NEXUS [File created by TreeBASE: 1/16/09 15:32:02] [Matrix accession#: M3555] BEGIN TAXA; TITLE M3555; DIMENSIONS NTAX=182; TAXLABELS Cuscuta_aurea Cuscuta_aristeguietae Cuscuta_applanata_850 Cuscuta_applanata_844 Cuscuta_applanata_674 Cuscuta_applanata_535 Cuscuta_americana Cuscuta_aff._floribunda Cuscuta_acuta Cuacuta_cf._chilensis Cuscuta_micrantha_708_cl.2 Cuscuta_mcvaughii Cuscuta_macrocephala_731 Cuscuta_macrocephala_613 Cuscuta_lindsayi Cuscuta_liliputana_848 Cuscuta_liliputana_665 Cuscuta_liliputana_664_cl.2 Cuscuta_liliputana_664_cl.1 Cuscuta_leptantha_884 Cuscuta_leptantha_719 Cuscuta_leptantha_608 Cuscuta_kilimanjari Cuscuta_jalapensis_607 Cuscuta_jalapensis_606 Cuscuta_indecora_neuropeltata Cuscuta_indecora_longisepala Cuscuta_indecora_attenuata_723 Cuscuta_indecora_attenuata_721_724 Cuscuta_indecora_561_cl.4 Cuscuta_indecora_525 Cuscuta_incurvata Cuscuta_hyalina_840_cl.4_6_8 Cuscuta_hyalina_840_cl. 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TCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCGAAACCTTATGG--CAGAATGACT--TGTTAACTTG-TACCAATACAAGA----TTCTA--GT--GTCGGGG--CCAT-CTCTTGGGTTTGGCCACGCCGAAC--AAAAACACCGGC-GCAGCGGCGCCAAGGAATTT--CGT-AATGAGA--ATGCTGC-CTCGCAGAGCTCA-TCTCCGCT--GCTTGTGAGGTTGGCGTCTTTTT-------TATAATAA-TGACTCTCGGCAATGGATATCTCGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAAACTTTGAACGCAAGTTGCGCCTTAAGCCA-TTAGGTTGAGGGCACGTTTGCTTGGGTGTCAT--GCATAGT------GTCTT-CCCT----------CCCGTGT-TTTGGGTTGGGAGTGGATCGTGGCCTCCTGGGCCCATCC--TTGGG--TGTGGTTGGCCGAAAA-TATTGTCCGTGAT-TTTGTT----GATGTCTTGGCGTGCGGTGGA-TGTACAGAGTGTGCAT---AATGGCTTGCCCTGCTCGACTTC-ATTGTGGCGTTG---AGATCCTATGAAGCAGTCGGTGTTGGCTCTTTGATTGCGACCCCAAGTCAGGCGAGACTACCCGCTGAGTTT------ Cuscuta_salina_salina_652_653 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-----ACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCG-AACCCTCGCG-GTAGAATGACT--TGCTAACCTG-TACCAATTATTGA----TTCGA--GT--GTCGGGGTGCTGT-CTTTTTGATTTGCCCA-GACGAAC--AAAAACACCGGC-GCAGCAGCGCCAAGGAATAT--GAT-AACGAGT--GTGCAAC-CTTGCAGAGCTCA-ATTATGTT--GCCTGTGAGCTTCGCATCCTTTT-------AATAAAAA-TGACTCTCGGCAATGGATATCTCGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAAACTTTGAACGCAAGTTGCGCCTCAAGCCA-TTGGGTTGAGGGCACGTCTGCTTGGGTGTCAT--GCACTAT------TTCTT-CCCT----------CTCGTG--TGTGGAGTGGGAATAGATCCTGGCCTCCTGGGCCCTTCC--TTGGG--CGTGGTTGGCCGAAAA-TGTTGTCCTTGAT-TTTGTT----GATGTCTTGGTGAGCGGTGGA-TGTGCCAGGTGTGCAT---AGTTGCCAGCCTTGCTCGACTTC-ATTGTGGCGTTG---GGATCCTATGAAGCTGCCGGTTTTGGCTCTATGATTGCGACCCCAAGTCAGGCGAGACTACCCGCTGAGTTTAA---- Cuscuta_gymnocarpa --------------------------------AAGGATCATTGTCG-AACCCTCGCG-GTAGAATGACT--TGCTAACCTG-TACCAATTATTGA----TTCGA--AT--GTCTGGGTGCCGT-CTTTCTGATTTGCCCACGGCGAAC--AAAAACACCGGC-GCACCAGCGCCAAGGAATAT--AAT-AATGAGT--GTGCAAC-CTCGCAGAGCTTA-GTTATGCT--GCCTGTGAGCTTTGCATCCTTTT-------AATAAAAA-TGACTCTCGGCAATGGATATCTCGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGTACCGAAATGCGATACGTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAAACTTTGAACGCAAGTTGCGCCTCAAGCCA-TTCGGTTGAGGGCACGTATGCTTGGGTGTCAT--GCATTAT------GTCTC-CCCT----------CTCGTG--TGTGGAGTGGGAATAGATCCTGGCCTCCTGGGCCCTTCC--TTGGG--CGTGGTTGGCCGAAAA-TGTTGTCCTTGAT-TTTGTT----GATGTCTTGGTGTGCGGTGGA-TGCGCCAGGTGTGCAT---AGTTGCCAGCCTTGCTCGGCTTC-ATTGTGGCGTCG---GGATCCTATGAAGCTGCCGGTTTTGGCTCTTTGATTGCGACCCCAAGT------------------------------ Cuscuta_gronovii_latiflora_704 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---------------------TGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCG-AAACCTCGCG-GTAGAATGACG--TGCTAACTTG-TACCAATTATTGC----TTCGA--GT--GTCGGGGTGCTGT-CTTTTTGATTTGCCCA-GACAAA---AAAAACACCGGT-GCAGTAGCGCCAAGGAATAT--AAT-AATGAGT--GTGCAACTTTTGCAGGGCTCA-ATTTTGTG--GCCTGTGAGCTTTGCATCCTTTT-------AATAAAAA-TGACTCTCGGCAATGGATATCTTGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGTAGCAAAATGCGATACTTTGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAAACTTTGAACGCAAGTTGCGCCTCAAGCCA-TTGGGTTGAGGGCACGTCTGCTTGGGTGTCAT--GCATTAT------GTCTC-CCCT----------CTCGTG--TGTGGAGTGGGAATAGATCCTGGCCTCCTGGGCCCTTCC--TTGGG--TGTGGTTGGCCAAAAA-TGTTGTCCTTGAT-TTTGTT----GATGTCTTGGTGTGCGGTGGA-TGTGCCAGGTGTGCAT---AGTTGCCAGCCTTGCTTGACGTC-ATTGGGGCGTTT---GGATCCTATGAAGCTGCTGGTTTTGGCTCTTTGATTGCGACCCCAAGTCAGG-------------------------- Cuscuta_friesii 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----AACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCGAAACCTGCAA-AGCAGAATGACT--TGAGAACTTG-TA-AAAGTATAAAA---CTCTA--GT--GGTGGAT--CCAT-CTTTTGGGTCCAACCTCTACGAAC---AAAACCCCAGC-GTAGTAGCGCCAAGGAATTT--CAT-AATGAGA--ATG-TAG-CTTGCAAAGTGCTTTTTTAAGT--GTTTGTGTGGGTGGCATCTTTAC-------TTACAATA-TGACTCTCGGCAATGGATATCTCGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAATCTTTGAACGCAAGTTGCGCTTGAAGCCT-TTAGGCTGAGGGCACGTTTGCTTGGGTGTCAT--GCATTGT------GTCGT-CCCA----------CTCATGTGTTTTGAGTGGGAGTGGATCATGGCCTCTTGGGCCCATCC--TTGGG--TGTGGTTGGCCGAAAT-TCTTGTCCTTGATGATG-------AATGTCCTGGCGTGTGGTGGA-TGTACGAAGTGTGCAT---AATGGCGCGCCTTGCTCGGGTTC-GTTGTGGCGGTT---AGACCCTTGGAAGCTGATTGAGTTGGCTCTTTGAT-GCGACCCCAAGTCAAGCGGGACTACCCGCTGAGTTTAAGCA- Cuscuta_foetida_922 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---TAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCG-AACCCTCGCG-GTAGAATGACT--TGCCAACCTG-TACCAATTATTGA----TTCGA--GT--GTCGGGGTGCTGT-CTTTCTGATTTGCCCA-GACGAAC--AAAAACACCGGC-GCAGCAGCGCCAAGGAATAT--AAT-AATGAGT--GTGCAAC-CTTGCAGAGCTCA-ATTATGTT--GCCTGTGAGCTTCGCATCCTTTT-------AATAAAAA-TGACTCTCGGCAATGGATATCTCGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAAACTTTGAACGCAAGTTGCGCCTCAAGCCA-TTGGGTTGAGGGCACGTCTGCTTGGGTGTCAT--GCACTAT------GTCTC-CCCT----------CTCGTG--TGTGGAGTGGGAATAGATCCTGGCCTCCTGGGCCCTTCC--TTGGG--CGTGGTTGGCCGAAAA-TGTTGTCCTTGAT-TTTGTT----GATGTCTTGGTGAGCGGTGGA-TGTGCCAGGGGTGCAT---AGTTGCCAGCCTTGCTCGACTTC-ATTGTGGCGTTG---GGATCCTATGAAGCTGCCGTTTTTCGCTCTTTGATTGCGACCCCAAGTCAGGCGAGACTACCCGCTG----------- Cuscuta_polyanthemos_826_cl.7 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-----------------------AACCTGCGGAAGGATCATTGTCG-AACCCTCGCG-GTAGAATGACT--TGCCAACCTG-TACCAATTATTGA----TTCGA--GT--GTCGGGGTGCTGT-CTTTCTGATTTGCCCA-GACGAAC--AAAAACACCGGC-GCAGCAGCGCCAAGGAATAT--AAT-AATGAGT--GTGCAAC-CTTGCAGAGCTCA-ATTATGTT--GCCTGTGAGCTTCGCATCCTTTT-------AATAAAAA-TGACTCTCGGCAATGGATATCTCGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGTAGCGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGTGAACCATCGAAACTTTGAACGCAAGTTGCGCCTCAAGCCA-TTGGGTTGAGGGCWCGTCTGCTTGGGTGTCAT--GCACTAT------GTCTC-CCCT----------CTCGTG--TGTGGAGTGGGAATAGATCCTGGCCTCCTGGGCCCTTCC--TTGGG--CGTGGTTGGCCGAAAA-TGTTGTCCTGGAT-TTTGTT----GATGTCTTGGTGTGCGGTGGA-TGTGCCAGGGGTGCAT---AGTTGCCAGCCTTGCTCGACTTC-ATTGTGGCGTTG---GGATCCTATGAAGCTGCCGTTTTTTGCTCTTTGATTGCGAACCCAAGTCAGGCGAGACTACCCGCTGAGTTTAAGC-- Cuscuta_parviflora_elongata 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-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GTGGCCATGACGAAC--CCAAACAACGGC-GCAGCGGCGCCAAGGATTTT--TGT-AATGGGA--ATGCCAC-CTCGTAGAGTTCT-CTTGTGCA--GCTTTTGAGGTTGGCGTCTTTTC-------AATAAAAA-TGACTCTTGGCAATGGATATCTCGGCTCTTGCATCGATGAAGAACGTAGTGAAATGCGATACTTGGTGTGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAAACTTTGAACGCAAGTTGCGCCTCAAGCCA-CTAGGTTGAGGGCACGTTTGCTTGGGTGTCAT--GCATTAT------GTCTT-CCCT----------CTCGTGT-CTTGAAGTGGGAGTAGATCATGGCCTCCCGGGCCCGTCC--TCGGG--CGTGGTTGGCCGAAAG-TAATGTCCTTGACTTTTGTT----GATGTCTTGGCGTGTGGTGGA-TGTACCAAGTGTGCATGACAGTGGCCTGCCTTGCTTGACTTC-ATTGTGGGCTTG---AGATCCTATGAAGC---------------------------------------------------------------- Cuscuta_parodiana 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