#NEXUS [written Mon Aug 22 11:44:04 CEST 2016 by Mesquite version 3.04 (build 725) at Bib_01/141.2.46.45] BEGIN TAXA; TITLE Taxa; DIMENSIONS NTAX=79; TAXLABELS 'Telimena picramniae MM-05' 'Polystigma pusillum MM-113' 'Telimena canafistulae MM-13' 'Telimena bicincta MM-133' 'Phyllachora sp.3 MM-134' 'Camarotella costaricensis MM-149' 'Polystigma sp. MM-163' 'Coccodiella sp. MM-165' 'Polystigma pusillum MM-19' 'Camarotella costaricensis MM-21' 'Camarotella sp. MM-27' 'Phyllachora sp.3 MM-78' 'Telimena sp.4 MM-88' 'Telimena sp.3 MM-92' 'Phyllachora sp.3 MM-98' Aniptodera_chesapeakensis Balansia_henningsiana Bionectria_ochroleuca Bombardia_bombarda Buergenerula_spartinae Calosphaeria_pulchella Camarops_amorpha Camarops_microspora Camarops_tubulina Camarops_ustulinoides Cercophora_coprophila Chaetosphaerella_phaeostroma Chrysoporthe_cubensis Coccodiella_miconiae Coccodiella_miconiicola Cordyceps_cardinalis Ophiocordyceps_irangiensis Tolypocladium_japonicum Cryphonectria_parasitica Cryptosporella_hypodermia Diaporthe_eres Diatrype_disciformis Tolypocladium_capitatum Eutypa_lata Cocoicola_californica_F59034 Cocoicola_californica_F59038 Falcocladium_multivesiculatum Falcocladium_sphaeropedunculatum Gelasinospora_tetrasperma Glomerella_cingulata Gnomonia_gnomon Graphium_penicillioides Halosphaeria_appendiculata Hypocrea_lutea Kylindria_peruamazonensis Lasiosphaeria_ovina Leotia_lubrica Melanospora_tiffanii Melanospora_zamiae Microascus_trigonosporus Monilochaetes_infuscans Ophioceras_dolichostomum Ophioceras_leptosporum Ophiodothella_vaccinii Ophiostoma_piliferum Ophiostoma_stenoceras Serenomyces_phoenicis_PLM314 Serenomyces_phoenicis_PLM315 Papulosa_amerospora Telimena_engleri_TH551 Phyllachora_graminis_TH544 Telimena_leeae_TH549 Telimena_zanthoxylicola_TH550 Polystigma_amygdalinum Pseudohalonectria_lignicola Roumegueriella_rufula Sordaria_fimicola Sordaria_macrospora Sphaerodothis_acrocomiae Sphaerostilbella_berkeleyana Togninia_vibratilis Valsa_ambiens Verticillium_dahliae Xylaria_acuta ; END; BEGIN CHARACTERS; TITLE 'Matrix in file "Phyllachorales in Sordariomycetes_Matrix.nex"'; DIMENSIONS NCHAR=2637; FORMAT DATATYPE = DNA GAP = - MISSING = ?; MATRIX 'Telimena picramniae MM-05' GGAGGAAAAAAGAAAMCCCAACAGGGATTGCCCTAGGGCCGGAGTGAAAGCAATAGCTCTTTGAAATCTGGCTTTGGCCCGAGTTGTGCAGAGGAAGTTCTGGGCGCCTTCTGAGTCCACTGGAACGTGCCCTAGAGGGTGAGAGCCCCGAGTTGGATCCAAGCCTGTGTGAAGCTTTCGACGAGTCGAGTAGGGGAATGCTGCTCTAAATGGGGAGAAATTCCCTTCTAAAGCTAAATATGGGCCCGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGTACAAAAGAGAGTCAAATAGCACGTGAAATTGTTGAAAGAGAATTTGTGACCAGTGCTGCATCTCCCGGTGTTTCACCGGTGTACTCCGCGCGGTCAGGCCAGCATCGGTTTCCGGGGGGACAAAAGCGGGAACGTAGCTCCCAGGGAGCGTTATAGCCGCAAATACCCCTTGGGGACCGAGGCCCGCGTTTACGGAAATGGTGATCACCCGTCTAT??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GCTCTCAGTACTCCTCGCTACTGGAATTGGGGCGAAAAAAGTCGACGAGCTCCACGCTGGTGTCTCGGAGGTGCTGAACCGCTACACTTTGCGTCGACCTTGTCTCATCTTCGGCGAACGAACACGCCCATTGGACGAGACGGCAAGATTGCGAAACCGCGCCAGCTGCACAACGCATTTGGGGACTGGGTCTGAAACGCCCGAAGGCAGGCTTGTGGTTTCGTCAAAAACCTTTCGCTATGTGCTATGTCAGGGGTGGCCGCCCTCGGAACCCATCGTTGAGTTCATGACAGCGAGAACATGGGAGGGGAGGAATACGAGCCTTTGCGCCCGAAAGCACCAATTCTTCAACGGTTCTGGGTGTGCATCAAGATCCAAGCAGCTTGAGCCTGGTCCAGCATTTGGAAGAACGTCATTAGTTAGGTTTTCTTTGGTTCGTGACATTCTAGCGAGTTCAAGATTTTTCCGACGCCGGACGTGTGATGGGCCTCTGTTGTTGTGGAAGAAGAAGAAGAGAGAGCGGGGTGGAAAGGGCCAACTGATCCTAACAAGCACCACATTTGCCCAGGGACAAGGAGGTTGAGAGGCGACGGCTACTTTGGCTGGGAAGGCCTAGTCCGGTGATTGAGTATTGGACGCCGAAGAGGAGGAAACGGCCATGATCTGCATGACCCGGAGATTTGGATACCGGTTGGCCAGGACCCCGACGAGAGAACAACCAACGCGCGTCTCAAGCTCAAGGCCAACCCGACCACCACATG?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TACCGCGACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATAGTACCTTACTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAGCCCCAACTCACGGGGTGTATTTATAAGATTAAAAACCAATGTTCTGGGCTCACTGGTGATAAACTTTCTCTTTGCACGGCCTTGTGGATGGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATTTCGATGGCTGGGTCTTGGCCAGCCATGGTGACAACGGGTAACGGATTAGGGCTCGACCCCGGAGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGCGCAAAACCCAATCCCGACTCGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATGCAGGGCTCTTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAGTTGTTTTAAAAAGCTAGTTGAAGGCTGGCCGGGCCTCACCGCGTGCACTGGTCGGCCGGGTCTTTCCCTCTGGGGAGCCGCATGCCCTTTACTGGGCGTGCCGTTTTACCTGAATAAATTGGATCAAGGCCTATGCTCGAACAGTGCAGCATGGAATAATGTAGGACGGGTTCTATTTTGGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGAGGGGGCGTCCGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTTCTTTGAAGACTGCGAAAGCATTTCAGGATGTTTTCATTAAGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGATTAGGGATCGGACGGTGTTATTTTTTGACCCGTTCGGCACCTTACGAAAATCAAAATGTTGG?????????????? 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MM-165' TAGC????GAGAAAAGAACAACAGGGATTGCCTCAGGGCGAGCGAAGCGGCAACAGCTCTTTGAAATCTGCCTTTGGGCCGAGTTGTGCAGAGGATGTTTCGGGTGGCTTCTAAGTTCTCTGGAACGAGCCATAGAGGGTGAGAGCCCCGAGTCGTGCCCTAGCCGGTGTAAAGCTTTCGACGAGTCGAGTAGGGGAATGCTGCTCTAAATGGGAGGTAAATTCCTTCTAAAGCTAAATATCTGCCGGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACAAAAGAGAGTCAAACAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAACCTGTGACCAGCACCGGATCTCCCGTTGTTTCAGCGGTGCACTCGTCCCGGTCAGGCCAGCATCGGTTCCTGGGGGGAAAAAAGCGGCAACGTAGCTCTTT??GAGTGTTATAGCTGCAAATACCCTGGGGGGACCGAGGACTGCGCATAGGATAATGGTCACAACCCGTCTTGAA??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TTCGGGGATAGTTCGCAAGTGACTCAGGACCTTACATCAAGCGTTGTATTGACCAACAGAAGCAGTTTTCTCTCTCTAGGTGTCAAGCCTTCCAATGTCACAAATGCCCTCAAATACTCTTAGCCACGGGAACTGGGGTGAAAAAAATCTATGAGCTCGACGCTGGCGTGTCCCAGGTCCTCAATCGGTACACTTTGCATCGACCCTCTCGCACCTGCGACGTACAAACACTCCTATCGGCCGTGATGGAAAGATTGCCAAGCCCCGACAGCTGCACAATACTCACTGGGGTCTAGTTTGAAACGCCCGAAGGCAGGCTTGTGGACTTGTCAAGAATCTCTCTCTATGTGCTACGTTAGTGTGGGTCTCTGGCCGACCCTATCGTTGATTTTATGATCGCGAGAAACATGGAGGAGAAGAGTATGAACCGCTTCGTCCTAACGCACGAATTTGTAAACGGAACTGGGTGTTCCTCTGGATCCAAGAGTCTTTAGCGTTGTTCAGAATTCGAAAAACTAGCATATCATGAAGTTTCCTTAGTACGTGACATCCGCGGGAGTTTAAGATTTCTCAGACGCCGGTCGGGTCATGAGCCACTTTTGTCGTTGAGCAAGATGAAGAACAGTGGGCGTGGAAAGGGTCGACTCCCACTAACAAGGAACATGTTTACAAGCAGATAGAGAATTAGTATCACGCTGATCACTGGGGCTGGGAAGGGCTAGTCGGGTGATTGAGTACTCGATGCAGAGGAGGAGGAAACGGCTATGAGACGCATGTCCCCGAGACCTCGATACCGTCTGAGAAAAGCCCGGATGAAATCAAGGCGACCTCACGACTCAAGCCCGGTATCAACCCAGCCACCATACGTACACACA?TGCGAGATTCATCCTGCCATGCTGCTCGGCATT?GGCGAGC??????????????????????????????????????????????????????????TTATCGTTTATTTGATAGTACCTTACTACATGGACAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAACCCCGATTC??GGGGTGTATTTATTAGATTAAAAACGCGCATTCGGGGCTTGATGGTGATGATAACTTCTATCGCACGGCCTTGCGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATTTCGATGGCTGGGTATTGGCCAGCCATGGTGACAACGGGTAACGGATTAGGGCTCGACCCCGGAGAACCTGAGAGACGGCGAATACATCCAAGGAAGGCAGCAGCGCAAAGCCCAATGCCGACTCGGCGAGGCAGCGACAAGAAATACTGATACAGGGCTCTTGGAATGAGTACAATCTAAACCCCTTAACGAGGAACAATTAGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCGGTAATTCCAGCTCTAATAGCGTATATTAGTTGTTTTAAAAAGCTAGTTGAAGGCTGGCTGGGCCTCACCGCGTGCACTGGTCGGCCGGGGCTTTCCCTCTGGGGAGCCGCATGCCCTTTACTGGGTGTGACGGTTTACTTGAACAAATTAGATCAAGGCCTATGCTCGAATAGTCTAGCATGGAATAAT?TAGGATGGGTTCTATTTTGGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGAGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTTCGAAGACTGCGAAAGCATTTGAGGATGTTTTCATTAAGAACGAAAGTCAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTGACCATAAACTATGCCGATTAGGGATCGGACGGCGTT????????????????????????????????????????????????????????? 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'Camarotella sp. MM-27' AAGCGGAGGAAAAGAAACCAACAGGGATTGCCTCAGGGCGAGTGAAGCGGCAATAGCTCTTTGAAATCTGCCCCTGGGCTGAGTTGTGCAGAGGATGTTTCGGGCGTCGTAGAAGTCCTCTGGAACGGGCCATGGAGGGTGAGAGCCCCGACGCAGACCCAAGCTGGTGTAAAGCTATCGACGAGTCGAGTAGGGGAATGCTGCTCTAAATGGGAGGTAAATTCCTTCTAAAGCTAAATATTTGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACAAAAGAGAGTTAAACAGCACGTGAAATTGTTGAGAGGGAACCTGTGACCAGAGCTGGATCTCCTGCCGTTTCGGCAGTGCACTCGTCCCGGTCAGGCCAGCGTCAGTTTCCCGGGGAAGAAAAGCGGTTACGTAGCTCTTTTGGAGTGATATAGC?GTAAATGCCCTGGGAGAACTGAGGACCGCGCCCAAGGAAATGGTCACGACCCGTCTTGA?CCACGGACCA?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TTA???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TTTTACGGCCAGACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTATATTTGACAGTTTCTTCCTACATGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAACCTCAACTTTGGGGGTGTATTTATTAGATTAAAAACCAACGCCCGGGGCTTATTGGTTATGATAACTTCTATCGCATGGCCTTGTGGATGGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATTTCGACGGCTGGGTATTGGCCAGCCGTGGTGACAACGGGTAACGGATTAGGGCTCGACCCCGGAGAACCTGAGAGACGGCGAATACATCCAAGGAAGGCAGCAGCGCAAAGCCCAATGCCGACTCGGCGAGGCAGCGACAAGAAATACTGATACAGGGCTCTTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAACTAAAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCGGTAATTCCAGCTTTAGTAGCGTATATTCGTTGTTTTAAAAAGCTAGTTGAAGACCGGCCGGGCCTAAACGCGTGTACTGGTCGGTTGGACCTTTCCCCTGGGGGAGCTGCATGCCCTTTATTGGGTGTGCTAAGTTACTTGAATAAATTAGATCAAGGTCTATGCTCGAATAGTCTAGCATGGAATAATGTAGGACGGGTTCTATTTTGGGTTTCTGGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGAGGGGGCATCAGTATTTATTTGTCAGAGGTGAAATTCTTTTGAAGACTGCGAAAGCATTTGAGGATGTTTTCATTAAGAACGAAAGTCAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTGACCATAAACTATGCCGATCAGGGATTGGACGGTGTTAATATTTGACCCGTTCGGCACC?TGCGAAAATCAGAATGTTGG?????????????? 'Phyllachora sp.3 MM-78' ???CGGAGGAAAAGAAACCAACAGGGATTGCCTTAGGGCGAGTGAAGTGGCAAAAGCTCTTTGAAATCTGCCGCC?GGCCGAGTTGTGCAGAGGAATTTTGGGATTCGCTCCAAGTCCCCTGGAACGGGCCATAGAGGGTGAGAGCCCCGGAGATGTTTTAGCCCTGCATGAAGATTTCAACGAGTCGAGTAGGGAATGCCTGCTCTAAATGGGAGGTAAATTCTTTCTAAAGCTTAATATTAGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACAAAAGAGAGTTAAA?AGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAACTTGTAACCAGCACTATATTTGCTACTGTTCCAGTGGTGTACTCTGCGTAGGTTGGCTAGCATGAGTTTTTCGGGGGATAAAAGCGGGAATGTAACTCGTT??GAGTATTATAATTGCAAATACCCCAGGAAAACTGAGGAAAGCGTTTAAGGAAATGGTTT???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????ATGTGCGC?AGATGACC??AGACCTTATATCAAGCGCTGTATCGA?CAGAACAAACATTTCTCGCTCTCT?GGTATCAAGCCATCACAGATTACAAATGC?TTGAAATATTCCTGG?CACCGGAACT?GGGCGAAAGAAATCGATGCAGTCGACGCCGGCGTGTCCCAGGTGCTCAACCGATATACTTCGCATCAA?CCTGTCCCATTTGCGGCGCACCAACA?CCCCATCGGTCGTGATGGCAAGATAGCCAAACCTCGGCAGCTGCACAACACACATTGGGGGCTGGTCTGAAACACCCGAGGGCAGGCATGCGGACTCGTTAAGAATCTTTCCCTATGTGCTACGTCAGCGTAGGACGCCGGCCGAGCCCATCATCGACTTCATGATCGCACGAACCATGGAAGGGAGGAGTACGAACCGTTGCGCCCCAACGCACTAATTTGTCAACGGTACTGGGTGTGCATCAGGACCCAAGCACTTTCAGTCTGGTACAGGGCTTGTAGAAACGTCATCTCCTGAAGTTTCGCTCGTCCGCGACATTCGCGGGAATTCAAGATTTTTCCGACGCCGGACGGGTCATGGACCGTTGTAGTCGTCGAAACCGAAGACAAGAGAGCGGCGTCGAAAAGGCAGTCTCATTCTAACAAAGACCACATCTGCAGGTGGATAAGGAGYTAGTACCACCCAAACTACTGGGGCTGGAAGGGTCTAGGCTGGTGGTCGAGTACTGGATGCTGAAGAAGAAGAGACGGTCATGATTTGCATGTCCCCGAGATCTGGACATCGGTTGACGAAGCGGATGCCAGGAGGAACAGCAACGCCCGTCTCAAGTTAAGGATCAATCCAGAACACACAC?TTCACCCCCTGTGAGATCCAT????CCATCCCATG???????????????????????????CCTGCCAT??????????????ACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATAGTACCTTACTACATGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAGCCCCGAACTTGTGGGGTGAATTTATTAGATTCAAAACCAATGTCCGGGGCTCTTGGGCGATGATAACTGCTATCGCATGGCCTTGTGGATGGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATTTCGATGGCTGGGTCTTGGCCAGCCATGGTGACAACGGGTAACGGATTAGGGCTCGACCCCGGAGAACCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGCGCAAAACCCACTCTCAAAACGAGGAGGTAGTGACAATACGTACTGATACAGGGCTCTTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAGCAATTGCAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCGGTAATTCCAGCTGCAATAGCGTATATTAGTTGTTTTAAAAAGCTAGTTGAAGGCTGGCTGGGCCTCATCGCGTGCACTAGTCGGCCGGGTCTTTCCCTCTGGGGAGCTGCATGCCCTTTACTGGGTGTGTCAGTTTACTTGAATAAATCAGATCAAGGCCTATGCTTGAATGCTCTAGCATGGAATAATGTAGGACGGGTTCTATTTTGGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGAGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTTTGAAGACTGCGAAAGCATTTGAGGATGTTTTCATTAAGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGATTAGGGATCAGACAGTGTTA?TTATTGACCTGTTTGGCACCTTACGAAAATC???????????????????????? 'Telimena sp.4 MM-88' AAGCGGAGGAAAAGAAACCAACAGGGATTGCCCTAGGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCTTTGAAAATCTGCTTCGGCCCGAGTTGTGCAGAGGAAGTTCTGGGTGCCATCTGAGTCCACTGGAACGTGCCACAGAGGGTGAGAGGCCCGAGTAGGATCCGCGCCTGTGTGAAACTTTCGACGAGTCGAGTAGGGGAATGCTGCTCTAAATGGGAGGTAAATTTCCTTTAAGCCTAAATACTGCCCCGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACAAAAGAGAGTCAAATAGCATGTGAAATTGTTGAAAGGGAATTTGTGACCAGCGCCCGTCTCCCCGGTGTTTCACCGGTGCACTCCGCGCGGTCAGGCCAGCATCGGTTCCTGGGGGGACAAGAGCGGGAACGTAGCTCCCTGGGAGTGTTATAGCCGCAAATACCCCCGAGGGACTGAGGCCCGCGTTTACGGAAATGGTTATCACCCGTCTTGCAACCCCGG?????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GGCAACC???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????TGTTTAAATCAGCGGTGATCACCGAGGAAAACCTTTTCGCTCGCTAGG?ATCAAGCCCGCCAGCATTAGCAACGCTCTCAAGTACTCCTCGCCACTGGAACTGGGGCGAAAAAAGTCGATGAGCTCCACGCCGGTGTGTCCCAGGTGCTGAACCGCTACACTTTGCGTCGACCTTGTCTCACTTGCGGCGAACGAACACACCCATCGGAAGAGACGGCAAGATTGCGAAACCGCGCCAGCTGCACAACACGCATTGGGGACTGGTTTGAAACGCCCGAAG?CAGGCTTGTGGTCTCGTGAAGAACCTTTCACTATGTGCTACGTCAGTGTGGGACGCCCTCGGAGCCCATCGTCGAGTTCATGACGGCGAGAAACATGGGAGGAGGAAATACGAACGTTTGCGCCCCAACGCACCAATTTGTCAACGGTTCTGGGAGCATTCAAGGATTCAAGCAGCT????????????????????????????????????????????????????????????????????GGTCAAGCC??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????AAACTGCGAATGGCTCATT?AATCAGTTATCGTTTATTTGATAGTACCCTACTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAACCCCAACTCACGGGGTGTATTTATTAGATTAAAAACCGATGTTCGGGGCTTCCTGGTGATAGTAACTAGTATCGCACGGCCTTGCGGATGGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATTTCGATGGCTGGGTCTTGGCCAGCCATGGTGACAACGGGTAACGGATTAGGGCTCGACCCCGGAGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGCGCAAAACCCAATCCCGACTCGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATGCAGGGCTCTTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAGTTGTTTTAAAAAGCTAGTTGAAGGCTGGCCGGGCCTCACCGCGTGCACTGGTCGGCCGGGTCTTTCCCTCTGGGGAGCCGCATGCCCTTTACTGGGCGTGCCGGTTTACCTGAATAAATTGGATCAAAGCCTATGCTCGGACAGTGCAGCATGGAATAATGTAGGATGGGTTCTATTTTTGTTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGAGGGGGCGTCCGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTTTGAAGACTGCGAAAGCATTCGAGGATGTTTTCATTAAGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGATTAGGGATCGGACGGTGTTATTTTTTGACCCGTTCGGCACCTCACGAAAA?????????????????????????? 'Telimena sp.3 MM-92' ?????????????????????????GATGACCCTTGGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCTTTGAAATCTGGCTTCGGCCCGAGTTGTGCAGAGGATGTTCGGGGTGCCTCCCGAGTCCACTGGAACGTGCCACAGAGGGTGAGAGCCCCGGGTTGGACCCGCGCCTGTGTGAAGCTCTCGACGAGTCGAGTAGGGGAATGCTGCTCTAAACGGGAGGTAAATTCCTTCCAAAGCTAAATACCGGCCCGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACGAAAGAGAGTCAAATAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAATTTGTGACCAGCGCCGTATCTCCCGGTGTTTCACCGGTGCACTCCGCGCGGTCAGGCCAGCATCGGTTTTCGGGGGGACGAAAGCGGGAACGTAGCTCCCCGGGAGTGTTATAGCCGCAAATACCCCCCGGGGACCGAGGCCCGCGTTTACGGAAAGGGTTATCACCCGTCTTGAAACACGGACC??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????GAGGAATCGGG?GACAGAAGACCCAAGATCTTACAACCAAGGTGGATCAAGCGAGGACAAGCACTTCTCGCTCGCTCGGCATCAAGCCCAACAACATTACCAACGCTCTCAAGTACTCCTCGCCACTGGAACTGGGGCGAAAGAAGTCGATGAGCTCCACGCCGGTGTGTCGCAGGTGCTGAACCGCTACACTTCGCGTCGACGCTGTCTCATTTGCGGCGAACGAACACGCCCATCGGACGAGACGGCAAGATCGCGAAACCGCGCCAGCTGCACAACACGCACTGGGGACTGGTCTGAAACGCCCGAAGGCAGGCGTGTGGTCTCGTCAAGAACCTGTCGCTATGTGTTACGTCAGCGTGGGACGCCCTCGGAGCCCATTGTCGAGTTCATGACGGCGCGGAACATGGAGGGGAGGAGTACGAGCCGTTGCGCCCGAACGCACCAATTCGTCAACGGCTCTGGGTGTGCATCAAGATCCAAGCAGCTTGAGCCTGGTCCCAGTCCTGGAAGAGCGTCATTAGTTGGTTTTCTCTGGGTTCGCGACATCCGCGCGAGTTCAAGATTTTCCGGACGCTGGACGTGTGATGGGCCTCTGTTGTCGTGGAGCAGGAAGACGAGATGCCGGGGTGCAAAGGGCCAACTGATCCTAACAAGGACCACATTTGGCCAGGGACAAGGAGGTTGAAAGGCCGCGGCTACTTGGCCTGGGAAGGCCTAGTCGGGCGATCGAGTACTGGACGCCGAAGAGGAGGAAACGGCCATGATCTGCATGACCCGGAGATTTGGATACCGCCTGACGAGGTCCCGGACGAGAGAATAAACAACGCTCGCTAAATTCCCATGGCTGGTTGGCAATCCAGCCATATAATC??????GCAGCCATCCCA???????????????????GTTGGCTT????????????????????TTGTACGGCGAACTTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATTGTTTATCTGATAGTACCTTACTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACACGCTAAAAACCCCGACTCACGGGGCGTACTATTTAGATAAAAAACCAATGTTCGGGGCTCAGTGGTGATAATAACTTCTATCGCACGGCCTTGCGCGATGGTTCATCCAAATTTCTGCCCTATTTCGATGGCTGGGTCTTGGCCAGCCATGGTGACAACGGGTAACGGATTAGGGCTCGACCCCGGAGAGCCTGAGAAACGGCTACCACATCCAAGGAAGGCAGCAGCGCAAAACCCAATCCCGACGCGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATGCAGGGCTCTTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAGTTGTTTTAAAAAGCTAGTTGAAGGCCGGCCGGGCCTCACCGCGTGCACTGGCCGGCCGGGTCTTTCCCTCTGGGGAGCCGCATGCCCTTTACTGGGCGTGCCGGTTTACCTGAATAAATTGGATCAAGGCCTATGCTCGAACAGTGCAGCATGGAATAATGTAGGATGGGTTCTATTTTTGTTTCTGGGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGACGGGGGGCCCGTATTCAATTGTTGAAGGTGAAATTCTTTTGAAGACTGCGAAAGCATTCGAGGATGTTTTCATTAAGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGATTAGGGATCGGGCGGTGTTATTTTTTGACCCGCTCGGCACCTTACGAAAATCAAAA???????????????????? 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Bombardia_bombarda 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Calosphaeria_pulchella 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Camarops_amorpha 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Camarops_microspora 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Camarops_tubulina 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Camarops_ustulinoides 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Cercophora_coprophila 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Chrysoporthe_cubensis 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Coccodiella_miconiae 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Coccodiella_miconiicola 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Cordyceps_cardinalis 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Tolypocladium_japonicum 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Glomerella_cingulata 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Graphium_penicillioides 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Halosphaeria_appendiculata 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Hypocrea_lutea 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Kylindria_peruamazonensis 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Lasiosphaeria_ovina 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Leotia_lubrica 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Melanospora_tiffanii 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Microascus_trigonosporus 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Verticillium_dahliae 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Xylaria_acuta ?????????????????CCAACAGGGATTGCCCTAGGGCGAGTGAAGCGGCAACAGCTCTTTGAAATCTGGCCTTGGTCCGAGTTGTGTAGAGGATGTTTTGGGTGCCTTCCGAGTTCCCTGGAACGGGCCTTAGAGGGTGAGAGCCCCGGGTTGGACCTAAGCCTCTGTAAAGCTTTCGACGAGTCGAGTAGGGGAATGCTGCTCTAAATGGGAGGTAAATTTCTTCTAAAGCTAAATATTGGCCAGAGACCGATAGCGCACAAGTAGAGTGATCGAAAGATGAAAAGCACAAAAGAGGGTTAAATAGCACGTGAAATTGTTGAAAGGGAATTTGCGACCAGTTCCTAATCATCCGGTGTTTCACCGGTGCACTTCGCTAGGTTAGGCCAGCATCGGTTTCCGGGGGGATAAAAGCGGGAACGTAGCTCCTCGGGAGTGTTATATCTGCAAATACCCTACAGGGACCGAGGACCGCGCTTAAGGAAATGGTCGCGACCCGTCTTGAAACACGGACCAAGGAGTCGCGAGTGTTTGGGTGTTAAACCCTCACGCGTAATGAAAGTGAACGGAGGTGAGAGCCCGGTGCATCATCGACCGATCCTGATGTCTTCGGATGGATTTGAGTAAGAGCATAACTGTTCGGACCCGAAAGATGGTGAACTATGCGTGGATAGGGTGAAGCCAGAGGAAACTCTGGTGGAGGCTCGCAGCGGTTCTGACGTGCAAATCGATCGTCAAATCTGCGCATGGGGGCGAAAGACTTATCGAACCATCTAGTAGCTGGTTAC????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????CGCCGGCGTTTCGCAGGTGTTGAACAGATACACTTCGCATCTACGCTGTCACATTTGCGAAGAACAAATACTCCAGTTGGCAGAGATGGTAAGCTTGCCAAACCACGGCAGCTTCACAACACCCACTGGGGTCTGGTCTGAGACGCCTGAGGGCAGGCTTGTGGTTTAGTCAAAAACCTGTCACTATGTGCTCTATCAGCGTGGGACGTCGACGGAACCTATTATAGAATATATGATTTCGCGAAATATGGAGGGGAAGAGTATGAACCTCTAAGCCCACATGCACGAATTCCTCAACGGATCTGGATATCCACCAAGATCCAAAGCTCTTCAGGGATGTTCAACAATTGAACGAATCAGATTCCGGGAAGTATCCCTGATTCGGGATATTCGCGCGAATTTAAAATTTTTCACATGCTGGCCGTGTCATGGGCCCTTGTTGTGGTTGAGAA??????????????????????????????????????????????????????TTTCAGAATGACCAAGGGCCG?????????????????????????????????????????????????ACCTGACGCAGAATCAAA??????????????????????????????????????????????????????????????CTGAACGAGCAATAAGCGACTAAAGACAAAGATGAATCCGACTACCATACGTACACCCATTGTGAAATTCACCCAAGTATGCTTCTTGGTATTTGGCCAGCATATTCCTTTCCCCGATCATAATTATACGGCGAAACTGCGAATGGCTCATTAAATCAGTTATCGTTTATTTGATAGTACCTTACTACTTGGATAACCGTGGTAATTCTAGAGCTAATACATGCTAAAAATCCCGACTCACGGGATGTATTTATTAGATTAAAAACCAATGCTCGGGGCTTTCTGGTGATAATAACTTCTATCGCATGGCCTTGCGCGATGGTTCATTCAAATTTCTGCCCTATTTCGATGGCAGGGTCTTGGCCTGCCATGGTTACAACGGGTAACGGATTAGGGCTCGACCCCGGAGAACCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGCGCAAAACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGTGACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAATTGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAGTTGTTTTAAAAAGCTAGTTGAAGGCTGGCCGGGCCTCACCGCGTGCACTGGTTGGCCGGGCCTTTCCCTCTGGGGAGCCCTATGCCCTTCACTGGGTGTAGTGTTTTACTTGAAAAAATTAGAGTCAGGCCTATGCTCGAATACATCAGCATGGAATAATATAGGACGGGTTCTATTTTGGGTTTCTAGGACCGCCGTAATGATTAATAGGGAGGGGGCATCAGTATTCAATTGTCAGAGGTGAAATTCTTTTGAAGACTGCGAAAGCATTTGAGGATGTTTTCATTAAGAACGAAAGTTAGGGGATCGAAGACGATCAGATACCGTCGTAGTCTTAACCATAAACTATGCCGACTAGGGATCGGACGATGTTATTTTTTGACTCGTTCGGCACCTTACGAAAATCAAAGTTTTTGGGTTCTGGGGGGAG ; END; BEGIN ASSUMPTIONS; TYPESET * UNTITLED (CHARACTERS = 'Matrix in file "Phyllachorales in Sordariomycetes_Matrix.nex"') = unord: 1 - 2637; END; BEGIN CODONS; CODESET * UNTITLED (CHARACTERS = 'Matrix in file "Phyllachorales in Sordariomycetes_Matrix.nex"') = universal: 1 - 2637; END; BEGIN MESQUITECHARMODELS; ProbModelSet * UNTITLED (CHARACTERS = 'Matrix in file "Phyllachorales in Sordariomycetes_Matrix.nex"') = 'Jukes-Cantor': 1 - 2637; END; BEGIN TREES; Title 'Trees from "Phyllachorales in Sordariomycetes_Bayesian.tre"'; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE [0] 1 'Telimena picramniae MM-05', [1] 2 'Polystigma pusillum MM-113', [2] 3 'Telimena canafistulae MM-13', [3] 4 'Telimena bicincta MM-133', [4] 5 'Phyllachora sp.3 MM-134', [5] 6 'Camarotella costaricensis MM-149', [6] 7 'Polystigma sp. MM-163', [7] 8 'Coccodiella sp. MM-165', [8] 9 'Polystigma pusillum MM-19', [9] 10 'Camarotella costaricensis MM-21', [10] 11 'Camarotella sp. MM-27', [11] 12 'Phyllachora sp.3 MM-78', [12] 13 'Telimena sp.4 MM-88', [13] 14 'Telimena sp.3 MM-92', [14] 15 'Phyllachora sp.3 MM-98', [15] 16 Aniptodera_chesapeakensis, [16] 17 Balansia_henningsiana, [17] 18 Bionectria_ochroleuca, [18] 19 Bombardia_bombarda, [19] 20 Buergenerula_spartinae, [20] 21 Calosphaeria_pulchella, [21] 22 Camarops_amorpha, [22] 23 Camarops_microspora, [23] 24 Camarops_tubulina, [24] 25 Camarops_ustulinoides, [25] 26 Cercophora_coprophila, [26] 27 Chaetosphaerella_phaeostroma, [27] 28 Chrysoporthe_cubensis, [28] 29 Coccodiella_miconiae, [29] 30 Coccodiella_miconiicola, [30] 31 Cordyceps_cardinalis, [31] 32 Ophiocordyceps_irangiensis, [32] 33 Tolypocladium_japonicum, [33] 34 Cryphonectria_parasitica, [34] 35 Cryptosporella_hypodermia, [35] 36 Diaporthe_eres, [36] 37 Diatrype_disciformis, [37] 38 Tolypocladium_capitatum, [38] 39 Eutypa_lata, [39] 40 Cocoicola_californica_F59034, [40] 41 Cocoicola_californica_F59038, [41] 42 Falcocladium_multivesiculatum, [42] 43 Falcocladium_sphaeropedunculatum, [43] 44 Gelasinospora_tetrasperma, [44] 45 Glomerella_cingulata, [45] 46 Gnomonia_gnomon, [46] 47 Graphium_penicillioides, [47] 48 Halosphaeria_appendiculata, [48] 49 Hypocrea_lutea, [49] 50 Kylindria_peruamazonensis, [50] 51 Lasiosphaeria_ovina, [51] 52 Leotia_lubrica, [52] 53 Melanospora_tiffanii, [53] 54 Melanospora_zamiae, [54] 55 Microascus_trigonosporus, [55] 56 Monilochaetes_infuscans, [56] 57 Ophioceras_dolichostomum, [57] 58 Ophioceras_leptosporum, [58] 59 Ophiodothella_vaccinii, [59] 60 Ophiostoma_piliferum, [60] 61 Ophiostoma_stenoceras, [61] 62 Serenomyces_phoenicis_PLM314, [62] 63 Serenomyces_phoenicis_PLM315, [63] 64 Papulosa_amerospora, [64] 65 Telimena_engleri_TH551, [65] 66 Phyllachora_graminis_TH544, [66] 67 Telimena_leeae_TH549, [67] 68 Telimena_zanthoxylicola_TH550, [68] 69 Polystigma_amygdalinum, [69] 70 Pseudohalonectria_lignicola, [70] 71 Roumegueriella_rufula, [71] 72 Sordaria_fimicola, [72] 73 Sordaria_macrospora, [73] 74 Sphaerodothis_acrocomiae, [74] 75 Sphaerostilbella_berkeleyana, [75] 76 Togninia_vibratilis, [76] 77 Valsa_ambiens, [77] 78 Verticillium_dahliae, [78] 79 Xylaria_acuta; TREE con_all_compat = (52:0.2943268,((((((((((1:0.08708255,4:0.2404417):0.03804414,((3:0.09950361,(13:0.1255286,65:0.05452318):0.00627092):0.004399194,(67:0.0292455,68:0.0479515):0.008511499):0.005878448):0.02105482,14:0.1034071):0.1468452,(2:0.1144017,9:0.2314372):0.2818069):0.01808758,(((((5:0.02239101,15:0.04239194):0.01003281,12:0.02030692):0.3328931,7:0.08255177):0.02595896,66:0.09745202):0.02172951,(((6:0.1102487,10:0.0519978):0.2141089,11:0.2324491):0.07053122,(8:0.1123155,(29:0.04962064,30:0.123947):0.0158207):0.06339505):0.05508615):0.03118994):0.05194618,((40:0.01603626,41:0.08392046):0.06980407,(62:0.2665661,63:0.5538903):0.1694559):0.1668028):0.03055089,((22:0.04095925,23:0.03684005):0.01869773,(24:0.03383608,25:0.02890917):0.02759859):0.06899881):0.0203839,(((19:0.09975234,51:0.1106668):0.02062983,(44:0.02102177,(72:0.009043965,73:0.01165499):0.0108396):0.07732259):0.0127848,26:0.1448143):0.03669802):0.05291672,(((((20:0.04903992,(57:0.06419705,58:0.09693505):0.1019754):0.01769385,70:0.184968):0.04482629,(60:0.03288914,61:0.006690125):0.09727229):0.02084005,64:0.118209):0.03208123,((21:0.1462531,76:0.1047574):0.02903034,(((28:0.03813684,34:0.03907519):0.04068286,(35:0.03701399,46:0.04229321):0.06673271):0.03938484,(36:0.09452653,77:0.0444746):0.03886166):0.08128303):0.02951898):0.03008361):0.02488038,(((((16:0.1299555,48:0.06694766):0.1277191,55:0.1231286):0.02566928,47:0.1244307):0.07211702,((45:0.08164151,(56:0.07714689,78:0.192321):0.01367422):0.01743986,50:0.09681761):0.08796071):0.02561811,(((((17:0.07983792,(31:0.09565221,74:0.1057969):0.008966516):0.01839868,(49:0.06814749,75:0.07359921):0.04908935):0.01552931,(32:0.1900551,(33:0.03376676,38:0.02199122):0.04090225):0.02297565):0.02757423,(18:0.1110127,71:0.1193645):0.06034078):0.04388522,((27:0.220207,(53:0.01977359,54:0.008973679):0.2792389):0.03928668,(42:0.01653846,43:0.02749473):0.2275562):0.07166314):0.01744789):0.07463111):0.04158141,((((37:0.04665425,39:0.02929376):0.0389355,59:0.0271917):0.04554814,69:0.1745355):0.03104076,79:0.09747585):0.05813474); END; BEGIN TREES; Title Imported_trees; LINK Taxa = Taxa; TRANSLATE [0] 1 'Telimena picramniae MM-05', [1] 2 'Polystigma pusillum MM-113', [2] 3 'Telimena canafistulae MM-13', [3] 4 'Telimena bicincta MM-133', [4] 5 'Phyllachora sp.3 MM-134', [5] 6 'Camarotella costaricensis MM-149', [6] 7 'Polystigma sp. 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