NEXUS
[File created by TreeBASE:  1/16/09  15:32:41]
[Matrix accession#: M3606]

BEGIN TAXA;
	TITLE M3606;
	DIMENSIONS  NTAX=13;
	TAXLABELS
		'Dubautia waianapanapaensis Dadh-B'	'Dubautia scabra PH Dadh-B'	'Dubautia scabra OL Dadh-B'	'Dubautia scabra HV Dadh-B'	'Dubautia reticulata Dadh-B'	'Dubautia platyphylla Dadh-B'	'Dubautia menziesii Dadh-B'	'Dubautia linearis Dadh-B'	'Dubautia laxa hirsuta Dadh-B'	'Dubautia ciliolata Dadh-B'	'Dubautia arborea Dadh-B'	'Argyroxiphium sandwicense sandwicense Dadh-B'	'Argyroxiphium sandwicense macrocephalum Dadh-B'
	;
END;

BEGIN CHARACTERS;
	TITLE M3606;
	DIMENSIONS NCHAR=781;
	FORMAT DATATYPE = DNA MISSING = ? GAP = - ;
	MATRIX
		'Dubautia waianapanapaensis Dadh-B'                    AAGTTTTCGACTTTACAAGAATCCGAATTCTTATCCAAATGCTCATTATAATAATTTCTTTGTGATCAGGCTGCTGAAGGTGCAAGAATTGCAGGTGCTTCAAGGATCATAGGGGTTGATCTCAATGCCAACAGATTTGAGCTTGGTAAGAAGAACTTT-AACTGTTTTGCAGTTAAAAATGTGAACCATGTCTCATATAATTAACCTTCTTTTGTCACAACAGCGAAGAAGTTTGGGGTTACAGAGTTTGTGAACCCGAAAGATTACACGAAACCGGTGCAAGAAGTGATTGCAGAGATGACAAATGGAGGCGTTGACAGGAGTGTTGAGTGCACTGGTCATATTGATGCTATGATCTCTGCCTTTGAATGTGTACATGATGTAAGAATTTACGTTTAAAACTAAGTCGAAACCAGTTATTTCGCGT---------CCCCTATCTTTTATAATATTTGTTATATTTTTGTAGGGTTGGGGTCTGGCTGTTCTTGTTGGCGTTCCACATAAAGATGCCGTATTCAAGACGAGTCCTTTGAATCTGTTAAACGAAAGGACGCTGAAGGGTACCTTTTTCGGAAACTACAAGCCTCGATCTGATATTCCTTCTGTTGTCGAACAATATATGAACAAGGTGGTTATATTACATAACACATGTTATTATTATTGTTTTTCAATTATTTAATAAGATGGAAACTGAAGAATGTTTGTTGCAGGAACTTGAGGTGGAGAAATTCATAACACATGAGGTGCCATTTTCAGAGATCAATAAGCCC-TTG
		'Dubautia scabra PH Dadh-B'                            AAGTTTTCGACTTTACAAGAATCCGAATTCTTATCCAAATGCTCATTATAATAATTTCTTTGTGATCAGGCTGCTGAAGGTGCAAGAATTGCAGGTGCTTCAAGGATCATAGGGGTTGATCTCAATGCCAACAGATTTGAGCTTGGTAAGAAGAACTTT-AACTGTTTTGCAGTTAAAAATGTGAACCATGTCTCATATAATTAACCTTCTTTTGTCACAACAGCGAAGAAGTTTGGGGTTACAGAGTTTGTGAACCCGAAAGATTACACGAAACCGGTGCAAGAAGTGATTGCAGAGATGACAAATGGAGGCGTTGACAGGAGTGTTGAGTGCACTGGTCATATTGATGCTATGATCTCTGCCTTTGAATGTGTTCATGATGTAAGAATTTACGTTTAAAACTAAGTCGAAACCAGTTATTTCGCGTAAACATGCACCCCTATCTTTTATAATATTTGTTATATTTTTGTAGGGTTGGGGTCTGGCTGTTCTTGTTGGCGTTCCACATAAAGATGCCGTATTCAAGACGAGTCCTTTGAATCTGTTAAACGAAAGGACGCTGAAGGGTACCTTTTTCGGAAACTACAAGCCTCGATCTGATATTCCTTCTGTTGTCGAACAATATATGAACAAGGTGGTTATATTACATAACACATGTTATTATTATTGTTTTTCAATTATTTAATAAGATGGAAACTGAAGAATGTTTGTTGCAGGAACTTGAGGTGGAGAAGTTCATAACACATGAGGTGCCATTTTCAGAGATCAATAAGCCCTTTG
		'Dubautia scabra OL Dadh-B'                            AAGTTTTCGACTTTACAAGAATCCGAATTCTTATCCAAATGCTCATTATAATAATTTCTTTGTGATCAGGCTGCTGAAGGTGCAAGAATTGCAGGTGCTTCAAGGATCATAGGGGTTGATCTCAATGCCAACAGATTTGAGCTTGGTAAGAAGAACTTT-AACTGTTTTGCAGTTAAAAATGTGAACCATGTCTCATATAATTAACCTTCTTTTGTCACAACAGCGAAGAAGTTTGGGGTTACAGAGTTTGTGAACCCGAAAGATTACACGAAACCGGTGCAAGAAGTGATTGCAGAGATGACAAATGGAGGCGTTGACAGGAGTGTTGAGTGCACTGGTCATATTGATGCTATGATCTCTGCCTTTGAATGTGTTCATGATGTAAGAATTTACGTTTAAAACTAAGTCGAAACCAGTTATTTCGCGTAAACATGCACCCCTATCTTTTATAATATTTGTTATATTTTTGTAGGGTTGGGGTCTGGCTGTTCTTGTTGGCGTTCCACATAAAGATGCCGTATTCAAGACGAGTCCTTTGAATCTGTTAAACGAAAGGACGCTGAAGGGTACCTTTTTCGGAAACTACAAGCCTCGATCTGATATTCCTTCTGTTGTCGAACAATATATGAACAAGGTGGTTATATTACATAACACATGTTATTATTATTGTTTTTCAATTATTTAATAAGATGGAAACTGAAGAATGTTTGTTGCAGGAACTTGAGGTGGAGAAGTTCATAACACATGAGGTGCCATTTTCAGAGATCAATAAGCCCTTTG
		'Dubautia scabra HV Dadh-B'                            AAGTTTTCGACTTTACAAGAATCCGAATTCTTATCCAAATGCTCATTATAATAATTTCTTTGTGATCAGGCTGCTGAAGGTGCAAGAATTGCAGGTGCTTCAAGGATCATAGGGGTTGATCTCAATGCCAACAGATTTGAGCTTGGTAAGAAGAACTTT-AACTGTTTTGCAGTTAAAAATGTGAACCATGTCTCACATAATTAACCTTCTTTTGTCACAACAGCGAAGAAGTTTGGGGTTACAGAGTTTGTGAACCCGAAAGATTACACAAAACCGGTGCAAGAAGTGATTGCAGAGATGACAAATGGAGGCGTTGACAGGAGTGTTGAGTGCACTGGTCATATTGATGCTATGATCTCTGCCTTTGAATGTGTTCATGATGTAAGAATTTACGTTTAAAACTAAGTCGAAACCAGTTATTTCGCGTAAACATGCACCCCTATCTTTTATAATATTTGTTATATTTTTGTAGGGTTGGGGTGTGGCTGTTCTTGTTGGCGTTCCACATAAAGATGCCGTATTCAAGACGAGTCCTTTGAATCTGTTAAACGAAAGGACGCTGAAGGGTACCTTTTTCGGAAACTACAAGCCTCGATCTGATATTCCTTCTGTTGTCGAACAATATATGAACAAGGTGGTTATATTACATAACGCATGTTATTATTATTGTTTTTCAATTATTTAATAAGATGGAAACTGAAGAATGTTTGTTGCAGGAACTTGAGGTGGAGAAATTCATAACACATGAGGTGCCATTTTCAGAGATCAATAAGCCCT---
		'Dubautia reticulata Dadh-B'                           AAGTTTTCGACTTTACAAGAATCCGAATTCTTATCCAAATGCTCATTATAATAATTTCTTTGTGATCAGGCTGCTGAAGGTGCAAGAATTGCAGGTGCTTCAAGGATCATAGGGGTTGATCTCAATGCCAACAGATTTGAGCTTGGTAAGAAGAACTTT-AACTGTTTTGCAGTTAAAAATGTGAACCATGTCTCATATAATTAACCTTCTTTTGTCACAACAGCGAAGAAGTTTGGGGTTACAGAGTTTGTGAACCCGAAAGATTACACGAAACCGGTGCAAGAAGTGATTGCAGAGATGACAAATGGAGGCGTTGACAGGAGTGTTGAGTGCACTGGTCATATTGATGCTATGATCTCTGCCTTTGAATGTGTACATGATGTAAGAATTTACGTTTAAAACTAAGTCGAAACCAGTTATTTCGCGT---------CCCCTATCTTTTATAATATTTGTTATATTTTTGTAGGGTTGGGGTCTGGCTGTTCTTGTTGGCGTTCCACATAAAGATGCCGTATTCAAGACGAGTCCTTTGAATCTGTTAAACGAAAGGACGCTGAAGGGTACCTTTTTCGGAAACTACAAGCCTCGATCTGATATTCCTTCTGTTGTCGAACAATATATGAACAAGGTGGTTATATTACATAACACATGTTATTATTATTGTTTTTCAATTATTTAATAAGATGGAAACTGAAGAATGTTTGTTGCAGGAACTTGAGGTGGAGAAATTCATAACACATGAGGTGCCATTTTCAGAGATCAATAAGCCCTTTG
		'Dubautia platyphylla Dadh-B'                          AAGTTTTCGACTTTACAAGAATCCGAATTCTTATCCAAATGCTCATTATAATAATTTCTTTGTGATCAGGCTGCTGAAGGTGCAAGAATTGCAGGTGCTTCAAGGATCATAGGGGTTGATCTCAATGCCAACAGATTTGAGCTTGGTAAGAAGAACTTT-AACTGTTTTGCAGTTAAAAATGTGAACCATGTCTCATATAATTAACCTTCTTTTGTCACAACAGCGAAGAAGTTTGGGGTTACAGAGTTTGTGAACCCGAAAGATTACACGAAACCGGTGCAAGAAGTGATTGCAGAGATGACAAATGGAGGCGTTGACAGGAGTGTTGAGTGCACTGGTCATATTGATGCTATGATCTCTGCCTTTGAATGTGTACATGATGTAAGAATTTACGTTTAAAACTAAGTCGAAACCAGTTATTTCGCGT---------CCCCTATCTTTTATAATATTTGTTATATTTTTGTAGGGTTGGGGTCTGGCTGTTCTTGTTGGCGTTCCACATAAAGATGCCGTATTCAAGACGAGTCCTTTGAATCTGTTAAACGAAAGGACGCTGAAGGGTACCTTTTTCGGAAACTACAAGCCTCGATCTGATATTCCTTCTGTTGTCGAACAATATATGAACAAGGTGGTTATATTACATAACACATGTTATTATTATTGTTTTTCAATTATTTAATAAGATGGAAACTGAAGAATGTTTGTTGCAGGAACTTGAGGTGGAGAAATTCATAACACATGAGGTGCCATTTTCAGAGATCAATAAGCCCTTTG
		'Dubautia menziesii Dadh-B'                            AAGTTTTCGACTTTACAAGAATCCGAATTCTTATCCAAATGCTCATTATAATAATTTCTTTGTGATCAGGCTGCTGAAGGTGCAAGAATTGCAGGTGCTTCAAGGATCATAGGGGTTGATCTCAATGCCAACAGATTTGAGCTTGGTAAGAAGAACTTT-AACTATTTTGCAGTTAAAAATGTGAACCATGTCTCATATAATTAACCTTCTTTTGTCACAACAGCGAAGAAGTTTGGGGTTACAGAGTTTGTGAACCCGAAAGATTACACGAAACCGGTGCAAGAAGTGATTGCAGAGATGACAAATGGAGGCGTTGACAGGAGTGTTGAGTGCACTGGTCATATTGATGCTATGATCTCTGCCTTTGAATGTGTACATGATGTAAGAATTTACGTTTAAAACTAAGTCGAAACCAGTTATTTCGCGT---------CCCCTATCTTTTATAATATTTGTTATATTTTTGTAGGGTTGGGGTCTGGCTGTTCTTGTTGGCGTTCCACATAAAGATGCCGTATTCAAGACGAGTCCTTTGAATCTGTTAAACGAAAGGACGCTGAAGGGTACCTTTTTCGGAAACTACAAGCCTCGATCTGATATTCCTTCTGTTGTCGAACAATATATGAACAAGGTGGTTATATTACATAACACATGTTATTATTATTGTTTTTCAATTATTTAATAAGATGGAAACTGAAGAATGTTTGTTGCAGGAACTTGAGGTGGAGAAATTCATAACACATGAGGTGCCATTTTCAGAGATCAATAAGCCCTTTG
		'Dubautia linearis Dadh-B'                             AAGTTTTCGACTTTACAAGAATCCGAATTCTTATCCAAATGCTCATTATAATAATTTCTTTGTGATCAGGCTGCTGAAGGTGCAAGAATTGCAGGTGCTTCAAGGATCATAGGGGTTGATCTCAATGCCAACAGATTTGAGCTTGGTAAGAAGAACTTT-AACTGTTTTGCAATTAAAAATGTGAACCATGTCTCATATAATTAACCTTCTTTTGTCACAACAGCGAAGAAGTTTGGGGTTACAGAGTTTGTGAACCCGAAAGATTACACGAAACCGGTGCAAGAAGTGATTGCAGAGATGACAAATGGAGGCGTTGACAGGAGTGTTGAGTGCACTGGTCATATTGATGCTATGATCTCTGCCTTTGAATGTGTTCATGATGTAAA------CGTTTAAAACTAAGTCGAAACCAGTTATTTCGCTTAAACATGCACCCCTATCTTTTATAATATTTGTTATATTTTTGTAGGGTTGGGGTGTGGCTGTTCTTGTTGGCGTTCCACATAAAGATGCCGTATTCAAGACGAGTCCTTTGAATCTGTTAAACGAAAGGACGCTGAAGGGTACCTTTTTCGGAAACTACAAGCCTCGATCTGATATTCCTTCTGTTGTCGAACAATATATGAACAAGGTGGTTATATTACATAACACATGTTATTATTATTGTTTTTCAATTATTTAATAAGATGGAAACTGAAGAATGTTTGTTGCAGGAACTTGAGGTGGAGAAATTCATAACACATGAGGTGCCATTTTCAGAGATCAATAAGCCCTTTG
		'Dubautia laxa hirsuta Dadh-B'                         AAGTTTTCGACTTTACAAGAATCCGAATTCTTATCCAAATGCTCATTATAATAATTTCTTTGTGATCAGGCTGCTGAAGGTGCAAGAATTGCAGGTGCTTCAAGGATCATAGGGGTTGATCTCAATGCCAACAGATTTGAGCTTGGTAAGAAGAACTTTTAACTGTTTTGCAGTTAAAAATGTGAACCATGTCTCATATAATTAACCTTCTTTTGTCACAACAGCGAAGAAGTTTGGGGTTACAGAGTTTGTGAACCCGAAAGATTACACGAAACCGGTGCAAGAAGTGATTGCAGAGATGACAAATGGAGGCGTTGACAGGAGTGTTGAGTGCACTGGTCATATTGATGCTATGATCTCTGCCTTTGAATGTGTTCATGATGTAAGAATTTACGTTTAAAACTAAGTCGAAACCAGTTATTTCGCGTAAACATGCACCCCTATCTTTTATAATATTTGTTATATTTTTGTAGGGTTGGGGTGTGGCTGTTCTTGTTGGCGTTCCACATAAAGATGCCGTATTCAAGACGAGTCCTTTGAATCTGTTAAACGAAAGGACGCTGAAGGGTACCTTTTTCGGAAACTACAAGCCTCGATCTGATATTCCTTCTGTTGTCGAACAATATATGAACAAGGTGGTTATATTACATAACACATGTTATTATTATTGTTTTTCAATTATTTAATAAGATGGAAACTGAAGAATGTTTGATGCAGGAACTTGAGGTGGAGAAATTCATAACACATGAGGTGCCATTTTCAGAGATCAATAAGCCCTTTG
		'Dubautia ciliolata Dadh-B'                            AAGTTTTCGACTTTACAAGAATCCGAATTCTTATCCAAATGCTCATTATAATAATTTCTTTGTGATCAGGCTGCTGAAGGTGCAAGAATTGCAGGTGCTTCAAGGATCATAGGGGTTGATCTCAATGCCAACAGATTTGAGCTTGGTAAGAAGAACTTT-AACTGTTTTGCAGTTAAAAATGTGAACCATGTCTCATATAATTAACCTTCTTTTGTCACAACAGCGAAGAAGTTTGGGGTTACAGAGTTTGTGAACCCGAAAGATTACACGAAACCGGTGCAAGAAGTGATTGCAGAGATGACAAATGGAGGCGTTGACAGGAGTGTTGAGTGCACTGGTCATATTGATGCTATGATCTCTGCCTTTGAATGTGTACATGATGTAAGAATTTACGTTTAAAACTAAGTCGAAACCAGTTATTTCGCGT---------CCCCTATCTTTTATAATATTTGTTATATTTTTGTAGGGTTGGGGTCTGGCTGTTCTTGTTGGCGTTCCACATAAAGATGCCGTATTCAAGACGAGTCCTTTGAATCTGTTAAACGAAAGGACGCTGAAGGGTACCTTTTTCGGAAACTACAAGCCTCGATCTGATATTCCTTCTGTTGTCGAACAATATATGAACAAGGTGGTTATATTACATAACACATGTTATTATTATTGTTTTTCAATTATTTAATAAGATGGAAACTGAAGAATGTTTGTTGCAGGAACTTGAGGTGGAGAAATTCATAACACATGAGGTGCCATTTTCTGAGATCAATAAGCCCTTTG
		'Dubautia arborea Dadh-B'                              AAGTTTTCGACTTTACAAGAATCCGAATTCTTATCCAAATGCTCATTATAATAATTTCTTTGTGATCAGGCTGCTGAAGGTGCAAGAATTGCAGGTGCTTCAAGGATCATAGGGGTTGATCTCAATGCCAACAGATTTGAGCTTGGTAAGAAGAACTTT-AACTGTTTTGCAGTTAAAAATGTGAACCATGTCTCATATAATTAACCTTCTTTTGTCACAACAGCGAAGAAGTTTGGGGTTACAGAGTTTGTGAACCCGAAAGATTACACGAAACCGGTGCAAGAAGTGATTGCAGAGATGACAAATGGAGGCGTTGACAGGAGTGTTGAGTGCACTGGTCATATTGATGCTATGATCTCTGCCTTTGAATGTGTACATGATGTAAGAATTTACGTTTAAAACTAAGTCGAAACCAGTTATTTCGCGT---------CCCCTATCTTTTATAATATTTGTTATATTTTTGTAGGGTTGGGGTCTGGCTGTTCTTGTTGGCGTTCCACATAAAGATGCCGTATTCAAGACGAGTCCTTTGAATCTGTTAAACGAAAGGACGCTGAAGGGTACCTTTTTCGGAAACTACAAGCCTCGATCTGATATTCCTTCTGTTGTCGAACAATATATGAACAAGGTGGTTATATTACATAACACATGTTATTATTATTGTTTTTCAATTATTTAATAAGATGGAAACTGAAGAATGTTTGTTGCAGGAACTTGAGGTGGAGAAATTCATAACACATGAGGTGCCATTTTCAGAGATCAATAAGCCCTTTG
		'Argyroxiphium sandwicense sandwicense Dadh-B'         AAGTTTTCGACTTTACAAGAATCCGAATTCTTATCCAAATGCTCATTATAATAATTTCTTTGTGATCAGGCTGCTGAAGGTGCAAGAATTGCAGGTGCTTCAAGGATCATAGGGGTTGATCTCAATGCCAACAGATTTGAGCTTGGTAAGAAGAACTTT-AACTGTTTTGCAGTTAAAAATGTGAACCATGTCTCACATAATTAACCTTCTTTTGTCACAACAGCGAAGAAGTTTGGGGTTACAGAGTTTGTGAACCCGAAAGATTACACGAAACCGGTGCAAGAAGTGATTGCAGAGATGACAAATGGAGGCGTTGACAGGAGTGTTGAGTGCACTGGTCATATTGATGCTATGATCTCTGCCTTTGAATGTGTTCATGATGTAAGAATTTACGTTTAAAACTAAGTCGAAACCAGTTATTTCGTGTAAACATGCACCCCTATCTTTTATAATATTTGTTATATTTTTGTAGGGTTGGGGTGTGGCTGTTCTTGTTGGCGTTCCACATAAAGATGCCGTATTCAAGACGAGTCCTTTGAATCTGTTAAACGAAAGGACGCTGAAGGGTACCTTTTTCGGAAACTACAAGCCTCGATCTGATATTCCTTCTGTTGTCGAACAATATATGAACAAGGTGGTTATATTACATAACGCATGTTATTATTATTGTTTTTCAATTATTTAATAAGATGGAAACTGAAGAATGTTTGTTGCAGGAACTTGAGGTGGAGAAATTCATAACACATGAGGTACCATTTTCTGAGATCAATAAGCCCTTTG
		'Argyroxiphium sandwicense macrocephalum Dadh-B'       AAGTTTTCGACTTTACAAGAATCCGAATTCTTATCCAAATGCTCATTATAATAATTTCTTTGTGATCAGGCTGCTGAAGGTGCAAGAATTGCAGGTGCTTCAAGGATCATTGGGGTTGATCTCAATGCCAACAGATTTGAGCTTGGTAAGAAGAACTTT-AACTGTTTTGCAGTTAAAAATGTGAACCATGTCTCACATAATTAACCTTCTTTTGTCACAACAGCGAAGAAGTTTGGGGTTACAGAGTTTGTGAACCCGAAAGATTACACGAAACCGGTGCAAGAAGTGATTGCAGAGATGACAAATGGAGGCGTTGACAGGAGTGTTGAGTGCACTGGTCATATTGATGCTATGATCTCTGCCTTTGAATGTGTTCATGATGTAAGAATTTACGTTTAAAACTAAGTCGAAACCAGTTATTTCGCGTAAACATGCACCCCTATCTTTTATAATATTTGTTATATTTTTGTAGGGTTGGGGTGTGGCTGTTCTTGTTGGCGTTCCACATAAAGATGCCGTATTCAAGACGAGTCCTTTGAATCTGTTAAACGAAAGGACGCTGAAGGGTACCTTTTTCGGAAACTACAAGCCTCGATCTGATATTCCTTCTGTTGTCGAACAATATATGAACAAGGTGGTTATATTACATAACGCATGTTATTATTATTGTTTTTCAATTATTTAATAAGATGGAAACTGAAGAATGTTTGTTGCAGGAACTTGAGGTGGAGAAATTCATAACACATGAGGTGCCATTTTCAGAGATCAATAAGCCCTT-G
	;
END;

BEGIN CODONS;
CODONPOSSET * CodonPositions = 
 N: 1 - 781 ; 
 CODESET * UNTITLED = Universal: all ; 
 END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
OPTIONS DEFTYPE = unord PolyTcount = MINSTEPS ; 
 END;