NEXUS
[File created by TreeBASE:  1/16/09  15:32:15]
[Matrix accession#: M3568]

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	TITLE M3568;
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	TITLE M3568;
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		Cophosaurus_texanus_texanus                CAATTCCTCCCTATGACATTAGCCCTATGCCTATGACACACATCTTTACCAATTTCAACATTTAGCCTTCCACCTCAACAATAAAC--GGAAATGTGCCCGAATTATT-AAGGGTTACTTTGATAGAGTAAACAATAGAGGTTAAAATCCACTCATTTCCTTAGAAGAACAGGACTTGAACCCGCACACAAAGACTCAAAATCTTTAGTACTTCACTATACTACCTTCTACCAAAGTAAAGTCAGCTAACT-AAGCTATCGGGCCCATACCCCGAAAATGTTGGTTTAAACCCCTCCTTTACTAATGAGCCCAACGACAACAACCATCCTAATTTCAAGCCTGGCCACTGGTACAGTAATTGCATCCTCAAGCCACCACTGATTAATAGCCTGAATTGGACTAGAAATAAACACACTAGCTATTATTCCAATAATCTCAAAAAAACATCACCCACGAGCCACAGAAGCCGCAACAAAATATTTTCTAACACAAGCAGCCGCCTCAGCCACACTCCTATTCGCAAGCACTATTAATGCATGACAAACAGGAACCTGAGACATTACCAACATAACAAATCCAACTGCAAACATACTTTTCACTATAGCCATTGCAATAAAACTAGGGCTCGCACCAGTACACTTTTGACTTCCAGAAGTACTACAAGGATCAACCACAAAAACAGCCCTAATTATTACAACCTGACAAAAACTTGCCCCCATAGCCCTAATTTTATCTTCATCAAACAATATATCAACACCAGCCCTTTTAACAATAGGCATCATTTCAACTACCATTGGGGGATGAGCAGGACTTAACCAAACCCAAACCCGAAAAATCATGGCCTACTCATCAATCGCCCACCTAGGATGAATGGCCACAGTAGCCTCAATTATACCAAAAATTATGTTATTAAACTTAGTACTATATCTACTTATAACAACATCAATATTTTATACCTTAATTATTCTAAACTCCAAAAACATCAAAGACATAGCAACCTCACCAACCACCTCTTCAACAACCACTGCCACCGCAATGCTAGTGTTACTATCACTAGGGGGGCTCCCACCTCTAACAGGATTTATACCAAAATGACTTATTCTAGAGGAACTAATTATACAAGACTTAACCACAATAGCAACAATAATAGCTATGTCAGCATTATTAAGCCTTTTCTTCTACCTACGATTAGGCTACTCAACTACAATCACTCTAGCCCCAAACACAATAATAGTAAAACACAAATGACGGTTCAAACCCACTGACAACACACTCCTACTTTCACTAACACTGCCAGCATCACTATTAATATTACCCCTAACTCCAATAATACTA---TAGGAACTTAGGATAACTTTA-AACCAAGAACCTTCAAAGTTCTAAATAGGGGTTTAAACCCCCTAGCTCCTGC----CAGGACCTGCGAAACACTAAAACGCATCTTCTGAACGCAAATCAGACACTTTAATTAAGCTAAGGCCTCAA--CTAGATAGGCGGGCTTCGATCCCACGAAAACTTAATTAACAGCTAAGTACCCAATCCAGCGGGCTTCTATCCGCTT-CTCCCGCTCGTTTAAA-ACGGGAG-AAGCCCCGGGACCCTGTTG-GGTCCTTCTTCAAACTTGCATTTTGATGTGGAAA-ACACCTCAGGACTCT-ATGATAAAAAGAGGAGTTTAACCCCCGTGAGTAAGTCTACAGCCTACCGCCTGAACACTCGGCCACTTTACCT---------GTGTCTATCAACCGTTGATTTTTCTCAACTCTTCGGCTCACTGCTAGGAATTTGCCTAATTATCCAAATCCTAACAGGACTATTTTTAGCTATGCACTATACAGCCGACATTACATCAGCCTTTTCATCAATCGCCCATATTTGCCGAGATGTTCAATATGGCTGACTTATCCGAAACATCCACGCTAACGGCGCCTCAATATTCTTCATTTGCATCTACCTTCACATTGGCCGGGGTTTATACTACGGATCATACATATTTAAAGAAACCTGAAATATCGGAGTAATACTACTACTCCTAGTGATAGCAACGGCATTCGTAGGCTACGTATTACCATGAGGACAAATATCATTTTGAGGAGCAACAGTCATTACCAACCTACTTTCAGCCGTTCCATATATTGGTACAACCCTAGTAGAATGAATCTGAGGTGGCTTCTCCGTAGACAATGCAACACTAACCCGATTCTTTACATTTCACTTTCTACTTCCATTTGTTATCATCGGCGTTACCATACTACACCTTTTATTCTTACATGAAACAGGATCTAACAACCCAACCGGACTAACCTCAAACACAGATAAAATTCCATTCCACCCATACTTTTCATATAAAGACTTACTCGGCGCCTTACTATTGATTATTATTCTACTAACACTTGCATTATTTTCACCTAACCTATTAGGAGACCCAGAAAATTTTTCACCAGCAAACCCACTAGTCACCCCACCACACATCAAACCAGAATGGTACTTCCTATTTGCCTACGCCATCCTACGATCCATTCCAAACAAACTTGGGGGGGTACTAGCCTTACTATTCTCAATCCTAATCCTAATATTAGTCCCACTACTACACACATCAAAACAACGAAGTACCTCCTTCCGCCCAATATCTCAAATCATATTCTGATTTCTAATTGCAGACGTACTTATCCTAACATGAATTGGAGGTCAACCAGTAGAACACCCATTCATCATTATTGGACAACTCGCCTCAATTATTTATTTTTTCCTATTTTTACTTATTATACCAACAACAGCAATGCTAGAGAACAAACTACTAAAATGATAGTACCCACCAAAC------GCCCTTGTAGCTTAAACATTTA---AAGCATTG
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		Urosaurus_ornatus                          CAATTCCTACCTCTAACCCTTGCCATATGCCTCTGACATACAGCCCTTCCAATCTCAACATTTAGCCTACCACCACAACAATAAACC-GGACGTGTGCCCGAATTCCT-AAGGGTTACTTTGATAGAGTAAACAACAGAGGTTAAAATCCTCTCACTTCC-TAGAAGAACAGGACTCGAACCCGCACATAAAGACTCAAAATCTTTAGCACTCCATTATACTACCTTCTA-----GTAAAATCAGCTAACT-AAGCTATCGGGCCCATACCCCGAAAATGTTGGTTTAAACCCTTCTTTTACTAATGAGCCCAACAACAGCCACAATCCTAATTTCAAGTCTAGCCACAGGCACAATCATTACAGCATCCAGCTTCCATTGACTTATAGCCTGAATCGGCCTAGAAATAAACACCCTAGCTATTATTCCACTAGTATCAAAACAACACCACCCTCGAGCAACAGAAGCTGCAACAAAATACTTCATAACACAAGCAGCGGCATCTGCCACAATCCTATTCGCAAGCACAATAAATGCATGACAAACGGGAACCTGAGACATCATCAACTCTACACAACCAACAGCAAATACACTACTAACAATAGCCCTGGCAATAAAACTAGGACTTGCCCCAATACACTTCTGACTACCAGAAGTACTGCAAGGATCAAACATAAAAACTGCAATAATCATTGCAACATGACAAAAACTAGCCCCAATAGCCCTAATTGTTCAAATCCACAATAACCTATCAACCACAATTCTACTAACAATAGGAATAATCTCATCACTAATAGGGGGCTGGGCCGGACTAAACCAAACTCAAACACGAAAAATCATAGCCTATTCATCAATCGCCCACCTCGGCTGAATAGCTGCAATCACCACAATTATACCAAATATTATACTACTAAACCTAACATTATACCTATTAATAACAACCTCAATATTTTATACACTAATCCTATTAAACTCCAAAAACATCAAAGATTTAGCAACCTCATGAACAACCTCCCCTACAACGACCTCCATAACAATACTGATCCTTTTATCCCTAGGAGGACTACCACCACTAACAGGGTTTATACCAAAATGATTAATCCTCGAAGAACTTACAACCCAAAACCTAACAACAATAGCAACAATCATAGCCATCTCAGCCTTACTTAGCCTTTTCTTCTACCTACGGCTAAGCTATACATCAACTATTACCCTTTCCCCAAACACAACAACAACAAAACACAAATGACGATTCAAACAAACAACAAACACACTACTACTAACGACCACTATTCCAATATCAACATTAATATTACCCATAACCCCAATACTATTAATATAGAAGCTTAGGATAATTTA--AACCAAGGGCCTTCAAAGCCCTAAATAGGGACCA--CACCCCTAGCTTCTGATCAATAAAACCTGTGTAACACTAATACACATCTCCTGAATGCAAACCAGGCACTTTAATTAAGCTAAGGCTTCTCTACTAGATAGGCGGGCCTTGATCCCACGAAAAATTAGTTAACAGCTAAACACCCAATCCAGCGGGCTTCTATCCGCTTTCTCCCGTCACTTCTAAAACGGGAGAAAGCCCCGGGGCACTTTAT-GGCCCTACTTCAAACTTGCATTTTGACGTGTAA--ACACCTCGAGACT----TGATAGAAAGAGGAATTAAACCCCTGTAAATAGGACTACAGCCTACCGCCTAAACTCTCGGCCACCCTACCC---------GTGTCCATTAACCGTTGATTCTTCTCAACACTTCGGCTCACTATTAGGCATCTGCCTAGTAATACAAATCCTAACTGGACTTTTCCTAGCCATACACTACACAGCAGACATCTCATCTGCCTTTTCATCAGTAGCCCACATCTGTCGAGATGTACAATACGGCTGATTAATCCGAAACCTCCATGCAAATGGAGCTTCAATATTCTTTATCTGCATTTATATGCATGTTGGACGAGGCCTGTACTACGGATCCTATATATTTAAAGAAACATGAAACCTAGGTGTTATCTTACTCCTACTAGTAATAGCTACCGCCTTCGTTGGGTACGTCCTACCATGAGGACAAATATCATTCTGAGGGGCTACAGTAATTACCAATCTTCTATCAGCAGTTCCATATATCGGAACAACCCTAGTAGAGTGAATCTGAGGGGGTTTCTCAGTTGATAATGCAACACTAACTCGATTTTTTACCTTCCACTTCCTCCTACCATTTGCCATTATTGGTGTTTCAATAATTCACCTTCTTTTTCTTCATGAAACCGGATCAAATAACCCAACCGGACTAGAATCAAACACAGACAAAATCCCATTCCACCCTTACTTCTCATACAAAGACATCCTAGGCGCCCTACTACTAATCATTATTTTATTACTTCTAGCCTTATTTTCACCAAACCTATTAGGAGACCCAGAAAACTTCACACCCGCCAACCCACTCGTCACACCCCCACACATTAAACCAGAATGATACTTTCTATTTGCCTACGCCATTTTACGATCAATTCCAAACAAACTAGGAGGAGTTTTAGCTCTACTATTTTCAATCTTAATCCTAATACTAGTCCCACTTTTACACACATCAAAACAACGAAGCACTATATTCCGCCCAATATCACAAATTATATTCTGACTACTAATCTCAGACGTACTTATTCTCACATGAATTGGAGGCCAACCAGTTGAACACCCATTTATTATTATTGGTCAACTAGCCTCAATTATTTACTTCGCATTATTCCTTATTCTTATGCCAATAACATCCATTTTAGAAAACAAACTACTCAAATGATAACCTAA-------------GCCTCTGTAGCTAAAATCCT-----AAGCACTG
		Uta_stansburiana                           CAATTTTTACCAATAACACTTGCCATATGCTTATGGCACACAGCACTACCAATTTCAACATTTAGCCTTCCACCACAACAATAAAC--GGAAATGTGCCCGAAAATT--AAGGGTTACTTTGATAGAGTAAACCACAGAGGTTAAAACCCTCTCATTTCCTTAGAAGAACAGGACTCGAACCTGCACGTAAAGACTCAAAATCTCTAGCACTCCATTATACTATCCTCTA-----GTAAAGTCAGCTAACTCAAGCTATCGGGCCCATACCCCGAAAATGTTGGTTTAAATCCTTCCTCTACTAATGAGCCCAACTACAACCACCATCCTAGTATCCAGCCTAGCCACAGGAACAATCATTACAGCCTCAAGTCACCATTGACTAATAGCCTGAATCGGACTAGAAATAAACACCCTAGCTATTATTCCAATAATTTCAAAACAACACCACCCACGAGCAACAGAGGCCGCTACAAAATACTTCTTAACACAAGCAGCCGCCTCTGCCCTAATTCTTTTTTCAAGCACAGTAAACGCATGACAAAACGGAACATGAGACATTATTAACCTAACAAACCCAACCGCAAACATAATACTAACCATAGCCCTAGCCATAAAACTAGGCTTAGCCCCAATACACTTTTGACTTCCAGAAGTACTACAAGGATCAACCATAAAAACAGCCATAGTTATTGCAACCTGACAAAAACTAGCCCCAATAGCACTCATTTACCAAACATCTAATAACCTTTCCACACCAACCCTACTAACAATAGGCATCATTTCCACTATGCTAGGAGGATGGGCCGGATTAAACCAGACACAAACCCGAAAAATCATAGCATATTCATCAATCGCCCACCTAGGATGAATAGCCGCAATCACCACAATCATACCAAACATCCTCCTACTCAATTTAACCCTATATTTATTAATAACAGCCTCAATATTCTTCACACTAGTATTATTAAACTCAAAAAACATCAAAGATATTGCAACCTCATGAACAACCTCCCCAACAACATCCACCATAACTATACTAATTTTACTATCACTAGGAGGACTACCCCCACTTACAGGATTTATACCAAAATGACTTATTCTTGAAGAACTTACAACACAAAATTTAACAACAGCAGCAACCATAATAGCTATATCTGCCCTACTTAGCTTATTTTTTTATCTACGACTAAGCTACACATCAACAATCACACTATCCCCTAACACAACAACAACAAAACACAAATGACGATTTAAACAAACAACAAGCACAGCCCTACTCACCCTAACACTACCAATATCAGTATTAATACTACCAATAACCCCCATACTAACA---TAGAAGCTTAGGATAAACACA-AACCGAGGGCCTTCAAAGCCCTAAATAGGGGCCACCACCCCCTAGCTTCTGC----TAAGACCTGTGTAACACTAATACACATCAATTGAATGCAAATCAAACACTTTAATTAAGCTAAGGCCTCA---CTAGATAGGCGGGCCTCGATCCCACAAAAAATTAGTTAACAGCTAAACACCCAATCCAGCGGGCTTCTATCTGCTT-CTCCCGTCTCTAAAA--ACGGGAG-AAGCCCCGGAACCCTTTTG-GGTTCTTCTTCAAACTTGCATTTTGATGTGTAG--ACACCTCGAGGCT---CTGGTAAAAAGAGGAGTCTAACCTCCATAAATAGGACTACAGCCTACCACCTAAACGCTCGGCCATTTTACCT---------GTGTCAATTAATCGTTGATTTTTCTCAACACTTTGGCTCTCTTTTAGGACTTTGCTTAATCATTCAAATCCTAACAGGATTATTCTTAGCAATACACTATACAGCCGACATTTCATCAGCATTCTCATCAGTAGCCCACATCTGTCGAGACGTACAATACGGCTGACTAATCCGAAACATCCATGCAAATGGAGCTTCAATATTCTTTATCTGCATCTATATACATGTAGGACGAGGACTCTACTACGGATCATACATATTTAAGGAAACATGAAACCTTGGCGTGATCCTTCTACTCCTAGTAATAGCCACTGCCTTCGTAGGATACGTCCTGCCATGAGGACAAATGTCATTTTGAGGCGCAACAGTAATTACCAACCTACTCTCAGCCATCCCATATATTGGAACAACCCTAGTTGAATGAATTTGAGGCGGATTTTCAGTCGACAACGCAACATTAACCCGATTCTTCACCTTTCACTTCCTTCTACCATTTGCCATCATTGGCGTTTCAATAATTCACCTCCTCCTCCTTCACGAAACAGGCTCAAACAACCCAACAGGACTGACCTCAAACACAGACAAAATCCCATTTCATCCATACTTTTCGTACAAAGATCTACTAGGGGCACTCCTACTAATTTTCCTTCTCCTACTTTTAGCACTATTCTCACCAAACCTGCTAGGAGACCCAGAAAATTTTTCACCAGCTAACCCACTAGTAACACCACCACATATCAAACCAGAATGATACTTCTTATTCGCATACGCCATTCTACGTTCAATTCCAAACAAACTAGGCGGGGTACTTGCCCTACTCTTCTCAATCATAATCCTAATAATCGTCCCACTACTTCACACATCAAAACAACGAAGCACAACATTCCGCCCAATATCACAAGCTATATTTTGACTTTTGATTTCAGATGTATTAATTCTAACATGAATCGGCGGACAGCCAGTAGAGCACCCATTTATCATCATTGGACAACTAGCCTCAATCATCTATTTTATATTATTCCTAATCCTAATACCAACCACATCACTACTAGAAAACAAACTACTAAAATGATAATTAACAAT----------GCCTCCGTAGCTTAAAAA-------AAGCACTG
		Sceloporus_jarrovii                        CAATTCCTACCAATAACACTTGCCATATGCCTATGACATACAGCTTTACCAATCTCAATATTTAGCCTACCACCACAA---TAGCAAAGGATGTGTGCCCGAATGTTTTAAGGGTTACTTTGATAGAGTAAATAATAGAGGCTAAAATCCTCTCACCTCCTTAGAAGAACAGGACTCGAACCTGCACACAAAGACTCAAAATCTTCAGAACTCCATTATTCTACCTCCTA-----GTAAAGTCAGCTAATA-AAGCTATCGGGCCCATACCCCGAAAATGTTGGTTTAACCCCTTCCTCTACTAATGAGCCCCACAACAACCATAATCATTATTTCAAGCCTTGCTACAGGAACAATTATTACAGCATCCAGCTACCACTGGTTTATAGCCTGAGTTGGCCTAGAAATAAATACACTAGCCATTATTCCAATAATCTCAAAACAACACCACCCACGAGCAACAGAAGCCGCCACAAAATACTTCCTAACACAAGCAGCTGCCTCAGCAATAATTTTATTCTCAAGCACAATAAATGCATCACTCTCAGGAACCTGAGACATCATAAGCTCCGACAACCCTACAGCAAACATACTTCTGACCATGGCCCTTGCAATAAAACTTGGACTGGCCCCACTTCACTTCTGACTACCAGAAGTACTGCAAGGCTCTACCTTAAAAACAGCCATAGTCATCACAACATGACAAAAACTAGCCCCAATAGCCCTAATTTATCAAACATCCAACAACCTACCAACAACAGCCCTCTTAATCATAGCACTGATTTCAACAACCGTTGGTGGTTGAGCCGGGCTCAATCAAACACAAACCCGAAAAATTATAGCCTATTCATCAATCGCCCACCTCGGCTGAATAGCTGCAGTCACAACAATTTTACCAAACATTCTTCTACTTAACCTTTTAATTTATCTACTAATAACTGTATCTATGTTCTATACCTTAACTCTACTTAAATCAAAAAACATCAAAGATCTAGCTACCTCATGAACCACCTCCCCCCCAATAACCACTATCACTATGCTAACACTACTATCACTAGGAGGACTCCCACCATTAACAGGCTTCATGCCAAAATGACTTATTCTTGAAGAACTAACAATACAAAGCCTAACACTAGTAGCAACAACTCTAGCCATGTCTGCACTACTCAGCCTCTTCTTTTACCTACGACTGACTTACTCATCAACAATTACATTATCCCCAAACACCACTACAACTACGCACAAATGACGATTTAAACAAACATCAAATACCCTACTTCTGTCACTCACACTACCAACATCAATTTTAATATTACCCCTAACCCCAATATTATCC---TAGAGACTTAGGATAATCTTA-AACCAAGGGCCTTCAAAGCCCTAAACAGGGGCTGA-AACCCCTAGTCTCTGC----CAAGACCTGTGTAATATTAATACACATCTAATGAACGCAAATCAAATACTTTAATTAAGCTAAGGCCTCA---CTAGACAGGCGGGCCTTGATCCCACAAAAAATTAATTAACAGCTAAACACCCAATCCAGCGGGCTTCTGTCTGCTT-CTCCCGTTATGTAACAAACGGGAG-AAGCCCCGGGGCCATTGAG-GGCCCTACTTCAAACTTGCATTTTGATGTGTAA--ACACCTCGAGGCTACGTTGATAAAAAGAGGAATTAAACCCCTATGAGTAGATCTACAGTCTACCGCCT-AACATTCGGCCATTTTACCC---------GTGTCTATTAATCGTTGATTTTTCTCAACACTTTGGCTCCCTTCTAGGAATCTGCTTAATTATCCAGCTATTAACAGGCCTATTTCTAGCCATACACTATACAGCCGACATCTCATCAGCTTTCTCATCCATCGCCCACATCTGCCGAGACGTACAATATGGCTGACTTATTCGTAACCTTCACGCCAACGGCGCTTCAATATTTTTCATCTGTATTTACCTCCATGTAGGACGAGGACTTTATTATGGCTCCTATATATTTAAAGAAACCTGAAATATTGGAGTAGTACTTCTCCTCCTAGTAATAGCCACTGCTTTCGTAGGATACGTACTACCATGAGGACAAATATCATTTTGAGGCGCAACAGTAATCACAAACCTACTTTCAGCCATCCCCTACATTGGAGCTACTATAGTTGAATGAATCTGAGGTGGATTTTCAGTTGACAACGCAACCCTTACCCGATTTTTTACCTTCCATTTCTTACTTCCATTCGCAATCATTGGAGCATCCATACTCCACCTACTTTTCCTTCATGAAACAGGCTCCAATAATCCCACAGGATTAACCTCAAGCACAGACAAAATCCCATTCCATCCATACTTCTCATACAAAGACCTACTAGGCTTTCTATTACTAATTTTTTTCCTTCTTTTACTTGCATTATTCTCACCAAACTTTCTCGGAGACCCAGAAAACTTTACACCCGCTAACCCCCTAGTGACTCCACCTCACATCAAGCCAGAGTGGTATTTTCTATTTGCATACGCTATCCTACGATCAATCCCAAACAAACTCGGAGGGGTACTAGCACTATTATTATCAATTTTAATTCTAATAGTTGTTCCACTCCTACACACCTCAAAACAACGAAGCACCTCATTTCGCCCAACCTCCCAAATAATATTTTGATTACTAGTATCAAACGTACTTATTTTAACATGAATTGGGGGCCAACCAGTTGAACACCCATTTATTATTATTGGCCAACTAGCCTCAGCAACCTACTTCATACTATTCTTAGTAATTATACCAATAACAGCCACTATAGAAAATATACTACTCAAATGATAAAACCAA------------GTCTCCGTAGCTTAAGAA-------CTGCTCTG
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