NEXUS
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[Matrix accession#: M3129]

BEGIN TAXA;
	TITLE M3129;
	DIMENSIONS  NTAX=15;
	TAXLABELS
		Nephroselmis_sp.	Chaetosphaeridium_sp.	Mesostigma_sp.	Arabidopsis_sp.	Amphidinium_sp.	Emiliania_sp.	Odontella_sp.	Guillardia_sp.	Cyanidium_sp.	Cyanidioschyzon_sp.	Gracilaria_sp.	Porphyra_sp.	Synechocystis_sp.	Nostoc_sp.	Cyanophora_sp.
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M3129;
	DIMENSIONS NCHAR=8541;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = - ;
	MATRIX
		Nephroselmis_sp.            atgagtaaaatctatgactggttcgaagaacgcttagaaattcaggcaattgcagatgatattactagtaagtatgttccacctcatgtaaatatattttactgttttggcgggattacattaacttgtttcttaattcaggtagcgaccggttttgccatgaccttctactaccgcccaacagtgacagaagcttttgcttcggtagagtacatcatgaccaatgtcaactttggttggctcattcgttcgatccaccgctggtcagcaagtatgatggttatgatgttaattttgcacgtgttccgcgtttacttgactgggggcttcaaaaaacctcgtgaacttacttgggtcactggtgtgatccttgcagtcattactgtatcttttggagtgaccggatattctcttccatgggaccaagttggttactgggcagtgaaaattgttacaggtgttcctgatgcaattcctgtgattggtgctcctcttgtc------------gagttgcttcgtggaagcgtaagtgttggacaatccaccttgacacgtttctacagtttgcatacttttgtgcttccattgctgaccgcagtgtttatgctaatgcacttcttaatgattcgtaaacaaggtatttccggtcctctataaatgagcgtaacaaagaaacctgacttaactgatccagtccttcgggccaaattggcaaaaggaatggggcataattactatggcgaacctgcttggccgaatgatttgctttatatgttccctgtcgtaattcttggaactctttcttgtattactggtcttgctgttcttgatcctgcagcgattggagaacctgctaatccatttgctactcctcttgagattttgccagagtggtatttcttcccagttttccaattattgcgtactgttccgaacaaactgctcggtgttcttttgatggccgctgtccctgcaggcttattgactgtcccatttattgaaagtattaataagtttcaaaacccatttcgtcgtccagtggcaactacagtattcttaatcggtactgtcgtagctatttggcttggaattggtgcgaccctacccattgacatttctttgacacttggattattctaaatggttgaagctcttctctctggtattgttcttggcctaattcctgtcaccttagcaggtctctttgtcactgcttacctccaatatcgtcgtggtgatcagatggcaaccaaatttccaaagtttagtcagggcctcgcagaggaccctacaacccgtcgcatttggtatgggattgcaacggctcatgatttcgaaagtcatgatggaatgacagaagagagtttgtaccaaaagatctttgcatctcattttgggcaactcgcgatcattttcttatggacttctggaaaccttttccacgtagcgtggcaagggaactttgaacaatgggggcaagacccattgcatgtacgtcctattgctcatgcaatttgggaccctcattttggacaacctgcagttgaagcatttactcgtggaggagctgcaggacctgtcaacatctcttattctggtgtctatcaatggtggtatacaattggaatgcgtagctccaatgatttgtatacaggggctcttttccttttggtaggcgctgctatccttttgttcgcgggttggttacatttacagccaaagttccaaccaagcttgtcttggttcaaaaacgcagagtctcgcttgaaccaccacttggcaggtctttttggagttagctctcttgcatggactggacacttggtacacgtagcgattcctgaatcccgtggacaacatgttggatgggataatttcttgacgacattacctcacccagctggtttggctcctttctttaacggaaactggagtgtgtatgcgcagaatccagactccgcgagtcacttatttggaacttccactggggctggaaccgccattcttaccttccttggtgggttccatccacaaactcagagcttgtggctgaccgatatggctcaccaccacttggccatcgctgtcgtgtttatcttggcagggcatatgtaccgcaccaatttcggaattgggcactccatgcgagaaattttggaagcacaccgtgcaccttcaggacgtttagggcttggtcacaaaggtctctttgatactgtgaataac------------tccttgcatttccaattaggactcgcgcttgcttccttaggtgtgatcacttccttagtcgcacagcatatgtattcccttccgccatatgcatttatggcccaggatttcacgacgatgtccgctttgtacactcatcaccagtacattgcaggtttcattatgactggtgcgtttgcacacggagctattttcttcattcgtgattacgacccaatccaaaatgaaggaaacgtacttgcacgtatgctagagcataaagaggctttaatttctcatctaagctgggtgactcttttccttggcttccatactcttggactgtatgtgcataacgatgttatgttggcctttggaactccagagaagcaaatcttgattgagcctgtctttgctcaatggattcaagcatctcatggaaaagctctctatggatttgatgtattgctttccagtgcagatagccctgcaactagcgcgagccaatcg---------atttggcttcctggctggttagatgcaattaacagttcaagcaattctttgttcttgacaattggaccgggtgatttccttgtgcaccatgcaattgctcttgggcttcatacaactactctgattttagtgaaaggtgcattagatgcacgtggatctaagctaatgccagataagaaagattttggttatagcttcccatgtgatggtccaggacgtggcggtacatgtgatatttctgcgtgggatgccttctacttagctgttttctggatgttaaacacgattggttggacgactttctactggcactggaagcatttggcgttgtggcaaggaaatgctgcacagtttaatgaatcttctacgtacctcatgggttggttacgtgactatctctggttaaactcttcccagttgattaacggatataatccatttggtatgaatagcctttctgtgtgggcatggatgttcttatttggacaccttgtatgggcaactggctttatgtttttgatttcatggcgtgggtactggcaagaattaattgagacattggcgtgggcacatgagcgtactccattggctaacttagttcgttggaaagacaagccagtggctctttccattgtgcaagctcgtcttgtaggtctcgctcacttctccgtcggttatgtgtttacatatgctgcgttcgtgatcgcatccacttcaggtaagtttggtgactttactacttacctctccactgcgccagttttggcagctgtttggtttggttttttggctgggcttttaattgaaattaatcgtttcttcccagatgctcttatgggactaccttggtaccgtgtccatactgtcgtgttaaatgacccaggtcgacttattgcagttcacctgatgcatactgctttggtgtccggatgggcaggatccatggctctgtatgaaatttctgtatttgatccatctgatcctgtcttaaatccaatgtggcgtcaaggaatgtttgtgattccgtttatgacccgtcttggtgtgactaaatcttggggtggttggagcattacaggggagagtgtaagcaatccaggtatctggagttatgaaggagtagctactgctcatattcttctttccggtgctctcttcatggctgccatttggcactgggttttttgggatttggaactgttccgtgacccacgtactggtgagccagcactcgacttaccaaaaatctttgggattcacttattcttatcaggacttctttgttttggatttggcgcgttccatgtaactggcctttatggaccaggtatttgggtatctgatccatacgggattactggcagtgttcaacctgttgaacctgcatggggaccagaaggatttgatccatttaatccagggggaattgcttcacatcatattgcagcaggcatccttgggattttggcaggtttattccacctcagtgtaagaccacctcaacgtttgtataaagcacttcgtatggggaacgttgaaaccgttctttctagcagtattgcagcagtcttctgggctgctttcgttgtatctggtacaatgtggtatggatctgctgctacacctatcgaattgttcggtccaactcgttatcagtgggaccaaggtttcttccaacaagaaattgaaaaacgagtacaaggtagcttagcttctggtgcaagtttatccgatgcatgggcaaaaattcctgaaaaactctctttctacgactatatcggaaataacccagcgaaaggtggattattccgtgctggcgcgatgaacagtggagacggaattgctgcaggatggctaggacatccagtattcaccgataaagcaggcaatgaactcttcgtacgtcgtatgccaaccttctttgaaaccttccctgtgttgttagtagacaaagatggtgttgtacgtgcagacgttccattccgtcgtgctgaatccaagtacagcattgaacaagtaggtgttagcgtgacattctatggtggggaacttgatggtgtcactttcaatgacccaagcactgtgaaaaaatatgctcgtcgtgctcaactcggatccgttttcgaatttgaccgtgcgactcttcaatcagatggtgtattccgcagcagcccacgcggttggttcactttcggacacctttggttcgcgcttctattcttcttcggacatatttggcatggcgcaagaacaatcttccg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		Chaetosphaeridium_sp.       atgggtaaagtatacgattggtttgaagaacgtttagaaattcaagctattgcagatgatattagtagtaaatacgttccgcctcatgtaaacattttttattgtttaggaggaattacttttacatctttcgtcatacaagtagctagcggatttgctatgactttttattatagacctactgtaactgaagcttttgcatcagttcaatatataatgactgaagtcaattttgggtggcttataagatcagttcatagatggtctgctagtatgatggtactaatgatgatcttacatatattccgtgtctatttaacaggtggatttaaaaaacctagagaattaacttgggttactggtgttattttatctgttttgacagtttcttttggtgtaacaggatactcgttaccttgggaccaagtaggatactgggcagttaaaattgtaaccggagtacctgatgctattccagttataggttcaacagttgtt------------gaacttttaagaggtagtgttagtgttggtcagtcaactttaacacgtttttatagtttacatactttcgttttacctcttttaaccgcagtttttatgttgatgcactttttaatgattcgcaaacaaggaatttctggacctttataaatgggagtaactaaaaaacctgatttgagcgatcctgttttaagagctaagttagcaaaaggtatgggtcataattattatggtgaacctgcttggccaaacgatttattatatattttccctgtttgtatttttggaactattgcttgtaccgttggactttctgttctagaacctgtaattgttggtgaaccagcaaatccttttgctacacctcttgaaattttacctgagtggtattttttcccggtattccaaattttaagaacagttccaaataaattgttaggtgtattattaatggcaggagttcctgttggacttttaacagttccttttattgaaaatgtaaataagtttcaaaacccttttcgtcgtcctgtagcaactaccgtttttcttttaggtacagttgttgcaatatggttaggtataggagcagctcttcctattgatacttcattaactttaggcttattttaaatggttgaaccgttattatcaggaattgttttaggtttgataccgattacgttagccggtctttttgtaactgcttatttacagtatagacgtggagatcaaatggcatcaagatttccaaaatttagccagggactttcacaagacccgaccactcgtcgtatttggtttggtattgctacagcacatgatttcgaaagtcatgatggtattaccgaagaaaagctatatcaaaaaatatttgcttctcactttggtcaattagcagtaatatttttatggacttcgggaaatttatttcatgttgcttggcaaggcaattttgaagcatggtctcaagatccattacatgtgcgtcctatagctcatgctatttgggatccacattttggtcaacctgcagtagaagcttttactcgtggaggagcatctgggcctgttaatatatcttattcaggtgtatatcaatggtggtatacacaaggtataagaactaaccttgaactttatcaaggagcgctatttttacttggactagctgctgtatctttagctgctggttggttacatcttcaaccaaaatggcaaccaaaaatttcatggtttaaaaatgcagaatcccgcttaaaccaccatttatcaggattatttggcgttagttcattagcttggtctggtcatttagttcatgtggctatacctgaatcaagaggacaacacgtaggttgggataatttattaacaactttaccacatccggcaggattagcaccatttttctctggtcagtggagtgtttattcacaaaatcccgattctgctagtcatctttttagcactagtcaaggttctggaacagctattttaactttccttgggggttttcatccacaaacacaaagtttatggttaactgatattgctcatcaccatttagctattgcagtacttttcattattgcaggtcatcagtatcgtactaatttcggaattggtcatagtatacgagaaattttagaatctcatgttcctccaggtggtggacttggtcaaggacataaaggtttatatgatactcttaacaat------------tctttacattttcaattaggtcttgctttagcttcattaggtgttattacttctctagttgctcagcatatgtattctttaccttcatatgcctttatagctcaagattttactactcaagctgctctttatactcatcaccaatatatagctggtttcattatgagtggtgcttttgctcatggagctatcttttttattagagattataatcccgagcaaaacaaaggaaatgtcttagctagaatgttagaacataaagaagctatcatctcacatttaagttgggctagtttgtttttaggttttcatacgctaggtctttatgttcataatgatgtagtgcaagcttttggaaacccagaaaaacaaatattaattgaacctgtttttgctcaatggattcaatcttctcatggtaaaactttatacggttttgatgttttcttatcttctaccgcaagcccagctttttatgctggtcaaagt---------ctttggttacctggttggttagattcaattaatagtaatacaaattcattattcttaacaattggtcctggtgatttcttagtacaccatgctatcgctttaggtcttcacactactactttaattttagtaaaaggagctttagacgctagaggttctaaattaatgccagataagaaagaatttggatatagcttcccttgtgatggtcctggtcgtggcggtacttgcgatatttctgcttgggatgctttttatttagctattttttggatgttaaatactattggttgggtaactttttattggcattggaaacatttagctttgtggcaaggtaatgcagctcaatttaacgaatcatccacatatttaatgggttggttgagagattatttatggttaaactcttctcaattgattaatggttataatccatttggtatgaatagtttatcagtttgggcttggatgttcttatttggacatttaatttgggctacaggttttatgttcttaatctcttggagaggctattggcaagagcttattgaaactttagcttgggctcatgaaagaactccattagctaatttagttcgttggaaagataagccagttgctttatctattgttcaggctagattagttggtttagctcatttttctgtgggttatatttttacttatgctgcgtttttaattgcatcaacatcaggtaaatttggttattttaaaacttatctttctactgctccagtaatagcaactatttggtttggatttttggctggtttattaatagaaattaatcgtttttttccagatgcattaatgggtttgccttggtaccgcgtacatacagttgttttaaatgatcctggtagactaattgcagttcatattatgcatactgctttagtttcaggttgggctggttctatggctttatatgaactagctgtttttgatccctcagatcctgttttagatccaatgtggcgtcaaggaatgtttgtaataccatttatcactcgtttaggggtaactaaatcttggggcggatggagtattactggagaaacagtaaccaatgcaggactttggagttatgaaggcgttgccgcagtacacattatcctatcaggtttactatttttggctgcaatctggcactgggttttttgggatttagagttatttcgtgatgaaagaactggaaaaccatctttagatttacctaaaatttttggtattcatttatttctttcaggtttattatgctttggattcggtgcatttcatgtaacaggcttgtttggacctggtatttgggtatcagacccttatggattgaccggttctgtacaaccagtttctcctgcttggggagctgaaggctttgatccttttaatgcaggaggtattgcttctcaccatatagctgccggtattttaggaattcttgcaggtttatttcatttaagcgttcgtcctccacaaagattatataaaggtttacgtatggggaacgtagaaactgtattatctagtagtattgcggctgttttttgggctgcgtttgttgttgcaggaacaatgtggtatggatcagcggcaactccaattgagttatttggtcctactcgttatcaatgggatcaaggttattttgaacaagaaattgataaaagagtaggtactagtctttctgaaggacttactttatcagaagcttggtcaaaaattcctgaaaagttagctttttatgattacattggtaacaacccagctaaaggtggtttatttagagccggtgcaatggataacggggatggtattgctgtaggttggttagggcatgcttcttttaaagataaagaaggtcgtgaactttttgtacgccgtatgccaagtttctttgaaacattcccggttgttcttttagatagtgaaggtattgtacgtgcggatgttccgttccgtcgagctgaatctaaatatagtattgaacaagttggtgtaacggttcaattctatggcggtgaactagatggagtaagcttttcagatcctgctactgtgaaaaaatatgctagacgtgctcagttaggtgaaatttttgaatttgatcgtgcaactttaaaatctgatggtgttttccgtagtagccctagaggttggtttacttttggacacgcaaactttgcattattatttttctttggtcatatctggcatggcggtcgtacattatttag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		Mesostigma_sp.              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		Cyanophora_sp.              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	;
END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions = 
 N: 1 - 8541 ; 
 CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 END;