#NEXUS

BEGIN TAXA;
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		Ganoderma_wiiroense Polyporus_varius_EST Polyporus_varius_GER Polyporus_varius_GER2 Polyporus_varius_RUS Polyporus_varius_StaraPl Polyporus_varius_StaraPl2 Polyporus_varius_StaraPl3 Polyporus_varius_StaraPl4 Polyporus_varius_Tara Polyporus_varius_Tara2 Polyporus_varius_USA Polyporus_varius_USA2 Polyporus_varius_USA3 Polyporus_varius_USA4 Polyporus_varius_USA5 
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BEGIN CHARACTERS;
	TITLE  Polyporus_varius_ITS_alignment;
	DIMENSIONS  NCHAR=563;
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	MATRIX
	Ganoderma_wiiroense        TGTAGCTGGCCTTCCG--AGGCATGTGCACGCCCTGCTCA-TCCACTCT--ACACCTGTGCACTCACTGTGGGCTTCAGGCAT---TATTGCGGAGCGCGTTCCTCACTGGACTTGTGGAAGCAGTGTGT---CTGTGCCTACGTTT-ATCACAAACTCTATAAAGTATCAGAATGTGTATTGCGATGTAACGCATCTATATACAACTTTCAGCAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACCTTGCGCTCCTTGGTATTCCGAGGAGCATGCCTGTTTGAGTGTCATGAAATCTTCAACCTACGAGCTTTT--GTGGTTTG--TAG-GCTTGGACTTGGAG--GCTTGTCGGC-CGTTCTTGGTCGGCTTCTCTTAAATGCATTAGCTTGGTTCCTT-GCGGATCGGCTCTCGGTGTGATAAT-GTCTACGCTGCGACCGTGAAGCGT-TTGGCGAGCTTCTAACCGTCTCTTTGAGACAGCTTTATGACC
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;
END;

BEGIN TREES;
	Title Polyporus_varius_ITS;
	LINK Taxa = Taxa;
	TRANSLATE
[0] 		1 Ganoderma_wiiroense,
[1] 		2 Polyporus_varius_EST,
[2] 		3 Polyporus_varius_GER,
[3] 		4 Polyporus_varius_GER2,
[4] 		5 Polyporus_varius_RUS,
[5] 		6 Polyporus_varius_StaraPl,
[6] 		7 Polyporus_varius_StaraPl2,
[7] 		8 Polyporus_varius_StaraPl3,
[8] 		9 Polyporus_varius_StaraPl4,
[9] 		10 Polyporus_varius_Tara,
[10] 		11 Polyporus_varius_Tara2,
[11] 		12 Polyporus_varius_USA,
[12] 		13 Polyporus_varius_USA2,
[13] 		14 Polyporus_varius_USA3,
[14] 		15 Polyporus_varius_USA4,
[15] 		16 Polyporus_varius_USA5;
	TREE P_varius = (1:0.10176057,((11:0.0,(3:0.0,(6:0.0,(7:0.0,(8:0.0,9:0.0)0.1310:0.0)0.0420:0.0)0.0460:0.0)0.1260:0.0)0.9860:0.00528933,((4:0.0,(2:0.0,(5:0.0,10:0.0)0.2100:0.0)0.1520:0.0)0.9800:0.00400915,(12:0.0036336,(13:-0.00001957,(15:-0.00003612,(14:0.00385019,16:-0.00006708)0.2410:0.00003612)0.2300:0.00001957)0.6900:0.00015191)0.9320:0.00742941)0.5690:0.00234039)0.0000:0.08793298);
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