#NEXUS [written Thu Jul 09 21:58:51 CST 2015 by Mesquite version 3.03 (build 702) at Yu-2015/127.0.0.1] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=14; TAXLABELS Zostera_marina_YI1983 Potamogeton_distinctus_YI1686 Althenia_filiformis_YI1977 Althenia_orientalis_YI1562 Lepilaena_australis_YI1917 Lepilaena_bilocularis_YI1918 Lepilaena_cylindrocarpa_YI1106 Lepilaena_marina_YI1920 Lepilaena_preissii_YI1082 Pseudalthenia_aschersoniana_YI1981 Zannichellia_peltata_YI1470 Zannichellia_obtusifolia_YI1542 Zannichellia_pedunculata_YI1344 Zannichellia_palustris_YI1473 ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE Character_Matrix; DIMENSIONS NCHAR=4439; FORMAT DATATYPE = DNA INTERLEAVE GAP = - MISSING = ?; MATRIX Zostera_marina_YI1983 TAAAAATGGAACATCTTGCTGTAGTTTTTTGTAATTATTTTCAGAAAAACTTA??????CAATTGCTCAAAGATCCTTTCATGCATTATGTTAGATATCAAGGAAAATCCATTATGGCTTCAAAGGGAACTCATCTTATAATGAAGAAATGGAAATATCACCTTGTTTTTTTTTGGCAATGTCATTTTTATTTTTGGTCTCAACCATATAGAATTCATATAAATCCATTAGCAAATAACTCTTTTTATTTTCTGGGTTACTTTTTAAGTGTATTAATAAATCCTTTAATAGTAAGTAGTAAAATCTTAGAGTCTTGTTTTCTAATAGATACAGTTATTAAAAAATTGGATATTATTGTTCCAATTATTCCTATCATTAGATCCTTGTCTAAAGCTAAGTTTTGTAATATATCTGGATATCCTATTAGTAAGCCCATTTGGACCGATTTATCGGATTCTGCAATTATTGATCGGTTTGGTCGTATATGTAGAAACCTTTCTCATTATTATAGTGGGTCCTCAAAAAAACAGAGTTTGTATCGAATGAAGTATATACTTCGACTTTCCTGTGCTAGAACTTTGGCTCGTAAACATAAAACCACAGTACGCGCTTTTTTACAAAGATTGGGTTCAGGCTTTTTAGAAGAATTTTTTACAGAAGAAGAAAAA?????????????????????????????????????? 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Lepilaena_preissii_YI1082 AAAAGTAAAATTAGAGAAAAAGAAAGGATTGTATGGGAAATACTTCAAGAAGTTATGCAGGGACATCCTGTATTGCTGAATAGAGCGCCCACTCTGCATAGATTAGGAATACAGGCATTCCAACCCATTTTAGTGGAGGGACGCGCTATTTTTTTACACCCATTAGTTTGTAAGGGCTTTAATGCGGATTTTGATGGGGATCAAATGGCTGTTCATGTCCCTTTATCCTTGGAAGCTCAAGTGGAATGTGTGAATAACACGAGTTTTGATCAACAAGCGAAGGGTAGGAAGCTGTGGGGTTTGGTAGTTTGCCATAATGCAAATCCGAGATTTATCCCGTTTCCACTTAGGTATGCTTGTGAACTTCTGCTTCAAGTTTTTGGTATTCAACTGAACAAAGAGGTGGAATTGACTACTCAAAAAAGGGAGAAAAATATAATAAAAACACAAGCTTTTCTTTGCGACATGCTTCTCAGAGACTCACCTGTAGGGATATTTACTCAAACTCTTAATGTTATGGTTCTAGTGAAGTTTGATGGTGCTGCCCTATATTATAGAAACCAATTTTGGTTATTTGGTATAACACCTACTAAGATGCAGATAAAAGAGTTGACCAGGTGGCTTCTGGAATATCATAATGGCACTACCGGATTAAGTACTGATAGCATTTCAGAGGCAGGTTGTCCAGGTGCACAAGTGTTGGGAG Pseudalthenia_aschersoniana_YI1981 AAAAGTAAAATTAGAGAAAAAGAACGAGTTGTATGGGAAATACTTCAAGAAGTTATGCAGGGACATCCCGTATTGCTGAATAGAGCACCCACTCTGCATAGATTAGGAATACAGGCATTCCAACCCATTTTAGTGGAGGGACGCGCTATTTGTTTACATCCATTAGTTTGTAAGGGCTTTAATGCAGATTTTGATGGGGATCAAATGGCTGTTCATGTCCCTTTATCCTTGGAAGCTCAAGCGGAGAATGTGAATGAGGCAGGGTCTGATCAACAACCAAAGGGTAGGAAGCTCTGGGGTTTGGTAGTCTGCCATCATTCAACTCCAAGGTTTGTCCCCTTTCCTCTTAGATATGCTTGTGAATTTCTGCTTCAAGTTTTTGGTATACAACTAAACAAGGAAGTGGAATTGGCTGCTCAAACAAGGGAGAAAAATATAATAAAGACGCAAGCTTTTCTTTGCGACGTACTTCTCAGAGATTCACCTGTAGGGATATTTACTCAAACTCCAAATGTTATGGATCTAGTAAAGTGTGATGGTGCTGCACTATATTTTAGAAACGAGTTTTGGTTGCTTGGGGTAACACCTACTAGGATACAAATAAAAGAGATGGCTAGATGGCTTCTGGAGTATCATGATGGCACCACTGGATTAAGTACGGATAGCATTTCAGAGGCAGGTTGTCCAGGTGCACAAGTTCTGGGAG Zannichellia_peltata_YI1470 AAAAGTAAAATTAGAGAAAAAGAACGAATTGTATGGGAAATACTTCAAGAAGTTATGCAGGGACATCCTGTATTGCTGAATAGAGCACCCACTCTGCATAGATTAGGAATACAGGCATTCCAACCCATTTTAGTGGAGGGACGCGCTATTTGTTTACATCCATTAGTTTGTAAGGGCTTTAATGCAGATTTTGATGGGGATCAAATGGCTGTTCATGTCCCTTTATCCTTGGAAGCTCAAGCGGAGAACGAGAATGAGGCAGGGTCTGATCAACCACCAAAGGGTAGGAAGCTCTGGGGTTTGGTAGTTTGCCATCATTCAACTCCGAGGTTTGTCCCCTTTCCTCTTAGGTATGCTTGTGAATTTCTTCTTCAAGTTTTTGGTATACAACTGAACAAGGAAGTAGAATTAGCTGCTCAAACAAGGGAGAAAAATATAATAAAGACACAAGCTTTTCTTTGCGACGTACTTCTCAGAGATTCACCTGTAGGGATATTTACTCAAACTCCAAACGTTATGGATCTAGTAAAATGTGATGGTGCTGCACTATATTATAGAAACGAGTTTTGGTTACTTGGGGTAACACCCACTAGGATGCAAATAAAAGAGATGGCTAGATGGCTTCTGGAGTATCATGATGGCACCACTGGATTAAGTACGGATAGCATTTCAGAGGCAGGTTGTCCAGGTGCACAAGCGCTGGGAG Zannichellia_obtusifolia_YI1542 AAAAGTAAAATTAGAGAAAAAGAACGAATTGTATGGGAAATACTTCAAGAAGTTATGCAGGGACATCCTGTATTGCTGAATAGAGCACCCACTCTGCATAGATTAGGAATACAGGCATTCCAACCTATTTTAGTGGAGGGACGCGCTATTTGTTTACATCCATTAGTTTGTAAGGGCTTTAATGCAGATTTTGATGGGGATCAAATGGCTGTTCATGTCCCTTTATCCTTGGAAGCTCAAGCAGAGAATGAGAATGAGGCAGGGTCTGATCAACAACCAAAGGGTAGGAAGCTCTGGGGTTTGGTAGTTTGCCATCATTCAACTCCGAGGTTTGTCCCCTTTCCCCTTAGGTATGCTTGTGAATTTCTTCTTCAAGTTTTTGGTATACAACTGAACAAGGAAGTAGAATTGGCTGCTCAAACAAGGGAGAAAAATATAATAAAGACACAAGCTTTTCTTTGTGACGTGCTTCTCAGAGATTCACCTGTAGGAATATTTACTCAAACTCCAAACGTTATGGATCTAGTCAAATGTGATGGTGCTGCACTATATTATAGAAATGAGTTTTGGTTACTTGGGGTAACACCCACTAGGATGCAAATAAAAGAGATGGCTAGATGGCTTCTGGAGTATCATGATGGCACCACTGGATTAAGTACGGATAGCATTTCAGAGGCGGGTTGTCCAGGTGCACAAGCGCTGGGAG Zannichellia_pedunculata_YI1344 AAAAGTAAAATTAGAGAAAAAGAACGAATTGTATGGGAAATACTTCAAGAAGTTATGCAGGGACATCCTGTATTGCTGAATAGAGCACCCACTCTGCATAGATTAGGAATACAGGCATTCCAACCCATTTTAGTGGAGGGACGCGCTATTTGTTTACATCCATTAGTTTGTAAGGGCTTTAATGCGGATTTTGATGGGGATCAAATGGCTGTTCATGTCCCTTTATCCTTGGAAGCTCAAGCAGAGAATGAKAAKGWGGCAGGGTCTGATCAACAACCAAAGGGTAGGAAGCTMTGGGGTTTGGTAGTTTGCCATCATTCAACTCCGARGTTTGTCCCCTTTCCTCTTAGGTATGCTTGTGAATTTCTKCTTCAAGTTTTTGGTATACAACTSAACAAGGAAGTRGAATTGGCTGCTCAAACAAGGGAGAAAAATATAATAAAGACACAAGCTTTTCTTTGYGACGTACTTCTCAGAGATTCACCTGTAGGGATATTTACTCAAACTCCAAACRTTATGGATCTAGTAAARTGTGATGGTGCTGCACTATATTATAGAAAYGAGTTTTGGTTACTTGGGGTAACACCYACYAGGATRCAAATAAAAGAGATGGCTAGATGGCTTCTGGAGTATCATGAYGGCACCACTGGATTAAGTACRGATAGCATTTCAGAGGCAGGTTGTCCAGGTGCRCAAGYGCTGGGAR Zannichellia_palustris_YI1473 AAAAGTAAAATTAGAGAAAAAGAACGAATTGTATGGGAAATACTTCAAGAAGTTATGCAGGGACATCCTGTATTGCTGAATAGAGCACCCACTCTGCATAGATTAGGAATACAGGCATTCCAACCCATTTTAGTGGAGGGACGCGCTATTTGTTTACATCCATTAGTTTGTAAGGGCTTTAATGCGGATTTTGATGGGGATCAAATGGCTGTTCATGTCCCTTTATCCTTGGAAGCTCAAGCAGAGAATGAKAAKGWGGCAGGGTCTGATCAACAACCAAAGGGTAGGAAGCTMTGGGGTTTGGTAGTTTGCCATCATTCAACTCCGARGTTTGTCCCCTTTCCTCTTAGGTATGCTTGTGAATTTCTKCTTCAAGTTTTTGGTATACAACTSAACAAGGAAGTRGAATTGGCTGCTCAAACAAGGGAGAAAAATATAATAAAGACACAAGCTTTTCTTTGYGACGTACTTCTCAGAGATTCACCTGTAGGGATATTTACTCAAACTCCAAACRTTATGGATCTAGTAAARTGTGATGGTGCTGCACTATATTATAGAAAYGAGTTTTGGTTACTTGGGGTAACACCYACYAGGATRCAAATAAAAGAGATGGCTAGATGGCTTCTGGAGTATCATGAYGGCACCACTGGATTAAGTACRGATAGCATTTCAGAGGCAGGTTGTCCAGGTGCRCAAGYGCTGGGAR Zostera_marina_YI1983 ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Potamogeton_distinctus_YI1686 ATGCTGTCTGTGGTATGGCTGCTATCAAAATCACCAACAAGGACTTTATTTTCTGGTTTCGATCCCACACAGCAAAAGATATTAAATGGGGAGGAGCTAAAAATGATCCAACTGATATGAACATTGATAGCACGCAGATGCACCCACGTTCTTCATTCAACGCTTTCTTGGAAGTTGTCAAGCAACGGAGTCTTCCATGGGAA Althenia_filiformis_YI1977 ATGCTGTTTGTGGTATGGCTGCTGTCAAAATCACTGATAAGGACTTTATTTACTGGTTTCGATCACACACAGCAAAAGAGATTAAATGGGGAGGAGCTAAAAATGATCCAACTGATATGGACACTGATAACACACAGATGCACCCACGTTCTTCATTCAACGCTTTCCTAGAAGTCATCAAGCAAAGGAGTCTTCCATGGGAA Althenia_orientalis_YI1562 ATGCTGTTTGTGGTATGGCTGCTGTCAAAATCACTGATAAGGACTTTATTTACTGGTTTCGATCACACACAGCAAAAGAGATTAAATGGGGAGGAGCTAAAAATGATCCAACTGATATGGACACTGATAACACACAGATGCACCCACGTTCTTCATTCAACGCTTTCCTAGAA?????????????????????????????? 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Lepilaena_preissii_YI1082 ATGTTGTCTGTGGTATGGCTGCTGTCAGAATCACCGACAAGGACTTTATTTTCTGGTTTCGATCCCACACAGCAAAAGAGATTAAATGGGGAGGAGCTAAAAATGATCCAACTGATATAAACACTGATAGCACACAGATGCATCCACGTTCTTCATTCAAGACTTTCCTAGAGGTTGTCAAGCAAAGGAGCCTTCCATGGGAA Pseudalthenia_aschersoniana_YI1981 ATGCTGTCTGTGGTATGTCTGCTATCAAGATTACCAACAAGGACTTTATTTTCTGGTTTCGATCGCACACAGAAAAAGAAATTAAATGGGGAGGAGCTAAAAATGATCCAACAGATGTGAATACTGATAGCACACAAATGCATCCACGTTCTTCATTCAATGCTTTCCTGGAAGTTGTCAAGCAAAGGAGTCTTCCATGGGAA Zannichellia_peltata_YI1470 ATGCAGTCTGTGGTATGGCTGCTATCAAAATTACCAACAAGGACTTTATTTTCTGGTTTCGATCCCACACAGCAAAAGAAATTAAATGGGGAGGAGCTAAAAATGATCCAACTGATATGAATACTGACAGCACACAAATGCATCCACGTTCTTCATTCAATGCTTTCCTAGAAGTTGTCAAGCAAAGGAGTCTTCCATGGGAA Zannichellia_obtusifolia_YI1542 ATGCAGTCTGTGGTATGGCTGCTATCAAAATTACCAACAAGGACTTTATTTTCTGGTTTCGATCCCACACAGCGAAAGAAATTAAATGGGGAGGAGCTAAAAATGATCCAACTGATATGAATACTGATAGCACACAAATGCATCCACGTTCTTCATTCAATGCTTTCCTAGAAGTTGTCAAGCAAAGGAGTCTTCCATGGGAA Zannichellia_pedunculata_YI1344 ATGYWGTCTGTGGTWTGGCTGCTATCAAAATTACCAACAAGGACTTTATYTTYTGGTTTCGATCCCACACAGCAAAAGAAATTAAATGGGGAGGAGCTAAAAATGATCCAACTGATATGAATACTGATAGCACACARATGCATCCACGYTCTTCATTCAATGCTTTCCTRGAAGTTGTCAAGC???????????????????? 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