAACAAATATGTTCCTCGTGCAGTTCTTGTCGATTTAGAGCCAGGAACCATGGATGCAGTGCGAGCCGGTCCTTTTGGTCAGCTATTCAGACCAGATAACTTTGTTTTCGGACAATCTGGAGCAGGAAACAATTGGGCAAAAGGTCACTACACCGAAGGCGCGGAGCTTGTTGACCAAGTACTAGACGTGGTACGAAGAGAAGCGGAAGGC
		Blumeria_graminis_ex_Poa_MUMH1620             AGTTTTCATCGGAGAACACGGTACCCGCTTCAGCCTATCATTCGTAATGACTCAAATAGCTACAATGGTACATCAGATTTGCAACTCGAACGGATGAACGTCTACTTTAACGAGGTCGAGTCAAGCACCCGAGGAAGACCTTATCGCTAATATTCTCAAGGCTTCTGGCAACAAATATGTTCCTCGTGCAGTTCTTGTCGATTTAGAGCCAGGAACCATGGATGCAGTGCGAGCCGGTCCTTTTGGTCAGCTATTCAGACCAGATAACTTTGTTTTCGGACAATCTGGAGCAGGAAACAATTGGGCAAAAGGTCACTACACCGAAGGCGCGGAGCTTGTCGACCAAGTACTAGACGTGGTACGAAGAGAAGCGGAAGGC
		Blumeria_graminis_ex_Avena_MUMH1700           AGTTT-CCTCGGAGAGTGAGGTACTTTTCAT---CAAACAATCCTAACGACTCCATTAGCTACAATGGTACATCAGATTTACAACTCGAGAGGATGAACGTATATTTTAATGAGGTCCGTTTAAGCTCTCAAAAGAGATGTTATTGCTAACCTTCCTAAGGCTTCTGGTAACAAGTATGTTCCTCGTGCTGTTCTTGTCGATTTAGAGCCAGGTACCATGGATGCTGTACGAGCTGGTCCCTTTGGCCAGCTATTCAGACCAGACAACTTTGTTTTCGGGCAATCTGGAGCAGGAAACAACTGGGCAAAAGGTCACTATACCGAAGGCGCGGAGCTTGTCGACCAAGTACTAGATGTAGTGCGAAGAGAAGCAGAGGGC
		Blumeria_graminis_ex_Dactylis_MUMH1703        AGTTT-CCTCGGAAAATGAGGTGACTTCCGT---CAAACAATCATAATGACTCCACTAGCTACAATGGTACATCAGATTTACAACTCGAGAGGATGAACGTATACTTCAATGAGGTCCGTTTAAGCTCTCAAAAGAGATGTTATCGCTAACTCTCTTAAGGCTTCTGGTAACAAGTATGTTCCTCGTGCTGTTCTTGTCGATTTAGAGCCAGGTACCATGGATGCTGTACGAGCTGGTCCCTTTGGCCAGCTATTCAGACCAGACAACTTTGTTTTTGGGCAATCCGGAGCAGGAAACAACTGGGCAAAAGGTCACTACACTGAAGGCGCGGAGCTTGTCGACCAAGTACTAGATGTGGTGCGAAGAGAAGCAGAGGGT
		Blumeria_graminis_ex_Hordeum_MUMH1704         AGTTC-CCTCGCATAATTAGGTATCCGTATTCATCAACGAATTATAATGACTCCATTAGCTACAATGGTACATCAGATTTACAACTTGAGAGGATGAACGTATACTTTAACGAGGTCTGGTGAAGCTCTCTAAAGAGAAGTTATCGCTAACCCTCTTAAGGCTTCTGGTAACAAATATGTTCCTCGTGCTGTTCTCGTCGACTTGGAGCCAGGTACTATGGATGCTGTACGAGCTGGTCCTTTTGGCCAGCTATTCAGACCAGACAACTTCGTCTTCGGACAATCTGGAGCCGGAAATAATTGGGCAAAAGGTCACTACACTGAAGGCGCGGAGCTTGTCGACCAAGTACTAGATGTAGTGCGAAGAGAAGCAGAGGGA
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		Blumeria_graminis_ex_Avena_MUMH1724           AGTTT-CCTCGGAGAGTGAGGTACTTTTCAT---CAAACAATCCTAACGACTCCATTAGCTACAATGGTACATCAGATTTACAACTCGAGAGGATGAACGTATATTTTAATGAGGTCCGTTTAAGCTCTCAAAAGAGATGTTATTGCTAACCTTCCTAAGGCTTCTGGTAACAAGTATGTTCCTCGTGCTGTTCTTGTCGATTTAGAGCCAGGTACCATGGATGCTGTACGAGCTGGTCCCTTTGGCCAGCTATTCAGACCAGACAACTTTGTTTTCGGGCAATCTGGAGCAGGAAACAACTGGGCAAAAGGTCACTATACCGAAGGCGCGGAGCTTGTCGACCAAGTACTAGATGTAGTGCGAAGAGAAGCAGAGGGC
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		Blumeria_graminis_ex_Bromus_MUMH3273          AGTTCACCCCGTAGAATAAGGTACCGGCTTTCACCAGGCAATCATAATGACCTCAATAGTTACAATGGTACATCAGATTTACAACTCGAAAGGATGAACGTATACTTCAATGAGGTCGGGCTAAGCTCTCCAAAGAGATACCATAGCTAATTTTCTTAAGGCTTCTGGTAACAAGTATGTTCCTCGTGCTGTTCTTGTCGATTTAGAGCCAGGTACCATGGACGCCGTTCGAGCTGGCCCTTTCGGTCAGCTATTCAGACCAGACAACTTCGTTTTTGGACAATCCGGCGCAGGAAACAACTGGGCAAAGGGTCATTACACCGAAGGTGCGGAGCTTGTCGACCAGGTACTAGACGTGGTGCGACGAGAAGCAGAAGGC
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	;
END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions = 
 N: 1 - 379 ; 
 CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 END;