#NEXUS BEGIN DATA; DIMENSIONS NTAX=33 NCHAR=258; FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING = ?; MATRIX Acer_cappadocicum_sinicum TCATAATGGAA-GAACAGATACTTTGCC-TTATCCCA-AG?AAGCTAGCTCCTTCTACCATCTTAGTAAGGTTCATGACTCGAATAACATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATCTGAATCAAGGAGTGGTTTATGGAGTTACAACAGAA-GAGACAGCTATGCATGAAGAGCTTTGTAATAGGCTCGATTACGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTTCAAGCTGCTG Acer_palmatum TCATAATGGAA-GAACAGATACTTTGCC-TTATCCCA-AGCAAGCTAGCTCCTTCTACCATCTTAGTAAGGTTCATGACTCGAATAACATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATCTGAATCAAGGAGTGGTTTATGGAGTTACAACAGAA-GAGACAGCTATGCATGAAGAGCTTTGTAATAGGCTCGATTACGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTTCAAGCTGCTG Acer_sacharinum TCATAATGGAGAGAACAGATACTTTGCC-TTATCCCA-AGCAAGCTAGCTCCTTCTACCATCTTAGTAAGGTTCACGACTCGAATAACATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCGACTGATCTGAATCAAGGAGTGGTTTACGGAGTTACGACAG-AAGAGACAGCTATGCATGAAGAGCTTTGTAATAGGCTCGATTATGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTTCAAGCTGCTG Acer_triflorum TCATAATGGAA-GAACAGATACTTTGCCATTATCCCA-AGCAAGCTAGCTCCTTCTACCATCTTAGTAAGGTTCATGACTCAAATAACATAGCCTTCACTTGCAAAGCTTGGGGAATCAGAGCGACTGATCTGAATCAAGGAGTGGTTTATGGAGTTACGACAG-AAGAGACAGCTATGCATGAAGAGCTTTGTAATAGGCTCGATTACGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTTCAAGCTGCTG Aesculus_californica TCATAATGGCA-GAACAGATACTTTACC-TTATCCCA-AGCAAGCCAGTTCCTTCTACCATCTGAGTAAGGTTCATGACTCGAATAACATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATTTGAATCAAGGAGTGGTTTACGGAGTTATGACAG-ATGAGACAGCTATGCATGAAGAGCTTTGTAATAGGTTCGATTACGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTTCAAGCTGCTG Aesculus_chinensis_1 TCATAATGGAA-GAACAGATACTTTACC-TTATCCCA-AGCAAGCCAGTTCCTTCTACCATCTGAGTAAGGTTCATGACTCGAATAACATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATTTGAATCAAGGAGTGGTTTACGGAGTYACGACAG-ATGAGACAGCTATGCATGAAGAGCTTTGTAATAGGTTCGATTACGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTTCAAGCTGCTG Aesculus_chinensis_2 TCATAATGGAA-GAACAGATACTTTACC-TTATCCCGAAGCAAGCCAGTTCCTTCTACCATCTGAGTAAGGTTCATGACTCGAATAACATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATTTGAATCAAGGAGTGGTTTACGGAGTTACGACAG-ATGAGACAGCTATGCATGAAGAGCTTTGTAATAGGTTCGATTACGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTTC????????? Aesculus_flava_1 TCATAATGGAA-GAACAGATACTTTACC-TTATCCCA-AGCAAGCCAGTTCCTTCTACCATCTGAGTAAGGTTCATGACTCGAATAATATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATTTGAATCAAGGAGTGGTTTACGGAGTTACGACAG-ATGAGACAGCTATGCATGAAGAGCTTTGTAATAGGTTCGATTACGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTTCAAGCTGCTG Aesculus_flava_2 TCATAATGGAA-GAACAGATACTTTACC-TTATCCCA-AGCAAGCCAGTTCCTTCTACCATCTGAGTAAGGTTCATGACTCGAATAACATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATTTGAATCAAGGAGTGGTTTACGGAGTTACGACAG-ATGAGACAGCTATGCATGAAGAGCTTTGTAATAGGTTCGATTACGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTKCAAGCTGCTG Aesculus_glabra_arguta_1 TCATAATGGAA-GAACAGATACTTTACC-TTATCCCA-AGCAAGCCAGTTCCTTCTACCATCTGAGTAAGGTTCATGACTCGAATAATATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATTTGAATCAAGGAGTGGTTTACGGAATTACGACAG-ATGAGACAGCTATGCATGAAGAGCTTTGTAATATGTTTGATTACKATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTTCC-GCTGCTG Aesculus_glabra_arguta_2 TCATAATGGAA-GAACAGATACTTTACC-TTATCCCA-AGCAAGCCAGTTCCTTCTACCATCTGAGTAAGGTTCATGACTCGAATAATATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATTTGAATCAAGGAGTGGTTTACGGAGTTACGACAG-ATGAGACAGCTATGCATGAAGAGCTTTGTAATAGGTTCGATTACGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTTCAAGCTGCTG Aesculus_hippocastanum TCATAATGGAA-GAACAGATACTTTACC-TTATCCCA-AGCAAGCCAGTTCCTTCTACCATCTGAGTAAGGTTCATGACTCAAATAACATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATTTGAATCAAGGAGTGGTTTACGGAGTTACGACAG-ATGAGACAGGTATGCATGAAGAGCTATGTAACAGGTTTGATTACGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTTCAAGCTGCTG Aesculus_indica TCATAATGGAA-GAACAGATACTTTACC-TTATCCCA-AGCAAGCCAGTTCCTTCTACCATCTGAGTAAGGTTCATGACTCGAATAACATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATTTGAATCAAGGAGTGGTTTACGGAGTTACGACAG-ATGAGACAGCTATGCATGAAGAGCTTTGTAATAGGTTCGATTACGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTTCAAGCTG??? Aesculus_parryi TCATAATGGAA-GAACAGATACTTTACC-TTATCCCA-AGCAAGCCAGTTCCTTCTACCATCTGAGTAAGGTTCATGACTCGAATAACATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATTTGAATCAAGGAGTGGTTTACGGAGTTACGACAG-ATGAGACAGCTATGCATGAAGAGCTTTGTAATAGGTTCGATTACGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTTCAAGCTGCTG Aesculus_parviflora_1 TCATAATGGAA-GAACAGATACCTTACC-TTATCCCA-AGCAAGCCAGTTCCTTCTACCATCTGAGTAAGGTTCATGACTCGAATAACATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATTTGAATCAAGGAGTGGTTTACGGACTTACGACAG-ATGAGACAGCTATGCATGAAGAACTTTGTAATAGGTTCGATTACGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTTCAAGCTGCTG Aesculus_parviflora_2 TCATAATGGAA-GAACAGATACCTTACC-TTATCCCA-AGCAAGCCAGTTCCTTCTACCATCTGAGTAAGGTTCATGACTCGAATAACATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATTTGAATCAAGGAGTGGTTTACGGACTTACGACAG-ATGAGACAGCTATGCATGAAGAGCTTTGTAATAGGTTCGATTACGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGT??????????? Aesculus_pavia_flavescens_1 TCATAATGGAA-GAACAGATACTTTACC-TTATCCCA-AGCAAGCCAGTTCCTTCTACCATCTGAGTAAGGTTCATGACTCGAATAATATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATTTGAATCAAGGAGTGGTTTACGGAATTACGACAG-ATGAGACAGCTATGCATGAAGAGCTTTGTAATAGGTTTGATTACGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTTCAAGCTGCTG Aesculus_pavia_flavescens_2 TCATAATGGAA-GAACAGATACTTTACC-TTATCCCA-AGCAAGCCAGTTCCTTCTACCATCTGAGTAAGGTTCATGACTCGAATAATATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATTTGAATCAAGGAGTGGTTTACGGAGTTACGACAG-ATGAGACAGCTATGCATGAAGAGCTTTGTAATAGGTTCGATTACGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTTCAAGCTGCTG Aesculus_pavia_pavia_1 TCATAATGGAA-GAACAGATACTTTACC-TTATCCCA-AGCAAGCCAGTTCCTTCTACCATCTGAGTAAGGTTCATGACTCGAATAATATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATTTGAATCAAGGAGTGGTTTACGGAGTTACGACAG-ATGAGACAGCTATGCATGAAGAGCTTTGTAATAGGTTCGATTACGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTTCAAG?????? Aesculus_pavia_pavia_2 TCATAATGGAA-GAACAGATACTTTACC-TTATCCCA-AGCAAGCCAGTTCCTTCTACCATCTGAGTAAGGTTCATGACTCGAATAATATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCARAGCCACTGATTTGAATCAAGGAGTGGTTTACGGAGTTACGACAG-ATGAGACAGCTATGCATGAAGAGCTTTGTAATAGGTTCGATTACRATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTTCAAGCTGCTG Aesculus_sylvatica_1 TCATAATGGAA-GAACAGATACTTTACC-TTATCCCA-AGCAAGCCAGTTCCTTCTACCATCTGAGTAAGGTTCATGACTCGAATAATATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATTTGAATCAAGGAGTGGTTTACGGAGTTACGACAG-ATGAGACAGCTATGCATGAAGAGCTTTGTAATAGGTTCGATTACGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTTCAAGCTGCTG Aesculus_sylvatica_2 TCATAATGGAA-GAACAGATACTTTACC-TTATCCCA-AGCAAGCCAGTTCCTTCTACCATCTGAGTAAGGTTCATGACTCGAATAATATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATTTGAATCAAGGAGTGGTTTACGGAGTTACGACAG-ATGAGACAGCTATGCATGAAGAGCTTTGTAATAGGTTCGATTACGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTTCAAGCTGCTG Aesculus_turbinata TCATAATGGAA-GAACAGATACTTTACC-TTATCCCA-AGCAAGCCAGTTCCTTCTACCATCTGAGTAAGGTTCATGACTCAAATAACATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATTTGAATCAAGGAGTGGTTTACGGAGTTACGACAG-ATGAGACAGGTATGCATGAAGAGCTATGTAACAGGTTTGATTACGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGKGTTCA???????? Aesculus_wangii TCATAATGGAA-GAACAGATACTTTACC-TTATCCCA-AGCAAGCCAGTTCCTTCTACCATCTGAGTAAGGTTCATGACTCGAATAACATTGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATTTGAATCAAGGAGTGGTTTACGGAGTTACGACAG-ATGARACAGCTATGCATGAAGAGCTTTGTAATAGGTTCGATTACGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTTCAAGCTGCTG Aesculus_wilsonii_1 TCATAATGGAA-GAACAGATACTTTACC-TTATCCCA-AGCAAGCCAGTTCCTTCTACCATCTGAGTAAGGTTCATGACTCGAATAACATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATTTGAATCAAGGAGTGGTTTACGGAGTTACGACAG-ATGAGACAGCTATGCATGAAGAGCTTTGTAATAGGTTCGATTACGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTTCAAGCTGCTG Aesculus_wilsonii_2 TCATAATGGAA-GAACAGATACTTTACC-TTATCCCA-AGCAAGCCAGTTCCTTCTACCATCTGAGTAAGGTTCATGACTCGAATAACATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATTTGAATCAAGGAGTGGTTTACGGAGTTACGACAG-ATGAGACAGCTATGCATGAAGAGCTTTGTAATAGGTTCGATTACGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTTCAAGCTGC?? Billia_rosea_1 ?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????? Billia_hippocastanum_3 TCATAATGGAA-GAACAGACACTTTACC-TTACCCCA-AG?AAGCCAGTTCCTTCTACCATCTGAGTAAGGTTCATGACTCAAATAACATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATTTGAATCAAGGAGTGGTTTATGGAGTTACGACAG-ATGAGACAGCTATGCATGAAGAGCTTTGTAATAGGCTCGATTACGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTKCAAGCTGCTG Billia_hippocastanum_4 ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGACTCGAATAAAATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATTTGAATCAAGGAGTGGTTTACGGAGTTACGACAG-A?GAGACAGCTATGCATGAAGAGCTTTGTAATAGGCTCGATTACGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTTCAAGCTGCTG Handeliodendron_bodineri_1 ???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????RACWT-ATGASACAGCTAKGCYTGAAGAGCTTTGWAATAWGTTCYATTACKATGGARTGWTCKKKACTGCATTGAATCSKTTCTGTGTKCRAGCTGCTG Handeliodendron_bodineri_2 ????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ACAT-ATGASACAGCTAKGCYTGAAGAGCTTTGWAAWAAGWTCYATTACKATGGAGTGWTCGGGACTGCATTG????????????????????????? Keureulteria_bipinnata ?????????AA-GAACAGATACTTTACC-TTATCCCA-AGCAAGCCAGCTCTTTCTACCATCTGAGTAAGGTTCATGACTCGAATAACATAGCCTTCACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATCTGAATCAAGGAGTCGTTTATGGAGTTAGAACAG-ATGAGACAGCTATGCATGAGGAGCTCTGTAATAGGCTTGATTATGATGGAGTGTTTGGGACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTTCAAGCTGCTG Sapindus_sp TCATAATGGAA-GGACAGATACTTTGCC-ATATCCCA-AGCAAGCAAGCTCTTTCTACCATCTGAGTAAGGTTCATGATTCGAACAATATAGCCTTTACTTGCAAGGCTTGGGGAATCAGAGCCACTGATCTGAATCAAGGAGTTGTTTATGGAGTTAGAACAG-ATGAGACAGCTATGCATGAAGAGCTTTGTAATAGGTTCGATTATGATGGAGTGTTTGGAACTGCATTGAATCGGTTCTGTGTTCAAGCTGCTG ; END; BEGIN mrbayes; Lset nst=1 rates=invgamma Ngammacat=10; prset statefreqpr=fixed(equal) shapepr = uniform ( 0.1 , 50 ) pinvarpr = uniform ( 0 , 1 ); mcmc stoprule=no ngen=15000000 nruns=2 printfreq=500 samplefreq=5000 diagnfreq=5000 nchains=12 savebrlens=yes; ; End;