NEXUS
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[Matrix accession#: M3395]

BEGIN TAXA;
	TITLE M3395;
	DIMENSIONS  NTAX=6;
	TAXLABELS
		Mucor_racemosus	Mucor_hiemalis	Poitrasia_circinans	Gilbertella_persicaria	Choanephora_cucurbitarum	Blakeslea_trispora
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M3395;
	DIMENSIONS NCHAR=1095;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = - ;
	MATRIX
		Mucor_racemosus                GGTAAGTCCACCACCACTGGTCACTTGATTTACAAGTGTGGTGGTATCGATAAGCGTACCATCGAAAAGTTCGAGAAGGAAGCTGCTGAACTCGGTAAGGGTTCTTTCAAGTACGCTTGGGTCCTTGATAAACTTAAGGCTGAACGTGAGCGTGGTATCACCATTGATATTGCTCTCTGGAAGTTCGAGACCCCCAAGTACAACGTTACCGTTATTGATGCTCCCGGTCATCGTGATTTCATCAAGAACATGATTACTGGTACTTCTCAAGCTGATTGTGCTATTCTTATCATTGCTGGTGGTACTGGTGAATTCGAAGCTGGTATTTCCAAGGATGGTCAAACCCGTGAGCACGCTCTTCTTGCTTTCACCTTGGGTGTCCGTCAATTGATTGTTGCTATCAACAAGATGGATACCACCAAGTGGTCTCAAGCTCGTTACGAAGAAATCGTCAAGGAAGTTTCCAGTTTCATCAAGAAGATTGGTTTCAACCCCAAGTCTGTTCCTTTCGTCCCCATTTCCGGATGGCACGGTGATAACATGTTGGATGAATCCAACAACATGCCTTGGTTCAAGGGATGGAACAAGGAGACTAAGGCCGGTTCCAAGACTGGTAAGACTCTTCTTGAAGCTATTGATGCTATTGAGCCCCCTGTCCGTCCTTCTGACAAGCCTCTCCGTCTTCCTCTTCAAGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGTACAGTTCCCGTCGGTCGTGTCGAAACTGGTGTTATCAAGGCTGGTATGGTTGTTAACTTTGCCCCTGCTGCTGTCACCACTGAAGTCAAGTCCGTTGAAATGCATCACGAAACCCTCACTGAAGGTCTCCCCGGAGACAACGTTGGTTTCAACGTCAAGAACGTCTCCGTCAAGGATATCCGTCGTGGTAACGTCTGTTCCGACTCCAAGAACGATCCCGCTAAGGAATCTGGTTCTTTCCTCGCTCAAGTTATTATCTTGAACCATCCCGGTCAAATCTCTGCTGGTTACGCACCAGTTCTCGATTGTCACACTGCTCACATCGCCTGTAAGTTCTCTGAACTCGTTGAGAAGATTGATCGTCGTTCCGGTAAG
		Mucor_hiemalis                 GGTAAGTCCACCACTACCGGTCACTTGATTTACAAGTGTGGTGGTATTGATAAGCGTACTATCGAAAAGTTCGAGAAGGAAGCTGCTGAACTCGGTAAGGGTTCTTTCAAGTACGCCTGGGTCCTCGATAAGCTTAAGGCTGAACGTGAAAGAGGTATCACCATTGATATTGCTCTCTGGAAGTTCGAAACCCCCAAGTTCAACGTCACCGTTATTGATGCTCCCGGTCATCGTGATTTCATCAAGAACATGATTACTGGTACTTCTCAAGCTGATTGTGCTATTCTTATTATTGCCGGTGGTACTGGTGAATTCGAAGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAAACTCGTGAACACGCTCTTCTTGCCTTCACCTTGGGTGTCCGTCAATTGATTGTTGCTATTAACAAGATGGATACCACCAAGTGGTCCGAATCTCGTTACACTGAAATCGTCAAGGAAGTCTCTTCTTTCATCAAGAAGATTGGTTTCAACCCCAAGTCTGTTCCTTTCGTCCCCATCTCCGGATGGCACGGTGATAACATGTTGGAAGAATCCAAGAACATGGGTTGGTTCAAGGGATGGAACAAGGAAACTAAGGCCGGTTCCAAGACTGGTAAGACTCTCCTCGAAGCCATCGATGCTATCGAACCCCCTACCCGTCCTTCTGACAAGCCTCTCCGTCTTCCCCTCCAAGATGTCTACAAGATTGGTGGTATTGGTACAGTGCCCGTTGGTCGTGTCGAAACTGGTGTCATCAAGGCTGGTATGGTTGTTAACTTTGCCCCTGCTGCTGTTACCACTGAAGTCAAGTCCGTTGAAATGCATCACGAAACTTTGACTGAAGGTCTTCCTGGAGATAACGTTGGTTTCAACGTCAAGAACGTCTCCGTCAAGGATATCCGTCGTGGTAACGTCTGTTCCGACTCCAAGAACGACCCCGCTAAGGAATCTGGTTCTTTCCTCGCTCAAGTTATTATCTTGAACCATCCCGGTCAAATCTCTGCTGGTTACGCACCAGTCCTCGATTGTCACACTGCTCACATCGCCTGTAAGTTCGCTGAACTCGTTGAGAAGATTGATCGTCGTTCCGGTAAG
		Poitrasia_circinans            GGTAAGTCTACCACCACTGGTCACTTGATTTACAAGTGTGGTGGTATTGACAAGCGTACCATTGAAAAGTTCGAGAAGGAAGCCGCTGAACTCGGTAAGGGTTCCTTCAAGTACGCCTGGGTTCTTGACAAGCTTAAGGCCGAACGTGAAAGAGGTATCACCATCGATATTGCTCTCTGGAAGTTCGAAACCCCCAAGTACCACGTTACCGTTATTGATGCTCCCGGTCACCGTGATTTCATCAAGAACATGATTACCGGTACTTCTCAAGCCGATTGTGCTATTCTTATCATTGCTGGTGGTACTGGTGAATTCGAAGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAAACCCGTGAACACGCTCTTCTTGCCTTCACCTTGGGTGTCCGTCAATTGATTGTTGCTATCAACAAGATGGATACCACCAAGTGGTCCGAAGCCCGTTACACTGAAATCGTCAAGGAAGTCTCCTCTTTCATCAAGAAGATCGGTTTCAACCCCAAGGCTGTTCCCTTCGTCCCCATTTCTGGCTGGCACGGTGATAACATGTTGGAAGAATCTACCAACATGCCCTGGTTCAAGGGATGGAAGAAGGAAACCAAGGCTGGTGAAAAGTCTGGTAAGACCCTCCTCGAAGCCATTGATGCCATCGAACCCCCTGTTCGTCCTTCCGACAAGCCTCTCCGTCTTCCCCTCCAAGATGTCTACAAGATCGGTGGTATCGGTACTGTTCCCGTTGGTCGTGTTGAAACTGGTGTTATCAAGGCTGGTATGGTTGTCACTTTCGCTCCTGCTGCTGTCACCACTGAAGTTAAGTCCGTCGAAATGCACCACGAAACCCTCACTGAAGGTCTCCCCGGTGACAACGTCGGTTTCAACGTCAAGAACGTTTCCGTCAAGGATATCCGTCGTGGTAACGTCTGTCCTGACTCCAAGAACGACCCCGCCAAGGAAGCCGGTTCTTTCACTGCTCAAGTTATTATCTTGAACCACCCTGGTCAAATTGGTGCTGGTTACGCTCCTGTCCTCGATTGTCACACTGCTCACATCGCCTGTAAGTTCTCTGAACTTATTGAAAAGATTGACCGTCGTTCTGGTAAG
		Gilbertella_persicaria         GGTAAGTCCACCACCACTGGTCACTTGATTTACAAGTGTGGTGGTATTGACAAGCGTACCATCGAAAAGTTCGAAAAGGAAGCCGCTGAACTCGGTAAGGGTTCCTTCAAGTACGCTTGGGTTCTCGATAAGCTCAAGGCCGAACGTGAAAGAGGTATCACCATCGATATTGCTCTCTGGAAGTTCGAAACCCCCAAGTACCACGTTACTGTTATTGATGCTCCCGGTCACCGTGATTTCATCAAGAACATGATTACTGGTACCTCTCAAGCCGATTGTGCTATTCTTATCATTGCTGGTGGTACTGGTGAATTCGAAGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAAACCCGTGAACACGCTCTTCTTGCCTTCACCTTGGGTGTCCGTCAATTGATCGTTGCTATCAACAAGATGGATACCACCAAGTGGTCCGAAGCCCGTTACAACGAAATCGTCAAGGAAGTCTCTTCTTTCATCAAGAAGATTGGTTTCAACCCCAAGGCTGTTCCCTTCGTCCCCATCTCTGGCTGGCACGGTGATAACATGTTGGATGAATCTACCAACATGCCCTGGTTCAAGGGATGGAACAAGGAAACCAAGGCTGGTGCCAAGACTGGTAAGACCCTTCTTGAAGCCATTGATGCCATCGAACCCCCTGTTCGTCCTTCTGACAAGCCTCTTCGTCTTCCCCTCCAAGATGTCTACAAGATCGGTGGTATCGGTACTGTGCCCGTTGGTCGTGTTGAAACTGGTGTTATCAAGGCTGGTATGGTTGTCACTTTCGCTCCTGCTGCTGTCACCACTGAAGTTAAGTCCGTCGAAATGCACCACGAAACCCTCACTGAAGGTCTTCCCGGTGACAACGTCGGTTTCAACGTCAAGAACGTTTCCGTCAAGGATATCCGTCGTGGTAACGTCTGCTCTGACTCCAAGAACGACCCCGCCAAGGAAGCCGGTTCTTTCACTGCTCAAGTTATCATCTTGAACCACCCTGGTCAAATTGGTGCTGGTTACGCTCCCGTTCTCGATTGTCACACCGCCCACATTGCCTGTAAGTTCGCTGAATTGATCGAAAAGATCGATCGTCGTTCCGGTAAG
		Choanephora_cucurbitarum       GGTAAATCTACCACCACTGGTCACTTGATTTACAAGTGTGGTGGTATTGACAAGCGTACCATTGAAAAGTTCGAAAAGGAAGCCGCTGAACTCGGTAAGGGTTCCTTCAAGTACGCCTGGGTTCTTGACAAGCTTAAGGCTGAACGTGAAAGAGGTATCACCATCGATATTGCTCTCTGGAAGTTCGAAACCCCCAAGTACCACGTTACCGTCATTGATGCTCCCGGTCACCGTGATTTCATCAAGAACATGATTACCGGTACTTCTCAAGCCGATTGTGCTATTCTTATCATTGCTGGTGGTACTGGTGAATTCGAAGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAAACCCGTGAACACGCTCTTCTTGCCTTCACCTTGGGTGTCCGTCAATTGATCGTTGCTATCAACAAGATGGATACCACCAAGTGGTCCGAAGCCCGTTACACTGAAATCGTCAAGGAAGTCTCCTCCTTCATCAAGAAGATCGGTTTCAACCCCAAGGCTGTCCCCTTCGTCCCCATTTCTGGCTGGCACGGTGACAACATGTTGGATGAATCTACCAACATGCCCTGGTTCAAGGGATGGAAGAAGGAAACCAAGGCTGGTGAAAAGACCGGTAAGACTCTCCTCGAAGCCATCGATGCCATCGAACCCCCTGTTCGTCCTTCCGACAAGCCTCTCCGTCTTCCCCTCCAAGATGTCTACAAGATCGGTGGTATCGGTACTGTTCCCGTTGGTCGTGTTGAAACTGGTGTTATCAAGGCTGGTATGGTTGTCACTTTCGCTCCTGCTGCCGTCACCACTGAAGTTAAGTCCGTCGAAATGCACCACGAAACCCTCACTGAAGGTCTCCCCGGTGACAACGTCGGTTTCAACGTCAAGAACGTTTCCGTCAAGGATATCCGTCGTGGTAACGTCTGTTCCGACTCCAAGAATGACCCCGCCAAGGAAGCCGGTTCTTTCACTGCTCAAGTTATTATCTTGAACCACCCCGGTCAAATTGGTGCTGGTTACGCTCCTGTCCTCGATTGTCACACTGCTCACATCGCCTGTAAGTTCTCTGAATTGATTGAAAAGATTGACCGTCGTTCTGGTAAG
		Blakeslea_trispora             GGTAAGTCTACCACCACTGGTCACTTGATTTACAAGTGTGGTGGTATTGACAAGCGTACCATTGAAAAGTTCGAAAAGGAAGCCGCTGAACTCGGTAAGGGTTCCTTCAAGTACGCCTGGGTTCTTGACAAGCTCAAGGCTGAACGTGAAAGAGGTATCACCATCGATATTGCTCTCTGGAAGTTCGAAACCCCCAAGTACCACGTTACCGTTATTGATGCTCCCGGTCACCGTGATTTCATCAAGAACATGATTACTGGTACTTCTCAAGCCGATTGTGCTATTCTTATCATTGCTGGTGGTACTGGTGAATTCGAAGCTGGTATCTCCAAGGATGGTCAAACCCGTGAACACGCTCTTCTTGCCTTCACCTTGGGTGTCCGTCAATTGATTGTTGCTATCAACAAGATGGATACCACCAAGTGGTCCGAAGCCCGTTACACTGAAATCGTCAAGGAAGTCTCTTCCTTCATCAAGAAGATTGGTTTCAACCCCAAGGCTGTTCCCTTCGTCCCCATTTCTGGCTGGCACGGTGATAACATGTTGGAAGAATCTACCAACATGCCCTGGTTCAAGGGATGGAAGAAGGAAACCAAGGCTGGTGAAAAGTCTGGTAAGACTCTCCTCGAAGCCATCGATGCTATTGAACCCCCTGTTCGTCCTTCCGACAAGCCTCTCCGTCTTCCCCTCCAAGATGTCTACAAGATCGGTGGTATCGGTACTGTTCCCGTTGGTCGTGTTGAAACTGGTGTTATCAAGGCTGGTATGGTTGTCACTTTCGCTCCTGCTGCTGTCACCACTGAAGTTAAGTCCGTCGAAATGCACCACGAAACCCTCACTGAAGGTCTCCCCGGTGACAACGTCGGTTTCAACGTCAAGAACGTTTCCGTCAAGGATATCCGTCGTGGTAACGTCTGTTCCGACTCCAAGAACGACCCCGCCAAGGAAGCCGGTTCTTTCACTGCTCAAGTTATTATCTTGAACCACCCTGGTCAAATTGGTGCTGGTTACGCTCCTGTCCTCGATTGTCACACTGCTCACATCGCCTGTAAGTTCTCTGAATTGATCGAAAAGATTGACCGTCGTTCTGGTAAG
	;
END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions = 
 N: 1 - 1095 ; 
 CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 END;